单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 356 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2024-08-07 |
RNA polymerase II pausing is essential during spermatogenesis for appropriate gene expression and completion of meiosis
2023-May-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.05.08.539879
PMID:37215034
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研究论文 | 本文通过使用稳态、新生和单细胞RNA测序策略，全面分析了雄性生殖细胞群体中的基因表达，揭示了RNA聚合酶II（Pol II）在精子分化早期暂停的必要性及其在调控基因活性和完成减数分裂中的作用。 | 发现RNA聚合酶II在精子分化早期暂停对于建立发育过程中的基因活性景观至关重要，并揭示了Pol II暂停在减数分裂调控中的新角色。 | NA | 旨在解析雄性生殖细胞发育过程中基因调控的机制，并为治疗相关不孕症提供新见解。 | 雄性生殖细胞及其在精子发生过程中的基因表达调控。 | NA | 不孕症 | RNA测序 | NA | RNA | 涉及多个雄性生殖细胞群体 | NA | NA | NA | NA |
| 122 | 2024-08-07 |
scDisInFact: disentangled learning for integration and prediction of multi-batch multi-condition single-cell RNA-sequencing data
2023-May-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.05.01.538975
PMID:37205545
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研究论文 | 介绍了一种名为scDisInFact的深度学习框架，用于处理和预测多批次、多条件的单细胞RNA测序数据，该框架能够分离批次效应和条件效应 | scDisInFact能够同时执行批次效应去除、条件相关关键基因检测和扰动预测，这在现有方法中是独特的 | NA | 开发一种能够同时处理批次效应和条件效应的深度学习框架，以提高单细胞RNA测序数据整合和预测的准确性 | 多批次、多条件的单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度学习框架 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 123 | 2024-08-07 |
Mesenchymal stem cells ameliorate inflammation in an experimental model of Crohn's disease via the mesentery
2023-May-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.05.22.541829
PMID:37292753
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研究论文 | 研究了人骨髓间充质干细胞（hMSC）在慢性小肠炎症模型中治疗克罗恩病的效果及其机制 | 首次探讨了hMSC在慢性炎症模型中的长期疗效，并通过单细胞RNA测序证实了其通过巨噬细胞重编程发挥作用的机制 | NA | 探讨hMSC在克罗恩病治疗中的作用机制 | 人骨髓间充质干细胞（hMSC）及其在慢性小肠炎症模型中的治疗效果 | NA | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序（Sc-RNAseq） | NA | 单细胞RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 124 | 2024-08-07 |
Ribonucleotide reductase regulatory subunit M2 drives glioblastoma TMZ resistance through modulation of dNTP production
2023-05-19, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ade7236
PMID:37196077
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研究论文 | 研究通过体内单细胞RNA测序分析，探讨了胶质母细胞瘤（GBM）在标准治疗药物替莫唑胺（TMZ）治疗期间细胞可塑性诱导的适应性变化 | 发现了核糖核苷酸还原酶调节亚基M2（RRM2）通过调节dNTP生产在TMZ治疗期间对DNA损伤反应的重要性，并提出了RRM2抑制剂3-AP增强TMZ疗效的新策略 | NA | 探究胶质母细胞瘤在替莫唑胺治疗期间细胞可塑性诱导的适应性变化 | 胶质母细胞瘤（GBM）患者来源的异种移植瘤（PDX）在治疗前、中、后的单细胞转录组 | 数字病理学 | 脑瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组和代谢组数据 | 患者来源的异种移植瘤（PDX）模型 | NA | NA | NA | NA |
| 125 | 2024-08-07 |
scViewer: An Interactive Single-Cell Gene Expression Visualization Tool
2023-05-27, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12111489
PMID:37296611
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研究论文 | 介绍了一个名为scViewer的交互式单细胞基因表达可视化工具，该工具基于R/Shiny应用程序，旨在简化scRNA-seq数据的分析和可视化 | scViewer提供了一个用户友好的图形用户界面，支持细胞类型特异性基因表达、基因共表达分析以及考虑细胞和样本水平变化的差异表达分析 | NA | 开发一个易于探索的单细胞基因表达可视化工具，以促进scRNA-seq数据的多条件比较分析 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 使用了一个公开的阿尔茨海默病研究中的脑细胞数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 126 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing dissects the transcriptional identity of activated fibroblasts and identifies novel persistent distal tubular injury patterns in kidney fibrosis
2023-May-17, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2880248/v1
PMID:37293022
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研究论文 | 该研究通过单细胞转录组分析揭示了肾纤维化中活化成纤维细胞的转录特征，并识别了新的持久远端小管损伤模式 | 首次确定了三种具有特定转录特征的成纤维细胞簇，并识别了肾小管损伤的新空间模式 | 研究未提及样本数量及其具体来源 | 深入理解肾纤维化的分子机制和促进靶向策略的开发 | 分析了两种与临床相关的肾纤维化模型中的单细胞转录组特征 | 数字病理学 | 慢性肾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 127 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomics of murine bone marrow megakaryocytes at single-cell resolution
2023-May, Research and practice in thrombosis and haemostasis
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.rpth.2023.100158
PMID:37255850
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研究论文 | 本研究结合空间转录组学和单细胞序列技术，分析小鼠骨髓巨核细胞的异质性 | 首次在小鼠骨髓中以单细胞分辨率探讨巨核细胞的空间异质性 | 仅分析了小鼠的巨核细胞，可能不适用于其他物种或人类细胞 | 探讨小鼠骨髓巨核细胞的空间分布及其在转录组上的异质性 | C57BL/6J小鼠的骨髓巨核细胞 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 44个单个巨核细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 128 | 2024-08-07 |
Decoding hereditary spastic paraplegia pathogenicity through transcriptomic profiling
2023-May-18, Zoological research
IF:4.0Q1
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综述 | 本文综述了通过转录组分析解码遗传性痉挛性截瘫（HSP）致病性的研究进展 | 探讨了转录组数据与临床表现之间的关联，并强调了跨物种模型的重要性，以及新兴的单细胞RNA测序技术在解决HSP致病性相关未解问题中的潜力 | 尽管识别了70多个新的HSP致病基因，但对HSP的病理生理学和有效管理及治疗策略的开发仍了解不足 | 研究HSP的致病机制，并探索转录组数据与临床表现之间的关系 | 遗传性痉挛性截瘫（HSP）及其致病基因 | NA | 遗传性痉挛性截瘫 | 下一代测序技术 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 129 | 2024-08-07 |
Multilineage contribution of CD34+ cells in cardiac remodeling after ischemia/reperfusion injury
2023-05-05, Basic research in cardiology
IF:7.5Q1
DOI:10.1007/s00395-023-00981-8
PMID:37147443
|
研究论文 | 本研究通过结合单细胞RNA测序和可诱导的Cd34谱系追踪小鼠模型，探讨了Cd34细胞在心脏重塑中的生物学功能及其对心脏重塑的净效应 | 本研究首次揭示了Cd34细胞在心脏重塑过程中的多谱系贡献，并阐明了其在心脏纤维化、血管新生和炎症反应中的具体作用 | NA | 旨在阐明异质性Cd34细胞群的生物学功能，并研究Cd34细胞干预对心脏重塑的净效应 | Cd34细胞在心脏重塑中的作用 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及人和小鼠的缺血心脏样本 | NA | NA | NA | NA |
| 130 | 2024-08-07 |
EPAS1 prevents telomeric damage-induced senescence by enhancing transcription of TRF1, TRF2, and RAD50
2023-May-18, Zoological research
IF:4.0Q1
|
研究论文 | 本研究通过跨物种比较，发现EPAS1基因在蝙蝠纤维母细胞中高表达，增强TRF1、TRF2和RAD50的转录，从而赋予蝙蝠纤维母细胞抵抗衰老的能力 | 首次揭示了EPAS1在蝙蝠和人类中保护端粒的机制，并发现EPAS1激动剂M1001对博来霉素诱导的肺部端粒损伤和衰老具有保护作用 | NA | 探索调节人类肺部疾病中端粒稳定性的潜在机制 | 蝙蝠纤维母细胞和人类肺部内皮细胞 | 分子生物学 | 肺部疾病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 131 | 2024-08-07 |
ARL13B promotes angiogenesis and glioma growth by activating VEGFA-VEGFR2 signaling
2023-05-04, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noac245
PMID:36322624
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研究论文 | 本文研究了ARL13B通过激活VEGFA-VEGFR2信号通路促进血管生成和胶质瘤生长的机制。 | 发现ARL13B通过与VEGFR2相互作用，调控VEGFR2的膜和纤毛定位，从而激活其下游信号，促进血管生成和肿瘤生长。 | NA | 旨在识别参与肿瘤血管生成的潜在信号通路。 | 研究了ARL13B在视网膜和脑部血管发育中的作用，以及在胶质瘤和黑色素瘤模型中对肿瘤生长和血管生成的影响。 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 免疫组织化学, scRNA-seq, GST融合蛋白-蛋白相互作用, 共免疫沉淀 | NA | 组织, 细胞 | 使用转基因小鼠模型和人类胶质瘤组织样本进行研究。 | NA | NA | NA | NA |
| 132 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA-seq analysis reveals BHLHE40-driven pro-tumour neutrophils with hyperactivated glycolysis in pancreatic tumour microenvironment
2023-05, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2021-326070
PMID:35688610
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研究论文 | 这项研究探讨了胰腺导管腺癌中的肿瘤相关中性粒细胞的异质性和促肿瘤机制。 | 发现BHLHE40在中性粒细胞极化为促肿瘤表型中的关键调节作用，并提供了多组学分析验证的支持。 | 研究样本仅限于5名胰腺导管腺癌患者，样本数量较小，可能影响结果的广泛适用性。 | 研究旨在探讨胰腺导管腺癌中非T细胞丰富的肿瘤中性粒细胞的作用。 | 研究对象为来自五名胰腺导管腺癌患者的外周血多形核白细胞及肿瘤浸润免疫细胞。 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组, 蛋白组和代谢组数据 | 来自五名胰腺导管腺癌患者的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 133 | 2024-08-07 |
Role of Up-Regulated Transmembrane Channel-Like Protein 5 in Pancreatic Adenocarcinoma
2023-05, Digestive diseases and sciences
IF:2.5Q2
DOI:10.1007/s10620-022-07771-7
PMID:36459296
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研究论文 | 研究上调的跨膜通道样蛋白5（TMC5）在胰腺腺癌（PAAD）中的作用 | 首次全面验证TMC5在PAAD中的高表达，并探讨其在细胞群体和细胞间通讯中的表达及潜在机制 | 研究结果需要进一步的实验验证 | 探讨TMC5在PAAD中的表达及其临床价值和潜在机制 | 胰腺腺癌（PAAD）中的TMC5表达 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 免疫组织化学（IHC）、微阵列、RNA测序（RNA-seq）、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 组织样本数据 | 148个PAAD样本和19个非PAAD样本，以及1166个PAAD样本和704个非PAAD样本的微阵列和RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 134 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals microenvironment context-specific routes for epithelial-mesenchymal transition in pancreas cancer cells
2023-May-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.05.30.542969
PMID:37398348
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术探讨胰腺癌细胞在缺氧或生长因子诱导下上皮-间质转化（EMT）的转录基础 | 发现FAT1蛋白在上皮细胞中富集并抑制EMT，以及AXL受体酪氨酸激酶在缺氧条件下与YAP核定位相关，这些发现为胰腺癌治疗提供了新的潜在药物靶点 | 研究主要集中在单细胞RNA测序数据分析，未涉及临床试验验证 | 揭示胰腺癌细胞在不同微环境条件下EMT的特定信号通路 | 胰腺癌细胞在缺氧或生长因子诱导下的上皮-间质转化 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 135 | 2024-08-07 |
Identification and Functional Analysis of Transcriptome Profiles, Long Non-Coding RNAs, Single-Nucleotide Polymorphisms, and Alternative Splicing from the Oocyte to the Preimplantation Stage of Sheep by Single-Cell RNA Sequencing
2023-05-25, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes14061145
PMID:37372325
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，从卵母细胞到胚胎着床前阶段，对绵羊细胞的转录组特征、长非编码RNA、单核苷酸多态性和选择性剪接进行了鉴定和功能分析 | 首次系统地分析了从卵母细胞到胚胎着床前各阶段绵羊细胞的转录组特征、长非编码RNA、单核苷酸多态性和选择性剪接，并构建了单细胞图谱 | NA | 研究胚胎发育过程中转录组特征、长非编码RNA、单核苷酸多态性和选择性剪接的作用 | 绵羊从卵母细胞到胚胎着床前阶段的细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 从卵母细胞到胚胎着床前各阶段的绵羊细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 136 | 2024-08-05 |
Prognostic, Immunological, and Mutational Analysis of MTA2 in Pan-Cancer and Drug Screening for Hepatocellular Carcinoma
2023-05-24, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom13060883
PMID:37371463
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研究论文 | 本研究探讨了MTA2在33种癌症中的预后价值及其潜在的免疫功能 | 提供了MTA2在不同癌症类型中的系统性分析及其与肿瘤突变负担和免疫细胞浸润的关联 | 缺乏长期的临床数据验证，实验结果在体外环境下可能无法完全代表体内情况 | 探究MTA2在全癌症中的预后作用及免疫功能 | 33种癌症类型中MTA2的表达和功能 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞测序(scRNA-seq)和免疫组织化学实验 | NA | 数据集分析和生物信息学方法 | HCC细胞系HepG2和不同癌症类型的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 137 | 2024-08-07 |
Revealing the roles of TLR7, a nucleic acid sensor for COVID-19 in pan-cancer
2023-May-09, Biosafety and health
IF:3.5Q1
DOI:10.1016/j.bsheal.2023.05.004
PMID:37362864
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研究论文 | 本研究提出了一种计算框架，全面研究了TLR7在COVID-19和泛癌中的作用，涉及遗传、基因表达、蛋白质、表观遗传和单细胞水平 | 首次系统研究了TLR7在不同癌症中的表达模式及其与COVID-19的关联 | NA | 探讨TLR7在COVID-19和泛癌中的作用及其机制 | TLR7在不同癌症中的表达及其与COVID-19的关联 | 数字病理学 | COVID-19 | 计算框架 | NA | 基因表达数据 | 包括TCGA、GTEx、CCLE、HPA等多个数据库的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 138 | 2024-08-07 |
Decoding the lncRNAome Across Diverse Cellular Stresses Reveals Core p53-effector Pan-cancer Suppressive lncRNAs
2023-05, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-22-0473
PMID:37377895
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研究论文 | 本研究通过结合计算和实验框架，整合泛癌RNAi/CRISPR筛选、基因组、表观遗传和表达谱数据，揭示了跨多种癌症的核心p53转录调控的长非编码RNA（lncRNA），这些lncRNA在不同细胞应激条件下与泛癌细胞生存/生长抑制和患者生存相关。 | 本研究揭示了先前未报告的高可信度核心p53靶向lncRNA，这些lncRNA在不同细胞类型和应激条件下抑制肿瘤发生。 | NA | 研究长非编码RNA在不同细胞应激条件下的转录调控及其在癌症中的功能。 | 长非编码RNA（lncRNA）及其在癌症中的作用。 | 基因组学 | 癌症 | RNAi/CRISPR筛选、单细胞RNA测序 | NA | 基因组、表观遗传和表达谱数据 | 多个癌症类型、多个细胞类型、患者队列 | NA | NA | NA | NA |
| 139 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing in cornea research: Insights into limbal stem cells and their niche regulation
2023-May-26, World journal of stem cells
IF:3.6Q3
DOI:10.4252/wjsc.v15.i5.466
PMID:37342216
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在角膜研究领域的应用，特别是对角膜缘干细胞及其微环境的最新发现 | 介绍了单细胞RNA测序技术揭示的角膜缘干细胞群体的异质性、新的干细胞标志物及其微环境的调控机制 | NA | 总结单细胞RNA测序在角膜研究中的最新进展，为临床治疗如角膜上皮伤口愈合、眼表重建及相关疾病干预提供参考 | 角膜缘干细胞及其微环境 | 数字病理学 | 眼科疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 140 | 2024-08-05 |
Quantifying Intratumoral Heterogeneity and Immunoarchitecture Generated In-Silico by a Spatial Quantitative Systems Pharmacology Model
2023-May-13, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers15102750
PMID:37345087
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研究论文 | 本文探讨了通过空间定量系统药理学模型量化肿瘤内异质性和免疫结构。 | 该研究采用了一种混合模型，将整体患者的分隔定量系统药理学模型与描述肿瘤微环境的空间基于代理的模型结合起来，以量化肿瘤内异质性。 | 由于样本收集时间点的不确定性和数据的局限性，全面理解肿瘤内异质性的作用仍然具有挑战性。 | 该研究的目的是定量评估肿瘤内异质性及其对治疗反应的影响。 | 研究对象为不同类型的肿瘤微环境及其在有效和无效抗PD-1治疗下的免疫结构。 | 数字病理学 | 肿瘤 | 定量系统药理学模型 | 混合模型、基于代理的模型 | 模拟数据 | 代表性的案例 | NA | NA | NA | NA |