单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 329 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2024-08-05 |
Epi-Impute: Single-Cell RNA-seq Imputation via Integration with Single-Cell ATAC-seq
2023-Mar-25, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24076229
PMID:37047200
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为Epi-Impute的计算方法，用于通过整合表达和编程组学数据来解决单细胞RNA-seq数据中的丢失现象 | Epi-Impute利用单细胞ATAC-seq数据作为额外的信息来源，以减少丢失现象的数量，特别适用于稀疏的单细胞RNA-seq数据集 | NA | 提出一种新的方法来改进单细胞RNA-seq数据的缺失值填补 | 单细胞RNA-seq数据和单细胞ATAC-seq数据 | 数字病理学 | NA | NA | NA | RNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 142 | 2024-08-08 |
ERS International Congress 2022: highlights from the Basic and Translational Science Assembly
2023-Mar, ERJ open research
IF:4.3Q1
DOI:10.1183/23120541.00561-2022
PMID:37077558
|
综述 | 本文综述了2022年欧洲呼吸学会国际大会中基础与转化科学会议的亮点内容 | 提出了人类肺细胞图谱(HLCA)作为健康人类肺部的新参考点，并结合单细胞RNA测序和空间数据，发现了新的细胞类型/状态和生态位 | NA | 探讨呼吸事件从出生到老年对气候变化相关空气质量变化的影响，以及转化研究中确定的哮喘新治疗靶点和免疫调节机制 | 呼吸事件、气候变化、空气质量、肺部疾病、哮喘治疗 | 数字病理学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 空间数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 143 | 2024-08-08 |
Sox11 is enriched in myogenic progenitors but dispensable for development and regeneration of skeletal muscle
2023-Mar-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.30.534956
PMID:37034612
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序数据分析，探讨了转录因子Sox11在肌肉干细胞分化和功能中的作用 | 发现Sox11在肌肉干细胞分化过程中表达增加，但在静止和衰老的肌肉干细胞中表达减少 | Sox11在肌肉发生中的具体功能尚未明确 | 研究Sox11在肌肉干细胞分化和肌肉再生中的作用 | 肌肉干细胞（MuSCs）及其在骨骼肌发育和再生中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 年轻和老年小鼠的肌肉再生样本 | NA | NA | NA | NA |
| 144 | 2024-08-08 |
Endothelial cells are a key target of IFN-g during response to combined PD-1/CTLA-4 ICB treatment in a mouse model of bladder cancer
2023-Mar-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.28.534561
PMID:37034778
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探索了在小鼠膀胱癌模型中，联合PD-1/CTLA-4免疫检查点阻断治疗对不同细胞类型的响应机制 | 首次揭示了内皮细胞在IFN-γ信号传导中作为ICB治疗响应的关键介质 | NA | 探索联合PD-1/CTLA-4免疫检查点阻断治疗在个体细胞类型中的响应机制 | 小鼠膀胱癌模型中的内皮细胞 | 数字病理学 | 膀胱癌 | scRNA-seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | 包含三种条件：未治疗的肿瘤、治疗的肿瘤和CD4+ T细胞耗竭后治疗的肿瘤 | NA | NA | NA | NA |
| 145 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome dataset of human and mouse in vitro adipogenesis models
2023-Mar-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.27.534456
PMID:37034809
|
研究论文 | 本文介绍了人类和小鼠体外脂肪形成模型的单细胞转录组数据集，通过单细胞RNA测序（scRNA-Seq）分析了3T3-L1和SGBS细胞在脂肪形成前后的转录变化。 | 首次提供了3T3-L1和SGBS细胞在脂肪形成过程中的单细胞转录组数据，有助于理解细胞间基因表达的变异性。 | NA | 研究人类和小鼠体外脂肪形成过程中的分子调控和细胞间基因表达的变异性。 | 3T3-L1和SGBS细胞在脂肪形成前后的转录变化。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 转录组数据 | 混合的3T3-L1和SGBS细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 146 | 2024-08-05 |
Single-Cell Sequencing-Based Validation of T Cell-Associated Diagnostic Model Genes and Drug Response in Crohn's Disease
2023-Mar-23, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24076054
PMID:37047025
|
研究论文 | 该研究旨在通过单细胞测序验证与T细胞相关的克罗恩病诊断模型基因及其药物反应 | 首次将单细胞表达谱数据与T细胞标记基因的诊断与药物反应相结合 | 样本数量较少，可能影响研究结果的广泛适用性 | 进一步探索克罗恩病的诊断及T细胞标记基因表达的药物预测 | 22例克罗恩病或正常样本的单细胞表达谱数据 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞测序 | TNF中心的5基因诊断模型 | 单细胞表达谱数据 | 22个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 147 | 2024-08-05 |
Single-cell analysis of peripheral blood from high-altitude pulmonary hypertension patients identifies a distinct monocyte phenotype
2023-03-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-37527-4
PMID:37002243
|
研究论文 | 本文通过单细胞转录组学分析高海拔肺动脉高压患者的外周血，识别出一种独特的单核细胞表型 | 发现高海拔肺动脉高压患者外周血单核细胞的特定亚群体及其与缺氧诱导转录因子-1α的下调相关 | 关于其他免疫细胞类型的具体影响和机制尚未深入研究 | 探讨高海拔肺动脉高压患者外周循环中的免疫谱系 | 高海拔肺动脉高压患者的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞转录组学 | NA | 外周血单核细胞 | HAPH患者的外周血单核细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 148 | 2024-08-08 |
Reprogramming anchorage dependency by adherent-to-suspension transition promotes metastatic dissemination
2023-03-30, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-023-01753-7
PMID:36991428
|
研究论文 | 本文研究了通过粘附到悬浮转变（AST）机制重新编程固体肿瘤细胞的锚定依赖性，促进肿瘤细胞的转移扩散 | 发现了一种生物现象AST，通过特定的造血转录调节因子将粘附细胞重新编程为悬浮细胞，这一机制被固体肿瘤细胞利用以扩散成循环肿瘤细胞（CTCs） | NA | 探索肿瘤细胞转移扩散过程中锚定依赖性的重新编程机制 | 乳腺癌和黑色素瘤的小鼠异种移植模型及新发转移患者的原发肿瘤、CTCs和转移瘤样本 | 数字病理学 | 乳腺癌, 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）, 组织染色 | NA | RNA | 乳腺癌和黑色素瘤的小鼠异种移植模型及新发转移患者的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 149 | 2024-08-08 |
Clinical and biological heterogeneities in triple-negative breast cancer reveals a non-negligible role of HER2-low
2023-03-30, Breast cancer research : BCR
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s13058-023-01639-y
PMID:36998014
|
研究论文 | 本研究探讨了HER2-low在三阴性乳腺癌（TNBC）中的临床和生物学特性 | 首次详细比较了HER2-low和HER2-negative TNBC在临床特征和肿瘤生物学特性上的差异 | 研究样本量相对较小，可能影响结果的普遍性 | 探究HER2-low在三阴性乳腺癌中的临床和生物学影响 | 251名三阴性乳腺癌患者，包括157名HER2-low和94名HER2-negative患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 251名患者，其中157名HER2-low和94名HER2-negative | NA | NA | NA | NA |
| 150 | 2024-08-08 |
Understanding host response to infectious salmon anaemia virus in an Atlantic salmon cell line using single-cell RNA sequencing
2023-Mar-29, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-023-09254-z
PMID:36991327
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了大西洋鲑鱼细胞系在感染传染性鲑鱼贫血病毒（ISAV）后的转录组变化 | 首次使用单细胞RNA测序技术深入研究了ISAV感染早期阶段的宿主-病毒相互作用 | NA | 深入理解大西洋鲑鱼在ISAV感染期间的细胞反应和宿主-病毒相互作用 | 大西洋鲑鱼细胞系在ISAV感染后的转录组变化 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用了鲑鱼头部肾脏（SHK-1）细胞在ISAV感染后24小时、48小时和96小时的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 151 | 2024-08-08 |
Supervised learning of high-confidence phenotypic subpopulations from single-cell data
2023-Mar-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.23.533712
PMID:36993424
|
研究论文 | 开发了一种名为PENCIL的监督学习框架，用于从单细胞数据中识别与表型相关的亚群 | 首次在框架中嵌入特征选择功能，实现同时选择信息特征和识别细胞亚群，提高了表型亚群识别的准确性 | NA | 准确识别从异质细胞群中与表型相关的细胞亚群，揭示驱动生物或临床表型的潜在机制 | 单细胞数据中的细胞亚群 | 机器学习 | NA | 监督学习 | PENCIL框架 | 单细胞数据 | 分析了100万个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 152 | 2024-08-08 |
An evaluation of statistical differential analysis methods in single-cell RNA-seq data
2023-Mar-23, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2670717/v1
PMID:36993457
|
研究论文 | 本文评估了五种开源流行方法在单细胞RNA测序数据中进行基因差异表达分析的性能 | 本文通过模拟研究和真实数据示例，评估了五种方法在不同样本大小、分布假设和数据中零比例下的表现 | NA | 评估单细胞RNA测序数据中基因差异表达分析方法的性能 | 单细胞RNA测序数据中的基因差异表达分析方法 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 不同样本大小，包括每组100个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 153 | 2024-08-08 |
HIV-1 Vpr combats the PU.1-driven antiviral response in primary human macrophages
2023-Mar-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.21.533528
PMID:36993393
|
研究论文 | 研究探讨了HIV-1辅助蛋白Vpr在人类原代巨噬细胞中对抗PU.1驱动的抗病毒反应的作用 | 发现Vpr通过靶向主转录调节因子PU.1，重编程HIV感染的巨噬细胞基因表达，并揭示了Vpr在非旁观者巨噬细胞中通过PU.1非依赖机制对抗HIV感染的固有免疫反应 | 未观察到PU.1对HIV基因转录的直接影响 | 阐明Vpr在HIV感染原代巨噬细胞中的作用 | HIV-1辅助蛋白Vpr和PU.1在HIV感染中的作用 | NA | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 原代人类巨噬细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 154 | 2024-08-05 |
Cis-regulatory control of transcriptional timing and noise in response to estrogen
2023-Mar-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.14.532457
PMID:36993565
|
研究论文 | 该文章探讨了顺式调控元件如何影响转录时间和噪声 | 研究揭示了影响转录特点的调控蛋白和表观遗传特征的组合 | 对不同转录特征控制所需的全貌尚未完全理解 | 确定与雌激素处理相关的转录时序和噪声的基因组预测因子 | 涉及雌激素处理条件下的单细胞RNA测序结果 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因组表达数据 | 在雌激素处理的时间过程中进行了单细胞分析 | NA | NA | NA | NA |
| 155 | 2024-08-08 |
CTLA-4 tail fusion enhances CAR-T anti-tumor immunity
2023-Mar-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.14.532655
PMID:36993364
|
研究论文 | 本文通过利用细胞毒性T淋巴细胞相关抗原-4（CTLA-4）细胞质尾（CT）的内吞特性，重新编程嵌合抗原受体（CAR）功能，显著增强了CAR-T细胞的疗效 | 通过将CTLA-4 CT融合到CAR的C端，实现了CAR-T细胞的渐进性细胞毒性增加，同时减少了激活和促炎细胞因子的产生 | NA | 探索通过合成CTLA-4 CT融合来改进CAR-T细胞功能的新策略 | 嵌合抗原受体T细胞（CAR-T）及其在肿瘤治疗中的应用 | 生物技术 | 白血病 | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 156 | 2024-08-05 |
Analysis of RNA processing directly from spatial transcriptomics data reveals previously unknown regulation
2023-Mar-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.13.532412
PMID:36993757
|
研究论文 | 本研究直接分析了空间转录组数据中的RNA处理，揭示了之前未知的调节机制 | 首次将ReadZS和SpliZ方法应用于空间转录组数据，以分析RNA处理的空间定位 | 主要集中在小鼠的大脑和肾脏数据，可能无法代表其他组织类型 | 研究空间转录组数据中的RNA处理及其空间调节机制 | 使用小鼠脑和肾脏样本中的RNA数据进行分析 | 数字病理学 | NA | 空间转录组 | NA | RNA数据 | 小鼠脑和肾脏样本 | NA | NA | NA | NA |
| 157 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome profiling of the vaginal epithelium reveals the heterogeneity of suprabasal cells
2023-Mar, Precision clinical medicine
IF:5.1Q1
DOI:10.1093/pcmedi/pbad006
PMID:37007744
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 158 | 2024-08-08 |
A transcriptomic pan-cancer signature for survival prognostication and prediction of immunotherapy response based on endothelial senescence
2023-Mar-28, Journal of biomedical science
IF:9.0Q1
DOI:10.1186/s12929-023-00915-5
PMID:36978029
|
研究论文 | 本文基于内皮细胞衰老，开发了一种泛癌转录组标志物，用于生存预测和免疫治疗反应预测 | 首次提出基于内皮细胞衰老的泛癌转录组标志物，用于提高生存预测和免疫治疗反应预测的准确性 | NA | 开发一种新的生物标志物，用于精准肿瘤学中的生存预测和免疫治疗反应预测 | 内皮细胞衰老及其在多种癌症中的转录组特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 转录组数据 | 多种癌症实体的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 159 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome analysis and in vitro differentiation of testicular cells reveal novel insights into male sterility of the interspecific hybrid cattle-yak
2023-Mar-27, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-023-09251-2
PMID:36973659
|
研究论文 | 这篇文章通过单细胞转录组分析和体外分化研究了牦牛-牛杂交动物的雄性不育新见解 | 研究表明除了减数分裂停滞外，未分化精原细胞的分化阶段以及其微环境也可能导致雄性杂交不育 | 对雄性生殖细胞的细胞特性和发育潜力的系统研究仍然不够 | 探讨牦牛-牛杂交动物雄性不育的细胞特性及其发育潜力 | 牦牛-牛杂交动物和牦牛的青春期睾丸生殖细胞及其微环境 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 牦牛-牛杂交动物和牦牛的青春期睾丸细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 160 | 2024-08-08 |
An integrated single-cell transcriptomic dataset for non-small cell lung cancer
2023-03-27, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-023-02074-6
PMID:36973297
|
研究论文 | 本文介绍了一个包含224,611个细胞的大型综合单细胞转录组数据集，用于研究人类原发性非小细胞肺癌（NSCLC）肿瘤的细胞异质性。 | 该研究通过锚定方法整合了七个独立的单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据集，并创建了基于跨数据集细胞类型特异性标记的两级注释，以提高数据的可重用性。 | NA | 旨在提供一个资源，用于在单细胞水平上研究非小细胞肺癌的转录组。 | 人类原发性非小细胞肺癌肿瘤的细胞。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 224,611个细胞 | NA | NA | NA | NA |