单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 356 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2024-08-05 |
Speed and navigation control of thymocyte development by the fetal T-cell gene regulatory network
2023-05, Immunological reviews
IF:7.5Q1
DOI:10.1111/imr.13190
PMID:36722494
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review | 本文回顾了胎儿和成人小鼠胸腺中 T 细胞分化相关的转录因子网络 | 探讨了胎儿 T 细胞发育与成人的不同之处，并强调了转录因子网络的独特性 | 主要基于小鼠模型，可能无法完全转化到人类的机制理解 | 研究胎儿 T 细胞发育过程中的转录因子网络 | 胎儿和成人小鼠的 T 细胞和胸腺发育 | NA | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 82 | 2024-08-05 |
Generation of ventralized human thalamic organoids with thalamic reticular nucleus
2023-05-04, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2023.03.007
PMID:37019105
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研究论文 | 本研究报告了一种将人类胚胎干细胞转化为具有不同核身份的腹侧丘脑类器官的方法 | 实现了以前未能达到的丘脑模式，展现了丘脑网状核的特征 | 未影响整体丘脑谱系发育的神经功能变化可能限定了结果的适用性 | 探索人类丘脑中核特异性发育与病理的机制 | 使用腹侧丘脑类器官研究TRN特异性与病相关基因的功能 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 类器官模型 | 组织样本 | NA |
| 83 | 2024-08-05 |
The 'omics of obesity in B-cell acute lymphoblastic leukemia
2023-05-04, Journal of the National Cancer Institute. Monographs
DOI:10.1093/jncimonographs/lgad014
PMID:37139973
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研究论文 | 本研究探讨了肥胖如何影响人类B细胞急性淋巴细胞白血病的功能 | 使用多组学方法揭示了肥胖相关的B细胞特异性标志与生存结果之间的关联，提供了新的见解 | 研究未提及样本的多样性和肥胖机制的广泛性 | 理解脂肪细胞如何影响B细胞急性淋巴细胞白血病中的代谢和耐药性 | 正常和恶性B细胞，特别是B细胞急性淋巴细胞白血病细胞 | 数字病理学 | B细胞急性淋巴细胞白血病 | RNA测序，质谱 | NA | 血清和血浆样本 | 健康供体和B-ALL患者的样本 |
| 84 | 2024-08-04 |
Delivery of mitochondria confers cardioprotection through mitochondria replenishment and metabolic compliance
2023-05-03, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2023.02.016
PMID:36805084
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研究论文 | 本研究探讨了线粒体移植在心力衰竭中的保护作用及其机制 | 研究揭示了线粒体移植通过恢复心脏功能和代谢适应性来保护心脏 | 未明确讨论线粒体移植的长期效果及其临床应用的挑战 | 旨在研究线粒体移植在心力衰竭中的效果及机制 | 研究对象为两种不同模型的心力衰竭，包括多柔比星诱导的心力衰竭模型和人诱导的多能干细胞衍生的心肌细胞模型 | 机器学习 | 心血管疾病 | 线粒体移植、单细胞RNA测序 | 人诱导的多能干细胞衍生心肌细胞模型 | RNA序列 | NA |
| 85 | 2024-08-05 |
Tissue nanotransfection causes tumor regression by its effect on nanovesicle cargo that alters microenvironmental macrophage state
2023-05-03, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2022.11.003
PMID:36380587
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研究论文 | 本研究首次报告了肿瘤来源的细胞外囊泡的纳米尺度荧光可视化，揭示了其对小鼠肿瘤相关巨噬细胞状态的影响 | 揭示了肿瘤源性囊泡携带的miR-126对肿瘤相关巨噬细胞状态改变的肿瘤发生机制 | 未提及具体的临床研究数据或在人类模型中的应用 | 研究肿瘤来源的细胞外囊泡如何影响肿瘤相关巨噬细胞并导致肿瘤退缩 | 主要研究对象是肿瘤相关巨噬细胞和肿瘤来源的细胞外囊泡 | 数字病理学 | 肿瘤 | 纳米转染技术 | 小鼠肿瘤模型 | 分子和基因表达数据 | 涉及的样本数量未具体列出 |
| 86 | 2024-08-04 |
Molecular Evidence for Olfactory Neuroblastoma as a Tumor of Malignant Globose Basal Cells
2023-05, Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.modpat.2023.100122
PMID:36841178
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研究论文 | 本文利用人鼠集成的单细胞图谱识别与嗅神经母细胞瘤的特定干/祖细胞群体相关的转录组程序 | 首次将嗅神经母细胞瘤与特定细胞类型联系起来，并识别出保守的发育通路 | 缺乏对嗅上皮细胞类型标记在临床实践中的应用 | 探讨嗅神经母细胞瘤与嗅上皮中球状基底细胞之间的关系 | 嗅神经母细胞瘤及其与嗅上皮细胞的联系 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 人类和小鼠的鼻粘膜样本 |
| 87 | 2024-08-05 |
Epigenetic regulation of cancer-associated fibroblast heterogeneity
2023-05, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
DOI:10.1016/j.bbcan.2023.188901
PMID:37120098
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review | 本文回顾了癌相关成纤维细胞(CAF)成熟过程中的表观遗传变化，重点讨论了DNA甲基化和组蛋白修饰 | 探讨了CAF中表观遗传变化与肿瘤生长之间的关系，提出了一些CAF激活因子与表观遗传改变之间的联系 | 没有提供关于CAF的具体样本数据和实验结果的详细信息 | 旨在深入了解癌相关成纤维细胞的异质性及其在肿瘤微环境中的作用 | 集中讨论癌相关成纤维细胞及其成熟过程中的表观遗传变化 | 数字病理学 | 癌症 | NA | NA | NA | NA |
| 88 | 2024-08-05 |
Spinal astrocytic MeCP2 regulates Kir4.1 for the maintenance of chronic hyperalgesia in neuropathic pain
2023-05, Progress in neurobiology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.pneurobio.2023.102436
PMID:36931588
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研究论文 | 本文探讨了脊髓星形胶质细胞中的MeCP2如何调节Kir4.1以维持神经病理性疼痛中的慢性痛觉过敏 | 揭示了Kir4.1通道在慢性神经病理性疼痛中通过MeCP2的调节作用 | 研究主要基于小鼠模型，需要在其他模型中进一步验证 | 探讨脊髓星形胶质细胞在慢性神经病理性疼痛中的作用及其机制 | 脊髓星形胶质细胞和Kir4.1通道 | 数字病理学 | 神经病理性疼痛 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 小鼠模型中观察到的脊髓星形胶质细胞样本 |
| 89 | 2024-08-05 |
Cytotoxic T Cells Targeting Spike Glycoprotein Are Associated with Hybrid Immunity to SARS-CoV-2
2023-05-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2200815
PMID:36961450
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研究论文 | 这篇文章探讨了针对SARS-CoV-2尖峰糖蛋白的细胞毒性T细胞与混合免疫之间的关联 | 这项研究揭示了混合免疫中细胞毒性T细胞的重要性，并比较了带有和没有既往感染的个体的T细胞反应 | 样本数量相对较小，且未足够探讨其他可能影响免疫反应的因素 | 研究混合免疫的免疫机制及其对SARS-CoV-2突破性感染的保护作用 | 参与者分为SARS-CoV-2未感染和康复个体，均接受了两剂mRNA疫苗接种 | 免疫学 | SARS-CoV-2 | 流式细胞术和单细胞RNA测序 | NA | 生物数据 | 30名个体 (13名未感染者，17名康复者) |
| 90 | 2024-08-05 |
An update in club cell biology and its potential relevance to chronic obstructive pulmonary disease
2023-05-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00192.2022
PMID:36942863
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评论 | 本综述整合了俱乐部细胞的最新研究发现及其与慢性阻塞性肺病的潜在关联 | 通过整合单细胞RNA测序数据，提供了俱乐部细胞异质性和功能的新见解 | 缺乏对俱乐部细胞在COPD患者中的具体机制的深入探讨 | 探讨俱乐部细胞的生物学及其在慢性阻塞性肺病中的潜在重要性 | 俱乐部细胞及其在小气道中的功能 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 91 | 2024-08-05 |
Immune Checkpoint Molecule TIGIT Regulates Kidney T Cell Functions and Contributes to AKI
2023-05-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000000000063
PMID:36747315
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研究论文 | 本研究揭示了免疫检查点分子TIGIT在肾脏T细胞功能中的调节作用，并探讨其在急性肾损伤（AKI）中的贡献 | 发现TIGIT在小鼠及人类肾脏T细胞中的上调，并揭示其通过影响T细胞的效应特征和细胞因子产生来调节AKI病理生理 | 该研究主要在小鼠模型中进行，尚需进一步验证人类中的具体机制和临床相关性 | 探讨TIGIT在肾脏T细胞中的作用及其对AKI结果的影响 | 针对小鼠及人类肾脏T细胞进行的研究 | NA | 急性肾损伤 | RNA测序（RNA-Seq），流式细胞术 | NA | RNA序列数据 | 小鼠和人类样本，包括缺失TIGIT的小鼠和来自肾脏切除术样本的人类T细胞 |
| 92 | 2024-08-05 |
A Salivary Gland Resident Macrophage Subset Regulating Radiation Responses
2023-05, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345221150005
PMID:36883649
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研究论文 | 本研究发现唾液腺驻留巨噬细胞亚群在放射反应中起调节作用 | 首次报告了具有不同功能或转录谱的唾液腺驻留巨噬细胞亚群 | 研究主要在小鼠模型中进行，临床转化需进一步验证 | 揭示唾液腺驻留巨噬细胞亚群的功能及其对放射影响的调节作用 | 小鼠下颌唾液腺中的巨噬细胞亚群 | 数字病理学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 小鼠下颌唾液腺样本 |
| 93 | 2024-08-05 |
High-Resolution Transcriptomic Landscape of the Human Submandibular Gland
2023-05, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345221147908
PMID:36726292
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研究论文 | 该文章深入分析了人类下颌下腺的转录组特征，特别是在单细胞层面。 | 首次在单细胞分辨率下揭示了下颌下腺细胞群体的复杂转录组异质性，并识别了人特有的异常细胞类型。 | 由于正常人类组织获取的困难，全面的分子特征描述仍然不完整。 | 旨在深入理解人类下颌下腺的生物学和病理生理学。 | 人类下颌下腺的成年男性和女性样本。 | 数字病理学 | NA | RNA-seq, scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 成年男性和女性人类下颌下腺样本 |
| 94 | 2024-08-05 |
Single-cell RNAseq provides insight into altered immune cell populations in human fracture nonunions
2023-05, Journal of orthopaedic research : official publication of the Orthopaedic Research Society
IF:2.1Q2
DOI:10.1002/jor.25452
PMID:36200412
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研究论文 | 该研究通过单细胞 RNA 测序分析人类骨折不愈合中的免疫细胞群体变化 | 使用单细胞 RNA 测序揭示了骨折不愈合中免疫细胞基因表达的变化 | 样本量较小，仅涉及9名患者 | 探讨骨免疫学在骨折愈合中的作用 | 来自五名股骨不愈合患者的髓腔组织样本 | 数字病理学 | NA | 单细胞 RNA 测序 | NA | 基因表达数据 | 9个样本（5个股骨不愈合样本和4个原生骨对照） |
| 95 | 2024-08-05 |
Inference of cell type-specific gene regulatory networks on cell lineages from single cell omic datasets
2023-05-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-38637-9
PMID:37244909
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研究论文 | 本文提出了一种新颖的方法，通过单细胞组学数据推断特定细胞类型的基因调控网络 | 开发了单细胞多任务网络推断(scMTNI)框架，可以整合scRNA-seq和scATAC-seq数据，推断细胞谱系上的基因调控网络 | 当前方法在整合scRNA-seq和scATAC-seq测量及建模网络动态方面存在局限性 | 旨在提高细胞类型特异性基因调控网络的推断精度 | 特定细胞类型的基因调控网络 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 单细胞可转座酶可及染色质测序(scATAC-seq) | 多任务学习框架 | 模拟数据和真实数据 | NA |
| 96 | 2024-08-07 |
TripletCell: a deep metric learning framework for accurate annotation of cell types at the single-cell level
2023-05-19, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad132
PMID:37080771
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研究论文 | 本文提出了一种名为TripletCell的新型深度度量学习框架，用于跨物种、跨协议和跨样本的细胞类型注释 | TripletCell利用深度度量学习算法，通过特征提取模块TripletCell-FE，有效地处理了scRNA-seq数据中的批次效应和数据异质性问题 | NA | 开发一种高效准确的细胞类型注释方法，以克服传统手动注释的局限性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型注释 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | 深度度量学习 | 基因表达矩阵 | 21个数据集，涵盖九种scRNA-seq协议、两种物种和三种组织 |
| 97 | 2024-08-04 |
Prerequisite endocardial-mesenchymal transition for murine cardiac trabecular angiogenesis
2023-05-08, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.03.009
PMID:37023750
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研究论文 | 本文探讨了小鼠心脏内膜细胞如何通过“血管内皮细胞-间充质转化”机制生成小梁血管 | 首次揭示了小梁血管起源于心室内膜细胞的二步血管内皮细胞-间充质转化机制 | 研究主要集中于小鼠模型，可能对其他物种的应用有限 | 研究心脏小梁血管的起源和发育机制 | 心室内膜细胞及其在小梁血管形成中的作用 | 数字病理学 | 冠心病 | 单细胞转录组学、免疫荧光 | NA | NA | NA |
| 98 | 2024-08-04 |
Spatial transcriptomics reveals molecular dysfunction associated with Lewy pathology
2023-May-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.05.17.541144
PMID:37292685
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研究论文 | 本研究使用空间转录组学揭示与路易体病理相关的分子功能失调 | 首次识别出在皮质中易患路易体病的特定兴奋性神经元，并提出了路易体相关分子功能失调的基因特征 | 研究仅集中于那些有无病理的皮质神经元，可能未覆盖其他类型神经元的变化 | 探讨哪些神经元易于发展为路易体病，并识别相关的分子变化 | 路易体病的皮质神经元及其转录组特征 | 数字病理学 | 帕金森病 | 空间转录组学 | 小鼠模型 | 转录组数据 | 使用了来自人类及小鼠的多个皮质神经元样本 |
| 99 | 2024-08-04 |
Distinct Th17 effector cytokines differentially promote microglial and blood-brain barrier inflammatory responses during post-infectious encephalitis
2023-May-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.10.532135
PMID:37215000
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研究论文 | 本研究探讨了不同Th17效应细胞因子在感染后脑炎期间对小胶质细胞和血脑屏障炎症反应的不同促进作用 | 阐明了GAS感染中内皮细胞和小胶质细胞的反应机制，并识别了关键的Th17衍生细胞因子 | 研究主要在小鼠疾病模型中进行，可能无法完全反映人类的情况 | 探讨在GAS感染后的神经精神后遗症中Th17细胞因子的作用 | 小鼠模型中的内皮细胞和小胶质细胞 | 数字病理学 | 神经精神疾病 | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | 血清样本 | 未明确指出样本数量，仅提到患者血清 |
| 100 | 2024-08-04 |
Spatial and molecular profiling of the mononuclear phagocyte network in classic Hodgkin lymphoma
2023-05-11, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2022015575
PMID:36758207
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研究论文 | 本研究定义了经典霍奇金淋巴瘤及非淋巴瘤淋巴结的全球免疫细胞组成 | 首次高分辨率探讨了单核吞噬细胞网络的组织和与霍奇金-里德-斯坦伯格细胞的相互作用 | 仅通过少量经典标记识别的单核吞噬细胞可能限制了对其真正功能的全面理解 | 探讨经典霍奇金淋巴瘤中的免疫细胞组成及其在肿瘤微环境中的作用 | 聚焦于经典霍奇金淋巴瘤中的单核吞噬细胞及其全局组成 | 数字病理学 | 霍奇金淋巴瘤 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、多重免疫荧光 | NA | 免疫细胞组成数据 | 诊断活检样本 |