单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 352 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-09-21 |
Emergence of division of labor in tissues through cell interactions and spatial cues
2023-05-30, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112412
PMID:37086403
|
研究论文 | 该文章开发了一个计算框架，研究细胞间相互作用和空间线索如何导致细胞类型群体内的劳动分工，并通过优化集体任务性能来推断分工机制 | 提出了一个计算框架来研究劳动分工的机制，通过优化在权衡下的集体细胞任务性能，发现可区分的表达模式可以从细胞-细胞相互作用与指导信号中出现，并提出了一种构建专家细胞间配体-受体网络的方法 | 摘要中未提及具体限制 | 研究组织环境中劳动分工的出现机制，特别是细胞相互作用和空间线索的贡献 | 基质细胞、上皮细胞和免疫细胞 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 计算框架 | 基因表达数据, 空间数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2 | 2026-09-21 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals Evidence of Endothelial Dysfunction in the Brains of COVID-19 Patients with Implications for Glioblastoma Progression
2023-May-05, Brain sciences
IF:2.7Q3
DOI:10.3390/brainsci13050762
PMID:37239234
|
研究论文 | 该研究通过单细胞转录组分析揭示了COVID-19患者脑血管内皮功能障碍的特征，并探讨其与胶质母细胞瘤进展的潜在联系 | 首次通过单细胞转录组对比分析COVID-19与胶质母细胞瘤中脑血管内皮功能障碍的转录组特征，发现两者在先天免疫和炎症通路上的显著重叠，包括干扰素调节基因 | 样本量有限，仅基于公共数据库GEO中的两个数据集进行分析，缺乏实验验证，且未进行体内外功能实验来证实内皮功能障碍在两种疾病间的因果联系 | 探究COVID-19引起的脑血管内皮功能障碍的单细胞转录组景观及其对胶质母细胞瘤进展的潜在影响 | COVID-19患者脑组织内皮细胞和胶质母细胞瘤相关内皮细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | 两个公共数据集（GSE131928和GSE159812） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3 | 2026-09-21 |
Reversible transitions between noradrenergic and mesenchymal tumor identities define cell plasticity in neuroblastoma
2023-05-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-38239-5
PMID:37142597
|
研究论文 | 该研究记录了神经母细胞瘤中去甲肾上腺素能身份与间充质身份之间自发且可逆的细胞可塑性，并揭示微环境对肿瘤细胞身份的驱动作用 | 首次在多种神经母细胞瘤模型中记录到两种身份之间自发且可逆的转变，并结合18例肿瘤活检和15个PDX模型的单细胞RNA-seq证实该可塑性在患者肿瘤中具有相关性 | 主要基于细胞系和PDX模型，尚需更多患者样本验证；微环境驱动身份转变的具体分子机制尚未完全阐明 | 阐明神经母细胞瘤中去甲肾上腺素能与间充质身份之间的关系及其在患者肿瘤中的相对贡献 | 神经母细胞瘤细胞系、异种移植瘤、18例肿瘤活检及15个PDX模型 | 数字病理学, 机器学习 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA-seq, 表观遗传学分析 | NA | 文本, 图像 | 18例肿瘤活检和15个PDX模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2026-09-21 |
BACE1 regulates expression of Clusterin in astrocytes for enhancing clearance of β-amyloid peptides
2023-05-04, Molecular neurodegeneration
IF:14.9Q1
DOI:10.1186/s13024-023-00611-w
PMID:37143090
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现BACE1缺失上调星形胶质细胞中Clusterin和Cxcl14的表达，并通过胰岛素受体通路增强β-淀粉样蛋白的清除 | 首次揭示BACE1在星形胶质细胞中通过调控胰岛素受体切割来调节Clusterin和Cxcl14的表达，从而影响Aβ清除，提出抑制星形胶质细胞BACE1作为增强Aβ清除的潜在替代策略 | 机制研究主要基于体外培养的星形胶质细胞，体内具体信号通路仍需进一步验证，且未评估长期抑制BACE1的安全性 | 探究BACE1在星形胶质细胞中的功能及其对Aβ清除的调控作用 | Bace1敲除小鼠的星形胶质细胞、5xFAD阿尔茨海默病模型小鼠、星形胶质细胞特异性Bace1敲除小鼠 | 机器学习, 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | Bace1敲除小鼠及野生型对照小鼠的纯化星形胶质细胞，5xFAD;Bace1fl/fl;UBC-creER与5xFAD;Bace1fl/fl对照小鼠的星形胶质细胞，以及体外培养的星形胶质细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5 | 2026-09-21 |
Novel Populations of Lung Capillary Endothelial Cells and Their Functional Significance
2023-May-03, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2887159/v1
PMID:37205391
|
研究论文 | 通过单细胞转录组测序鉴定出五种新型肺毛细血管内皮细胞亚群，并揭示其在血管分区、屏障建立、再生修复和血管生成中的功能 | 首次发现五种新型gCaps亚群，包括表达Scn7a和Clic4的离子转运体亚群、有丝分裂活跃的Flot1+根细胞、表达Lingo2的静脉-毛细血管内皮以及高表达Fabp4和Tip细胞标志物的血管生成调节亚群 | 未提及 | 研究肺毛细血管内皮细胞的异质性及其在正常生理和肺疾病病理生物学中的功能意义 | 肺内皮细胞 | 单细胞转录组学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 转录组数据 | 未提及 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 6 | 2026-09-21 |
Explainable multi-task learning for multi-modality biological data analysis
2023-05-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-37477-x
PMID:37137905
|
研究论文 | 本文提出了UnitedNet，一个可解释的多任务深度神经网络，用于整合不同任务以分析单细胞多模态数据，并在多种数据集上验证了其性能。 | UnitedNet能够同时执行多模态整合和跨模态预测等多个任务，并通过可解释机器学习算法直接量化基因表达与其他模态之间的关系，具有细胞类型特异性。 | 未明确提及。 | 全面理解单细胞多模态数据，推断基因调控如何驱动生物多样性和功能。 | 单细胞多模态数据，包括Patch-seq、multiome ATAC+基因表达和空间转录组学数据。 | 机器学习, 计算生物学 | NA | 单细胞多模态测序, 空间转录组学 | 深度神经网络 | 多模态数据（如RNA、DNA可及性、蛋白质） | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7 | 2026-09-21 |
TissUUmaps 3: Improvements in interactive visualization, exploration, and quality assessment of large-scale spatial omics data
2023-May, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2023.e15306
PMID:37131430
|
研究论文 | 本文介绍了TissUUmaps 3，一个用于大规模空间组学数据交互式可视化、探索和质量评估的开源浏览器工具，新增了标记与区域可视化、空间统计探索、组织形态定量分析和原位转录组数据解码质量评估等模块 | TissUUmaps 3在之前版本基础上进行了针对性优化，显著提升了大规模多重数据集的性能，新增了标记与区域可视化、空间统计探索、组织形态定量分析以及原位转录组数据解码质量评估等模块，并支持多分辨率图像即时查看、自定义、共享及集成到Jupyter Notebooks中 | 摘要中未明确提及该工具的局限性 | 改进大规模空间组学数据的交互式可视化、探索和质量评估，降低交互式数据探索的时间和成本，促进大规模空间组学数据的广泛传播和灵活共享 | 大规模空间组学数据，包括空间转录组学数据、多重组织样本图像及107+数据点 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学，原位转录组学 | NA | 图像，文本 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 8 | 2026-09-21 |
Sleep loss potentiates Th17-cell pathogenicity and promotes autoimmune uveitis
2023-05, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1250
PMID:37132178
|
研究论文 | 该研究通过质谱流式、单细胞RNA测序和流式细胞术，揭示了睡眠剥夺通过IL-23-Th17-GM-CSF反馈机制增强Th17细胞致病性并促进自身免疫性葡萄膜炎发展的机制 | 首次揭示了睡眠剥夺通过IL-23-Th17-GM-CSF正反馈环路促进Th17细胞致病性和髓系细胞活化，从而加重自身免疫性葡萄膜炎的机制，并发现抗GM-CSF治疗可挽救睡眠剥夺诱导的葡萄膜炎加重 | 人类样本量较小（仅6例健康受试者），机制研究主要基于小鼠模型，睡眠剥夺与自身免疫疾病之间的因果关系在人类中尚需更大规模研究验证 | 探究睡眠剥夺如何影响免疫系统及自身免疫性疾病的发生发展，特别是与自身免疫性葡萄膜炎的关系 | 6名健康受试者（睡眠剥夺前后）的外周血单个核细胞、睡眠剥夺小鼠模型和实验性自身免疫性葡萄膜炎（EAU）小鼠模型的颈部引流淋巴结 | 免疫学 | 自身免疫性葡萄膜炎 | 质谱流式、单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据、质谱流式数据、流式细胞术数据 | 6名健康受试者睡眠剥夺前后的外周血单个核细胞，以及睡眠剥夺和EAU小鼠模型的颈部引流淋巴结 | NA | single-cell RNA-seq, 质谱流式 | NA | NA |
| 9 | 2026-09-20 |
MetaTiME integrates single-cell gene expression to characterize the meta-components of the tumor immune microenvironment
2023-05-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-38333-8
PMID:37149682
|
研究论文 | 该文章开发了一个数据驱动的框架MetaTiME，通过整合单细胞基因表达数据来表征肿瘤免疫微环境的元组分 | 利用数据驱动的方式从数百万肿瘤微环境单细胞中学习元组分，克服了传统手动标记在分辨率和一致性上的局限，能够编码跨癌种观察到的独立基因表达组分，并可通过表观遗传学数据揭示关键的转录调控因子 | 未明确提及 | 克服使用已知基因标记进行手动标注所导致的分辨率和一致性局限，整合多个肿瘤scRNA-seq数据集以表征肿瘤微环境中常见的细胞类型和状态 | 肿瘤微环境中的单细胞（包括非癌细胞） | 数字病理学、机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本（基因表达数据）、表观遗传学数据 | 数百万个肿瘤微环境单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10 | 2026-09-20 |
Acoel single-cell atlas reveals expression dynamics and heterogeneity of adult pluripotent stem cells
2023-05-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-38016-4
PMID:37147314
|
研究论文 | 该研究对无腔动物Hofstenia miamia在胚后发育和再生过程中进行单细胞RNA测序，构建了细胞图谱并揭示了成体多能干细胞的表达动态和异质性。 | 首次对无腔动物Hofstenia miamia进行单细胞RNA测序，构建了跨发育阶段和再生过程的转录细胞状态图谱，鉴定出共享细胞类型及其基因表达动态，发现了一个富集组蛋白变体H3.3的新胚细胞亚群，该亚群似乎缺乏分化特化。 | 摘要中未明确提及研究局限性。 | 研究无腔动物成体多能干细胞的细胞状态及其在再生过程中的表达动态和异质性，以促进跨物种比较和干细胞命运潜能研究。 | 无腔动物Hofstenia miamia（成虫），及其成体多能干细胞（新胚细胞）。 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11 | 2026-09-18 |
Six3 and Six6 jointly regulate the identities and developmental trajectories of multipotent retinal progenitor cells in the mouse retina
2023-May-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.05.03.539288
PMID:37205402
|
研究论文 | 该研究通过对Six3条件性敲除且Six6胚系敲除的小鼠胚胎眼杯进行单细胞RNA测序，识别细胞簇并推断发育轨迹，揭示Six3和Six6共同调控多能视网膜祖细胞的身份和发育轨迹 | 首次在Six3和Six6双敲除背景下利用单细胞RNA测序解析视网膜祖细胞的转录组和发育轨迹，发现了两种主要的发育轨迹（睫状缘和视网膜神经元），并揭示了Six3和Six6共同调控Fgf和Wnt信号通路的相反梯度以平衡眼杯的中央-外周模式化 | 研究仅基于小鼠胚胎模型，未在人类视网膜中验证；单细胞RNA测序可能遗漏低表达基因；未进行功能实验验证新候选基因的具体作用机制 | 揭示Six3和Six6在早期视网膜发育过程中共同调控多能视网膜祖细胞身份和发育轨迹的分子机制 | 小鼠胚胎眼杯中的视网膜祖细胞，包括对照组和Six3/Six6双敲除组 | 单细胞组学、发育生物学 | 失明、视网膜疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12 | 2026-09-18 |
Single-nucleus RNA sequencing of human pancreatic islets identifies novel gene sets and distinguishes β-cell subpopulations with dynamic transcriptome profiles
2023-05-01, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-023-01179-2
PMID:37127706
|
研究论文 | 该论文通过单核RNA测序（snRNA-seq）分析人类胰岛细胞，识别了新的基因标记，并区分了具有动态转录组特征的β细胞亚群。 | 1. 使用snRNA-seq技术，兼容冷冻样本，消除解离诱导的转录应激反应，并利用内含子序列信息识别pre-mRNA转录本；2. 发现了人类胰岛内分泌细胞中新的非经典基因标记，如ZNF385D、TRPM3等；3. 通过整合scRNA-seq和snRNA-seq数据，区分了三个β细胞亚群（β1、β2、β3），并揭示了它们在体外和体内的动态转录组状态；4. 发现富含INS mRNA的β1亚群在体内成为主要亚群。 | 摘要中未明确提及研究的局限性。 | 利用单核RNA测序技术，更准确地识别人类胰岛细胞类型、亚群及其在体内的动态转录组特征。 | 人类胰岛细胞，包括体外培养的胰岛细胞和移植到免疫缺陷小鼠体内的人类胰岛。 | 单细胞转录组学 | 糖尿病 | 单核RNA测序（snRNA-seq）、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 来自同一供体的人类胰岛细胞（新鲜和冷冻样本），以及移植到免疫缺陷小鼠体内的人类胰岛。具体样本量未在摘要中明确。 | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | 使用GRCh38-2020-A文库进行分析 |
| 13 | 2026-09-14 |
A parathyroid hormone/salt-inducible kinase signaling axis controls renal vitamin D activation and organismal calcium homeostasis
2023-05-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI163627
PMID:36862513
|
研究论文 | 该研究发现甲状旁腺激素通过抑制盐诱导激酶（SIK）活性来调控肾脏中Cyp27b1表达和1,25-维生素D的生成，揭示了PTH/SIK/CRTC信号轴在钙稳态中的作用 | 首次揭示了盐诱导激酶（SIK）作为PTH信号下游的关键调控因子，通过CRTC2介导肾脏Cyp27b1基因增强子的结合来调控1,25-维生素D的合成，并证明SIK抑制剂可促进CKD-MBD模型中的维生素D生成 | 研究主要基于小鼠模型和胚胎干细胞来源的肾脏类器官，缺乏人体临床试验数据验证SIK抑制剂在CKD-MBD患者中的疗效和安全性 | 探究PTH依赖性维生素D激活的信号机制，明确SIK在肾脏1,25-维生素D生成及机体钙稳态调控中的作用 | 小鼠模型、人胚胎干细胞来源的肾脏类器官、足细胞损伤慢性肾病-矿物质骨病（CKD-MBD）模型 | 机器学习, 数字病理学 | 慢性肾病-矿物质骨病, 心血管疾病 | 单细胞转录组学, 全组织转录组学 | NA | 文本, 图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 14 | 2026-09-04 |
scAnno: a deconvolution strategy-based automatic cell type annotation tool for single-cell RNA-sequencing data sets
2023-05-19, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad179
PMID:37183449
|
research paper | 开发了scAnno，一种基于去卷积策略的自动化细胞类型注释工具，用于单细胞RNA测序数据集，并在多个数据集上验证其高准确性 | 首次利用去卷积策略进行自动化细胞类型注释，无需先验信息即可准确识别细胞类型特异性基因 | 未提供具体局限性信息 | 开发并验证一种准确、稳健的自动化细胞类型注释工具，以支持单细胞RNA测序数据分析 | 人类和小鼠单细胞RNA测序数据集，包括外周血单个核细胞等 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 逻辑回归 | 基因表达数据 | 30种人类细胞类型和50个人类组织，26种小鼠细胞类型和50个小鼠组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 15 | 2026-08-29 |
A wound-induced differentiation trajectory for neurons
2023-May-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.05.10.540286
PMID:37214981
|
研究论文 | 本研究聚焦于高再生能力的无肠蠕虫，探究截肢后由伤口诱导的神经元分化轨迹及其转录调控机制 | 首次揭示NFY转录因子复合物在截肢后一小时内于尾片段动态结合，直接调控神经元分化启动，并鉴定干细胞为多种神经元亚型的祖细胞群 | 摘要未明确提及研究限制 | 阐明伤口诱导的转录调控事件如何导致神经元产生，揭示再生过程中神经元分化的启动机制 | 高再生能力的无肠蠕虫及其再生组织 | 分子生物学 | NA | 染色质可及性分析、单细胞转录组分析、足迹分析 | NA | 染色质可及性数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 16 | 2026-08-07 |
Modulation of virus-induced neuroinflammation by the autophagy receptor SHISA9 in mice
2023-05, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-023-01357-3
PMID:37081201
|
研究论文 | 本研究揭示了自噬受体SHISA9通过介导IKKi的自噬依赖性降解，调节单纯疱疹病毒1型感染诱导的神经炎症，并影响小胶质细胞和星形胶质细胞的免疫异质性 | 首次鉴定SHISA9为自噬货物受体，通过非锚定K48连接多聚泛素链识别IKKi并桥接至自噬体膜组分GABARAPL1，揭示了SHISA9-IKKi轴在调控中枢神经系统不同驻留细胞免疫异质性中的关键作用 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探究SHISA9在病毒诱导的神经炎症中对自噬和免疫活性的调控作用及其机制 | 小鼠模型中的小胶质细胞和星形胶质细胞，以及单纯疱疹病毒1型感染过程 | 神经免疫学 | 单纯疱疹病毒性脑炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及Shisa9缺陷小鼠和野生型小鼠，具体样本数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 17 | 2026-05-30 |
Deciphering tumor ecosystems at super resolution from spatial transcriptomics with TESLA
2023-05-17, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2023.03.008
PMID:37164011
|
研究论文 | 提出一种名为TESLA的机器学习框架，通过整合组织学信息和基因表达，在空间转录组数据中实现像素级分辨率的组织注释，揭示肿瘤微环境的超分辨率结构 | 首次利用机器学习方法整合组织学图像与基因表达数据，实现空间转录组像素级分辨率组织注释，能够检测三级淋巴结构等独特肿瘤微环境特征 | 主要验证在癌症领域的应用，虽声称可推广至其他疾病但未充分验证；依赖Visium等低分辨率平台数据的空间覆盖问题 | 开发高分辨率空间转录组数据分析工具，解析肿瘤微环境的细胞组成、空间分布及精细组织结构 | 肿瘤微环境中的免疫细胞和肿瘤细胞，包括其丰度、组成和空间定位 | 机器学习， 数字病理学 | 肿瘤疾病 | 空间转录组学 | 机器学习框架 | 图像， 基因表达数据 | 未说明具体样本数量 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | Visium低分辨率空间转录组平台 |
| 18 | 2026-05-29 |
scDisInFact: disentangled learning for integration and prediction of multi-batch multi-condition single-cell RNA-sequencing data
2023-May-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.05.01.538975
PMID:37205545
|
研究论文 | 提出scDisInFact，一种解耦学习方法，用于多批次多条件单细胞RNA测序数据的整合与预测 | 首次同时建模批次效应和条件效应，实现批次效应去除、条件相关关键基因检测和扰动预测三项任务的联合执行 | 仅在模拟和真实数据集上验证，未提及对复杂临床场景的泛化能力或计算资源需求 | 开发能够解耦批次效应和条件效应的深度学习框架，以提升多批次多条件scRNA-seq数据的整合与预测准确性 | 多批次多条件单细胞RNA测序数据，包括模拟数据和真实数据集 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 深度学习 (解耦学习框架) | 基因表达数据 (单细胞转录组) | 模拟数据集和真实数据集（具体规模未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | NA |
| 19 | 2026-05-28 |
RNA polymerase II pausing is essential during spermatogenesis for appropriate gene expression and completion of meiosis
2023-May-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.05.08.539879
PMID:37215034
|
研究论文 | 本研究利用稳态、新生和单细胞RNA测序策略全面分析雄性生殖细胞群体的基因表达，揭示RNA聚合酶II暂停在精子发生过程中对基因表达调控和减数分裂完成的关键作用 | 首次发现RNA聚合酶II暂停在精子分化的早期阶段对建立基因活性图谱至关重要，并揭示了Pol II暂停在减数分裂过程中对SPO11介导的双链断裂形成的新调控作用 | 未在摘要中明确说明研究局限性 | 阐明RNA聚合酶II暂停在雄性生殖细胞分化和减数分裂中的调控机制 | 雄性生殖细胞（包括未成熟和成熟精子细胞） | 机器学习 | 不育症 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 新生RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 20 | 2026-05-25 |
Tissue nanotransfection causes tumor regression by its effect on nanovesicle cargo that alters microenvironmental macrophage state
2023-05-03, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2022.11.003
PMID:36380587
|
研究论文 | 本研究首次通过纳米级荧光可视化，揭示肿瘤来源携带miR-126的细胞外囊泡如何改变肿瘤相关巨噬细胞状态，促进肿瘤形成，并通过组织纳米转染技术实现肿瘤消退 | 首次实现肿瘤来源细胞外囊泡及其miR-126 cargo的纳米级荧光可视化，并阐明其通过诱导肿瘤相关巨噬细胞向血管生成状态转变来促进肿瘤形成的新机制，同时利用局部组织纳米转染技术有效靶向该过程 | 研究基于小鼠血管肿瘤模型，结论向人类肿瘤的转化尚需验证；未明确组织纳米转染技术应用于深层肿瘤的可行性 | 探究肿瘤来源细胞外囊泡携带的miR-126如何通过改变肿瘤微环境中的巨噬细胞状态来促进肿瘤形成，并评估局部组织纳米转染技术作为治疗手段的效果 | 小鼠致死性血管肿瘤模型中的肿瘤细胞、肿瘤相关巨噬细胞及肿瘤来源细胞外囊泡 | 数字病理学 | 肿瘤（血管肿瘤） | NA | NA | 图像（纳米级荧光可视化）、测序数据（单细胞RNA-seq） | 小鼠模型，未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |