单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 356 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics reveals immune suppression and cell states predictive of patient outcomes in rhabdomyosarcoma
2023-05-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-38886-8
PMID:37244912
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研究论文 | 该文章使用单细胞转录组学揭示了横纹肌肉瘤中的免疫抑制和可预测患者结果的细胞状态 | 本研究首次将单细胞mRNA测序应用于横纹肌肉瘤，揭示了免疫微环境的作用及其与患者预后的相关性 | 研究的样本量和肿瘤亚型的覆盖可能有限，可能影响结果的普遍适用性 | 探讨横纹肌肉瘤的细胞分化状态与患者预后的关系 | 针对小儿横纹肌肉瘤，分析恶性肿瘤细胞的转录组状态 | 数字病理学 | 横纹肌肉瘤 | 单细胞mRNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 142 | 2024-08-07 |
Identification of 12 hub genes associated to the pathogenesis of osteoporosis based on microarray and single-cell RNA sequencing data
2023-May-27, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-023-01116-x
PMID:37243790
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研究论文 | 本研究利用微阵列和单细胞RNA测序数据，识别了与骨质疏松症发病机制相关的12个枢纽基因，并探讨了免疫微环境在此过程中的作用。 | 首次结合微阵列和单细胞RNA测序数据，全面分析了免疫微环境在骨质疏松症发病机制中的作用，并识别了关键的枢纽基因。 | NA | 旨在全面探讨免疫微环境在骨质疏松症发病机制中的作用。 | 骨质疏松症的免疫微环境及相关枢纽基因。 | 数字病理学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 使用了GSE35959、GSE7158和GSE13850数据集以及一位骨质疏松症患者的单细胞RNA测序数据。 |
| 143 | 2024-08-05 |
SMARCB1 regulates a TFCP2L1-MYC transcriptional switch promoting renal medullary carcinoma transformation and ferroptosis resistance
2023-05-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-38472-y
PMID:37236926
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研究论文 | 该文章研究了SMARCB1如何调节TFCP2L1-MYC转录开关，促进肾髓癌转化和抗铁死亡能力 | 探讨了SMARCB1缺失如何导致肾髓癌细胞的转化及其与抗铁死亡的机制 | 尚未明确肾髓癌的细胞来源及致癌机制 | 研究SMARCB1在肾髓癌转化中的作用及其机制 | 人类肾髓癌的单细胞测序数据 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞测序 | NA | 细胞数据 | NA |
| 144 | 2024-08-05 |
scSemiAAE: a semi-supervised clustering model for single-cell RNA-seq data
2023-May-26, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-023-05339-4
PMID:37237310
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研究论文 | 该研究提出了一个用于单细胞RNA测序数据的半监督聚类模型scSemiAAE | scSemiAAE通过设计一个基于ZINB对抗自编码器的架构，结合了对抗训练和半监督模块，提高了聚类性能 | 未在摘要中具体说明该模型的局限性 | 提高单细胞RNA测序数据的聚类性能和可解释性 | 包括数千到数万个细胞的scRNA-seq数据集 | 数字病理学 | NA | 深度生成神经网络 | 对抗自编码器 | RNA-seq数据 | 数千到数万个细胞 |
| 145 | 2024-08-07 |
Cellular-scale proximity labeling for recording cell spatial organization in mouse tissues
2023-05-26, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adg6388
PMID:37235653
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research paper | 本文开发了一种名为QMID的化学策略，用于记录小鼠组织中细胞的空间组织，该策略通过酶激活产生QM亲电体，能够标记邻近细胞而不依赖细胞间接触。 | QMID策略的标记半径与细胞尺寸匹配，能够跨越微米级距离标记邻近细胞，为研究细胞间间接通信和细胞空间组织提供了新的方法。 | NA | 开发一种新的化学策略，用于记录细胞在组织中的空间组织。 | 研究细胞间的空间关系及其对基因表达的影响。 | NA | NA | QMID | NA | single-cell RNA sequencing | 涉及小鼠脾脏中的CD4和CD8 T细胞及其邻近细胞。 |
| 146 | 2024-08-07 |
Pluripotent stem cell-derived committed cardiac progenitors remuscularize damaged ischemic hearts and improve their function in pigs
2023-May-26, NPJ Regenerative medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41536-023-00302-6
PMID:37236990
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研究论文 | 本文报道了人多能胚胎干细胞衍生的心脏前体细胞（CCPs）在猪心肌梗死模型中的移植效果，显示其在改善心脏功能和心肌再生方面的潜力 | 首次在猪模型中展示了多能干细胞衍生的心脏前体细胞在心肌梗死治疗中的应用，并观察到显著的心功能改善和心肌再生 | 研究中观察到部分猪出现室性心动过速，尽管所有猪均存活且未形成肿瘤 | 探索多能干细胞衍生的心脏前体细胞在心肌梗死治疗中的应用及其对心脏功能的影响 | 人多能胚胎干细胞衍生的心脏前体细胞及其在猪心肌梗死模型中的移植效果 | 再生医学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 10头猪 |
| 147 | 2024-08-05 |
scMEB: a fast and clustering-independent method for detecting differentially expressed genes in single-cell RNA-seq data
2023-May-25, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-023-09374-6
PMID:37231345
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研究论文 | 本文提出了一种新的快速方法scMEB，用于在单细胞RNA-seq数据中检测差异表达基因。 | scMEB方法不依赖于先前的细胞聚类结果，利用已知的稳定表达基因来构建最小包围球，并基于映射基因到超球中心的距离来定义差异表达基因。 | 未提及具体的局限性 | 开发一种准确且快速的方法用于单细胞RNA-seq数据中的差异表达基因检测。 | 使用11个真实数据集评估新提出的方法scMEB的表现。 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 11个真实数据集 |
| 148 | 2024-08-05 |
A T-cell-related signature for prognostic stratification and immunotherapy response in hepatocellular carcinoma based on transcriptomics and single-cell sequencing
2023-May-25, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-023-05344-7
PMID:37231356
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研究论文 | 该研究提出了一种用于肝细胞癌的T细胞相关预后标志。 | 这项研究开发了一种基于T细胞相关基因的预后签名(TRPS)，并且在多个队列中验证了其有效性。 | 该研究可能受到样本选择和外部验证数据集的限制。 | 研究旨在通过转录组学和单细胞测序评估T细胞标志在肝细胞癌中的作用。 | 研究对象为肝细胞癌患者及其T细胞相关标志。 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | LASSO算法 | 基因组数据 | 181个T细胞标志 |
| 149 | 2024-08-07 |
PD-1 blockade potentiates neoadjuvant chemotherapy in NSCLC via increasing CD127+ and KLRG1+ CD8 T cells
2023-May-25, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-023-00384-x
PMID:37231145
|
研究论文 | 本文研究了PD-1阻断剂与新辅助化疗联合治疗非小细胞肺癌（NSCLC）的机制，通过单细胞RNA测序和多重荧光免疫组化分析，揭示了PD-1阻断剂增强化疗效果的免疫细胞机制。 | 首次详细阐述了PD-1阻断剂通过增加CD127+和KLRG1+ CD8 T细胞来增强新辅助化疗效果的机制，并通过空间分布分析和GEO数据集验证了其有效性。 | 研究样本量相对较小，且仅限于手术切除的新鲜肿瘤样本，可能限制了结果的普遍性。 | 探讨PD-1阻断剂与新辅助化疗联合治疗NSCLC的免疫机制，以提高治疗效果。 | 非小细胞肺癌患者及其免疫细胞在PD-1阻断剂与新辅助化疗联合治疗下的反应。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，多重荧光免疫组化 | NA | 免疫细胞数据 | 7名接受新辅助化疗或新辅助化疗联合PD-1阻断剂的NSCLC患者，以及65名接受新辅助化疗或新辅助化疗联合PD-1阻断剂的NSCLC患者的FFPE组织样本。 |
| 150 | 2024-08-07 |
Rapid TCR:Epitope Ranker (RAPTER): a primary human T cell reactivity screening assay pairing epitope and TCR at single cell resolution
2023-05-25, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-35710-7
PMID:37231180
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为Rapid TCR:Epitope Ranker (RAPTER)的单细胞RNA测序方法，用于评估功能性T细胞反应性 | RAPTER方法能够以单细胞分辨率定义配对的表位特异性和TCR序列，并包含RNA和蛋白质水平的T细胞表型信息 | NA | 旨在识别T细胞响应的表位，以理解T细胞介导的免疫反应 | 主要使用人源T细胞和抗原呈递细胞(APCs)进行功能性T细胞反应性评估 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-SEQ) | NA | RNA | 涉及低血液体积的主要细胞样本 |
| 151 | 2024-08-05 |
Single-Cell RNA-Seq Analysis Reveals Ferroptosis in the Tumor Microenvironment of Clear Cell Renal Cell Carcinoma
2023-May-22, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24109092
PMID:37240436
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研究论文 | 本研究调查了清细胞肾细胞癌(TME)肿瘤微环境中的铁死亡作用 | 首次识别与清细胞肾细胞癌预后相关的免疫介导的铁死亡基因 | 样本量相对较小，仅包括七个ccRCC病例 | 探讨铁死亡在清细胞肾细胞癌肿瘤微环境中的作用 | 七个清细胞肾细胞癌病例的单细胞数据 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | Cox回归模型 | 基因表达数据 | 7个清细胞肾细胞癌病例 |
| 152 | 2024-08-05 |
The Effect of Lung Resection for NSCLC on Circulating Immune Cells: A Pilot Study
2023-05-17, Current oncology (Toronto, Ont.)
DOI:10.3390/curroncol30050387
PMID:37232845
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研究论文 | 本研究评估了非小细胞肺癌肺切除术前后循环免疫细胞，特别是调节性T细胞亚群的水平。 | 首次系统地分析了肺切除术对循环免疫细胞，特别是Treg亚群的影响 | 样本量较小，仅包括25名患者且部分数据因技术问题被排除 | 评估非小细胞肺癌肺切除术对循环免疫细胞的影响 | 参与研究的患者是接受非小细胞肺癌肺切除术的患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序和TCR测序 | NA | 血液样本 | 共25名患者，最终19名患者参与循环免疫细胞分析 |
| 153 | 2024-08-05 |
Progress and Challenges of Immunotherapy Predictive Biomarkers for Triple Negative Breast Cancer in the Era of Single-Cell Multi-Omics
2023-May-16, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life13051189
PMID:37240834
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综述 | 本文讨论了三阴性乳腺癌免疫治疗预测生物标志物的进展与挑战 | 本文提出使用单细胞多组学分析来识别新的有效生物标志物，突破了传统生物标志物的局限性 | 本文为综述，未提供原始实验数据或直接研究结果 | 探讨并总结如何通过单细胞多组学分析提升三阴性乳腺癌的生物标志物识别 | 三阴性乳腺癌及其相关的免疫治疗特征 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 154 | 2024-08-07 |
Macrophage-Related Testicular Inflammation in Individuals with Idiopathic Non-Obstructive Azoospermia: A Single-Cell Analysis
2023-May-16, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24108819
PMID:37240164
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析技术探讨特发性非阻塞性无精子症（iNOA）的潜在机制及其在睾丸环境中的细胞和分子变化 | 采用单细胞RNA测序和微阵列数据进行生物信息学分析，揭示了iNOA与正常组在生精微环境中的显著差异，并发现了与巨噬细胞相关的睾丸炎症以及潜在的生物标志物 | NA | 旨在理解特发性非阻塞性无精子症（iNOA）的根本原因 | iNOA患者的睾丸组织 | 数字病理学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 155 | 2024-08-05 |
Cellular and Genetic Background of Osteosarcoma
2023-May-15, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb45050276
PMID:37232745
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综述 | 本文总结了骨肉瘤的细胞和遗传背景及其最新进展 | 探讨了新技术如下一代测序和单细胞测序在骨肉瘤研究中的应用 | 针对肿瘤高异质性和不同突变的靶向治疗方法受限 | 研究骨肉瘤的细胞特征及其分子发病机制 | 骨肉瘤及其干细胞的特性和存在 | 数字病理学 | NA | 下一代测序, 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 156 | 2024-08-05 |
Neuromorphological Atlas of Human Prenatal Brain Development: White Paper
2023-May-13, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life13051182
PMID:37240827
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research paper | 该论文提供了关于人类胎儿大脑发育的新在线人类胎儿大脑发育图谱的初始信息 | 介绍了基于不同胎龄的人类胎儿大脑系列切片的前脑注释半球图，并展示了区域特定免疫表型的时空变化 | 没有提到具体的样本大小和实验方法的局限性 | 建立一个人类胎儿大脑发育数据的参考数据库，为神经学研究提供支持 | 人类胎儿大脑的发育过程和相关的免疫表型资料 | 神经学 | 神经退行性疾病和癌症 | 神经超声、X射线计算机断层扫描（CT）和磁共振成像（MRI） | NA | 虚拟切片图像 | NA |
| 157 | 2024-08-05 |
Nuclei Isolation from Mouse Cardiac Progenitor Cells for Epigenome and Gene Expression Profiling at Single-Cell Resolution
2023-05-12, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/65328
PMID:37246858
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研究论文 | 本文提出了一种快速隔离小鼠心脏前体细胞核的新方法 | 首次实现了从冷冻样本中快速隔离细胞核以进行单核双组学分析 | 缺乏对更广泛实验条件的分析 | 开发一种灵活的细胞核隔离方法以支持单细胞基因组和表观基因组分析 | 小鼠心脏前体细胞 | 数字疾病病理学 | 心脏病 | 单细胞RNA测序(snRNA-seq)和单细胞可接近染色质转座酶测定(snATAC-seq) | NA | 细胞核 | 冷冻心脏前体细胞样本 |
| 158 | 2024-08-05 |
Comparative Genomic and Transcriptomic Profiling Revealed the Molecular Basis of Starch Promoting the Growth and Proliferation of Balantioides coli
2023-May-11, Animals : an open access journal from MDPI
IF:2.7Q1
DOI:10.3390/ani13101608
PMID:37238038
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研究论文 | 该研究揭示了淀粉促进Balantioides coli生长和增殖的分子机制 | 研究首次阐明了淀粉通过激活cAMP/PKA信号通路和抑制PI3K/AKT/mTOR通路影响Balantioides coli生长的机制 | NA | 探讨淀粉对Balantioides coli生长和复制的机制 | Balantioides coli及其相关的基因组和转录组特征 | NA | NA | SMART-seq2单细胞RNA-seq | NA | 基因组数据和转录组数据 | 单个滋养体 |
| 159 | 2024-08-05 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals Evidence of Endothelial Dysfunction in the Brains of COVID-19 Patients with Implications for Glioblastoma Progression
2023-May-05, Brain sciences
IF:2.7Q3
DOI:10.3390/brainsci13050762
PMID:37239234
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研究论文 | 本研究探讨了COVID-19患者大脑中内皮功能障碍的单细胞转录组特征及其对胶质母细胞瘤发展的影响 | 研究揭示了COVID-19与胶质母细胞瘤之间在内皮功能障碍方面的显著重叠 | 研究限制在于仅使用了两个数据集，可能影响结果的普适性 | 研究COVID-19导致的大脑内皮功能障碍及其与胶质母细胞瘤进展的关联 | COVID-19患者的大脑内皮细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了多个COVID-19患者的单细胞转录组数据集（GSE131928和GSE159812） |
| 160 | 2024-08-05 |
[Latest Findings on the Pathogenic Mechanisms of Thoracic Aortic Dissection]
2023-May, Sichuan da xue xue bao. Yi xue ban = Journal of Sichuan University. Medical science edition
DOI:10.12182/20230260101
PMID:37248608
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综述 | 本文总结了功能失调的血管平滑肌细胞在胸主动脉夹层的发病机制和发展中的关键作用 | 探讨了血管平滑肌细胞功能失调的分子机制及其在胸主动脉夹层发病中的特殊角色 | 尚未提供有效的药物治疗方案，且目前的研究仍处于初步阶段 | 探讨胸主动脉夹层的发病机制，以推动有效药物靶点的发现 | 胸主动脉夹层中的功能失调的血管平滑肌细胞 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |