单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 288 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Revealed Heterogeneity and Identified Novel Therapeutic Targets for Breast Cancer Subtypes
2023-04-18, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12081182
PMID:37190091
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研究论文 | 本研究利用计算算法分析了来自26名乳腺癌患者的49,899个单细胞转录组数据，揭示了乳腺癌亚型的细胞组成，并识别了新的治疗靶点 | 首次揭示了各乳腺癌分子亚型的独特基因特征，并识别了新的依赖性和治疗脆弱性 | NA | 识别乳腺癌亚型的新治疗靶点，为开发更有效的靶向疗法奠定基础 | 乳腺癌的四种亚型：雌激素受体阳性（ER）、HER2、ERHER2和三阴性乳腺癌（TNBC） | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 49,899个单细胞，来自26名乳腺癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 122 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Analysis of Gene Regulatory Network Changes in the Development of Lung Adenocarcinoma
2023-04-12, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom13040671
PMID:37189418
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研究论文 | 本研究利用公开的单细胞转录组数据，绘制了从发病到进展的肺腺癌细胞图谱，并提供了不同疾病阶段的细胞间通信视图 | 构建了一个筛选细胞间基因调控网络的过程，减少了单细胞通信分析产生的误差，并增加了所选细胞通信信号的可信度 | NA | 探索肺腺癌中癌细胞与其肿瘤微环境的调控关系，以及肿瘤微环境在肺腺癌发生发展中的作用 | 肺腺癌中的细胞间通信及其在疾病发展中的作用 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用了远端正常肺组织（nLung）、早期肺腺癌（tLung）和晚期肺腺癌（tL/B）的单细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA |
| 123 | 2024-08-08 |
Dozer: Debiased personalized gene co-expression networks for population-scale scRNA-seq data
2023-Apr-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.25.538290
PMID:37163070
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Dozer的方法，用于校正单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据中的基因-基因相关性估计，以准确量化个体间的网络水平变异 | Dozer在通用泊松测量模型中校正相关性估计，并提供了一种量化高噪声测量基因的指标 | NA | 旨在改进从scRNA-seq数据中估计个性化共表达网络的方法 | 单细胞RNA测序数据中的基因共表达网络 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 涉及多个分化的人诱导多能干细胞（iPSC）线和阿尔茨海默病及对照组的后遗症人组织中的少突胶质细胞的群体规模scRNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA |
| 124 | 2024-08-08 |
Role of MicroRNAs and their Downstream Target Transcription Factors in Zebrafish Thrombopoiesis
2023-Apr-24, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2807790/v1
PMID:37162944
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研究论文 | 本研究利用斑马鱼血栓细胞模型，通过单细胞RNA测序和基因敲降技术，探讨了微小RNA及其下游转录因子在血栓生成中的作用 | 首次系统研究了斑马鱼血栓细胞中的微小RNA及其下游转录因子，揭示了它们在血栓生成中的调控网络 | 研究主要集中在斑马鱼模型，尚未在人类中验证这些发现 | 探讨微小RNA及其下游转录因子在斑马鱼血栓生成中的作用 | 斑马鱼血栓细胞中的微小RNA及其下游转录因子 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 15种微小RNA在斑马鱼血栓细胞中被鉴定 | NA | NA | NA | NA |
| 125 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA-seq uncovers dynamic processes orchestrated by RNA-binding protein DDX43 in chromatin remodeling during spermiogenesis
2023-04-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-38199-w
PMID:37120627
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研究论文 | 该研究揭示了RNA结合蛋白DDX43在精子发生过程中的染色质重塑中的动态过程 | 首次识别RNA解旋酶DDX43作为精子发生过程中染色质重塑的关键调节因子 | 研究主要集中于小鼠模型，可能对其他物种的适用性有限 | 探讨DDX43在精子发生过程中染色质重塑的作用 | 研究了缺失Ddx43或表达Ddx43 ATP酶失活突变体的生殖细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型中的多个生殖细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 126 | 2024-08-05 |
Reconstruction of the cell pseudo-space from single-cell RNA sequencing data with scSpace
2023-04-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-38121-4
PMID:37120608
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研究论文 | 本文提出了一种方法，通过重建细胞的伪空间来识别空间变异的细胞亚群体 | 创新之处在于提出了单细胞空间位置相关的共同嵌入方法，能够基于空间转录组参考重建细胞的空间信息 | 在某些情况下，可能依赖于特定的空间转录组参考数据 | 研究旨在识别细胞的空间变异性及其亚群体 | 研究对象包括不同组织中单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 癌症（黑色素瘤）和COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 生物数据集（模拟和真实数据集） | 涉及多个复杂组织样本如脑皮层、小肠绒毛等 | NA | NA | NA | NA |
| 127 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals the fragility of male spermatogenic cells to Zika virus-induced complement activation
2023-04-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-38223-z
PMID:37120617
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了Zika病毒感染小鼠睾丸细胞的影响，揭示了生精细胞对Zika病毒感染的脆弱性及其与补体系统激活的关系 | 首次揭示了Zika病毒感染通过激活补体系统影响生精细胞，并评估了补体抑制剂和S100A4抑制剂对保护睾丸功能的效果 | NA | 探讨Zika病毒对男性生殖健康的影响及其机制 | Zika病毒感染的小鼠睾丸细胞和北方猪尾猕猴 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠和北方猪尾猕猴 | NA | NA | NA | NA |
| 128 | 2024-08-05 |
MASI enables fast model-free standardization and integration of single-cell transcriptomics data
2023-04-28, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-023-04820-3
PMID:37117305
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研究论文 | 本文介绍了一种名为MASI的快速无模型集成方法，旨在对单细胞转录组数据进行标准化和集成。 | MASI方法在细胞类型注释和数据集成速度方面表现优于其他已建立的方法。 | 本研究未明确提及具体的局限性。 | 本研究的目的是提高单细胞转录组数据的研究包容性，通过标准化细胞类型注释和数据集成。 | 研究对象为来自不同研究实验室的单细胞转录组数据集。 | 数字病理学 | NA | NA | NA | 单细胞转录组数据 | 约100万个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 129 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing analysis fibrosis provides insights into the pathobiological cell types and cytokines of radiation-induced pulmonary fibrosis
2023-Apr-28, BMC pulmonary medicine
IF:2.6Q2
DOI:10.1186/s12890-023-02424-5
PMID:37118713
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析放射诱导的肺纤维化的细胞类型和细胞因子 | 首次提供了放射诱导肺纤维化中细胞类型和细胞因子变化的具体数据 | 研究仅使用了鼠模型，可能限制了对人类疾病的直接推论 | 揭示放射诱导的肺纤维化的病理生物学机制 | 对照组和接受放射治疗的小鼠肺部细胞进行分析 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序 | NA | 细胞数据 | 小鼠样本，包含对照组（0 Gy）和放射治疗组（20 Gy） | NA | NA | NA | NA |
| 130 | 2024-08-08 |
An ERK-dependent molecular switch antagonizes fibrosis and promotes regeneration in spiny mice (Acomys)
2023-04-28, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adf2331
PMID:37126559
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研究论文 | 本文研究了刺鼠（Acomys）中ERK依赖的分子开关如何对抗纤维化并促进组织再生 | 揭示了ERK信号在不同再生能力哺乳动物中的活性差异，并发现了纤维母细胞生长因子和ErbB信号作为再生上游ERK调控因子 | NA | 探索驱动哺乳动物组织再生的核心信号通路 | 刺鼠的皮肤和复杂肌肉骨骼组织的再生机制 | 生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 131 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing of immune cells after marathon and symptom-limited cardiopulmonary exercise
2023-Apr-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.106532
PMID:37123249
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研究论文 | 本文研究了马拉松和症状限制性的心肺运动对免疫细胞的影响。 | 本文首次通过单细胞RNA测序分析了剧烈运动后外周血单核细胞的反应，揭示了免疫细胞的时序变化。 | 研究主要集中在运动后的短期影响，未深入探讨长期影响。 | 探索剧烈运动对免疫功能的影响及相关机制。 | 外周血单核细胞（PBMCs）在马拉松及心肺运动测试后的变化。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | scRNA-seq | NA | 细胞数据 | 所有参与者的PBMC样本 | NA | NA | NA | NA |
| 132 | 2024-08-05 |
General anesthetic action profile on the human prefrontal cortex cells through comprehensive single-cell RNA-seq analysis
2023-Apr-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.106534
PMID:37123239
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了全身麻醉药物对人类前额叶皮层细胞的作用特征 | 提供了麻醉药物在前额叶皮层对不同细胞类型的影响的全面蓝图 | 研究主要集中在胎儿前额叶皮层细胞，可能不完全适用于成人或其他脑区 | 揭示全身麻醉药物对人类前额叶皮层细胞的分子和细胞作用 | 使用的研究对象是人类胎儿前额叶皮层的混合细胞群 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 133 | 2024-08-05 |
Single-cell temporal dynamics reveals the relative contributions of transcription and degradation to cell-type specific gene expression in zebrafish embryos
2023-Apr-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.20.537620
PMID:37131717
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研究论文 | 该研究揭示了斑马鱼胚胎中转录和降解对细胞特异性基因表达的相对贡献 | 引入动力学模型量化不同细胞类型中mRNA转录和降解的调节速率 | 对在多样化细胞身份下，系统性剖析mRNA转录和降解的调控仍然具有挑战性 | 研究胚胎发育过程中细胞特异性基因表达的调控机制 | 斑马鱼胚胎中的细胞转录组 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 动力学模型 | 转录组数据 | 斑马鱼胚胎的多个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 134 | 2024-08-08 |
Multiomic landscape of immune pathogenesis in Kimura's disease
2023-Apr-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.106559
PMID:37123228
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研究论文 | 本研究通过批量RNA测序和流式细胞术分析，揭示了Kimura病中eosinophils中TMEM176A的高表达和Erk/MAPK信号通路的过度激活，并探讨了S100P在myeloid细胞中促进活性氧（ROS）产生的作用。 | 首次系统研究Kimura病的免疫发病机制，并提出Erk/MAPK信号通路可能是潜在的治疗靶点。 | NA | 探究Kimura病的免疫发病机制及其潜在治疗靶点。 | Kimura病的免疫发病机制及治疗靶点。 | 数字病理学 | 罕见慢性炎症性疾病 | RNA测序 | NA | RNA | Kimura病与健康对照组的eosinophils和myeloid细胞。 | NA | NA | NA | NA |
| 135 | 2024-08-08 |
Suprabasal cells retaining stem cell identity programs drive basal cell hyperplasia in eosinophilic esophagitis
2023-Apr-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.20.537495
PMID:37131652
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研究论文 | 本研究探讨了嗜酸性食管炎（EoE）中基底细胞增生（BCH）的分子机制 | 发现EoE中的BCH是由保留干细胞转录程序的非增殖性细胞扩张引起的，这一发现未在胃食管反流病（GERD）中观察到 | 研究仅限于EoE患者，未涉及其他疾病状态的比较 | 揭示嗜酸性食管炎中基底细胞增生的分子驱动因素 | 嗜酸性食管炎患者的食管上皮细胞 | NA | 嗜酸性食管炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 所有EoE患者 | NA | NA | NA | NA |
| 136 | 2024-08-05 |
Insufficient epitope-specific T cell clones are responsible for impaired cellular immunity to inactivated SARS-CoV-2 vaccine in older adults
2023-04, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-023-00379-0
PMID:37117789
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研究论文 | 本研究揭示了老年人对灭活SARS-CoV-2疫苗的细胞免疫减弱与特异性T细胞克隆不足有关 | 本研究提供了老年人对灭活疫苗反应减弱的机制性见解，特别是在T细胞克隆扩展方面 | 研究可能未涵盖所有影响免疫反应的因素，样本量较小可能影响结果的普遍性 | 探讨老年人对灭活SARS-CoV-2疫苗免疫反应的潜在机制 | 研究对象为接种灭活SARS-CoV-2疫苗的老年人和年轻人 | 免疫学 | 新型冠状病毒肺炎 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 老年人和年轻人的捐赠者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 137 | 2024-08-08 |
Depicting pseudotime-lagged causality across single-cell trajectories for accurate gene-regulatory inference
2023-Apr, PNAS nexus
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/pnasnexus/pgad113
PMID:37113980
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研究论文 | 本文介绍了DELAY，一种用于推断伪时间排序的单细胞轨迹上基因调控关系的卷积神经网络 | DELAY结合了监督深度学习和伪时间滞后轨迹的联合概率矩阵，克服了普通基于格兰杰因果关系方法的重要局限，如无法推断反馈循环等循环关系 | NA | 准确理解转录因子与其目标基因之间的时间滞后关系，以识别基因调控网络中的因果交互作用 | 单细胞轨迹上的基因调控关系 | 机器学习 | NA | scRNA-seq, scATAC-seq | CNN | 单细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 138 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomics reveal topological immune landscapes of Asian head and neck angiosarcoma
2023-04-27, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-023-04856-5
PMID:37106027
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研究论文 | 这篇文章研究了亚洲头颈部血管肉瘤的肿瘤免疫景观 | 通过空间转录组学揭示了肿瘤微环境的拓扑特征和免疫信号 | 未提供关于研究设计或样本选择的具体限制信息 | 了解亚洲头颈部血管肉瘤的免疫微环境 | 81例血管肉瘤病例，包括47例亚洲头颈部血管肉瘤 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 (10X Visium) | NA | 基因组测序数据和基因表达数据 | 81例病例 | NA | NA | NA | NA |
| 139 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing reveals the immune microenvironment landscape related to anti-PD-1 resistance in metastatic colorectal cancer with high microsatellite instability
2023-04-27, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-023-02866-y
PMID:37106440
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研究论文 | 该研究使用单细胞RNA测序分析与抗PD-1耐药相关的转移性结直肠癌免疫微环境。 | 首次揭示了在MSI-H/dMMR转移性结直肠癌中，IL-1β驱动的MDSCs和CD8+ T细胞浸润与抗PD-1耐药性的相关性。 | 样本量较小，仅限于特定的患者群体，可能影响结果的普遍性。 | 探讨MSI-H/dMMR转移性结直肠癌中抗PD-1耐药的分子机制。 | 研究对象为MSI-H/dMMR转移性结直肠癌患者的肿瘤微环境细胞。 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞数据 | 23名MSI-H/dMMR转移性结直肠癌患者的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 140 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomes reveal heterogeneity of chlorine-induced mice acute lung injury and the inhibitory effect of pentoxifylline on ferroptosis
2023-04-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-32093-7
PMID:37100790
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探讨了戊四唑（PTX）对氯气诱导的小鼠急性肺损伤（ALI）的影响及其对铁死亡的抑制作用 | 本研究首次揭示了氯气诱导的ALI中细胞异质性及PTX通过抑制铁死亡过程的潜在作用 | NA | 探讨PTX对氯气诱导的ALI的影响及其对铁死亡的抑制作用 | BALB/c雌性小鼠及其肺组织 | 数字病理学 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 32只小鼠分为四组：对照组、氯气组、氯气+Fer-1组、氯气+PTX组 | NA | NA | NA | NA |