单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 329 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-10-06 |
Species-specific regulation of XIST by the JPX/FTX orthologs
2023-03-21, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad029
PMID:36727460
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研究论文 | 本研究探讨了XIST基因在人类和小鼠中受JPX/FTX同源基因调控的物种特异性差异 | 揭示了同源长链非编码RNA基因在不同物种中功能保守但作用机制多样化的现象 | 研究主要集中于人类和小鼠的比较，未涵盖更多哺乳动物物种 | 探究X染色体失活过程中XIST基因调控机制的物种特异性差异 | 人类和小鼠的多能干细胞及分化后XCI细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 功能测定 | NA | 单细胞RNA-seq数据 | 早期人类胚胎发生的单细胞RNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 22 | 2025-10-06 |
IBRAP: integrated benchmarking single-cell RNA-sequencing analytical pipeline
2023-03-19, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad061
PMID:36847692
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研究论文 | 开发了一个集成基准测试的单细胞RNA测序分析流程IBRAP，用于比较和优化不同分析工具的组合 | 提出了首个包含可互换分析组件和多种基准测试指标的单细胞RNA测序分析流程，支持用户根据数据特性确定最优分析方案 | 未明确说明该工具在处理超大规模数据集时的计算效率限制 | 开发一个标准化的单细胞RNA测序数据分析流程，解决分析工具选择困难的问题 | 单细胞RNA测序数据分析方法和工具 | 生物信息学 | 胰腺疾病，癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 原代胰腺组织、癌细胞系和模拟数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 23 | 2025-10-06 |
Apoptotic cell fragments locally activate tingible body macrophages in the germinal center
2023-03-16, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2023.02.004
PMID:36868219
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研究论文 | 本研究揭示了生发中心内凋亡细胞片段如何局部激活可染体巨噬细胞以清除细胞碎片 | 首次通过多种互补方法证明可染体巨噬细胞来源于淋巴结驻留的CD169谱系前体细胞，并发现其采用'懒惰'搜索策略捕获凋亡片段 | NA | 探究生发中心内凋亡细胞清除机制及可染体巨噬细胞的来源和功能 | 小鼠淋巴组织中的可染体巨噬细胞和凋亡B细胞 | 免疫学 | 自身免疫疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 24 | 2025-10-06 |
Skin γδ T cell inflammatory responses are hardwired in the thymus by oxysterol sensing via GPR183 and calibrated by dietary cholesterol
2023-03-14, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2023.01.025
PMID:36842431
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研究论文 | 本研究揭示了胆固醇代谢物氧固醇通过GPR183受体调控皮肤γδ T细胞的胸腺发育和炎症功能 | 首次发现氧固醇通过GPR183受体在胸腺中程序化地塑造皮肤γδ T细胞的炎症反应能力，并证明饮食胆固醇可通过此途径加剧银屑病炎症 | 研究主要基于小鼠模型，人类中的相关性需要进一步验证 | 探究胆固醇代谢物氧固醇如何通过GPR183受体影响γδ T细胞的组织驻留和功能 | 小鼠皮肤中产生IL-17的γδ T细胞 | 免疫学 | 银屑病 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 25 | 2025-10-06 |
Loss of MC1R signaling implicates TBX3 in pheomelanogenesis and melanoma predisposition
2023-Mar-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.10.532018
PMID:37090624
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示MC1R信号缺失导致红色毛发特征和黑色素瘤易感性的分子机制 | 首次发现TBX3作为红色素基因特征的关键调控因子，连接色素生成与衰老逃逸机制 | 研究基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证 | 阐明MC1R信号通路调控色素生成和黑色素瘤易感性的分子机制 | 携带红色毛发特征突变的小鼠模型黑色素细胞 | 单细胞组学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 红色毛发特征小鼠模型的黑色素细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 26 | 2025-10-06 |
Myocardial Milieu Favors Local Differentiation of Regulatory T Cells
2023-03-03, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.122.322183
PMID:36744467
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研究论文 | 本研究揭示了心肌微环境如何促进抗原特异性调节性T细胞的局部分化及其在心肌梗死后修复中的作用 | 首次证明心脏及其引流淋巴结通过促进具有抑制功能的抗原特异性调节性T细胞分化来主动塑造局部免疫反应 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限 | 研究心肌微环境如何影响抗原特异性T辅助细胞的分化 | 小鼠心肌梗死模型中的抗原特异性CD4+ T细胞 | 免疫学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序,流式细胞术,T细胞受体测序 | 转基因T细胞受体模型 | 基因表达数据,蛋白质表达数据 | 小鼠心肌组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 27 | 2025-10-06 |
Pioneer factor ASCL1 cooperates with the mSWI/SNF complex at distal regulatory elements to regulate human neural differentiation
2023-03-01, Genes & development
IF:7.5Q1
DOI:10.1101/gad.350269.122
PMID:36931659
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研究论文 | 本研究揭示了先驱转录因子ASCL1在人类神经分化过程中通过与mSWI/SNF复合物在远端调控元件合作调控染色质重塑的新机制 | 发现ASCL1不仅作为经典先驱因子发挥作用，还能作为非先驱重塑因子与BAF SWI/SNF染色质重塑复合物相互作用，揭示其染色质重塑功能依赖于伴侣ATPase活性的新机制 | 研究主要关注ASCL1在神经分化中的功能，可能不适用于其他发育过程或细胞类型 | 探索先驱转录因子ASCL1在人类神经分化过程中调控染色质重塑的分子机制 | 人类神经分化过程中的先驱转录因子ASCL1及其与mSWI/SNF复合物的相互作用 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 28 | 2025-10-06 |
Placental Inflammation Leads to Abnormal Embryonic Heart Development
2023-03-21, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究通过建立胎盘炎症模型，揭示了中性粒细胞驱动的胎盘炎症如何通过改变胎盘屏障功能导致胚胎心脏发育异常 | 首次阐明了胎盘炎症通过母源炎症单核细胞迁移至胚胎心脏，改变心脏巨噬细胞组成和心脏结构的机制 | 研究仅使用小鼠模型，人类临床相关性尚需验证 | 探究胎盘发育异常导致先天性心脏病的机制 | 妊娠期小鼠及其胚胎 | 发育生物学 | 先天性心脏病 | 流式细胞术, 组织学分析, 批量RNA测序, 单细胞测序, 超声心动图 | NA | 基因表达数据, 细胞组成数据, 组织图像, 心脏功能数据 | 妊娠期小鼠模型，在胚胎期4.5、7.5和14.5天以及出生后5和28天进行分析 | NA | 单细胞测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 29 | 2025-10-06 |
MARVEL: an integrated alternative splicing analysis platform for single-cell RNA sequencing data
2023-03-21, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac1260
PMID:36631981
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研究论文 | 开发了一个用于单细胞RNA测序数据的综合可变剪接分析平台MARVEL | 首个适用于平板和液滴法的综合单细胞剪接分析R包，能系统整合剪接和基因表达分析 | NA | 解决单细胞分辨率下剪接动态分析计算工具缺乏的问题 | 多种细胞类型（包括疾病状态）的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 多个公开数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 适用于平板和液滴法的单细胞RNA测序数据 |
| 30 | 2025-10-06 |
Cancer-Associated Fibroblasts in Inflammation and Antitumor Immunity
2023-03-14, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-22-1031
PMID:36399325
|
综述 | 本文系统阐述了癌症相关成纤维细胞在肿瘤相关炎症和抗肿瘤免疫中的双重作用 | 通过单细胞测序技术揭示了CAF的异质性和可塑性，并系统总结了其在肿瘤促进性炎症和免疫抑制中的新机制 | 作为综述文章，不涉及原始实验数据，主要基于已有研究进行总结和分析 | 探讨癌症相关成纤维细胞在肿瘤微环境炎症反应和免疫调节中的作用机制 | 癌症相关成纤维细胞及其在肿瘤微环境中的功能 | 肿瘤免疫学 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 文献资料 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 31 | 2025-10-06 |
Transcriptomic analyses reveal neuronal specificity of Leigh syndrome associated genes
2023-03, Journal of inherited metabolic disease
IF:4.2Q2
DOI:10.1002/jimd.12578
PMID:36502462
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研究论文 | 本研究通过转录组分析揭示了Leigh综合征相关基因在大脑中的神经元特异性表达模式 | 首次系统性地分析了所有Leigh综合征相关基因在大脑不同细胞类型中的表达特异性，并发现了与帕金森病和癫痫的遗传共通性 | 研究依赖于现有的公共数据库数据，缺乏实验验证 | 确定Leigh综合征相关基因在大脑中的细胞特异性，并探索与其他神经疾病的遗传共通性 | Leigh综合征相关基因和大脑不同细胞类型 | 生物信息学 | Leigh综合征 | 共表达网络分析, 表达加权细胞类型富集分析, 单细胞RNA测序 | CoExp网络分析, EWCE分析 | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | 基于英国大脑表达联盟数据的分析 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组分析 | NA | NA |
| 32 | 2025-10-06 |
Preparation of single-cell suspensions from the human placenta
2023-03, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-022-00772-w
PMID:36451054
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研究论文 | 开发了一种从人类胎盘组织制备高质量单细胞悬液的实验方案 | 首次描述了从胎盘组织制备单细胞悬液的标准化流程，填补了该领域的方法空白 | 需要具备胎盘结构基础知识的合格研究人员操作，未在多种实验条件下验证 | 建立适用于单细胞RNA测序的胎盘组织单细胞悬液制备方法 | 人类胎盘组织（基板、胎盘绒毛和绒毛膜羊膜） | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞悬液 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 基于液滴的单细胞RNA测序技术 |
| 33 | 2025-10-06 |
Identifying Fibrogenic Cells Following Salivary Gland Obstructive Injury
2023-Mar-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.09.531751
PMID:36945483
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探索唾液腺梗阻性损伤后参与纤维化反应的基质细胞类型及其信号通路 | 首次结合单细胞RNA测序和Gli1谱系追踪技术系统分析唾液腺纤维化过程中的细胞动态变化 | 研究仅使用小鼠模型，Gli1信号通路在纤维化中的作用相对有限 | 鉴定唾液腺梗阻性损伤后参与纤维化反应的基质细胞类型和信号通路 | 雌性小鼠颌下唾液腺 | 单细胞生物学 | 唾液腺纤维化 | 单细胞RNA测序, 谱系追踪, 导管结扎手术 | 小鼠疾病模型 | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 | 胚胎期16天和成年小鼠唾液腺组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 34 | 2025-10-06 |
exFINDER: identify external communication signals using single-cell transcriptomics data
2023-Mar-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.24.533888
PMID:37034624
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研究论文 | 开发了一种名为exFINDER的计算方法，用于从单细胞转录组数据中识别细胞接收的外部通讯信号 | 首次提出能够识别单细胞转录组数据中细胞接收的外部信号的方法，而现有方法仅能推断数据中已测量细胞发送的信号 | NA | 开发计算工具以识别细胞接收的外部通讯信号 | 单细胞转录组测序数据中的细胞通讯信号 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | exFINDER算法 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 35 | 2025-10-07 |
Epigenetic and transcriptomic characterization reveals progression markers and essential pathways in clear cell renal cell carcinoma
2023-03-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-37211-7
PMID:36973268
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研究论文 | 通过多组学方法揭示透明细胞肾细胞癌的肿瘤特异性标志物、表观遗传调控和空间异质性 | 首次整合单核RNA测序、单核ATAC测序和空间转录组学数据，鉴定出20个肿瘤特异性标志物并发现铜蓝蛋白在肿瘤-间质相互作用中的新功能 | 样本量相对有限（34例snRNA-seq，28例snATAC-seq），需要在更大队列中验证发现 | 阐明透明细胞肾细胞癌的进展标志物和关键通路 | 人类透明细胞肾细胞癌标本 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单核RNA测序, 单核ATAC测序, 空间转录组学, 蛋白质组学 | 多组学整合分析 | 基因组, 转录组, 表观基因组, 蛋白质组, 空间转录组 | 34例snRNA-seq样本，28例snATAC-seq样本 | NA | 单核RNA测序, 单核ATAC测序, 空间转录组学, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 36 | 2025-03-20 |
LAL deficiency induced myeloid-derived suppressor cells as targets and biomarkers for lung cancer
2023-03, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2022-006272
PMID:36914206
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研究论文 | 本文探讨了溶酶体酸性脂肪酶（LAL）缺乏诱导的髓系来源抑制细胞（MDSCs）在肺癌中的潜在作用及其作为抗癌免疫治疗靶点和生物标志物的可能性 | 揭示了LAL缺乏如何通过改变代谢途径诱导MDSCs的产生，并展示了这些细胞在肿瘤免疫抑制和促进肿瘤生长中的作用 | 研究主要基于小鼠模型和人类血液样本，缺乏直接的人体组织验证 | 探索LAL缺乏诱导的MDSCs在肺癌中的机制及其作为治疗靶点的潜力 | 小鼠骨髓来源的Ly6G+髓系细胞和非小细胞肺癌（NSCLC）患者的血液样本 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），流式细胞术 | NA | 基因表达数据，细胞表型数据 | 小鼠骨髓细胞和NSCLC患者的血液样本 | NA | NA | NA | NA |
| 37 | 2025-10-07 |
APOE modulates microglial immunometabolism in response to age, amyloid pathology, and inflammatory challenge
2023-03-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112196
PMID:36871219
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研究论文 | 本研究探讨APOE基因型如何调控小胶质细胞的免疫代谢功能，及其在衰老、淀粉样病理和炎症挑战中的作用 | 结合bulk、单细胞和空间转录组学技术，系统揭示APOE4通过影响Hif1α表达、TCA循环和糖酵解途径改变小胶质细胞免疫代谢特征 | 研究主要基于表达人类APOE的小鼠模型，人类样本验证尚需进一步研究 | 阐明APOE基因型在调节小胶质细胞免疫代谢中的核心作用机制 | 表达人类APOE的小鼠模型中的小胶质细胞 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | RNA测序, 单细胞转录组学, 空间转录组学, 质谱成像 | NA | 转录组数据, 代谢组数据, 空间表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 38 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals gonadal dynamic changes during sex differentiation in hermaphroditic protogynous orange-spotted grouper ( Epinephelus coioides)
2023-03-18, Zoological research
IF:4.0Q1
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 39 | 2025-10-07 |
Neoadjuvant chemotherapy plus nivolumab with or without ipilimumab in operable non-small cell lung cancer: the phase 2 platform NEOSTAR trial
2023-03, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-022-02189-0
PMID:36928818
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研究论文 | 评估纳武利尤单抗联合化疗与联合伊匹木单抗在可手术非小细胞肺癌新辅助治疗中的疗效和生物标志物 | 首次在NEOSTAR平台试验中比较纳武利尤单抗+化疗与联合伊匹木单抗三药方案的病理缓解率，并通过单细胞测序和多平台免疫分析探索生物标志物 | 样本量较小（每组22例患者），II期试验需要更大规模验证 | 评估新辅助免疫治疗联合化疗在可手术非小细胞肺癌中的疗效和安全性 | 可手术的非小细胞肺癌患者 | 临床肿瘤学 | 肺癌 | 单细胞测序，多平台免疫分析，微生物组分析 | NA | 临床数据，基因组数据，微生物组数据 | 44例患者（每组22例） | NA | 单细胞RNA测序，免疫分析，微生物组测序 | NA | NA |
| 40 | 2025-01-07 |
Protocols for single-cell RNA-seq and spatial gene expression integration and interactive visualization
2023-03-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102047
PMID:36853708
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研究论文 | 本文提供了整合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间基因表达数据的协议，并展示了如何创建交互式网络应用来可视化和分享结果 | 提供了使用Seurat和Giotto软件包整合scRNA-seq和空间转录组数据的详细协议，并展示了如何创建交互式网络应用 | 协议仅适用于特定数据集，可能不适用于所有类型的scRNA-seq和空间转录组数据 | 整合单细胞RNA测序和空间基因表达数据，以解析细胞类型分布 | 人类输尿管scRNA-seq数据集 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞RNA测序数据，空间基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |