单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 329 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2024-08-05 |
Loss of MC1R signaling implicates TBX3 in pheomelanogenesis and melanoma predisposition
2023-Mar-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.10.532018
PMID:37090624
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研究论文 | 本研究揭示了MC1R信号传导缺失如何通过TBX3影响红色头发颜色（RHC）性状和黑色素瘤的易感性 | 首次发现TBX3在红色头发颜色性状中的作用，并揭示其与黑色素瘤易感性之间的关系 | 研究主要基于小鼠模型，结果是否完全适用于人类尚需进一步验证 | 探究MC1R信号传导缺失如何通过改变黑色素生成影响黑色素瘤的易感性 | 研究对象为来自RHC小鼠模型的黑素细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因数据 | 通过RHC小鼠模型提取的黑素细胞 |
| 62 | 2024-08-05 |
Immature natural killer cells promote progression of triple-negative breast cancer
2023-03-08, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abl4414
PMID:36888695
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研究论文 | 这篇文章研究了不成熟的自然杀伤细胞在三阴性乳腺癌进展中的作用 | 识别了一种仅存在于三阴性乳腺癌样本中的不成熟NK细胞亚群，且其促进肿瘤进展的机制新颖 | 研究主要在小鼠模型中进行，临床转化需要进一步的验证 | 探讨自然杀伤细胞在三阴性乳腺癌中的潜在作用及机制 | 以多种三阴性乳腺癌和基底肿瘤样本为研究对象 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 样本 | 多个三阴性乳腺癌和基底肿瘤样本 |
| 63 | 2024-08-05 |
MerlinS13 phosphorylation controls meningioma Wnt signaling and magnetic resonance imaging features
2023-Mar-14, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2577844/v1
PMID:36993679
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研究论文 | 本研究揭示了Merlin S13磷酸化对脑膜瘤Wnt信号传导和MRI特征的影响 | 本研究首次明确了Merlin在维持脑膜瘤Wnt信号传导中的作用并提出了一种新的非侵入性影像生物标志物 | 研究中对Merlin完整性的生物化学机制仍存在一定的不完全理解 | 探讨脑膜瘤中Merlin的生化机制及其临床结果的预测 | 研究对象包括脑膜瘤细胞、异种移植模型及人类患者 | 数字病理学 | 脑膜瘤 | 单细胞RNA测序、亲近标记蛋白质组学质谱 | NA | 影像 | 涉及人类患者及异种移植模型的研究样本 |
| 64 | 2024-08-05 |
Renal enhanced CT images reveal the tandem mechanism between tumor cells and immunocytes based on bulk/single-cell RNA sequencing
2023-Mar-18, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-023-01011-5
PMID:36933049
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研究论文 | 这篇文章探讨了代谢重编程在透明细胞肾癌中的作用，尤其是谷氨酰胺代谢对肿瘤微环境的影响 | 文章首次揭示了谷氨酰胺代谢在透明细胞肾癌的免疫微环境形成中的关键作用，并构建了有效的影像基因组模型 | 样本主要来源于公开数据库，可能存在选择偏差，且未能全面覆盖不同的肾癌亚型 | 研究透明细胞肾癌中谷氨酰胺代谢的作用及其对肿瘤微环境和免疫细胞浸润的影响 | 涉及539个透明细胞肾癌样本和59个正常样本的数据分析 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO-Cox回归模型 | 转录组数据 | 539个透明细胞肾癌样本和59个正常样本 |
| 65 | 2024-08-04 |
Identifying strengths and weaknesses of methods for computational network inference from single-cell RNA-seq data
2023-03-09, G3 (Bethesda, Md.)
DOI:10.1093/g3journal/jkad004
PMID:36626328
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研究论文 | 本文对十一种近期的网络推断方法在七个已发布的单细胞RNA测序数据集上的性能进行评估 | 扩展的基准研究评估了不同类型的黄金标准网络和评估指标 | 推断网络准确性的改进方法和更好的黄金标准仍然需要 | 研究不同方法在单细胞RNA测序数据上推断转录基因调控网络的有效性 | 评估十一种方法在不同物种（人类、小鼠和酵母）上处理的scRNA-seq数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | SCENIC, PIDC, MERLIN, Correlation | 转录组数据 | 七个已发布的数据集 |
| 66 | 2024-08-05 |
Aberrant cell state plasticity mediated by developmental reprogramming precedes colorectal cancer initiation
2023-03-29, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adf0927
PMID:36989360
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研究论文 | 该文章探讨了细胞状态可塑性的改变如何在结直肠癌发生之前发挥作用 | 提出了通过再生活性和发育重编程介导的异常细胞状态可塑性在癌症发生前的作用 | 研究主要基于小鼠模型，临床应用需进一步验证 | 研究细胞状态可塑性在结直肠癌发生中的角色 | 基因工程和致癌物诱导的小鼠模型和患者样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因组数据 | 来自小鼠模型的前癌变病变和一个患者的样本 |
| 67 | 2024-08-05 |
Dysregulated miRNAs modulate tumor microenvironment associated signaling networks in pancreatic ductal adenocarcinoma
2023-Mar, Precision clinical medicine
IF:5.1Q1
DOI:10.1093/pcmedi/pbad004
PMID:37007745
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研究论文 | 该文章探讨了微调miRNAs在胰腺导管腺癌(Tumor Microenvironment, TME)中的作用 | 本文创新性地重点分析了miRNAs如何影响胰腺导管腺癌微环境的信号网络，并提出了它们作为潜在的诊断和预后生物标志物的应用 | 研究主要集中于PDAC的miRNA表达，限制了对其他癌症类型的比较和理解 | 旨在深入理解miRNAs对胰腺导管腺癌微环境重塑的影响 | 主要研究来自胰腺导管腺癌患者的plasma和肿瘤组织中的miRNAs及其调控的信号通路 | 数字病理学 | 胰腺癌 | RNA-seq, miRNA-seq, 单细胞RNA-seq (scRNA-seq) | NA | RNA数据 | 在研究中涉及了PDAC患者的plasma和肿瘤组织样本 |
| 68 | 2024-08-05 |
Integrated transcriptomics contrasts fatty acid metabolism with hypoxia response in β-cell subpopulations associated with glycemic control
2023-Mar-28, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-023-09232-5
PMID:36978008
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研究论文 | 本研究整合了胰岛单细胞和整体RNA测序数据，以识别与糖尿病相关的β细胞亚群。 | 通过整合单细胞和整体胰岛转录组，该研究探索了β细胞异质性，识别出新的亚群和与肥胖相关的遗传通路。 | 本研究的限制在于主要基于小鼠模型，可能无法完全反映人类的β细胞功能。 | 研究不同β细胞功能对糖尿病的影响，为疗法开发提供信息。 | 本研究主要针对胰腺β细胞亚群在肥胖小鼠中的基因表达特征。 | 数字病理学 | 糖尿病 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了SM/J小鼠的单细胞和整体RNA测序数据 |
| 69 | 2024-08-05 |
Prognostic subtypes of thyroid cancer was constructed based on single cell and bulk-RNA sequencing data and verified its authenticity
2023-Mar-18, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-023-01027-x
PMID:36933059
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研究论文 | 通过单细胞和大规模RNA测序数据构建了甲状腺癌的预后亚型并验证其真实性 | 创新性地结合了单细胞RNA测序和全局RNA测序数据，构建了有效的预后模型并揭示了甲状腺癌的细胞微环境及肿瘤异质性 | 研究主要基于样本数据，对于临床广泛应用的验证仍需进一步研究 | 研究甲状腺癌的预后因素及其细胞微环境 | 23个甲状腺癌肿瘤样本的细胞类型及其微环境 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序(Sc-RNAseq) | NA | RNA数据 | 23个甲状腺癌肿瘤样本 |
| 70 | 2024-08-05 |
Sortilin enhances fibrosis and calcification in aortic valve disease by inducing interstitial cell heterogeneity
2023-03-07, European heart journal
IF:37.6Q1
DOI:10.1093/eurheartj/ehac818
PMID:36660854
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研究论文 | 本研究探讨了sortilin在钙化性主动脉瓣病（CAVD）病理生理中的作用及其对瓣膜间质细胞（VICs）转变的影响 | 首次识别sortilin作为钙化性主动脉瓣病中关键因素，并发现了一种新型的炎症肌成纤维细胞-成骨细胞混合表型（IMO-VIC） | 研究主要集中于小鼠模型，可能无法完全反映人类的疾病机制 | 阐明sortilin在主动脉瓣钙化中的作用及其潜在的治疗靶点 | 研究对象为主动脉瓣间质细胞（VICs）及其在钙化性主动脉瓣病中的转变 | 数字病理学 | 主动脉瓣疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 小鼠模型 | 生物样本（VICs） | 使用sortilin缺陷的小鼠模型和人类初级VIC样本，样本数量未具体说明 |
| 71 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics uncovers a non-autonomous Tbx1-dependent genetic program controlling cardiac neural crest cell development
2023-03-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-37015-9
PMID:36941249
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研究论文 | 这篇文章揭示了一个非自主的Tbx1依赖的基因程序，该程序控制心脏神经嵴细胞的发展 | 首次使用单细胞RNA测序揭示了心脏神经嵴细胞的动态转变及其在Tbx1缺失下的非自主变化 | 未提及研究的限制 | 探讨心脏神经嵴细胞在发育过程中的命运动态 | 对照小鼠胚胎和Tbx1失活小鼠的神经嵴细胞进行单细胞RNA测序 | 数字病理学 | 先天性心脏病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 来自对照小鼠和Tbx1失活小鼠的神经嵴细胞 |
| 72 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing identifies hippocampal microglial dysregulation in diet-induced obesity
2023-Mar-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.106164
PMID:36915697
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序研究饮食诱导肥胖下海马微胶质细胞的失调 | 利用小鼠高脂饮食模型揭示饮食诱导肥胖对海马微胶质细胞活化的深刻影响 | 关于肥胖期间微胶质细胞活化的确切机制尚未完全理解 | 探讨肥胖对海马微胶质细胞的影响及其与认知障碍之间的关系 | 肥胖小鼠模型中的海马微胶质细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 研究了饮食诱导肥胖下的海马微胶质细胞，在高脂饮食下观察了不同时间点的变化 |
| 73 | 2024-08-05 |
Extracellular vesicle distribution and localization in skeletal muscle at rest and following disuse atrophy
2023-03-10, Skeletal muscle
IF:5.3Q2
DOI:10.1186/s13395-023-00315-1
PMID:36895061
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研究论文 | 本研究调查了静息及失用萎缩后骨骼肌中的细胞外囊泡分布和定位 | 本文首次揭示了α-鞘糖蛋白和miR-1在血清细胞外囊泡中不可检测，并且细胞外囊泡生物发生因子在多种骨骼肌细胞类型中表达 | 在大鼠的尾部悬置实验中，未发现血清细胞外囊泡浓度的变化 | 调查骨骼肌中细胞外囊泡的生物发生因子、标记物表达及其在细胞类型中的定位 | 研究对象为大鼠和人类模型中的骨骼肌细胞外囊泡 | 数字病理 | NA | qPCR、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、荧光相关光谱测量、免疫组化 | NA | 血清样本 | 在大鼠和人类模型中均涉及样本 |
| 74 | 2024-08-04 |
Conserved Transcriptome Features Define Prepubertal Primate Spermatogonial Stem Cells as Adark Spermatogonia and Identify Unique Regulators
2023-Mar-01, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24054755
PMID:36902187
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析未成熟的猕猴和狒狒睾丸细胞，探讨了人类前青春期生精干细胞的分子特征及调控因子 | 确定了前青春期人类生精干细胞的分子特征，并发现了新的调控通路，这可能有助于其体外选择和传播 | 尚未确定专门的生物标志物来明确识别前青春期生精干细胞 | 明确前青春期生精干细胞的分子身份 | 猕猴、狒狒与人类的生精干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 未成熟的猕猴和狒狒睾丸细胞 |
| 75 | 2024-08-05 |
Accurate estimation of rare cell type fractions from tissue omics data via hierarchical deconvolution
2023-Mar-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.15.532820
PMID:36993280
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研究论文 | 提出了一种新的Hierarchical Deconvolution方法以准确估计组织样本中稀有细胞类型的比例 | 该方法采用单细胞RNA测序参考和层次细胞类型树，能够在相关细胞类型之间传递信息并改进稀有细胞的比例估计 | 现有方法对于细胞类型不明显的组织样本估计困难 | 提高组织样本中细胞类型比例的估计精度 | 组织样本中的细胞类型及其相关细胞比例 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序 | 层次细胞类型树 | 转录组数据 | 通过模拟和真实数据应用进行了验证 |
| 76 | 2024-08-04 |
YAP1 and WWTR1 expression inversely correlates with neuroendocrine markers in Merkel cell carcinoma
2023-03-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI157171
PMID:36719743
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研究论文 | 本文探讨了Merkel细胞癌（MCC）中YAP1和WWTR1的表达与神经内分泌标志物之间的反向关系 | 研究揭示了MCC中NE基因表达的异质性，并发现YAP1/WWTR1沉默对MCPyV阳性MCC的发展至关重要 | 目前的临床诊断标志物无法区分MCPyV阳性和阴性亚型，且MCC肿瘤的表达谱尚未探索 | 研究MCC的转录环境及其与YAP1和WWTR1的关系 | 针对来自患者的肿瘤活检和细胞系进行的RNA-Seq分析 | 数字病理学 | 皮肤癌 | RNA-Seq | NA | 转录组数据 | 多个肿瘤活检样本和细胞系 |
| 77 | 2024-08-07 |
Multiplexed evaluation of mouse wound tissue using oligonucleotide barcoding with single-cell RNA sequencing
2023-03-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101946
PMID:36525348
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研究论文 | 本文介绍了一种使用寡核苷酸条形码标记和混合多个愈合伤口样本的单细胞RNA测序协议 | 提出了使用寡核苷酸条形码技术降低单细胞RNA测序成本的方法 | 目前仅适用于小鼠，但可扩展到其他物种如大鼠、猪和人类 | 开发一种成本效益高的方法来研究复杂组织的单细胞RNA测序 | 愈合伤口组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个样本 |
| 78 | 2024-08-04 |
Preclinical models for prediction of immunotherapy outcomes and immune evasion mechanisms in genetically heterogeneous multiple myeloma
2023-03, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-022-02178-3
PMID:36928817
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研究论文 | 本文介绍了一种反映多发性骨髓瘤遗传异质性的前临床模型，以预测免疫治疗结果和免疫逃逸机制 | 建立了包含八种MM病变的新型小鼠模型，揭示了与免疫检查点阻断反应相关的CD8 T细胞与T细胞的比例 | 未提及具体的实验样本来源和规模的局限性 | 探讨多发性骨髓瘤的遗传和免疫特点与治疗反应之间的关系 | 多发性骨髓瘤模型小鼠及相关临床患者的免疫反应 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞转录组学与功能检测 | 小鼠模型 | 生物样本和临床数据 | 约500只小鼠和约1000名患者 |
| 79 | 2024-08-04 |
In Silico Localization of Perilymph Proteins Enriched in Meńier̀e Disease Using Mammalian Cochlear Single-cell Transcriptomics
2023-Mar, Otology & neurotology open
DOI:10.1097/ONO.0000000000000027
PMID:38516320
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研究论文 | 本研究利用哺乳动物耳蜗的单细胞转录组学定位梅尼埃病患者富集的外淋巴蛋白 | 研究首次通过单细胞转录组数据分析梅尼埃病相关的外淋巴蛋白与特定耳蜗细胞类型的关联 | 目前对人类内耳疾病的理解有限，可能影响结果的广泛适用性 | 研究梅尼埃病患者外淋巴蛋白的表达与耳蜗特定细胞类型的关联 | 梅尼埃病患者的外淋巴蛋白及其在耳蜗细胞中的表达 | 数字病理学 | 梅尼埃病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个梅尼埃病患者及对照样本数据 |
| 80 | 2024-08-07 |
RNA sequencing of single allergen-specific memory B cells after grass pollen immunotherapy: Two unique cell fates and CD29 as a biomarker for treatment effect
2023-03, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.15529
PMID:36153670
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了草花粉免疫治疗后特异性记忆B细胞的变化，并探讨了CD29作为治疗效果生物标志物的可能性 | 首次揭示了草花粉免疫治疗后特异性记忆B细胞存在两种独特的转录特征，并发现CD29可作为治疗效果的早期生物标志物 | 研究样本量较小，仅涉及四名患者，可能影响结果的普遍性 | 探讨草花粉免疫治疗对特异性记忆B细胞的影响及其作为治疗效果生物标志物的潜力 | 特异性记忆B细胞及其表面蛋白表达变化 | NA | 过敏性鼻炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 27名对黑麦草花粉敏感且患有季节性鼻炎的患者 |