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当前共找到 286 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-09-21 |
[Evaluation of peripheral blood T-lymphocyte subpopulations features in patients with hepatitis B virus-related acute-on-chronic liver failure based on single-cell sequencing technology]
2023-Apr-20, Zhonghua gan zang bing za zhi = Zhonghua ganzangbing zazhi = Chinese journal of hepatology
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研究论文 | 该研究基于单细胞RNA测序技术，检测了乙肝病毒相关慢加急性肝衰竭（HBV-ACLF）患者外周血T淋巴细胞的异质性，并分析了耗竭性T淋巴细胞亚群的基因表达特征及其分化轨迹 | 利用单细胞RNA测序技术揭示了HBV-ACLF患者外周血T淋巴细胞存在异质性分化轨迹，并鉴定出以CD4+TIGIT+和CD8+LAG3+为特征的耗竭性T细胞亚群显著增多，提示这些亚群参与ACLF免疫功能障碍 | 样本量较小，仅纳入6例HBV-ACLF患者和3例健康对照，研究结果需在更大规模队列中验证 | 探索HBV-ACLF患者外周血耗竭性T淋巴细胞的特征，为ACLF免疫功能障碍提供潜在治疗靶点分子 | HBV-ACLF患者和健康对照者的外周血T淋巴细胞 | 单细胞组学 | 肝衰竭 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 6例HBV-ACLF患者和3例健康对照的外周血样本 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 2 | 2026-09-21 |
Testing for Phylogenetic Signal in Single-Cell RNA-Seq Data
2023-04, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2022.0357
PMID:36475926
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研究论文 | 该文章首次证明单细胞RNA测序数据包含足够的进化信号，可用于系统发育分析，并通过比较表达水平和单核苷酸变异两种方法重建肿瘤细胞的克隆组成 | 首次证明scRNA-seq数据包含足够的进化信号可用于系统发育分析，并比较了基于表达水平和SNV两种方法在重建系统发育关系中的效果 | scRNA-seq数据存在每细胞低产量和不均匀表达水平的问题，导致测序覆盖度低且不均匀，使得SNV检测和系统发育分析具有挑战性；需要进一步研究来完善和改进这些方法以全面捕捉癌症体细胞进化动态 | 探索单细胞RNA测序数据是否包含足够的进化信号，并比较基于表达水平和SNV两种方法在系统发育分析中的效果，以理解癌症进化动态 | 肿瘤细胞的单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3 | 2026-09-20 |
Single-cell RNA-seq reveals intratumoral heterogeneity in osteosarcoma patients: A review
2023-Apr, Journal of bone oncology
IF:3.1Q2
DOI:10.1016/j.jbo.2023.100475
PMID:37034356
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综述 | 该综述整合分析了来自18个骨肉瘤病灶（原发、复发和转移）的超过15万个单细胞转录组数据，揭示了骨肉瘤肿瘤微环境中的瘤内异质性及不同病灶间独特的细胞群体和基因特征 | 整合了超过15万个细胞、18个不同病灶（原发、复发、转移）的单细胞RNA测序数据，系统性揭示了骨肉瘤瘤内异质性，并比较了不同病灶类型之间的细胞群体和基因表达特征差异 | 本文为综述，未产生新的原始实验数据，其结论依赖于已有研究的综合分析，可能存在数据异质性和整合偏差 | 总结和整合单细胞RNA测序在骨肉瘤研究中的应用，揭示骨肉瘤肿瘤微环境的瘤内异质性，为发现新的生物标志物和治疗靶点提供依据 | 骨肉瘤患者的肿瘤病灶，包括原发、复发和转移性骨肉瘤病灶 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 来自18个骨肉瘤病灶（包括原发、复发和转移）的超过150,000个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4 | 2026-09-13 |
Potential Molecular Mechanisms of Alzheimer's Disease from Genetic Studies
2023-04-15, Biology
DOI:10.3390/biology12040602
PMID:37106802
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综述 | 本文通过叙述性综述分析了基于单细胞测序或空间基因组学的阿尔茨海默病分子机制研究，将分子机制差异归纳为性别特异性、早发性、衰老和免疫系统通路四个主要类别 | 从单细胞测序和空间基因组学研究中系统总结阿尔茨海默病的分子机制，并提出将分子失衡原因分为四大类的新视角 | 采用叙述性综述而非系统综述或荟萃分析，可能缺乏全面性和定量综合 | 识别阿尔茨海默病中分子失衡的常见原因及其潜在机制，为后续研究提供方向 | 阿尔茨海默病相关的分子机制研究 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞测序, 空间基因组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5 | 2026-08-26 |
Matters arising: Insufficient evidence that pancreatic β cells are derived from adult ductal Neurog3-expressing progenitors
2023-04-06, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2023.03.003
PMID:37028408
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研究论文 | 本文对Gribben等人的研究提出质疑，认为其证据不足以证明成年胰腺β细胞来源于导管中的Neurog3表达祖细胞，并通过重新分析指出其使用的Cre品系直接标记了胰岛δ细胞，且存在细胞误分类问题 | 本文通过重新审视已有谱系追踪模型和单细胞RNA测序数据，提出了对成人β细胞起源的替代解释，强调了Cre品系特异性和细胞鉴定准确性在研究中的关键作用 | 未能提供直接的实验证据支持或反驳β细胞来源，主要依赖于对已有数据的重新分析和逻辑推理 | 澄清成年胰腺β细胞是否真正来源于导管细胞中的内分泌祖细胞，以评估其临床相关性 | 成年胰腺中的β细胞、δ细胞以及导管细胞 | 分子生物学, 细胞生物学 | 糖尿病 | 谱系追踪, 单细胞RNA测序, 免疫共定位 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | 研究涉及来自两个谱系追踪模型的小鼠样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium 单细胞3'试剂盒 |
| 6 | 2026-08-23 |
Keystone pathobionts associated with colorectal cancer promote oncogenic reprograming
2023-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.03.535410
PMID:37066368
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究具核梭杆菌和产肠毒素脆弱拟杆菌对结直肠癌小鼠模型及野生型小鼠肠道上皮和免疫的影响，揭示其促进肿瘤发生的机制 | 首次利用单细胞RNA测序解析Fn和ETBF在CRC小鼠模型中对肠上皮细胞亚群及T细胞的具体影响，发现它们可诱导癌症干细胞样瞬时扩增细胞和成熟肠上皮细胞，并破坏CTL细胞毒功能 | 研究基于小鼠模型，可能不完全代表人类CRC微环境的复杂性；未对相关免疫细胞进行全面分析；未涉及人类样本验证 | 阐明Fn和ETBF在结直肠癌发生中通过影响上皮和局部免疫细胞促进肿瘤发生的分子机制 | 肠上皮细胞（特别是瞬时扩增细胞和成熟肠上皮细胞）以及T细胞（包括CTL） | 微生物组, 单细胞转录组学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 小鼠模型（野生型及结直肠癌模型） | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量，涉及野生型小鼠和结直肠癌小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7 | 2026-08-22 |
Novel Candidate Regulators and Developmental Trajectory of Pituitary Thyrotropes
2023-04-17, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/endocr/bqad076
PMID:37183548
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术研究幼年小鼠垂体促甲状腺细胞的发育轨迹和新型调控因子 | 发现促甲状腺细胞与促性腺细胞共表达标志物，并通过体内谱系追踪验证Nr5a1祖细胞产生部分促甲状腺细胞，同时鉴定出新的调控因子如Shox2b和Sox14 | 研究仅基于幼年小鼠（P7）样本，可能无法完全代表成人或病理状态下的促甲状腺细胞 | 阐明垂体干细胞如何分化为促甲状腺细胞，特别是其发育轨迹和新型调控因子 | 幼年小鼠（P7）垂体细胞，重点是促甲状腺细胞及其稀有亚型 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 幼年小鼠（P7）垂体细胞（具体数量未在摘要中提及） | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'基因表达分析 |
| 8 | 2026-08-18 |
Cloning a profibrotic stem cell variant in idiopathic pulmonary fibrosis
2023-04-26, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abp9528
PMID:37099633
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研究论文 | 通过单细胞克隆技术，在特发性肺纤维化（IPF）患者远端肺中鉴定出一种促纤维化干细胞变体，该变体能够转化正常成纤维细胞并激活肌成纤维细胞，且对特定药物敏感 | 首次利用单细胞克隆技术从IPF患者肺中分离出促纤维化干细胞变体，并揭示其与慢性阻塞性肺病中的促纤维化变体不同，为IPF发病机制提供新视角 | 未提供具体局限性信息 | 探讨IPF中肺基底干细胞异质性及其在纤维化发病中的致病作用 | 来自16名IPF患者和10名对照者的远端肺基底干细胞 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单细胞克隆技术 | 不适用 | 单细胞基因表达数据 | 16名IPF患者和10名对照者的肺组织样本 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 9 | 2026-08-18 |
Reconstruction Set Test (RESET): a computationally efficient method for single sample gene set testing based on randomized reduced rank reconstruction error
2023-Apr-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.03.535366
PMID:37066315
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研究论文 | 提出了一种新的单样本基因集检验方法RESET，基于随机化降秩重建误差，能高效检测差异丰度和差异相关模式。 | RESET方法创新性地利用随机化降秩重建算法，能同时检测差异丰度和差异相关模式，解决了现有方法在竞争性场景、组间比较及大数据集计算效率上的局限。 | 摘要未提及具体限制。 | 开发一种计算高效的单样本基因集检验方法，以克服现有技术的局限性。 | 基因集，用于评估样本和数据集层面的基因集重要性。 | 机器学习 | NA | NA | 随机化降秩重建算法 | 基因表达数据（特别是单细胞RNA测序数据） | 使用真实和模拟的单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10 | 2026-08-02 |
Stricturing Crohn's disease single-cell RNA sequencing reveals fibroblast heterogeneity and intercellular interactions
2023-Apr-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.03.534781
PMID:37066202
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建克罗恩病狭窄肠壁的细胞图谱，揭示成纤维细胞异质性及细胞间相互作用，并验证CDH11作为潜在治疗靶点 | 首个严格性克罗恩病全层肠壁的单细胞RNA测序图谱，识别出狭窄特异性成纤维细胞亚群及关键信号网络，并首次验证CDH11在纤维化中的促纤维化功能 | 样本量有限，且功能验证主要依赖体外实验和动物模型，需在更大临床队列中进一步验证 | 通过系统级研究解析克罗恩病狭窄形成中成纤维细胞的异质性和功能，识别新的治疗靶点 | 克罗恩病患者的手术切除肠壁组织（包括非受累、炎症非狭窄和狭窄段）及正常非克罗恩病肠壁组织 | 单细胞转录组学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序、NanoString nCounter、下一代测序、蛋白质组学 | 细胞间相互作用模型 | 单细胞基因表达数据、组织样本、蛋白质组数据 | 13例克罗恩病全层切除组织（99个组织样本，共409,001个细胞）和7例正常非克罗恩病肠段 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11 | 2026-07-03 |
Single-cell profiling reveals immune aberrations in progressive idiopathic pulmonary fibrosis
2023-Apr-29, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2023.04.29.23289296
PMID:37163015
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研究论文 | 该文章通过单细胞RNA测序揭示了特发性肺纤维化（IPF）患者在稳定期和进展期的外周免疫系统变化图谱 | 首次在单细胞分辨率下详细描述IPF患者外周血免疫细胞群的变化，特别是发现经典单核细胞和调节性T细胞（Tregs）增加与疾病进展和预后相关，并揭示了肺-血免疫招募轴 | 摘要未明确提及局限性，但可能包括样本量较小或验证队列有限 | 绘制IPF患者稳定期和进展期的外周免疫系统变化图谱 | 特发性肺纤维化（IPF）患者和对照组的外周血单核细胞（PBMCs） | 单细胞生物信息学 | 特发性肺纤维化（IPF） | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据 | 25名IPF患者和13名匹配对照组，共38个PBMC样本，获得149,564个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 10x Chromium | 10x Chromium 5' 单细胞RNA测序 |
| 12 | 2026-06-19 |
Transcriptomic landscapes of effective and failed liver regeneration in humans
2023-Apr, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2023.100683
PMID:36950091
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research paper | 探索人类肝脏再生过程中有效和失败时的转录组景观 | 首次利用人类生物样本库系统评估肝脏再生早期转录变化，并揭示功能失调再生中DUSP4降低与过度炎症反应的关系，挑战了现有动物模型概念 | 未提及具体限制，但可能包括样本量较小、临床风险因素的模拟模型与人类实际情况的差异 | 系统评估人类肝脏再生过程中的早期转录变化，并探究功能失调肝脏再生中这些过程的差异 | 接受肝切除手术患者的血液和组织样本 | machine learning | 肝脏疾病 | RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间转录组数据 | 154名患者的血液样本和46名患者的术中组织样本，其中21名患者用于RNA测序 | NA | bulk RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 13 | 2026-05-07 |
Piezo inhibition prevents and rescues scarring by targeting the adipocyte to fibroblast transition
2023-Apr-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.03.535302
PMID:37066136
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研究论文 | 本研究通过机械感应机制揭示脂肪细胞转化为瘢痕成纤维细胞的过程，并证明抑制Piezo可防止和逆转瘢痕形成 | 首次证实脂肪细胞在机械力感应下可转化为成纤维细胞驱动瘢痕形成，并发现Piezo抑制即使在已形成的瘢痕中也能诱导再生愈合 | 未明确说明局限性 | 探究脂肪细胞是否通过机械感应参与瘢痕纤维化，并评估Piezo抑制的治疗潜力 | 小鼠伤口模型和人源异种移植伤口模型中的脂肪细胞与成纤维细胞转化 | 数字病理学 | 瘢痕形成 | 单细胞RNA测序、空间转录组学Visium、CODEX多重成像 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据、成像数据 | 小鼠伤口模型和人源异种移植伤口模型 | 10x Genomics, 其他未指定 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 蛋白质组学成像 | 10x Chromium, 10x Visium, CODEX | 10x Chromium用于单细胞RNA测序，10x Visium用于空间转录组学，CODEX用于多重蛋白成像 |
| 14 | 2026-04-11 |
Universal recording of cell-cell contacts in vivo for interaction-based transcriptomics
2023-Apr-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.16.533003
PMID:36993443
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研究论文 | 本文介绍了一种通用版本的LIPSTIC技术（uLIPSTIC），用于在体内记录细胞间物理相互作用，并结合单细胞转录组学分析免疫细胞与非免疫细胞间的互作网络 | 开发了不依赖于特定受体-配体对的通用细胞间接触记录技术，扩展了原LIPSTIC技术的应用范围 | 未明确说明技术灵敏度或可能存在的假阳性/假阴性问题 | 开发通用技术以研究免疫细胞与非免疫细胞间的瞬时物理相互作用 | 免疫细胞（CD8 T细胞、调节性T细胞、滤泡辅助T细胞）与肠道上皮细胞等非免疫细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 15 | 2026-03-06 |
RhoA GEF Mcf2lb regulates rosette integrity during collective cell migration
2023-Apr-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.19.537573
PMID:37131612
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研究论文 | 本研究利用斑马鱼后侧线原基作为模型系统，发现RhoA鸟嘌呤核苷酸交换因子Mcf2lb通过调控顶端收缩来维持集体细胞迁移过程中多细胞玫瑰花结结构的完整性 | 首次鉴定出Mcf2lb作为RhoA特异性GEF在调控多细胞玫瑰花结结构完整性中的关键作用，并揭示了其通过RhoA-Rock-2a-非肌肉肌球蛋白II信号轴调控顶端收缩的分子机制 | 研究主要基于斑马鱼模型系统，在哺乳动物系统中的保守性有待进一步验证；对Mcf2lb调控RhoA活性的具体生化机制尚未深入解析 | 探究多细胞玫瑰花结结构形成和维持的分子调控机制 | 斑马鱼后侧线原基中的多细胞玫瑰花结结构 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序，整体原位杂交，活体成像，3D分析 | NA | 基因表达数据，成像数据 | 斑马鱼后侧线原基细胞群（约150个细胞） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 16 | 2026-03-06 |
Impaired Reorganization of Centrosome Structure Underlies Human Infantile Dilated Cardiomyopathy
2023-04-25, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究首次揭示人类婴儿扩张型心肌病由中心体结构重组缺陷引起，并发现RTTN基因在围产期心脏发育中的新作用 | 首次将中心体缺陷与非综合征性扩张型心肌病联系起来，并发现RTTN基因在心脏发育中的关键作用 | 研究基于单一罕见病例，未来需要更多样本验证；动物模型与人类疾病存在差异 | 探究中心体重组过程在心肌细胞生物学中的作用及其缺陷与人类心脏疾病的关系 | 婴儿扩张型心肌病患者、诱导多能干细胞、斑马鱼、果蝇模型 | 心血管疾病研究 | 扩张型心肌病 | 全外显子组测序、CRISPR/Cas9基因编辑、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、转录组数据、图像数据 | 1名iDCM患者及其父母 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 17 | 2026-03-02 |
Femtosecond laser microdissection for isolation of regenerating C. elegans neurons for single-cell RNA sequencing
2023-04, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-023-01804-3
PMID:36928074
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研究论文 | 本文介绍了一种利用飞秒激光显微切割技术从活体组织中分离特定神经元的方法，用于单细胞RNA测序，以研究线虫神经再生的分子机制 | 开发了飞秒激光显微切割技术，首次实现了从活体线虫组织中精确分离具有特定再生表型的神经元，避免了组织解离引起的转录伪影 | 方法可能受限于激光切割的精度和效率，且在线虫以外的模型中的应用尚未验证 | 研究神经再生的分子机制，实现表型到基因型的映射 | 秀丽隐杆线虫的再生神经元 | 单细胞测序 | 神经再生 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 18 | 2026-01-07 |
A mannitol-based buffer improves single-cell RNA sequencing of high-salt marine cells
2023-Apr-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.26.538465
PMID:37163054
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研究论文 | 本文介绍了一种基于甘露醇的缓冲液（PBS-M），用于改善高盐度海洋生物细胞的单细胞RNA测序质量 | 提出了一种低盐度磷酸盐缓冲液补充D-甘露醇（PBS-M）的方法，能减少细胞死亡和背景mRNA，提高海洋生物单细胞RNA测序的数据质量和细胞状态检测能力 | NA | 改善高盐度海洋生物细胞的单细胞RNA测序兼容性和数据质量 | 海鞘血细胞 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 19 | 2025-11-27 |
Spatially Resolved Transcriptomics Deconvolutes Prognostic Histological Subgroups in Patients with Colorectal Cancer and Synchronous Liver Metastases
2023-04-14, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-2794
PMID:37057593
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术解析结直肠癌肝转移患者预后相关的组织学亚群 | 首次将空间转录组学应用于同步切除的结直肠癌原发灶和肝转移灶，揭示了肿瘤内部和病灶间的异质性及驱动不同表型的转录组程序 | 样本量相对有限，需要更大规模研究验证 | 确定组织学评估在预测结直肠癌肝转移同步切除术后预后的实际应用价值，并探究驱动疾病进展的功能生物学机制 | 接受同步切除的原发性结直肠癌和肝转移患者样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 组织学评估、基因组panel分析、bulk转录组、免疫组化、空间转录组学 | NA | 组织样本、转录组数据、空间转录组数据 | 接受同步切除的结直肠癌肝转移患者样本 | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx | GeoMx空间转录组分析 |
| 20 | 2025-11-12 |
Structural and functional properties of mSWI/SNF chromatin remodeling complexes revealed through single-cell perturbation screens
2023-04-20, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2023.03.013
PMID:37028419
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研究论文 | 通过单细胞扰动筛选揭示mSWI/SNF染色质重塑复合物的结构和功能特性 | 首次结合Perturb-seq、CRISPR-Cas9敲除和单细胞多组学技术系统解析mSWI/SNF亚基功能 | NA | 解析mSWI/SNF染色质重塑复合物各亚基对基因表达的贡献 | 哺乳动物SWI/SNF染色质重塑复合物亚基 | 表观遗传学 | 癌症 | Perturb-seq, CRISPR-Cas9敲除, 单细胞RNA-seq, SHARE-seq | NA | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |