单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 356 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2024-08-05 |
Age-associated B cells are heterogeneous and dynamic drivers of autoimmunity in mice
2023-05-01, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20221346
PMID:36828389
|
研究论文 | 年龄相关的B细胞（ABCs）在小鼠中是异质性和动态的自身免疫驱动因子 | 首次揭示了ABCs在狼疮发病机制中的直接作用及其异质性和动态特性 | 研究主要集中于小鼠模型，临床相关性尚未得到验证 | 探讨年龄相关B细胞在自身免疫病中的作用 | 小鼠中的年龄相关B细胞及其在自身免疫中的作用 | 数字病理学 | 狼疮 | scRNA-seq | MRL/lpr SLE模型 | 细胞数据 | NA |
| 62 | 2024-08-04 |
The Genetic Landscape of Familial Pulmonary Fibrosis
2023-05-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202204-0781OC
PMID:36622818
|
研究论文 | 本文综合评估了家族性肺纤维化（FPF）的遗传风险，通过分析569个FPF家族的遗传稀有变异。 | 首次确定了已知与FPF相关的基因中遗传稀有变异的流行率，并识别出新的候选基因和通路。 | 未能识别多个家族共享的新稀有变异基因，表明大多数FPF家族的遗传风险涉及多样化的基因和通路。 | 研究FPF的遗传风险，揭示其相关的基因和通路。 | 569个FPF家族的受影响个体及其遗传稀有变异。 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 全外显子组测序和候选基因测序 | NA | 基因组数据 | 569个FPF家族的样本 |
| 63 | 2024-08-05 |
Identification of an adipose tissue-resident pro-preadipocyte population
2023-05-30, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112440
PMID:37119138
|
研究论文 | 本研究揭示了脂肪组织中一种特定的前脂肪细胞群体及其分化路径 | 通过单细胞RNA测序发现了一种新的人类CD31 CD45细胞群，并将其放置于已知前脂肪细胞群之前的表观遗传路径上 | 研究可能受到样本选择和细胞异质性的限制 | 揭示脂肪细胞的分化过程及其生理机制 | 研究了脂肪组织中的间质血管部分(SVF)中细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | NA |
| 64 | 2024-08-05 |
Osteoblast-intrinsic defect in glucose metabolism impairs bone formation in type II diabetic male mice
2023-05-05, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.85714
PMID:37144869
|
研究论文 | 本研究揭示了糖尿病小鼠骨生成受损的机制，强调了骨母细胞内在的葡萄糖代谢缺陷 | 首次识别糖尿病小鼠中骨母细胞内在的葡萄糖代谢缺陷是糖尿病性骨质疏松的潜在原因 | 仅在小鼠模型中进行研究，限制了结果对人类的直接适用性 | 探讨2型糖尿病对骨生成的影响及其机制 | 以青少年2型糖尿病小鼠为研究对象 | 数字病理学 | 糖尿病性骨质疏松 | 稳定同位素追踪，Seahorse测定，单细胞RNA测序 | NA | 生物样本 | NA |
| 65 | 2024-08-05 |
Intestinal stem cell aging at single-cell resolution: Transcriptional perturbations alter cell developmental trajectory reversed by gerotherapeutics
2023-05, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.13802
PMID:36864750
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研究论文 | 本文探讨了老化对肠道干细胞及其子代细胞成熟的影响 | 研究揭示了老化对Lgr5肠道干细胞转录组的重新编程及其对细胞发育轨迹的影响，并且通过使用老年治疗药物实现了逆转 | 该研究主要在小鼠模型中进行，可能无法完全反映人类的生理情况 | 本研究旨在理解老化如何影响肠道干细胞及其后代的发育 | 研究对象为小鼠中的Lgr5肠道干细胞及其成熟后代 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 小鼠的多个肠道样本 |
| 66 | 2024-08-05 |
Evaluating the transcriptional landscape and cell-cell communication networks in chronically irradiated parotid glands
2023-May-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.106660
PMID:37168562
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研究论文 | 本文探讨了长期辐射后唾液腺的转录组景观和细胞间通信网络 | 识别了特定表达的分泌细胞群体，可能是腺泡细胞前体，并展示了放射治疗后免疫参与的转录影响 | 研究仅限于小鼠模型，可能无法完全代表人类的生理情况 | 揭示辐射导致的慢性唾液功能低下的转录机制，以帮助识别损伤机制和开发再生疗法 | 采用了来自对照组和经过辐射的鼠类唾液腺的单细胞RNA测序分析 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | RNA序列数据 | 对照组和辐射组的小鼠唾液腺样本，具体数量未说明 |
| 67 | 2024-08-05 |
Genetic and Molecular Contributors in Eosinophilic Esophagitis
2023-05, Current allergy and asthma reports
IF:5.4Q1
DOI:10.1007/s11882-023-01075-0
PMID:37084008
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综述 | 本文旨在提供关于嗜酸性食管炎的遗传和分子进展的历史和最新更新 | 文章总结了最近的遗传和分子进展，强调了多种发现对理解该疾病的影响 | 没有明确提及具体的限制 | 旨在深入理解嗜酸性食管炎的遗传和分子机制 | 研究嗜酸性食管炎的遗传和分子因素 | 数字病理学 | 嗜酸性食管炎 | 新一代测序技术，包括全基因组关联研究、全外显子测序和RNA测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 68 | 2024-08-04 |
Re-convolving the compositional landscape of primary and recurrent glioblastoma reveals prognostic and targetable tissue states
2023-05-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-38186-1
PMID:37142563
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研究论文 | 本文研究了原发性和复发性胶质母细胞瘤中的细胞组成和转录状态 | 通过研究特定亚群体之间的共居模式识别了三种组成性组织状态，并提出了针对GBM微环境相互依赖性的治疗方案 | 未说明样本数量和研究范围的具体限制 | 本研究旨在确定原发性和复发性胶质母细胞瘤的细胞组成及其转录状态 | 研究对象为原发性和复发性胶质母细胞瘤中的细胞类型及其相互关系 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单核RNA测序和空间转录组学 | NA | RNA数据 | NA |
| 69 | 2024-08-05 |
Functional characterization of age-dependent p16 epimutation reveals biological drivers and therapeutic targets for colorectal cancer
2023-May-04, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-023-02689-y
PMID:37143122
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研究论文 | 本文探讨了与年龄相关的p16表观突变在结直肠癌中的角色及其潜在的治疗靶点 | 本研究首次揭示了年龄依赖的p16表观突变在肠道肿瘤发生中的生物驱动因素和治疗靶点 | 研究主要基于小鼠模型，临床适用性需要进一步验证 | 改善结直肠癌患者的临床治疗 | 对携带Apc突变和p16表观突变的小鼠进行肿瘤发展与进展的研究 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 小鼠肿瘤和结肠上皮细胞样本 |
| 70 | 2024-08-04 |
Transcriptomic signature, bioactivity and safety of a non-hepatoxic analgesic generating AM404 in the mid-brain PAG region
2023-May-04, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2883310/v1
PMID:37205420
|
研究论文 | 这篇文章探讨了一种新型非肝毒性的镇痛药SRP-001的转录组特征、生物活性和安全性 | SRP-001作为一种小分子药物，具有非肝毒性并能够在中脑PAG区域生成AM404，展现出与传统镇痛药相比的创新效果 | 研究主要集中在转录组学的分析上，未提供大规模的临床验证数据 | 本研究旨在开发一种安全有效的非opioid镇痛药以替代现有的药物 | 主要研究对象是SRP-001及其在中脑PAG区域的生物作用及安全性 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 生物样本 | NA |
| 71 | 2024-08-05 |
Identification of GPI-anchored protein LYPD1 as an essential factor for odontoblast differentiation in tooth development
2023-05, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2023.104638
PMID:36963497
|
研究论文 | 本研究识别了GPI锚定蛋白LYPD1作为牙齿发育中牙本质细胞分化的关键因素 | LYPD1被发现是发育中牙齿中前牙本质细胞的新标记，并且在通过其GPI-AP功能调节Smad1/5/8磷酸化以促进牙本质细胞分化中扮演重要角色 | 研究仅在小鼠牙髓细胞和外源性器官培养系统中验证，可能无法完全概括人类牙齿发育机制 | 探讨脂质筏对牙齿发育的具体影响，并确认LYPD1在牙本质细胞分化中的作用 | 通过微阵列和单细胞RNA测序方法研究前牙本质细胞以及相关的信号传导机制 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了小鼠牙髓细胞和牙胚的外源性器官培养 |
| 72 | 2024-08-05 |
Probe-based bacterial single-cell RNA sequencing predicts toxin regulation
2023-05, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-023-01348-4
PMID:37012420
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研究论文 | 本研究开发了一种基于探针的细菌单细胞RNA测序方法，以研究细菌的转录变异性 | 创新点在于开发了ProBac-seq方法，利用DNA探针库和现有的商业微流体平台进行细菌单细胞RNA测序 | 尚未提及具体的局限性 | 研究细菌在单细胞水平的转录变异性和相关性 | 研究对象包括拟杆菌和大肠杆菌，以及在病原过程中应用于梭状芽孢杆菌 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 每次实验测序数千个个体细菌细胞 |
| 73 | 2024-08-05 |
ScRNA-seq revealed an immunosuppression state and tumor microenvironment heterogeneity related to lymph node metastasis in prostate cancer
2023-May-23, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-023-00407-0
PMID:37221625
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研究论文 | 本研究使用scRNA-seq分析前列腺癌的肿瘤微环境异质性与淋巴结转移相关的免疫抑制状态 | 本研究揭示了MYC途径在前列腺癌进展和肿瘤微环境免疫抑制中的作用 | 样本数量较少，可能影响研究结果的普遍性 | 探索前列腺癌淋巴结转移的机制 | 前列腺癌组织样本中的细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | scRNA-seq | NA | 细胞数据 | 32,766个细胞来自四个前列腺癌组织样本 |
| 74 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics of human-skin-equivalent organoids
2023-05-30, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112511
PMID:37195865
|
研究论文 | 该研究利用单细胞转录组学比较人类皮肤等效类器官和自然皮肤的特征 | 该论文通过重建HSE角质形成细胞的分化轨迹，揭示了HSEs中的独特角质形成细胞状态及其与已知体内分化通路的相似性 | HSEs存在独特的角质形成细胞状态，并且终末分化受损 | 研究人类皮肤等效类器官的生物学特性及其分化过程 | 人类皮肤等效(organoid)培养物、异种移植物和体内表皮 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA |
| 75 | 2024-08-05 |
MetaTiME integrates single-cell gene expression to characterize the meta-components of the tumor immune microenvironment
2023-05-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-38333-8
PMID:37149682
|
研究论文 | MetaTiME整合单细胞基因表达以表征肿瘤免疫微环境的元组成部分 | 本研究开发了一个数据驱动框架MetaTiME，以克服手动标注已知基因标记所导致的分辨率和一致性局限性 | NA | 旨在通过集成多个scRNA-seq数据集来表征肿瘤微环境中的细胞类型和状态 | 使用数百万TME单细胞数据学习与癌症类型相关的独立基因表达组分 | 数字病理学 | 癌症免疫疗法 | 单细胞RNA测序 | 数据驱动模型 | 基因表达数据 | 数百万TME单细胞 |
| 76 | 2024-08-05 |
Lymphoid tissues contribute to viral clonotypes present in plasma at early post-ATI in SIV-infected rhesus macaques
2023-May-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.05.30.542512
PMID:37398418
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研究论文 | 本研究揭示了淋巴组织在抗逆转录病毒治疗干预后早期对血浆中病毒克隆型的贡献 | 通过使用条形码SIVmac239M感染狒狒，监测病毒条形码克隆型的动态，这为减小复发病毒储存库提供了新见解 | 样本量有限，仅涉及七只狒狒，并且在某些情况下血浆病毒RNA仍然低于检测阈值 | 探究抗逆转录病毒治疗干预后，病毒群体的细胞和组织来源以及动态变化 | 感染了SIV的狒狒，具体分析了其血液和多种淋巴及非淋巴组织样本 | 数字病理学 | NA | 条形码测序、完整前病毒DNA检测、单细胞RNA测序、结合CODEX/RNAscope/杂交 | NA | 血液和组织样本 | 七只狒狒 |
| 77 | 2024-08-04 |
Presence of immunogenic alternatively spliced insulin gene product in human pancreatic delta cells
2023-05, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-023-05882-y
PMID:36884057
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研究论文 | 本文研究人类胰腺δ细胞中免疫原性替代剪接胰岛素基因产物的表达 | 首次指出胰腺δ细胞中存在一种由替代剪接产生的胰岛素变体，并揭示其可能在胰岛素自身免疫和病理中发挥作用 | 未全面阐明这种替代剪接INS产物在其他细胞类型中的潜在作用 | 探讨人类胰腺内胰岛素基因的替代剪接及其在β细胞和其他内分泌细胞中的表达 | 人类胰腺中各种内分泌细胞（特别是δ细胞） | 数字病理学 | 糖尿病 | PCR分析、单细胞RNA-seq分析、免疫组化 | NA | RNA、蛋白序列 | 人类胰腺样本，具体样本数量未提及 |
| 78 | 2024-08-05 |
Speed and navigation control of thymocyte development by the fetal T-cell gene regulatory network
2023-05, Immunological reviews
IF:7.5Q1
DOI:10.1111/imr.13190
PMID:36722494
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review | 本文回顾了胎儿和成人小鼠胸腺中 T 细胞分化相关的转录因子网络 | 探讨了胎儿 T 细胞发育与成人的不同之处，并强调了转录因子网络的独特性 | 主要基于小鼠模型，可能无法完全转化到人类的机制理解 | 研究胎儿 T 细胞发育过程中的转录因子网络 | 胎儿和成人小鼠的 T 细胞和胸腺发育 | NA | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 79 | 2024-08-05 |
Generation of ventralized human thalamic organoids with thalamic reticular nucleus
2023-05-04, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2023.03.007
PMID:37019105
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研究论文 | 本研究报告了一种将人类胚胎干细胞转化为具有不同核身份的腹侧丘脑类器官的方法 | 实现了以前未能达到的丘脑模式，展现了丘脑网状核的特征 | 未影响整体丘脑谱系发育的神经功能变化可能限定了结果的适用性 | 探索人类丘脑中核特异性发育与病理的机制 | 使用腹侧丘脑类器官研究TRN特异性与病相关基因的功能 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 类器官模型 | 组织样本 | NA |
| 80 | 2024-08-05 |
The 'omics of obesity in B-cell acute lymphoblastic leukemia
2023-05-04, Journal of the National Cancer Institute. Monographs
DOI:10.1093/jncimonographs/lgad014
PMID:37139973
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研究论文 | 本研究探讨了肥胖如何影响人类B细胞急性淋巴细胞白血病的功能 | 使用多组学方法揭示了肥胖相关的B细胞特异性标志与生存结果之间的关联，提供了新的见解 | 研究未提及样本的多样性和肥胖机制的广泛性 | 理解脂肪细胞如何影响B细胞急性淋巴细胞白血病中的代谢和耐药性 | 正常和恶性B细胞，特别是B细胞急性淋巴细胞白血病细胞 | 数字病理学 | B细胞急性淋巴细胞白血病 | RNA测序，质谱 | NA | 血清和血浆样本 | 健康供体和B-ALL患者的样本 |