单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 356 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2024-08-05 |
Comparative Genomic and Transcriptomic Profiling Revealed the Molecular Basis of Starch Promoting the Growth and Proliferation of Balantioides coli
2023-May-11, Animals : an open access journal from MDPI
IF:2.7Q1
DOI:10.3390/ani13101608
PMID:37238038
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研究论文 | 该研究揭示了淀粉促进Balantioides coli生长和增殖的分子机制 | 研究首次阐明了淀粉通过激活cAMP/PKA信号通路和抑制PI3K/AKT/mTOR通路影响Balantioides coli生长的机制 | NA | 探讨淀粉对Balantioides coli生长和复制的机制 | Balantioides coli及其相关的基因组和转录组特征 | NA | NA | SMART-seq2单细胞RNA-seq | NA | 基因组数据和转录组数据 | 单个滋养体 |
| 162 | 2024-08-05 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals Evidence of Endothelial Dysfunction in the Brains of COVID-19 Patients with Implications for Glioblastoma Progression
2023-May-05, Brain sciences
IF:2.7Q3
DOI:10.3390/brainsci13050762
PMID:37239234
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研究论文 | 本研究探讨了COVID-19患者大脑中内皮功能障碍的单细胞转录组特征及其对胶质母细胞瘤发展的影响 | 研究揭示了COVID-19与胶质母细胞瘤之间在内皮功能障碍方面的显著重叠 | 研究限制在于仅使用了两个数据集，可能影响结果的普适性 | 研究COVID-19导致的大脑内皮功能障碍及其与胶质母细胞瘤进展的关联 | COVID-19患者的大脑内皮细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了多个COVID-19患者的单细胞转录组数据集（GSE131928和GSE159812） |
| 163 | 2024-08-05 |
[Latest Findings on the Pathogenic Mechanisms of Thoracic Aortic Dissection]
2023-May, Sichuan da xue xue bao. Yi xue ban = Journal of Sichuan University. Medical science edition
DOI:10.12182/20230260101
PMID:37248608
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综述 | 本文总结了功能失调的血管平滑肌细胞在胸主动脉夹层的发病机制和发展中的关键作用 | 探讨了血管平滑肌细胞功能失调的分子机制及其在胸主动脉夹层发病中的特殊角色 | 尚未提供有效的药物治疗方案，且目前的研究仍处于初步阶段 | 探讨胸主动脉夹层的发病机制，以推动有效药物靶点的发现 | 胸主动脉夹层中的功能失调的血管平滑肌细胞 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 164 | 2024-08-07 |
Highly efficient cell-microbead encapsulation using dielectrophoresis-assisted dual-nanowell array
2023-May, PNAS nexus
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/pnasnexus/pgad155
PMID:37252002
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研究论文 | 本文介绍了一种基于介电电泳辅助的双纳米孔阵列（ddNA）设备，用于高效地将细胞与微珠封装 | 该设备通过创新的微结构设计和操作流程，解耦了珠和细胞的加载过程，提高了单细胞捕获和配对率 | NA | 开发一种便携式微流控设备，用于高吞吐量的单细胞分析 | 人类胚胎肾细胞 | 微纳制造技术 | NA | 介电电泳（DEP） | NA | 微流控设备 | 数千个亚纳升微孔对 |
| 165 | 2024-08-08 |
Stem cell decoupling underlies impaired lymphoid development during aging
2023-05-30, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2302019120
PMID:37216517
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研究论文 | 研究探讨了衰老过程中造血干细胞（HSCs）在淋巴细胞发育受损中的作用 | 提出衰老小鼠中造血干细胞与造血功能的普遍解耦，而非髓系偏向，是淋巴细胞生成受损的主要原因 | NA | 探究衰老过程中造血干细胞在淋巴细胞发育受损中的具体机制 | 衰老小鼠的造血干细胞及其在淋巴细胞发育中的作用 | 血液学 | NA | 单细胞RNA测序和免疫表型分析（CITE-Seq） | NA | 细胞 | 老年小鼠的造血干细胞 |
| 166 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis of gastric signet ring cell carcinoma reveals cytological and immune microenvironment features
2023-05-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-38426-4
PMID:37225691
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析胃印戒细胞癌（GSRC），揭示了其细胞学特征和免疫微环境特点 | 首次系统深入地研究了GSRC的细胞学特征和免疫微环境，发现微seminoprotein-beta（MSMB）可作为标记基因用于识别中/低分化腺癌和印戒细胞癌（SRCC） | NA | 探讨GSRC的细胞学特征和免疫微环境，以提高其诊断和治疗准确性 | 胃印戒细胞癌（GSRC）及其细胞和免疫微环境 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 167 | 2024-08-08 |
Immune stimulation recruits a subset of pro-regenerative macrophages to the retina that promotes axonal regrowth of injured neurons
2023-05-24, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-023-01580-3
PMID:37226256
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研究论文 | 本文研究了视网膜神经节细胞（RGCs）损伤后，炎症刺激如何招募特定亚群的促再生巨噬细胞，促进轴突再生 | 首次揭示了炎症刺激招募的巨噬细胞亚群通过分泌促再生因子，通过旁分泌信号促进轴突再生的机制 | NA | 探讨炎症如何通过调节先天免疫反应促进中枢神经系统（CNS）再生 | 视网膜神经节细胞（RGCs）损伤后的再生过程及巨噬细胞的作用 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序和命运图谱技术 | NA | RNA序列 | 大量单细胞样本 |
| 168 | 2024-08-08 |
Identification and validation of diagnostic signature genes in non-obstructive azoospermia by machine learning
2023-05-24, Aging
DOI:10.18632/aging.204749
PMID:37227814
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研究论文 | 本研究利用机器学习方法在非阻塞性无精症中识别并验证了诊断标志基因 | 首次使用Boruta算法和Lasso回归筛选出6个在非阻塞性无精症中低表达的标志基因，并通过LightGBM算法构建模型验证其诊断效能 | NA | 旨在发现非阻塞性无精症的诊断标志基因，以促进其早期诊断 | 非阻塞性无精症及相关基因的表达和调控机制 | 机器学习 | 男性不育 | 机器学习算法（Boruta, Lasso回归, LightGBM）, GSEA算法, 实时定量PCR | LightGBM | 基因表达数据 | 使用了来自GEO数据库的三个训练数据集（GSE45885, GSE45887, GSE108886）和一个外部验证数据集（GSE145467），以及人类睾丸单细胞RNA测序数据集（GSE149512） |
| 169 | 2024-08-05 |
Identification and validation of CCL2 as a potential biomarker relevant to mast cell infiltration in the testicular immune microenvironment of spermatogenic dysfunction
2023-May-23, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-023-01034-2
PMID:37221631
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研究论文 | 本研究揭示了在生精功能障碍的睾丸免疫微环境中，与CCL2相关的变化 | 首次识别并验证CCL2作为与生精功能障碍相关的潜在生物标志物 | 尚未针对特定的生精障碍类型进行深入探讨 | 研究睾丸免疫微环境中免疫因素与生精功能障碍的关系 | 睾丸的肥大细胞浸润水平及其与生精功能的关联 | 数字病理学 | 生精功能障碍 | 单细胞RNA测序、微阵列数据分析、临床数据分析、组织学/病理学染色 | NA | 临床数据、基因表达数据 | 涉及生精功能障碍的睾丸样本 |
| 170 | 2024-08-08 |
Gut AstA mediates sleep deprivation-induced energy wasting in Drosophila
2023-May-23, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-023-00541-3
PMID:37221172
|
研究论文 | 研究使用果蝇模型探讨肠道分泌的激素Allatostatin A (AstA)在严重睡眠剥夺(SD)导致的能量消耗中的作用 | 首次揭示了肠道AstA通过促进脂肪动员激素(Akh)的释放，在睡眠剥夺导致的能量消耗中的分子机制 | NA | 探讨肠道分泌激素在睡眠剥夺导致的能量消耗中的作用及机制 | 果蝇和老鼠 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 成年果蝇和睡眠剥夺小鼠 |
| 171 | 2024-08-05 |
Differentiation and single-cell RNA-seq analyses of human pluripotent-stem-cell-derived renal organoids
2023-May-22, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102314
PMID:37220001
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研究论文 | 本文提出了一种将人类多能干细胞分化为肾类器官的协议 | 提供了一种快速且可重复的人肾发育和肾病建模模型 | NA | 研究人类多能干细胞向肾类器官分化的过程 | 人类多能干细胞及其衍生的肾类器官 | 数字病理学 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 单细胞RNA-seq | NA |
| 172 | 2024-08-07 |
Application of single-cell RNA sequencing analysis of novel breast cancer phenotypes based on the activation of ferroptosis-related genes
2023-May-22, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-023-01086-0
PMID:37212877
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研究论文 | 本研究基于铁死亡相关基因的表达差异，利用单细胞RNA测序分析了乳腺癌的新表型，并通过机器学习建立了预测模型，验证了其在乳腺癌患者中的预后能力 | 首次利用单细胞RNA测序数据系统揭示了高和低铁死亡激活组间的微环境差异，包括转录因子激活状态、细胞伪时特征、细胞通讯、免疫浸润、化疗效率和潜在药物抵抗 | NA | 旨在建立一个基于铁死亡激活相关基因差异表达的模型，并验证其在乳腺癌中的应用 | 乳腺癌患者的铁死亡激活水平及其对肿瘤微环境的影响 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 使用了TCGA-BRCA数据集和GEO数据集 |
| 173 | 2024-08-07 |
A scalable sparse neural network framework for rare cell type annotation of single-cell transcriptome data
2023-05-20, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-023-04928-6
PMID:37210444
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研究论文 | 介绍了一种名为scBalance的集成稀疏神经网络框架，用于单细胞转录组数据的自动细胞类型注释 | scBalance框架结合了自适应权重采样和dropout技术，能够有效处理单细胞RNA测序数据集的不平衡问题，并提高对稀有细胞类型的识别能力 | NA | 开发一种新的方法来提高单细胞RNA测序数据中细胞类型注释的准确性和效率 | 单细胞转录组数据中的细胞类型注释 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 稀疏神经网络 | 转录组数据 | 20个不同规模和平衡程度的单细胞RNA测序数据集 |
| 174 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics reveals heterogeneity and intercellular crosstalk in human intervertebral disc degeneration
2023-May-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.106692
PMID:37216089
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研究论文 | 这篇文章揭示了人类椎间盘退化的异质性和细胞间相互作用 | 首次通过单细胞转录组学揭示了人类椎间盘退化的微环境及其机制 | 该研究主要集中于椎间盘的转录组特征，未探讨其他生物标志物 | 探究人类椎间盘退化的微环境及其机制 | 人类椎间盘中的细胞群体及其在退化不同阶段的特征 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | NA |
| 175 | 2024-08-05 |
PCNT is a prognostic biomarker correlated with tumor immune microenvironment in hepatocellular carcinoma and promotes tumor progression by inhibiting cell cycle arrest
2023-05-19, Aging
DOI:10.18632/aging.204711
PMID:37211383
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研究论文 | PCNT在肝细胞癌中作为预后生物标志物，与肿瘤免疫微环境相关，并通过抑制细胞周期停滞促进肿瘤进展 | 发现PCNT在肝细胞癌中表达升高，与不良的临床病理特征和预后相关，且抑制PCNT能降低肝细胞癌细胞的生存能力、迁移和侵袭能力 | 未详细讨论PCNT在其他癌症中的作用，实验仅限于174名患者的队列和公共数据库 | 研究PCNT在肝细胞癌中的作用及其与肿瘤免疫微环境的关系 | 174名肝细胞癌患者 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达和蛋白表达数据 | 174名肝细胞癌患者 |
| 176 | 2024-08-07 |
RANK+TLR2+ myeloid subpopulation converts autoimmune to joint destruction in rheumatoid arthritis
2023-05-19, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.85553
PMID:37204303
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研究论文 | 本文报道了在类风湿性关节炎（RA）的小鼠模型中，RANK髓系单核细胞中TLR2表达及其α(2,3)唾液酸化的上调介导了从自身免疫到破骨细胞融合和骨吸收的转变，导致关节破坏 | 发现了一种新的RANKTLR2亚群，该亚群负向调节破骨细胞融合，并提供了TRAP单核细胞在骨中的成骨活性的潜在解释 | NA | 探究类风湿性关节炎中从自身免疫到关节破坏的机制 | RANK髓系单核细胞中的TLR2表达及其α(2,3)唾液酸化 | 数字病理学 | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 来自RA小鼠的单细胞RNA测序库 |
| 177 | 2024-08-05 |
Advances in spatial transcriptomics and related data analysis strategies
2023-05-18, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04150-2
PMID:37202762
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review | 本文总结了空间转录组学技术及其数据分析策略 | 论述了空间转录组学的应用及未来潜力，突出其在生物医学研究中的重大突破 | 未提到具体的技术局限，可能导致对某些应用场景的理解不足 | 探讨空间转录组学的技术及其在生物医学研究中的应用 | 空间转录组技术及其在组织结构和细胞微环境相互作用中的应用 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学技术 | NA | RNA数据 | NA |
| 178 | 2024-08-07 |
Identification of RAC1 in promoting brain metastasis of lung adenocarcinoma using single-cell transcriptome sequencing
2023-05-18, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-023-05823-y
PMID:37202394
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术，识别了RAC1在肺腺癌脑转移中的作用及其相关生物标志物和治疗潜力 | 首次通过单细胞转录组测序技术详细分析了RAC1在肺腺癌脑转移中的作用，并验证了其在转移过程中的关键角色 | 研究样本量较小，仅基于有限的患者数据进行分析，可能影响结果的普遍性 | 探索肺腺癌脑转移中的生物标志物、相关通路及潜在治疗策略 | 肺腺癌患者的循环肿瘤细胞、原发肿瘤组织和转移肿瘤组织 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 8名肺腺癌患者 |
| 179 | 2024-08-07 |
The cellular and immunological dynamics of early and transitional human milk
2023-05-18, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-023-04910-2
PMID:37202439
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研究论文 | 本研究利用系统方法分析了产后两周内36位母亲的人乳中的62种可溶性成分和细胞成分，并通过单细胞转录组分析识别了24种不同的上皮细胞和免疫细胞群体 | 首次详细描述了人乳中可溶性免疫和生长因子的时间动态变化，并识别了24种不同的细胞群体 | NA | 深入了解人乳中的可溶性和细胞成分，为未来人乳研究提供重要资源 | 人乳中的可溶性成分和细胞成分 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 细胞 | 128,016个人乳细胞 |
| 180 | 2024-08-08 |
Interplay of spermatogonial subpopulations during initial stages of spermatogenesis in adult primates
2023-05-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.201430
PMID:37222410
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研究论文 | 研究分析了成年猕猴精原细胞在精原细胞生成初期的表达谱，并与人类数据进行比较 | 发现了新的早期分化精原细胞亚群，并揭示了这些细胞在精原细胞生成过程中的作用 | NA | 探讨精原细胞亚群在成年灵长类动物精原细胞生成初期的相互作用 | 成年猕猴的精原细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 成年猕猴 |