单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 329 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2024-08-04 |
APOL1 kidney risk variants in glomerular diseases modeled in transgenic mice
2023-Mar-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.27.534273
PMID:37090576
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研究论文 | 本文研究了携带APOL1肾脏风险变异的小鼠模型中肾小管病的特征 | 研究提出了两种小鼠模型，以展示APOL1-G1等位基因在肾小管疾病中的作用，并发现了潜在的新的肾小管损伤标记 | 缺乏在人类模型中的直接验证和对比 | 探讨APOL1基因变异对不同小鼠模型中肾脏疾病的影响 | 研究对象是HIV相关肾病（HIVAN）小鼠模型和接收到干扰素-γ的APOL1转基因小鼠 | 数字病理 | 肾脏疾病 | RNA测序 | 转基因小鼠 | RNA序列 | 不同类型的转基因小鼠样本（具体数量未提及） | NA | NA | NA | NA |
| 102 | 2024-08-05 |
Esm-1 mediates transcriptional polarization associated with diabetic kidney disease
2023-Mar-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.01.530562
PMID:36993439
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研究论文 | 本研究探讨了Esm-1在糖尿病肾病中的转录极化机制 | 揭示了Esm-1在糖尿病肾病发病机制中的作用及其在肾脏内皮细胞中的表达模式 | 未详细研究Esm-1在所有成熟组织中的表达及其潜在的生物学效应 | 研究Esm-1在糖尿病肾病中的表达和功能 | 研究对象包括成年人和小鼠的肾脏内皮细胞 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 27,786个肾脏内皮细胞，及20名健康受试者和41名糖尿病肾病患者 | NA | NA | NA | NA |
| 103 | 2024-08-05 |
Immature natural killer cells promote progression of triple-negative breast cancer
2023-03-08, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abl4414
PMID:36888695
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研究论文 | 这篇文章研究了不成熟的自然杀伤细胞在三阴性乳腺癌进展中的作用 | 识别了一种仅存在于三阴性乳腺癌样本中的不成熟NK细胞亚群，且其促进肿瘤进展的机制新颖 | 研究主要在小鼠模型中进行，临床转化需要进一步的验证 | 探讨自然杀伤细胞在三阴性乳腺癌中的潜在作用及机制 | 以多种三阴性乳腺癌和基底肿瘤样本为研究对象 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 样本 | 多个三阴性乳腺癌和基底肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 104 | 2024-08-05 |
Renal enhanced CT images reveal the tandem mechanism between tumor cells and immunocytes based on bulk/single-cell RNA sequencing
2023-Mar-18, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-023-01011-5
PMID:36933049
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研究论文 | 这篇文章探讨了代谢重编程在透明细胞肾癌中的作用，尤其是谷氨酰胺代谢对肿瘤微环境的影响 | 文章首次揭示了谷氨酰胺代谢在透明细胞肾癌的免疫微环境形成中的关键作用，并构建了有效的影像基因组模型 | 样本主要来源于公开数据库，可能存在选择偏差，且未能全面覆盖不同的肾癌亚型 | 研究透明细胞肾癌中谷氨酰胺代谢的作用及其对肿瘤微环境和免疫细胞浸润的影响 | 涉及539个透明细胞肾癌样本和59个正常样本的数据分析 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO-Cox回归模型 | 转录组数据 | 539个透明细胞肾癌样本和59个正常样本 | NA | NA | NA | NA |
| 105 | 2024-08-05 |
Aberrant cell state plasticity mediated by developmental reprogramming precedes colorectal cancer initiation
2023-03-29, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adf0927
PMID:36989360
|
研究论文 | 该文章探讨了细胞状态可塑性的改变如何在结直肠癌发生之前发挥作用 | 提出了通过再生活性和发育重编程介导的异常细胞状态可塑性在癌症发生前的作用 | 研究主要基于小鼠模型，临床应用需进一步验证 | 研究细胞状态可塑性在结直肠癌发生中的角色 | 基因工程和致癌物诱导的小鼠模型和患者样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因组数据 | 来自小鼠模型的前癌变病变和一个患者的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 106 | 2024-08-05 |
Dysregulated miRNAs modulate tumor microenvironment associated signaling networks in pancreatic ductal adenocarcinoma
2023-Mar, Precision clinical medicine
IF:5.1Q1
DOI:10.1093/pcmedi/pbad004
PMID:37007745
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研究论文 | 该文章探讨了微调miRNAs在胰腺导管腺癌(Tumor Microenvironment, TME)中的作用 | 本文创新性地重点分析了miRNAs如何影响胰腺导管腺癌微环境的信号网络，并提出了它们作为潜在的诊断和预后生物标志物的应用 | 研究主要集中于PDAC的miRNA表达，限制了对其他癌症类型的比较和理解 | 旨在深入理解miRNAs对胰腺导管腺癌微环境重塑的影响 | 主要研究来自胰腺导管腺癌患者的plasma和肿瘤组织中的miRNAs及其调控的信号通路 | 数字病理学 | 胰腺癌 | RNA-seq, miRNA-seq, 单细胞RNA-seq (scRNA-seq) | NA | RNA数据 | 在研究中涉及了PDAC患者的plasma和肿瘤组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 107 | 2024-08-05 |
Prognostic subtypes of thyroid cancer was constructed based on single cell and bulk-RNA sequencing data and verified its authenticity
2023-Mar-18, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-023-01027-x
PMID:36933059
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研究论文 | 通过单细胞和大规模RNA测序数据构建了甲状腺癌的预后亚型并验证其真实性 | 创新性地结合了单细胞RNA测序和全局RNA测序数据，构建了有效的预后模型并揭示了甲状腺癌的细胞微环境及肿瘤异质性 | 研究主要基于样本数据，对于临床广泛应用的验证仍需进一步研究 | 研究甲状腺癌的预后因素及其细胞微环境 | 23个甲状腺癌肿瘤样本的细胞类型及其微环境 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序(Sc-RNAseq) | NA | RNA数据 | 23个甲状腺癌肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 108 | 2024-08-05 |
Sortilin enhances fibrosis and calcification in aortic valve disease by inducing interstitial cell heterogeneity
2023-03-07, European heart journal
IF:37.6Q1
DOI:10.1093/eurheartj/ehac818
PMID:36660854
|
研究论文 | 本研究探讨了sortilin在钙化性主动脉瓣病（CAVD）病理生理中的作用及其对瓣膜间质细胞（VICs）转变的影响 | 首次识别sortilin作为钙化性主动脉瓣病中关键因素，并发现了一种新型的炎症肌成纤维细胞-成骨细胞混合表型（IMO-VIC） | 研究主要集中于小鼠模型，可能无法完全反映人类的疾病机制 | 阐明sortilin在主动脉瓣钙化中的作用及其潜在的治疗靶点 | 研究对象为主动脉瓣间质细胞（VICs）及其在钙化性主动脉瓣病中的转变 | 数字病理学 | 主动脉瓣疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 小鼠模型 | 生物样本（VICs） | 使用sortilin缺陷的小鼠模型和人类初级VIC样本，样本数量未具体说明 | NA | NA | NA | NA |
| 109 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics uncovers a non-autonomous Tbx1-dependent genetic program controlling cardiac neural crest cell development
2023-03-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-37015-9
PMID:36941249
|
研究论文 | 这篇文章揭示了一个非自主的Tbx1依赖的基因程序，该程序控制心脏神经嵴细胞的发展 | 首次使用单细胞RNA测序揭示了心脏神经嵴细胞的动态转变及其在Tbx1缺失下的非自主变化 | 未提及研究的限制 | 探讨心脏神经嵴细胞在发育过程中的命运动态 | 对照小鼠胚胎和Tbx1失活小鼠的神经嵴细胞进行单细胞RNA测序 | 数字病理学 | 先天性心脏病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 来自对照小鼠和Tbx1失活小鼠的神经嵴细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 110 | 2024-08-04 |
Conserved Transcriptome Features Define Prepubertal Primate Spermatogonial Stem Cells as Adark Spermatogonia and Identify Unique Regulators
2023-Mar-01, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24054755
PMID:36902187
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析未成熟的猕猴和狒狒睾丸细胞，探讨了人类前青春期生精干细胞的分子特征及调控因子 | 确定了前青春期人类生精干细胞的分子特征，并发现了新的调控通路，这可能有助于其体外选择和传播 | 尚未确定专门的生物标志物来明确识别前青春期生精干细胞 | 明确前青春期生精干细胞的分子身份 | 猕猴、狒狒与人类的生精干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 未成熟的猕猴和狒狒睾丸细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 111 | 2024-08-04 |
YAP1 and WWTR1 expression inversely correlates with neuroendocrine markers in Merkel cell carcinoma
2023-03-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI157171
PMID:36719743
|
研究论文 | 本文探讨了Merkel细胞癌（MCC）中YAP1和WWTR1的表达与神经内分泌标志物之间的反向关系 | 研究揭示了MCC中NE基因表达的异质性，并发现YAP1/WWTR1沉默对MCPyV阳性MCC的发展至关重要 | 目前的临床诊断标志物无法区分MCPyV阳性和阴性亚型，且MCC肿瘤的表达谱尚未探索 | 研究MCC的转录环境及其与YAP1和WWTR1的关系 | 针对来自患者的肿瘤活检和细胞系进行的RNA-Seq分析 | 数字病理学 | 皮肤癌 | RNA-Seq | NA | 转录组数据 | 多个肿瘤活检样本和细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 112 | 2024-08-04 |
Preclinical models for prediction of immunotherapy outcomes and immune evasion mechanisms in genetically heterogeneous multiple myeloma
2023-03, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-022-02178-3
PMID:36928817
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研究论文 | 本文介绍了一种反映多发性骨髓瘤遗传异质性的前临床模型，以预测免疫治疗结果和免疫逃逸机制 | 建立了包含八种MM病变的新型小鼠模型，揭示了与免疫检查点阻断反应相关的CD8 T细胞与T细胞的比例 | 未提及具体的实验样本来源和规模的局限性 | 探讨多发性骨髓瘤的遗传和免疫特点与治疗反应之间的关系 | 多发性骨髓瘤模型小鼠及相关临床患者的免疫反应 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞转录组学与功能检测 | 小鼠模型 | 生物样本和临床数据 | 约500只小鼠和约1000名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 113 | 2024-08-04 |
In Silico Localization of Perilymph Proteins Enriched in Meńier̀e Disease Using Mammalian Cochlear Single-cell Transcriptomics
2023-Mar, Otology & neurotology open
DOI:10.1097/ONO.0000000000000027
PMID:38516320
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研究论文 | 本研究利用哺乳动物耳蜗的单细胞转录组学定位梅尼埃病患者富集的外淋巴蛋白 | 研究首次通过单细胞转录组数据分析梅尼埃病相关的外淋巴蛋白与特定耳蜗细胞类型的关联 | 目前对人类内耳疾病的理解有限，可能影响结果的广泛适用性 | 研究梅尼埃病患者外淋巴蛋白的表达与耳蜗特定细胞类型的关联 | 梅尼埃病患者的外淋巴蛋白及其在耳蜗细胞中的表达 | 数字病理学 | 梅尼埃病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个梅尼埃病患者及对照样本数据 | NA | NA | NA | NA |
| 114 | 2024-08-07 |
RNA sequencing of single allergen-specific memory B cells after grass pollen immunotherapy: Two unique cell fates and CD29 as a biomarker for treatment effect
2023-03, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.15529
PMID:36153670
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了草花粉免疫治疗后特异性记忆B细胞的变化，并探讨了CD29作为治疗效果生物标志物的可能性 | 首次揭示了草花粉免疫治疗后特异性记忆B细胞存在两种独特的转录特征，并发现CD29可作为治疗效果的早期生物标志物 | 研究样本量较小，仅涉及四名患者，可能影响结果的普遍性 | 探讨草花粉免疫治疗对特异性记忆B细胞的影响及其作为治疗效果生物标志物的潜力 | 特异性记忆B细胞及其表面蛋白表达变化 | NA | 过敏性鼻炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 27名对黑麦草花粉敏感且患有季节性鼻炎的患者 | NA | NA | NA | NA |
| 115 | 2024-08-07 |
A Refined Single Cell Landscape of Haematopoiesis in the Mouse Foetal Liver
2023-Mar-23, Journal of developmental biology
IF:2.2Q3
DOI:10.3390/jdb11020015
PMID:37092477
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，对小鼠胎肝中的造血细胞进行了精细的细胞图谱构建 | 发现了小鼠胎肝中一种类似于人类已知的胎盘中等血红蛋白特征，以及一种先前未被识别的原始红细胞群 | NA | 获得胎肝中造血细胞的精细单细胞图谱 | 小鼠胎肝中的造血细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 包括了比先前数据集更多的细胞的E12.5小鼠胎肝样本 | NA | NA | NA | NA |
| 116 | 2024-08-07 |
Plasticity in airway smooth muscle differentiation during mouse lung development
2023-03-13, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.02.002
PMID:36868232
|
研究论文 | 研究探讨了在小鼠肺部发育过程中，平滑肌分化对气道上皮分支形态的影响 | 发现胚胎期气道平滑肌表现出可塑性，并证实合成型平滑肌层促进气道分支形态发生 | NA | 探究平滑肌分化在肺部发育中的作用及其机制 | 小鼠胚胎肺部平滑肌分化 | NA | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | Srf基因缺失的小鼠胚胎肺部样本 | NA | NA | NA | NA |
| 117 | 2024-08-04 |
Nephronectin is required to maintain right lung lobar separation during embryonic development
2023-03-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00505.2021
PMID:36719987
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研究论文 | 本研究探讨了Nephronectin在胚胎发育过程中维持右肺叶分离的作用 | 首次揭示了Nephronectin通过整合素α8维持右肺叶分离的机制 | 研究主要基于小鼠模型，可能不完全适用于其他生物 | 研究Nephronectin在肺发育中的潜在角色 | 使用全身敲除的小鼠胚胎进行研究 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 生物样本 | 使用的样本为敲除小鼠胚胎和成年的肺组织 | NA | NA | NA | NA |
| 118 | 2024-08-07 |
Haplotype-aware analysis of somatic copy number variations from single-cell transcriptomes
2023-03, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-022-01468-y
PMID:36163550
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Numbat的计算方法，该方法结合了从群体分型中获得的单细胞转录组中的等位基因和表达信号，以增强对拷贝数变异的检测 | Numbat利用亚克隆之间的进化关系，迭代推断单细胞拷贝数谱和肿瘤克隆系统发育，无需样本匹配的DNA数据或先验基因分型 | NA | 开发一种新的计算方法，以提高从单细胞转录组中检测拷贝数变异的准确性 | 单细胞转录组中的拷贝数变异 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤，胃癌，乳腺癌，甲状腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 22个肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 119 | 2024-08-07 |
Tubular-specific expression of HIV protein Vpr leads to severe tubulointerstitial damage accompanied by progressive fibrosis and cystic development
2023-03, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2022.12.012
PMID:36565808
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研究论文 | 本研究利用一种新型诱导性管状上皮细胞特异性Vpr转基因小鼠模型，展示了Vpr表达导致渐进性管间质损伤、间质炎症和纤维化以及管状囊肿发展的过程 | 首次详细研究了Vpr在体内的管状损伤和慢性肾脏疾病（CKD）发病机制，并揭示了Vpr介导的转录组响应在特定管状亚群中的作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中进行验证 | 探讨HIV病毒蛋白Vpr在管状细胞中的表达对肾脏疾病进展和纤维化的影响 | HIV病毒蛋白Vpr在管状上皮细胞中的表达及其对肾脏疾病的影响 | NA | 慢性肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | 转基因小鼠模型 | RNA | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 120 | 2024-08-07 |
Glioma epileptiform activity and progression are driven by IGSF3-mediated potassium dysregulation
2023-03-01, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2023.01.013
PMID:36787748
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研究论文 | 本研究探讨了恶性胶质瘤中癫痫样活动和进展的分子机制，发现IGSF3介导的钾失调是关键因素 | 首次揭示了IGSF3通过与Kir4.1相互作用抑制钾缓冲，导致肿瘤进展和癫痫样活动 | NA | 探究恶性胶质瘤中癫痫样活动和肿瘤进展的分子机制 | 恶性胶质瘤患者肿瘤中的基因表达和神经电路功能 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | scRNA-seq, ECoG记录 | NA | 基因表达数据, 电生理数据 | 人类和鼠类样本 | NA | NA | NA | NA |