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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
81 2024-08-05
Adenomyosis: single-cell transcriptomic analysis reveals a paracrine mesenchymal-epithelial interaction involving the WNT/SFRP pathway
2023-05, Fertility and sterility IF:6.6Q1
研究论文 该研究通过单细胞转录组分析评估了腺肌症的细胞和分子景观 揭示了腺肌症中与WNT/SFRP通路相关的间充质-上皮相互作用的独特特征 样本量较小,仅包括3名患者 评估腺肌症的细胞和分子特点 分析来自腺肌症、内膜和肌层的匹配组织的单细胞RNA表达 数字病理学 腺肌症 单细胞RNA测序 NA RNA 3名患者的匹配组织样本 NA NA NA NA
82 2024-08-04
Effective Rapid Blood Perfusion in Xenopus
2023-May-16, Journal of visualized experiments : JoVE
研究论文 本文定义了一种快速血液灌注的协议,以大幅减少蛙类组织中的血液. 该研究创新性地提出了一种通过直接在心脏腔室内插入针头进行快速灌注的方法. 该协议在本研究中可能未考虑不同个体间的生理差异. 研究致力于标准化蛙类组织采样的实践. 研究对象包括不同性别、年龄和健康状态的非洲爪蟾(Xenopus laevis 和 Xenopus tropicalis). 数字病理学 NA 生理盐水灌注 NA NA 每只动物大约需要10分钟的误差. NA NA NA NA
83 2024-08-04
Accurate integration of multiple heterogeneous single-cell RNA-seq data sets by learning contrastive biological variation
2023-05, Genome research IF:6.2Q1
研究论文 本文介绍了一个新的单细胞RNA测序数据集整合方法 scInt scInt通过构建精确、稳健的细胞间相似性并学习统一的对比生物变异,从多个数据集中进行有效整合,超越了现有的十种 cutting-edge 方法 针对复杂实验设计的整合效果仍需进一步验证 实现多种异质单细胞RNA测序数据集的有效整合 不同生物条件下的单细胞异质样本及其功能性亚群体 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 数据集 涉及多种生物条件的多个模拟和真实数据集 NA NA NA NA
84 2024-08-05
Upregulation of acid ceramidase contributes to tumor progression in tuberous sclerosis complex
2023-05-08, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究探讨了酸性神经酰胺酶在结节性硬化症中对肿瘤进展的贡献 研究首次揭示了TSC2缺失细胞中ASAH1上调与肿瘤形成相关的机制 仅在小鼠模型中进行实验,未在人类样本中验证结果 探讨ASAH1在结节性硬化症(TSC)和淋巴管平滑肌肉瘤(LAM)中的作用 研究对象为结节性硬化症相关突变细胞及其小鼠异种移植模型 数字病理学 结节性硬化症 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 使用了TSC2缺失的小鼠模型和人类细胞样本 NA NA NA NA
85 2024-08-04
Dissociation protocols used for sarcoma tissues bias the transcriptome observed in single-cell and single-nucleus RNA sequencing
2023-May-31, BMC cancer IF:3.4Q2
研究论文 本文研究了不同肉瘤亚型的细胞分离方法对转录组的影响 首次阐明了分离方法对肉瘤患者衍生肿瘤样本分子特征解读的影响 仅探讨了三种肉瘤亚型,可能不适用于所有肉瘤类型 评估不同的细胞分离方法如何影响肉瘤样本的转录组数据 患者来源的肉瘤样本及其相应的单细胞和单核RNA测序数据 数字病理 肉瘤 RNA测序 NA 基因表达数据 125,831个细胞和细胞核 NA NA NA NA
86 2024-08-05
Clonally expanded, thyrotoxic effector CD8+ T cells driven by IL-21 contribute to checkpoint inhibitor thyroiditis
2023-05-17, Science translational medicine IF:15.8Q1
研究论文 本研究揭示了IL-21驱动的克隆扩展的效应CD8+ T细胞在免疫检查点抑制剂相关甲状腺炎中的作用 首次直接比较了免疫检查点抑制剂甲状腺炎与自身免疫性桥本甲状腺炎的免疫浸润,揭示了IL-21在甲状腺毒性CD8 T细胞中的关键作用 研究主要依赖于小鼠模型,缺乏临床试验数据支持 探讨免疫检查点抑制剂相关副作用的免疫机制及潜在治疗靶点 包括接受免疫检查点抑制剂治疗的患者和桥本甲状腺炎患者的甲状腺样本 数字病理学 自身免疫性疾病 单细胞RNA测序 小鼠模型 组织样本 涉及多个患者的甲状腺样本 NA NA NA NA
87 2024-08-04
Investigating the Role of Ferroptosis-Related Genes in Ovarian Aging and the Potential for Nutritional Intervention
2023-05-25, Nutrients IF:4.8Q1
研究论文 本研究探讨了铁死亡相关基因对卵巢衰老的影响及营养干预的潜力 首次结合空间转录组学和单细胞RNA测序研究铁死亡与卵巢衰老的关系 缺乏广泛的样本数据支持和长期效果评估 探讨铁死亡相关基因在卵巢衰老中的作用及营养补充的效果 75名卵巢衰老不足患者 数字病理学 NA 空间转录组学, 单细胞RNA测序 NA 组织样本 75名患者 NA NA NA NA
88 2024-08-04
Cardiac pericytes mediate the remodeling response to myocardial infarction
2023-05-15, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 这篇文章探讨了心脏周细胞在心肌梗死后的重塑反应中的作用 首次揭示了心脏周细胞在急性缺血损伤后调控血管稳态和纤维化反应的关键角色 未详细探讨心脏周细胞的全部作用机制 旨在阐明心脏周细胞在缺血性重塑中的角色 心脏周细胞与心肌梗死后的纤维化及血管通透性变化 数字病理学 心脏病 单细胞RNA测序 小鼠模型 基因表达数据 多个来源的心脏周细胞样本 NA NA NA NA
89 2024-08-04
IL-13-associated epithelial remodeling correlates with clinical severity in nasal polyposis
2023-05, The Journal of allergy and clinical immunology IF:11.4Q1
研究论文 这篇文章探讨了上皮细胞重塑与慢性鼻窦炎的炎症表型和疾病结果之间的关系 本研究首次通过单细胞测序和RNA测序分析,揭示了IL-13介导的上皮重塑与鼻息肉临床严重程度之间的相关性 研究的样本主要来自于慢性鼻窦炎患者,未涵盖所有潜在的鼻窦炎类型及其相应的临床数据 本研究旨在理解上皮细胞重塑与慢性鼻窦炎的炎症表型和疾病结果之间的关系 研究对象为慢性鼻窦炎患者,比较有鼻息肉和无鼻息肉患者的上皮细胞特征 数字病理学 NA RNA测序 NA 基因表达数据 参与研究的样本包括来自慢性鼻窦炎患者的筛查样本和健康对照样本 NA NA NA NA
90 2024-08-05
Age-associated B cells are heterogeneous and dynamic drivers of autoimmunity in mice
2023-05-01, The Journal of experimental medicine IF:12.6Q1
研究论文 年龄相关的B细胞(ABCs)在小鼠中是异质性和动态的自身免疫驱动因子 首次揭示了ABCs在狼疮发病机制中的直接作用及其异质性和动态特性 研究主要集中于小鼠模型,临床相关性尚未得到验证 探讨年龄相关B细胞在自身免疫病中的作用 小鼠中的年龄相关B细胞及其在自身免疫中的作用 数字病理学 狼疮 scRNA-seq MRL/lpr SLE模型 细胞数据 NA NA NA NA NA
91 2024-08-05
Osteoblast-intrinsic defect in glucose metabolism impairs bone formation in type II diabetic male mice
2023-05-05, eLife IF:6.4Q1
研究论文 本研究揭示了糖尿病小鼠骨生成受损的机制,强调了骨母细胞内在的葡萄糖代谢缺陷 首次识别糖尿病小鼠中骨母细胞内在的葡萄糖代谢缺陷是糖尿病性骨质疏松的潜在原因 仅在小鼠模型中进行研究,限制了结果对人类的直接适用性 探讨2型糖尿病对骨生成的影响及其机制 以青少年2型糖尿病小鼠为研究对象 数字病理学 糖尿病性骨质疏松 稳定同位素追踪,Seahorse测定,单细胞RNA测序 NA 生物样本 NA NA NA NA NA
92 2024-08-05
Genetic and Molecular Contributors in Eosinophilic Esophagitis
2023-05, Current allergy and asthma reports IF:5.4Q1
综述 本文旨在提供关于嗜酸性食管炎的遗传和分子进展的历史和最新更新 文章总结了最近的遗传和分子进展,强调了多种发现对理解该疾病的影响 没有明确提及具体的限制 旨在深入理解嗜酸性食管炎的遗传和分子机制 研究嗜酸性食管炎的遗传和分子因素 数字病理学 嗜酸性食管炎 新一代测序技术,包括全基因组关联研究、全外显子测序和RNA测序 NA 基因组数据 NA NA NA NA NA
93 2024-08-04
Re-convolving the compositional landscape of primary and recurrent glioblastoma reveals prognostic and targetable tissue states
2023-05-04, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文研究了原发性和复发性胶质母细胞瘤中的细胞组成和转录状态 通过研究特定亚群体之间的共居模式识别了三种组成性组织状态,并提出了针对GBM微环境相互依赖性的治疗方案 未说明样本数量和研究范围的具体限制 本研究旨在确定原发性和复发性胶质母细胞瘤的细胞组成及其转录状态 研究对象为原发性和复发性胶质母细胞瘤中的细胞类型及其相互关系 数字病理学 脑肿瘤 单核RNA测序和空间转录组学 NA RNA数据 NA NA NA NA NA
94 2024-08-05
Functional characterization of age-dependent p16 epimutation reveals biological drivers and therapeutic targets for colorectal cancer
2023-May-04, Journal of experimental & clinical cancer research : CR IF:11.4Q1
研究论文 本文探讨了与年龄相关的p16表观突变在结直肠癌中的角色及其潜在的治疗靶点 本研究首次揭示了年龄依赖的p16表观突变在肠道肿瘤发生中的生物驱动因素和治疗靶点 研究主要基于小鼠模型,临床适用性需要进一步验证 改善结直肠癌患者的临床治疗 对携带Apc突变和p16表观突变的小鼠进行肿瘤发展与进展的研究 数字病理学 结直肠癌 RNA测序,单细胞RNA测序 NA 组织样本 小鼠肿瘤和结肠上皮细胞样本 NA NA NA NA
95 2024-08-04
Transcriptomic signature, bioactivity and safety of a non-hepatoxic analgesic generating AM404 in the mid-brain PAG region
2023-May-04, Research square
研究论文 这篇文章探讨了一种新型非肝毒性的镇痛药SRP-001的转录组特征、生物活性和安全性 SRP-001作为一种小分子药物,具有非肝毒性并能够在中脑PAG区域生成AM404,展现出与传统镇痛药相比的创新效果 研究主要集中在转录组学的分析上,未提供大规模的临床验证数据 本研究旨在开发一种安全有效的非opioid镇痛药以替代现有的药物 主要研究对象是SRP-001及其在中脑PAG区域的生物作用及安全性 数字病理学 NA 单细胞转录组测序 NA 生物样本 NA NA NA NA NA
96 2024-08-05
Probe-based bacterial single-cell RNA sequencing predicts toxin regulation
2023-05, Nature microbiology IF:20.5Q1
研究论文 本研究开发了一种基于探针的细菌单细胞RNA测序方法,以研究细菌的转录变异性 创新点在于开发了ProBac-seq方法,利用DNA探针库和现有的商业微流体平台进行细菌单细胞RNA测序 尚未提及具体的局限性 研究细菌在单细胞水平的转录变异性和相关性 研究对象包括拟杆菌和大肠杆菌,以及在病原过程中应用于梭状芽孢杆菌 数字病理学 NA RNA测序 NA 转录组数据 每次实验测序数千个个体细菌细胞 NA NA NA NA
97 2024-08-05
ScRNA-seq revealed an immunosuppression state and tumor microenvironment heterogeneity related to lymph node metastasis in prostate cancer
2023-May-23, Experimental hematology & oncology IF:9.4Q1
研究论文 本研究使用scRNA-seq分析前列腺癌的肿瘤微环境异质性与淋巴结转移相关的免疫抑制状态 本研究揭示了MYC途径在前列腺癌进展和肿瘤微环境免疫抑制中的作用 样本数量较少,可能影响研究结果的普遍性 探索前列腺癌淋巴结转移的机制 前列腺癌组织样本中的细胞 数字病理学 前列腺癌 scRNA-seq NA 细胞数据 32,766个细胞来自四个前列腺癌组织样本 NA NA NA NA
98 2024-08-04
Single-cell transcriptomics of human-skin-equivalent organoids
2023-05-30, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 该研究利用单细胞转录组学比较人类皮肤等效类器官和自然皮肤的特征 该论文通过重建HSE角质形成细胞的分化轨迹,揭示了HSEs中的独特角质形成细胞状态及其与已知体内分化通路的相似性 HSEs存在独特的角质形成细胞状态,并且终末分化受损 研究人类皮肤等效类器官的生物学特性及其分化过程 人类皮肤等效(organoid)培养物、异种移植物和体内表皮 数字病理学 NA 单细胞转录组学 NA NA NA NA NA NA NA
99 2024-08-05
MetaTiME integrates single-cell gene expression to characterize the meta-components of the tumor immune microenvironment
2023-05-06, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 MetaTiME整合单细胞基因表达以表征肿瘤免疫微环境的元组成部分 本研究开发了一个数据驱动框架MetaTiME,以克服手动标注已知基因标记所导致的分辨率和一致性局限性 NA 旨在通过集成多个scRNA-seq数据集来表征肿瘤微环境中的细胞类型和状态 使用数百万TME单细胞数据学习与癌症类型相关的独立基因表达组分 数字病理学 癌症免疫疗法 单细胞RNA测序 数据驱动模型 基因表达数据 数百万TME单细胞 NA NA NA NA
100 2024-08-05
Lymphoid tissues contribute to viral clonotypes present in plasma at early post-ATI in SIV-infected rhesus macaques
2023-May-30, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究揭示了淋巴组织在抗逆转录病毒治疗干预后早期对血浆中病毒克隆型的贡献 通过使用条形码SIVmac239M感染狒狒,监测病毒条形码克隆型的动态,这为减小复发病毒储存库提供了新见解 样本量有限,仅涉及七只狒狒,并且在某些情况下血浆病毒RNA仍然低于检测阈值 探究抗逆转录病毒治疗干预后,病毒群体的细胞和组织来源以及动态变化 感染了SIV的狒狒,具体分析了其血液和多种淋巴及非淋巴组织样本 数字病理学 NA 条形码测序、完整前病毒DNA检测、单细胞RNA测序、结合CODEX/RNAscope/杂交 NA 血液和组织样本 七只狒狒 NA NA NA NA
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