单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 356 篇文献，本页显示第 321 - 340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 321 | 2024-08-08 |
Intestinal cell type-specific communication networks underlie homeostasis and response to Western diet
2023-05-01, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20221437
PMID:36880999
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和统计建模研究了肠道细胞的动态特性和潜在的细胞机制，特别是在西方饮食影响下的变化 | 揭示了新的肠道细胞亚群和发育轨迹模型，以及西方饮食对特定免疫细胞群和肠上皮细胞功能的影响 | NA | 探究肠道细胞在免疫和炎症反应中的作用，特别是在高脂高糖饮食下的影响 | 肠道细胞，包括肠上皮内淋巴细胞、固有层淋巴细胞、常规树突状细胞和肠上皮细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 统计建模 | RNA序列数据 | 涉及不同饮食（常规饮食和高脂高糖饮食）的小鼠肠道细胞样本 |
| 322 | 2024-08-08 |
Construction of endothelial cell-related and autophagy-related prognostic models for hepatocellular carcinoma based on single-cell data
2023-May, Journal of gastroenterology and hepatology
IF:3.7Q2
DOI:10.1111/jgh.16172
PMID:36894323
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据构建了与内皮细胞和自噬相关的肝细胞癌预后模型 | 首次使用单细胞RNA测序数据构建了与内皮细胞和自噬相关的肝细胞癌预后模型 | NA | 开发与自噬相关的预后模型，用于肝细胞癌患者的预后预测 | 肝细胞癌患者的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 (ScRNA-Seq) | Cox回归模型 | RNA测序数据 | 涉及多种细胞类型的肝细胞癌患者数据 |
| 323 | 2024-08-08 |
Reversal of Lactate and PD-1-mediated Macrophage Immunosuppression Controls Growth of PTEN/p53-deficient Prostate Cancer
2023-05-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-22-3350
PMID:36862086
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研究论文 | 本文研究了PTEN/p53缺陷型前列腺癌中乳酸和PD-1介导的巨噬细胞免疫抑制的逆转机制，并探讨了联合治疗策略的效果。 | 本文首次揭示了乳酸减少通过抑制巨噬细胞中的组蛋白乳酸化来激活其抗癌吞噬作用，并提出了联合ADT和PD-1抑制剂的治疗策略。 | 研究主要基于基因工程小鼠模型和单细胞RNA测序分析，需要在临床试验中进一步验证。 | 阐明ADT/PI3K-AKT轴阻断的耐药机制，并开发针对PTEN缺陷型mCRPC的有效联合治疗策略。 | PTEN/p53缺陷型前列腺癌及其治疗策略。 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组和蛋白质组数据 | 使用10X Genomics平台对人类mCRPC样本进行单细胞RNA测序 |
| 324 | 2024-08-08 |
T-cell dysregulation and inflammatory process in Gcn2 (Eif2ak4-/-)-deficient rats in basal and stress conditions
2023-05-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00460.2021
PMID:36852942
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研究论文 | 研究Gcn2缺陷大鼠在基础和应激条件下的T细胞失调和炎症过程 | 首次探讨了Gcn2缺陷大鼠在氨基酸剥夺条件下的肺部分子和细胞反应，以及与hPVOD病理生理学相关的表型变化 | NA | 探讨Gcn2缺陷大鼠在基础和应激条件下的免疫稳态和hPVOD发展的机制 | Gcn2缺陷大鼠的肺部 | NA | 肺高压 | RNA测序，单细胞RNA测序，流式细胞术，组织成像，Western blot | NA | RNA | 三组Gcn2缺陷大鼠的肺部样本 |
| 325 | 2024-08-08 |
Myeloid-specific deletion of activating transcription factor 6 alpha increases CD11b+ macrophage subpopulations and aggravates lung fibrosis
2023-05, Immunology and cell biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1111/imcb.12637
PMID:36862017
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research paper | 研究激活转录因子6α（ATF6α）在特发性肺纤维化（IPF）中对肺泡巨噬细胞亚群组成和功能的影响 | 首次探讨了ATF6α在肺损伤和纤维化过程中对肺泡巨噬细胞亚群的影响，并揭示了其对纤维化进程的负面作用 | 研究仅在特定的小鼠模型中进行，可能需要进一步的人体研究来验证结果 | 探讨ATF6α在肺纤维化中的作用及其对肺泡巨噬细胞亚群的影响 | 特发性肺纤维化患者和ATF6α缺陷小鼠的肺泡巨噬细胞 | NA | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | RNA | 包括IPF患者的肺组织和循环单核细胞，以及ATF6α缺陷小鼠的肺泡巨噬细胞 |
| 326 | 2024-08-05 |
PDPN positive CAFs contribute to HER2 positive breast cancer resistance to trastuzumab by inhibiting antibody-dependent NK cell-mediated cytotoxicity
2023-05, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy
IF:15.8Q1
DOI:10.1016/j.drup.2023.100947
PMID:36812747
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研究论文 | 本研究识别了一种新的与 trastuzumab 抗药性相关的 PDPN 阳性 CAFs 亚群 | 首次发现 PDPN 阳性 CAFs 在 trastuzumab 抗药性肿瘤组织中富集，并通过分泌免疫抑制因子抑制 NK 细胞介导的 ADCC | 研究中可能未全面评估所有类型的免疫反应和其他潜在的肿瘤微环境因素 | 研究 PDPN 阳性 CAFs 如何影响 HER2 阳性乳腺癌对 trastuzumab 的抗药性 | HER2 阳性乳腺癌患者的肿瘤组织及其 CAFs | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序 | NA | 组织样本 | NA |
| 327 | 2024-08-08 |
Low TCR Binding Strength Results in Increased Progenitor-like CD8+ Tumor-Infiltrating Lymphocytes
2023-05-03, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-22-0761
PMID:36787375
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研究论文 | 研究了T细胞受体（TCR）与肽-MHC抗原复合物的结合强度如何影响肿瘤微环境中内源性多克隆T细胞反应的蛋白质和转录组学特征 | 首次展示了高亲和力和低亲和力的肿瘤浸润淋巴细胞（TIL）在已建立的肿瘤微环境中可以分化成具有多种抗原特异性转录组学特征的细胞，并发现更多祖细胞样表型偏向于低亲和力T细胞 | 研究仅限于特定的肿瘤相关抗原和特定的TCR亲和力，可能无法完全代表所有T细胞反应的复杂性 | 探讨TCR结合强度对肿瘤微环境中T细胞功能的影响 | 肿瘤浸润淋巴细胞（TIL）及其在肿瘤微环境中的分化和功能 | 免疫学 | 肿瘤 | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质和转录组学数据 | 使用了TCR转基因小鼠模型和多克隆T细胞反应的数据 |
| 328 | 2024-08-08 |
Single-cell Deconvolution of a Specific Malignant Cell Population as a Poor Prognostic Biomarker in Low-risk Clear Cell Renal Cell Carcinoma Patients
2023-05, European urology
IF:25.3Q1
DOI:10.1016/j.eururo.2023.02.008
PMID:36801089
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了低风险透明细胞肾细胞癌患者的肿瘤内异质性，并探讨了特定恶性细胞群体作为不良预后生物标志物的潜力 | 首次利用单细胞RNA测序技术揭示透明细胞肾细胞癌中的表达异质性，并设计了一种基于去卷积的策略来风险分层低风险患者 | 研究样本量较小，仅包括五名患者，且结果需要在更大规模的研究中验证 | 探索透明细胞肾细胞癌中的表达异质性，并评估其对低风险患者预后的影响 | 透明细胞肾细胞癌患者的肿瘤样本 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 5名未治疗的透明细胞肾细胞癌患者 |
| 329 | 2024-08-08 |
Cross-species transcriptomic analysis identifies mitochondrial dysregulation as a functional consequence of the schizophrenia-associated 3q29 deletion
2023-May-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.27.525748
PMID:36747819
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研究论文 | 本研究通过跨物种转录组分析，探讨了与精神分裂症相关的3q29缺失对线粒体功能的影响 | 首次在人类前脑皮质类器官和3q29缺失小鼠模型中进行跨物种单细胞转录组分析，揭示了线粒体功能失调与精神分裂症的关联 | 研究主要集中在转录组水平，蛋白质水平的验证较少，且未涉及所有可能的细胞类型 | 探究3q29缺失对中枢神经系统发育的影响及其在精神分裂症病理生物学中的作用 | 人类前脑皮质类器官和3q29缺失小鼠模型的皮质区域 | 遗传学 | 精神分裂症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 包括2个月和12个月的人类皮质类器官以及出生后7天的小鼠皮质 |
| 330 | 2024-08-05 |
Dynamic changes of 3'UTR length during oocyte-to-zygote transition of in vitro pig embryos
2023-May, Reproduction in domestic animals = Zuchthygiene
DOI:10.1111/rda.14327
PMID:36755113
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研究论文 | 本文研究了体外猪胚胎中卵母细胞到受精卵转变过程中的3'UTR动态变化 | 首次系统性分析了在卵母细胞到受精卵转变过程中3'UTR长度变化及其对基因表达的影响 | 本文仅基于特定阶段的scRNA-seq数据，可能无法全面反映所有动态变化 | 探讨3'UTR在猪胚胎卵母细胞转变中的分子机制 | 体外成熟的II期卵母细胞、体外受精的受精卵和单细胞胚胎 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA序列数据 | 139种mRNA和105种mRNA |
| 331 | 2024-08-08 |
Correction to: Single-cell RNA sequencing reveals changes in glioma-associated macrophage polarization and cellular states of malignant gliomas with high AQP4 expression
2023-May, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-023-00592-4
PMID:36755124
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 332 | 2024-08-05 |
Review of single-cell RNA-seq data clustering for cell-type identification and characterization
2023-05, RNA (New York, N.Y.)
DOI:10.1261/rna.078965.121
PMID:36737104
|
综述 | 本文回顾了单细胞RNA-seq数据聚类方法，用于细胞类型的识别和特征化。 | 提供了对现有单细胞RNA-seq数据聚类方法的深入见解和比较，以及聚类方法的优势和局限性。 | 聚类方法的性能可能会受到模拟数据和多种单细胞转录组数据集的限制。 | 探讨和评估单细胞RNA-seq数据聚类方法，以促进细胞类型的识别。 | 现有单细胞RNA-seq数据聚类方法及其相关的处理技术。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据 | 多个单细胞转录组数据集 |
| 333 | 2024-08-05 |
Deciphering Adult Neural Stem Cells with Single-Cell Sequencing
2023-05, Stem cells and development
IF:2.5Q2
DOI:10.1089/scd.2022.0234
PMID:36721381
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综述 | 本文综述了关于成体神经干细胞的最新研究进展，特别是在单细胞分析方面 | 介绍了常规和非常规神经干细胞的单细胞分析的异质性和转录改变 | 未提供具体的实验数据和样本分析 | 全面理解成体神经干细胞在生理和病理状态下的作用 | 成体神经干细胞及其在衰老和脑肿瘤中的转录改变 | 数字病理学 | 神经疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 334 | 2024-08-08 |
Endothelial hyperactivation of mutant MAP3K3 induces cerebral cavernous malformation enhanced by PIK3CA GOF mutation
2023-05, Angiogenesis
IF:9.2Q1
DOI:10.1007/s10456-023-09866-9
PMID:36719480
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研究论文 | 本研究通过全外显子测序和液滴数字聚合酶链反应分析了散发性脑洞畸形患者的病变和匹配血液，发现MAP3K3和PIK3CA突变在病变中的共存及其对血管异常的影响。 | 首次揭示了MAP3K3和PIK3CA突变在脑洞畸形中的分子机制，并通过动物模型验证了这些突变对病变形成和维持的影响。 | 研究主要集中在动物模型和体外实验，需要进一步的人体研究来验证这些发现。 | 探讨MAP3K3和PIK3CA突变在脑洞畸形中的分子机制及其对病变的影响。 | 散发性脑洞畸形患者的病变组织和匹配血液，以及小鼠模型。 | 数字病理学 | 脑血管疾病 | 全外显子测序，液滴数字聚合酶链反应，单细胞RNA测序 | NA | 基因序列，RNA | 94例散发性脑洞畸形患者，小鼠模型 |
| 335 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing of solid pseudopapillary neoplasms of the pancreas in children
2023-May, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.15744
PMID:36721980
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究儿童胰腺实性假乳头状瘤（SPN）的细胞类型和起源 | 首次描述了SPN内部的异质性，并提出了Wnt/β-catenin途径和上皮间质转化在肿瘤发生和复发中的作用 | NA | 全面揭示儿童胰腺实性假乳头状瘤的特征和发病机制 | 儿童胰腺实性假乳头状瘤的细胞类型和起源 | 数字病理学 | 胰腺肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用手术标本进行研究 |
| 336 | 2024-08-08 |
scRNA-seq data analysis method to improve analysis performance
2023-May, IET nanobiotechnology
IF:3.8Q3
DOI:10.1049/nbt2.12115
PMID:36727937
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综述 | 本文综述了当前常用的单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据分析方法及其上游处理流程 | NA | NA | 探讨和评估单细胞RNA测序数据分析工具及其性能 | 单细胞RNA测序数据分析方法和工具 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 文本 | NA |
| 337 | 2024-08-08 |
Cardiovascular utility of single cell RNA-Seq
2023-05-01, Current opinion in cardiology
IF:2.0Q3
DOI:10.1097/HCO.0000000000001014
PMID:36728943
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在心血管疾病诊断、风险分层和提供新型治疗靶点方面的应用潜力 | 单细胞RNA测序技术在心血管领域的应用有助于改善患者预后，并可能扩展到其他高影响临床领域 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在心血管疾病中的应用及未来发展方向 | 心血管疾病 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 338 | 2024-08-08 |
Shear Stress Markedly Alters the Proteomic Response to Hypoxia in Human Pulmonary Endothelial Cells
2023-05, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2022-0340OC
PMID:36730645
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研究论文 | 研究剪切应力对人类肺微血管内皮细胞在低氧条件下蛋白质组响应的影响 | 首次探讨了低氧与剪切应力对肺微血管内皮细胞表型的交互作用，并发现了60种蛋白质在生理剪切应力条件下对低氧的响应，其中55种蛋白质之前未被认为与低氧肺疾病的发展有关 | 研究仅限于人类肺微血管内皮细胞，未涉及其他类型的细胞或组织 | 探讨低氧和剪切应力对肺微血管内皮细胞蛋白质组响应的交互作用及其在低氧性肺血管疾病发展中的重要性 | 人类肺微血管内皮细胞 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 无偏蛋白质组学 | NA | 蛋白质组数据 | 60种蛋白质 |
| 339 | 2024-08-08 |
CTLA-4 inhibition facilitates follicular T and B cell interaction and the production of tumor-specific antibodies
2023-05-01, International journal of cancer
IF:5.7Q1
DOI:10.1002/ijc.34438
PMID:36650700
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析了CTLA-4抑制剂在小鼠同基因肿瘤移植模型中对免疫细胞景观的影响 | 首次全面展示了CTLA-4抑制后肿瘤内免疫微环境的改变，并揭示了肿瘤特异性B细胞在抗肿瘤免疫中的作用 | NA | 探讨CTLA-4抑制剂对肿瘤内免疫细胞相互作用及肿瘤特异性抗体产生的影响 | 小鼠同基因肿瘤移植模型中的免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠同基因肿瘤移植模型 |
| 340 | 2024-08-08 |
STRA6 is essential for induction of vascular smooth muscle lineages in human embryonic cardiac outflow tract development
2023-05-22, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvad010
PMID:36635482
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研究论文 | 本研究探讨了STRA6在人类胚胎心脏流出通道发育中诱导血管平滑肌谱系的关键作用 | 发现了STRA6在人类心脏发育中的新作用，特别是在血管平滑肌细胞的诱导中，以及STRA6与RA信号传导和TBX1转录因子的新相互作用 | 研究主要集中在体外实验和RNA测序数据分析，可能需要进一步的体内实验验证 | 研究STRA6在人类心脏发育和先天性心脏疾病中的作用机制 | STRA6基因、人类胚胎心脏流出通道的发育、血管平滑肌细胞的诱导 | 数字病理学 | 先天性心脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括人类和鼠类胚胎心脏细胞的单细胞RNA测序数据 |