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当前共找到 356 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2024-08-05 |
The Black Hole: CAR T Cell Therapy in AML
2023-May-11, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers15102713
PMID:37345050
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综述 | 本文讨论了急性髓性白血病中CAR T细胞疗法的独特治疗挑战及新策略 | 提出了针对急性髓性白血病的CAR T细胞和其他细胞治疗的新观念和策略 | 目前仅约30%的患者对治疗有反应，并且存在显著的肿瘤外副作用 | 探讨急性髓性白血病的细胞疗法及其面临的挑战 | 急性髓性白血病患者的CAR T细胞疗法 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | 单细胞测序 | NA | DNA、表观遗传、RNA和蛋白质数据 | 约100名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 142 | 2024-08-07 |
The Novel-Natural-Killer-Cell-Related Gene Signature Predicts the Prognosis and Immune Status of Patients with Hepatocellular Carcinoma
2023-May-31, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24119587
PMID:37298537
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组数据分析筛选与自然杀伤细胞（NK细胞）相关的基因，并开发了一种NK细胞相关基因签名（NKRGS），用于预测肝细胞癌（HCC）患者的预后和免疫状态 | 本研究首次开发了一种新的NK细胞相关基因签名（NKRGS），用于分层HCC患者的预后，并揭示了免疫抑制的肿瘤微环境（TME）与高NKRGS风险之间的关系 | NA | 研究旨在通过开发NK细胞相关基因签名（NKRGS）来预测肝细胞癌患者的预后和免疫状态 | 肝细胞癌（HCC）患者的预后和免疫状态 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞转录组数据分析 | 多重回归分析 | 转录组数据 | 使用了癌症基因组图谱队列中的患者数据 | NA | NA | NA | NA |
| 143 | 2024-08-07 |
Identification of immune-related genes and patient selection for hepatocellular carcinoma immunotherapy
2023-May-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-22-2304
PMID:37304539
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研究论文 | 本研究通过构建肝细胞癌（HCC）细胞基因的异常表达图谱，利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）和多尺度嵌入基因共表达网络分析（MEGENA）等技术，筛选出与HCC免疫治疗相关的潜在生物标志物，并基于这些标志物的共表达网络，通过非负矩阵分解（NMF）选择适合进行免疫治疗的HCC患者。 | 本研究首次通过大规模数据分析，结合单细胞RNA测序和多尺度嵌入基因共表达网络分析，系统地筛选出HCC免疫治疗的潜在生物标志物，并开发了一种基于这些标志物的分子分类系统，用于选择适合免疫治疗的HCC患者。 | 研究主要依赖于公共数据库中的高吞吐量数据，可能存在数据质量和样本代表性的限制。此外，筛选出的生物标志物和分类系统需要在更大规模和多样化的临床样本中进行验证。 | 旨在识别肝细胞癌（HCC）免疫治疗的新型免疫相关生物标志物，并选择适合进行免疫治疗的HCC患者。 | 肝细胞癌（HCC）及其免疫治疗相关的生物标志物和患者选择。 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），多尺度嵌入基因共表达网络分析（MEGENA） | 非负矩阵分解（NMF） | 基因表达数据 | 7,384个样本（3,941个HCC组织 vs. 3,443个非HCC组织） | NA | NA | NA | NA |
| 144 | 2024-08-07 |
Integrated analysis of single-cell and bulk transcriptome identifies a signature based on NK cell marker genes to predict prognosis and therapeutic response in clear cell renal cell carcinoma
2023-May-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-22-2782
PMID:37304554
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量转录组数据，构建了一个基于NK细胞标记基因的特征（NKMS），用于预测透明细胞肾细胞癌（ccRCC）患者的预后和治疗反应 | 本研究首次构建了一个基于NK细胞标记基因的特征（NKMS），并验证了其在预测ccRCC患者预后和治疗反应中的有效性 | NA | 构建一个NK细胞标记基因特征（NKMS），用于预测透明细胞肾细胞癌（ccRCC）患者的预后和治疗反应 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC）患者 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | LASSO和Cox回归 | 转录组数据 | 来自多个数据库的ccRCC患者的单细胞和批量RNA数据 | NA | NA | NA | NA |
| 145 | 2024-08-07 |
[FARSB stratifies prognosis and cold tumor microenvironment across different cancer types: an integrated single cell and bulk RNA sequencing analysis]
2023-May-20, Nan fang yi ke da xue xue bao = Journal of Southern Medical University
|
研究论文 | 本研究通过综合单细胞和批量RNA测序分析，探讨了FARSB基因在泛癌中的表达水平及其对肿瘤微环境和患者免疫治疗反应的影响 | 首次研究FARSB作为冷肿瘤微环境标记物的潜力，并揭示其在促进DNA损伤修复和构建免疫荒漠肿瘤微环境中的生物学功能 | NA | 研究FARSB基因在泛癌中的表达及其对肿瘤微环境和患者免疫治疗反应的影响 | FARSB基因在不同癌症类型中的表达及其对肿瘤微环境和患者免疫治疗反应的影响 | 数字病理学 | 泛癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 25个肿瘤组织样本及正常组织样本，3个免疫检查点抑制剂治疗队列 | NA | NA | NA | NA |
| 146 | 2024-08-05 |
Dkk2 interacts with Pax9 in palate mesenchyme to pattern and tune osteogenesis
2023-May-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.05.16.541037
PMID:37292772
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研究论文 | 这项研究探讨了Dkk2在腭间质中与Pax9相互作用的作用，如何影响骨生成的模式和调节。 | 该研究提供了Dkk2在腭骨发育中的新调节作用，揭示了Wnt信号通路在腭骨模式形成中的重要性。 | 该研究主要依赖于小鼠模型，可能无法完全反映人类腭裂的复杂遗传和环境机制。 | 本研究旨在探讨腭发育过程中骨生成的分子机制。 | 本研究使用了缺乏特定基因的小鼠模型来研究骨生成的能力。 | 数字病理学 | NA | 单细胞核转录组学和染色质可及性实验 | NA | NA | 缺特定基因的小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 147 | 2024-08-07 |
Spatial analysis of stromal signatures identifies invasive front carcinoma-associated fibroblasts as suppressors of anti-tumor immune response in esophageal cancer
2023-May-31, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-023-02697-y
PMID:37254126
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组测序、成像质谱流式细胞术和多重免疫荧光染色技术，分析了食管鳞状细胞癌中基质特征的空间分布及其对预后的影响 | 本文揭示了肿瘤侵袭前沿的纤维母细胞与抗肿瘤免疫反应的抑制关系，并验证了基于α-SMA+纤维母细胞和CD163+巨噬细胞的分子预后模型 | NA | 研究食管鳞状细胞癌中肿瘤微环境基质特征的临床和病理生物学意义 | 食管鳞状细胞癌中的肿瘤微环境基质特征 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞转录组测序、成像质谱流式细胞术、多重免疫荧光染色 | NA | 图像 | 具体样本数量未在摘要中明确 | NA | NA | NA | NA |
| 148 | 2024-08-07 |
Bulk and single-cell transcriptome profiling reveal the metabolic heterogeneity in gastric cancer
2023-05-31, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-35395-y
PMID:37258571
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研究论文 | 本研究通过批量和单细胞转录组测序，揭示了胃癌中的代谢异质性 | 首次将TCGA-STAD数据集分为两个代谢亚型，并从转录组学、基因组学、肿瘤浸润细胞和单细胞分辨率等多个维度详细阐述了亚型间的差异 | NA | 探索胃癌中的代谢异质性 | 胃癌的代谢亚型及其特征 | 数字病理学 | 胃癌 | 转录组测序 | NA | 转录组数据 | 使用了TCGA-STAD数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 149 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the mediatory role of cancer-associated fibroblast PTN in hepatitis B virus cirrhosis-HCC progression
2023-May-31, Gut pathogens
IF:4.3Q2
DOI:10.1186/s13099-023-00554-z
PMID:37259127
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了癌症相关成纤维细胞（CAFs）中的PTN在乙型肝炎病毒（HBV）引起的肝硬化-肝细胞癌（HCC）进展中的中介作用 | 发现了PTN作为CAFs的新中介因子，参与调节HBV肝硬化-HCC的进展 | NA | 探索CAFs中调节HBV肝硬化-HCC进展的新中介因子 | 癌症相关成纤维细胞（CAFs）、肝细胞癌（HCC）、乙型肝炎病毒（HBV）感染 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 肝细胞癌（HCC）的单细胞数据被分为多个子集，具体样本数量未详细说明 | NA | NA | NA | NA |
| 150 | 2024-08-07 |
Unraveling the potential of senescence-related genes in guiding clinical therapy of lung adenocarcinoma patients
2023-May-29, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-023-01073-5
PMID:37246190
|
研究论文 | 本研究探讨了衰老相关基因在肺腺癌临床治疗中的潜在作用 | 首次全面揭示了细胞衰老在肺腺癌中的作用，并建立了基于衰老相关基因的风险模型，用于预测肺腺癌的预后和治疗反应 | 研究主要基于单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，未来需要更多的临床验证 | 探索衰老在肺腺癌进展中的重要作用，并验证衰老相关基因在预测肺腺癌预后和治疗反应中的潜力 | 肺腺癌样本和细胞系 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序 | NA | RNA | 包括一个单细胞RNA测序数据集（GSE149655）和两个批量RNA测序数据集（TCGA和GSE31210） | NA | NA | NA | NA |
| 151 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics reveals immune suppression and cell states predictive of patient outcomes in rhabdomyosarcoma
2023-05-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-38886-8
PMID:37244912
|
研究论文 | 该文章使用单细胞转录组学揭示了横纹肌肉瘤中的免疫抑制和可预测患者结果的细胞状态 | 本研究首次将单细胞mRNA测序应用于横纹肌肉瘤，揭示了免疫微环境的作用及其与患者预后的相关性 | 研究的样本量和肿瘤亚型的覆盖可能有限，可能影响结果的普遍适用性 | 探讨横纹肌肉瘤的细胞分化状态与患者预后的关系 | 针对小儿横纹肌肉瘤，分析恶性肿瘤细胞的转录组状态 | 数字病理学 | 横纹肌肉瘤 | 单细胞mRNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 152 | 2024-08-07 |
Identification of 12 hub genes associated to the pathogenesis of osteoporosis based on microarray and single-cell RNA sequencing data
2023-May-27, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-023-01116-x
PMID:37243790
|
研究论文 | 本研究利用微阵列和单细胞RNA测序数据，识别了与骨质疏松症发病机制相关的12个枢纽基因，并探讨了免疫微环境在此过程中的作用。 | 首次结合微阵列和单细胞RNA测序数据，全面分析了免疫微环境在骨质疏松症发病机制中的作用，并识别了关键的枢纽基因。 | NA | 旨在全面探讨免疫微环境在骨质疏松症发病机制中的作用。 | 骨质疏松症的免疫微环境及相关枢纽基因。 | 数字病理学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 使用了GSE35959、GSE7158和GSE13850数据集以及一位骨质疏松症患者的单细胞RNA测序数据。 | NA | NA | NA | NA |
| 153 | 2024-08-05 |
SMARCB1 regulates a TFCP2L1-MYC transcriptional switch promoting renal medullary carcinoma transformation and ferroptosis resistance
2023-05-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-38472-y
PMID:37236926
|
研究论文 | 该文章研究了SMARCB1如何调节TFCP2L1-MYC转录开关，促进肾髓癌转化和抗铁死亡能力 | 探讨了SMARCB1缺失如何导致肾髓癌细胞的转化及其与抗铁死亡的机制 | 尚未明确肾髓癌的细胞来源及致癌机制 | 研究SMARCB1在肾髓癌转化中的作用及其机制 | 人类肾髓癌的单细胞测序数据 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞测序 | NA | 细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 154 | 2024-08-05 |
scSemiAAE: a semi-supervised clustering model for single-cell RNA-seq data
2023-May-26, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-023-05339-4
PMID:37237310
|
研究论文 | 该研究提出了一个用于单细胞RNA测序数据的半监督聚类模型scSemiAAE | scSemiAAE通过设计一个基于ZINB对抗自编码器的架构，结合了对抗训练和半监督模块，提高了聚类性能 | 未在摘要中具体说明该模型的局限性 | 提高单细胞RNA测序数据的聚类性能和可解释性 | 包括数千到数万个细胞的scRNA-seq数据集 | 数字病理学 | NA | 深度生成神经网络 | 对抗自编码器 | RNA-seq数据 | 数千到数万个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 155 | 2024-08-07 |
Cellular-scale proximity labeling for recording cell spatial organization in mouse tissues
2023-05-26, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adg6388
PMID:37235653
|
research paper | 本文开发了一种名为QMID的化学策略，用于记录小鼠组织中细胞的空间组织，该策略通过酶激活产生QM亲电体，能够标记邻近细胞而不依赖细胞间接触。 | QMID策略的标记半径与细胞尺寸匹配，能够跨越微米级距离标记邻近细胞，为研究细胞间间接通信和细胞空间组织提供了新的方法。 | NA | 开发一种新的化学策略，用于记录细胞在组织中的空间组织。 | 研究细胞间的空间关系及其对基因表达的影响。 | NA | NA | QMID | NA | single-cell RNA sequencing | 涉及小鼠脾脏中的CD4和CD8 T细胞及其邻近细胞。 | NA | NA | NA | NA |
| 156 | 2024-08-07 |
Pluripotent stem cell-derived committed cardiac progenitors remuscularize damaged ischemic hearts and improve their function in pigs
2023-May-26, NPJ Regenerative medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41536-023-00302-6
PMID:37236990
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研究论文 | 本文报道了人多能胚胎干细胞衍生的心脏前体细胞（CCPs）在猪心肌梗死模型中的移植效果，显示其在改善心脏功能和心肌再生方面的潜力 | 首次在猪模型中展示了多能干细胞衍生的心脏前体细胞在心肌梗死治疗中的应用，并观察到显著的心功能改善和心肌再生 | 研究中观察到部分猪出现室性心动过速，尽管所有猪均存活且未形成肿瘤 | 探索多能干细胞衍生的心脏前体细胞在心肌梗死治疗中的应用及其对心脏功能的影响 | 人多能胚胎干细胞衍生的心脏前体细胞及其在猪心肌梗死模型中的移植效果 | 再生医学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 10头猪 | NA | NA | NA | NA |
| 157 | 2024-08-05 |
scMEB: a fast and clustering-independent method for detecting differentially expressed genes in single-cell RNA-seq data
2023-May-25, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-023-09374-6
PMID:37231345
|
研究论文 | 本文提出了一种新的快速方法scMEB，用于在单细胞RNA-seq数据中检测差异表达基因。 | scMEB方法不依赖于先前的细胞聚类结果，利用已知的稳定表达基因来构建最小包围球，并基于映射基因到超球中心的距离来定义差异表达基因。 | 未提及具体的局限性 | 开发一种准确且快速的方法用于单细胞RNA-seq数据中的差异表达基因检测。 | 使用11个真实数据集评估新提出的方法scMEB的表现。 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 11个真实数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 158 | 2024-08-05 |
A T-cell-related signature for prognostic stratification and immunotherapy response in hepatocellular carcinoma based on transcriptomics and single-cell sequencing
2023-May-25, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-023-05344-7
PMID:37231356
|
研究论文 | 该研究提出了一种用于肝细胞癌的T细胞相关预后标志。 | 这项研究开发了一种基于T细胞相关基因的预后签名(TRPS)，并且在多个队列中验证了其有效性。 | 该研究可能受到样本选择和外部验证数据集的限制。 | 研究旨在通过转录组学和单细胞测序评估T细胞标志在肝细胞癌中的作用。 | 研究对象为肝细胞癌患者及其T细胞相关标志。 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | LASSO算法 | 基因组数据 | 181个T细胞标志 | NA | NA | NA | NA |
| 159 | 2024-08-07 |
PD-1 blockade potentiates neoadjuvant chemotherapy in NSCLC via increasing CD127+ and KLRG1+ CD8 T cells
2023-May-25, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-023-00384-x
PMID:37231145
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研究论文 | 本文研究了PD-1阻断剂与新辅助化疗联合治疗非小细胞肺癌（NSCLC）的机制，通过单细胞RNA测序和多重荧光免疫组化分析，揭示了PD-1阻断剂增强化疗效果的免疫细胞机制。 | 首次详细阐述了PD-1阻断剂通过增加CD127+和KLRG1+ CD8 T细胞来增强新辅助化疗效果的机制，并通过空间分布分析和GEO数据集验证了其有效性。 | 研究样本量相对较小，且仅限于手术切除的新鲜肿瘤样本，可能限制了结果的普遍性。 | 探讨PD-1阻断剂与新辅助化疗联合治疗NSCLC的免疫机制，以提高治疗效果。 | 非小细胞肺癌患者及其免疫细胞在PD-1阻断剂与新辅助化疗联合治疗下的反应。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，多重荧光免疫组化 | NA | 免疫细胞数据 | 7名接受新辅助化疗或新辅助化疗联合PD-1阻断剂的NSCLC患者，以及65名接受新辅助化疗或新辅助化疗联合PD-1阻断剂的NSCLC患者的FFPE组织样本。 | NA | NA | NA | NA |
| 160 | 2024-08-07 |
Rapid TCR:Epitope Ranker (RAPTER): a primary human T cell reactivity screening assay pairing epitope and TCR at single cell resolution
2023-05-25, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-35710-7
PMID:37231180
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Rapid TCR:Epitope Ranker (RAPTER)的单细胞RNA测序方法，用于评估功能性T细胞反应性 | RAPTER方法能够以单细胞分辨率定义配对的表位特异性和TCR序列，并包含RNA和蛋白质水平的T细胞表型信息 | NA | 旨在识别T细胞响应的表位，以理解T细胞介导的免疫反应 | 主要使用人源T细胞和抗原呈递细胞(APCs)进行功能性T细胞反应性评估 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-SEQ) | NA | RNA | 涉及低血液体积的主要细胞样本 | NA | NA | NA | NA |