单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 329 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2024-08-05 |
Single-cell analysis of peripheral blood from high-altitude pulmonary hypertension patients identifies a distinct monocyte phenotype
2023-03-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-37527-4
PMID:37002243
|
研究论文 | 本文通过单细胞转录组学分析高海拔肺动脉高压患者的外周血，识别出一种独特的单核细胞表型 | 发现高海拔肺动脉高压患者外周血单核细胞的特定亚群体及其与缺氧诱导转录因子-1α的下调相关 | 关于其他免疫细胞类型的具体影响和机制尚未深入研究 | 探讨高海拔肺动脉高压患者外周循环中的免疫谱系 | 高海拔肺动脉高压患者的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞转录组学 | NA | 外周血单核细胞 | HAPH患者的外周血单核细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 142 | 2024-08-05 |
SMASH: Scalable Method for Analyzing Spatial Heterogeneity of genes in spatial transcriptomics data
2023-Mar-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.23.533980
PMID:36993287
|
研究论文 | 本研究提出了一种名为SMASH的方法，用于分析空间转录组数据中的基因空间异质性 | SMASH是一种非参数方法，在计算需求和统计能力之间取得平衡，克服了现有方法的局限 | 未提及具体的局限性 | 旨在识别与细胞/点的空间位置变化相关的空间变异基因 | 采用不同平台的四个空间转录组数据集进行研究 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 非参数方法 | 基因表达数据 | 四个不同平台的空间转录组数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 143 | 2024-08-08 |
Reprogramming anchorage dependency by adherent-to-suspension transition promotes metastatic dissemination
2023-03-30, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-023-01753-7
PMID:36991428
|
研究论文 | 本文研究了通过粘附到悬浮转变（AST）机制重新编程固体肿瘤细胞的锚定依赖性，促进肿瘤细胞的转移扩散 | 发现了一种生物现象AST，通过特定的造血转录调节因子将粘附细胞重新编程为悬浮细胞，这一机制被固体肿瘤细胞利用以扩散成循环肿瘤细胞（CTCs） | NA | 探索肿瘤细胞转移扩散过程中锚定依赖性的重新编程机制 | 乳腺癌和黑色素瘤的小鼠异种移植模型及新发转移患者的原发肿瘤、CTCs和转移瘤样本 | 数字病理学 | 乳腺癌, 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）, 组织染色 | NA | RNA | 乳腺癌和黑色素瘤的小鼠异种移植模型及新发转移患者的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 144 | 2024-08-08 |
Clinical and biological heterogeneities in triple-negative breast cancer reveals a non-negligible role of HER2-low
2023-03-30, Breast cancer research : BCR
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s13058-023-01639-y
PMID:36998014
|
研究论文 | 本研究探讨了HER2-low在三阴性乳腺癌（TNBC）中的临床和生物学特性 | 首次详细比较了HER2-low和HER2-negative TNBC在临床特征和肿瘤生物学特性上的差异 | 研究样本量相对较小，可能影响结果的普遍性 | 探究HER2-low在三阴性乳腺癌中的临床和生物学影响 | 251名三阴性乳腺癌患者，包括157名HER2-low和94名HER2-negative患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 251名患者，其中157名HER2-low和94名HER2-negative | NA | NA | NA | NA |
| 145 | 2024-08-08 |
Understanding host response to infectious salmon anaemia virus in an Atlantic salmon cell line using single-cell RNA sequencing
2023-Mar-29, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-023-09254-z
PMID:36991327
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了大西洋鲑鱼细胞系在感染传染性鲑鱼贫血病毒（ISAV）后的转录组变化 | 首次使用单细胞RNA测序技术深入研究了ISAV感染早期阶段的宿主-病毒相互作用 | NA | 深入理解大西洋鲑鱼在ISAV感染期间的细胞反应和宿主-病毒相互作用 | 大西洋鲑鱼细胞系在ISAV感染后的转录组变化 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用了鲑鱼头部肾脏（SHK-1）细胞在ISAV感染后24小时、48小时和96小时的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 146 | 2024-08-08 |
Supervised learning of high-confidence phenotypic subpopulations from single-cell data
2023-Mar-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.23.533712
PMID:36993424
|
研究论文 | 开发了一种名为PENCIL的监督学习框架，用于从单细胞数据中识别与表型相关的亚群 | 首次在框架中嵌入特征选择功能，实现同时选择信息特征和识别细胞亚群，提高了表型亚群识别的准确性 | NA | 准确识别从异质细胞群中与表型相关的细胞亚群，揭示驱动生物或临床表型的潜在机制 | 单细胞数据中的细胞亚群 | 机器学习 | NA | 监督学习 | PENCIL框架 | 单细胞数据 | 分析了100万个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 147 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics of adult skin VE-cadherin expressing lineages during hair cycle
2023-Mar-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.22.533784
PMID:36993228
|
研究论文 | 本研究揭示了在毛发生长周期中成体皮肤内表现VE-钙粘附蛋白的细胞的单细胞转录组学变化 | 该研究首次通过单细胞RNA测序技术深入分析了皮肤内VE-钙粘附蛋白表达细胞在毛发生长周期各阶段的动态 | 研究只涉及了小鼠模型，结果可能在其他物种中不完全适用 | 探讨成体皮肤内血管内皮系细胞在毛发生长周期中的动态变化 | 主要研究表现VE-钙粘附蛋白的内皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | FACS分选的VE-钙粘附蛋白表达细胞（确切样本量未提供） | NA | NA | NA | NA |
| 148 | 2024-08-08 |
An evaluation of statistical differential analysis methods in single-cell RNA-seq data
2023-Mar-23, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2670717/v1
PMID:36993457
|
研究论文 | 本文评估了五种开源流行方法在单细胞RNA测序数据中进行基因差异表达分析的性能 | 本文通过模拟研究和真实数据示例，评估了五种方法在不同样本大小、分布假设和数据中零比例下的表现 | NA | 评估单细胞RNA测序数据中基因差异表达分析方法的性能 | 单细胞RNA测序数据中的基因差异表达分析方法 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 不同样本大小，包括每组100个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 149 | 2024-08-08 |
HIV-1 Vpr combats the PU.1-driven antiviral response in primary human macrophages
2023-Mar-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.21.533528
PMID:36993393
|
研究论文 | 研究探讨了HIV-1辅助蛋白Vpr在人类原代巨噬细胞中对抗PU.1驱动的抗病毒反应的作用 | 发现Vpr通过靶向主转录调节因子PU.1，重编程HIV感染的巨噬细胞基因表达，并揭示了Vpr在非旁观者巨噬细胞中通过PU.1非依赖机制对抗HIV感染的固有免疫反应 | 未观察到PU.1对HIV基因转录的直接影响 | 阐明Vpr在HIV感染原代巨噬细胞中的作用 | HIV-1辅助蛋白Vpr和PU.1在HIV感染中的作用 | NA | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 原代人类巨噬细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 150 | 2024-08-05 |
Cis-regulatory control of transcriptional timing and noise in response to estrogen
2023-Mar-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.14.532457
PMID:36993565
|
研究论文 | 该文章探讨了顺式调控元件如何影响转录时间和噪声 | 研究揭示了影响转录特点的调控蛋白和表观遗传特征的组合 | 对不同转录特征控制所需的全貌尚未完全理解 | 确定与雌激素处理相关的转录时序和噪声的基因组预测因子 | 涉及雌激素处理条件下的单细胞RNA测序结果 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因组表达数据 | 在雌激素处理的时间过程中进行了单细胞分析 | NA | NA | NA | NA |
| 151 | 2024-08-08 |
CTLA-4 tail fusion enhances CAR-T anti-tumor immunity
2023-Mar-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.14.532655
PMID:36993364
|
研究论文 | 本文通过利用细胞毒性T淋巴细胞相关抗原-4（CTLA-4）细胞质尾（CT）的内吞特性，重新编程嵌合抗原受体（CAR）功能，显著增强了CAR-T细胞的疗效 | 通过将CTLA-4 CT融合到CAR的C端，实现了CAR-T细胞的渐进性细胞毒性增加，同时减少了激活和促炎细胞因子的产生 | NA | 探索通过合成CTLA-4 CT融合来改进CAR-T细胞功能的新策略 | 嵌合抗原受体T细胞（CAR-T）及其在肿瘤治疗中的应用 | 生物技术 | 白血病 | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 152 | 2024-08-05 |
Analysis of RNA processing directly from spatial transcriptomics data reveals previously unknown regulation
2023-Mar-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.13.532412
PMID:36993757
|
研究论文 | 本研究直接分析了空间转录组数据中的RNA处理，揭示了之前未知的调节机制 | 首次将ReadZS和SpliZ方法应用于空间转录组数据，以分析RNA处理的空间定位 | 主要集中在小鼠的大脑和肾脏数据，可能无法代表其他组织类型 | 研究空间转录组数据中的RNA处理及其空间调节机制 | 使用小鼠脑和肾脏样本中的RNA数据进行分析 | 数字病理学 | NA | 空间转录组 | NA | RNA数据 | 小鼠脑和肾脏样本 | NA | NA | NA | NA |
| 153 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome profiling of the vaginal epithelium reveals the heterogeneity of suprabasal cells
2023-Mar, Precision clinical medicine
IF:5.1Q1
DOI:10.1093/pcmedi/pbad006
PMID:37007744
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 154 | 2024-08-08 |
A transcriptomic pan-cancer signature for survival prognostication and prediction of immunotherapy response based on endothelial senescence
2023-Mar-28, Journal of biomedical science
IF:9.0Q1
DOI:10.1186/s12929-023-00915-5
PMID:36978029
|
研究论文 | 本文基于内皮细胞衰老，开发了一种泛癌转录组标志物，用于生存预测和免疫治疗反应预测 | 首次提出基于内皮细胞衰老的泛癌转录组标志物，用于提高生存预测和免疫治疗反应预测的准确性 | NA | 开发一种新的生物标志物，用于精准肿瘤学中的生存预测和免疫治疗反应预测 | 内皮细胞衰老及其在多种癌症中的转录组特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 转录组数据 | 多种癌症实体的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 155 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome analysis and in vitro differentiation of testicular cells reveal novel insights into male sterility of the interspecific hybrid cattle-yak
2023-Mar-27, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-023-09251-2
PMID:36973659
|
研究论文 | 这篇文章通过单细胞转录组分析和体外分化研究了牦牛-牛杂交动物的雄性不育新见解 | 研究表明除了减数分裂停滞外，未分化精原细胞的分化阶段以及其微环境也可能导致雄性杂交不育 | 对雄性生殖细胞的细胞特性和发育潜力的系统研究仍然不够 | 探讨牦牛-牛杂交动物雄性不育的细胞特性及其发育潜力 | 牦牛-牛杂交动物和牦牛的青春期睾丸生殖细胞及其微环境 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 牦牛-牛杂交动物和牦牛的青春期睾丸细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 156 | 2024-08-08 |
An integrated single-cell transcriptomic dataset for non-small cell lung cancer
2023-03-27, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-023-02074-6
PMID:36973297
|
研究论文 | 本文介绍了一个包含224,611个细胞的大型综合单细胞转录组数据集，用于研究人类原发性非小细胞肺癌（NSCLC）肿瘤的细胞异质性。 | 该研究通过锚定方法整合了七个独立的单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据集，并创建了基于跨数据集细胞类型特异性标记的两级注释，以提高数据的可重用性。 | NA | 旨在提供一个资源，用于在单细胞水平上研究非小细胞肺癌的转录组。 | 人类原发性非小细胞肺癌肿瘤的细胞。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 224,611个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 157 | 2024-08-08 |
Comprehensive analysis of scRNA-Seq and bulk RNA-Seq reveals dynamic changes in the tumor immune microenvironment of bladder cancer and establishes a prognostic model
2023-03-27, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04056-z
PMID:36973787
|
研究论文 | 本研究结合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序（bulk RNA-seq）数据，构建了膀胱癌（BLCA）的预后模型 | 通过整合scRNA-seq和bulk RNA-seq数据，构建了一个新的预后模型，能够更准确地预测膀胱癌患者的生存情况 | NA | 构建一个预后模型，用于预测膀胱癌患者的生存情况 | 膀胱癌（BLCA）患者的肿瘤免疫微环境 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序（bulk RNA-seq） | Cox比例风险模型，LASSO回归模型 | RNA测序数据 | scRNA-seq数据来自Gene Expression Omnibus（GEO）数据库，bulk RNA-seq数据来自UCSC Xena | NA | NA | NA | NA |
| 158 | 2024-08-05 |
Gene expression in organoids: an expanding horizon
2023-03-25, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-023-00360-2
PMID:36964575
|
综述 | 本文回顾了对类器官进行基因表达研究的最新进展和技术 | 介绍了利用单细胞转录组学和染色质可及性分析等最新多组学技术来研究类器官 | 类器官培养和处理的复杂性和异质性带来了挑战 | 探讨类器官作为发育模型和精准医学平台的研究 | 人体来源的多种组织衍生的类器官 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞转录组学和染色质可及性分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 159 | 2024-08-05 |
Cuproptosis correlates with immunosuppressive tumor microenvironment based on pan-cancer multiomics and single-cell sequencing analysis
2023-03-24, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-023-01752-8
PMID:36959665
|
研究论文 | 本研究分析了cuproptosis在全癌症中的表达差异及其与肿瘤微环境的关系 | 首次系统性地揭示了cuproptosis相关基因在不同肿瘤中的表达和突变情况，及其与免疫逃逸的相关性 | 目前的研究还未能全面解析cuproptosis在肿瘤发生和发展的具体机制 | 探讨cuproptosis在肿瘤发生、进展及预后中的作用 | 研究对象为不同类型癌症中的cuproptosis相关基因及其表达情况 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞转录组测序 (scRNA-seq), 单样本基因集富集分析 (ssGSEA), 免疫组化 (IHC) | NA | 基因组数据 | 涉及多种肿瘤类型，具体样本数量未明确说明 | NA | NA | NA | NA |
| 160 | 2024-08-08 |
MicroRNA-223 Dampens Pulmonary Inflammation during Pneumococcal Pneumonia
2023-03-21, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12060959
PMID:36980300
|
研究论文 | 研究微小RNA-223在肺炎链球菌性肺炎中调节肺部炎症的作用 | 首次探讨了微小RNA-223在肺炎链球菌性肺炎中的作用，并揭示了其在调节中性粒细胞相关炎症反应中的关键角色 | 研究主要基于小鼠模型和肺炎患者的血清样本，可能需要进一步的人体临床试验验证 | 理解微小RNA-223在肺炎链球菌性肺炎中调节肺部炎症的作用 | 肺炎链球菌性肺炎患者和小鼠模型 | NA | 肺部疾病 | 微小RNA测定，单细胞转录组分析 | NA | 血清，肺组织 | 包括肺炎患者和健康个体的血清样本，以及野生型和微小RNA-223敲除小鼠的肺组织 | NA | NA | NA | NA |