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当前共找到 352 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-05-30 |
Deciphering tumor ecosystems at super resolution from spatial transcriptomics with TESLA
2023-05-17, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2023.03.008
PMID:37164011
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研究论文 | 提出一种名为TESLA的机器学习框架，通过整合组织学信息和基因表达，在空间转录组数据中实现像素级分辨率的组织注释，揭示肿瘤微环境的超分辨率结构 | 首次利用机器学习方法整合组织学图像与基因表达数据，实现空间转录组像素级分辨率组织注释，能够检测三级淋巴结构等独特肿瘤微环境特征 | 主要验证在癌症领域的应用，虽声称可推广至其他疾病但未充分验证；依赖Visium等低分辨率平台数据的空间覆盖问题 | 开发高分辨率空间转录组数据分析工具，解析肿瘤微环境的细胞组成、空间分布及精细组织结构 | 肿瘤微环境中的免疫细胞和肿瘤细胞，包括其丰度、组成和空间定位 | 机器学习， 数字病理学 | 肿瘤疾病 | 空间转录组学 | 机器学习框架 | 图像， 基因表达数据 | 未说明具体样本数量 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | Visium低分辨率空间转录组平台 |
| 2 | 2026-05-29 |
scDisInFact: disentangled learning for integration and prediction of multi-batch multi-condition single-cell RNA-sequencing data
2023-May-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.05.01.538975
PMID:37205545
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研究论文 | 提出scDisInFact，一种解耦学习方法，用于多批次多条件单细胞RNA测序数据的整合与预测 | 首次同时建模批次效应和条件效应，实现批次效应去除、条件相关关键基因检测和扰动预测三项任务的联合执行 | 仅在模拟和真实数据集上验证，未提及对复杂临床场景的泛化能力或计算资源需求 | 开发能够解耦批次效应和条件效应的深度学习框架，以提升多批次多条件scRNA-seq数据的整合与预测准确性 | 多批次多条件单细胞RNA测序数据，包括模拟数据和真实数据集 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 深度学习 (解耦学习框架) | 基因表达数据 (单细胞转录组) | 模拟数据集和真实数据集（具体规模未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | NA |
| 3 | 2026-05-28 |
RNA polymerase II pausing is essential during spermatogenesis for appropriate gene expression and completion of meiosis
2023-May-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.05.08.539879
PMID:37215034
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研究论文 | 本研究利用稳态、新生和单细胞RNA测序策略全面分析雄性生殖细胞群体的基因表达，揭示RNA聚合酶II暂停在精子发生过程中对基因表达调控和减数分裂完成的关键作用 | 首次发现RNA聚合酶II暂停在精子分化的早期阶段对建立基因活性图谱至关重要，并揭示了Pol II暂停在减数分裂过程中对SPO11介导的双链断裂形成的新调控作用 | 未在摘要中明确说明研究局限性 | 阐明RNA聚合酶II暂停在雄性生殖细胞分化和减数分裂中的调控机制 | 雄性生殖细胞（包括未成熟和成熟精子细胞） | 机器学习 | 不育症 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 新生RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2026-05-25 |
Tissue nanotransfection causes tumor regression by its effect on nanovesicle cargo that alters microenvironmental macrophage state
2023-05-03, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2022.11.003
PMID:36380587
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研究论文 | 本研究首次通过纳米级荧光可视化，揭示肿瘤来源携带miR-126的细胞外囊泡如何改变肿瘤相关巨噬细胞状态，促进肿瘤形成，并通过组织纳米转染技术实现肿瘤消退 | 首次实现肿瘤来源细胞外囊泡及其miR-126 cargo的纳米级荧光可视化，并阐明其通过诱导肿瘤相关巨噬细胞向血管生成状态转变来促进肿瘤形成的新机制，同时利用局部组织纳米转染技术有效靶向该过程 | 研究基于小鼠血管肿瘤模型，结论向人类肿瘤的转化尚需验证；未明确组织纳米转染技术应用于深层肿瘤的可行性 | 探究肿瘤来源细胞外囊泡携带的miR-126如何通过改变肿瘤微环境中的巨噬细胞状态来促进肿瘤形成，并评估局部组织纳米转染技术作为治疗手段的效果 | 小鼠致死性血管肿瘤模型中的肿瘤细胞、肿瘤相关巨噬细胞及肿瘤来源细胞外囊泡 | 数字病理学 | 肿瘤（血管肿瘤） | NA | NA | 图像（纳米级荧光可视化）、测序数据（单细胞RNA-seq） | 小鼠模型，未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5 | 2026-05-22 |
Stress resilience-enhancing drugs preserve tissue structure and function in degenerating retina via phosphodiesterase inhibition
2023-05-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2221045120
PMID:37126699
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研究论文 | 通过系统药理学平台识别环核苷酸磷酸二酯酶抑制作为增强视网膜应激韧性的治疗策略，在多种视网膜退行性模型中保护组织结构与功能 | 首次通过整合单细胞转录组学、蛋白质组学和磷酸蛋白质组学，揭示年龄相关和遗传性视网膜退行性病变的通用分子机制，并证明选择性抑制环核苷酸磷酸二酯酶可同时激活保护性机制并协同抑制退行性过程 | 未提供 | 开发针对视网膜退行性疾病早期阶段的治疗方法，以保留视网膜结构和视觉功能 | 年龄相关和遗传性视网膜退行性病变的多种模型 | 系统药理学 | 年龄相关性黄斑变性、糖尿病视网膜病变、视网膜色素变性 | 单细胞转录组学、蛋白质组学、磷酸蛋白质组学 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据、磷酸蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、蛋白质组学、磷酸蛋白质组学 | NA | NA |
| 6 | 2026-05-01 |
Identification of an adipose tissue-resident pro-preadipocyte population
2023-05-30, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112440
PMID:37119138
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序发现脂肪组织中一种驻留的前前脂肪细胞群体 | 识别并定位了一种新的前前脂肪细胞群体，将其置于前脂肪细胞分化的上游层次结构中，并揭示了调节脂肪生成的生理机制 | 仅基于单细胞RNA测序数据，未提供体内功能验证或谱系追踪实验 | 阐明脂肪细胞分化过程中的过渡阶段，并识别新的祖细胞群体 | 脂肪组织基质血管组分中的CD31阴性CD45阴性细胞 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 7 | 2026-04-25 |
[Single-cell transcriptome analysis reveals development atlas of mouse molar pulp cells]
2023-May-09, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序分析小鼠磨牙发育过程，构建牙髓细胞时空发育图谱 | 首次构建小鼠磨牙牙髓细胞发育的时空图谱，揭示牙髓细胞分化为成熟牙髓细胞和成牙本质细胞的两条发育轨迹 | 仅使用小鼠模型，研究时间点有限（出生后第0、3、7天） | 研究牙齿发育过程中牙髓细胞的发育过程和调控机制 | C57BL/6小鼠的十颗下颌第一磨牙（出生后第0天和第3天）及之前研究中的第7天数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 10颗小鼠下颌第一磨牙（出生后第0天和第3天各5颗） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics平台进行单细胞RNA测序 |
| 8 | 2026-04-08 |
The 'omics of obesity in B-cell acute lymphoblastic leukemia
2023-05-04, Journal of the National Cancer Institute. Monographs
DOI:10.1093/jncimonographs/lgad014
PMID:37139973
|
研究论文 | 本研究通过多组学方法探讨肥胖如何影响B细胞急性淋巴细胞白血病（B-ALL）的细胞功能和化疗耐药性 | 首次结合单细胞和批量转录组学、代谢组学及蛋白质组学分析，揭示脂肪细胞分泌组对B-ALL细胞的代谢、氧化应激保护、生存和化疗耐药性的调控作用，并发现肥胖相关的B细胞特异性转录特征与患者生存结局相关 | 研究主要基于体外和动物模型，人类样本分析可能受限于样本数量和异质性，且未详细探讨肥胖与B-ALL之间的因果关系机制 | 探究肥胖如何通过脂肪细胞影响B-ALL细胞的生物学功能及化疗耐药性，以识别潜在的治疗靶点 | 正常和恶性B细胞、小鼠模型、健康捐赠者和B-ALL患者的血清和血浆样本 | 数字病理学 | B细胞急性淋巴细胞白血病 | RNA测序（单细胞和批量转录组学）、质谱分析（代谢组学和蛋白质组学） | NA | 转录组数据、代谢组数据、蛋白质组数据 | 涉及小鼠模型、健康捐赠者和B-ALL患者的样本，具体数量未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, 代谢组学, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 9 | 2026-03-02 |
Massively parallel base editing to map variant effects in human hematopoiesis
2023-05-25, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2023.03.035
PMID:37137305
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研究论文 | 本文开发了一种大规模并行碱基编辑筛选方法，应用于人类造血干细胞和祖细胞，以系统性评估遗传变异在造血过程中的功能影响 | 首次在人类造血干细胞和祖细胞中实现大规模并行碱基编辑筛选，结合单细胞RNA测序和单细胞基因分型，实现跨造血分化状态的功能变异效应映射 | 方法主要针对造血系统，可能不适用于其他类型的原代细胞，且依赖于碱基编辑技术的特异性 | 系统性评估遗传变异对人类造血过程的影响，以研究疾病机制并开发治疗策略 | 人类造血干细胞和祖细胞 | 基因编辑与功能基因组学 | 血液疾病 | 碱基编辑，单细胞RNA测序，单细胞基因分型 | NA | 单细胞RNA测序数据，基因分型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10 | 2026-02-10 |
Profiling the bloodstream form and procyclic form Trypanosoma brucei cell cycle using single-cell transcriptomics
2023-05-11, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.86325
PMID:37166108
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术，对布氏锥虫的血液期和原循环期细胞周期进行了高分辨率转录组分析 | 首次在无需细胞分选或同步化的情况下，通过单细胞转录组学获得了两种生命形式的高分辨率细胞周期调控转录组；开发了适用于冷冻保存样本的高效冻融方案 | 研究主要基于转录组层面，蛋白质功能验证和调控机制研究有待深入 | 解析布氏锥虫不同生命阶段的细胞周期调控机制 | 布氏锥虫的血液期和原循环期细胞 | 单细胞组学 | 寄生虫感染（锥虫病） | 单细胞转录组学 | 周期性伪时间推断计算模型 | 单细胞转录组数据 | 未同步化的细胞群体（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11 | 2025-12-31 |
Novel Populations of Lung Capillary Endothelial Cells and Their Functional Significance
2023-May-03, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2887159/v1
PMID:37205391
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学技术，在肺毛细血管内皮细胞中发现了五个具有不同分子特征和功能的新细胞群 | 首次识别出五个新的肺毛细血管内皮细胞群，包括表达特定离子转运蛋白的细胞群、具有再生功能的“根”细胞群以及具有血管生成调节能力的细胞群 | 研究主要基于单细胞转录组学数据，需要进一步的体内功能验证 | 探究肺毛细血管内皮细胞的异质性及其在生理和病理过程中的功能 | 肺毛细血管内皮细胞 | 单细胞组学 | 肺疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12 | 2025-12-04 |
PfAP2-MRP DNA-binding protein is a master regulator of parasite pathogenesis during malaria parasite blood stages
2023-May-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.05.23.541898
PMID:37293082
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研究论文 | 本文鉴定并表征了疟原虫血液阶段的关键转录因子PfAP2-MRP，揭示了其在调控寄生虫生长、抗原变异和染色质结构中的核心作用 | 首次将PfAP2-MRP鉴定为疟原虫致病性的主调控因子，并阐明其在两个不同发育阶段（滋养体和裂殖体）的转录调控机制，包括通过ChIP-seq、单细胞RNA-seq和Hi-C技术揭示其对基因表达和染色质构象的多层次控制 | 研究主要基于体外实验和特定时间点的分析，可能未完全反映体内复杂环境下的调控网络；基因敲除模型的长期效应和临床相关性有待进一步验证 | 探究疟原虫在红细胞内发育周期中致病性的分子调控机制，特别是转录因子在寄生虫生长、宿主细胞重塑和免疫逃避中的作用 | 恶性疟原虫（Plasmodium falciparum）的血液阶段寄生虫，重点关注其转录因子PfAP2-MRP及相关基因家族 | 分子生物学与寄生虫学 | 疟疾 | ChIP-seq、单细胞RNA-seq、荧光激活细胞分选、染色体构象捕获（Hi-C）、诱导性基因敲除 | NA | 基因组DNA、RNA、染色质互作数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学（未明确指定平台） | NA | NA |
| 13 | 2025-11-29 |
Low TCR Binding Strength Results in Increased Progenitor-like CD8+ Tumor-Infiltrating Lymphocytes
2023-05-03, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-22-0761
PMID:36787375
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研究论文 | 本研究探讨TCR结合强度对肿瘤微环境中CD8+肿瘤浸润淋巴细胞功能分化的影响 | 首次在內源性多克隆T细胞反应中揭示TCR结合强度与祖细胞样表型分化的关联 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床样本验证尚不充分 | 阐明TCR结合强度如何影响T细胞在肿瘤微环境中的功能分化 | 肿瘤浸润淋巴细胞（TIL）和TCR转基因小鼠模型 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，MHC四聚体标记 | NA | 转录组数据，蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 14 | 2025-10-05 |
The Genetic Landscape of Familial Pulmonary Fibrosis
2023-05-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202204-0781OC
PMID:36622818
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研究论文 | 通过全外显子组测序和遗传分析对569个家族性肺纤维化家系进行综合遗传风险评估 | 定义了已知FPF相关基因中罕见变异的流行率，发现了新的候选基因和通路，并开发了跨家系评估罕见变异基因的工具 | 未能在多个家系中发现共享的新罕见变异基因，表明大多数FPF家系存在遗传异质性 | 探索家族性肺纤维化的遗传风险因素 | 569个家族性肺纤维化家系中的患病个体 | 遗传学 | 肺纤维化 | 全外显子组测序, 候选基因测序, 共分离分析, 基因负荷分析, 单细胞转录组学 | NA | 基因组测序数据, 转录组数据 | 569个FPF家系 | NA | 全外显子组测序, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 15 | 2025-10-06 |
Single-cell multiomic analysis identifies a HOX-PBX gene network regulating the survival of lymphangioleiomyomatosis cells
2023-05-10, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adf8549
PMID:37163604
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研究论文 | 通过单细胞多组学分析发现HOX-PBX基因网络调控淋巴管平滑肌瘤病细胞存活机制 | 首次在肺LAM细胞中发现子宫特异性HOX-PBX转录程序的激活，并证实HOXD11-PBX1二聚化是细胞存活的关键调控机制 | NA | 探索淋巴管平滑肌瘤病的发病机制并寻找新的治疗靶点 | 淋巴管平滑肌瘤病肺组织细胞 | 单细胞多组学 | 淋巴管平滑肌瘤病 | 单细胞RNA测序, 单核ATAC测序 | 基因调控网络分析 | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 16 | 2025-10-06 |
Distinct Th17 effector cytokines differentially promote microglial and blood-brain barrier inflammatory responses during post-infectious encephalitis
2023-May-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.10.532135
PMID:37215000
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示了A组链球菌感染后Th17效应细胞因子如何差异调节小胶质细胞和血脑屏障的炎症反应 | 首次在单细胞水平揭示IL-17A而非GM-CSF在GAS感染后脑炎中的关键作用，并发现小胶质细胞来源的趋化因子在患者血清中升高 | 研究主要基于小鼠疾病模型，人类临床验证仍需进一步研究 | 探究Th17效应细胞因子在感染后脑炎中对小胶质细胞和血脑屏障炎症反应的调控机制 | 小鼠疾病模型、内皮细胞、小胶质细胞、Th17淋巴细胞 | 神经免疫学 | 感染后脑炎 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 中和抗体实验 | 小鼠疾病模型 | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 17 | 2025-10-06 |
Integrative Proteomics and N-Glycoproteomics Analyses of Rheumatoid Arthritis Synovium Reveal Immune-Associated Glycopeptides
2023-05, Molecular & cellular proteomics : MCP
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.mcpro.2023.100540
PMID:37019382
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研究论文 | 通过整合蛋白质组学和N-糖基化蛋白质组学分析类风湿关节炎滑膜组织，揭示免疫相关糖肽特征 | 首次系统描绘类风湿关节炎滑膜组织的N-糖基化蛋白质组图谱，发现特定糖基化位点与免疫细胞浸润的显著相关性 | 样本量未明确说明，分析主要基于生物信息学预测需要实验验证 | 探究类风湿关节炎滑膜组织中蛋白质N-糖基化的特征及其与免疫反应的关系 | 类风湿关节炎患者的滑膜组织样本 | 蛋白质组学 | 类风湿关节炎 | N-糖基化蛋白质组学，生物信息学分析，单细胞转录组数据整合 | NA | 蛋白质组数据，糖基化肽段数据，转录组数据 | NA | NA | 蛋白质组学，糖基化分析，单细胞RNA-seq | DNASTAR | NA |
| 18 | 2025-10-06 |
Interference of sympathetic overactivation restores limbal stem/progenitor cells function and accelerates corneal epithelial wound healing in diabetic mice
2023-May, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2023.114523
PMID:36931034
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研究论文 | 本研究揭示了糖尿病角膜病变中交感神经过度激活通过NE-Adrb2-Shh信号通路损害角膜缘干/祖细胞功能和角膜上皮再生的机制 | 首次发现交感神经过度激活在糖尿病角膜病变中的作用机制，并证实通过干扰该通路可恢复角膜缘干/祖细胞功能 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床应用效果需进一步验证 | 探究糖尿病角膜病变中角膜缘干/祖细胞功能障碍的分子机制 | 糖尿病小鼠和人类角膜组织 | 眼科疾病研究 | 糖尿病角膜病变 | 单细胞测序, RT-PCR, 化学遗传学 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 组织学图像 | 糖尿病小鼠模型和人类角膜样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 19 | 2025-10-06 |
Cardiovascular utility of single cell RNA-Seq
2023-05-01, Current opinion in cardiology
IF:2.0Q3
DOI:10.1097/HCO.0000000000001014
PMID:36728943
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在心血管疾病领域的应用现状与未来前景 | 系统总结了单细胞RNA测序在心脏病学中的创新应用，并展望了在心脏电生理学和心脏肿瘤学等新兴领域的潜在价值 | 当前研究主要集中于结构性或动脉粥样硬化性心脏病，其他心脏疾病领域的研究相对有限 | 探讨单细胞RNA测序技术在心血管疾病诊断、风险分层和治疗靶点发现中的应用潜力 | 心血管疾病相关细胞类型和分子机制 | 自然语言处理 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 20 | 2025-10-06 |
A human liver organoid screening platform for DILI risk prediction
2023-05, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2023.01.019
PMID:36738840
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研究论文 | 本研究开发了基于人肝类器官的高通量和器官芯片平台用于药物性肝损伤风险预测 | 首次将人肝类器官同时应用于高通量筛选和器官芯片系统进行DILI风险评估，并展示了其在预测协同肝毒性和机制研究方面的能力 | 仅使用了三个iPSC细胞系，样本规模有限；需要进一步验证在更广泛药物和患者群体中的适用性 | 评估人肝类器官在药物性肝损伤风险预测中的应用价值 | 人肝类器官、肝毒性化合物 | 器官芯片技术 | 药物性肝损伤 | 单细胞转录组学、生化检测、形态学分析 | 器官芯片、类器官模型 | 转录组数据、图像数据、生化指标数据 | 三个独立的iPSC细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |