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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-10-06 |
Pseudotime dynamics of T cells in pancreatic ductal adenocarcinoma inform distinct functional states within the regulatory and cytotoxic T cells
2023-Apr-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.106324
PMID:36968070
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和RNA速度分析研究胰腺导管腺癌中T细胞的功能动态 | 首次在PDAC中应用基于RNA速度的拟时序分析揭示T细胞功能状态转变轨迹 | 研究基于手术切除样本,可能无法完全反映疾病进展全过程 | 理解PDAC微环境中T细胞的功能动态以开发新的治疗策略 | 人类胰腺导管腺癌手术切除标本中的T细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, RNA速度分析, 拟时序分析 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 22 | 2025-10-06 |
Novel Candidate Regulators and Developmental Trajectory of Pituitary Thyrotropes
2023-04-17, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/endocr/bqad076
PMID:37183548
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究小鼠垂体促甲状腺激素细胞的发育轨迹和新型调控因子 | 发现了同时表达促甲状腺激素和促性腺激素标记物的细胞群体,确定了Nr5a1祖细胞在促甲状腺激素发育中的作用,并识别了Shox2b和Sox14等新型调控因子 | 研究仅使用P7幼年小鼠垂体细胞,未涵盖其他发育阶段 | 探究垂体干细胞分化为特定细胞类型,特别是促甲状腺激素细胞的分子机制 | 幼年P7小鼠垂体细胞,重点关注促甲状腺激素细胞和稀有亚型 | 发育生物学 | 内分泌系统疾病 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学,谱系追踪 | NA | 单细胞转录组数据,图像数据 | 幼年P7小鼠垂体细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 23 | 2025-10-06 |
Low-dose IL-2 enhances the generation of IL-10-producing immunoregulatory B cells
2023-04-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-37424-w
PMID:37045832
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研究论文 | 本研究证明低剂量IL-2能增强人类B细胞产生IL-10的能力,并通过单细胞RNA测序揭示了其分子机制 | 首次发现低剂量IL-2可治疗性诱导人类调节性B细胞,并揭示BACH2转录抑制因子在此过程中的关键作用 | 研究样本量有限,机制研究主要基于体外实验和转录组分析 | 探究低剂量IL-2对调节性B细胞的诱导作用及其分子机制 | 人类外周血和脾脏B细胞,接受低剂量IL-2治疗的患者 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序,体外细胞培养,流式细胞术 | NA | 基因表达数据,细胞表型数据 | 未明确样本数量,包括患者外周血细胞和脾脏细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 24 | 2025-10-06 |
Tissue-Resident Memory T Cells in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma Coexpress PD-1 and TIGIT and Functional Inhibition Is Reversible by Dual Antibody Blockade
2023-04-03, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-22-0121
PMID:36689623
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示了胰腺导管腺癌中组织驻留记忆T细胞共表达PD-1和TIGIT的耗竭表型,并证明双抗体阻断可逆转其功能抑制 | 首次在PDAC中发现大量TRM细胞共表达PD-1和TIGIT,并证实双检查点阻断能有效增强T细胞功能 | 研究样本量有限,未进行体内功能验证实验 | 阐明PDAC肿瘤免疫微环境中T细胞的特征及免疫检查点阻断的治疗潜力 | 胰腺导管腺癌患者的肿瘤浸润T细胞 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 飞行时间质谱流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据, 蛋白质表达数据 | PDAC患者肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 25 | 2025-10-06 |
Transcriptomic landscapes of effective and failed liver regeneration in humans
2023-Apr, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2023.100683
PMID:36950091
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研究论文 | 本研究通过转录组分析探索人类肝脏再生过程中功能性再生与功能障碍性再生的分子机制差异 | 首次在人类中系统评估肝脏再生早期转录变化,发现功能障碍性再生患者存在DUSP4表达降低和过度炎症反应的新机制 | 样本量相对有限(21例用于RNA测序),主要关注早期转录变化,长期再生过程未涉及 | 系统评估人类肝脏再生早期转录变化及其在功能障碍性再生中的差异 | 接受肝切除术的154例患者血液样本和46例患者术中组织样本 | 转录组学 | 肝脏疾病 | RNA测序, 空间转录组学, 细胞因子检测 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据, 细胞因子数据 | 154例患者血液样本, 46例患者组织样本, 其中21例匹配队列用于RNA测序 | NA | RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 26 | 2025-10-06 |
Single-cell profiling to explore pancreatic cancer heterogeneity, plasticity and response to therapy
2023-04, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-023-00526-x
PMID:36959420
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综述 | 本文综述了单细胞分析技术在胰腺导管腺癌研究中的应用,探讨肿瘤异质性、可塑性及治疗反应机制 | 整合高分辨率单细胞测序与空间转录组学技术,系统解析PDAC在稳态和治疗扰动下的细胞类型特征 | NA | 通过单细胞多组学方法阐明胰腺癌生物学特性及治疗反应机制 | 胰腺导管腺癌(PDAC)的恶性细胞和宿主细胞类型 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞测序,空间转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 27 | 2025-10-06 |
Cellular and Molecular Atlas of Peripheral Blood Mononuclear Cells from a Pregnant Woman After Recovery from COVID-19
2023-Apr, Maternal-fetal medicine (Wolters Kluwer Health, Inc.)
DOI:10.1097/FM9.0000000000000190
PMID:40406392
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析研究一名COVID-19康复孕妇外周血单个核细胞的免疫反应特征 | 首次在单细胞分辨率水平揭示COVID-19康复孕妇PBMCs中CD16单核细胞和MAIT细胞的免疫应答特征 | 仅研究单个病例样本,样本量有限 | 探究COVID-19康复孕妇的免疫反应机制 | 孕妇外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1名COVID-19康复孕妇,与已发表健康孕妇数据对比 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 28 | 2025-10-06 |
Targeting of epigenetic co-dependencies enhances anti-AML efficacy of Menin inhibitor in AML with MLL1-r or mutant NPM1
2023-04-13, Blood cancer journal
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41408-023-00826-6
PMID:37055414
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研究论文 | 本研究通过表观遗传协同靶向策略增强Menin抑制剂对MLL1重排或NPM1突变AML的抗白血病疗效 | 发现Menin抑制剂与BET、MOZ、LSD1或CBP/p300抑制剂的联合使用可协同消除AML细胞,并首次在体内模型中验证其优越疗效 | 研究主要基于临床前模型,尚未在人体临床试验中验证 | 探索增强Menin抑制剂在MLL1重排或NPM1突变急性髓系白血病中疗效的联合治疗策略 | 携带MLL1重排或NPM1突变的急性髓系白血病细胞 | 表观遗传学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序, ChIP-Seq, ATAC-Seq, RNA-Seq, RPPA, 质谱流式细胞术, CRISPR-Cas9筛选 | 异种移植模型 | 基因组学数据, 蛋白质组学数据, 表观基因组学数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, ATAC-seq, 质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 29 | 2025-10-07 |
Spatial epigenome-transcriptome co-profiling of mammalian tissues
2023-04, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-05795-1
PMID:36922587
|
研究论文 | 开发两种空间表观基因组-转录组联合分析技术,实现在同一组织切片上同时检测染色质可及性与基因表达或组蛋白修饰与基因表达 | 首次实现空间分辨的全基因组表观基因组与转录组联合分析,突破现有单组学检测限制 | 技术分辨率接近单细胞水平但尚未完全达到单细胞精度 | 探索表观遗传机制在组织中控制转录表型和细胞动态的机制 | 胚胎和幼年小鼠大脑、成年人类大脑组织 | 空间多组学 | NA | 空间表观基因组学、空间转录组学、染色质可及性测序、组蛋白修饰检测 | NA | 空间组学数据、基因表达数据、表观遗传数据 | 小鼠胚胎和幼年大脑、成年人类大脑组织样本 | NA | 空间表观基因组学、空间转录组学、单细胞多组学 | NA | NA |
| 30 | 2025-10-07 |
Potential Molecular Mechanisms of Alzheimer's Disease from Genetic Studies
2023-04-15, Biology
DOI:10.3390/biology12040602
PMID:37106802
|
综述 | 通过单细胞测序和空间基因组学研究阿尔茨海默病的潜在分子机制 | 整合单细胞测序和空间基因组学数据,将AD分子机制差异归纳为四大关键类别并识别新的分子失衡原因 | 采用叙述性综述方法,缺乏系统性meta分析 | 识别阿尔茨海默病分子失衡的共同原因及其潜在机制 | 阿尔茨海默病相关分子机制 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 空间基因组学 | NA | 基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 31 | 2025-03-20 |
FRC transplantation restores lymph node conduit defects in laminin α4-deficient mice
2023-04-24, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.167816
PMID:37092548
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研究论文 | 本研究揭示了细胞外基质Lama4在调节淋巴结导管中的特定作用,并探讨了FRC移植对Lama4缺陷小鼠淋巴结导管缺陷的修复作用 | 首次揭示了FRC衍生的Lama4在维持导管纤维完整性中的关键作用,并展示了通过FRC移植修复Lama4缺陷小鼠的淋巴结导管结构和功能的创新方法 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类中进行验证 | 探讨FRC衍生的Lama4在调节淋巴结导管结构和功能中的作用,并评估FRC移植对Lama4缺陷小鼠的修复效果 | Lama4缺陷小鼠及其淋巴结导管 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | Lama4缺陷小鼠及其淋巴结组织 | NA | NA | NA | NA |
| 32 | 2025-10-07 |
Osteosarcoma tumors maintain intra-tumoral transcriptional heterogeneity during bone and lung colonization
2023-04-27, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-023-01593-3
PMID:37106386
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析骨肉瘤在骨和肺转移过程中维持肿瘤内转录异质性的机制 | 首次结合谱系追踪和单细胞转录组学揭示肺转移过程中具有不同转录谱的多个克隆被富集并在细胞世代间保持稳定 | 研究主要基于细胞系和患者来源的异种移植模型,可能不能完全反映人类体内真实情况 | 研究肿瘤细胞异质性在适应不同微环境中的作用机制 | 骨肉瘤细胞系和患者来源的异种移植模型 | 单细胞生物学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序,免疫荧光染色,谱系追踪 | NA | 单细胞转录组数据,图像数据 | 47,977个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 33 | 2025-10-07 |
Nanoparticle stereochemistry-dependent endocytic processing improves in vivo mRNA delivery
2023-04, Nature chemistry
IF:19.2Q1
DOI:10.1038/s41557-023-01138-9
PMID:36864143
|
研究论文 | 本研究探讨了脂质纳米颗粒中立体化学对mRNA体内递送效率的影响 | 首次证明多组分胶体系统中单一化合物的立体化学能够显著影响纳米颗粒在体内的mRNA递送效率 | 研究主要聚焦于肝脏细胞,对其他组织器官的适用性尚需验证 | 探究立体化学对脂质纳米颗粒mRNA递送效率的影响机制 | 含有不同立体化学构型羟基胆固醇的脂质纳米颗粒 | 纳米医学 | NA | 单细胞RNA测序,成像技术 | NA | 基因表达数据,成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 34 | 2025-10-07 |
The covariance environment defines cellular niches for spatial inference
2023-Apr-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.18.537375
PMID:37131616
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研究论文 | 开发了一种名为COVET的细胞生态位表示方法和ENVI空间推断算法,用于整合空间转录组和单细胞RNA-seq数据 | 提出协方差环境(COVET)表示法捕捉细胞生态位的连续多变量性质,并开发基于最优传输的距离度量和环境变分推断(ENVI)算法 | NA | 解决多路空间分析技术中的计算挑战,开发细胞生态位的合适表示方法 | 细胞生态位和空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | 条件变分自编码器 | 空间转录组数据,单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 35 | 2025-10-07 |
M2 macrophages drive leukemic transformation by imposing resistance to phagocytosis and improving mitochondrial metabolism
2023-04-14, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adf8522
PMID:37058562
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研究论文 | 本研究揭示了M2巨噬细胞通过降低吞噬活性和增强线粒体代谢促进急性髓系白血病转化的机制 | 首次发现M2巨噬细胞通过线粒体转移和代谢重编程保护白血病原始细胞免受吞噬,增强其体内转化潜能 | 研究样本量有限,机制研究仍需进一步深入 | 探究肿瘤微环境中免疫细胞如何促进急性髓系白血病的恶性进展 | 急性髓系白血病患者的骨髓样本和白血病原始细胞 | 肿瘤免疫学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,免疫组织化学 | NA | 基因表达数据,蛋白质表达数据,细胞表型数据 | 急性髓系白血病患者骨髓样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 36 | 2025-10-07 |
Piezo inhibition prevents and rescues scarring by targeting the adipocyte to fibroblast transition
2023-Apr-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.03.535302
PMID:37066136
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研究论文 | 本研究揭示了脂肪细胞通过机械传感转化为成纤维细胞驱动伤口纤维化的机制 | 首次证明机械力足以驱动脂肪细胞向成纤维细胞转化,并发现Piezo抑制可预防和挽救疤痕形成 | 研究主要基于小鼠模型和新型人源异种移植伤口模型,人类临床验证尚需进一步研究 | 探究脂肪细胞在疤痕形成中的作用及其治疗潜力 | 脂肪细胞、成纤维细胞、伤口愈合过程 | 细胞生物学 | 皮肤疤痕 | 克隆谱系追踪、单细胞RNA测序、空间转录组学、CODEX多标检测 | NA | 单细胞RNA测序数据、空间转录组数据、多标成像数据 | 小鼠伤口模型和人类异种移植伤口模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 10x Visium | 空间转录组技术 |
| 37 | 2025-10-07 |
Modeling maternal cholesterol exposure reveals a reduction of neural progenitor proliferation using human cerebral organoids
2023-Apr, Life medicine
DOI:10.1093/lifemedi/lnac034
PMID:39872117
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研究论文 | 本研究利用人类多能干细胞衍生的脑类器官构建胆固醇暴露模型,揭示母体高胆固醇暴露导致神经祖细胞增殖减少的机制 | 首次使用人类脑类器官建立母体胆固醇暴露模型,并通过单细胞测序发现与自闭症谱系障碍的高度相关性 | 研究基于体外类器官模型,可能与体内真实生理环境存在差异 | 探究母体高胆固醇暴露对后代大脑发育缺陷的影响及其机制 | 人类多能干细胞衍生的脑类器官 | 发育神经生物学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞测序,类器官培养 | 脑类器官模型 | 转录组数据,单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 38 | 2025-10-07 |
Size matters: the impact of nucleus size on results from spatial transcriptomics
2023-04-21, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04129-z
PMID:37081484
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研究论文 | 本研究探讨了连续切片数据整合方法对空间转录组学分析结果的影响 | 提出了连续切片数据整合方法,解决了细胞核尺寸超过组织切片厚度时对转录组数据捕获的负面影响 | 研究仅针对人类死后大脑组织,未验证在其他组织类型中的适用性 | 评估连续切片数据整合对空间转录组学spot聚类和解卷积准确性的影响 | 人类死后大脑组织切片 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学,单核RNA测序 | 无监督聚类 | 空间基因表达数据,组织学图像 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium | Visium Spatial Gene Expression |
| 39 | 2024-12-17 |
SPADE: Spatial Deconvolution for Domain Specific Cell-type Estimation
2023-Apr-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.14.536924
PMID:37131788
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研究论文 | 本文提出了一种名为SPADE的空间反卷积方法,用于在特定领域中估计细胞类型的比例 | SPADE通过结合单细胞RNA测序数据、空间位置信息和组织学信息,能够成功识别现有反卷积方法未能识别的细胞类型特定空间模式 | 本文仅展示了在合成数据和鸡心脏发育数据集上的应用,未来需要在更多不同类型的数据集上验证其有效性 | 开发一种能够准确估计异质组织中细胞类型空间分布的方法 | 细胞类型的空间分布及其在复杂生物系统中的变化 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 反卷积方法 | 基因表达数据 | 合成数据和鸡心脏发育数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 40 | 2024-11-17 |
CIMLA: Interpretable AI for inference of differential causal networks
2023-Apr-25, ArXiv
PMID:37163135
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CIMLA的新工具,用于发现条件依赖的因果关系变化,并展示了其在基因调控网络中的应用 | CIMLA工具在发现条件依赖的因果关系变化方面比现有方法更稳健和准确 | NA | 发现高维数据中的因果关系 | 基因调控网络在不同生物条件下的差异 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 特征归因模型 | 高维数据 | NA | NA | NA | NA | NA |