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当前共找到 417 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-09-21 |
Single-cell profiling reveals a potent role of quercetin in promoting hair regeneration
2023-06-07, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1093/procel/pwac062
PMID:37285263
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组测序揭示槲皮素通过促进毛囊角质细胞增殖和真皮内皮细胞血管生成来促进毛发生长 | 首次构建了槲皮素促进毛发生长过程中的动态单细胞转录组图谱，发现槲皮素通过激活内皮细胞HIF-1α诱导血管生成信号，揭示了毛囊微环境在毛发生长中的关键作用 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证槲皮素促进毛发生长的效果和安全性 | 探究槲皮素促进毛发生长的分子机制及其对毛囊微环境的影响 | 小鼠皮肤组织中的毛囊细胞、真皮内皮细胞等 | 单细胞转录组学 | 脱发 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2 | 2026-09-02 |
RETROFIT: Reference-free deconvolution of cell-type mixtures in spatial transcriptomics
2023-Jun-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.07.544126
PMID:37333291
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研究论文 | 提出一种无需单细胞参考的贝叶斯方法RETROFIT，用于空间转录组数据中细胞类型混合物的解卷积，并在合成和真实数据集上验证其性能。 | RETROFIT是一种参考自由的贝叶斯方法，不依赖单细胞转录组参考，能够产生稀疏且可解释的解卷积结果，优于现有参考依赖和参考自由方法。 | 未明确提及 | 开发一种参考自由的细胞类型解卷积方法，以准确估计空间转录组数据中每个位置的细胞类型组成和基因表达重建。 | 空间转录组数据，包括合成数据集和来自Slide-seq和Visium平台的真实ST数据，以及人类肠道发育ST数据。 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | 贝叶斯模型 | 空间基因表达数据 | 包含合成数据集和真实ST数据集（Slide-seq和Visium），以及人类肠道发育ST数据 | 10x Genomics, NA（Slide-seq可能涉及其他平台） | 空间转录组学 | 10x Visium, Slide-seq | Slide-seq和Visium平台 |
| 3 | 2026-08-04 |
Recording morphogen signals reveals origins of gastruloid symmetry breaking
2023-Jun-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.02.543474
PMID:37333235
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研究论文 | 使用合成基因回路追踪胃类器官中的信号动态，揭示Wnt和TGF信号异质性如何驱动前后轴对称性破缺 | 创新点在于实时追踪单细胞信号历史，并识别关键的6小时窗口，表明细胞分选和差异粘附驱动对称性破缺 | 局限性包括类器官模型与体内环境的差异，以及合成回路可能带来的干扰 | 阐明干细胞胃类器官如何从均匀聚集体转变为极化结构并定义单一前后轴 | 哺乳动物干细胞形成的三维胃类器官 | 干细胞生物学 | NA | 合成基因回路、单细胞RNA测序、活体成像 | NA | 图像和基因表达数据 | 未明确 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 用于单细胞RNA测序的10x Chromium平台 |
| 4 | 2026-07-24 |
Lactate from glycolysis regulates inflammatory macrophage polarization in breast cancer
2023-06, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-023-03382-x
PMID:36729212
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研究论文 | 通过多组学数据分析，发现乳腺癌中乳酸主要来源于糖酵解，并调控炎症性巨噬细胞极化 | 首次结合多组学数据分析和单细胞转录组揭示乳酸主要源于糖酵解而非谷氨酰胺分解，并阐明其通过SLC16A3转运体影响M1巨噬细胞极化的机制 | 未详细阐述体内实验验证及临床治疗应用的具体效果 | 探究乳腺癌中乳酸的来源及其对免疫微环境中巨噬细胞极化的调控作用 | 乳腺癌细胞和肿瘤相关巨噬细胞 | NA | 乳腺癌 | 多组学数据分析、单细胞转录组分析、体外实验（RNA和蛋白质水平检测） | NA | 转录组数据、临床数据 | 未明确样本数量，涉及22种免疫细胞分析 | NA | NA | NA | NA |
| 5 | 2026-06-17 |
CD168+ macrophages promote hepatocellular carcinoma tumor stemness and progression through TOP2A/β-catenin/YAP1 axis
2023-Jun-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.106862
PMID:37275516
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研究论文 | 通过单细胞RNA-seq分析，发现CD168+巨噬细胞通过TOP2A/β-catenin/YAP1轴促进肝癌干细胞特性与肿瘤进展 | 首次揭示CD168+巨噬细胞通过TOP2A竞争性结合β-catenin，解除其与YAP1的结合，从而促进肝癌干细胞特性与空间异质性 | NA | 探索肝癌干细胞样细胞的起源及TOP2A/β-catenin/YAP1轴在肿瘤干细胞特性和进展中作用 | 肝细胞癌中的癌症干细胞样细胞和M2样巨噬细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞测序平台，10x Visium空间转录组学平台 |
| 6 | 2026-06-02 |
Single-cell RNA sequencing identifies response of renal lymphatic endothelial cells to acute kidney injury
2023-Jun-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.09.544380
PMID:37333313
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序鉴定肾脏淋巴管内皮细胞对急性肾损伤的反应 | 首次通过单细胞RNA测序表征小鼠肾脏淋巴管内皮细胞亚群及其在顺铂急性肾损伤中的变化，并发现以往研究未描述的肾淋巴管内皮细胞及其淋巴管血管作用 | 未明确说明局限性 | 探索肾脏淋巴管内皮细胞对急性肾损伤的反应及其在肾脏疾病进展中的潜在作用 | 小鼠肾脏淋巴管内皮细胞 | 单细胞转录组学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠肾脏细胞样本（具体数量未说明） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 7 | 2026-06-01 |
Spatial transcriptomics stratifies psoriatic disease severity by emergent cellular ecosystems
2023-06-08, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abq7991
PMID:37267384
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研究论文 | 利用空间转录组学分析银屑病（PsO）皮肤活检样本，揭示健康与发炎皮肤之间免疫微环境的显著差异，以及疾病严重程度分层的组织生态系统特征 | 首次通过空间转录组学对银屑病的组织生态系统进行系统性分类，发现轻度和重度银屑病具有不同的分子特征，且重度银屑病可能从分子水平改变远端未受累皮肤区域 | 样本量较小（25例活检样本），且未提及空间转录组学的分辨率限制或潜在批次效应；单细胞数据的整合可能受公共数据异质性影响 | 探究银屑病（一种炎症性皮肤病）的组织空间特征及其与疾病严重程度和系统性表现的关系 | 银屑病患者和健康对照者的皮肤活检样本（包括活动性皮损、临床未受累皮肤和健康皮肤） | 空间转录组学 | 银屑病 | 空间转录组学（ST）、单细胞转录组学整合分析 | NA | 空间转录组数据、单细胞转录组数据 | 25例皮肤活检样本（包括健康、活动性皮损和临床未受累皮肤） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 8 | 2026-05-28 |
The origin and structural evolution of de novo genes in Drosophila
2023-Jun-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.13.532420
PMID:37425675
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研究论文 | 结合全基因组比对、生物信息学和计算结构建模，系统性研究了果蝇属新基因的起源、演化及蛋白质结构特征 | 首次系统揭示果蝇谱系特异性新基因的蛋白质结构起源与演化规律，发现大多数潜在折叠良好的蛋白质在诞生时即已折叠，并观察到少数无序蛋白在短时间内转变为有序结构 | 基于计算预测的蛋白质结构缺乏实验验证，且研究局限于果蝇属，结论的普适性有待验证 | 解析新基因在果蝇属中的起源机制、演化过程及蛋白质结构变化规律 | 果蝇属（Drosophila）中555个谱系特异性新基因候选者 | 机器学习和生物信息学交叉 | NA | 全基因组比对、生物信息学分析、Alphafold2、ESMFold、分子动力学模拟、祖先序列重构、单细胞RNA-seq | Alphafold2, ESMFold | 基因组序列、蛋白质结构预测数据、单细胞转录组数据 | 果蝇属555个新基因候选者，以及睾丸单细胞RNA-seq数据 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 用于果蝇睾丸组织的单细胞RNA-seq分析 |
| 9 | 2026-04-29 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Identifies Subclusters with Inflammatory Fibroblast Responses in Localized Scleroderma
2023-Jun-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24129796
PMID:37372943
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析，识别局限性硬皮病中具有炎症性成纤维细胞反应的新亚群 | 首次在局限性硬皮病（LS）患者皮肤中通过单细胞RNA测序技术，识别出12个成纤维细胞亚群，并发现了一个独特的CXCL2/IRF1亚群，具有强烈的炎症基因特征，包括IL-6，以及一个与系统性硬化症肌成纤维细胞相关的SFRP4/PRSS23亚群，同时表达CXCL9/10/11 | 样本量有限（14例LS患者和14例健康对照），且主要为成人患者 | 探索局限性硬皮病中成纤维细胞在炎症和纤维化过程中的作用 | 局限性硬皮病（LS）患者（包括儿童和成人）和健康对照组的皮肤组织中的成纤维细胞 | 单细胞转录组学 | 局限性硬皮病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 14例局限性硬皮病患者和14例健康对照组的皮肤组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10 | 2026-04-29 |
IRF7 and UNC93B1 variants in an infant with recurrent herpes simplex virus infection
2023-06-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI154016
PMID:37097753
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研究报告 | 报告了一名反复感染单纯疱疹病毒1型的婴儿携带IRF7和UNC93B1基因变异，并探讨了其免疫机制 | 首次在一个婴儿中发现IRF7和UNC93B1基因的有害变异与反复HSV-1感染和脑炎相关，并证明了这些变异通过抑制TLR3通路和I型干扰素反应在分子水平上起作用 | 该研究仅涉及单一病例，结果可能不具普遍性；需要更多患者研究来确认IRF7和UNC93B1变异在新生儿HSV易感性中的作用 | 探索新生儿单纯疱疹病毒感染的遗传基础 | 一名患有反复HSV-1感染并发展为脑炎的男性婴儿 | 机器学习 | 单纯疱疹病毒感染 | 全外显子测序，单细胞RNA测序 | NA | 测序数据 | 1名婴儿 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11 | 2026-04-05 |
Single-cell transcriptomic profiling of microvascular endothelial cell heterogeneity in congenital diaphragmatic hernia
2023-06-17, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-37050-y
PMID:37330615
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了先天性膈疝（CDH）肺中微血管内皮细胞的异质性，特别是炎症性mvEC簇和mvCa4+ ECs的减少，可能参与疾病发病机制 | 首次在CDH模型中利用单细胞RNA测序识别出转录组学上不同的微血管内皮细胞簇，包括独特的炎症性mvEC簇和与肺发育相关的mvCa4+ ECs减少 | 研究基于大鼠硝苯酮模型，可能无法完全模拟人类CDH的复杂性；样本量相对较小；未进行功能验证实验 | 探究先天性膈疝肺中微血管内皮细胞异质性及其与肺发育不良和重塑的关系 | 大鼠胎儿肺组织（E21.5），包括健康对照组、硝苯酮暴露对照组和硝苯酮诱导的CDH组 | 数字病理学 | 先天性膈疝 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 三组大鼠胎儿肺组织（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12 | 2026-03-28 |
Protocol for using single-cell sequencing to study the heterogeneity of NF1 nerve sheath tumors from clinical biospecimens
2023-Jun-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102297
PMID:37167059
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研究论文 | 本文介绍了一种从神经纤维瘤病1型相关神经鞘肿瘤中获取单细胞悬液，并在10x平台上进行转录组分析的实验方案 | 提出了一种针对临床神经鞘肿瘤样本的单细胞测序实验方案，并整合了生物信息学工具进行发育轨迹构建和比较分析 | 该方案主要针对神经纤维瘤病1型相关肿瘤，可能不适用于其他类型肿瘤，且依赖于10x平台技术 | 研究神经纤维瘤病1型相关神经鞘肿瘤的异质性 | 神经纤维瘤病1型相关的神经鞘肿瘤临床样本 | 数字病理学 | 神经纤维瘤病 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x平台单细胞转录组分析 |
| 13 | 2026-03-28 |
Differentiation and single-cell RNA-seq analyses of human pluripotent-stem-cell-derived renal organoids
2023-Jun-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102314
PMID:37220001
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研究论文 | 本文介绍了一种将人类多能干细胞分化为肾脏类器官的协议，包括维护、分化、单细胞RNA-seq分析和验证步骤 | 提供了一种快速、可重复的人类肾脏发育和疾病建模模型，并详细描述了使用CRISPR-Cas9同源定向修复进行基因组工程以生成肾脏疾病模型 | NA | 开发人类肾脏发育和疾病建模的协议 | 人类多能干细胞衍生的肾脏类器官 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA-seq，CRISPR-Cas9 | NA | RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 14 | 2026-03-28 |
Protocol to assess fatal embolism risks from human stem cells
2023-Jun-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102268
PMID:37133989
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研究论文 | 本文提出了一种协议，用于识别人类脂肪来源多能基质细胞（ADSCs）中促栓塞亚群并预测ADSC输注的致命栓塞风险 | 开发了一种结合单细胞RNA-seq数据分析和数学建模的协议，以预测干细胞治疗中的栓塞风险 | 协议细节依赖于先前研究（Yan et al., 2022），可能需进一步验证 | 评估干细胞治疗中的栓塞风险，以提升细胞质量和临床应用安全性 | 人类脂肪来源多能基质细胞（ADSCs） | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA-seq | 数学模型 | 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 15 | 2026-03-28 |
Isolation of human cutaneous immune cells for single-cell RNA sequencing
2023-Jun-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102239
PMID:37120815
|
研究论文 | 本文介绍了一种从人类皮肤中分离高活性免疫细胞用于单细胞RNA测序的协议 | 提出了一种针对人类皮肤屏障特性的高活性免疫细胞分离方法，适用于单细胞RNA测序 | 协议依赖于酶解和流式细胞术，可能对细胞活性有特定要求，且未详细讨论所有潜在技术挑战 | 开发一种从人类皮肤中分离免疫细胞的方法，以支持单细胞RNA测序在炎症性疾病研究中的应用 | 人类皮肤活检样本中的免疫细胞 | 数字病理学 | 炎症性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 16 | 2026-03-28 |
Protocol for analyzing γδ T cells from the vagina of diet-induced obese mice using single-cell RNA sequencing and flow cytometry
2023-Jun-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102278
PMID:37289592
|
研究论文 | 本文介绍了一种在高脂饮食诱导的肥胖小鼠中，通过单细胞RNA测序和流式细胞术分析阴道γδ T细胞的实验方案 | 开发了针对肥胖小鼠阴道γδ T细胞分析的综合实验方案，结合单细胞RNA测序和流式细胞术，以研究肥胖对生殖器疱疹易感性的影响 | NA | 研究肥胖如何影响生殖器疱疹（由HSV-2引起）的易感性，并分析阴道γδ T细胞在其中的作用 | 高脂饮食诱导的肥胖小鼠的阴道γδ T细胞 | 数字病理学 | 生殖器疱疹 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞术数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 17 | 2026-03-28 |
Protocol for tumor dissociation and fluorescence-activated cell sorting of human head and neck cancers
2023-Jun-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102294
PMID:37149858
|
protocol | 本文描述了一种用于新鲜人类头颈部肿瘤标本解离及荧光激活细胞分选获取活性单细胞的逐步操作方案 | 提供了一种标准化的头颈部肿瘤组织解离与单细胞分选流程，支持下游单细胞RNA测序和三维患者来源类器官生成等应用 | NA | 建立头颈部肿瘤单细胞研究的前处理实验方案 | 人类头颈部肿瘤组织 | digital pathology | head and neck cancer | fluorescence-activated cell sorting (FACS), single-cell RNA sequencing, organoid culture | NA | NA | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 18 | 2026-03-28 |
Isolating peripheral blood mononuclear cells from HIV-infected patients for single-cell RNA sequencing and integration analysis
2023-Jun-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102222
PMID:37060557
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研究论文 | 本文介绍了一种从HIV感染患者中分离外周血单个核细胞并进行单细胞RNA测序及整合分析的实验方案 | 结合10x Genomics单细胞测序技术和Illumina NovaSeq平台，对HIV感染患者的PBMCs进行单细胞转录组分析，并整合B细胞亚群功能和BCR受体库轨迹分析 | 未提及样本量大小或具体患者特征，可能限制结果的普适性 | 研究HIV感染对免疫细胞转录组的影响 | HIV感染患者的外周血单个核细胞 | 单细胞测序 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序 | 10x Genomics protocol, Illumina NovaSeq 6000 | 10x Genomics单细胞测序方案结合Illumina NovaSeq 6000测序平台 |
| 19 | 2026-03-06 |
Spatial Single-Cell Technologies for Exploring Gastrointestinal Tissue Transcriptome
2023-06-26, Comprehensive Physiology
IF:4.2Q1
DOI:10.1002/cphy.c210053
PMID:37358516
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综述 | 本文总结了空间单细胞转录组技术在探索胃肠道组织转录组方面的最新进展及其对理解胃肠道生理学的促进作用 | 系统综述了新兴的空间单细胞技术如何通过提供全基因组水平的基因表达空间信息，弥补传统方法在解析胃肠道组织结构和细胞异质性方面的不足 | 作为一篇小型综述，未涉及具体实验数据或技术细节的深入分析，主要聚焦于技术概述和应用前景讨论 | 探讨空间单细胞转录组技术在胃肠道组织研究中的应用价值和发展前景 | 胃肠道组织及其多层次结构和异质性细胞群体 | 空间转录组学 | NA | 空间单细胞转录组技术 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 20 | 2026-03-06 |
TFAP2 paralogs regulate midfacial development in part through a conserved ALX genetic pathway
2023-Jun-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.16.545376
PMID:37398373
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研究论文 | 本研究揭示了TFAP2旁系同源物通过调控ALX基因表达，在脊椎动物中面部发育中发挥关键作用 | 首次通过联合失活TFAP2A和TFAP2B，结合bulk和单细胞RNA-seq分析，揭示了TFAP2在调控中面部基因调控网络中的核心作用，并证实了TFAP2-ALX调控轴在脊椎动物间的保守性 | 研究主要基于小鼠和斑马鱼模型，在人类或其他哺乳动物中的直接验证尚需进一步探索 | 探究TFAP2旁系同源物在中面部发育中的调控机制 | 小鼠和斑马鱼的颅神经嵴细胞及中面部发育过程 | 发育生物学 | 面部畸形 | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, ChIP-seq | NA | 基因表达数据, 染色质免疫沉淀数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |