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当前共找到 356 篇文献，本页显示第 301 - 320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2024-08-08 |
MCPIP1 restrains mucosal inflammation by orchestrating the intestinal monocyte to macrophage maturation via an ATF3-AP1S2 axis
2023-05, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2022-327183
PMID:37015751
|
研究论文 | 本文研究了MCPIP1在调节肠道巨噬细胞分化和功能中的作用，以及其在炎症性肠病（IBD）发病机制中的影响。 | 揭示了MCPIP1通过ATF3-AP1S2轴调控肠道巨噬细胞成熟的新机制。 | NA | 探究MCPIP1在调节肠道巨噬细胞功能中的作用及其在IBD发病机制中的影响。 | MCPIP1在肠道巨噬细胞分化和功能中的作用。 | 免疫学 | 炎症性肠病 | ScRNA-seq, RNA-seq, 荧光素酶 assay, CUT&Tag assay, 蛋白质印迹 | NA | 单细胞RNA测序数据 | Mcpip1 ∆Mye小鼠和Mcpip1 fl/fl同窝小鼠，以及IBD患者。 | NA | NA | NA | NA |
| 302 | 2024-08-08 |
Bayesian cluster analysis
2023-May-15, Philosophical transactions. Series A, Mathematical, physical, and engineering sciences
DOI:10.1098/rsta.2022.0149
PMID:36970819
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研究论文 | 本文概述了贝叶斯聚类分析方法，包括基于模型和基于损失的方法，并讨论了核函数或损失选择以及先验设定的重要性 | 贝叶斯聚类分析不仅提供点估计，还提供聚类结构和每个聚类内模式的不确定性 | 文章讨论了有限混合和无限混合在基于模型方法中的争议以及对模型误设的稳健性，但主要关注的是边际后验的聚类数量 | 研究贝叶斯聚类分析在单细胞RNA测序数据中识别潜在细胞类型以研究胚胎细胞发育的应用 | 单细胞RNA测序数据中的细胞聚类和潜在细胞类型 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 贝叶斯模型 | 数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 303 | 2024-08-08 |
Epithelial cells activate fibroblasts to promote esophageal cancer development
2023-05-08, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2023.03.001
PMID:36963399
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析，揭示了食管鳞状细胞癌（ESCC）发展过程中上皮细胞和成纤维细胞之间的信号交流机制。 | 首次报道了ANXA1在上皮细胞中的表达逐渐减少，并通过FPR2受体影响成纤维细胞的稳态，进而促进ESCC的发展。 | 研究样本仅来自29名患者，可能影响结果的普遍性。 | 探讨食管鳞状细胞癌发展过程中上皮细胞和成纤维细胞之间的信号交流机制。 | 食管鳞状细胞癌的多阶段病变。 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 79个多阶段食管病变样本 | NA | NA | NA | NA |
| 304 | 2024-08-05 |
TAK1 deficiency promotes liver injury and tumorigenesis via ferroptosis and macrophage cGAS-STING signalling
2023-May, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2023.100695
PMID:36968217
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研究论文 | 这篇文章探讨了肝细胞缺失TAK1如何通过铁死亡和巨噬细胞cGAS-STING信号通路促进肝损伤和肿瘤发生 | 文章首次揭示了肝细胞铁死亡引起的氧化DNA损伤如何促进巨噬细胞STING激活，从而加剧肝损伤和肿瘤生成 | 缺乏对肝细胞铁死亡与巨噬细胞STING激活之间精确机制的深入探讨 | 研究肝细胞铁死亡在自发性肝损伤、纤维化和肿瘤发生中的作用 | TAK1缺失的小鼠模型及体外的主要肝细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA-Seq | NA | 生物样本 | TAK1ΔHEP小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 305 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome analysis of male chicken germ cells reveals changes in signaling pathway-related gene expression profiles during mitotic arrest
2023-05, FEBS open bio
IF:2.8Q3
DOI:10.1002/2211-5463.13600
PMID:36961279
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，探讨了雄性胚胎鸡生殖细胞在有丝分裂停滞期间信号通路相关基因表达谱的变化。 | 首次揭示了雄性胚胎鸡生殖细胞在有丝分裂停滞期间多个信号通路的转录水平变化，包括BMP、Notch、JAK-STAT、MAPK、Hedgehog和甲状腺激素信号通路。 | NA | 理解调控有丝分裂停滞的信号通路，为胚胎生殖细胞发育提供新的见解。 | 雄性胚胎鸡生殖细胞在有丝分裂停滞期间的信号通路动态。 | 分子生物学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 306 | 2024-08-05 |
A universal framework for single-cell multi-omics data integration with graph convolutional networks
2023-05-19, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad081
PMID:36929841
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研究论文 | 本研究提出了一种基于图卷积网络的单细胞多组学数据整合的通用框架 | 创新性地提出了GCN-SC框架，利用互近邻算法和图卷积网络有效整合不同的单细胞组学数据 | 未提及特定的局限性 | 旨在解决单细胞多组学数据整合中的挑战 | 涉及六个不同的单细胞数据集 | 数字病理学 | NA | 图卷积网络 | GCN | 单细胞组学数据 | 六个数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 307 | 2024-08-08 |
SoCube: an innovative end-to-end doublet detection algorithm for analyzing scRNA-seq data
2023-05-19, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad104
PMID:36941114
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SoCube的新型深度学习算法，用于精确检测单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据中的双峰现象 | SoCube提出了一种新颖的3D复合特征嵌入策略，并构建了多核、多通道的CNN集成架构，以提高双峰检测的泛化性能 | NA | 开发一种能够精确检测scRNA-seq数据中双峰现象的新算法 | scRNA-seq数据中的双峰现象 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | CNN | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 308 | 2024-08-08 |
Prioritizing prognostic-associated subpopulations and individualized recurrence risk signatures from single-cell transcriptomes of colorectal cancer
2023-05-19, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad078
PMID:36946415
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研究论文 | 本文提出了一种名为scRankXMBD的计算框架，用于从结直肠癌的单细胞转录组数据中优先识别与预后相关的细胞亚群，并开发了个体化的复发风险基因对签名。 | scRankXMBD框架通过基因对的相对表达顺序在单细胞转录组数据中优先识别预后相关细胞亚群，与现有五种方法相比，具有更高的精确度和一致性。 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）由于成本高昂，在大规模队列中的应用受限，且大多数单细胞实验缺乏临床表型信息。 | 开发一种新的计算框架，用于从单细胞转录组数据中识别结直肠癌患者的预后相关细胞亚群和个体化复发风险签名。 | 结直肠癌患者的单细胞转录组数据。 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 计算框架 | 转录组数据 | 未明确提及具体样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 309 | 2024-08-08 |
The Cellular Landscape of Chronic Thromboembolic Pulmonary Hypertension Revealed by Single-Cell Sequencing: Therapeutic Implications?
2023-05-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202302-0326ED
PMID:36952236
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 310 | 2024-08-05 |
Gender differences in smoking-induced changes in the tumor immune microenvironment
2023-05-01, Archives of biochemistry and biophysics
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.abb.2023.109579
PMID:36933758
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研究论文 | 本研究评估了性别和吸烟对肿瘤免疫微环境的影响 | 首次揭示了吸烟对肿瘤免疫微环境的性别特异性差异 | 研究可能受到公开数据集的局限，不能完全代表所有癌症患者 | 探讨吸烟对肿瘤免疫微环境的影响与性别的关系 | 分析男性和女性癌症患者中吸烟对免疫细胞类型的影响 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | 基因组数据 | TCGA数据集（n = 2724），expO数据集（n = 1118），单细胞RNA-seq（n = 14） | NA | NA | NA | NA |
| 311 | 2024-08-05 |
METTL3 (Methyltransferase Like 3)-Dependent N6-Methyladenosine Modification on Braf mRNA Promotes Macrophage Inflammatory Response and Atherosclerosis in Mice
2023-05, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.122.318451
PMID:36951060
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研究论文 | 本研究探讨了METTL3对巨噬细胞中Braf mRNA的N6-甲基腺苷修饰如何促进小鼠的炎症反应和动脉粥样硬化 | 首次揭示了METTL3在巨噬细胞中促进超脂血症诱导的动脉粥样硬化和炎症反应的作用 | 本研究主要基于小鼠模型，临床相关性尚待进一步验证 | 阐明METTL3在巨噬细胞中的作用及其对动脉粥样硬化进展的影响 | 使用Mettl3fl/fl Lyz2cre Apoe-/-小鼠模型来研究巨噬细胞中的METTL3 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序、m6A甲基化RNA免疫沉淀测序、qPCR | NA | RNA | Mettl3fl/fl Lyz2cre Apoe-/-小鼠和对照小鼠，各组涉及数十只小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 312 | 2024-08-08 |
Dissecting the heterogeneities of the tumor microenvironment between metastatic and nonmetastatic primary colorectal cancer patients by single-cell RNA sequencing
2023-May-01, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2023.121576
PMID:36933827
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了转移性和非转移性结直肠癌患者的肿瘤微环境异质性 | 揭示了转移性结直肠癌中癌细胞和成纤维细胞的特定亚型及其功能和分化特征 | 研究仅限于单细胞水平的数据分析，未涉及临床治疗效果的验证 | 深入研究结直肠癌转移的驱动因素，以提高预测和预防结直肠癌转移的方法和药物 | 转移性和非转移性结直肠癌患者的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 50,462个单细胞来自20个原发性结直肠癌样本，包括40,910个非转移性结直肠癌细胞和9552个转移性结直肠癌细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 313 | 2024-08-08 |
FPR2 Shapes an Immune-Excluded Pancreatic Tumor Microenvironment and Drives T-cell Exhaustion in a Sex-Dependent Manner
2023-05-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-2932
PMID:36919330
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和蛋白质分析，揭示了FPR2在女性中塑造免疫排除的胰腺肿瘤微环境并驱动T细胞耗竭的作用 | 首次发现FPR2在女性中通过调节髓系细胞亚群，影响胰腺肿瘤的免疫微环境和T细胞功能 | NA | 深入理解性别驱动的免疫差异如何影响肿瘤进展和肿瘤微环境，以优化性别特异性的免疫治疗 | 胰腺肿瘤中的髓系细胞亚群和T细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质 | 包括野生型和FPR2敲除的小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 314 | 2024-08-05 |
Gene function and cell surface protein association analysis based on single-cell multiomics data
2023-05, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2023.106733
PMID:36924730
|
研究论文 | 这篇文章介绍了一种新的分析框架GFPA，用于从单细胞多组学数据中挖掘基因功能与细胞表面蛋白之间的关联 | 本研究提出了GFPA框架，克服了以往单细胞多组学研究中数据整合的局限，能够深入挖掘基因功能与细胞表面蛋白的可靠关联 | NA | 研究基因功能与细胞表面蛋白的关联 | 研究人类外周血单核细胞中的CD4 T细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | GFPA | 多组学数据 | 人类外周血单核细胞（PBMCs） | NA | NA | NA | NA |
| 315 | 2024-08-08 |
A protocol for single nucleus RNA-seq from frozen skeletal muscle
2023-05, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202201806
PMID:36914268
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研究论文 | 本文介绍了一种用于从冷冻骨骼肌中进行单核RNA测序的新方法 | 提出了一种可靠且成本效益高的方法，适用于长时间冷冻和病理变化显著的人类骨骼肌组织 | NA | 研究人类肌肉疾病 | 人类骨骼肌组织 | 数字病理学 | 肌肉疾病 | 单核RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 316 | 2024-08-08 |
Therapeutic strategies targeting pro-fibrotic macrophages in interstitial lung disease
2023-05, Biochemical pharmacology
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.bcp.2023.115501
PMID:36921632
|
综述 | 本文综述了间质性肺疾病中促纤维化巨噬细胞的作用及其特征，并探讨了通过预防或重编程巨噬细胞极性来治疗肺纤维化的可能性 | 利用单细胞RNA测序等转录组分析技术，详细描绘了促纤维化巨噬细胞的表型特征 | NA | 探讨治疗肺纤维化的新策略，特别是通过干预巨噬细胞极性 | 间质性肺疾病中的促纤维化巨噬细胞 | NA | 间质性肺疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 317 | 2024-08-08 |
Single cell molecular alterations reveal target cells and pathways of conditioned fear memory
2023-05-15, Brain research
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.brainres.2023.148309
PMID:36870465
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了条件性恐惧记忆（CFM）再巩固过程中海马体细胞的转录调控基因变化及其目标细胞 | 首次揭示了CFM再巩固过程中海马体细胞的转录调控基因变化，并发现了与神经退行性疾病相关基因的关联，为CFM在预防阿尔茨海默病中的作用提供了新的转录视角 | 目前的研究仅限于正常C57小鼠，需要进一步在阿尔茨海默病模型小鼠中进行研究以验证初步结论 | 探索条件性恐惧记忆再巩固过程中海马体细胞的转录调控基因变化及其目标细胞 | 海马体细胞及其在条件性恐惧记忆再巩固过程中的转录调控基因变化 | NA | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | 成年雄性C57小鼠的海马体细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 318 | 2024-08-05 |
SCREENING OF POTENTIAL CORE GENES IN THE PERIPHERAL BLOOD OF ADULT PATIENTS WITH SEPSIS BASED ON IMMUNOREGULATION AND SIGNAL TRANSDUCTION FUNCTIONS
2023-05-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002115
PMID:36880832
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研究论文 | 基于免疫调节和信号转导功能，筛选潜在的核心基因用于脓毒症成人患者的外周血 | 首次通过RNA-seq技术和生物信息学方法综合分析脓毒症患者外周血中的核心基因，识别和验证潜在的研究靶点 | 样本量相对较小，只包含23名脓毒症患者和10名正常志愿者，可能影响结果的泛化能力 | 筛选和验证脓毒症患者外周血中的潜在核心基因，以理解其免疫调节作用 | 脓毒症患者的外周血样本以及正常志愿者的外周血样本 | 数字病理学 | 脓毒症 | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 总共33个样本（脓毒症患者23个，正常志愿者10个） | NA | NA | NA | NA |
| 319 | 2024-08-05 |
Insights into the characteristics of primary radioresistant cervical cancer using single-cell transcriptomics
2023-May, Human cell
IF:3.4Q3
DOI:10.1007/s13577-023-00882-x
PMID:36867313
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学探讨了原发性放射抗性宫颈癌的特征 | 开发了三种放射抗性和两种放射敏感的原发性宫颈癌细胞系，并保持了肿瘤内异质性 | 尚未提及具体的研究局限性 | 研究宫颈癌的放射抗性特征 | 来自患者标本的宫颈癌细胞系 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | CR细胞系 | 细胞系特征数据 | 五种细胞系（包括三种放射抗性和两种放射敏感） | NA | NA | NA | NA |
| 320 | 2024-08-05 |
High-resolution anatomical and spatial transcriptome analyses reveal two types of meristematic cell pools within the secondary vascular tissue of poplar stem
2023-05-01, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2023.03.005
PMID:36895162
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研究论文 | 本研究结合高分辨率解剖分析和空间转录组技术，定义了杨树干次生 vascular 组织中 meristematic 细胞的特征 | 研究推断出次生 vascular 组织中存在两种类型的 meristematic 样细胞池，基于高分辨率显微镜和空间转录组结果 | 在技术上对木质树干从初级到次级 vascular 组织的全貌分子特征进行表征存在挑战 | 理解 vascular 植物（如森林树木）的演化、生长和次生径向生长调节机制 | 杨树干中初级和次级 vascular 组织的发展过程中 meristematic 细胞的特征 | 数字病理学 | NA | 空间转录组技术 | NA | 基因表达数据 | 涉及转基因树和单细胞测序样本 | NA | NA | NA | NA |