单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 329 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2024-08-05 |
The EBV Gastric Cancer Resource (EBV-GCR): A Suite of Tools for Investigating EBV-Associated Human Gastric Carcinogenesis
2023-03-27, Viruses
DOI:10.3390/v15040853
PMID:37112833
|
研究论文 | 本研究构建了一个名为EBV胃癌资源（EBV-GCR）的在线工具套件，用于研究EBV相关的人类胃癌发生 | 创新性地整合了TCGA和单细胞RNA测序数据，提供了探究EBV在胃癌中的作用的独特机会 | 未明确说明具体的局限性 | 研究EBV在胃癌发生中的作用及EBVaGC和EBVnGC之间的差异 | EBV相关的胃腺癌（EBVaGC）和EBV阴性胃腺癌（EBVnGC） | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组学和基因组学数据 | 包括数千个主要人类癌症样本的公共数据集 |
| 122 | 2024-08-05 |
Identification and Characterisation of Infiltrating Immune Cells in Malignant Pleural Mesothelioma Using Spatial Transcriptomics
2023-Mar-28, Methods and protocols
IF:2.3Q3
DOI:10.3390/mps6020035
PMID:37104017
|
研究论文 | 本文描述了一种使用空间转录组学技术映射和表征恶性胸膜间皮瘤中肿瘤浸润免疫细胞的方法 | 提出了基于Visium技术的空间转录组学协议，增强了肿瘤特异性免疫细胞基因特征的识别和空间分辨率 | 关于肿瘤微环境中免疫组成的了解仍然有限 | 探讨肿瘤微环境中的免疫细胞特征，以提高免疫检查点抑制剂的疗效与安全性 | 恶性胸膜间皮瘤中的浸润免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 123 | 2024-08-08 |
Identification of distinct tumor cell patterns with single-cell RNA sequencing integrating primary lung adenocarcinoma and brain metastasis tumor
2023-Mar-31, Translational lung cancer research
IF:4.0Q1
DOI:10.21037/tlcr-23-107
PMID:37057123
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，整合原发性肺腺癌和脑转移瘤的数据，分析肿瘤细胞的异质性并识别潜在的治疗靶点 | 本研究首次整合了原发性肺腺癌和脑转移瘤的单细胞RNA测序数据，揭示了脑转移瘤细胞的高度异质性及其潜在的恶性细胞来源 | 研究样本量较小，仅包括8名未经治疗的肺腺癌脑转移患者，可能影响结果的普遍性 | 旨在解析肿瘤细胞的异质性并识别潜在的治疗靶点 | 肺腺癌及其脑转移瘤的肿瘤细胞 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞RNA测序数据 | 8名未经治疗的肺腺癌脑转移患者及10个原发性肺腺癌样本及其匹配的正常组织 |
| 124 | 2024-08-05 |
Single-Cell Isolation Microfluidic Chip Based on Thermal Bubble Micropump Technology
2023-Mar-30, Sensors (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/s23073623
PMID:37050683
|
研究论文 | 本研究介绍了一种基于热气泡微泵技术的微流体芯片，用于单细胞的分离。 | 该方法通过匹配流道的流阻实现单细胞分离，无需注射泵和蠕动泵，大大简化了操作流程。 | 目前单细胞的捕获率约为75%，尚未实现100%的捕获率。 | 研究旨在开发一种高通量的单细胞分离技术。 | 研究对象为单细胞，包括细胞悬浮液和聚苯乙烯微珠。 | 数字病理学 | NA | 热气泡微泵技术 | 微流体芯片 | 细胞悬液、微珠 | 多个单细胞和聚苯乙烯微珠样本 |
| 125 | 2024-08-05 |
Data-driven microscopy allows for automated context-specific acquisition of high-fidelity image data
2023-03-27, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2023.100419
PMID:37056378
|
研究论文 | 本文介绍了一种数据驱动显微镜技术，可以自动获取背景特定的高保真图像数据。 | 提出了一种数据驱动显微镜(DDM)框架，结合实时的人群特征化，能够根据人群背景进行高保真成像。 | 尚未明确提及限制 | 研究目标是提高显微成像的质量和可重复性，特别是在样本人群背景下。 | 研究对象为细胞迁移和感染过程中感兴趣的事件。 | 数字病理学 | NA | 显微镜成像 | NA | 图像 | NA |
| 126 | 2024-08-08 |
A robust and efficient microvascular isolation method for multimodal characterization of the mouse brain vasculature
2023-03-27, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2023.100431
PMID:37056377
|
research paper | 本文开发了一种快速简单的脑血管片段分离方法，无需转基因报告基因，适用于多种实验模式 | 该方法能够快速简单地分离脑血管片段，适用于单细胞分析、蛋白质印迹和原代细胞培养等多种实验模式 | NA | 研究与疾病相关的脑血管变化 | 小鼠脑血管 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 22,515个细胞 |
| 127 | 2024-08-05 |
Epi-Impute: Single-Cell RNA-seq Imputation via Integration with Single-Cell ATAC-seq
2023-Mar-25, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24076229
PMID:37047200
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为Epi-Impute的计算方法，用于通过整合表达和编程组学数据来解决单细胞RNA-seq数据中的丢失现象 | Epi-Impute利用单细胞ATAC-seq数据作为额外的信息来源，以减少丢失现象的数量，特别适用于稀疏的单细胞RNA-seq数据集 | NA | 提出一种新的方法来改进单细胞RNA-seq数据的缺失值填补 | 单细胞RNA-seq数据和单细胞ATAC-seq数据 | 数字病理学 | NA | NA | NA | RNA-seq数据 | NA |
| 128 | 2024-08-08 |
ERS International Congress 2022: highlights from the Basic and Translational Science Assembly
2023-Mar, ERJ open research
IF:4.3Q1
DOI:10.1183/23120541.00561-2022
PMID:37077558
|
综述 | 本文综述了2022年欧洲呼吸学会国际大会中基础与转化科学会议的亮点内容 | 提出了人类肺细胞图谱(HLCA)作为健康人类肺部的新参考点，并结合单细胞RNA测序和空间数据，发现了新的细胞类型/状态和生态位 | NA | 探讨呼吸事件从出生到老年对气候变化相关空气质量变化的影响，以及转化研究中确定的哮喘新治疗靶点和免疫调节机制 | 呼吸事件、气候变化、空气质量、肺部疾病、哮喘治疗 | 数字病理学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 空间数据 | NA |
| 129 | 2024-08-08 |
Sox11 is enriched in myogenic progenitors but dispensable for development and regeneration of skeletal muscle
2023-Mar-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.30.534956
PMID:37034612
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序数据分析，探讨了转录因子Sox11在肌肉干细胞分化和功能中的作用 | 发现Sox11在肌肉干细胞分化过程中表达增加，但在静止和衰老的肌肉干细胞中表达减少 | Sox11在肌肉发生中的具体功能尚未明确 | 研究Sox11在肌肉干细胞分化和肌肉再生中的作用 | 肌肉干细胞（MuSCs）及其在骨骼肌发育和再生中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 年轻和老年小鼠的肌肉再生样本 |
| 130 | 2024-08-08 |
Endothelial cells are a key target of IFN-g during response to combined PD-1/CTLA-4 ICB treatment in a mouse model of bladder cancer
2023-Mar-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.28.534561
PMID:37034778
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探索了在小鼠膀胱癌模型中，联合PD-1/CTLA-4免疫检查点阻断治疗对不同细胞类型的响应机制 | 首次揭示了内皮细胞在IFN-γ信号传导中作为ICB治疗响应的关键介质 | NA | 探索联合PD-1/CTLA-4免疫检查点阻断治疗在个体细胞类型中的响应机制 | 小鼠膀胱癌模型中的内皮细胞 | 数字病理学 | 膀胱癌 | scRNA-seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | 包含三种条件：未治疗的肿瘤、治疗的肿瘤和CD4+ T细胞耗竭后治疗的肿瘤 |
| 131 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome dataset of human and mouse in vitro adipogenesis models
2023-Mar-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.27.534456
PMID:37034809
|
研究论文 | 本文介绍了人类和小鼠体外脂肪形成模型的单细胞转录组数据集，通过单细胞RNA测序（scRNA-Seq）分析了3T3-L1和SGBS细胞在脂肪形成前后的转录变化。 | 首次提供了3T3-L1和SGBS细胞在脂肪形成过程中的单细胞转录组数据，有助于理解细胞间基因表达的变异性。 | NA | 研究人类和小鼠体外脂肪形成过程中的分子调控和细胞间基因表达的变异性。 | 3T3-L1和SGBS细胞在脂肪形成前后的转录变化。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 转录组数据 | 混合的3T3-L1和SGBS细胞 |
| 132 | 2024-08-05 |
exFINDER: identify external communication signals using single-cell transcriptomics data
2023-Mar-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.24.533888
PMID:37034624
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为exFINDER的方法，用于利用单细胞转录组数据识别细胞接收到的外部信号 | exFINDER通过利用信号通路的先验知识，能够发现激活特定目标基因的外部信号，并推断外部信号-靶标信号网络 | NA | 研究旨在开发一种方法识别通过单细胞转录组数据接收到的外部信号 | 使用不同物种的scRNA-seq数据集进行外部信号的识别和分析 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个不同物种的scRNA-seq数据集 |
| 133 | 2024-08-05 |
Single-Cell Sequencing-Based Validation of T Cell-Associated Diagnostic Model Genes and Drug Response in Crohn's Disease
2023-Mar-23, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24076054
PMID:37047025
|
研究论文 | 该研究旨在通过单细胞测序验证与T细胞相关的克罗恩病诊断模型基因及其药物反应 | 首次将单细胞表达谱数据与T细胞标记基因的诊断与药物反应相结合 | 样本数量较少，可能影响研究结果的广泛适用性 | 进一步探索克罗恩病的诊断及T细胞标记基因表达的药物预测 | 22例克罗恩病或正常样本的单细胞表达谱数据 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞测序 | TNF中心的5基因诊断模型 | 单细胞表达谱数据 | 22个样本 |
| 134 | 2024-08-05 |
Single-cell analysis of peripheral blood from high-altitude pulmonary hypertension patients identifies a distinct monocyte phenotype
2023-03-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-37527-4
PMID:37002243
|
研究论文 | 本文通过单细胞转录组学分析高海拔肺动脉高压患者的外周血，识别出一种独特的单核细胞表型 | 发现高海拔肺动脉高压患者外周血单核细胞的特定亚群体及其与缺氧诱导转录因子-1α的下调相关 | 关于其他免疫细胞类型的具体影响和机制尚未深入研究 | 探讨高海拔肺动脉高压患者外周循环中的免疫谱系 | 高海拔肺动脉高压患者的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞转录组学 | NA | 外周血单核细胞 | HAPH患者的外周血单核细胞样本 |
| 135 | 2024-08-08 |
Brassinosteroid gene regulatory networks at cellular resolution in the Arabidopsis root
2023-03-31, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adf4721
PMID:36996230
|
研究论文 | 本文通过时间序列单细胞RNA测序技术，研究了拟南芥根中细胞分辨率下的油菜素内酯基因调控网络，揭示了油菜素内酯在细胞增殖到伸长转变中的作用。 | 本文首次在单细胞分辨率下研究了油菜素内酯在拟南芥根中的基因调控网络，揭示了油菜素内酯信号网络在细胞增殖到伸长转变中的作用。 | NA | 研究油菜素内酯在拟南芥根中细胞分辨率下的基因调控网络及其在细胞生长中的作用。 | 拟南芥根中的油菜素内酯响应基因表达及其在不同细胞类型和发育阶段中的调控网络。 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 不同细胞类型和发育阶段的拟南芥根细胞 |
| 136 | 2024-08-05 |
SMASH: Scalable Method for Analyzing Spatial Heterogeneity of genes in spatial transcriptomics data
2023-Mar-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.23.533980
PMID:36993287
|
研究论文 | 本研究提出了一种名为SMASH的方法，用于分析空间转录组数据中的基因空间异质性 | SMASH是一种非参数方法，在计算需求和统计能力之间取得平衡，克服了现有方法的局限 | 未提及具体的局限性 | 旨在识别与细胞/点的空间位置变化相关的空间变异基因 | 采用不同平台的四个空间转录组数据集进行研究 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 非参数方法 | 基因表达数据 | 四个不同平台的空间转录组数据集 |
| 137 | 2024-08-08 |
Reprogramming anchorage dependency by adherent-to-suspension transition promotes metastatic dissemination
2023-03-30, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-023-01753-7
PMID:36991428
|
研究论文 | 本文研究了通过粘附到悬浮转变（AST）机制重新编程固体肿瘤细胞的锚定依赖性，促进肿瘤细胞的转移扩散 | 发现了一种生物现象AST，通过特定的造血转录调节因子将粘附细胞重新编程为悬浮细胞，这一机制被固体肿瘤细胞利用以扩散成循环肿瘤细胞（CTCs） | NA | 探索肿瘤细胞转移扩散过程中锚定依赖性的重新编程机制 | 乳腺癌和黑色素瘤的小鼠异种移植模型及新发转移患者的原发肿瘤、CTCs和转移瘤样本 | 数字病理学 | 乳腺癌, 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）, 组织染色 | NA | RNA | 乳腺癌和黑色素瘤的小鼠异种移植模型及新发转移患者的样本 |
| 138 | 2024-08-08 |
Clinical and biological heterogeneities in triple-negative breast cancer reveals a non-negligible role of HER2-low
2023-03-30, Breast cancer research : BCR
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s13058-023-01639-y
PMID:36998014
|
研究论文 | 本研究探讨了HER2-low在三阴性乳腺癌（TNBC）中的临床和生物学特性 | 首次详细比较了HER2-low和HER2-negative TNBC在临床特征和肿瘤生物学特性上的差异 | 研究样本量相对较小，可能影响结果的普遍性 | 探究HER2-low在三阴性乳腺癌中的临床和生物学影响 | 251名三阴性乳腺癌患者，包括157名HER2-low和94名HER2-negative患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 251名患者，其中157名HER2-low和94名HER2-negative |
| 139 | 2024-08-08 |
Understanding host response to infectious salmon anaemia virus in an Atlantic salmon cell line using single-cell RNA sequencing
2023-Mar-29, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-023-09254-z
PMID:36991327
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了大西洋鲑鱼细胞系在感染传染性鲑鱼贫血病毒（ISAV）后的转录组变化 | 首次使用单细胞RNA测序技术深入研究了ISAV感染早期阶段的宿主-病毒相互作用 | NA | 深入理解大西洋鲑鱼在ISAV感染期间的细胞反应和宿主-病毒相互作用 | 大西洋鲑鱼细胞系在ISAV感染后的转录组变化 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用了鲑鱼头部肾脏（SHK-1）细胞在ISAV感染后24小时、48小时和96小时的样本 |
| 140 | 2024-08-08 |
Supervised learning of high-confidence phenotypic subpopulations from single-cell data
2023-Mar-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.23.533712
PMID:36993424
|
研究论文 | 开发了一种名为PENCIL的监督学习框架，用于从单细胞数据中识别与表型相关的亚群 | 首次在框架中嵌入特征选择功能，实现同时选择信息特征和识别细胞亚群，提高了表型亚群识别的准确性 | NA | 准确识别从异质细胞群中与表型相关的细胞亚群，揭示驱动生物或临床表型的潜在机制 | 单细胞数据中的细胞亚群 | 机器学习 | NA | 监督学习 | PENCIL框架 | 单细胞数据 | 分析了100万个细胞 |