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当前共找到 329 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2024-08-07 |
Ploidy-stratified single cardiomyocyte transcriptomics map Zinc Finger E-Box Binding Homeobox 1 to underly cardiomyocyte proliferation before birth
2023-03-02, Basic research in cardiology
IF:7.5Q1
DOI:10.1007/s00395-023-00979-2
PMID:36862248
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，研究了出生前后心肌细胞的转录组变化，特别是锌指E盒结合同源盒1（ZEB1）在心肌细胞增殖中的作用 | 首次揭示了ZEB1在心肌细胞增殖和内复制中的关键作用，并提供了高分辨率的心肌细胞单细胞转录组图谱 | 研究仅限于小鼠模型，且样本量相对较小 | 识别出生前后心肌细胞增殖和终末分化相关的转录因子 | 心肌细胞的转录组和增殖机制 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 来自发育中（E16.5、P1和P5）小鼠心脏的固定心肌细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 122 | 2024-08-07 |
Immune profiling and prognostic model of pancreatic cancer using quantitative pathology and single-cell RNA sequencing
2023-03-21, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04051-4
PMID:36944944
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研究论文 | 本研究利用定量病理学和单细胞RNA测序技术，对胰腺癌的免疫特征和预后模型进行了深入分析 | 首次结合定量病理学和单细胞RNA测序技术，揭示了胰腺癌的免疫微环境特征，并建立了基于免疫特征的风险评分预后模型 | NA | 旨在描绘胰腺导管腺癌的免疫景观，并确定免疫特征在肿瘤免疫微环境中的临床价值 | 胰腺导管腺癌及其免疫微环境 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、多重免疫组化（mIHC） | Cox回归分析 | 免疫特征数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 123 | 2024-08-07 |
Integrated transcriptional analysis reveals macrophage heterogeneity and macrophage-tumor cell interactions in the progression of pancreatic ductal adenocarcinoma
2023-Mar-02, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-023-10675-y
PMID:36864399
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研究论文 | 本研究通过综合转录组分析揭示了胰腺导管腺癌进展中巨噬细胞的异质性和巨噬细胞-肿瘤细胞相互作用 | 开发了一种结合批量和单细胞转录组测序的计算方法，用于描绘巨噬细胞异质性，并应用CellPhoneDB算法推断巨噬细胞-肿瘤相互作用网络 | NA | 识别肿瘤-巨噬细胞相互作用的分子机制，从而设计新的治疗策略 | 胰腺导管腺癌中的巨噬细胞及其与肿瘤细胞的相互作用 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞转录组测序 | CellPhoneDB算法 | 转录组数据 | 多个巨噬细胞亚群和胰腺癌细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 124 | 2024-08-05 |
Molecular features and evolutionary trajectory of ASCL1+ and NEUROD1+ SCLC cells
2023-03, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-022-02103-y
PMID:36517551
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研究论文 | 本文探讨了ASCL1+和NEUROD1+小细胞肺癌细胞的分子特征和演化轨迹 | 发现ASCL1+和NEUROD1+ SCLC细胞在同一肿瘤组织中共存，并揭示了它们的不同生物学特征和代谢能力 | 未提及具体的样本量和研究范围的限制 | 研究小细胞肺癌（SCLC）亚型的生物学功能和演变过程 | 人类原发性小细胞肺癌组织中的ASCL1+和NEUROD1+细胞 | 数字病理 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 125 | 2024-08-07 |
Single-cell profiling of the microenvironment in decidual tissue from women with missed abortions
2023-03, Fertility and sterility
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.fertnstert.2022.12.016
PMID:36528108
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研究论文 | 本研究旨在定义正常染色体和非整倍体流产及选择性终止妊娠中的蜕膜微环境 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了非整倍体流产蜕膜组织微环境的改变，并发现衰老的基质细胞比例与胚胎染色体异常的相关性 | 研究样本量较小，且仅限于特定时间段内的患者 | 探索流产中蜕膜组织的微环境变化及其与胚胎染色体异常的关系 | 34名经历流产的女性，包括6名选择性终止妊娠和28名非整倍体流产患者 | 数字病理学 | 妊娠并发症 | 单细胞RNA测序，逆转录定量聚合酶链反应 | NA | 转录组数据 | 16名女性的蜕膜组织进行单细胞RNA测序，18名女性的蜕膜组织进行逆转录定量聚合酶链反应 | NA | NA | NA | NA |
| 126 | 2024-08-07 |
scHOIS: Determining Cell Heterogeneity Through Hierarchical Clustering Based on Optimal Imputation Strategy
2023 Mar-Apr, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2022.3203592
PMID:37815942
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研究论文 | 本文提出了一种基于最优插补策略的分层聚类算法scHOIS，用于分析单细胞RNA测序数据中的细胞异质性 | scHOIS算法通过两阶段处理，首先使用掩蔽非负矩阵分解近似原始观测数据，然后通过分层聚类对插补细胞进行分组，显著提高了细胞差异的区分能力和聚类性能 | NA | 开发有效的计算方法来解决单细胞RNA测序数据中的缺失值和聚类问题 | 单细胞RNA测序数据中的细胞异质性 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 非负矩阵分解(NMF) | 基因表达数据 | 使用真实世界数据集进行广泛实验 | NA | NA | NA | NA |
| 127 | 2024-08-05 |
Identification of the candidate genes of diagnosing rheumatoid arthritis using the single-cell sequencing technology and T cell subclusters analysis of patients with rheumatoid arthritis
2023-Mar, Archives of rheumatology
IF:1.1Q4
DOI:10.46497/ArchRheumatol.2022.9573
PMID:37235118
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序技术分析类风湿关节炎患者外周血单核细胞中的细胞异质性并鉴定关键基因 | 首次通过单细胞测序分析确定九个与RA发生密切相关的候选基因 | 研究的样本量和数据来源可能影响结果的普遍性 | 分析类风湿关节炎患者外周血单核细胞中细胞类型的异质性 | 类风湿关节炎患者的外周血单核细胞及其T细胞亚群 | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | 单细胞测序 | NA | 细胞数据 | 10,483个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 128 | 2024-08-05 |
scTransSort: Transformers for Intelligent Annotation of Cell Types by Gene Embeddings
2023-03-28, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom13040611
PMID:37189359
|
研究论文 | 本研究提出了一种基于基因嵌入的智能细胞类型标注方法scTransSort | 创新点在于采用transformer的思想进行单细胞转录组数据的细胞类型分类，自动提取有效特征而无需手动标记 | 缺乏对大规模样本的广泛验证，尚需在更多类型的细胞上进行验证 | 研究单细胞RNA测序技术中的细胞类型识别 | 对来自35个人类和26只小鼠组织的细胞进行分类和标注 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | transformer | 基因表达数据 | 来自35个人类和26只小鼠组织的细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 129 | 2024-08-05 |
The EBV Gastric Cancer Resource (EBV-GCR): A Suite of Tools for Investigating EBV-Associated Human Gastric Carcinogenesis
2023-03-27, Viruses
DOI:10.3390/v15040853
PMID:37112833
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研究论文 | 本研究构建了一个名为EBV胃癌资源（EBV-GCR）的在线工具套件，用于研究EBV相关的人类胃癌发生 | 创新性地整合了TCGA和单细胞RNA测序数据，提供了探究EBV在胃癌中的作用的独特机会 | 未明确说明具体的局限性 | 研究EBV在胃癌发生中的作用及EBVaGC和EBVnGC之间的差异 | EBV相关的胃腺癌（EBVaGC）和EBV阴性胃腺癌（EBVnGC） | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组学和基因组学数据 | 包括数千个主要人类癌症样本的公共数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 130 | 2024-08-05 |
Identification and Characterisation of Infiltrating Immune Cells in Malignant Pleural Mesothelioma Using Spatial Transcriptomics
2023-Mar-28, Methods and protocols
IF:2.3Q3
DOI:10.3390/mps6020035
PMID:37104017
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研究论文 | 本文描述了一种使用空间转录组学技术映射和表征恶性胸膜间皮瘤中肿瘤浸润免疫细胞的方法 | 提出了基于Visium技术的空间转录组学协议，增强了肿瘤特异性免疫细胞基因特征的识别和空间分辨率 | 关于肿瘤微环境中免疫组成的了解仍然有限 | 探讨肿瘤微环境中的免疫细胞特征，以提高免疫检查点抑制剂的疗效与安全性 | 恶性胸膜间皮瘤中的浸润免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 131 | 2024-08-08 |
Identification of distinct tumor cell patterns with single-cell RNA sequencing integrating primary lung adenocarcinoma and brain metastasis tumor
2023-Mar-31, Translational lung cancer research
IF:4.0Q1
DOI:10.21037/tlcr-23-107
PMID:37057123
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，整合原发性肺腺癌和脑转移瘤的数据，分析肿瘤细胞的异质性并识别潜在的治疗靶点 | 本研究首次整合了原发性肺腺癌和脑转移瘤的单细胞RNA测序数据，揭示了脑转移瘤细胞的高度异质性及其潜在的恶性细胞来源 | 研究样本量较小，仅包括8名未经治疗的肺腺癌脑转移患者，可能影响结果的普遍性 | 旨在解析肿瘤细胞的异质性并识别潜在的治疗靶点 | 肺腺癌及其脑转移瘤的肿瘤细胞 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞RNA测序数据 | 8名未经治疗的肺腺癌脑转移患者及10个原发性肺腺癌样本及其匹配的正常组织 | NA | NA | NA | NA |
| 132 | 2024-08-05 |
Single-Cell Isolation Microfluidic Chip Based on Thermal Bubble Micropump Technology
2023-Mar-30, Sensors (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/s23073623
PMID:37050683
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研究论文 | 本研究介绍了一种基于热气泡微泵技术的微流体芯片，用于单细胞的分离。 | 该方法通过匹配流道的流阻实现单细胞分离，无需注射泵和蠕动泵，大大简化了操作流程。 | 目前单细胞的捕获率约为75%，尚未实现100%的捕获率。 | 研究旨在开发一种高通量的单细胞分离技术。 | 研究对象为单细胞，包括细胞悬浮液和聚苯乙烯微珠。 | 数字病理学 | NA | 热气泡微泵技术 | 微流体芯片 | 细胞悬液、微珠 | 多个单细胞和聚苯乙烯微珠样本 | NA | NA | NA | NA |
| 133 | 2024-08-05 |
Data-driven microscopy allows for automated context-specific acquisition of high-fidelity image data
2023-03-27, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2023.100419
PMID:37056378
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研究论文 | 本文介绍了一种数据驱动显微镜技术，可以自动获取背景特定的高保真图像数据。 | 提出了一种数据驱动显微镜(DDM)框架，结合实时的人群特征化，能够根据人群背景进行高保真成像。 | 尚未明确提及限制 | 研究目标是提高显微成像的质量和可重复性，特别是在样本人群背景下。 | 研究对象为细胞迁移和感染过程中感兴趣的事件。 | 数字病理学 | NA | 显微镜成像 | NA | 图像 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 134 | 2024-08-08 |
A robust and efficient microvascular isolation method for multimodal characterization of the mouse brain vasculature
2023-03-27, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2023.100431
PMID:37056377
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research paper | 本文开发了一种快速简单的脑血管片段分离方法，无需转基因报告基因，适用于多种实验模式 | 该方法能够快速简单地分离脑血管片段，适用于单细胞分析、蛋白质印迹和原代细胞培养等多种实验模式 | NA | 研究与疾病相关的脑血管变化 | 小鼠脑血管 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 22,515个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 135 | 2024-08-05 |
Epi-Impute: Single-Cell RNA-seq Imputation via Integration with Single-Cell ATAC-seq
2023-Mar-25, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24076229
PMID:37047200
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为Epi-Impute的计算方法，用于通过整合表达和编程组学数据来解决单细胞RNA-seq数据中的丢失现象 | Epi-Impute利用单细胞ATAC-seq数据作为额外的信息来源，以减少丢失现象的数量，特别适用于稀疏的单细胞RNA-seq数据集 | NA | 提出一种新的方法来改进单细胞RNA-seq数据的缺失值填补 | 单细胞RNA-seq数据和单细胞ATAC-seq数据 | 数字病理学 | NA | NA | NA | RNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 136 | 2024-08-08 |
ERS International Congress 2022: highlights from the Basic and Translational Science Assembly
2023-Mar, ERJ open research
IF:4.3Q1
DOI:10.1183/23120541.00561-2022
PMID:37077558
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综述 | 本文综述了2022年欧洲呼吸学会国际大会中基础与转化科学会议的亮点内容 | 提出了人类肺细胞图谱(HLCA)作为健康人类肺部的新参考点，并结合单细胞RNA测序和空间数据，发现了新的细胞类型/状态和生态位 | NA | 探讨呼吸事件从出生到老年对气候变化相关空气质量变化的影响，以及转化研究中确定的哮喘新治疗靶点和免疫调节机制 | 呼吸事件、气候变化、空气质量、肺部疾病、哮喘治疗 | 数字病理学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 空间数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 137 | 2024-08-08 |
Sox11 is enriched in myogenic progenitors but dispensable for development and regeneration of skeletal muscle
2023-Mar-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.30.534956
PMID:37034612
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序数据分析，探讨了转录因子Sox11在肌肉干细胞分化和功能中的作用 | 发现Sox11在肌肉干细胞分化过程中表达增加，但在静止和衰老的肌肉干细胞中表达减少 | Sox11在肌肉发生中的具体功能尚未明确 | 研究Sox11在肌肉干细胞分化和肌肉再生中的作用 | 肌肉干细胞（MuSCs）及其在骨骼肌发育和再生中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 年轻和老年小鼠的肌肉再生样本 | NA | NA | NA | NA |
| 138 | 2024-08-08 |
Endothelial cells are a key target of IFN-g during response to combined PD-1/CTLA-4 ICB treatment in a mouse model of bladder cancer
2023-Mar-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.28.534561
PMID:37034778
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探索了在小鼠膀胱癌模型中，联合PD-1/CTLA-4免疫检查点阻断治疗对不同细胞类型的响应机制 | 首次揭示了内皮细胞在IFN-γ信号传导中作为ICB治疗响应的关键介质 | NA | 探索联合PD-1/CTLA-4免疫检查点阻断治疗在个体细胞类型中的响应机制 | 小鼠膀胱癌模型中的内皮细胞 | 数字病理学 | 膀胱癌 | scRNA-seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | 包含三种条件：未治疗的肿瘤、治疗的肿瘤和CD4+ T细胞耗竭后治疗的肿瘤 | NA | NA | NA | NA |
| 139 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome dataset of human and mouse in vitro adipogenesis models
2023-Mar-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.27.534456
PMID:37034809
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研究论文 | 本文介绍了人类和小鼠体外脂肪形成模型的单细胞转录组数据集，通过单细胞RNA测序（scRNA-Seq）分析了3T3-L1和SGBS细胞在脂肪形成前后的转录变化。 | 首次提供了3T3-L1和SGBS细胞在脂肪形成过程中的单细胞转录组数据，有助于理解细胞间基因表达的变异性。 | NA | 研究人类和小鼠体外脂肪形成过程中的分子调控和细胞间基因表达的变异性。 | 3T3-L1和SGBS细胞在脂肪形成前后的转录变化。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 转录组数据 | 混合的3T3-L1和SGBS细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 140 | 2024-08-05 |
Single-Cell Sequencing-Based Validation of T Cell-Associated Diagnostic Model Genes and Drug Response in Crohn's Disease
2023-Mar-23, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24076054
PMID:37047025
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研究论文 | 该研究旨在通过单细胞测序验证与T细胞相关的克罗恩病诊断模型基因及其药物反应 | 首次将单细胞表达谱数据与T细胞标记基因的诊断与药物反应相结合 | 样本数量较少，可能影响研究结果的广泛适用性 | 进一步探索克罗恩病的诊断及T细胞标记基因表达的药物预测 | 22例克罗恩病或正常样本的单细胞表达谱数据 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞测序 | TNF中心的5基因诊断模型 | 单细胞表达谱数据 | 22个样本 | NA | NA | NA | NA |