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当前共找到 352 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2024-08-05 |
Single-cell RNAseq provides insight into altered immune cell populations in human fracture nonunions
2023-05, Journal of orthopaedic research : official publication of the Orthopaedic Research Society
IF:2.1Q2
DOI:10.1002/jor.25452
PMID:36200412
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研究论文 | 该研究通过单细胞 RNA 测序分析人类骨折不愈合中的免疫细胞群体变化 | 使用单细胞 RNA 测序揭示了骨折不愈合中免疫细胞基因表达的变化 | 样本量较小，仅涉及9名患者 | 探讨骨免疫学在骨折愈合中的作用 | 来自五名股骨不愈合患者的髓腔组织样本 | 数字病理学 | NA | 单细胞 RNA 测序 | NA | 基因表达数据 | 9个样本（5个股骨不愈合样本和4个原生骨对照） | NA | NA | NA | NA |
| 122 | 2024-08-05 |
Inference of cell type-specific gene regulatory networks on cell lineages from single cell omic datasets
2023-05-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-38637-9
PMID:37244909
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研究论文 | 本文提出了一种新颖的方法，通过单细胞组学数据推断特定细胞类型的基因调控网络 | 开发了单细胞多任务网络推断(scMTNI)框架，可以整合scRNA-seq和scATAC-seq数据，推断细胞谱系上的基因调控网络 | 当前方法在整合scRNA-seq和scATAC-seq测量及建模网络动态方面存在局限性 | 旨在提高细胞类型特异性基因调控网络的推断精度 | 特定细胞类型的基因调控网络 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 单细胞可转座酶可及染色质测序(scATAC-seq) | 多任务学习框架 | 模拟数据和真实数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 123 | 2024-08-07 |
TripletCell: a deep metric learning framework for accurate annotation of cell types at the single-cell level
2023-05-19, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad132
PMID:37080771
|
研究论文 | 本文提出了一种名为TripletCell的新型深度度量学习框架，用于跨物种、跨协议和跨样本的细胞类型注释 | TripletCell利用深度度量学习算法，通过特征提取模块TripletCell-FE，有效地处理了scRNA-seq数据中的批次效应和数据异质性问题 | NA | 开发一种高效准确的细胞类型注释方法，以克服传统手动注释的局限性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型注释 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | 深度度量学习 | 基因表达矩阵 | 21个数据集，涵盖九种scRNA-seq协议、两种物种和三种组织 | NA | NA | NA | NA |
| 124 | 2024-08-04 |
Prerequisite endocardial-mesenchymal transition for murine cardiac trabecular angiogenesis
2023-05-08, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.03.009
PMID:37023750
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研究论文 | 本文探讨了小鼠心脏内膜细胞如何通过“血管内皮细胞-间充质转化”机制生成小梁血管 | 首次揭示了小梁血管起源于心室内膜细胞的二步血管内皮细胞-间充质转化机制 | 研究主要集中于小鼠模型，可能对其他物种的应用有限 | 研究心脏小梁血管的起源和发育机制 | 心室内膜细胞及其在小梁血管形成中的作用 | 数字病理学 | 冠心病 | 单细胞转录组学、免疫荧光 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 125 | 2024-08-04 |
Spatial transcriptomics reveals molecular dysfunction associated with Lewy pathology
2023-May-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.05.17.541144
PMID:37292685
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研究论文 | 本研究使用空间转录组学揭示与路易体病理相关的分子功能失调 | 首次识别出在皮质中易患路易体病的特定兴奋性神经元，并提出了路易体相关分子功能失调的基因特征 | 研究仅集中于那些有无病理的皮质神经元，可能未覆盖其他类型神经元的变化 | 探讨哪些神经元易于发展为路易体病，并识别相关的分子变化 | 路易体病的皮质神经元及其转录组特征 | 数字病理学 | 帕金森病 | 空间转录组学 | 小鼠模型 | 转录组数据 | 使用了来自人类及小鼠的多个皮质神经元样本 | NA | NA | NA | NA |
| 126 | 2024-08-07 |
Single-cell atlas of the human neonatal small intestine affected by necrotizing enterocolitis
2023-05, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3002124
PMID:37205711
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研究论文 | 本研究通过结合单细胞RNA测序、T细胞受体β分析、批量转录组学和成像技术，详细描述了坏死性小肠结肠炎（NEC）中细胞身份、相互作用和区域变化的情况 | 本研究首次建立了NEC相关肠道组织中异常上皮-间质-免疫相互作用的详细图谱，并强调了NEC相关肠道组织的细胞失调 | NA | 旨在填补对坏死性小肠结肠炎（NEC）中细胞变化和异常相互作用全面认识的空白 | 人类新生儿受坏死性小肠结肠炎影响的小肠细胞 | 数字病理学 | 新生儿疾病 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 127 | 2024-08-07 |
Single Cell Transcriptomics Identifies Distinct Choroid Cell Populations Involved in Visually Guided Eye Growth
2023-May-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.05.30.542876
PMID:37398381
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术（scRNA-seq）分析了鸡视网膜色素上皮层（choroid）在视觉引导眼球生长过程中的细胞群体及其基因表达变化 | 首次提供了视网膜色素上皮层主要细胞类型及其在视觉引导眼球生长过程中的基因表达变化的综合图谱 | 基因表达变化主要较小（< 2倍），且最高变化出现在一个罕见的细胞群体中 | 阐明视网膜色素上皮层在视觉引导眼球生长过程中的作用 | 鸡视网膜色素上皮层的细胞群体及其在视觉引导眼球生长过程中的基因表达变化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 24个不同的细胞集群，代表了95%的总视网膜色素上皮层细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 128 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis reveals an Angpt4-initiated EPDC-EC-CM cellular coordination cascade during heart regeneration
2023-05-08, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1093/procel/pwac010
PMID:37155312
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了斑马鱼心脏再生过程中由Angpt4启动的EPDC-EC-CM细胞协调级联反应 | 首次全面分析了不同细胞和信号如何相互作用和协调以调节心脏再生，并揭示了Angpt4在心脏再生中的关键作用 | NA | 探讨斑马鱼心脏再生过程中细胞和信号的相互作用机制 | 斑马鱼心脏细胞类型及其在发育和再生过程中的分子进展 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组 | 斑马鱼心脏细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 129 | 2024-08-04 |
Temporal and spatial staging of lung alveolar regeneration is determined by the grainyhead transcription factor Tfcp2l1
2023-05-30, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112451
PMID:37119134
|
研究论文 | 本研究探讨了转录因子Tfcp2l1在肺泡再生过程中对细胞命运的调控作用 | 本研究揭示了Tfcp2l1在肺泡AT2细胞自我更新与分化中的时间和空间调控功能 | 本研究主要基于小鼠模型，可能限制了其在其他物种中的适用性 | 探讨Tfcp2l1在肺泡再生过程中的作用及其机制 | 焦点是肺泡上皮2型（AT2）细胞及其在再生过程中的行为 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞数据 | 通过小鼠进行的多次实验和细胞追踪 | NA | NA | NA | NA |
| 130 | 2024-08-07 |
Transcriptional diversity in specific synaptic gene sets discriminates cortical neuronal identity
2023-05-09, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-023-00372-y
PMID:37161421
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研究论文 | 本文通过结合SynGO数据库和单细胞RNA测序数据，研究了小鼠新皮质中神经元细胞类型的转录多样性，并展示了通过突触基因可以有效区分细胞类型。 | 首次系统地识别了大脑中所有突触群体的转录多样性，并发现突触基因在区分细胞类型方面与所有基因具有相同的能力。 | NA | 量化并识别神经元细胞类型的特定突触特征。 | 小鼠新皮质中的神经元细胞类型。 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 小鼠新皮质中的所有突触群体 | NA | NA | NA | NA |
| 131 | 2024-08-07 |
scJVAE: A novel method for integrative analysis of multimodal single-cell data
2023-05, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2023.106865
PMID:37030268
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为scJVAE的新方法，用于整合和学习多模态单细胞数据的联合表示，并去除批次效应 | scJVAE方法能够有效地去除批次效应并整合配对的scRNA-seq和scATAC-seq数据，优于现有的先进方法 | NA | 研究目的是开发一种新的方法来处理多模态单细胞数据的批次效应和联合表示 | 多模态单细胞数据，特别是scRNA-seq和scATAC-seq数据 | 单细胞组学 | NA | 单细胞技术 | 变分自编码器（VAE） | 多模态数据 | 使用多种配对基因表达和开放染色质数据集进行评估 | NA | NA | NA | NA |
| 132 | 2024-08-07 |
Mesenchymal stem cells ameliorate inflammation in an experimental model of Crohn's disease via the mesentery
2023-May-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.05.22.541829
PMID:37292753
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研究论文 | 研究了人骨髓间充质干细胞（hMSC）在慢性小肠炎症模型中治疗克罗恩病的效果及其机制 | 首次探讨了hMSC在慢性炎症模型中的长期疗效，并通过单细胞RNA测序证实了其通过巨噬细胞重编程发挥作用的机制 | NA | 探讨hMSC在克罗恩病治疗中的作用机制 | 人骨髓间充质干细胞（hMSC）及其在慢性小肠炎症模型中的治疗效果 | NA | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序（Sc-RNAseq） | NA | 单细胞RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 133 | 2024-08-07 |
Ribonucleotide reductase regulatory subunit M2 drives glioblastoma TMZ resistance through modulation of dNTP production
2023-05-19, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ade7236
PMID:37196077
|
研究论文 | 研究通过体内单细胞RNA测序分析，探讨了胶质母细胞瘤（GBM）在标准治疗药物替莫唑胺（TMZ）治疗期间细胞可塑性诱导的适应性变化 | 发现了核糖核苷酸还原酶调节亚基M2（RRM2）通过调节dNTP生产在TMZ治疗期间对DNA损伤反应的重要性，并提出了RRM2抑制剂3-AP增强TMZ疗效的新策略 | NA | 探究胶质母细胞瘤在替莫唑胺治疗期间细胞可塑性诱导的适应性变化 | 胶质母细胞瘤（GBM）患者来源的异种移植瘤（PDX）在治疗前、中、后的单细胞转录组 | 数字病理学 | 脑瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组和代谢组数据 | 患者来源的异种移植瘤（PDX）模型 | NA | NA | NA | NA |
| 134 | 2024-08-07 |
scViewer: An Interactive Single-Cell Gene Expression Visualization Tool
2023-05-27, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12111489
PMID:37296611
|
研究论文 | 介绍了一个名为scViewer的交互式单细胞基因表达可视化工具，该工具基于R/Shiny应用程序，旨在简化scRNA-seq数据的分析和可视化 | scViewer提供了一个用户友好的图形用户界面，支持细胞类型特异性基因表达、基因共表达分析以及考虑细胞和样本水平变化的差异表达分析 | NA | 开发一个易于探索的单细胞基因表达可视化工具，以促进scRNA-seq数据的多条件比较分析 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 使用了一个公开的阿尔茨海默病研究中的脑细胞数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 135 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing dissects the transcriptional identity of activated fibroblasts and identifies novel persistent distal tubular injury patterns in kidney fibrosis
2023-May-17, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2880248/v1
PMID:37293022
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研究论文 | 该研究通过单细胞转录组分析揭示了肾纤维化中活化成纤维细胞的转录特征，并识别了新的持久远端小管损伤模式 | 首次确定了三种具有特定转录特征的成纤维细胞簇，并识别了肾小管损伤的新空间模式 | 研究未提及样本数量及其具体来源 | 深入理解肾纤维化的分子机制和促进靶向策略的开发 | 分析了两种与临床相关的肾纤维化模型中的单细胞转录组特征 | 数字病理学 | 慢性肾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 136 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomics of murine bone marrow megakaryocytes at single-cell resolution
2023-May, Research and practice in thrombosis and haemostasis
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.rpth.2023.100158
PMID:37255850
|
研究论文 | 本研究结合空间转录组学和单细胞序列技术，分析小鼠骨髓巨核细胞的异质性 | 首次在小鼠骨髓中以单细胞分辨率探讨巨核细胞的空间异质性 | 仅分析了小鼠的巨核细胞，可能不适用于其他物种或人类细胞 | 探讨小鼠骨髓巨核细胞的空间分布及其在转录组上的异质性 | C57BL/6J小鼠的骨髓巨核细胞 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 44个单个巨核细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 137 | 2024-08-07 |
Decoding hereditary spastic paraplegia pathogenicity through transcriptomic profiling
2023-May-18, Zoological research
IF:4.0Q1
|
综述 | 本文综述了通过转录组分析解码遗传性痉挛性截瘫（HSP）致病性的研究进展 | 探讨了转录组数据与临床表现之间的关联，并强调了跨物种模型的重要性，以及新兴的单细胞RNA测序技术在解决HSP致病性相关未解问题中的潜力 | 尽管识别了70多个新的HSP致病基因，但对HSP的病理生理学和有效管理及治疗策略的开发仍了解不足 | 研究HSP的致病机制，并探索转录组数据与临床表现之间的关系 | 遗传性痉挛性截瘫（HSP）及其致病基因 | NA | 遗传性痉挛性截瘫 | 下一代测序技术 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 138 | 2024-08-07 |
Multilineage contribution of CD34+ cells in cardiac remodeling after ischemia/reperfusion injury
2023-05-05, Basic research in cardiology
IF:7.5Q1
DOI:10.1007/s00395-023-00981-8
PMID:37147443
|
研究论文 | 本研究通过结合单细胞RNA测序和可诱导的Cd34谱系追踪小鼠模型，探讨了Cd34细胞在心脏重塑中的生物学功能及其对心脏重塑的净效应 | 本研究首次揭示了Cd34细胞在心脏重塑过程中的多谱系贡献，并阐明了其在心脏纤维化、血管新生和炎症反应中的具体作用 | NA | 旨在阐明异质性Cd34细胞群的生物学功能，并研究Cd34细胞干预对心脏重塑的净效应 | Cd34细胞在心脏重塑中的作用 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及人和小鼠的缺血心脏样本 | NA | NA | NA | NA |
| 139 | 2024-08-07 |
EPAS1 prevents telomeric damage-induced senescence by enhancing transcription of TRF1, TRF2, and RAD50
2023-May-18, Zoological research
IF:4.0Q1
|
研究论文 | 本研究通过跨物种比较，发现EPAS1基因在蝙蝠纤维母细胞中高表达，增强TRF1、TRF2和RAD50的转录，从而赋予蝙蝠纤维母细胞抵抗衰老的能力 | 首次揭示了EPAS1在蝙蝠和人类中保护端粒的机制，并发现EPAS1激动剂M1001对博来霉素诱导的肺部端粒损伤和衰老具有保护作用 | NA | 探索调节人类肺部疾病中端粒稳定性的潜在机制 | 蝙蝠纤维母细胞和人类肺部内皮细胞 | 分子生物学 | 肺部疾病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 140 | 2024-08-07 |
ARL13B promotes angiogenesis and glioma growth by activating VEGFA-VEGFR2 signaling
2023-05-04, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noac245
PMID:36322624
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研究论文 | 本文研究了ARL13B通过激活VEGFA-VEGFR2信号通路促进血管生成和胶质瘤生长的机制。 | 发现ARL13B通过与VEGFR2相互作用，调控VEGFR2的膜和纤毛定位，从而激活其下游信号，促进血管生成和肿瘤生长。 | NA | 旨在识别参与肿瘤血管生成的潜在信号通路。 | 研究了ARL13B在视网膜和脑部血管发育中的作用，以及在胶质瘤和黑色素瘤模型中对肿瘤生长和血管生成的影响。 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 免疫组织化学, scRNA-seq, GST融合蛋白-蛋白相互作用, 共免疫沉淀 | NA | 组织, 细胞 | 使用转基因小鼠模型和人类胶质瘤组织样本进行研究。 | NA | NA | NA | NA |