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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-10-06 |
Identification of GPI-anchored protein LYPD1 as an essential factor for odontoblast differentiation in tooth development
2023-05, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2023.104638
PMID:36963497
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研究论文 | 本研究通过微阵列和单细胞RNA测序技术,发现GPI锚定蛋白LYPD1是牙本质细胞分化的关键调控因子 | 首次鉴定LYPD1作为前成牙本质细胞的特异性标志物,并揭示其通过调控BMP信号通路中Smad1/5/8磷酸化促进牙本质细胞分化的新机制 | 研究主要基于体外器官培养系统和小鼠牙髓细胞,尚未进行完整的体内功能验证 | 探究脂筏成分在牙齿发育过程中对牙本质细胞分化的调控作用 | 小鼠牙胚和牙髓细胞 | 发育生物学 | 牙齿发育异常 | 微阵列, 单细胞RNA测序, 体外器官培养 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 22 | 2025-10-06 |
Cellular mechanisms of oligoclonal vascular smooth muscle cell expansion in cardiovascular disease
2023-05-22, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvac138
PMID:35994249
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研究论文 | 本研究探讨了心血管疾病中血管平滑肌细胞寡克隆扩张的细胞机制 | 首次揭示了健康动脉中罕见SCA1+ VSMCs具有更高的增殖能力,并证明VSMC低频率增殖激活是其细胞固有特征 | 研究主要基于动物模型,人类样本验证有限 | 理解血管平滑肌细胞寡克隆性产生的细胞机制 | 血管平滑肌细胞(VSMCs) | 细胞生物学 | 心血管疾病 | 共聚焦显微镜,单细胞RNA测序 | VSMC谱系追踪动物模型 | 图像,单细胞转录组数据 | VSMC谱系追踪动物模型,健康人类主动脉样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 23 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics for the assessment of cardiac disease
2023-05, Nature reviews. Cardiology
DOI:10.1038/s41569-022-00805-7
PMID:36539452
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综述 | 概述单细胞转录组学在心脏疾病研究中的应用与挑战 | 整合单细胞数据与空间转录组学技术,揭示心脏细胞微环境在稳态和疾病进展中的调控作用 | 指出心脏细胞注释缺乏标准化是当前领域亟待解决的问题 | 探讨单细胞转录组学技术对心脏疾病机制研究和临床诊疗的推动作用 | 心脏主要细胞类型(从发育到成年期的健康与疾病状态) | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序, 单核转录组测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 24 | 2025-10-07 |
High-throughput single nucleus total RNA sequencing of formalin-fixed paraffin-embedded tissues by snRandom-seq
2023-05-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-38409-5
PMID:37173341
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研究论文 | 开发了一种名为snRandom-seq的高通量单核总RNA测序技术,用于福尔马林固定石蜡包埋组织 | 使用随机引物捕获全长总RNA,相比现有技术具有更低的双胞率、更高的RNA覆盖度,并能检测更多非编码RNA和新生RNA | NA | 开发适用于FFPE组织的单核RNA测序技术 | 福尔马林固定石蜡包埋组织样本 | 单细胞测序 | 肝癌 | 单核RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 人类肝癌FFPE标本 | NA | 单核RNA测序 | snRandom-seq | 基于液滴的单核总RNA测序技术,使用随机引物捕获全长RNA |
| 25 | 2025-10-07 |
Regulation of c-SMAC formation and AKT-mTOR signaling by the TSG101-IFT20 axis in CD4+ T cells
2023-05, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-023-01008-x
PMID:37029318
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现IFT20-TSG101轴通过调控SMAC形成来调节CD4+ T细胞的AKT-mTOR信号通路 | 首次揭示IFT20与TSG101相互作用促进SMAC形成并调节AKT-mTOR信号通路的机制 | 研究主要关注CD4+ T细胞,未涉及其他免疫细胞类型 | 探究CD4+ T细胞中SMAC形成的调控机制及其对细胞活化的影响 | CD4+ T细胞和小鼠模型 | 免疫学 | 过敏性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未提及具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 26 | 2025-10-07 |
Dendritic cell subsets in cancer immunity and tumor antigen sensing
2023-05, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-023-00990-6
PMID:36949244
|
综述 | 本文综述了树突状细胞在肿瘤免疫和肿瘤抗原识别中的作用机制及治疗潜力 | 整合单细胞RNA测序分析揭示树突状细胞的表型获得、转录状态和功能程序 | NA | 探讨树突状细胞捕获和激活肿瘤细胞抗原的机制及肿瘤微环境对其功能的调控 | 树突状细胞及其在肿瘤免疫中的作用 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 27 | 2025-10-07 |
Single-nucleus RNA sequencing of human pancreatic islets identifies novel gene sets and distinguishes β-cell subpopulations with dynamic transcriptome profiles
2023-05-01, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-023-01179-2
PMID:37127706
|
研究论文 | 通过单核RNA测序技术分析人类胰岛细胞,识别新型基因标记并区分具有动态转录组特征的β细胞亚群 | 发现胰岛内分泌细胞中非经典基因标记,首次通过整合scRNA-seq和snRNA-seq区分出三个具有不同生物学动态状态的β细胞亚群 | 研究样本来源有限,仅使用同一供体的胰岛细胞进行分析 | 探索人类胰岛细胞的转录组特征和细胞异质性 | 人类胰岛细胞及其在免疫缺陷小鼠中的移植模型 | 单细胞测序 | 糖尿病 | 单核RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 同一供体的人类胰岛细胞 | NA | 单核RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 使用GRCh38-2020-A文库进行snRNA-seq数据分析,包含内含子读取 |
| 28 | 2025-10-07 |
Spatial Transcriptomics Depict Ligand-Receptor Cross-talk Heterogeneity at the Tumor-Stroma Interface in Long-Term Ovarian Cancer Survivors
2023-05-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-1821
PMID:36787106
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术揭示了卵巢癌肿瘤微环境中配体-受体交互的异质性及其与长期生存的关系 | 首次整合空间转录组学和单细胞RNA测序数据,开发计算方法研究肿瘤微环境中不同肿瘤细胞与癌症相关成纤维细胞亚型之间的空间配体-受体相互作用 | 需要进一步研究确认这种交互是否在调节高级别浆液性卵巢癌恶性表型中发挥作用 | 探索卵巢癌肿瘤微环境中基质异质性及其与患者长期生存的关系 | 高级别浆液性卵巢癌长期生存者和短期生存者的治疗初治肿瘤组织 | 空间转录组学 | 卵巢癌 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 多重免疫组织化学 | 计算方法 | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 图像数据 | 高级别浆液性卵巢癌长期生存者和短期生存者的肿瘤样本 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 29 | 2025-10-07 |
Intestinal stem cell aging at single-cell resolution: Transcriptional perturbations alter cell developmental trajectory reversed by gerotherapeutics
2023-05, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.13802
PMID:36864750
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究肠道干细胞衰老过程中的转录重编程及其对细胞发育轨迹的影响,并探索老年保护药物的逆转作用 | 首次在单细胞分辨率下揭示衰老导致的Lgr5肠道干细胞转录重编程如何改变细胞发育轨迹,并发现二甲双胍和雷帕霉素可逆转这些衰老效应 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证 | 探究衰老对肠道干细胞功能及其子代细胞成熟过程的影响,以及老年保护药物的干预效果 | 小鼠肠道Lgr5阳性肠道干细胞及其子代细胞 | 单细胞生物学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠肠道细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 30 | 2025-10-07 |
CAR T-cell detection scoping review: an essential biomarker in critical need of standardization
2023-05, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2022-006596
PMID:37217245
|
综述 | 本文通过范围综述评估CAR-T细胞检测方法的异质性,强调建立标准化报告体系的必要性 | 首次系统评估FDA批准CAR-T细胞临床试验中检测方法的异质性和数据报告不一致性问题 | 仅纳入美国临床试验数据,可能无法代表全球实践;主要关注已发表文献而非原始数据 | 评估CAR-T细胞扩增和持久性检测方法的标准化程度和数据报告质量 | 21项美国CAR-T细胞临床试验的60篇相关文献 | 细胞治疗 | 肿瘤免疫治疗 | 流式细胞术,定量PCR,微滴数字PCR,NanoString,单细胞RNA测序 | NA | 临床检测数据,文献报告数据 | 21项临床试验的60篇文献分析 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 31 | 2025-10-07 |
scRNA-Seq and imaging mass cytometry analyses unveil iNKT cells-mediated anti-tumor immunity in pancreatic cancer liver metastasis
2023-05-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2023.216149
PMID:36990268
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和成像质谱流式分析揭示了iNKT细胞在胰腺癌肝转移中的抗肿瘤免疫作用 | 首次在模拟临床条件的胰腺癌肝转移模型中系统阐明iNKT细胞激活通过增强NK/T细胞免疫和减少肿瘤相关巨噬细胞发挥抗肿瘤作用 | 研究基于小鼠模型,尚未在人体临床试验中验证 | 探究iNKT细胞在胰腺癌肝转移中的免疫调节作用 | 胰腺癌肝转移小鼠模型中的免疫细胞 | 单细胞分析 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 成像质谱流式, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 成像数据 | 超过30,000个免疫细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 成像质谱流式 | NA | NA |
| 32 | 2024-12-13 |
Six3 and Six6 jointly regulate the identities and developmental trajectories of multipotent retinal progenitor cells in the mouse retina
2023-May-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.05.03.539288
PMID:37205402
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研究论文 | 研究了Six3和Six6在调控小鼠视网膜多能祖细胞的身份和发育轨迹中的作用 | 通过单细胞RNA测序和条件性基因敲除技术,揭示了Six3和Six6在视网膜祖细胞分化中的协同调控作用,并发现了新的候选基因 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类视网膜中验证这些发现 | 探讨Six3和Six6在视网膜发育中的分子机制,为视网膜再生治疗提供理论基础 | 小鼠视网膜中的多能祖细胞及其分化轨迹 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 胚胎小鼠眼杯样本 | NA | NA | NA | NA |
| 33 | 2024-11-22 |
Single-Cell Analysis Reveals Distinct Immune and Smooth Muscle Cell Populations that Contribute to Chronic Thromboembolic Pulmonary Hypertension
2023-05-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202203-0441OC
PMID:36803741
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析,揭示了慢性血栓栓塞性肺动脉高压中不同的免疫和肌细胞群体及其功能障碍 | 首次通过单细胞RNA测序技术,全面分析了慢性血栓栓塞性肺动脉高压中的多种细胞类型及其功能,并识别出潜在的治疗靶点PAR1 | 研究样本量较小,仅涉及五名患者,可能影响结果的普适性 | 识别构成慢性血栓栓塞性肺动脉高压血栓的多种细胞类型,并研究其功能障碍 | 慢性血栓栓塞性肺动脉高压中的免疫细胞和肌细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 五名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 34 | 2024-11-09 |
A human model of asthma exacerbation reveals transcriptional programs and cell circuits specific to allergic asthma
2023-05-12, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abq6352
PMID:37146132
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研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序比较过敏性哮喘患者和过敏性非哮喘对照组的下呼吸道黏膜,揭示了过敏性哮喘特有的转录程序和细胞回路 | 首次在人类模型中揭示了过敏性哮喘加重的特异性转录程序和细胞回路,特别是涉及T2细胞、DC2和MCs的相互作用 | 研究仅限于过敏性哮喘患者和对照组,未涵盖其他类型的哮喘 | 探究过敏性哮喘加重的分子机制和细胞回路 | 过敏性哮喘患者和过敏性非哮喘对照组的下呼吸道黏膜 | 数字病理学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 过敏性哮喘患者和过敏性非哮喘对照组 | NA | NA | NA | NA |
| 35 | 2024-11-08 |
Single-cell transcriptomics reveals that tumor-infiltrating natural killer cells are activated by localized ablative immunotherapy and share anti-tumor signatures induced by immune checkpoint inhibitors
2023-May-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.05.02.539163
PMID:37205468
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研究论文 | 研究通过单细胞转录组学揭示肿瘤浸润自然杀伤细胞在局部消融免疫疗法激活下与免疫检查点抑制剂诱导的抗肿瘤特征共享 | 首次揭示局部消融免疫疗法激活自然杀伤细胞的细胞毒性,并发现上调基因与癌症患者的有益临床结果正相关 | NA | 探讨自然杀伤细胞在癌症治疗中的激活基因特征和通路 | 自然杀伤细胞在肿瘤微环境中的转录变化 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用MMTV-PyMT小鼠模型和人类样本进行分析 | NA | NA | NA | NA |
| 36 | 2024-10-16 |
Impaired PPARγ activation by cadmium exacerbates infection-induced lung injury
2023-05-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.166608
PMID:36928191
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研究论文 | 研究揭示了镉暴露和感染对肺部巨噬细胞中PPARγ激活的抑制作用,加剧了感染诱导的肺损伤 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了镉暴露和感染对肺部巨噬细胞中PPARγ基因表达的影响,并发现ERK激活介导的PPARγ降解加剧了肺损伤 | 研究主要基于小鼠模型,结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 探讨环境重金属暴露与肺部疾病之间的关系,特别是感染诱导的肺损伤 | 肺部巨噬细胞、PPARγ基因、ERK激活 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型和人类样本 | NA | NA | NA | NA |
| 37 | 2024-10-14 |
A parathyroid hormone/salt-inducible kinase signaling axis controls renal vitamin D activation and organismal calcium homeostasis
2023-05-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI163627
PMID:36862513
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研究论文 | 本文研究了甲状旁腺激素(PTH)和盐诱导激酶(SIK)信号轴在肾脏维生素D激活和机体钙稳态中的作用 | 首次揭示了SIK在PTH信号下游调控肾脏1,25-维生素D生成的机制 | NA | 探讨PTH依赖的维生素D激活的信号机制 | 甲状旁腺激素(PTH)、盐诱导激酶(SIK)、维生素D基因模块 | NA | 慢性肾脏病-矿物质骨病(CKD-MBD) | 转录组学 | NA | 转录组数据 | 包括小鼠、人胚胎干细胞衍生的肾脏类器官和慢性肾脏病-矿物质骨病(CKD-MBD)模型 | NA | NA | NA | NA |
| 38 | 2024-10-08 |
Studying stochastic systems biology of the cell with single-cell genomics data
2023-May-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.05.17.541250
PMID:37292934
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综述 | 本文综述了单细胞基因组学数据在细胞系统生物学中的应用,并提出了一种统一的数学框架来处理单分子生物随机性和基因组学技术变异 | 提出了一个统一的数学框架,通过生成函数的方法整合单细胞RNA测序中的各种现象 | NA | 探讨单细胞基因组学数据在系统生物学中的应用,并提出一个数学框架来处理生物随机性和技术变异 | 单细胞RNA测序中的RNA转录过程和微流控技术中的封装和文库构建步骤 | 系统生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 生成函数 | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 39 | 2024-10-08 |
Spatial genomic, biochemical, and cellular mechanisms drive meningioma heterogeneity and evolution
2023-May-15, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2921804/v1
PMID:37292686
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研究论文 | 本文整合了空间转录组学和空间蛋白质组学方法,研究了高级别脑膜瘤的基因组、生化和细胞机制,揭示了肿瘤内异质性与分子、时间和空间演化的关系 | 通过空间转录组学和蛋白质组学方法,揭示了高级别脑膜瘤的基因和蛋白质表达差异,并发现了治疗抵抗性的空间扩展亚克隆拷贝数变异 | NA | 研究脑膜瘤的肿瘤内异质性和演化机制,为个性化医疗治疗提供基础 | 高级别脑膜瘤 | 数字病理学 | 脑膜瘤 | 空间转录组学、空间蛋白质组学、多重顺序免疫荧光(seqIF)、空间解卷积 | NA | 基因组数据、蛋白质数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 40 | 2024-10-04 |
Transcriptional programming of CD4+ TRM differentiation in viral infection balances effector- and memory-associated gene expression
2023-05-12, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abq7486
PMID:37172104
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研究论文 | 研究了在病毒感染后,CD4+ T细胞在小肠中的表型、功能和转录特征,揭示了其与循环T1细胞的共同基因表达程序和染色质可及性特征 | 首次揭示了CD4+ T细胞在病毒感染后形成的早期T细胞与T1效应细胞之间的发育关系,并比较了CD4+ T细胞与CD8+ T细胞的差异 | NA | 探讨CD4+ T细胞在病毒感染后的分化和转录调控机制 | CD4+ T细胞在小肠中的表型、功能和转录特征 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |