单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 287 篇文献，本页显示第 221 - 240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2024-08-08 |
A single-cell gene expression atlas of human follicular aspirates: Identification of leukocyte subpopulations and their paracrine factors
2023-04, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202201746RR
PMID:36934419
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了人类卵泡抽吸物中的基因表达，识别了白细胞亚群及其旁分泌因子 | 首次在人类卵泡中详细描述了白细胞亚群及其与卵泡细胞的相互作用，并揭示了多种白细胞衍生因子对卵泡细胞功能的直接影响 | 研究样本仅来自四名IVF患者，可能限制了结果的普遍性 | 探索人类卵泡中白细胞亚群及其与卵泡细胞的相互作用，以及这些相互作用对卵泡功能的影响 | 人类卵泡抽吸物中的白细胞亚群及其基因表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 四名IVF患者的卵泡抽吸物 |
| 222 | 2024-08-08 |
A Single-Cell RNA-Sequencing Analysis of Distinct Subsets of Synovial Macrophages in Rheumatoid Arthritis
2023-Apr, DNA and cell biology
IF:2.6Q2
DOI:10.1089/dna.2022.0509
PMID:36940312
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析类风湿性关节炎患者滑膜组织中巨噬细胞的不同亚群及其分子特征 | 首次通过单细胞RNA测序技术识别出类风湿性关节炎滑膜组织中三种巨噬细胞亚群，并分析了它们的分子特征和空间分布 | 研究仅限于分析巨噬细胞的亚群和分子特征，未涉及这些亚群在临床治疗中的具体应用 | 旨在识别类风湿性关节炎滑膜组织中特定的巨噬细胞亚群及其特征，为治疗类风湿性关节炎提供理论基础 | 类风湿性关节炎患者的滑膜组织中的巨噬细胞 | 数字病理学 | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括类风湿性关节炎和骨关节炎患者的滑膜细胞样本 |
| 223 | 2024-08-08 |
Evaluate the developmental competence of human 8-cell embryos by single-cell RNA sequencing
2023-04-01, Reproduction & fertility
DOI:10.1530/RAF-22-0119
PMID:36943184
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术评估了人类8细胞胚胎的发育能力，分析了基因表达与胚胎发育能力之间的关系 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了8细胞胚胎中基因表达与发育能力之间的关联，并识别了324个差异表达基因 | 研究样本量相对较小，且仅限于特定患者群体 | 探讨人类8细胞胚胎的基因表达与发育能力之间的关系 | 人类8细胞胚胎的单个卵裂球 | 生殖医学 | 不孕症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 20个卵裂球来自7名患者，10个卵裂球来自4名患者 |
| 224 | 2024-08-08 |
Investigating Thymic Epithelial Cell Diversity Using Systems Biology
2023-04-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2200610
PMID:36947816
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综述 | 本文综述了利用系统生物学方法研究胸腺上皮细胞多样性的最新进展 | 利用单细胞RNA测序技术揭示胸腺上皮细胞的异质性及其在T细胞发育中的作用 | NA | 探讨胸腺上皮细胞的新亚型及其在支持T细胞发育中的多样性 | 胸腺上皮细胞及其在T细胞发育中的作用 | 系统生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 225 | 2024-08-08 |
Single-cell and spatial transcriptomics during human organogenesis
2023-04, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-023-01113-z
PMID:36949166
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 226 | 2024-08-05 |
Distinct myofibre domains of the human myotendinous junction revealed by single-nucleus RNA sequencing
2023-04-15, Journal of cell science
IF:3.3Q3
DOI:10.1242/jcs.260913
PMID:36924352
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研究论文 | 通过单细胞核RNA测序揭示了人类肌腱连接部位的不同肌纤维区域 | 首次通过单细胞核RNA测序详细描绘了人类肌腱连接部位的肌细胞核特征 | 研究只涉及三名健康男性样本，结果可能无法广泛适用 | 探讨人类肌腱连接部位的基因特征及其在机械应力下的功能 | 三个健康男性的半腱肌-肌腱样本 | 数字病理 | 肌肉相关疾病 | 单细胞核RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 24,124个细胞核，来自三名健康男性的肌腱连接部位样本 |
| 227 | 2024-08-05 |
Transcriptome analysis reveals tumor microenvironment changes in glioblastoma
2023-04-10, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2023.02.019
PMID:36898379
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研究论文 | 文章探讨了胶质母细胞瘤转录组演变及其肿瘤微环境变化 | 该研究突出了胶质母细胞瘤主要通过微环境的重组而非肿瘤细胞的分子演变进行进化 | 未提及具体的局限性 | 深入了解IDH野生型胶质母细胞瘤的转录演变，以优化治疗 | 对322个胶质母细胞瘤的初次和复发样本的转录组进行RNA测序 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | RNA测序 | NA | RNA数据 | 322个测试样本和245个验证样本 |
| 228 | 2024-08-05 |
Improved Bacterial Single-Cell RNA-Seq through Automated MATQ-Seq and Cas9-Based Removal of rRNA Reads
2023-04-25, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.03557-22
PMID:36880749
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研究论文 | 该文章改进了细菌单细胞RNA测序协议，通过自动化和rRNA去除技术提高了RNA测序的效率和准确性 | 集成了自动化和更高效的逆转录酶，降低了细胞损失和提高了基因检测灵敏度 | 未提及研究中的限制因素 | 探讨细菌单细胞RNA测序中基因表达的异质性 | 研究对象为不同生长条件下的沙门氏菌单细胞 | 数字病理学 | 细菌感染 | MATQ-Seq | NA | RNA测序数据 | 大量沙门氏菌单细胞样本 |
| 229 | 2024-08-05 |
Recent advances in deciphering hippocampus complexity using single-cell transcriptomics
2023-04, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2023.106062
PMID:36878328
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综述 | 该文章总结了单细胞转录组学在海马区域的应用 | 创新性地应用scRNA-seq和snRNA-seq技术，深入探讨海马细胞类型和基因表达调控 | 未能完全阐明海马活动背后的所有分子机制 | 旨在加深对海马发育、健康和疾病相关分子机制的理解 | 海马的细胞类型及其基因表达 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq和snRNA-seq | NA | 转录组数据 | NA |
| 230 | 2024-08-05 |
Deep into the niche: Deciphering local endoderm-microenvironment interactions in development, homeostasis, and disease of pancreas and intestine
2023-04, BioEssays : news and reviews in molecular, cellular and developmental biology
IF:3.2Q1
DOI:10.1002/bies.202200186
PMID:36871153
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研究论文 | 本文探讨了局部内胚层微环境与胰腺和肠道的相互作用。 | 揭示了特定间充质亚型通过与上皮、神经和微血管的局部相互作用驱动胰腺内分泌细胞和胰岛的形成与成熟。 | 文章没有明确提到具体的实验局限性或模型限制。 | 研究内胚层微环境在胰腺和肠道发育、稳态及疾病中的作用。 | 探索内胚层发育过程中细胞间的功能异质性。 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学和空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 231 | 2024-08-08 |
TRIM28 promotes luminal cell plasticity in a mouse model of prostate cancer
2023-04, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-023-02655-0
PMID:36882525
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研究论文 | 本研究通过基因工程小鼠模型探讨TRIM28在前列腺癌进展中的作用 | 首次揭示TRIM28促进前列腺肿瘤细胞中近端腔细胞标志物的表达 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类前列腺癌中验证 | 研究TRIM28在前列腺癌进展中的作用及其对肿瘤细胞可塑性的影响 | TRIM28在前列腺癌中的表达及其对肿瘤细胞的影响 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 基因工程小鼠模型NPp53T |
| 232 | 2024-08-08 |
Cytotoxic CD161-CD8+ TEMRA cells contribute to the pathogenesis of systemic lupus erythematosus
2023-Apr, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2023.104507
PMID:36893588
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术分析，揭示了系统性红斑狼疮（SLE）中CD8+ T细胞的异质性，并发现了一种新的高细胞毒性的CD161-CD8+ TEMRA细胞亚群，该亚群在SLE患者中显著增加。 | 本研究首次发现了DTHD1基因突变与CD161-CD8+ TEMRA细胞在SLE中的异常积累之间的关联，并揭示了DTHD1通过抑制MYD88活性来调节CD161-CD8+ TEMRA细胞的增殖和细胞毒性。 | NA | 探讨系统性红斑狼疮（SLE）中CD8+ T细胞的异质性和潜在机制，以及其在SLE发病机制中的作用。 | 系统性红斑狼疮（SLE）患者和健康对照者的外周血单个核细胞（PBMCs）。 | 免疫学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、流式细胞术、qPCR、全外显子测序（WES） | NA | RNA | 包括3名健康对照和2名SLE患者的家族谱系，以及23名健康对照和33名SLE患者的队列。 |
| 233 | 2024-08-08 |
A combinatorial panel for flow cytometry-based isolation of enteric nervous system cells from human intestine
2023-04-05, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.15252/embr.202255789
PMID:36852936
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研究论文 | 本文介绍了一种用于从人肠道中通过流式细胞术分离肠神经系统细胞的组合标记面板 | 该研究提出了一种新的标记组合CD56/CD90/CD24，用于更特异性和高分辨率地标记肠神经系统细胞 | 研究中发现的神经元和胶质细胞标记物的共表达现象，主要由神经元片段驱动，这可能影响细胞类型的纯度 | 开发一种高效的方法来分离和富集人肠神经系统细胞，以便进行单细胞RNA测序 | 人肠神经系统中的神经元和胶质细胞 | NA | NA | 流式细胞术（FACS） | NA | 单细胞RNA测序数据 | 未具体说明样本数量 |
| 234 | 2024-08-05 |
Microanatomy of the metabolic associated fatty liver disease (MAFLD) by single-cell transcriptomics
2023-04, Journal of drug targeting
IF:4.3Q1
DOI:10.1080/1061186X.2023.2185626
PMID:36847649
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研究论文 | 该文章通过单细胞转录组学研究代谢相关脂肪肝病的微观结构 | 首次通过单细胞分析确定了与NASH相关的差异基因，并识别了潜在的生物标志物 | 未深入探讨生物标志物的具体机制和临床应用 | 旨在识别代谢相关脂肪肝病中的关键基因及其潜在的临床应用 | 主要研究对象是来自正常和脂肪变性小鼠肝脏的单细胞 | 数字病理学 | 肝病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞数据 | 30,038个单细胞 |
| 235 | 2024-08-05 |
Deoxynivalenol induces intestinal injury: insights from oxidative stress and intestinal stem cells
2023-Apr, Environmental science and pollution research international
DOI:10.1007/s11356-023-26084-4
PMID:36856999
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review | 本文探讨了脱氧尼维伦醇对肠道的影响，特别是其在氧化压力和肠道干细胞扩展中的作用 | 提出了脱氧尼维伦醇在诱导氧化应激和影响肠道干细胞扩展中的新见解 | 缺乏具体的实验数据支持所述的机制和方法 | 研究脱氧尼维伦醇对肠道的损伤机制及其对肠道干细胞的影响 | 关注脱氧尼维伦醇对肠道干细胞和氧化压力的影响 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 文献综述 | NA |
| 236 | 2024-08-08 |
Single-cell chemokine receptor profiles delineate the immune contexture of tertiary lymphoid structures in head and neck squamous cell carcinoma
2023-04-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2023.216105
PMID:36841416
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了头颈鳞状细胞癌中47种白细胞亚群，并通过多重免疫组织化学技术描绘了与三级淋巴结构相关的趋化因子受体细胞图谱 | 首次通过单细胞RNA测序和多重免疫组织化学技术详细描绘了头颈鳞状细胞癌中三级淋巴结构的免疫细胞组成和趋化因子受体分布 | NA | 旨在重建头颈鳞状细胞癌中三级淋巴结构的免疫架构，以促进抗肿瘤免疫反应 | 头颈鳞状细胞癌中的三级淋巴结构及其免疫细胞组成 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 47种白细胞亚群 |
| 237 | 2024-08-05 |
Distinct stage-specific transcriptional states of B cells derived from human tonsillar tissue
2023-04-10, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.155199
PMID:36809296
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研究论文 | 本文研究了源自人类扁桃体的B细胞的不同阶段特异性转录状态 | 识别出一种我们认为之前未被描述的表达CCL4/CCL3化学趋化因子的B细胞亚群，并提出了一种基于调控网络推断和伪时间建模的计算方法 | 研究可能仅限于来源于扁桃体的B细胞，对其他组织的B细胞状态缺乏比较 | 探索扁桃体来源B细胞的激活和成熟状态 | 扁桃体来源的B细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 伪时间建模 | NA | NA |
| 238 | 2024-08-05 |
CD11c+ macrophages are proangiogenic and necessary for experimental choroidal neovascularization
2023-04-10, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.168142
PMID:36821388
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研究论文 | 本文研究了CD11c+巨噬细胞在实验性脉络膜新生血管中的促血管生成作用。 | 该研究首次揭示了Spp1+巨噬细胞和CD11c+巨噬细胞的功能特性及其在脉络膜新生血管形成中的重要作用。 | 本文未提及对巨噬细胞异质性研究的临床应用和长期影响的评估。 | 研究CD11c+巨噬细胞在与neovascular AMD相关的脉络膜新生血管中的作用。 | 研究重点是小鼠模型中的免疫细胞和巨噬细胞群体。 | 数字病理学 | 老年性黄斑变性 | 单细胞RNA测序 | 激光诱导脉络膜新生血管模型 | 基因表达数据 | 使用了来自于WT和Ccr2-/-小鼠的免疫细胞样本 |
| 239 | 2024-08-05 |
A miRNA/CXCR4 signaling axis impairs monopoiesis and angiogenesis in diabetic critical limb ischemia
2023-04-10, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.163360
PMID:36821386
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研究论文 | 本研究揭示了miR-181在糖尿病危重肢体缺血中的作用机制 | 探讨了miRNA/CXCR4信号轴在糖尿病患者中对单核细胞生成和血管生成的影响 | 尚需进一步研究以完全理解糖尿病与CLI之间的潜在机制 | 阐明糖尿病危重肢体缺血患者中miR-181的作用及其对单核细胞生成的影响 | 糖尿病患者及其在小鼠模型中的表现 | 数字病理学 | 下肢缺血 | miRNA测序 | 小鼠模型 | 生物样本 | 糖尿病患者的血浆样本和高脂饮食下的miRNA-KO小鼠 |
| 240 | 2024-08-05 |
Establishment of a risk score model for bladder urothelial carcinoma based on energy metabolism-related genes and their relationships with immune infiltration
2023-04, FEBS open bio
IF:2.8Q3
DOI:10.1002/2211-5463.13580
PMID:36814419
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研究论文 | 本文建立了基于能量代谢相关基因的膀胱尿路上皮癌风险评分模型，并探讨其与免疫浸润的关系 | 创新点在于构建了一个风险评分模型，该模型有效关联了能量代谢相关基因与膀胱尿路上皮癌患者的预后及免疫微环境 | 本研究的局限性在于未提供样本的详细 demographic 信息，可能影响模型的广泛适用性 | 研究目的是寻找膀胱尿路上皮癌患者的有效预后生物标志物 | 研究对象为膀胱尿路上皮癌患者及其相关基因信息 | 数字病理学 | 膀胱癌 | RNA测序 | Cox回归分析 | 基因表达数据 | 584个能量代谢相关基因样本 |