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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2024-08-07 |
A Refined Single Cell Landscape of Haematopoiesis in the Mouse Foetal Liver
2023-Mar-23, Journal of developmental biology
IF:2.2Q3
DOI:10.3390/jdb11020015
PMID:37092477
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,对小鼠胎肝中的造血细胞进行了精细的细胞图谱构建 | 发现了小鼠胎肝中一种类似于人类已知的胎盘中等血红蛋白特征,以及一种先前未被识别的原始红细胞群 | NA | 获得胎肝中造血细胞的精细单细胞图谱 | 小鼠胎肝中的造血细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 包括了比先前数据集更多的细胞的E12.5小鼠胎肝样本 | NA | NA | NA | NA |
| 102 | 2024-08-07 |
Single-Cell Kinetic Modeling of β-Lapachone Metabolism in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
2023-Mar-17, Antioxidants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antiox12030741
PMID:36978989
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据,模拟了β-拉帕醌在头颈鳞状细胞癌中的代谢过程,并分析了其在肿瘤和健康组织中的细胞反应异质性 | 首次利用单细胞RNA测序数据进行系统级模拟,揭示了β-拉帕醌治疗引起的氧化应激反应在健康和恶性细胞模型中的差异 | 研究仅基于10个HNSCC患者肿瘤的转录组数据,样本量较小 | 探究头颈鳞状细胞癌中β-拉帕醌代谢的细胞反应异质性 | 头颈鳞状细胞癌中的β-拉帕醌代谢 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 10个HNSCC患者肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 103 | 2024-08-07 |
Plasticity in airway smooth muscle differentiation during mouse lung development
2023-03-13, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.02.002
PMID:36868232
|
研究论文 | 研究探讨了在小鼠肺部发育过程中,平滑肌分化对气道上皮分支形态的影响 | 发现胚胎期气道平滑肌表现出可塑性,并证实合成型平滑肌层促进气道分支形态发生 | NA | 探究平滑肌分化在肺部发育中的作用及其机制 | 小鼠胚胎肺部平滑肌分化 | NA | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | Srf基因缺失的小鼠胚胎肺部样本 | NA | NA | NA | NA |
| 104 | 2024-08-07 |
Endothelial and Leptin Receptor+ cells promote the maintenance of stem cells and hematopoiesis in early postnatal murine bone marrow
2023-03-13, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.02.003
PMID:36868235
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了出生后4天、14天和8周的小鼠骨髓基质细胞,探讨了早期新生小鼠骨髓中内皮细胞和瘦素受体阳性细胞在造血干细胞和造血维持中的作用。 | 首次详细描述了早期新生小鼠骨髓中瘦素受体阳性细胞和内皮细胞在造血干细胞和造血维持中的作用,并揭示了这些细胞表达的干细胞因子在不同造血阶段的作用。 | NA | 探究早期新生小鼠骨髓中内皮细胞和瘦素受体阳性细胞在造血干细胞和造血维持中的作用。 | 小鼠骨髓中的内皮细胞和瘦素受体阳性细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 出生后4天、14天和8周的小鼠骨髓基质细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 105 | 2024-08-07 |
Tumor PD-L1 engages myeloid PD-1 to suppress type I interferon to impair cytotoxic T lymphocyte recruitment
2023-03-13, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2023.02.005
PMID:36917954
|
研究论文 | 研究揭示了肿瘤细胞PD-L1通过与骨髓细胞PD-1相互作用,抑制I型干扰素信号通路,从而影响细胞毒性T淋巴细胞在肺转移中的招募 | 首次报道了肿瘤细胞PD-L1通过与骨髓细胞PD-1结合,激活SHP2,抑制I型干扰素和STAT1信号通路,减少Cxcl9表达,从而影响细胞毒性T淋巴细胞在肺转移中的招募 | 研究主要在肿瘤小鼠模型中进行,尚未在人体中验证 | 探讨肿瘤细胞PD-L1在肿瘤免疫逃逸中的分子机制 | 肿瘤细胞PD-L1、骨髓细胞PD-1、细胞毒性T淋巴细胞 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及肿瘤小鼠模型和人类癌症患者 | NA | NA | NA | NA |
| 106 | 2024-08-04 |
Nephronectin is required to maintain right lung lobar separation during embryonic development
2023-03-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00505.2021
PMID:36719987
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研究论文 | 本研究探讨了Nephronectin在胚胎发育过程中维持右肺叶分离的作用 | 首次揭示了Nephronectin通过整合素α8维持右肺叶分离的机制 | 研究主要基于小鼠模型,可能不完全适用于其他生物 | 研究Nephronectin在肺发育中的潜在角色 | 使用全身敲除的小鼠胚胎进行研究 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 生物样本 | 使用的样本为敲除小鼠胚胎和成年的肺组织 | NA | NA | NA | NA |
| 107 | 2024-08-07 |
Haplotype-aware analysis of somatic copy number variations from single-cell transcriptomes
2023-03, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-022-01468-y
PMID:36163550
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为Numbat的计算方法,该方法结合了从群体分型中获得的单细胞转录组中的等位基因和表达信号,以增强对拷贝数变异的检测 | Numbat利用亚克隆之间的进化关系,迭代推断单细胞拷贝数谱和肿瘤克隆系统发育,无需样本匹配的DNA数据或先验基因分型 | NA | 开发一种新的计算方法,以提高从单细胞转录组中检测拷贝数变异的准确性 | 单细胞转录组中的拷贝数变异 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤,胃癌,乳腺癌,甲状腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 22个肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 108 | 2024-08-07 |
Tubular-specific expression of HIV protein Vpr leads to severe tubulointerstitial damage accompanied by progressive fibrosis and cystic development
2023-03, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2022.12.012
PMID:36565808
|
研究论文 | 本研究利用一种新型诱导性管状上皮细胞特异性Vpr转基因小鼠模型,展示了Vpr表达导致渐进性管间质损伤、间质炎症和纤维化以及管状囊肿发展的过程 | 首次详细研究了Vpr在体内的管状损伤和慢性肾脏疾病(CKD)发病机制,并揭示了Vpr介导的转录组响应在特定管状亚群中的作用 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中进行验证 | 探讨HIV病毒蛋白Vpr在管状细胞中的表达对肾脏疾病进展和纤维化的影响 | HIV病毒蛋白Vpr在管状上皮细胞中的表达及其对肾脏疾病的影响 | NA | 慢性肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | 转基因小鼠模型 | RNA | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 109 | 2024-08-07 |
Glioma epileptiform activity and progression are driven by IGSF3-mediated potassium dysregulation
2023-03-01, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2023.01.013
PMID:36787748
|
研究论文 | 本研究探讨了恶性胶质瘤中癫痫样活动和进展的分子机制,发现IGSF3介导的钾失调是关键因素 | 首次揭示了IGSF3通过与Kir4.1相互作用抑制钾缓冲,导致肿瘤进展和癫痫样活动 | NA | 探究恶性胶质瘤中癫痫样活动和肿瘤进展的分子机制 | 恶性胶质瘤患者肿瘤中的基因表达和神经电路功能 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | scRNA-seq, ECoG记录 | NA | 基因表达数据, 电生理数据 | 人类和鼠类样本 | NA | NA | NA | NA |
| 110 | 2024-08-07 |
Tubular Epithelial Cell HMGB1 Promotes AKI-CKD Transition by Sensitizing Cycling Tubular Cells to Oxidative Stress: A Rationale for Targeting HMGB1 during AKI Recovery
2023-03-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000000000024
PMID:36857499
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研究论文 | 本文研究了高迁移率族蛋白B1(HMGB1)在管状上皮细胞中通过使循环中的管状细胞对氧化应激敏感,从而促进急性肾损伤(AKI)向慢性肾脏病(CKD)的转变,并提出针对HMGB1在AKI恢复期间的治疗策略。 | 本文首次提出细胞内HMGB1通过降低管状细胞对长时间缺血应激的适应性,从而在AKI-CKD转变中发挥作用,并探讨了针对细胞内和细胞外HMGB1的治疗潜力。 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,需要进一步的人体研究来验证这些发现。 | 探讨HMGB1在AKI向CKD转变中的作用,并寻找新的治疗策略。 | 研究对象包括人及小鼠的急性肾损伤和慢性肾脏病。 | NA | 肾脏病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 涉及人及小鼠的AKI和CKD样本,具体数量未详细说明。 | NA | NA | NA | NA |
| 111 | 2024-08-07 |
Lysyl oxidase regulates epithelial differentiation and barrier integrity in eosinophilic esophagitis
2023-Mar-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.27.534387
PMID:37034590
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研究论文 | 本文研究了赖氨酰氧化酶(LOX)在嗜酸性食管炎(EoE)中调控上皮细胞分化和屏障完整性的功能 | 首次揭示了LOX在食管上皮细胞中的非经典信号分子作用,通过激活骨形态发生蛋白(BMP)途径维持上皮稳态 | NA | 探究LOX在嗜酸性食管炎中对上皮细胞分化和屏障完整性的调控作用 | 人食管上皮细胞 | NA | 嗜酸性食管炎 | 单细胞RNA测序,定量逆转录-聚合酶链反应,蛋白质印迹,组织学 | NA | RNA | 患者来源的类器官 | NA | NA | NA | NA |
| 112 | 2024-08-07 |
A TREM2-activating antibody with a blood-brain barrier transport vehicle enhances microglial metabolism in Alzheimer's disease models
2023-03, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-022-01240-0
PMID:36635496
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研究论文 | 本文描述了一种高亲和力的人源TREM2激活抗体,该抗体通过单价的转铁蛋白受体(TfR)结合位点工程化,称为抗体运输载体(ATV),以促进血脑屏障的转运,从而增强阿尔茨海默病模型中的小胶质细胞代谢。 | 开发了一种新型的高亲和力TREM2激活抗体,结合了抗体运输载体(ATV)技术,以改善血脑屏障的穿透性和小胶质细胞的代谢活性。 | NA | 探索通过激活TREM2受体来改善阿尔茨海默病患者脑内小胶质细胞功能和代谢的治疗策略。 | TREM2激活抗体及其在阿尔茨海默病模型中的应用。 | 生物技术 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用人诱导多能干细胞(iPSC)衍生的小胶质细胞和阿尔茨海默病小鼠模型进行研究。 | NA | NA | NA | NA |
| 113 | 2024-08-04 |
LINE-1 retrotransposon expression in cancerous, epithelial and neuronal cells revealed by 5' single-cell RNA-Seq
2023-03-21, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad049
PMID:36744437
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研究论文 | 本研究开发了一种新方法以测量癌细胞、上皮细胞和神经细胞中LINE-1逆转录子表达 | 提出了5' scL1seq方法,能够在成千上万的单细胞中测量LINE-1的表达,并发现了人类上皮细胞和小鼠海马神经元中的LINE-1表达 | 缺乏对LINE-1在健康与疾病中作用的全面理解 | 准确理解LINE-1在不同细胞中的表达及其与衰老相关疾病的联系 | 癌细胞、上皮细胞和神经细胞 | 数字病理学 | 衰老相关疾病 | 5'单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA数据 | 成千上万的单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 114 | 2024-08-04 |
Inhibition of a signaling modality within the gp130 receptor enhances tissue regeneration and mitigates osteoarthritis
2023-03-22, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abq2395
PMID:36947594
|
研究论文 | 该研究探讨了gp130受体内一种信号方式的抑制如何促进组织再生并减轻骨关节炎 | 通过对gp130的Y814位点的遗传和药理干预,首次明确了其在组织再生中的关键作用 | 研究主要集中于小鼠和大鼠,可能无法完全应用于人体 | 旨在探讨如何增强组织再生能力和减轻骨关节炎的机制 | 研究对象为gp130受体及其在小鼠和大鼠模型中的作用 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 药理调节和基因编辑 | 小鼠模型和大鼠模型 | 单细胞测序数据 | 小鼠和大鼠的样本数量未具体说明 | NA | NA | NA | NA |
| 115 | 2024-08-04 |
A cofunctional grouping-based approach for non-redundant feature gene selection in unannotated single-cell RNA-seq analysis
2023-03-19, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad042
PMID:36754847
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研究论文 | 本研究开发了一种新颖的计算方法GeneClust,用于选择scRNA-seq细胞聚类的特征基因 | 该方法通过基因表达谱对基因进行分组,并旨在最大化相关性、最小化冗余和保持互补性 | 未提及研究限制 | 研究目标是改善单细胞RNA测序分析中的细胞聚类性能 | 研究对象是在未注释的单细胞RNA测序数据集中的特征基因 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 116 | 2024-08-05 |
Astroglial toxicity promotes synaptic degeneration in the thalamocortical circuit in frontotemporal dementia with GRN mutations
2023-03-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI164919
PMID:36602862
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研究论文 | 这篇文章揭示了在有GRN突变的额叶前额叶痴呆中,星形胶质细胞的毒性促进了丘脑皮层回路的突触退化 | 本研究首次揭示了一种在FTLD-GRN中未被充分认识的星形胶质细胞病理过程,揭示了其在神经退行性病理中的关键机制 | 尽管该研究通过小鼠和人类患者的单细胞转录组学进行了比较,但仍需更多临床数据验证 | 探讨GRN突变引起的星形胶质细胞毒性如何影响丘脑皮层回路中的突触退化 | 该研究对象包括Grn-/-小鼠和FTLD-GRN患者的丘脑和额叶皮层 | 数字病理学 | 额叶前额叶痴呆 | 单细胞转录组学 | 小鼠模型 | 转录组数据 | 研究包括Grn-/-小鼠和FTLD-GRN患者的样本,具体数量未提及 | NA | NA | NA | NA |
| 117 | 2024-08-07 |
HIV Infection Elicits Differential Transcriptomic Remodeling in CD4+ T Cells with Variable Proliferative Responses to the T Cell Receptor Stimulus
2023-Mar-24, Pathogens (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/pathogens12040511
PMID:37111397
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研究论文 | 研究了HIV感染初期在不同增殖反应的CD4+ T细胞中引起的转录组重塑 | 识别了HIV感染初期在不同增殖状态细胞中引起的转录变化,这些变化可能与潜伏感染细胞的标记物一致 | 研究仅限于特定细胞类型和感染初期的转录变化,未涵盖整个潜伏库 | 为了更好地理解潜伏建立前的细胞环境,研究HIV感染初期在不同增殖反应的CD4+ T细胞中引起的转录组重塑 | CD4+ T细胞在HIV感染初期的转录组变化 | 数字病理学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 不同增殖状态的CD4+ T细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 118 | 2024-08-05 |
Comparative analysis between single-cell RNA-seq and single-molecule RNA FISH indicates that the pyrimidine nucleobase idoxuridine (IdU) globally amplifies transcriptional noise
2023-Mar-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.14.532632
PMID:36993609
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研究论文 | 这篇文章比较了单细胞RNA测序和单分子RNA FISH,表明嘧啶核苷酸类似物IdU可全局放大转录噪声 | 研究表明IdU作为全局穿透性的噪声增强分子,能够推动对转录噪声生理影响的研究 | 单细胞RNA测序的技术缺陷可能掩盖IdU诱导的转录噪声放大的结果 | 量化IdU诱导噪声放大在全局与部分渗透性之间的差异 | 对来自全转录组的多个基因进行的RNA噪声量化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和单分子RNA FISH (smFISH) | NA | RNA数据 | 大约90%的基因 | NA | NA | NA | NA |
| 119 | 2024-08-05 |
Cell composition inference and identification of layer-specific spatial transcriptional profiles with POLARIS
2023-03, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.add9818
PMID:36857450
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研究论文 | 本文介绍了一种称为POLARIS的空间转录组学分析方法 | POLARIS方法能够进行细胞类型去卷积,并能从组织学图像推断细胞组成及鉴定层特异性差异表达基因 | 该方法的应用仍依赖于高质量的组织学图像数据 | 研究空间转录组学技术在健康和疾病相关关键生物过程中的应用 | 四种组织的细胞组成和差异表达基因 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 组织学图像 | 四种组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 120 | 2024-08-05 |
SODB facilitates comprehensive exploration of spatial omics data
2023-03, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-023-01773-7
PMID:36797409
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研究论文 | 本文介绍了一个名为空间组学数据库(SODB)的网络平台,该平台提供丰富的数据资源和交互式数据分析模块 | SODB提供了一种统一的数据格式,兼容多种计算软件包,并介绍了独特的空间组学视图模块(SOView),能够更好地分析和展示空间组学数据 | 可能尚未涵盖所有空间组学技术的实验数据 | 构建一个整合空间组学数据的数据库和分析工具 | 来自25种以上空间组学技术的2400多个实验数据 | 数字病理学 | NA | 空间组学 | NA | 实验数据 | 超过2400个实验 | NA | NA | NA | NA |