单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 329 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2024-08-08 |
Comprehensive analysis of scRNA-Seq and bulk RNA-Seq reveals dynamic changes in the tumor immune microenvironment of bladder cancer and establishes a prognostic model
2023-03-27, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04056-z
PMID:36973787
|
研究论文 | 本研究结合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序（bulk RNA-seq）数据，构建了膀胱癌（BLCA）的预后模型 | 通过整合scRNA-seq和bulk RNA-seq数据，构建了一个新的预后模型，能够更准确地预测膀胱癌患者的生存情况 | NA | 构建一个预后模型，用于预测膀胱癌患者的生存情况 | 膀胱癌（BLCA）患者的肿瘤免疫微环境 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序（bulk RNA-seq） | Cox比例风险模型，LASSO回归模型 | RNA测序数据 | scRNA-seq数据来自Gene Expression Omnibus（GEO）数据库，bulk RNA-seq数据来自UCSC Xena | NA | NA | NA | NA |
| 162 | 2024-08-05 |
Gene expression in organoids: an expanding horizon
2023-03-25, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-023-00360-2
PMID:36964575
|
综述 | 本文回顾了对类器官进行基因表达研究的最新进展和技术 | 介绍了利用单细胞转录组学和染色质可及性分析等最新多组学技术来研究类器官 | 类器官培养和处理的复杂性和异质性带来了挑战 | 探讨类器官作为发育模型和精准医学平台的研究 | 人体来源的多种组织衍生的类器官 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞转录组学和染色质可及性分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 163 | 2024-08-05 |
Cuproptosis correlates with immunosuppressive tumor microenvironment based on pan-cancer multiomics and single-cell sequencing analysis
2023-03-24, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-023-01752-8
PMID:36959665
|
研究论文 | 本研究分析了cuproptosis在全癌症中的表达差异及其与肿瘤微环境的关系 | 首次系统性地揭示了cuproptosis相关基因在不同肿瘤中的表达和突变情况，及其与免疫逃逸的相关性 | 目前的研究还未能全面解析cuproptosis在肿瘤发生和发展的具体机制 | 探讨cuproptosis在肿瘤发生、进展及预后中的作用 | 研究对象为不同类型癌症中的cuproptosis相关基因及其表达情况 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞转录组测序 (scRNA-seq), 单样本基因集富集分析 (ssGSEA), 免疫组化 (IHC) | NA | 基因组数据 | 涉及多种肿瘤类型，具体样本数量未明确说明 | NA | NA | NA | NA |
| 164 | 2024-08-08 |
MicroRNA-223 Dampens Pulmonary Inflammation during Pneumococcal Pneumonia
2023-03-21, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12060959
PMID:36980300
|
研究论文 | 研究微小RNA-223在肺炎链球菌性肺炎中调节肺部炎症的作用 | 首次探讨了微小RNA-223在肺炎链球菌性肺炎中的作用，并揭示了其在调节中性粒细胞相关炎症反应中的关键角色 | 研究主要基于小鼠模型和肺炎患者的血清样本，可能需要进一步的人体临床试验验证 | 理解微小RNA-223在肺炎链球菌性肺炎中调节肺部炎症的作用 | 肺炎链球菌性肺炎患者和小鼠模型 | NA | 肺部疾病 | 微小RNA测定，单细胞转录组分析 | NA | 血清，肺组织 | 包括肺炎患者和健康个体的血清样本，以及野生型和微小RNA-223敲除小鼠的肺组织 | NA | NA | NA | NA |
| 165 | 2024-08-05 |
Current Status and Prospects of the Single-Cell Sequencing Technologies for Revealing the Pathogenesis of Pregnancy-Associated Disorders
2023-03-20, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes14030756
PMID:36981026
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序在分析正常妊娠和妊娠并发症中的应用 | 该文章讨论了单细胞RNA测序在研究妊娠相关疾病发病机制中的应用和潜力 | 文章中提到单细胞技术和数据分析方法的主要原则、优势和局限性 | 研究与妊娠相关疾病的发病机制及其基因表达变化 | 各种细胞类型及其在妊娠和妊娠并发症中的基因表达变化 | 数字病理学 | 妊娠相关疾病 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 166 | 2024-08-08 |
Integrating Multiple Single-Cell RNA Sequencing Datasets Using Adversarial Autoencoders
2023-Mar-13, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24065502
PMID:36982574
|
研究论文 | 本文提出了一种名为IMAAE的新型深度学习模型，用于整合多个单细胞RNA测序数据集并校正批次效应 | IMAAE模型利用对抗自编码器来更好地利用已知标签，提高了批次校正方法的性能，特别是在多细胞类型的情况下 | NA | 旨在改进单细胞RNA测序数据集的整合和批次效应校正 | 单细胞RNA测序数据集 | 机器学习 | NA | RNA测序 | 对抗自编码器 | 基因表达数据 | 多个数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 167 | 2024-08-08 |
Novel Potential Markers of Myofibroblast Differentiation Revealed by Single-Cell RNA Sequencing Analysis of Mesenchymal Stromal Cells in Profibrotic and Adipogenic Conditions
2023-Mar-10, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines11030840
PMID:36979822
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析，揭示了在促纤维化和脂肪生成条件下间充质基质细胞向肌成纤维细胞分化的潜在标记物 | 首次展示了神经调节蛋白（NTM）在人类脂肪组织间充质基质细胞中的表达，并证明了其在肌成纤维细胞分化刺激下的基因表达增加和膜受体聚集 | 需要进一步验证通过组学方法获得的数据，如发现RDH10的检测结果与转录组分析数据相矛盾 | 测试多能细胞向肌成纤维细胞和脂肪细胞分化过程中基因表达模式的激活假设 | 人类脂肪组织间充质基质细胞在肌成纤维细胞或脂肪生成分化刺激后的单细胞RNA测序转录组 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 168 | 2024-08-08 |
New Insights into the Role of Synovial Fibroblasts Leading to Joint Destruction in Rheumatoid Arthritis
2023-Mar-08, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24065173
PMID:36982247
|
综述 | 本文综述了类风湿性关节炎中滑膜成纤维细胞在关节破坏中的关键作用及其与免疫细胞的相互作用 | 采用单细胞RNA测序等新技术揭示了滑膜成纤维细胞的异质性及其在类风湿性关节炎中的作用 | NA | 探讨滑膜成纤维细胞在类风湿性关节炎关节破坏中的作用及其与免疫细胞的相互作用 | 滑膜成纤维细胞及其在类风湿性关节炎中的作用 | NA | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 169 | 2024-08-08 |
Parallel Dysregulated Immune Response in Severe Forms of COVID-19 and Bacterial Sepsis via Single-Cell Transcriptome Sequencing
2023-Mar-03, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines11030778
PMID:36979757
|
研究论文 | 本文通过单细胞转录组测序技术，研究了COVID-19和细菌性脓毒症重症患者的免疫反应失调情况 | 发现了COVID-19和细菌性脓毒症重症患者在免疫反应上的相似性，并揭示了轻症和重症之间的基因表达差异 | NA | 旨在理解严重感染性疾病（如重症COVID-19或细菌性脓毒症休克）中的免疫机制，以更好地理解患者的临床轨迹和潜在治疗的成功 | COVID-19和细菌性脓毒症的重症患者 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 170 | 2024-08-05 |
Spatiotemporally deciphering the mysterious mechanism of persistent HPV-induced malignant transition and immune remodelling from HPV-infected normal cervix, precancer to cervical cancer: Integrating single-cell RNA-sequencing and spatial transcriptome
2023-03, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1219
PMID:36967539
|
研究论文 | 本研究首次剖析了人乳头瘤病毒（HPV）感染引起的宫颈癌变的时空机制 | 首次构建了HPV相关宫颈癌发生过程的时空图谱，并发现了三种独特的HPV相关上皮细胞群体及关键节点基因 | 样本量相对较小，仅包括九个患者样本，可能限制了研究结果的普适性 | 揭示持久HPV感染导致的宫颈癌发生机制及免疫重塑过程 | 来自正常宫颈、前体病变及宫颈癌的HPV感染患者样本 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序和空间转录组 | NA | 基因表达谱 | 九个患者样本，包括两例HPV阴性正常，两例HPV阳性正常，两例HPV阳性高等级鳞状上皮内病变（HSIL）和三例HPV阳性癌症样本 | NA | NA | NA | NA |
| 171 | 2024-08-05 |
AllenDigger, a Tool for Spatial Expression Data Visualization, Spatial Heterogeneity Delineation, and Single-Cell Registration Based on the Allen Brain Atlas
2023-Mar-30, The journal of physical chemistry. A
DOI:10.1021/acs.jpca.3c00145
PMID:36926884
|
研究论文 | 本文介绍了一种用于空间基因表达数据可视化和单细胞注册的工具AllenDigger | 开发了一个工具包，可以方便地收集和预处理来自Allen脑图谱的表达数据，并允许可视化和表征大脑的空间异质性 | 本文讨论了一些技术挑战和尚不成熟的数据分析方法 | 研究空间转录组学在生物学中的应用，特别是大脑的空间基因表达 | 研究对象为小鼠大脑在不同发育阶段的基因表达数据 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 机器学习方法 | 图像 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 172 | 2024-08-05 |
YBX1 integration of oncogenic PI3K/mTOR signalling regulates the fitness of malignant epithelial cells
2023-03-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-37161-0
PMID:36949044
|
研究论文 | 该文章分析了头颈癌中的YBX1与PI3K/mTOR信号通路的关系，对恶性上皮细胞的适应性进行了研究 | 文章首次揭示YBX1如何在不同亚型的头颈癌中调节细胞增殖和转移机制 | 缺乏临床治疗实验验证YBX1作为预后标志物的敏感性 | 研究YBX1集成致癌PI3K/mTOR信号传导如何影响恶性上皮细胞的适应性 | 头颈癌患者的单细胞序列和蛋白组学数据 | 数字病理学 | 头颈癌 | 单细胞测序 | NA | 蛋白组学数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 173 | 2024-08-05 |
Localized microglia dysregulation impairs central nervous system myelination in development
2023-03-22, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-023-01543-8
PMID:36949514
|
研究论文 | 这篇文章探讨了局部小胶质细胞失调如何影响中枢神经系统的髓鞘形成。 | 揭示了小胶质细胞与成熟少突胶质细胞之间相互作用及干扰素信号在调节人脑发育髓鞘形成中的重要性 | 未详细探讨其他可能影响髓鞘形成的细胞类型和机制 | 研究人类发育髓鞘形成的细胞和分子机制 | 人类发育中的白质 | 数字病理学 | NA | 数字空间转录组学 | NA | NA | 稀有的人类发育白质样本 | NA | NA | NA | NA |
| 174 | 2024-08-08 |
Identification of diagnostic molecules and potential therapeutic agents for atopic dermatitis by single-cell RNA sequencing combined with a systematic computing framework that integrates network pharmacology
2023-Mar-22, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-023-01005-3
PMID:36944896
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序结合系统计算框架，识别了特应性皮炎的诊断分子和潜在治疗药物 | 结合单细胞RNA测序和网络药理学的系统计算框架，为特应性皮炎的诊断和治疗提供了新的方法 | NA | 深入理解特应性皮炎的病理生物学和分子调控机制，开发更好的治疗方法 | 特应性皮炎的细胞类型、相关基因及潜在治疗药物 | 生物信息学 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 包括来自GSE180885的单细胞RNA测序数据和GSE193309的批量RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 175 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomic analysis of normal and pathological tissues from the same patient uncovers colon cancer progression
2023-Mar-21, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-023-01002-w
PMID:36944972
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了同一患者正常和病理组织中结肠癌的进展轨迹 | 揭示了结肠癌进展过程中的细胞演变轨迹和新的相关基因 | 研究仅基于单一患者的样本，可能无法广泛适用于所有患者 | 阐明正常结肠细胞向腺瘤和癌症的演变轨迹 | 正常结肠、腺瘤和癌症组织的单细胞分析 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞测序 | NA | 组织样本 | 同一患者的正常、腺瘤和癌症组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 176 | 2024-08-05 |
The short isoform of MS4A7 is a novel player in glioblastoma microenvironment, M2 macrophage polarization, and tumor progression
2023-Mar-21, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-023-02766-1
PMID:36944954
|
研究论文 | 研究表明MS4A7-s在胶质母细胞瘤微环境中发挥重要作用，并影响M2巨噬细胞的极化和肿瘤进展 | 首次发现短异构体MS4A7-s在胶质母细胞瘤中对M2特异性巨噬细胞的影响，揭示其作为预后标志物的潜力 | 研究主要集中在细胞和动物模型，而不包括临床试验数据 | 探索胶质母细胞瘤微环境中的功能性膜蛋白异构体及其对巨噬细胞极化的影响 | 胶质母细胞瘤患者样本中的短异构体MS4A7-s | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA-seq和RNA-seq | NA | 临床样本 | 胶质母细胞瘤患者队列 | NA | NA | NA | NA |
| 177 | 2024-08-05 |
Use of machine learning-based integration to develop a monocyte differentiation-related signature for improving prognosis in patients with sepsis
2023-03-20, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-023-00634-5
PMID:36941583
|
研究论文 | 本研究利用机器学习整合开发出与单核细胞分化相关的标志物以改善脓毒症患者的预后 | 文章创新性在于构建了基于单核细胞分化相关基因的预后标志物，并使用多种机器学习组合进行 prognostic 签名构建 | 临床验证样本数量较少，可能影响结果的普适性和准确性 | 旨在改善脓毒症患者的早期诊断和预后 | 研究对象为 12 名脓毒症患者的单细胞测序数据 | 机器学习 | 脓毒症 | 单细胞测序 | Lasso + CoxBoost | 细胞数据 | 共 52 个样本，包括 12 名患者的单细胞数据和 40 个临床样本 | NA | NA | NA | NA |
| 178 | 2024-08-05 |
Robust classification using average correlations as features (ACF)
2023-Mar-20, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-023-05224-0
PMID:36941542
|
研究论文 | 本研究提出了一种通过平均相关性作为特征的分类方法，以应对单细胞转录组学中的缺失值问题 | 提出了一种新的分类方法ACF，通过训练可调的机器学习模型在类间和类内相关性上进行分类，超越了现有的KNN和基于分布的分类方法 | 未提及具体的局限性 | 研究如何利用平均相关性处理单细胞转录组及其他组学技术中的缺失值 | 主要对象是单细胞RNA测序和自下而上的蛋白质组学产生的真实数据集 | 机器学习 | NA | NA | KNN | 数据集 | 使用了真实数据集，但具体样本大小未明示 | NA | NA | NA | NA |
| 179 | 2024-08-08 |
Application of single-cell RNA sequencing in probing oligodendroglia heterogeneity and neurological disorders
2023-Mar-20, Yi chuan = Hereditas
DOI:10.16288/j.yczz.22-306
PMID:36927646
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在探究少突胶质细胞异质性和神经疾病中的应用 | 介绍了单细胞RNA测序技术作为一种新工具，用于在转录组水平上特异性地识别细胞类型，并探讨其在少突胶质细胞谱系相关问题中的应用 | NA | 总结单细胞RNA测序技术的最新进展及其在少突胶质细胞异质性和神经疾病中的应用 | 少突胶质细胞及其在神经疾病中的作用 | 数字病理学 | 神经疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 180 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic analysis of tumor heterogeneity and intercellular networks in human urothelial carcinoma
2023-Mar-20, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000002573
PMID:36939254
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了人类尿路上皮癌中的肿瘤异质性和细胞间网络 | 本研究首次详细描述了尿路上皮癌中肿瘤细胞和肿瘤微环境的异质性，并揭示了其对治疗反应的影响 | 研究样本仅限于七名患者，可能限制了结果的普遍性 | 旨在深入理解尿路上皮癌中的肿瘤内异质性和免疫抑制性肿瘤微环境，并为开发新型治疗提供基础支持 | 尿路上皮癌患者的肿瘤组织及其匹配的正常组织 | 数字病理学 | 尿路上皮癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 七名尿路上皮癌患者及其肿瘤组织和匹配的正常组织 | NA | NA | NA | NA |