单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 287 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2024-08-05 |
Brain and blood single-cell transcriptomics in acute and subacute phases after experimental stroke
2023-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.31.535150
PMID:37066298
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研究论文 | 该文章研究了急性和亚急性中风后脑部和血液的单细胞转录组学 | 首次系统性分析了中风后免疫细胞亚群的时序动态和多样性，揭示了脑内浸润的白细胞和循环白细胞的转录组差异 | 对小鼠中风后的免疫细胞多样性尚不完全了解，且研究可能不适用于人类 | 了解中风后的免疫细胞反应及其在组织损伤和修复中的作用 | 小鼠的脑细胞和血液白细胞 | 数字病理学 | 脑卒中 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 小鼠，分别在中风后2天和14天收集样本 |
| 82 | 2024-08-07 |
deCS: A Tool for Systematic Cell Type Annotations of Single-cell RNA Sequencing Data among Human Tissues
2023-04, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2022.04.001
PMID:35470070
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研究论文 | 本文介绍了一种名为deCS的自动细胞类型注释方法，该方法结合了人类细胞类型表达谱和标记基因，用于单细胞RNA测序数据的系统细胞类型注释 | deCS显著减少了计算时间并提高了注释准确性，能够集成到标准的单细胞RNA测序分析流程中，增强细胞类型注释 | NA | 构建一个全面的人类细胞类型参考图谱，并开发一种自动细胞类型注释方法 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型注释 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 51个人类复杂性状 |
| 83 | 2024-08-07 |
Early events marking lung fibroblast transition to profibrotic state in idiopathic pulmonary fibrosis
2023-Apr-21, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-023-02419-0
PMID:37085855
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研究论文 | 研究揭示了特发性肺纤维化（IPF）中肺成纤维细胞从正常状态向促纤维化状态转变的早期事件 | 首次发现全局性核糖体蛋白下调和大多数铜结合蛋白（包括MOXD1）显著上调标记了IPF的转变 | 未发现IPF上叶和下叶样本在基因表达上有显著差异 | 探究IPF中成纤维细胞从正常到促纤维化状态转变的早期病理途径 | 健康对照组和IPF患者的肺部成纤维细胞 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞转录组学（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 健康对照组和IPF患者的肺部样本 |
| 84 | 2024-08-07 |
Distinct mesenchymal cell states mediate prostate cancer progression
2023-Apr-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.29.534769
PMID:37034687
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术比较了四种遗传工程小鼠模型中的间充质细胞与野生型对照，以及相应基因型的人类肿瘤，揭示了肿瘤间质在前列腺癌进展中的作用 | 发现了8种转录和功能上不同的间质细胞群，这些细胞群负责常见的和特定于小鼠模型的转录程序，并构建了一个可以预测前列腺癌患者转移进展的基因特征 | NA | 探讨肿瘤间质在前列腺癌进展和转移潜力中的分子基础 | 间充质细胞、遗传工程小鼠模型、人类前列腺癌 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 四种遗传工程小鼠模型和相应基因型的人类肿瘤 |
| 85 | 2024-08-05 |
A spatially resolved single cell genomic atlas of the adult human breast
2023-Apr-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.22.537946
PMID:37163043
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研究论文 | 本文构建了一个成人人的乳腺单细胞基因组图谱 | 首次以单细胞和空间分辨率构建了全面的人类乳腺细胞图谱 | 对非上皮细胞类型的研究仍然相对不足 | 研究成人正常乳腺组织，以了解乳腺生物学和相关疾病状态 | 535,941个细胞和120,024个细胞核的数据来自62名和20名女性 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 细胞数据 | 535,941个细胞和120,024个细胞核 |
| 86 | 2024-08-07 |
RhoA GEF Mcf2lb regulates rosette integrity during collective cell migration
2023-Apr-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.19.537573
PMID:37131612
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研究论文 | 本文研究了RhoA GEF Mcf2lb在多细胞迁移过程中对花环结构完整性的调控作用 | 首次揭示了Mcf2lb通过激活RhoA调控细胞顶端收缩，从而影响花环结构的形成和维持 | NA | 探究花环结构形成和维持的分子机制 | RhoA GEF Mcf2lb在多细胞花环结构中的作用 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序，原位杂交 | NA | 图像 | 约150个细胞组成的斑马鱼后侧线原基(pLLP) |
| 87 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing of PIT1-positive pituitary adenoma highlights the pro-tumour microenvironment mediated by IFN-γ-induced tumour-associated fibroblasts remodelling
2023-04, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-022-02126-5
PMID:36631635
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研究论文 | 这篇文章探讨了PIT1阳性垂体腺瘤中IFN-γ诱导的肿瘤相关成纤维细胞重塑所介导的促肿瘤微环境 | 本研究揭示了PIT1-PA微环境中细胞类型的功能异质性，以及IFN-γ在肿瘤相关成纤维细胞重塑中的抗肿瘤作用 | 仍需进一步研究以完全了解PIT1-PA中肿瘤相关成纤维细胞和免疫细胞的细胞和功能异质性 | 研究PIT1-阳性垂体腺瘤中的微环境及其在肿瘤发展的作用 | 研究了四个PIT1阳性垂体腺瘤样本中的28种不同细胞亚型 | 数字病理学 | 垂体腺瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 4个PIT1-阳性垂体腺瘤样本 |
| 88 | 2024-08-05 |
Glucocorticoid activation by HSD11B1 limits T cell-driven interferon signaling and response to PD-1 blockade in melanoma
2023-04-07, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-004150
PMID:37028818
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研究论文 | 这篇文章探讨了HSD11B1如何通过限制T细胞驱动的干扰素信号通路反过来影响黑色素瘤对PD-1阻断的反应 | 识别了HSD11B1作为负反馈机制，并提出HSD11B1抑制剂与免疫检查点抑制剂（ICIs）结合使用的药物重定位策略 | 需要更加仔细的人群分层来评估疗效 | 旨在识别影响黑色素瘤免疫治疗反应的新机制 | 使用不同的同基因黑色素瘤小鼠模型研究PD-1的阻断影响 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | RNA-seq, 免疫荧光, 流式细胞术, 免疫组化 | NA | 组织样本 | 使用了多种小鼠模型和两组患者样本 |
| 89 | 2024-08-05 |
TEAD1 trapping by the Q353R-Lamin A/C causes dilated cardiomyopathy
2023-04-14, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ade7047
PMID:37058558
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研究论文 | 本文探讨了突变的Lamin A/C如何通过捕获TEAD1导致扩张型心肌病的分子机制 | 发现了突变Lamin A/C通过在核膜捕获TEAD1导致心肌细胞结构成熟不足，并揭示了干预转录失调的潜在治疗方法 | NA | 阐明扩张型心肌病的分子机制 | 突变的Lamin A/C及其相关的扩张型心肌病 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，ATAC-seq，蛋白质阵列，电子显微镜分析 | NA | RNA，蛋白质 | 来自患有扩张型心肌病的患者的心脏组织样本 |
| 90 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing of intestinal immune cells in neonatal necrotizing enterocolitis
2023-Apr-11, Pediatric surgery international
IF:1.5Q3
DOI:10.1007/s00383-023-05461-7
PMID:37041419
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了新生儿坏死性小肠结肠炎（NEC）患者的肠道免疫细胞基因表达谱 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了NEC患者肠道免疫细胞中MTOR、TNF-α和MYC信号通路的富集，表明炎症和细胞增殖相关的免疫反应上调 | 样本量较小，仅包括四名新生儿，且未涉及更多NEC和非NEC病例的比较 | 分析NEC患者的肠道免疫反应，以增进对NEC发病机制的理解 | NEC患者的肠道免疫细胞 | 数字病理学 | 新生儿疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 四名新生儿（两名为NEC患者，两名为非NEC患者） |
| 91 | 2024-08-07 |
A novel immune checkpoint score system for prognostic evaluation in pancreatic adenocarcinoma
2023-Apr-06, BMC gastroenterology
IF:2.5Q2
DOI:10.1186/s12876-023-02748-w
PMID:37024802
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研究论文 | 本文研究了胰腺腺癌（PAAD）中免疫检查点评分系统的预测能力，并验证了OX40作为独立预后相关基因的作用。 | 首次建立了基于三个免疫检查点（OX40、TNFSF14和KIR3DL1）的风险评分系统，并验证了其在PAAD患者中的独立预后因子作用。 | NA | 探索胰腺腺癌的新型预后生物标志物 | 胰腺腺癌患者的免疫检查点和预后 | 数字病理学 | 胰腺癌 | scRNA-seq, RT-PCR, IHC | LASSO和Cox回归分析 | 基因表达数据 | 84个PAAD临床样本 |
| 92 | 2024-08-05 |
MANGEM: a web app for Multimodal Analysis of Neuronal Gene expression, Electrophysiology and Morphology
2023-Apr-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.03.535322
PMID:37066386
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研究论文 | 本研究开发了一个名为MANGEM的云端web应用，用于分析神经元的多模态数据 | 该应用提供了一种易于使用的界面，使生物学家和神经科学家能够进行多模态数据的机器学习对齐，而无需计算专业知识 | 使用此方法需要适当的计算基础设施，并且对生物学家和神经科学家的计算能力要求较高 | 旨在为神经元的多模态数据提供可访问的分析工具 | 研究对象是小鼠视觉皮层中的神经元细胞 | 机器学习 | NA | Patch-seq | NA | 多模态数据 | 小鼠视觉皮层中的神经元细胞 |
| 93 | 2024-08-05 |
Single-cell profiling to explore pancreatic cancer heterogeneity, plasticity and response to therapy
2023-04, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-023-00526-x
PMID:36959420
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评论 | 这篇文章概述了单细胞分析在胰腺癌中的应用及其对疾病理解的影响 | 文章介绍了高分辨率单细胞测序和空间转录组技术在研究胰腺癌异质性和可塑性方面的最新进展 | 该文章可能缺乏实际的实验数据支持其观点 | 探讨胰腺导管腺癌的异质性、可塑性及其对治疗的反应 | 胰腺癌的恶性细胞和宿主细胞类型 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞测序, 空间转录组 | NA | 细胞类型 | NA |
| 94 | 2024-08-05 |
Integrated single-nucleus and spatial transcriptomics captures transitional states in soybean nodule maturation
2023-04, Nature plants
IF:15.8Q1
DOI:10.1038/s41477-023-01387-z
PMID:37055554
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研究论文 | 本研究通过整合单核和空间转录组技术，建立了大豆结节和根部的细胞图谱 | 首次揭示了未感染细胞在结节发育过程中专门化为功能上不同的亚群体，并发现了富含结节相关基因的感染细胞过渡亚型 | NA | 研究根瘤菌与豆科植物的共生关系 | 大豆结节和根部细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组和空间转录组 | NA | 细胞 | NA |
| 95 | 2024-08-05 |
AIRE illuminates the feature of medullary thymic epithelial cells in thymic carcinoma
2023-04, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.5777
PMID:36912123
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研究论文 | 该文章探讨了胸腺癌中髓样胸腺上皮细胞的特征，并强调了AIRE的重要性 | 首次将AIRE与胸腺癌的起源联系起来，并指出胸腺癌可能来源于mTECs | 未能完全确定胸腺癌的所有分子特征及其来源 | 阐明胸腺癌及相关胸腺上皮肿瘤的细胞起源 | 胸腺癌样本及其与mTECs的关系 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 组织样本 | 使用了TCGA-THYM数据库和最新的人类单细胞RNA-seq数据 |
| 96 | 2024-08-07 |
Myosin light-chain 4 gene-transfer attenuates atrial fibrosis while correcting autophagic flux dysregulation
2023-04, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2023.102606
PMID:36645977
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研究论文 | 研究MYL4基因调控溶酶体功能及其在纤维化心房心肌病中的紊乱作用 | 首次揭示了MYL4蛋白通过调控溶酶体移动性影响心房心肌细胞自噬流，并提出MYL4过表达作为一种潜在的生物治疗策略 | NA | 探讨MYL4调控溶酶体功能及其在纤维化心房心肌病中的作用 | MYL4基因、溶酶体功能、纤维化心房心肌病 | NA | 心血管疾病 | 免疫荧光、电子显微镜、蛋白质组分析、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质、RNA | 涉及MYL4p.E11K突变的小鼠模型 |
| 97 | 2024-08-05 |
The Genomic Landscape of Melanoma and Its Therapeutic Implications
2023-04-29, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes14051021
PMID:37239381
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综述 | 本文提供了涵盖黑色素瘤基因组及其治疗影响的全面回顾 | 探讨了最新技术如何增进对黑色素瘤及其微环境基因组格局的理解 | 未提及具体的实验数据或临床试验结果 | 研究黑色素瘤的遗传构成及其对治疗的影响 | 黑色素瘤的肿瘤发生、转移和预后相关的遗传因素 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 下一代测序（NGS）和单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 98 | 2024-08-05 |
[Evaluation of peripheral blood T-lymphocyte subpopulations features in patients with hepatitis B virus-related acute-on-chronic liver failure based on single-cell sequencing technology]
2023-Apr-20, Zhonghua gan zang bing za zhi = Zhonghua ganzangbing zazhi = Chinese journal of hepatology
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研究论文 | 该研究探讨了HBV相关急性慢性肝衰竭患者外周血T淋巴细胞亚群特征 | 通过单细胞RNA测序技术识别了八种不同的T淋巴细胞亚群及其特征，揭示了T细胞在HBV-ACLF发病机制中的异质性 | 样本仅限于六例HBV-ACLF患者与三例健康对照，样本量较小 | 研究HBV相关急性慢性肝衰竭患者T淋巴细胞的免疫耗竭特征 | 含有HBV-ACLF患者及健康对照的外周血T淋巴细胞 | 数字病理 | 肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 六例HBV-ACLF患者和三例健康对照 |
| 99 | 2024-08-07 |
Endometrial Receptivity During the Preimplantation Period: A Narrative Review
2023-Apr, Cureus
DOI:10.7759/cureus.37753
PMID:37214054
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综述 | 本文综述了影响子宫内膜容受性的多种因素，包括激素调节和分子机制，以及评估子宫内膜容受性的潜在生物标志物 | 近期转录组学和蛋白质组学技术的进步已识别出几个可能增强预测子宫内膜容受性能力的候选生物标志物 | 尽管缺乏可靠的生物标志物，但已提出多种治疗策略以改善子宫内膜容受性 | 旨在阐明影响子宫内膜容受性的各种因素 | 子宫内膜容受性的激素调节、分子机制及潜在生物标志物 | NA | NA | 单细胞RNA测序和基于质谱的蛋白质组学 | NA | 转录组和蛋白质组数据 | NA |
| 100 | 2024-08-05 |
Construction of a prognostic model for lung adenocarcinoma based on membrane-tension-related genes
2023-Apr-28, Journal of thoracic disease
IF:2.1Q3
DOI:10.21037/jtd-23-396
PMID:37197492
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研究论文 | 本研究构建了一个与膜张力相关基因的肺腺癌预后模型 | 首次关注膜张力在肺腺癌中的作用，并构建了基于膜张力相关基因的预后模型 | 样本可能存在选择偏差，模型在不同人群中的验证需要进一步研究 | 旨在识别影响肺腺癌预后的关键生物标志物 | 关注于肺腺癌患者的膜张力相关基因及其预后价值 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序 | COX回归模型和LASSO回归模型 | 基因组数据 | 从TCGA数据库中获取了肺腺癌样本的RNA测序数据 |