单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 288 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2024-08-07 |
Comparative analysis of dimension reduction methods for cytometry by time-of-flight data
2023-04-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-37478-w
PMID:37005472
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研究论文 | 本文比较了21种降维方法在110个真实和425个合成CyTOF样本上的性能 | 发现了一些不太知名但表现优异的降维方法，如SAUCIE、SQuaD-MDS和scvis | 选择降维方法应取决于数据结构和分析需求 | 评估和发展适用于CyTOF数据的计算方法 | CyTOF数据的降维方法 | 生物信息学 | NA | CyTOF | NA | 数据 | 110个真实样本和425个合成样本 |
| 62 | 2024-08-07 |
Tet2- and Tet3- Mediated Cytosine Hydroxymethylation in Six2 Progenitor Cells in Mice Is Critical for Nephron Progenitor Differentiation and Nephron Endowment
2023-04-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2022040460
PMID:36522157
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研究论文 | 本研究通过遗传删除小鼠肾元祖细胞中的Tet1、Tet2和Tet3基因，探讨了Tet2和Tet3介导的胞嘧啶羟甲基化在肾元祖细胞分化和肾元赋予中的关键作用。 | 首次揭示了Tet2和Tet3介导的胞嘧啶羟甲基化在肾元祖细胞分化和肾元赋予中的生理作用。 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证这些发现。 | 探讨表观遗传变化在肾元赋予和肾脏发育中的作用。 | 小鼠肾元祖细胞中的Tet1、Tet2和Tet3基因。 | NA | 肾脏疾病 | 全基因组亚硫酸氢盐测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型 |
| 63 | 2024-08-07 |
Estradiol Augments Tumor-Induced Neutrophil Production to Promote Tumor Cell Actions in Lymphangioleiomyomatosis Models
2023-04-17, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/endocr/bqad061
PMID:37042477
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研究论文 | 本文研究了雌二醇在淋巴管平滑肌瘤病模型中通过促进中性粒细胞产生来增强肿瘤细胞作用的现象 | 首次报道了雌二醇通过促进中性粒细胞产生来间接促进肿瘤生长的机制 | NA | 探究雌二醇在淋巴管平滑肌瘤病中的作用机制 | 淋巴管平滑肌瘤病模型中的肿瘤细胞和中性粒细胞 | 数字病理学 | 淋巴管平滑肌瘤病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 使用TSC2-null小鼠子宫肌细胞系和来自淋巴管平滑肌瘤病患者的单细胞RNA测序数据 |
| 64 | 2024-08-07 |
Repression of the aryl-hydrocarbon receptor prevents oxidative stress and ferroptosis of intestinal intraepithelial lymphocytes
2023-04-11, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2023.01.023
PMID:36801011
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研究论文 | 研究揭示了芳基烃受体抑制剂（AHRR）对维持肠道上皮内淋巴细胞（IELs）的重要性，以及其缺乏导致的氧化应激和铁死亡 | 首次展示了AHRR在维持IELs中的关键作用，以及其缺乏如何导致氧化应激和铁死亡 | 研究主要集中在实验室模型和小鼠实验上，可能需要进一步的人体研究来验证结果 | 探讨AHRR在调节肠道免疫反应和防止氧化应激及铁死亡中的作用 | 肠道上皮内淋巴细胞（IELs）和芳基烃受体（AHR）及其抑制剂（AHRR） | NA | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及小鼠模型和炎症性肠病患者的组织样本 |
| 65 | 2024-08-04 |
Cellular states are coupled to genomic and viral heterogeneity in HPV-related oropharyngeal carcinoma
2023-04, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-023-01357-3
PMID:37012457
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序分析HPV阳性和阴性口咽肿瘤，揭示肿瘤内外的细胞多样性。 | 首次揭示了口咽癌细胞状态与基因组和病毒异质性的关系 | 研究中未明确涉及样本的具体数量和来源 | 探索HPV相关的口咽癌细胞的多样性及其对预后影响 | HPV阳性和阴性口咽肿瘤 | 数字病理学 | 其他癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 66 | 2024-08-04 |
Allograft tissue under the microscope: only the beginning
2023-04-01, Current opinion in organ transplantation
IF:1.8Q3
DOI:10.1097/MOT.0000000000001052
PMID:36787238
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review | 回顾了肾移植活检的新方法，以补充当前的Banff分类方案 | 引入了人工智能、机器学习和数字病理学等新方法来改进移植组织的检查 | 活检的内在抽样误差和没有自动形态测量分析限制了其在移植健康预后中的表现 | 探索可以改进肾移植组织活检分析的新方法 | 肾移植活检样本和相关组织研究 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | AI和ML算法 | 组织样本 | NA |
| 67 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomic heterogeneity between conduit and resistance mesenteric arteries in rats
2023-04-01, Physiological genomics
IF:2.5Q2
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研究论文 | 该文章探讨了大鼠导管和阻力肠系膜动脉中内皮细胞的单细胞转录组异质性 | 通过单细胞RNA测序，揭示了不同动脉节段的内皮和血管平滑肌细胞在表型上的差异 | 仅基于9只成年雄性斯普拉格-道利大鼠进行研究，可能限制了结果的外推性 | 研究内皮细胞和血管平滑肌细胞在不同动脉之间的表型异质性 | 成年雄性斯普拉格-道利大鼠的不同径向动脉 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 9只成年雄性斯普拉格-道利大鼠，分为6个样本 |
| 68 | 2024-08-04 |
MicroRNA-155 Plays Selective Cell-Intrinsic Roles in Brain-Infiltrating Immune Cell Populations during Neuroinflammation
2023-04-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2200478
PMID:36883849
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研究论文 | 本研究探讨了miR-155在神经炎症中浸润的免疫细胞群体中的细胞内作用 | 本研究首次确认了miR-155在不同免疫细胞中的特异性作用，展示了通过条件性KO方法对其功能的重要见解 | 研究未能确定miR-155在浸润的巨噬细胞中的作用 | 研究miR-155在多发性硬化症模型中不同免疫细胞群体的重要性 | 主要研究对象为小鼠模型中的T细胞、巨噬细胞和树突状细胞 | 数字病理学 | 神经炎症 | 单细胞RNA测序 | 条件性基因敲除（KO）模型 | RNA序列数据 | 多个小鼠样本，包括全球miR-155 KO小鼠和野生型对照小鼠 |
| 69 | 2024-08-04 |
NOX1 is essential for TNFα-induced intestinal epithelial ROS secretion and inhibits M cell signatures
2023-04, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2021-326305
PMID:36191961
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研究论文 | 本文探讨了NOX1缺失如何影响肠道上皮ROS分泌及M细胞特征 | 揭示了NOX1缺失对M细胞诱导的影响及其在UC炎症中的作用 | 研究主要集中在小鼠模型，可能不能完全反映人类疾病的复杂性 | 探讨NOX1在炎症性肠病（IBD）中的角色和机制 | 以NOX1基因型和TNFα刺激分层的肠道类器官为研究对象 | 数字病理学 | 肠炎 | 单细胞转录组分析，免疫组化 | 小鼠 | 基因表达数据 | 使用了多个人来源的肠道类器官和小鼠模型 |
| 70 | 2024-08-04 |
Osteoimmunology in Periodontitis and Orthodontic Tooth Movement
2023-04, Current osteoporosis reports
IF:4.2Q1
DOI:10.1007/s11914-023-00774-x
PMID:36862360
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review | 综述免疫细胞在牙周炎和正畸牙齿移动中的作用及其与其他细胞的相互作用 | 首次结合单细胞RNA测序揭示不同细胞类型在对抗细菌挑战中的作用 | 未能详细探讨系统性疾病对免疫反应的影响 | 研究免疫细胞与牙周组织中细胞的相互作用在牙周炎和正畸牙齿移动中的作用 | 牙周炎和正畸牙齿移动中细胞及其相互作用 | 数字病理学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 71 | 2024-08-07 |
Chronic jetlag accelerates pancreatic neoplasia in conditional Kras-mutant mice
2023-04, Chronobiology international
IF:2.2Q3
DOI:10.1080/07420528.2023.2186122
PMID:36912021
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研究论文 | 研究探讨了慢性时差对携带胰腺特异性激活突变的小鼠胰腺癌发生的影响 | 首次揭示了非细胞自主性时钟功能障碍在加速胰腺癌前病变发展中的作用，并通过单细胞RNA测序识别了与时钟依赖性变化最相关的细胞群 | 研究仅限于小鼠模型，需要进一步的人体研究来验证这些发现 | 探究时钟错位与胰腺癌之间的关联及其机制 | 携带胰腺特异性激活突变的小鼠 | NA | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 72 | 2024-08-07 |
Preneoplastic stromal cells promote BRCA1-mediated breast tumorigenesis
2023-04, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-023-01298-x
PMID:36914836
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研究论文 | 本文研究了BRCA1突变携带者中，癌前基质细胞如何促进乳腺肿瘤的发生 | 首次揭示了癌前基质微环境在BRCA1驱动的肿瘤发生中的作用，特别是通过促进上皮细胞增殖和改变腔前体细胞的分化 | NA | 探讨BRCA1突变携带者中癌前基质细胞对乳腺肿瘤发生的影响 | BRCA1突变携带者的乳腺组织 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 人类癌前BRCA1和非携带者的乳腺组织 |
| 73 | 2024-08-07 |
Cardiomyocyte Pdk4 response is associated with metabolic maladaptation in aging
2023-04, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.13800
PMID:36797808
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，探讨了老年和年轻小鼠心脏细胞在缺血/再灌注条件下转录差异，特别是心肌细胞中Pdk4基因的表达变化及其对葡萄糖代谢的影响 | 首次揭示了Pdk4在年轻和老年小鼠心肌细胞中的差异表达，及其对葡萄糖代谢的调控作用 | 研究仅限于小鼠模型，未来需在人类样本中验证这些发现 | 探索衰老如何增加心脏对缺血损伤的脆弱性 | 老年和年轻小鼠的心肌细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 老年和年轻小鼠的心脏样本 |
| 74 | 2024-08-07 |
Low-dose IL-2 enhances the generation of IL-10-producing immunoregulatory B cells
2023-04-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-37424-w
PMID:37045832
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研究论文 | 本文研究了低剂量白细胞介素-2（IL-2）对IL-10产生调节性B细胞生成的增强作用 | 首次证明了低剂量IL-2可以增强人体内IL-10产生调节性B细胞的生成 | NA | 探讨低剂量IL-2是否能在人体内诱导产生调节性B细胞 | 人体外周血和脾脏B细胞以及接受低剂量IL-2治疗的患者 | 免疫学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自接受低剂量IL-2治疗患者的循环免疫细胞 |
| 75 | 2024-08-05 |
Single-Cell Discovery and Multiomic Characterization of Therapeutic Targets in Multiple Myeloma
2023-04-14, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-1769
PMID:36779841
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研究论文 | 这项研究分析了多发性骨髓瘤患者的骨髓抽吸样本，以发现治疗靶标。 | 研究发现了38个多发性骨髓瘤标记基因，其中11个尚未被认识为治疗靶点。 | 样本量有限可能影响结果的广泛适用性，但结果仍然展示了较高的一致性。 | 旨在开发一种识别肿瘤标记的新策略，以促进靶向癌症治疗的进展。 | 研究对象为41名多发性骨髓瘤患者的53个骨髓抽吸样本。 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 41名多发性骨髓瘤患者的53个骨髓抽吸样本 |
| 76 | 2024-08-07 |
Mesenchymal-epithelial transition in lymph node metastases of oral squamous cell carcinoma is accompanied by ZEB1 expression
2023-04-19, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04102-w
PMID:37076857
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和批量转录组测序，探讨了口腔鳞状细胞癌（OSCC）淋巴结转移中上皮-间质可塑性（EMP）的异质性及其对基质细胞的影响 | 首次揭示了在口腔鳞状细胞癌淋巴结转移中，间质-上皮转化（MET）过程中ZEB1的活性增加，表明ZEB1在MET中的复杂作用 | 研究样本量有限，且仅限于口腔鳞状细胞癌，可能限制了结果的普遍性 | 探讨口腔鳞状细胞癌淋巴结转移中上皮-间质可塑性的异质性及其对肿瘤微环境的影响 | 口腔鳞状细胞癌的肿瘤细胞和基质细胞 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 23个口腔鳞状细胞癌病变样本，共7263个癌细胞的单细胞转录组数据 |
| 77 | 2024-08-07 |
Stricturing Crohn's disease single-cell RNA sequencing reveals fibroblast heterogeneity and intercellular interactions
2023-Apr-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.03.534781
PMID:37066202
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，首次揭示了克罗恩病狭窄部位的纤维母细胞异质性及其细胞间相互作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术构建了克罗恩病狭窄肠道的全面图谱，并验证了CDH11作为潜在治疗靶点 | NA | 旨在通过系统层面的研究揭示克罗恩病狭窄形成的病理机制，并发现新的治疗靶点 | 克罗恩病患者的全层肠组织，包括未受累、非狭窄炎症和狭窄段以及正常非克罗恩病肠段 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | RNA | 99个组织样本和409,001个细胞 |
| 78 | 2024-08-05 |
Immune-interacting lymphatic endothelial subtype at capillary terminals drives lymphatic malformation
2023-04-03, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20220741
PMID:36688917
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研究论文 | 本研究揭示了一种新的免疫相互作用淋巴内皮亚型，该亚型在毛细血管末端促进淋巴管畸形 | 发现了一种新的Ptx3阳性皮肤淋巴毛细血管内皮细胞亚型，其能够招募促淋巴管生成的巨噬细胞 | 尚需进一步研究以深入理解该内皮细胞亚型的作用机制和临床应用 | 研究PIK3CA突变驱动的淋巴管畸形的致病机制 | 小鼠模型中的Pik3caH1047R驱动的血管畸形 | 数字病理学 | 淋巴管畸形 | 单细胞转录组学 | NA | 生物样本 | 使用了小鼠模型，具体样本数量未提及 |
| 79 | 2024-08-07 |
Neutrophilic granulocyte-derived B-cell activating factor supports B cells in skin lesions in hidradenitis suppurativa
2023-04, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2022.10.034
PMID:36481267
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研究论文 | 本研究旨在探讨支持藏毛窦病灶中B细胞/浆细胞持续存在的介质 | 发现中性粒细胞衍生的B细胞激活因子（BAFF）在藏毛窦病灶中支持B细胞/浆细胞的持续存在和功能 | NA | 研究藏毛窦病灶中支持B细胞/浆细胞持续存在的介质 | 藏毛窦病患者的皮肤样本和对照组样本 | 免疫学 | 藏毛窦病 | mRNA测序、定量PCR、流式细胞术、免疫荧光染色 | NA | RNA测序数据 | 多个藏毛窦病患者和对照组的皮肤样本 |
| 80 | 2024-08-07 |
Trajectory reconstruction identifies dysregulation of perinatal maturation programs in pluripotent stem cell-derived cardiomyocytes
2023-04-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112330
PMID:37014753
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）重建轨迹，识别了多能干细胞衍生的心肌细胞（PSC-CMs）中胎儿成熟程序的失调 | 首次通过单细胞RNA测序技术，比较了体内外心肌细胞成熟过程的差异，并识别了跨物种间在PSC-CMs中持续失调的转录因子网络 | 多能干细胞衍生的心肌细胞未能达到完全功能成熟 | 探究多能干细胞衍生的心肌细胞成熟过程中的机制差异，并寻找改善其临床应用的方法 | 多能干细胞衍生的心肌细胞及其成熟过程 | 干细胞研究 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 广泛采样了先前难以分离的胎儿期时间段的鼠体内心肌细胞 |