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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-12-04 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals the Difference of Aortic Atherosclerosis Response to Phytosterols and Oxidation Products of Sterols
2023-06, Molecular nutrition & food research
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/mnfr.202200811
PMID:36877953
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,揭示了植物甾醇及其氧化产物对主动脉粥样硬化细胞异质性的不同影响 | 首次在单细胞水平上比较了植物甾醇、胆固醇氧化产物和植物甾醇氧化产物对主动脉细胞组成的差异影响,并鉴定了四个功能不同的成纤维细胞亚群 | 研究基于ApoE-/-小鼠模型,结果可能不完全适用于人类;样本量未明确说明 | 探究饮食中植物甾醇及其氧化产物在动脉粥样硬化发展中对主动脉细胞的影响机制 | ApoE-/-小鼠的主动脉细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2 | 2025-12-02 |
Antigen-driven colonic inflammation is associated with development of dysplasia in primary sclerosing cholangitis
2023-06, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-023-02372-x
PMID:37322120
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研究论文 | 本研究通过分析原发性硬化性胆管炎(PSC)患者的结肠组织,发现了一种独特的适应性炎症转录特征,该特征与PSC患者发生异型增生的更高风险和更短时间相关 | 首次结合流式细胞术、批量与单细胞转录组学以及T和B细胞受体库分析,识别出PSC中与异型增生风险相关的特异性抗原驱动的炎症特征,揭示了PSC与IBD在异型增生机制上的差异 | 样本量相对有限(共221名参与者),且研究主要关注右结肠组织,可能未全面反映整个结肠的炎症状态 | 探究PSC患者结肠炎症与异型增生发展的关联机制,以指导结直肠癌预防 | 65名PSC患者、108名IBD患者和48名健康个体的右结肠组织 | 数字病理学 | 原发性硬化性胆管炎 | 流式细胞术、批量转录组学、单细胞转录组学、T和B细胞受体库分析 | NA | 转录组数据、细胞表型数据 | 221名参与者(65名PSC患者、108名IBD患者、48名健康个体) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3 | 2025-12-02 |
The tumor immune microenvironment of nasopharyngeal carcinoma after gemcitabine plus cisplatin treatment
2023-06, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-023-02369-6
PMID:37280275
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术,揭示了吉西他滨联合顺铂(GP)化疗后鼻咽癌肿瘤免疫微环境的变化,并发现了一种以先天样B细胞(ILB)为中心的抗肿瘤免疫反应机制 | 首次在单细胞分辨率下描绘了GP化疗后鼻咽癌的免疫微环境图谱,并发现了化疗诱导的DNA片段通过STING通路和TLR9信号激活先天样B细胞(ILB)的新型抗肿瘤免疫机制 | 样本量相对有限(15对匹配样本),且为观察性研究,需要进一步的功能性实验验证机制 | 阐明GP化疗在鼻咽癌中发挥临床活性的免疫学机制 | 鼻咽癌患者 | 单细胞组学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序,T细胞和B细胞受体测序 | NA | 单细胞转录组数据,免疫受体序列数据 | 15对匹配的初治与GP化疗后鼻咽癌样本(单细胞测序),一项III期试验中的139名患者(生存分析),以及380名接受GP联合免疫治疗的患者(验证队列) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2025-11-27 |
Chi3l1 Is a Modulator of Glioma Stem Cell States and a Therapeutic Target in Glioblastoma
2023-06-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-21-3629
PMID:37101376
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研究论文 | 本研究揭示Chi3l1通过调控胶质瘤干细胞状态促进胶质母细胞瘤生长的分子机制 | 首次发现Chi3l1通过CD44受体诱导Akt/β-catenin信号通路和MAZ转录活性,形成促进间质表型的正向反馈环路 | NA | 探究Chi3l1在胶质母细胞瘤干细胞状态调控中的作用及其治疗潜力 | 患者来源的胶质瘤干细胞 | 癌症生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,ATAC-seq,RNA velocity | NA | 基因表达数据,表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,ATAC-seq | NA | NA |
| 5 | 2025-11-18 |
Combined lineage tracing and scRNA-seq reveals unexpected first heart field predominance of human iPSC differentiation
2023-06-07, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.80075
PMID:37284748
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研究论文 | 开发结合谱系追踪和单细胞RNA测序的系统,揭示人iPSC分化过程中第一心区祖细胞占主导地位 | 首次建立TBX5/MYL2谱系追踪报告系统,结合单细胞RNA测序全面分析hiPSC心脏分化过程 | 研究基于体外iPSC分化模型,不能完全模拟体内胚胎发育环境 | 研究人诱导多能干细胞向心脏细胞分化的发育轨迹和细胞谱系 | 人诱导多能干细胞(hiPSCs)及其分化产生的心脏祖细胞和心肌细胞 | 发育生物学 | 心血管疾病 | 谱系追踪,单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 2个独立iPSC细胞系,12个时间点 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 基于寡核苷酸样本多重分析的scRNA-seq技术 |
| 6 | 2025-11-15 |
Single-cell meta-analysis of inflammatory bowel disease with scIBD
2023-06, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-023-00464-9
PMID:38177426
|
研究论文 | 开发了一个用于炎症性肠病单细胞元分析的交互式可视化平台scIBD | 首次提供了炎症性肠病单细胞RNA测序数据集的综合集成分析平台,能够识别罕见细胞类型并解析溃疡性结肠炎与克罗恩病的异同 | 未提及具体的数据集规模限制或分析灵敏度限制 | 揭示炎症性肠病的异质性肠道微环境发病机制 | 炎症性肠病患者的单细胞转录组数据 | 生物信息学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7 | 2025-11-14 |
Targeting lymphoid-derived IL-17 signaling to delay skin aging
2023-06, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-023-00431-z
PMID:37291218
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现皮肤老化与淋巴源性IL-17信号通路相关,并证明阻断该通路可延缓皮肤衰老特征 | 首次揭示皮肤衰老过程中T细胞、γδ T细胞和先天淋巴样细胞向IL-17表达表型的倾斜,并证明靶向IL-17信号可延缓皮肤老化 | 研究基于小鼠模型,尚未在人类皮肤中得到验证 | 探究皮肤衰老的炎症机制及干预策略 | 小鼠皮肤真皮层细胞 | 单细胞组学 | 皮肤衰老 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8 | 2025-11-09 |
Cellular senescence in white matter microglia is induced during ageing in mice and exacerbates the neuroinflammatory phenotype
2023-06-23, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-023-05027-2
PMID:37353538
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示白质小胶质细胞在衰老过程中发生细胞衰老,并加剧神经炎症表型 | 首次发现白质小胶质细胞在衰老和疾病模型中发生细胞衰老,并证实共生细菌促进衰老小胶质细胞积累 | 研究主要基于小鼠模型,人类中枢神经系统中的相关性尚需进一步验证 | 探讨中枢神经系统细胞衰老特征及其在神经功能障碍中的作用 | 小鼠脑部和脊髓中的小胶质细胞 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞转录组分析 | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞RNA测序数据 | 多种小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2025-10-05 |
Analysis of Donor Pancreata Defines the Transcriptomic Signature and Microenvironment of Early Neoplastic Lesions
2023-06-02, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-23-0013
PMID:37021392
|
研究论文 | 本研究通过分析脑死亡供体的胰腺组织,首次揭示了成人健康胰腺和早期胰腺肿瘤病变的转录组特征和微环境 | 首次使用脑死亡供体胰腺避免了组织缺血损伤,结合多重免疫组化、单细胞RNA测序和空间转录组学技术,首次全面表征了成人健康胰腺和散发性PanIN病变的独特微环境 | 样本量相对有限(30例供体),且仅包含无已知胰腺疾病的个体 | 研究健康成人胰腺和早期胰腺肿瘤病变的转录组特征和微环境特征 | 脑死亡供体的胰腺组织,包括健康胰腺组织、胰腺癌组织和癌旁组织 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 多重免疫组化,单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 组织图像,单细胞转录组数据,空间转录组数据 | 30例不同年龄和种族的脑死亡供体胰腺样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,多重免疫组化 | NA | NA |
| 10 | 2025-10-05 |
It is better to light a candle than to curse the darkness: single-cell transcriptomics sheds new light on pancreas biology and disease
2023-06, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2022-329313
PMID:36997301
|
综述 | 本文综述单细胞转录组学技术如何革新我们对胰腺生物学和疾病机制的理解 | 利用单细胞转录组学技术首次揭示胰腺中未被描述的上皮细胞和基质细胞类型及其在疾病进展中的动态变化 | NA | 总结单细胞转录组学在胰腺生物学和疾病研究中的应用进展 | 胰腺组织及其相关疾病(特别是胰腺导管腺癌) | 单细胞生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 11 | 2025-10-05 |
Ultraviolet radiation shapes dendritic cell leukaemia transformation in the skin
2023-06, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06156-8
PMID:37286599
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研究论文 | 本研究通过肿瘤系统基因组学和单细胞转录组学分析,揭示了紫外线辐射在皮肤部位塑造树突状细胞白血病转化的机制 | 首次证明紫外线辐射可在远位解剖部位影响前恶性克隆的演化,发现Tet2功能缺失突变使浆细胞样树突状细胞对UV诱导的细胞死亡产生抗性 | 研究样本量有限,主要聚焦于BPDCN这一罕见疾病,机制研究仍需进一步验证 | 探究浆细胞样树突状细胞肿瘤(BPDCN)的发病机制和进化过程 | 浆细胞样树突状细胞肿瘤患者样本 | 数字病理学 | 白血病 | 肿瘤系统基因组学, 单细胞转录组学, 基因分型 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12 | 2025-10-05 |
Deterministic evolution and stringent selection during preneoplasia
2023-06, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06102-8
PMID:37258665
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研究论文 | 通过人类胃类器官模型研究TP53双等位基因失活后的癌前病变演化过程 | 建立了人类胃类器官模型模拟早期肿瘤发生过程,揭示了TP53失活后染色体不稳定的演化规律和克隆选择机制 | 研究基于体外类器官模型,可能与体内真实肿瘤发生环境存在差异 | 探索人类肿瘤发生的最早期事件及其演化规律 | TP53双等位基因失活的人类胃类器官 | 癌症生物学 | 胃癌 | 单细胞测序, 高通量谱系追踪, 实验演化 | 类器官模型 | 基因组数据, 转录组数据 | 多个克隆来源的培养物,历时2年的纵向研究 | NA | 单细胞测序, 谱系追踪 | NA | NA |
| 13 | 2025-10-05 |
Hallmarks of transcriptional intratumour heterogeneity across a thousand tumours
2023-06, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06130-4
PMID:37258682
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研究论文 | 通过整合77项研究的单细胞RNA测序数据,系统分析了24种肿瘤类型中1,163个肿瘤样本的转录组瘤内异质性模式 | 首次大规模整合跨研究单细胞数据,识别出41个保守元程序并归纳为11个瘤内异质性标志 | 基于已有研究的整合分析,可能受原始数据质量和批次效应影响 | 系统表征肿瘤转录组瘤内异质性模式 | 1,163个肿瘤样本涵盖24种肿瘤类型 | 生物信息学 | 多种癌症 | 单细胞RNA测序 | 整合分析 | 单细胞转录组数据 | 1,163个肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 14 | 2025-10-05 |
CCL5-producing migratory dendritic cells guide CCR5+ monocytes into the draining lymph nodes
2023-06-05, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20222129
PMID:36946983
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研究论文 | 本研究揭示了分泌CCL5的迁移性树突状细胞通过CCR5引导单核细胞进入引流淋巴结的新机制 | 首次发现迁移性cDCs通过分泌CCL5引导表达CCR5的单核细胞进入淋巴结,突破了仅CCR7依赖迁移的传统认知 | 研究主要基于小鼠模型,在人体中的适用性需要进一步验证 | 探究单核细胞在缺乏CCR7表达情况下如何进入引流淋巴结的机制 | 树突状细胞、单核细胞、淋巴结单核吞噬细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用多种基因缺陷小鼠模型(Ccl5、Ccr2、Ccr5、Ccr7、Batf3缺陷型) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 15 | 2025-10-05 |
Myelin dysfunction drives amyloid-β deposition in models of Alzheimer's disease
2023-06, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06120-6
PMID:37258678
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研究论文 | 本研究揭示了髓鞘功能障碍通过影响淀粉样前体蛋白加工和分散斑块清除小胶质细胞来驱动阿尔茨海默病模型中β-淀粉样蛋白沉积的机制 | 首次发现髓鞘功能障碍是阿尔茨海默病β-淀粉样蛋白沉积的上游风险因素,并揭示了其通过分散斑块清除小胶质细胞的新型机制 | 研究主要基于小鼠模型,在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究年龄相关髓鞘功能障碍在阿尔茨海默病发病机制中的作用 | 阿尔茨海默病小鼠模型 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | 小鼠疾病模型 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 16 | 2025-10-05 |
CIARA: a cluster-independent algorithm for identifying markers of rare cell types from single-cell sequencing data
2023-06-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.201264
PMID:37294170
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研究论文 | 开发了一种名为CIARA的聚类独立算法,用于从单细胞测序数据中识别稀有细胞类型的标记基因 | 提出不依赖聚类的方法直接识别稀有细胞类型标记基因,可应用于多种单细胞组学数据类型 | NA | 开发识别稀有细胞类型标记基因的计算工具 | 单细胞测序数据中的稀有细胞类型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | CIARA算法 | 单细胞组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 17 | 2025-10-05 |
Transcriptional changes in specific subsets of Drosophila neurons following inhibition of the serotonin transporter
2023-06-24, Translational psychiatry
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41398-023-02521-3
PMID:37355701
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研究论文 | 本研究通过RNA测序分析果蝇蘑菇体神经元在血清素转运蛋白抑制后的转录组变化 | 首次在果蝇特定神经元亚型中系统分析血清素转运蛋白抑制的转录效应,并比较发育期与成年期的差异 | 蘑菇体神经元转录组变化有限,且一个突变等位基因导致显著的人工表达变化 | 探究血清素转运蛋白抑制对特定神经元亚型转录组的影响 | 果蝇蘑菇体中的Kenyon细胞 | 神经科学 | NA | 荧光激活细胞分选,bulk RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 果蝇Kenyon细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 18 | 2025-10-06 |
Leveraging single-cell RNA sequencing to unravel the impact of aging on stroke recovery mechanisms in mice
2023-06-20, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2300012120
PMID:37307473
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示衰老如何通过影响微glia/巨噬细胞与内皮细胞/少突胶质前体细胞间的相互作用来损害中风后脑修复机制 | 首次在单细胞水平系统揭示衰老对中风后脑修复机制的影响,并证明年轻来源的MG/MΦ移植可部分恢复老年小鼠的脑修复功能 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中得到验证;机制研究仍需要进一步深入 | 探究衰老对中风后脑组织修复机制的影响 | 年轻和老年小鼠的中风后脑组织 | 单细胞转录组学 | 中风 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 年轻和老年小鼠在急性期(3天)和慢性期(14天)的中风后脑组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 19 | 2025-10-06 |
Ubiquitin Ligases Siah1a/2 Control Alveolar Macrophage Functions to Limit Carcinogen-Induced Lung Adenocarcinoma
2023-06-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-0258
PMID:37078793
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研究论文 | 本研究揭示泛素连接酶Siah1a/2通过调控肺泡巨噬细胞功能抑制致癌物诱导的肺腺癌发生 | 首次发现Siah1a/2通过调控肺泡巨噬细胞成熟状态和促纤维化基因特征影响肺腺癌发展 | 研究主要基于小鼠模型,临床样本验证仍需扩展 | 探究Siah1a/2在肺泡巨噬细胞功能调控及肺腺癌发生中的作用机制 | 肺泡巨噬细胞、肺腺癌小鼠模型、LUAD患者样本 | 癌症免疫学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序、基因敲除 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据 | 野生型小鼠、基因敲除小鼠、LUAD患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 20 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals sexual diversity in the human bladder and its prospective impacts on bladder cancer and urinary tract infection
2023-06-05, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-023-01535-6
PMID:37277784
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示人类膀胱中的性别差异及其对膀胱癌和尿路感染的潜在影响 | 首次在单细胞水平系统揭示人类膀胱中不同细胞类型的性别特异性基因表达差异 | 基于已发表的单细胞RNA测序数据进行分析,样本来源和数量可能有限 | 探究膀胱相关疾病中性别差异的分子机制 | 人类正常膀胱组织细胞 | 单细胞转录组学 | 膀胱癌,尿路感染 | 单细胞RNA测序 | Monocle2, scMetabolism, SCENIC | 单细胞转录组数据 | 27,437个细胞通过严格质量控制 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |