单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 287 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2024-08-05 |
IRF7 and IFIT2 in mediating different hemorrhage outcomes for non-small cell lung cancer after bevacizumab treatment
2023-Apr-28, Journal of thoracic disease
IF:2.1Q3
DOI:10.21037/jtd-23-389
PMID:37197507
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研究论文 | 本文研究了IRF7和IFIT2在非小细胞肺癌患者接受贝伐单抗治疗后不同出血结果中的作用 | 揭示了IRF7和IFIT2可能影响非小细胞肺癌患者贝伐单抗治疗后的出血结果的新机制 | 在贝伐单抗治疗对不同类型肺癌出血结果的影响机制方面仍需进一步研究 | 探讨贝伐单抗治疗后非小细胞肺癌不同病理类型患者出血结果的潜在机制 | 非小细胞肺癌患者中的腺癌和鳞癌肿瘤样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序，实时聚合酶链反应，免疫荧光分析等 | NA | 肿瘤组织样本 | LUAD和LUSC患者的肿瘤组织样本 |
| 102 | 2024-08-05 |
Immune characteristics and genetic markers of esophageal cancer by single-cell analysis: implications for immunotherapy
2023-Apr-28, Journal of thoracic disease
IF:2.1Q3
DOI:10.21037/jtd-23-317
PMID:37197539
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析探讨了食管癌的肿瘤环境特征和潜在遗传标记. | 应用单细胞分析技术识别了食管癌中的特定细胞亚群，并发现了CXCL8蛋白作为潜在的预后标志物. | 本研究主要基于公共基因组数据，可能缺乏临床样本的多样性与个体差异考量. | 研究食管癌患者的肿瘤微环境特征，为个性化治疗提供基础. | 研究对象为食管癌样本及其旁癌样本中的免疫细胞亚群. | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 从TCGA数据库下载的食管癌样本数据 |
| 103 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Atlas of Yak Testis Cells
2023-Apr-28, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24097982
PMID:37175687
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了牦牛睾丸细胞的图谱 | 首次通过单细胞RNA测序技术全面且无偏地研究了性成熟4岁牦牛的精子发生过程，并鉴定了多种细胞类型及其标记基因 | NA | 探索牦牛精子发生过程中的细胞异质性 | 牦牛的睾丸细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 性成熟4岁牦牛的睾丸细胞 |
| 104 | 2024-08-05 |
UVRAG Promotes Tumor Progression through Regulating SP1 in Colorectal Cancer
2023-Apr-27, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers15092502
PMID:37173968
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研究论文 | 本研究探讨了UVRAG在结直肠癌中的作用及其对预后的影响 | 揭示了UVRAG通过上调SP1表达增强肿瘤迁移和药物耐受性，提供了结直肠癌潜在机制的见解 | 本研究的具体限制未提及 | 旨在分析UVRAG在结直肠癌中的表达及其对患者预后的影响 | 研究对象为结直肠癌患者的肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA测序和单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 高UVRAG表达组和低UVRAG表达组的样本 |
| 105 | 2024-08-08 |
Single-Cell Next-Generation Sequencing to Monitor Hematopoietic Stem-Cell Transplantation: Current Applications and Future Perspectives
2023-Apr-26, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers15092477
PMID:37173944
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综述 | 本文综述了单细胞下一代测序技术在急性髓系白血病（AML）和骨髓增生异常综合征（MDS）患者造血干细胞移植（HSCT）后微小残留病（MRD）评估中的应用及未来展望 | 介绍了单细胞DNA基因组学在MRD评估中的应用，并探讨了单细胞RNA测序和可及染色质分析的潜在优势 | NGS技术的一个主要缺点是无法区分非白血病克隆性造血，且HSCT后的风险评估和预后因基因型漂移而变得更加复杂 | 探讨单细胞下一代测序技术在预测HSCT后患者预后中的应用 | 急性髓系白血病（AML）和骨髓增生异常综合征（MDS）患者 | 数字病理学 | 白血病 | 下一代测序（NGS） | NA | 基因组数据 | NA |
| 106 | 2024-08-08 |
Characterizing Intraindividual Podocyte Morphology In Vitro with Different Innovative Microscopic and Spectroscopic Techniques
2023-04-25, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12091245
PMID:37174644
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研究论文 | 本文开发了一种新的连续相关方法，通过结合多种显微和光谱技术在同一细胞中进行分析，以更好地理解足细胞的形态学特征 | 本文采用了一系列创新的显微和光谱技术，如光学显微镜、拉曼光谱、扫描电子显微镜和原子力显微镜，以及扫描离子电导显微镜，这些技术通常需要不同的处理和固定方法，但本文成功地开发了一种兼容的协议，允许在同一细胞上使用多种技术进行分析 | NA | 旨在通过多种显微和光谱技术深入理解足细胞的形态学特征 | 足细胞的形态学特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq）、光学显微镜（LM）、拉曼光谱、扫描电子显微镜（SEM）、原子力显微镜（AFM）、扫描离子电导显微镜（SICM） | NA | 细胞图像 | 未明确提及具体样本数量 |
| 107 | 2024-08-08 |
The Functions and Phenotypes of Microglia in Alzheimer's Disease
2023-04-21, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12081207
PMID:37190116
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综述 | 本文综述了阿尔茨海默病中微胶质细胞的功能和表型，以及它们在疾病发展中的作用 | 利用单细胞RNA测序等新技术揭示了阿尔茨海默病中微胶质细胞的异质性状态 | NA | 总结微胶质细胞对阿尔茨海默病病理的反应，并探讨其在疾病中的保护作用和炎症关系 | 微胶质细胞在阿尔茨海默病中的功能和表型 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 108 | 2024-08-05 |
Large-Scale Integration of Single-Cell RNA-Seq Data Reveals Astrocyte Diversity and Transcriptomic Modules across Six Central Nervous System Disorders
2023-04-19, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom13040692
PMID:37189441
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研究论文 | 本文展示了如何通过大规模整合多组学数据揭示在六种中枢神经系统疾病中星形胶质细胞的多样性和转录组模块 | 通过整合302个公开单细胞RNA测序数据集，揭示了未识别的星形胶质细胞亚群，构建了涉及疾病发展的七个转录组模块 | 人类大脑样本的稀少性限制了星形胶质细胞的单细胞转录组分析 | 研究星形胶质细胞在多种神经系统疾病中的功能和转录组特征 | 分析302个单细胞RNA测序数据集中的星形胶质细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病, 帕金森病, 亨廷顿病, 多发性硬化, 癫痫, 慢性创伤性脑病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 近一百万个细胞 |
| 109 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Revealed Heterogeneity and Identified Novel Therapeutic Targets for Breast Cancer Subtypes
2023-04-18, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12081182
PMID:37190091
|
研究论文 | 本研究利用计算算法分析了来自26名乳腺癌患者的49,899个单细胞转录组数据，揭示了乳腺癌亚型的细胞组成，并识别了新的治疗靶点 | 首次揭示了各乳腺癌分子亚型的独特基因特征，并识别了新的依赖性和治疗脆弱性 | NA | 识别乳腺癌亚型的新治疗靶点，为开发更有效的靶向疗法奠定基础 | 乳腺癌的四种亚型：雌激素受体阳性（ER）、HER2、ERHER2和三阴性乳腺癌（TNBC） | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 49,899个单细胞，来自26名乳腺癌患者 |
| 110 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Analysis of Gene Regulatory Network Changes in the Development of Lung Adenocarcinoma
2023-04-12, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom13040671
PMID:37189418
|
研究论文 | 本研究利用公开的单细胞转录组数据，绘制了从发病到进展的肺腺癌细胞图谱，并提供了不同疾病阶段的细胞间通信视图 | 构建了一个筛选细胞间基因调控网络的过程，减少了单细胞通信分析产生的误差，并增加了所选细胞通信信号的可信度 | NA | 探索肺腺癌中癌细胞与其肿瘤微环境的调控关系，以及肿瘤微环境在肺腺癌发生发展中的作用 | 肺腺癌中的细胞间通信及其在疾病发展中的作用 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用了远端正常肺组织（nLung）、早期肺腺癌（tLung）和晚期肺腺癌（tL/B）的单细胞转录组数据 |
| 111 | 2024-08-08 |
Dozer: Debiased personalized gene co-expression networks for population-scale scRNA-seq data
2023-Apr-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.25.538290
PMID:37163070
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为Dozer的方法，用于校正单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据中的基因-基因相关性估计，以准确量化个体间的网络水平变异 | Dozer在通用泊松测量模型中校正相关性估计，并提供了一种量化高噪声测量基因的指标 | NA | 旨在改进从scRNA-seq数据中估计个性化共表达网络的方法 | 单细胞RNA测序数据中的基因共表达网络 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 涉及多个分化的人诱导多能干细胞（iPSC）线和阿尔茨海默病及对照组的后遗症人组织中的少突胶质细胞的群体规模scRNA-seq数据 |
| 112 | 2024-08-08 |
A mannitol-based buffer improves single-cell RNA sequencing of high-salt marine cells
2023-Apr-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.26.538465
PMID:37163054
|
research paper | 本文研究了一种基于甘露醇的低盐磷酸盐缓冲液（PBS-M）对高盐海洋细胞单细胞RNA测序（scRNA-seq）质量的改善效果 | 提出了一种新的缓冲液配方，通过添加D-甘露醇，使得高盐海洋细胞的scRNA-seq质量得到提升 | NA | 探索和优化适用于高盐海洋生物的单细胞RNA测序方法 | 海洋生物中的血细胞 | digital pathology | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 具体样本数量未提及 |
| 113 | 2024-08-08 |
Role of MicroRNAs and their Downstream Target Transcription Factors in Zebrafish Thrombopoiesis
2023-Apr-24, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2807790/v1
PMID:37162944
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研究论文 | 本研究利用斑马鱼血栓细胞模型，通过单细胞RNA测序和基因敲降技术，探讨了微小RNA及其下游转录因子在血栓生成中的作用 | 首次系统研究了斑马鱼血栓细胞中的微小RNA及其下游转录因子，揭示了它们在血栓生成中的调控网络 | 研究主要集中在斑马鱼模型，尚未在人类中验证这些发现 | 探讨微小RNA及其下游转录因子在斑马鱼血栓生成中的作用 | 斑马鱼血栓细胞中的微小RNA及其下游转录因子 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 15种微小RNA在斑马鱼血栓细胞中被鉴定 |
| 114 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA-seq uncovers dynamic processes orchestrated by RNA-binding protein DDX43 in chromatin remodeling during spermiogenesis
2023-04-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-38199-w
PMID:37120627
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研究论文 | 该研究揭示了RNA结合蛋白DDX43在精子发生过程中的染色质重塑中的动态过程 | 首次识别RNA解旋酶DDX43作为精子发生过程中染色质重塑的关键调节因子 | 研究主要集中于小鼠模型，可能对其他物种的适用性有限 | 探讨DDX43在精子发生过程中染色质重塑的作用 | 研究了缺失Ddx43或表达Ddx43 ATP酶失活突变体的生殖细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型中的多个生殖细胞样本 |
| 115 | 2024-08-05 |
Reconstruction of the cell pseudo-space from single-cell RNA sequencing data with scSpace
2023-04-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-38121-4
PMID:37120608
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研究论文 | 本文提出了一种方法，通过重建细胞的伪空间来识别空间变异的细胞亚群体 | 创新之处在于提出了单细胞空间位置相关的共同嵌入方法，能够基于空间转录组参考重建细胞的空间信息 | 在某些情况下，可能依赖于特定的空间转录组参考数据 | 研究旨在识别细胞的空间变异性及其亚群体 | 研究对象包括不同组织中单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 癌症（黑色素瘤）和COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 生物数据集（模拟和真实数据集） | 涉及多个复杂组织样本如脑皮层、小肠绒毛等 |
| 116 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals the fragility of male spermatogenic cells to Zika virus-induced complement activation
2023-04-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-38223-z
PMID:37120617
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了Zika病毒感染小鼠睾丸细胞的影响，揭示了生精细胞对Zika病毒感染的脆弱性及其与补体系统激活的关系 | 首次揭示了Zika病毒感染通过激活补体系统影响生精细胞，并评估了补体抑制剂和S100A4抑制剂对保护睾丸功能的效果 | NA | 探讨Zika病毒对男性生殖健康的影响及其机制 | Zika病毒感染的小鼠睾丸细胞和北方猪尾猕猴 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠和北方猪尾猕猴 |
| 117 | 2024-08-05 |
MASI enables fast model-free standardization and integration of single-cell transcriptomics data
2023-04-28, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-023-04820-3
PMID:37117305
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研究论文 | 本文介绍了一种名为MASI的快速无模型集成方法，旨在对单细胞转录组数据进行标准化和集成。 | MASI方法在细胞类型注释和数据集成速度方面表现优于其他已建立的方法。 | 本研究未明确提及具体的局限性。 | 本研究的目的是提高单细胞转录组数据的研究包容性，通过标准化细胞类型注释和数据集成。 | 研究对象为来自不同研究实验室的单细胞转录组数据集。 | 数字病理学 | NA | NA | NA | 单细胞转录组数据 | 约100万个细胞 |
| 118 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing analysis fibrosis provides insights into the pathobiological cell types and cytokines of radiation-induced pulmonary fibrosis
2023-Apr-28, BMC pulmonary medicine
IF:2.6Q2
DOI:10.1186/s12890-023-02424-5
PMID:37118713
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析放射诱导的肺纤维化的细胞类型和细胞因子 | 首次提供了放射诱导肺纤维化中细胞类型和细胞因子变化的具体数据 | 研究仅使用了鼠模型，可能限制了对人类疾病的直接推论 | 揭示放射诱导的肺纤维化的病理生物学机制 | 对照组和接受放射治疗的小鼠肺部细胞进行分析 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序 | NA | 细胞数据 | 小鼠样本，包含对照组（0 Gy）和放射治疗组（20 Gy） |
| 119 | 2024-08-08 |
An ERK-dependent molecular switch antagonizes fibrosis and promotes regeneration in spiny mice (Acomys)
2023-04-28, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adf2331
PMID:37126559
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研究论文 | 本文研究了刺鼠（Acomys）中ERK依赖的分子开关如何对抗纤维化并促进组织再生 | 揭示了ERK信号在不同再生能力哺乳动物中的活性差异，并发现了纤维母细胞生长因子和ErbB信号作为再生上游ERK调控因子 | NA | 探索驱动哺乳动物组织再生的核心信号通路 | 刺鼠的皮肤和复杂肌肉骨骼组织的再生机制 | 生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 120 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing of immune cells after marathon and symptom-limited cardiopulmonary exercise
2023-Apr-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.106532
PMID:37123249
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研究论文 | 本文研究了马拉松和症状限制性的心肺运动对免疫细胞的影响。 | 本文首次通过单细胞RNA测序分析了剧烈运动后外周血单核细胞的反应，揭示了免疫细胞的时序变化。 | 研究主要集中在运动后的短期影响，未深入探讨长期影响。 | 探索剧烈运动对免疫功能的影响及相关机制。 | 外周血单核细胞（PBMCs）在马拉松及心肺运动测试后的变化。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | scRNA-seq | NA | 细胞数据 | 所有参与者的PBMC样本 |