单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 417 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-03-28 |
Protocol for using single-cell sequencing to study the heterogeneity of NF1 nerve sheath tumors from clinical biospecimens
2023-Jun-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102297
PMID:37167059
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研究论文 | 本文介绍了一种从神经纤维瘤病1型相关神经鞘肿瘤中获取单细胞悬液，并在10x平台上进行转录组分析的实验方案 | 提出了一种针对临床神经鞘肿瘤样本的单细胞测序实验方案，并整合了生物信息学工具进行发育轨迹构建和比较分析 | 该方案主要针对神经纤维瘤病1型相关肿瘤，可能不适用于其他类型肿瘤，且依赖于10x平台技术 | 研究神经纤维瘤病1型相关神经鞘肿瘤的异质性 | 神经纤维瘤病1型相关的神经鞘肿瘤临床样本 | 数字病理学 | 神经纤维瘤病 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x平台单细胞转录组分析 |
| 2 | 2026-03-28 |
Differentiation and single-cell RNA-seq analyses of human pluripotent-stem-cell-derived renal organoids
2023-Jun-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102314
PMID:37220001
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研究论文 | 本文介绍了一种将人类多能干细胞分化为肾脏类器官的协议，包括维护、分化、单细胞RNA-seq分析和验证步骤 | 提供了一种快速、可重复的人类肾脏发育和疾病建模模型，并详细描述了使用CRISPR-Cas9同源定向修复进行基因组工程以生成肾脏疾病模型 | NA | 开发人类肾脏发育和疾病建模的协议 | 人类多能干细胞衍生的肾脏类器官 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA-seq，CRISPR-Cas9 | NA | RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3 | 2026-03-28 |
Protocol to assess fatal embolism risks from human stem cells
2023-Jun-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102268
PMID:37133989
|
研究论文 | 本文提出了一种协议，用于识别人类脂肪来源多能基质细胞（ADSCs）中促栓塞亚群并预测ADSC输注的致命栓塞风险 | 开发了一种结合单细胞RNA-seq数据分析和数学建模的协议，以预测干细胞治疗中的栓塞风险 | 协议细节依赖于先前研究（Yan et al., 2022），可能需进一步验证 | 评估干细胞治疗中的栓塞风险，以提升细胞质量和临床应用安全性 | 人类脂肪来源多能基质细胞（ADSCs） | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA-seq | 数学模型 | 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2026-03-28 |
Isolation of human cutaneous immune cells for single-cell RNA sequencing
2023-Jun-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102239
PMID:37120815
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研究论文 | 本文介绍了一种从人类皮肤中分离高活性免疫细胞用于单细胞RNA测序的协议 | 提出了一种针对人类皮肤屏障特性的高活性免疫细胞分离方法，适用于单细胞RNA测序 | 协议依赖于酶解和流式细胞术，可能对细胞活性有特定要求，且未详细讨论所有潜在技术挑战 | 开发一种从人类皮肤中分离免疫细胞的方法，以支持单细胞RNA测序在炎症性疾病研究中的应用 | 人类皮肤活检样本中的免疫细胞 | 数字病理学 | 炎症性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5 | 2026-03-28 |
Protocol for analyzing γδ T cells from the vagina of diet-induced obese mice using single-cell RNA sequencing and flow cytometry
2023-Jun-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102278
PMID:37289592
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研究论文 | 本文介绍了一种在高脂饮食诱导的肥胖小鼠中，通过单细胞RNA测序和流式细胞术分析阴道γδ T细胞的实验方案 | 开发了针对肥胖小鼠阴道γδ T细胞分析的综合实验方案，结合单细胞RNA测序和流式细胞术，以研究肥胖对生殖器疱疹易感性的影响 | NA | 研究肥胖如何影响生殖器疱疹（由HSV-2引起）的易感性，并分析阴道γδ T细胞在其中的作用 | 高脂饮食诱导的肥胖小鼠的阴道γδ T细胞 | 数字病理学 | 生殖器疱疹 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞术数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6 | 2026-03-28 |
Protocol for tumor dissociation and fluorescence-activated cell sorting of human head and neck cancers
2023-Jun-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102294
PMID:37149858
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protocol | 本文描述了一种用于新鲜人类头颈部肿瘤标本解离及荧光激活细胞分选获取活性单细胞的逐步操作方案 | 提供了一种标准化的头颈部肿瘤组织解离与单细胞分选流程，支持下游单细胞RNA测序和三维患者来源类器官生成等应用 | NA | 建立头颈部肿瘤单细胞研究的前处理实验方案 | 人类头颈部肿瘤组织 | digital pathology | head and neck cancer | fluorescence-activated cell sorting (FACS), single-cell RNA sequencing, organoid culture | NA | NA | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 7 | 2026-03-28 |
Isolating peripheral blood mononuclear cells from HIV-infected patients for single-cell RNA sequencing and integration analysis
2023-Jun-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102222
PMID:37060557
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研究论文 | 本文介绍了一种从HIV感染患者中分离外周血单个核细胞并进行单细胞RNA测序及整合分析的实验方案 | 结合10x Genomics单细胞测序技术和Illumina NovaSeq平台，对HIV感染患者的PBMCs进行单细胞转录组分析，并整合B细胞亚群功能和BCR受体库轨迹分析 | 未提及样本量大小或具体患者特征，可能限制结果的普适性 | 研究HIV感染对免疫细胞转录组的影响 | HIV感染患者的外周血单个核细胞 | 单细胞测序 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序 | 10x Genomics protocol, Illumina NovaSeq 6000 | 10x Genomics单细胞测序方案结合Illumina NovaSeq 6000测序平台 |
| 8 | 2026-03-06 |
Spatial Single-Cell Technologies for Exploring Gastrointestinal Tissue Transcriptome
2023-06-26, Comprehensive Physiology
IF:4.2Q1
DOI:10.1002/cphy.c210053
PMID:37358516
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综述 | 本文总结了空间单细胞转录组技术在探索胃肠道组织转录组方面的最新进展及其对理解胃肠道生理学的促进作用 | 系统综述了新兴的空间单细胞技术如何通过提供全基因组水平的基因表达空间信息，弥补传统方法在解析胃肠道组织结构和细胞异质性方面的不足 | 作为一篇小型综述，未涉及具体实验数据或技术细节的深入分析，主要聚焦于技术概述和应用前景讨论 | 探讨空间单细胞转录组技术在胃肠道组织研究中的应用价值和发展前景 | 胃肠道组织及其多层次结构和异质性细胞群体 | 空间转录组学 | NA | 空间单细胞转录组技术 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 9 | 2026-03-06 |
TFAP2 paralogs regulate midfacial development in part through a conserved ALX genetic pathway
2023-Jun-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.16.545376
PMID:37398373
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研究论文 | 本研究揭示了TFAP2旁系同源物通过调控ALX基因表达，在脊椎动物中面部发育中发挥关键作用 | 首次通过联合失活TFAP2A和TFAP2B，结合bulk和单细胞RNA-seq分析，揭示了TFAP2在调控中面部基因调控网络中的核心作用，并证实了TFAP2-ALX调控轴在脊椎动物间的保守性 | 研究主要基于小鼠和斑马鱼模型，在人类或其他哺乳动物中的直接验证尚需进一步探索 | 探究TFAP2旁系同源物在中面部发育中的调控机制 | 小鼠和斑马鱼的颅神经嵴细胞及中面部发育过程 | 发育生物学 | 面部畸形 | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, ChIP-seq | NA | 基因表达数据, 染色质免疫沉淀数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 10 | 2026-03-06 |
Activation of Angiopoietin-Tie2 Signaling Protects the Kidney from Ischemic Injury by Modulation of Endothelial-Specific Pathways
2023-06-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000000000098
PMID:36787763
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研究论文 | 本研究探讨了通过激活Angiopoietin-Tie2信号通路来保护肾脏免受缺血性损伤的分子机制，并测试了一种新型angiopoietin模拟物Hepta-ANG1的治疗潜力 | 揭示了VE-PTP在缺血再灌注损伤中上调并抑制Tie2的机制，首次展示了Hepta-ANG1作为新型治疗生物制剂在单细胞水平上促进肾脏内皮细胞新亚群出现的能力 | 研究基于小鼠模型，尚未在人类临床试验中验证Hepta-ANG1的安全性和有效性 | 探究Angiopoietin-Tie2信号通路在缺血再灌注急性肾损伤中的保护作用及分子机制 | 小鼠肾脏内皮细胞及缺血再灌注损伤模型 | 单细胞组学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 使用VE-PTP野生型或敲除小鼠及C57BL/6J小鼠进行实验 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11 | 2026-03-02 |
CX3CR1+ Macrophage Facilitates the Resolution of Allergic Lung Inflammation via Interacting CCL26
2023-06-01, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202209-1670OC
PMID:36790376
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研究论文 | 本研究揭示了CX3CR1+巨噬细胞通过与CCL26相互作用，在解决过敏性肺部嗜酸性粒细胞炎症中的关键作用 | 首次阐明了气道来源的CCL26通过激活CX3CR1+巨噬细胞分泌C1q，从而促进嗜酸性粒细胞清除的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 探究组织驻留巨噬细胞在嗜酸性过敏性肺部炎症消退过程中的细胞机制 | 人类和小鼠的肺泡巨噬细胞亚群、嗜酸性粒细胞、气道上皮细胞 | 免疫学 | 过敏性肺部疾病 | 质谱流式细胞术、单细胞RNA测序、生物物理和免疫学分析 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白质表达数据 | 人类过敏原激发样本、小鼠过敏性肺部炎症模型、条件性CCL26敲除转基因小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12 | 2026-03-02 |
Matrix stiffness enhances cancer-macrophage interactions and M2-like macrophage accumulation in the breast tumor microenvironment
2023-06, Acta biomaterialia
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.actbio.2022.04.031
PMID:35483629
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，探究了基质硬度对乳腺癌肿瘤微环境中细胞异质性和细胞间通讯的影响 | 首次在体内外结合单细胞RNA测序和生物材料平台，系统揭示了基质硬度通过调节CSF-1表达影响肿瘤相关巨噬细胞招募和M2表型极化的新机制 | 研究基于MMTV-PyMT小鼠模型，结论在人类乳腺癌中的普适性有待验证；未深入探究硬度影响CSF-1表达的具体信号通路 | 探究肿瘤基质硬度对肿瘤内异质性、细胞间通讯及巨噬细胞表型的影响 | MMTV-PyMT小鼠乳腺肿瘤模型、乳腺癌细胞、肿瘤相关巨噬细胞 | 单细胞组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 13 | 2026-02-15 |
A cell marker-based clustering strategy (cmCluster) for precise cell type identification of scRNA-seq data
2023-Jun, Quantitative biology (Beijing, China)
DOI:10.15302/J-QB-022-0311
PMID:41675663
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研究论文 | 本文提出了一种基于细胞标记的聚类策略（cmCluster），用于单细胞RNA测序数据的精确细胞类型识别 | cmCluster结合遗传算法和网格搜索优化Louvain聚类方法，平衡聚类准确性和生物学解释，即使在细胞类型信息不完整或多数据源情况下也能有效识别细胞群体 | 未明确说明策略在大型数据集上的计算效率或与其他先进方法的全面比较 | 开发一种精确且高效的单细胞转录组数据分析策略，以改善细胞聚类和注释的准确性 | 单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | Louvain聚类方法、遗传算法 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 14 | 2026-01-07 |
Genetic and immune determinants of E. coli liver abscess formation
2023-Jun-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.11.543319
PMID:37398354
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和单细胞RNA测序技术，揭示了小鼠肝脏脓肿形成的遗传和免疫决定因素，特别是TLR4介导的早期炎症反应在脓肿易感性中的作用 | 首次结合空间转录组学和单细胞RNA测序技术，系统性地描述了E. coli肝脏脓肿的免疫细胞组成和遗传易感性，并发现TLR4介导的早期炎症反应在脓肿形成与细菌清除之间的权衡机制 | 研究主要基于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类；脓肿形成的详细分子机制仍需进一步探索 | 探究E. coli肝脏脓肿形成的宿主遗传和免疫决定因素 | 小鼠肝脏组织及E. coli感染模型 | 数字病理学 | 肝脏感染 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多种小鼠品系（如C57BL/6N雌性） | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 15 | 2026-01-07 |
ENPP1 is an innate immune checkpoint of the anticancer cGAMP-STING pathway
2023-Jun-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.01.543353
PMID:37333273
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研究论文 | 本文揭示了ENPP1作为抗癌cGAMP-STING通路中的先天免疫检查点，通过抑制细胞外cGAMP水解和激活免疫抑制性腺苷信号，促进乳腺癌生长和转移 | 首次在单细胞水平上证明ENPP1通过协同抑制cGAMP-STING抗肿瘤免疫和激活免疫抑制性腺苷信号驱动乳腺癌进展，并发现选择性抑制其cGAMP水解活性可恢复旁分泌cGAMP-STING信号 | 研究主要聚焦于乳腺癌，未广泛验证其他癌症类型；机制研究依赖于小鼠模型，临床转化需进一步验证 | 探究ENPP1在肿瘤发生中的分子和细胞机制，特别是其在cGAMP-STING通路中的免疫调节作用 | 乳腺癌细胞、肿瘤微环境中的基质细胞和免疫细胞 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 未明确指定样本数量，但涉及乳腺癌患者数据和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 16 | 2025-12-04 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals the Difference of Aortic Atherosclerosis Response to Phytosterols and Oxidation Products of Sterols
2023-06, Molecular nutrition & food research
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/mnfr.202200811
PMID:36877953
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，揭示了植物甾醇及其氧化产物对主动脉粥样硬化细胞异质性的不同影响 | 首次在单细胞水平上比较了植物甾醇、胆固醇氧化产物和植物甾醇氧化产物对主动脉细胞组成的差异影响，并鉴定了四个功能不同的成纤维细胞亚群 | 研究基于ApoE-/-小鼠模型，结果可能不完全适用于人类；样本量未明确说明 | 探究饮食中植物甾醇及其氧化产物在动脉粥样硬化发展中对主动脉细胞的影响机制 | ApoE-/-小鼠的主动脉细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 17 | 2025-12-02 |
Antigen-driven colonic inflammation is associated with development of dysplasia in primary sclerosing cholangitis
2023-06, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-023-02372-x
PMID:37322120
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研究论文 | 本研究通过分析原发性硬化性胆管炎（PSC）患者的结肠组织，发现了一种独特的适应性炎症转录特征，该特征与PSC患者发生异型增生的更高风险和更短时间相关 | 首次结合流式细胞术、批量与单细胞转录组学以及T和B细胞受体库分析，识别出PSC中与异型增生风险相关的特异性抗原驱动的炎症特征，揭示了PSC与IBD在异型增生机制上的差异 | 样本量相对有限（共221名参与者），且研究主要关注右结肠组织，可能未全面反映整个结肠的炎症状态 | 探究PSC患者结肠炎症与异型增生发展的关联机制，以指导结直肠癌预防 | 65名PSC患者、108名IBD患者和48名健康个体的右结肠组织 | 数字病理学 | 原发性硬化性胆管炎 | 流式细胞术、批量转录组学、单细胞转录组学、T和B细胞受体库分析 | NA | 转录组数据、细胞表型数据 | 221名参与者（65名PSC患者、108名IBD患者、48名健康个体） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 18 | 2025-12-02 |
The tumor immune microenvironment of nasopharyngeal carcinoma after gemcitabine plus cisplatin treatment
2023-06, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-023-02369-6
PMID:37280275
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术，揭示了吉西他滨联合顺铂（GP）化疗后鼻咽癌肿瘤免疫微环境的变化，并发现了一种以先天样B细胞（ILB）为中心的抗肿瘤免疫反应机制 | 首次在单细胞分辨率下描绘了GP化疗后鼻咽癌的免疫微环境图谱，并发现了化疗诱导的DNA片段通过STING通路和TLR9信号激活先天样B细胞（ILB）的新型抗肿瘤免疫机制 | 样本量相对有限（15对匹配样本），且为观察性研究，需要进一步的功能性实验验证机制 | 阐明GP化疗在鼻咽癌中发挥临床活性的免疫学机制 | 鼻咽癌患者 | 单细胞组学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序，T细胞和B细胞受体测序 | NA | 单细胞转录组数据，免疫受体序列数据 | 15对匹配的初治与GP化疗后鼻咽癌样本（单细胞测序），一项III期试验中的139名患者（生存分析），以及380名接受GP联合免疫治疗的患者（验证队列） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 19 | 2025-11-27 |
Chi3l1 Is a Modulator of Glioma Stem Cell States and a Therapeutic Target in Glioblastoma
2023-06-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-21-3629
PMID:37101376
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研究论文 | 本研究揭示Chi3l1通过调控胶质瘤干细胞状态促进胶质母细胞瘤生长的分子机制 | 首次发现Chi3l1通过CD44受体诱导Akt/β-catenin信号通路和MAZ转录活性，形成促进间质表型的正向反馈环路 | NA | 探究Chi3l1在胶质母细胞瘤干细胞状态调控中的作用及其治疗潜力 | 患者来源的胶质瘤干细胞 | 癌症生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,ATAC-seq,RNA velocity | NA | 基因表达数据,表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,ATAC-seq | NA | NA |
| 20 | 2025-11-18 |
Combined lineage tracing and scRNA-seq reveals unexpected first heart field predominance of human iPSC differentiation
2023-06-07, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.80075
PMID:37284748
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研究论文 | 开发结合谱系追踪和单细胞RNA测序的系统，揭示人iPSC分化过程中第一心区祖细胞占主导地位 | 首次建立TBX5/MYL2谱系追踪报告系统，结合单细胞RNA测序全面分析hiPSC心脏分化过程 | 研究基于体外iPSC分化模型，不能完全模拟体内胚胎发育环境 | 研究人诱导多能干细胞向心脏细胞分化的发育轨迹和细胞谱系 | 人诱导多能干细胞(hiPSCs)及其分化产生的心脏祖细胞和心肌细胞 | 发育生物学 | 心血管疾病 | 谱系追踪，单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 2个独立iPSC细胞系，12个时间点 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 基于寡核苷酸样本多重分析的scRNA-seq技术 |