单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 287 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2024-08-05 |
General anesthetic action profile on the human prefrontal cortex cells through comprehensive single-cell RNA-seq analysis
2023-Apr-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.106534
PMID:37123239
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了全身麻醉药物对人类前额叶皮层细胞的作用特征 | 提供了麻醉药物在前额叶皮层对不同细胞类型的影响的全面蓝图 | 研究主要集中在胎儿前额叶皮层细胞，可能不完全适用于成人或其他脑区 | 揭示全身麻醉药物对人类前额叶皮层细胞的分子和细胞作用 | 使用的研究对象是人类胎儿前额叶皮层的混合细胞群 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 122 | 2024-08-05 |
Single-cell temporal dynamics reveals the relative contributions of transcription and degradation to cell-type specific gene expression in zebrafish embryos
2023-Apr-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.20.537620
PMID:37131717
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研究论文 | 该研究揭示了斑马鱼胚胎中转录和降解对细胞特异性基因表达的相对贡献 | 引入动力学模型量化不同细胞类型中mRNA转录和降解的调节速率 | 对在多样化细胞身份下，系统性剖析mRNA转录和降解的调控仍然具有挑战性 | 研究胚胎发育过程中细胞特异性基因表达的调控机制 | 斑马鱼胚胎中的细胞转录组 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 动力学模型 | 转录组数据 | 斑马鱼胚胎的多个细胞 |
| 123 | 2024-08-08 |
Multiomic landscape of immune pathogenesis in Kimura's disease
2023-Apr-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.106559
PMID:37123228
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研究论文 | 本研究通过批量RNA测序和流式细胞术分析，揭示了Kimura病中eosinophils中TMEM176A的高表达和Erk/MAPK信号通路的过度激活，并探讨了S100P在myeloid细胞中促进活性氧（ROS）产生的作用。 | 首次系统研究Kimura病的免疫发病机制，并提出Erk/MAPK信号通路可能是潜在的治疗靶点。 | NA | 探究Kimura病的免疫发病机制及其潜在治疗靶点。 | Kimura病的免疫发病机制及治疗靶点。 | 数字病理学 | 罕见慢性炎症性疾病 | RNA测序 | NA | RNA | Kimura病与健康对照组的eosinophils和myeloid细胞。 |
| 124 | 2024-08-08 |
Suprabasal cells retaining stem cell identity programs drive basal cell hyperplasia in eosinophilic esophagitis
2023-Apr-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.20.537495
PMID:37131652
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研究论文 | 本研究探讨了嗜酸性食管炎（EoE）中基底细胞增生（BCH）的分子机制 | 发现EoE中的BCH是由保留干细胞转录程序的非增殖性细胞扩张引起的，这一发现未在胃食管反流病（GERD）中观察到 | 研究仅限于EoE患者，未涉及其他疾病状态的比较 | 揭示嗜酸性食管炎中基底细胞增生的分子驱动因素 | 嗜酸性食管炎患者的食管上皮细胞 | NA | 嗜酸性食管炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 所有EoE患者 |
| 125 | 2024-08-05 |
Insufficient epitope-specific T cell clones are responsible for impaired cellular immunity to inactivated SARS-CoV-2 vaccine in older adults
2023-04, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-023-00379-0
PMID:37117789
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研究论文 | 本研究揭示了老年人对灭活SARS-CoV-2疫苗的细胞免疫减弱与特异性T细胞克隆不足有关 | 本研究提供了老年人对灭活疫苗反应减弱的机制性见解，特别是在T细胞克隆扩展方面 | 研究可能未涵盖所有影响免疫反应的因素，样本量较小可能影响结果的普遍性 | 探讨老年人对灭活SARS-CoV-2疫苗免疫反应的潜在机制 | 研究对象为接种灭活SARS-CoV-2疫苗的老年人和年轻人 | 免疫学 | 新型冠状病毒肺炎 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 老年人和年轻人的捐赠者样本 |
| 126 | 2024-08-08 |
Depicting pseudotime-lagged causality across single-cell trajectories for accurate gene-regulatory inference
2023-Apr, PNAS nexus
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/pnasnexus/pgad113
PMID:37113980
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研究论文 | 本文介绍了DELAY，一种用于推断伪时间排序的单细胞轨迹上基因调控关系的卷积神经网络 | DELAY结合了监督深度学习和伪时间滞后轨迹的联合概率矩阵，克服了普通基于格兰杰因果关系方法的重要局限，如无法推断反馈循环等循环关系 | NA | 准确理解转录因子与其目标基因之间的时间滞后关系，以识别基因调控网络中的因果交互作用 | 单细胞轨迹上的基因调控关系 | 机器学习 | NA | scRNA-seq, scATAC-seq | CNN | 单细胞数据 | NA |
| 127 | 2024-08-05 |
Osteosarcoma tumors maintain intra-tumoral transcriptional heterogeneity during bone and lung colonization
2023-04-27, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-023-01593-3
PMID:37106386
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研究论文 | 这篇文章研究了骨肉瘤肿瘤在骨骼和肺部转移期间保持内肿瘤转录异质性。 | 文章揭示了骨肉瘤细胞在应对不同微环境压力时如何维持表型异质性，特别是通过单细胞RNA测序分析了不同转录特征的细胞亚群。 | 未提及具体实验的局限性。 | 了解肿瘤细胞如何适应主要和转移微环境，以促进治疗靶向策略的发展。 | 研究对象是来自细胞系和患者衍生异种移植模型的47,977个细胞。 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | 47,977个细胞 |
| 128 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomics reveal topological immune landscapes of Asian head and neck angiosarcoma
2023-04-27, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-023-04856-5
PMID:37106027
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研究论文 | 这篇文章研究了亚洲头颈部血管肉瘤的肿瘤免疫景观 | 通过空间转录组学揭示了肿瘤微环境的拓扑特征和免疫信号 | 未提供关于研究设计或样本选择的具体限制信息 | 了解亚洲头颈部血管肉瘤的免疫微环境 | 81例血管肉瘤病例，包括47例亚洲头颈部血管肉瘤 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 (10X Visium) | NA | 基因组测序数据和基因表达数据 | 81例病例 |
| 129 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing reveals the immune microenvironment landscape related to anti-PD-1 resistance in metastatic colorectal cancer with high microsatellite instability
2023-04-27, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-023-02866-y
PMID:37106440
|
研究论文 | 该研究使用单细胞RNA测序分析与抗PD-1耐药相关的转移性结直肠癌免疫微环境。 | 首次揭示了在MSI-H/dMMR转移性结直肠癌中，IL-1β驱动的MDSCs和CD8+ T细胞浸润与抗PD-1耐药性的相关性。 | 样本量较小，仅限于特定的患者群体，可能影响结果的普遍性。 | 探讨MSI-H/dMMR转移性结直肠癌中抗PD-1耐药的分子机制。 | 研究对象为MSI-H/dMMR转移性结直肠癌患者的肿瘤微环境细胞。 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞数据 | 23名MSI-H/dMMR转移性结直肠癌患者的样本 |
| 130 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomes reveal heterogeneity of chlorine-induced mice acute lung injury and the inhibitory effect of pentoxifylline on ferroptosis
2023-04-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-32093-7
PMID:37100790
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探讨了戊四唑（PTX）对氯气诱导的小鼠急性肺损伤（ALI）的影响及其对铁死亡的抑制作用 | 本研究首次揭示了氯气诱导的ALI中细胞异质性及PTX通过抑制铁死亡过程的潜在作用 | NA | 探讨PTX对氯气诱导的ALI的影响及其对铁死亡的抑制作用 | BALB/c雌性小鼠及其肺组织 | 数字病理学 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 32只小鼠分为四组：对照组、氯气组、氯气+Fer-1组、氯气+PTX组 |
| 131 | 2024-08-08 |
Analysis of cardiac single-cell RNA-sequencing data can be improved by the use of artificial-intelligence-based tools
2023-04-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-32293-1
PMID:37100826
|
研究论文 | 本文通过整合三种人工智能技术（AI）到一个工具包中，用于评估单细胞RNA测序（scRNAseq）数据，以改善心脏单细胞RNA测序数据的分析 | 本文引入了AI自动编码、AI稀疏建模和AI半监督学习三种技术，用于细胞类型和亚群的分离、差异激活基因和信号机制的识别以及细胞亚群间转变的追踪 | 目前可用的工具在处理和解释这些庞大的数据集时效果有限 | 提高心脏单细胞RNA测序数据的分析效果 | 心脏单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | 自动编码器（Autoencoder） | 基因表达数据 | 三个scRNAseq数据集，来自小鼠和猪的心脏 |
| 132 | 2024-08-05 |
The single-cell chromatin accessibility landscape in mouse perinatal testis development
2023-04-25, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.75624
PMID:37096870
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研究论文 | 本研究分析了小鼠围产期睾丸发育中单细胞染色质可及性特征 | 利用单细胞测序技术揭示了细胞类型特异的可及性和新的细胞命运规范调控因子 | 研究主要集中于小鼠模型，是否适用于其他物种尚不明确 | 深入了解睾丸细胞类型的调控程序 | 分析小鼠发育睾丸中超过25,000个细胞的单细胞染色质可及性特征 | 数字病理学 | 冠状动脉疾病 | scATAC-Seq | NA | 单细胞数据 | 超过25,000个小鼠睾丸细胞 |
| 133 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis of the aged ovarian immune system reveals a shift towards adaptive immunity and attenuated cell function
2023-04-25, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.74915
PMID:37096871
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和流式细胞术，全面描述了小鼠卵巢免疫系统，并揭示了随着年龄增长，免疫细胞组成向适应性免疫转变的现象 | 首次全面描述了小鼠卵巢免疫系统，并揭示了女性衰老过程中卵巢免疫系统的变化 | 研究仅限于小鼠模型，可能需要进一步的人体研究来验证结果 | 探究女性衰老对卵巢免疫系统的影响 | 小鼠卵巢免疫系统 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据 | 未具体说明样本数量 |
| 134 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome analysis of NEUROG3+ cells during pancreatic endocrine differentiation with small molecules
2023-04-25, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-023-03338-z
PMID:37098639
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，探讨了使用小分子化合物促进人胚胎干细胞向NEUROG3+胰腺内分泌细胞分化的方法 | 本研究采用DAPT联合四种因子（4FS）的方法，显著提高了NEUROG3的表达，并促进了胰腺内分泌细胞和肠嗜铬样细胞的分化 | NA | 提高人胚胎干细胞向胰腺内分泌细胞分化的效率，为糖尿病的干细胞治疗提供新策略 | 人胚胎干细胞及其向胰腺内分泌细胞的分化过程 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA |
| 135 | 2024-08-05 |
ALS is imprinted in the chromatin accessibility of blood cells
2023-Apr-24, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-023-04769-w
PMID:37095391
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研究论文 | 本研究识别了与肌萎缩侧索硬化症（ALS）相关的表观遗传特征，通过分析ALS患者血细胞的染色质可及性来进行。 | 本研究首次通过染色质可及性分析识别出一种与ALS相关的表观遗传特征，显示出表观遗传调控与疾病发病机制之间的关系。 | 研究主要集中在血细胞中，未探讨其他受影响组织中的表观遗传特征，可能会限制对疾病的全面理解。 | 旨在揭示和识别与肌萎缩侧索硬化症相关的表观遗传特征。 | 对肌萎缩侧索硬化症患者的血细胞进行研究。 | 数字病理学 | 肌萎缩侧索硬化症 | ATAC-seq 和 RNA-seq 的结合与单细胞测序 | NA | 细胞样本数据 | 来自ALS患者的外周血单核细胞（PBMCs）和运动皮层的样本 |
| 136 | 2024-08-08 |
Classification of triple-negative breast cancer based on pathway enrichment levels
2023-Apr-24, Medical oncology (Northwood, London, England)
DOI:10.1007/s12032-023-02021-w
PMID:37093316
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研究论文 | 本文基于免疫、间质、致癌和代谢途径的富集水平，对三阴性乳腺癌（TNBC）进行了分类 | 首次通过无监督聚类方法，根据14条相关途径的富集水平对TNBC进行分类，并识别出四种亚型 | NA | 对三阴性乳腺癌进行分类，以深入理解肿瘤生物学和临床意义 | 三阴性乳腺癌（TNBC）及其亚型 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 无监督聚类 | 转录组数据 | 三个批量肿瘤转录组数据集和一个单细胞RNA测序数据集 |
| 137 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome analysis profiles the expression features of TMEM173 in BM cells of high-risk B-cell acute lymphoblastic leukemia
2023-Apr-24, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-023-10830-5
PMID:37095455
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，揭示了高风险B细胞急性淋巴细胞白血病（B-ALL）患者骨髓（BM）细胞中TMEM173的表达特征 | 首次详细描述了TMEM173在高风险B-ALL患者骨髓细胞中的转录组特征，并探讨了其在不同细胞类型中的表达模式 | NA | 探究TMEM173在B细胞急性淋巴细胞白血病中的转录组特征，为癌症免疫治疗提供新策略 | TMEM173在B-ALL患者骨髓细胞中的表达特征 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 涉及2名B-ALL患者的骨髓细胞 |
| 138 | 2024-08-08 |
An integrative analysis of the single-cell transcriptome identifies DUSP4 as an exhaustion-associated gene in tumor-infiltrating CD8+ T cells
2023-04-22, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-023-01056-6
PMID:37086337
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 139 | 2024-08-08 |
Novel insight into the underlying dysregulation mechanisms of immune cell-to-cell communication by analyzing multitissue single-cell atlas of two COVID-19 patients
2023-04-22, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-023-05814-z
PMID:37087411
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研究论文 | 本研究通过分析两名COVID-19患者的肺、血液和骨髓的单细胞转录组图谱，探讨了SARS-CoV-2感染引起的细胞间通信失调机制 | 首次揭示了SARS-CoV-2感染导致肺部微环境紊乱和炎症风暴的细胞通信失调机制 | 研究样本仅为两名死亡的COVID-19患者，可能影响结果的普遍性 | 探讨SARS-CoV-2感染如何引起肺部微环境紊乱和炎症风暴的机制 | COVID-19患者的肺、血液和骨髓中的单细胞转录组 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 两名COVID-19患者 |
| 140 | 2024-08-05 |
Size matters: the impact of nucleus size on results from spatial transcriptomics
2023-04-21, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04129-z
PMID:37081484
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研究论文 | 该文章探讨了细胞核大小对空间转录组学实验结果的影响 | 文章提出了连续切片数据整合（CSDI）方法，提升了空间转录组学的准确性 | 该研究可能对特定类型的组织切片有局限性，未探讨不同组织的广泛适用性 | 研究空间转录组学中细胞核尺寸对结果影响的机制 | 人类死后脑组织的连续切片 | 数字病理学 | NA | 空间基因表达（ST） | NA | RNA-seq数据 | 人类死后大脑连续切片 |