单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 329 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics of adult skin VE-cadherin expressing lineages during hair cycle
2023-Mar-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.22.533784
PMID:36993228
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研究论文 | 本研究揭示了在毛发生长周期中成体皮肤内表现VE-钙粘附蛋白的细胞的单细胞转录组学变化 | 该研究首次通过单细胞RNA测序技术深入分析了皮肤内VE-钙粘附蛋白表达细胞在毛发生长周期各阶段的动态 | 研究只涉及了小鼠模型，结果可能在其他物种中不完全适用 | 探讨成体皮肤内血管内皮系细胞在毛发生长周期中的动态变化 | 主要研究表现VE-钙粘附蛋白的内皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | FACS分选的VE-钙粘附蛋白表达细胞（确切样本量未提供） |
| 142 | 2024-08-05 |
Inference of single cell profiles from histology stains with the Single-Cell omics from Histology Analysis Framework (SCHAF)
2023-Mar-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.21.533680
PMID:36993643
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研究论文 | 本研究开发了一个名为SCHAF的框架，能够从H&E组织图像生成空间分辨率的单细胞组学数据集 | 该研究利用对抗性机器学习方法，将组织切片的H&E图像与单细胞RNA测序数据有效结合，提供了单细胞的空间信息 | 本文主要集中于肺癌和转移性乳腺癌样本，可能限制了其方法的广泛适用性 | 探讨如何从组织切片获取单细胞的分子信息和空间结构 | 研究对象为来自肺癌和转移性乳腺癌的人类肿瘤样本 | 数字病理学 | 肺癌、转移性乳腺癌 | 对抗性机器学习 | NA | 图像 | 两个类型的人类肿瘤样本 |
| 143 | 2024-08-08 |
An evaluation of statistical differential analysis methods in single-cell RNA-seq data
2023-Mar-23, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2670717/v1
PMID:36993457
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研究论文 | 本文评估了五种开源流行方法在单细胞RNA测序数据中进行基因差异表达分析的性能 | 本文通过模拟研究和真实数据示例，评估了五种方法在不同样本大小、分布假设和数据中零比例下的表现 | NA | 评估单细胞RNA测序数据中基因差异表达分析方法的性能 | 单细胞RNA测序数据中的基因差异表达分析方法 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 不同样本大小，包括每组100个样本 |
| 144 | 2024-08-08 |
HIV-1 Vpr combats the PU.1-driven antiviral response in primary human macrophages
2023-Mar-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.21.533528
PMID:36993393
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研究论文 | 研究探讨了HIV-1辅助蛋白Vpr在人类原代巨噬细胞中对抗PU.1驱动的抗病毒反应的作用 | 发现Vpr通过靶向主转录调节因子PU.1，重编程HIV感染的巨噬细胞基因表达，并揭示了Vpr在非旁观者巨噬细胞中通过PU.1非依赖机制对抗HIV感染的固有免疫反应 | 未观察到PU.1对HIV基因转录的直接影响 | 阐明Vpr在HIV感染原代巨噬细胞中的作用 | HIV-1辅助蛋白Vpr和PU.1在HIV感染中的作用 | NA | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 原代人类巨噬细胞 |
| 145 | 2024-08-05 |
Cis-regulatory control of transcriptional timing and noise in response to estrogen
2023-Mar-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.14.532457
PMID:36993565
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研究论文 | 该文章探讨了顺式调控元件如何影响转录时间和噪声 | 研究揭示了影响转录特点的调控蛋白和表观遗传特征的组合 | 对不同转录特征控制所需的全貌尚未完全理解 | 确定与雌激素处理相关的转录时序和噪声的基因组预测因子 | 涉及雌激素处理条件下的单细胞RNA测序结果 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因组表达数据 | 在雌激素处理的时间过程中进行了单细胞分析 |
| 146 | 2024-08-08 |
CTLA-4 tail fusion enhances CAR-T anti-tumor immunity
2023-Mar-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.14.532655
PMID:36993364
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研究论文 | 本文通过利用细胞毒性T淋巴细胞相关抗原-4（CTLA-4）细胞质尾（CT）的内吞特性，重新编程嵌合抗原受体（CAR）功能，显著增强了CAR-T细胞的疗效 | 通过将CTLA-4 CT融合到CAR的C端，实现了CAR-T细胞的渐进性细胞毒性增加，同时减少了激活和促炎细胞因子的产生 | NA | 探索通过合成CTLA-4 CT融合来改进CAR-T细胞功能的新策略 | 嵌合抗原受体T细胞（CAR-T）及其在肿瘤治疗中的应用 | 生物技术 | 白血病 | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | 细胞 | NA |
| 147 | 2024-08-05 |
Analysis of RNA processing directly from spatial transcriptomics data reveals previously unknown regulation
2023-Mar-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.13.532412
PMID:36993757
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研究论文 | 本研究直接分析了空间转录组数据中的RNA处理，揭示了之前未知的调节机制 | 首次将ReadZS和SpliZ方法应用于空间转录组数据，以分析RNA处理的空间定位 | 主要集中在小鼠的大脑和肾脏数据，可能无法代表其他组织类型 | 研究空间转录组数据中的RNA处理及其空间调节机制 | 使用小鼠脑和肾脏样本中的RNA数据进行分析 | 数字病理学 | NA | 空间转录组 | NA | RNA数据 | 小鼠脑和肾脏样本 |
| 148 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome profiling of the vaginal epithelium reveals the heterogeneity of suprabasal cells
2023-Mar, Precision clinical medicine
IF:5.1Q1
DOI:10.1093/pcmedi/pbad006
PMID:37007744
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 149 | 2024-08-08 |
A transcriptomic pan-cancer signature for survival prognostication and prediction of immunotherapy response based on endothelial senescence
2023-Mar-28, Journal of biomedical science
IF:9.0Q1
DOI:10.1186/s12929-023-00915-5
PMID:36978029
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研究论文 | 本文基于内皮细胞衰老，开发了一种泛癌转录组标志物，用于生存预测和免疫治疗反应预测 | 首次提出基于内皮细胞衰老的泛癌转录组标志物，用于提高生存预测和免疫治疗反应预测的准确性 | NA | 开发一种新的生物标志物，用于精准肿瘤学中的生存预测和免疫治疗反应预测 | 内皮细胞衰老及其在多种癌症中的转录组特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 转录组数据 | 多种癌症实体的单细胞RNA测序数据 |
| 150 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome analysis and in vitro differentiation of testicular cells reveal novel insights into male sterility of the interspecific hybrid cattle-yak
2023-Mar-27, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-023-09251-2
PMID:36973659
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研究论文 | 这篇文章通过单细胞转录组分析和体外分化研究了牦牛-牛杂交动物的雄性不育新见解 | 研究表明除了减数分裂停滞外，未分化精原细胞的分化阶段以及其微环境也可能导致雄性杂交不育 | 对雄性生殖细胞的细胞特性和发育潜力的系统研究仍然不够 | 探讨牦牛-牛杂交动物雄性不育的细胞特性及其发育潜力 | 牦牛-牛杂交动物和牦牛的青春期睾丸生殖细胞及其微环境 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 牦牛-牛杂交动物和牦牛的青春期睾丸细胞 |
| 151 | 2024-08-08 |
An integrated single-cell transcriptomic dataset for non-small cell lung cancer
2023-03-27, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-023-02074-6
PMID:36973297
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研究论文 | 本文介绍了一个包含224,611个细胞的大型综合单细胞转录组数据集，用于研究人类原发性非小细胞肺癌（NSCLC）肿瘤的细胞异质性。 | 该研究通过锚定方法整合了七个独立的单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据集，并创建了基于跨数据集细胞类型特异性标记的两级注释，以提高数据的可重用性。 | NA | 旨在提供一个资源，用于在单细胞水平上研究非小细胞肺癌的转录组。 | 人类原发性非小细胞肺癌肿瘤的细胞。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 224,611个细胞 |
| 152 | 2024-08-08 |
Comprehensive analysis of scRNA-Seq and bulk RNA-Seq reveals dynamic changes in the tumor immune microenvironment of bladder cancer and establishes a prognostic model
2023-03-27, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04056-z
PMID:36973787
|
研究论文 | 本研究结合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序（bulk RNA-seq）数据，构建了膀胱癌（BLCA）的预后模型 | 通过整合scRNA-seq和bulk RNA-seq数据，构建了一个新的预后模型，能够更准确地预测膀胱癌患者的生存情况 | NA | 构建一个预后模型，用于预测膀胱癌患者的生存情况 | 膀胱癌（BLCA）患者的肿瘤免疫微环境 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序（bulk RNA-seq） | Cox比例风险模型，LASSO回归模型 | RNA测序数据 | scRNA-seq数据来自Gene Expression Omnibus（GEO）数据库，bulk RNA-seq数据来自UCSC Xena |
| 153 | 2024-08-05 |
Gene expression in organoids: an expanding horizon
2023-03-25, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-023-00360-2
PMID:36964575
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综述 | 本文回顾了对类器官进行基因表达研究的最新进展和技术 | 介绍了利用单细胞转录组学和染色质可及性分析等最新多组学技术来研究类器官 | 类器官培养和处理的复杂性和异质性带来了挑战 | 探讨类器官作为发育模型和精准医学平台的研究 | 人体来源的多种组织衍生的类器官 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞转录组学和染色质可及性分析 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 154 | 2024-08-05 |
Cuproptosis correlates with immunosuppressive tumor microenvironment based on pan-cancer multiomics and single-cell sequencing analysis
2023-03-24, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-023-01752-8
PMID:36959665
|
研究论文 | 本研究分析了cuproptosis在全癌症中的表达差异及其与肿瘤微环境的关系 | 首次系统性地揭示了cuproptosis相关基因在不同肿瘤中的表达和突变情况，及其与免疫逃逸的相关性 | 目前的研究还未能全面解析cuproptosis在肿瘤发生和发展的具体机制 | 探讨cuproptosis在肿瘤发生、进展及预后中的作用 | 研究对象为不同类型癌症中的cuproptosis相关基因及其表达情况 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞转录组测序 (scRNA-seq), 单样本基因集富集分析 (ssGSEA), 免疫组化 (IHC) | NA | 基因组数据 | 涉及多种肿瘤类型，具体样本数量未明确说明 |
| 155 | 2024-08-08 |
RevGel-seq: instrument-free single-cell RNA sequencing using a reversible hydrogel for cell-specific barcoding
2023-03-24, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-31915-y
PMID:36964177
|
研究论文 | 介绍了一种名为RevGel-seq的新型单细胞RNA测序技术，该技术使用可逆水凝胶进行细胞特异性条形码标记，无需仪器辅助 | RevGel-seq技术通过化学连接剂稳定单细胞与条形码珠的复合体，并在液态水凝胶中分散，无需纳米孔或液滴即可实现细胞的固定和物理分离 | 目前的凝胶设备处理的标准分析范围在10,000个输入细胞，可能限制了大规模研究的应用 | 开发一种无需仪器辅助的单细胞RNA测序技术，以提高实验设计的灵活性和样本处理的时效性 | 新鲜细胞样本，包括外周血单核细胞（PBMC）、胰腺胰岛细胞和心肌细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 分析范围在10,000个输入细胞 |
| 156 | 2024-08-08 |
MicroRNA-223 Dampens Pulmonary Inflammation during Pneumococcal Pneumonia
2023-03-21, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12060959
PMID:36980300
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研究论文 | 研究微小RNA-223在肺炎链球菌性肺炎中调节肺部炎症的作用 | 首次探讨了微小RNA-223在肺炎链球菌性肺炎中的作用，并揭示了其在调节中性粒细胞相关炎症反应中的关键角色 | 研究主要基于小鼠模型和肺炎患者的血清样本，可能需要进一步的人体临床试验验证 | 理解微小RNA-223在肺炎链球菌性肺炎中调节肺部炎症的作用 | 肺炎链球菌性肺炎患者和小鼠模型 | NA | 肺部疾病 | 微小RNA测定，单细胞转录组分析 | NA | 血清，肺组织 | 包括肺炎患者和健康个体的血清样本，以及野生型和微小RNA-223敲除小鼠的肺组织 |
| 157 | 2024-08-05 |
Current Status and Prospects of the Single-Cell Sequencing Technologies for Revealing the Pathogenesis of Pregnancy-Associated Disorders
2023-03-20, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes14030756
PMID:36981026
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序在分析正常妊娠和妊娠并发症中的应用 | 该文章讨论了单细胞RNA测序在研究妊娠相关疾病发病机制中的应用和潜力 | 文章中提到单细胞技术和数据分析方法的主要原则、优势和局限性 | 研究与妊娠相关疾病的发病机制及其基因表达变化 | 各种细胞类型及其在妊娠和妊娠并发症中的基因表达变化 | 数字病理学 | 妊娠相关疾病 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA |
| 158 | 2024-08-08 |
Integrating Multiple Single-Cell RNA Sequencing Datasets Using Adversarial Autoencoders
2023-Mar-13, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24065502
PMID:36982574
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研究论文 | 本文提出了一种名为IMAAE的新型深度学习模型，用于整合多个单细胞RNA测序数据集并校正批次效应 | IMAAE模型利用对抗自编码器来更好地利用已知标签，提高了批次校正方法的性能，特别是在多细胞类型的情况下 | NA | 旨在改进单细胞RNA测序数据集的整合和批次效应校正 | 单细胞RNA测序数据集 | 机器学习 | NA | RNA测序 | 对抗自编码器 | 基因表达数据 | 多个数据集 |
| 159 | 2024-08-08 |
Novel Potential Markers of Myofibroblast Differentiation Revealed by Single-Cell RNA Sequencing Analysis of Mesenchymal Stromal Cells in Profibrotic and Adipogenic Conditions
2023-Mar-10, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines11030840
PMID:36979822
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析，揭示了在促纤维化和脂肪生成条件下间充质基质细胞向肌成纤维细胞分化的潜在标记物 | 首次展示了神经调节蛋白（NTM）在人类脂肪组织间充质基质细胞中的表达，并证明了其在肌成纤维细胞分化刺激下的基因表达增加和膜受体聚集 | 需要进一步验证通过组学方法获得的数据，如发现RDH10的检测结果与转录组分析数据相矛盾 | 测试多能细胞向肌成纤维细胞和脂肪细胞分化过程中基因表达模式的激活假设 | 人类脂肪组织间充质基质细胞在肌成纤维细胞或脂肪生成分化刺激后的单细胞RNA测序转录组 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未具体说明样本数量 |
| 160 | 2024-08-08 |
New Insights into the Role of Synovial Fibroblasts Leading to Joint Destruction in Rheumatoid Arthritis
2023-Mar-08, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24065173
PMID:36982247
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综述 | 本文综述了类风湿性关节炎中滑膜成纤维细胞在关节破坏中的关键作用及其与免疫细胞的相互作用 | 采用单细胞RNA测序等新技术揭示了滑膜成纤维细胞的异质性及其在类风湿性关节炎中的作用 | NA | 探讨滑膜成纤维细胞在类风湿性关节炎关节破坏中的作用及其与免疫细胞的相互作用 | 滑膜成纤维细胞及其在类风湿性关节炎中的作用 | NA | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |