单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 356 篇文献，本页显示第 261 - 280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2024-08-05 |
m6 A promotes planarian regeneration
2023-May, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13481
PMID:37084418
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研究论文 | 本研究揭示了m6 A修饰在调节整个生物体再生中的不可或缺的作用 | 本研究首次揭示了m6 A修饰如何通过细胞间通讯和细胞周期相关基因调控计划生物的再生 | 研究中未明确探讨m6 A修饰在其他生物体内的作用 | 研究m6 A修饰在计划生物再生过程中的作用 | 计划生物及其成体干细胞（neoblasts） | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA数据 | NA |
| 262 | 2024-08-08 |
Modulation of virus-induced neuroinflammation by the autophagy receptor SHISA9 in mice
2023-05, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-023-01357-3
PMID:37081201
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研究论文 | 研究揭示了SHISA9作为自噬货物受体在单纯疱疹病毒1型感染中通过调节IKKi的降解来调控神经炎症的作用 | 首次发现SHISA9通过介导IKKi的自噬依赖性降解，在病毒感染的不同阶段调节微胶质细胞和星形胶质细胞的抗病毒和炎症反应 | NA | 探讨SHISA9在病毒诱导的神经炎症中的作用及其机制 | 小鼠的微胶质细胞和星形胶质细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | Shisa9小鼠与野生型小鼠 |
| 263 | 2024-08-08 |
Exploration of the heterogeneity and interaction of epithelial cells and NK/T-cells in Laryngeal Squamous Cell Carcinoma based on single-cell RNA sequencing data
2023 May-Jun, Brazilian journal of otorhinolaryngology
IF:1.7Q2
DOI:10.1016/j.bjorl.2023.02.003
PMID:37105033
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据探索喉鳞状细胞癌中上皮细胞和NK/T细胞的异质性及其相互作用 | 本研究揭示了喉鳞状细胞癌的新异质性，并发现了一种新的机制和治疗靶点 | NA | 探索喉鳞状细胞癌中上皮细胞和NK/T细胞的异质性和分化轨迹 | 喉鳞状细胞癌中的上皮细胞和NK/T细胞 | 数字病理学 | 喉鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 包含LSCC01和LSCC02样本的GSE150321数据集 |
| 264 | 2024-08-08 |
The transcriptional and regulatory identity of erythropoietin producing cells
2023-05, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-023-02314-7
PMID:37106166
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA和转座酶可及染色质(ATAC)测序技术，在低氧条件下分子识别了Epo产生细胞，并揭示了其在肾脏中的特定细胞群——Norn细胞，及其在人和小鼠中的保守性。 | 首次通过单细胞测序技术识别并命名了肾脏中主要的内分泌Epo产生细胞——Norn细胞，并提供了其在人类中的保守性证据。 | 研究主要集中在小鼠和人类肾脏组织，未涉及其他物种或组织类型。 | 旨在揭示Epo产生细胞的分子和基因组背景，以促进更有效的贫血治疗。 | Epo产生细胞及其在肾脏中的分子特征和保守性。 | NA | 贫血 | 单细胞RNA测序，转座酶可及染色质(ATAC)测序 | NA | RNA | Epo报告小鼠和人类肾脏组织 |
| 265 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals XBP1-SLC38A2 axis as a metabolic regulator in cytotoxic T lymphocytes in multiple myeloma
2023-05-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2023.216171
PMID:37054944
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，比较了多发性骨髓瘤患者与健康捐赠者骨髓和外周血中T细胞的基因表达谱，揭示了XBP1-SLC38A2轴在细胞毒性T淋巴细胞中的代谢调控作用。 | 首次揭示了XBP1通过直接结合SLC38A2的启动子来抑制其表达，从而影响T细胞的谷氨酰胺摄取和免疫功能。 | 研究样本仅包括10名新诊断的多发性骨髓瘤患者和3名健康捐赠者，样本量较小。 | 阐明多发性骨髓瘤中T淋巴细胞功能障碍和代谢重编程的机制。 | 多发性骨髓瘤患者的骨髓和外周血中的T细胞。 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 10名多发性骨髓瘤患者和3名健康捐赠者 |
| 266 | 2024-08-05 |
Single-Cell Spatial Analysis Identifies Regulators of Brain Tumor-Initiating Cells
2023-05-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-3004
PMID:37067922
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学分析揭示了调节脑肿瘤发起细胞的机制 | 首次揭示了脑肿瘤微环境中不同解剖区域对肿瘤异质性调控的影响 | 研究主要基于小鼠模型，应用于人类具体情况需要进一步验证 | 探索脑肿瘤微环境如何影响脑胶质母细胞瘤的异质性 | 小鼠和人类的脑胶质母细胞瘤微环境 | 数字病理学 | 脑癌 | 空间转录组学和单细胞RNA测序 | 无 | 转录组数据 | 在小鼠模型中使用了特定的脑胶质母细胞瘤细胞系 |
| 267 | 2024-08-08 |
Mesenchymal loss of p53 alters stem cell capacity and models human soft tissue sarcoma traits
2023-05-09, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2023.03.009
PMID:37059101
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研究论文 | 本研究探讨了p53在间充质干细胞中缺失对成人未分化软组织肉瘤（USTS）的影响 | 发现p53缺失导致间充质干细胞的干细胞特性改变，并模拟了人类软组织肉瘤的特征 | NA | 理解间充质干细胞介导的肿瘤发生，并为肉瘤研究提供有效的鼠模型 | 间充质干细胞中的p53缺失及其对软组织肉瘤的影响 | 数字病理学 | 软组织肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 268 | 2024-08-08 |
Identifying a dynamic transcriptomic landscape of the cynomolgus macaque placenta during pregnancy at single-cell resolution
2023-05-08, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.03.012
PMID:37054708
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学方法，全面分析了食蟹猴胎盘在妊娠期间的动态转录组景观 | 首次展示了食蟹猴胎盘在整个妊娠期间的单细胞转录组全景，揭示了胎盘细胞在不同妊娠阶段的特异性差异及其分子机制 | NA | 深入理解灵长类胎盘在妊娠期间的细胞层次结构和分子机制，为支持健康妊娠结果提供基础 | 食蟹猴胎盘在妊娠期间的细胞和分子机制 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 269 | 2024-08-08 |
Characterization of T-cell receptors and immunoglobulin heavy chains loci and identification of T/B cell clusters in teleost
2023-May, Fish & shellfish immunology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.fsi.2023.108746
PMID:37054766
|
研究论文 | 本研究通过Iso-seq技术测序了大量完整的T细胞受体（TCR）和免疫球蛋白重链（IgH）转录本，并利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析了血液白细胞中的T/B细胞簇，揭示了鲆鱼中TCR和IgH基因座的组织结构和表达模式 | 首次全面描述了鲆鱼中T细胞受体和免疫球蛋白重链基因座的基因组织结构，并通过单细胞RNA测序技术验证了这些基因在T/B细胞簇中的高表达 | NA | 旨在深入理解鲆鱼中T细胞受体和免疫球蛋白重链基因座的结构和功能，以及它们在T和B淋巴细胞进化和功能中的作用 | 鲆鱼中的T细胞受体（TCR）和免疫球蛋白重链（IgH）基因座及其在T/B细胞簇中的表达 | 数字病理学 | NA | Iso-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 转录本, 基因表达 | 大量完整的TCR和IgH转录本, 血液白细胞的单细胞RNA测序数据 |
| 270 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome analysis revealed the immune profile of PD-1 blockade in gallbladder carcinoma liver metastasis
2023-05-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000131
PMID:37058121
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了PD-1阻断剂在胆囊癌肝转移中的免疫特征 | 发现PD-1治疗后CD8+T细胞的细胞毒性活性提高和骨髓细胞的促炎表型增强，以及SPP1+TAMs与不良预后相关 | NA | 探讨PD-1阻断剂在胆囊癌肝转移治疗中的免疫机制 | 胆囊癌肝转移患者的免疫细胞动态 | 数字病理学 | 胆囊癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 19,648个高质量单细胞转录组数据 |
| 271 | 2024-08-08 |
Analysis of Madelung disease based on sc-RNA sequencing: A case report and literature review
2023-05, Molecular immunology
IF:3.2Q3
DOI:10.1016/j.molimm.2023.04.005
PMID:37060787
|
病例报告和文献综述 | 本研究首次利用单细胞RNA测序分析了Madelung病中肿瘤细胞与免疫细胞的关系，并结合文献综述提供了新的病理机制视角和临床治疗依据 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析Madelung病中肿瘤细胞与免疫细胞的关系 | 缓解手术效果有限，多数患者治疗后仍会复发或转移 | 探讨Madelung病的病理机制并为靶向治疗提供临床依据 | Madelung病中的肿瘤细胞和免疫细胞 | NA | Madelung病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 272 | 2024-08-08 |
Effect of high alkalinity on shrimp gills: Histopathological alternations and cell specific responses
2023-May, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2023.114902
PMID:37062262
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研究论文 | 本研究首次评估了高碱度胁迫对Exopalaemon carinicauda鳃微结构的影响，并通过单细胞RNA测序探索了鳃细胞在碱度适应中的异质性响应 | 本研究首次使用单细胞RNA测序技术探讨了高碱度胁迫下虾鳃细胞的特定响应和分子机制 | NA | 研究高碱度胁迫对虾鳃的组织病理变化和细胞特异性响应 | Exopalaemon carinicauda虾的鳃细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 273 | 2024-08-08 |
Dissecting aortic aneurysm in Marfan syndrome is associated with losartan-sensitive transcriptomic modulation of aortic cells
2023-05-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.168793
PMID:37022786
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了马凡综合征小鼠模型中胸主动脉瘤相关转录组变化，发现了一种与洛沙坦敏感的转录组调控相关的特定细胞亚群。 | 首次在马凡综合征小鼠模型中识别出两种特定的主动脉细胞亚群，并揭示了这些细胞在胸主动脉瘤发展中的动态变化。 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步的人体研究来验证这些发现。 | 旨在深入理解导致胸主动脉瘤和急性主动脉夹层的病理机制。 | 马凡综合征小鼠模型中的主动脉细胞。 | 数字病理学 | 马凡综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | Fbn1mgR/mgR小鼠的主动脉细胞 |
| 274 | 2024-08-08 |
Accurate and interpretable gene expression imputation on scRNA-seq data using IGSimpute
2023-05-19, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad124
PMID:37039664
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为IGSimpute的方法，用于在scRNA-seq数据中准确且可解释地恢复缺失值 | IGSimpute通过引入可解释的实例级基因选择层（GSL），在保持高准确性的同时提供了可解释性 | NA | 提高scRNA-seq数据中缺失值恢复的准确性和可解释性 | scRNA-seq数据中的基因表达缺失值 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 涉及17个数据集，包括心脏和大动脉以及四肢肌肉组织 |
| 275 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Unique Alterations in the Immune Panorama and Treg Subpopulations in Mice during the Late Stages of Echinococcus granulosus Infection
2023-05-16, Infection and immunity
IF:2.9Q2
DOI:10.1128/iai.00029-23
PMID:37039643
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和免疫组库测序技术，分析了健康和感染细粒棘球蚴的小鼠脾脏及外周血单个核细胞中的53,298个细胞，揭示了感染晚期小鼠免疫全景和调节性T细胞亚群的独特改变。 | 本研究首次详细描述了细粒棘球蚴感染晚期小鼠免疫细胞的全谱变化，包括先前研究中未被重视的细胞亚群。 | NA | 研究细粒棘球蚴感染晚期小鼠免疫系统的变化，特别是调节性T细胞亚群的负向免疫调节作用。 | 健康和感染细粒棘球蚴的小鼠脾脏及外周血单个核细胞。 | 数字病理学 | 寄生虫病 | 单细胞RNA测序，免疫组库测序 | NA | 细胞 | 53,298个细胞 |
| 276 | 2024-08-05 |
Recent advances in single-cell subcellular sampling
2023-May-02, Chemical communications (Cambridge, England)
DOI:10.1039/d3cc00573a
PMID:37039236
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研究论文 | 文章探讨了单细胞技术在亚细胞采样中的最新进展 | 引入了微侵入性分析工具，避免了细胞裂解，提升了活细胞分析的可行性 | 当前技术限制了广泛的单细胞追踪和应用 | 研究如何有效去除活细胞内容物以进行下游分析 | 重点关注单细胞的化学成分及其动态分析 | 数字病理学 | NA | 单细胞分析技术 | NA | NA | NA |
| 277 | 2024-08-05 |
Deep Multi-Constraint Soft Clustering Analysis for Single-Cell RNA-Seq Data via Zero-Inflated Autoencoder Embedding
2023 May-Jun, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2023.3240253
PMID:37022218
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研究论文 | 本研究提出了一种基于零膨胀自动编码器嵌入的单细胞多约束深度软聚类分析框架 | 提出了一种新的细胞级紧凑性约束，通过考虑相似细胞之间的关联来强调聚类之间的紧凑性 | 未提及具体的限制 | 研究单细胞RNA-seq数据的聚类问题 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 零膨胀负二项模型 | 加权软K均值算法 | 单细胞RNA测序数据 | 十一组单细胞RNA-seq数据集 |
| 278 | 2024-08-05 |
scENT for Revealing Gene Clusters From Single-Cell RNA-Seq Data
2023 May-Jun, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2023.3242260
PMID:37022879
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研究论文 | 本文提出了一种新颖的深度学习框架scENT，用于从单细胞RNA-seq数据中识别显著的基因簇 | scENT集成了在单细胞RNA-seq数据学习过程中引入扰动，以提高其对高维数据的鲁棒性和性能 | 目前的方法尚未充分开发以探讨具有生物学意义的基因级簇 | 探索基因与人类疾病之间的关系并识别重要的基因簇 | 基于患者的阿尔茨海默病和脑转移的公共实验单细胞RNA-seq数据 | 数字病理 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 深度学习 | 基因表达数据 | NA |
| 279 | 2024-08-05 |
Role of stemness-related genes TIMP1, PGF, and SNAI1 in the prognosis of colorectal cancer through single-cell RNA-seq
2023-05, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.5833
PMID:37017587
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研究论文 | 本研究分析了与癌症干性相关的预后基因TIMP1、PGF和SNAI1在结直肠癌中的作用 | 识别了与结直肠癌预后相关的新的干性基因，可能成为结直肠癌的潜在治疗靶点 | 研究可能缺乏多中心验证和临床试验进一步确认 | 分析基于单细胞RNA测序数据的结直肠癌干性相关预后基因 | 研究结直肠癌（CRC）中的干性相关基因及其预后 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 单个细胞轨迹模型 | 基因表达数据 | 7916个差异表达基因（CRC和正常组织） |
| 280 | 2024-08-08 |
ScCCL: Single-Cell Data Clustering Based on Self-Supervised Contrastive Learning
2023 May-Jun, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2023.3241129
PMID:37022258
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研究论文 | 本文提出了一种基于自监督对比学习的单细胞数据聚类方法ScCCL | ScCCL通过随机遮蔽基因表达并添加高斯噪声，利用动量编码器结构提取特征，并在实例级和聚类级对比学习模块中应用对比学习，提高了聚类效果 | NA | 探索单细胞RNA测序数据在细胞层面的异质性，并改进聚类计算方法 | 单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | 对比学习 | 基因表达数据 | 多个公共数据集 |