单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 329 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-10-05 |
A molecularly defined and spatially resolved cell atlas of the whole mouse brain
2023-Mar-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.06.531348
PMID:36945367
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研究论文 | 通过整合MERFISH和scRNA-seq技术，构建了全小鼠大脑的高分辨率空间细胞图谱 | 首次在全脑范围内实现单细胞水平的高通量空间转录组分析，识别了5000多个转录特征不同的细胞簇 | 研究仅针对成年小鼠大脑，尚未在人类或其他物种中验证 | 解析大脑的分子和细胞结构基础 | 成年小鼠全脑约800万个细胞 | 空间转录组学 | NA | 多重误差鲁棒荧光原位杂交(MERFISH), 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 空间基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 约800万个细胞 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | MERFISH技术检测>1100个基因, 整合scRNA-seq数据进行全转录组分析 |
| 22 | 2025-10-05 |
A high-resolution transcriptomic and spatial atlas of cell types in the whole mouse brain
2023-Mar-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.06.531121
PMID:37034735
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研究论文 | 构建了成年小鼠全脑的高分辨率转录组和空间细胞类型图谱 | 结合单细胞RNA测序和MERFISH空间转录组技术，首次在单细胞水平创建了全脑尺度的分层细胞分类系统 | 研究仅限于小鼠模型，未涉及其他物种或人类大脑 | 建立哺乳动物大脑细胞类型的完整目录，理解大脑功能和组织原理 | 成年小鼠全脑细胞 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序, MERFISH空间转录组 | NA | 转录组数据, 空间定位数据 | 约700万单细胞RNA测序细胞, 约430万MERFISH空间转录组细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组 | NA | MERFISH空间转录组技术 |
| 23 | 2025-10-05 |
Revealing the Heterogeneity of the Tumor Ecosystem of Cholangiocarcinoma through Single-Cell Transcriptomics
2023-03-10, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12060862
PMID:36980203
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综述 | 通过单细胞转录组学揭示胆管癌肿瘤生态系统的异质性 | 利用单细胞RNA测序技术首次系统解析胆管癌肿瘤生态系统中各类细胞的表型和功能多样性 | 当前研究存在样本量有限和技术方法标准化不足等局限性 | 探讨胆管癌肿瘤生态系统的细胞异质性和细胞间相互作用 | 胆管癌肿瘤生态系统中的基质细胞和恶性细胞 | 数字病理学 | 胆管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 24 | 2025-10-05 |
An analysis of classical multidimensional scaling with applications to clustering
2023-Mar, Information and inference : a journal of the IMA
DOI:10.1093/imaiai/iaac004
PMID:36761434
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研究论文 | 本文分析了经典多维标度法的理论性能，并应用于噪声数据聚类 | 建立了分析经典多维标度法嵌入样本质量的理论框架，提出了信噪比缩放条件 | NA | 分析经典多维标度法的统计性能，为下游统计分析奠定基础 | 经典多维标度法及其在聚类分析中的应用 | 机器学习 | 癌症 | 多维标度法，距离聚类算法 | 经典多维标度法 | 基因表达数据，单细胞RNA测序数据，自然语言数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 25 | 2025-10-06 |
Multi-omic analysis of the cardiac cellulome defines a vascular contribution to cardiac diastolic dysfunction in obese female mice
2023-03-29, Basic research in cardiology
IF:7.5Q1
DOI:10.1007/s00395-023-00983-6
PMID:36988733
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研究论文 | 通过多组学分析揭示平滑肌细胞盐皮质激素受体在肥胖雌性小鼠心脏舒张功能障碍中的关键作用 | 首次利用单细胞RNA测序技术系统分析非心肌细胞群体，揭示血管平滑肌细胞MR信号在肥胖相关心脏功能障碍中的核心机制 | 研究仅限于雌性小鼠模型，未涉及雄性动物及人类临床样本验证 | 探究平滑肌细胞特异性MR缺失对肥胖相关冠状动脉和心脏舒张功能的影响 | 雌性小鼠（西方饮食诱导的肥胖模型） | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，基因表达谱分析 | NA | 基因表达数据，蛋白质表达数据 | 雌性小鼠（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 26 | 2025-10-06 |
RevGel-seq: instrument-free single-cell RNA sequencing using a reversible hydrogel for cell-specific barcoding
2023-03-24, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-31915-y
PMID:36964177
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研究论文 | 介绍了一种基于可逆水凝胶技术的单细胞RNA测序方法RevGel-seq，无需专用仪器即可实现细胞特异性条形码标记 | 开发了无需微流控设备或液滴系统的单细胞RNA测序技术，通过可逆水凝胶固定细胞-磁珠复合物，提供实验设计的灵活性和样品处理的时间自由度 | 当前凝胶化设备的标准分析范围在10,000个输入细胞水平，可能限制更高通量应用 | 开发无需专用仪器的单细胞RNA测序技术 | 外周血单个核细胞(PBMC)、胰腺胰岛细胞、心肌细胞 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 标准分析约10,000个细胞，展示了PBMC、胰岛细胞和心肌细胞的应用 | NA | 单细胞RNA-seq | RevGel-seq | 基于可逆水凝胶的单细胞条形码技术，无需微流控或液滴系统 |
| 27 | 2025-10-06 |
Cancer stem cells: Recent insights and therapies
2023-03, Biochemical pharmacology
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.bcp.2023.115441
PMID:36720355
|
综述 | 本文综述了癌症干细胞的最新研究进展及其治疗策略 | 整合单细胞测序和空间转录组分析技术研究癌症干细胞，并总结靶向消除癌症干细胞的治疗策略 | NA | 探讨癌症干细胞在癌症生物学中的基础作用及治疗应用 | 癌症干细胞及其与肿瘤微环境中其他细胞的相互作用 | 肿瘤生物学 | 癌症 | 单细胞测序, 空间转录组分析 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 28 | 2025-10-06 |
Senescent cell population with ZEB1 transcription factor as its main regulator promotes osteoarthritis in cartilage and meniscus
2023-03, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/ard-2022-223227
PMID:36564153
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析人类膝关节软骨和半月板组织，发现了一个以ZEB1转录因子为主要调控因子的衰老细胞群在骨关节炎中起关键作用 | 首次在软骨和半月板组织中鉴定出共享的致病性衰老细胞亚群，并确定FAP和ZEB1作为该细胞群的主要调控因子 | 样本量相对有限（健康组n=6-7，OA组n=6），功能验证实验需要进一步扩展 | 研究骨关节炎发病机制中软骨和半月板组织的细胞异质性 | 人类膝关节软骨和半月板组织 | 单细胞生物学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学，基因过表达和敲除 | NA | 单细胞RNA测序数据，基因表达数据 | 软骨70,972个细胞，半月板78,017个细胞；来自健康（n=6-7）和OA（n=6）膝关节 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 29 | 2025-10-06 |
Phospho-seq: Integrated, multi-modal profiling of intracellular protein dynamics in single cells
2023-Mar-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.27.534442
PMID:37034703
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研究论文 | 开发了一种名为Phospho-seq的集成方法，用于在单细胞水平同时分析磷酸化蛋白质、染色质可及性和基因表达 | 首次实现了在单细胞水平整合磷酸化蛋白质、染色质可及性和转录组的多模态分析，通过简化的抗体偶联方法创建大型定制抗体panel | NA | 开发能够同时分析细胞信号状态与其他分子模态的集成单细胞分析技术 | 细胞系、诱导多能干细胞和3个月大脑类器官 | 单细胞多组学 | 神经发育疾病 | 单细胞多组学分析 | 桥接整合 | 单细胞多模态数据 | 细胞系、iPSCs和脑类器官样本 | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq, 蛋白质组分析 | NA | 整合scATAC-seq和scRNA-seq数据集的多模态分析平台 |
| 30 | 2025-10-06 |
Characterization of Intestinal Mesenchymal Stromal Cells From Patients With Inflammatory Bowel Disease for Autologous Cell Therapy
2023-03-03, Stem cells translational medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1093/stcltm/szad003
PMID:36869704
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研究论文 | 本研究评估了炎症性肠病患者自体肠道间充质基质细胞用于细胞治疗的适用性和功能性 | 首次系统性评估自体肠道MSCs作为细胞治疗平台的潜力，并发现IFN-γ预处理可消除基线转录差异 | 样本量相对较小（克罗恩病11例，溃疡性结肠炎12例，对照14例），需要更大规模研究验证 | 评估自体肠道MSCs作为炎症性肠病细胞治疗平台的可行性 | 炎症性肠病（克罗恩病和溃疡性结肠炎）患者和对照组的肠道黏膜活检来源的间充质基质细胞 | 细胞治疗 | 炎症性肠病 | 显微镜检查，流式细胞术，bulk RNA测序，单细胞RNA测序，Luminex多重检测 | NA | 图像，流式细胞数据，基因表达数据，蛋白质分泌数据 | 克罗恩病11例，溃疡性结肠炎12例，对照组14例 | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | NA | 30-plex Luminex panel |
| 31 | 2025-10-06 |
Integrated transcriptomics contrasts fatty acid metabolism with hypoxia response in β-cell subpopulations associated with glycemic control
2023-Mar-28, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-023-09232-5
PMID:36978008
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据，探索肥胖小鼠中β细胞异质性及其与血糖控制相关的亚群 | 整合单细胞和批量转录组数据识别β细胞新亚群，并发现脂肪酸代谢与缺氧反应在不同血糖表型肥胖中的关联 | 研究仅限于SM/J肥胖小鼠模型，未在其他物种或模型中验证 | 探索β细胞异质性对糖尿病发病机制的影响 | 肥胖SM/J小鼠的胰腺胰岛β细胞 | 单细胞转录组学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 32 | 2025-10-06 |
Extracellular vesicle distribution and localization in skeletal muscle at rest and following disuse atrophy
2023-03-10, Skeletal muscle
IF:5.3Q2
DOI:10.1186/s13395-023-00315-1
PMID:36895061
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研究论文 | 本研究探讨了细胞外囊泡在骨骼肌中的分布定位及其在废用性萎缩中的变化 | 首次系统揭示了骨骼肌中细胞外囊泡生物发生因子的细胞类型表达谱和空间定位特征，并比较了不同物种在废用性萎缩模型中细胞外囊泡浓度的差异 | 样本量有限，仅使用了啮齿动物和人类模型，且未深入探讨细胞外囊泡功能机制 | 研究骨骼肌中细胞外囊泡的生物发生、标记物表达和细胞定位，及其在废用性萎缩中的变化 | 大鼠骨骼肌和血清样本，以及人类卧床休息模型的血清样本 | 细胞生物学 | 肌肉萎缩疾病 | 密度梯度超速离心，荧光相关光谱，qPCR，单细胞RNA测序，免疫组织化学，纳米颗粒跟踪分析 | NA | 基因表达数据，蛋白质定位数据，纳米颗粒浓度数据 | 大鼠和人类废用性萎缩模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 33 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome analysis reveals a cancer-associated fibroblast marker gene signature in hepatocellular carcinoma that predicts prognosis
2023-Mar, ILIVER..
DOI:10.1016/j.iliver.2022.12.002
PMID:40636406
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析构建了肝细胞癌中癌症相关成纤维细胞的标志基因特征，用于预测患者预后 | 首次构建了基于单细胞RNA测序数据的CAF标志基因特征模型(CAFMGS)，为肝细胞癌预后预测提供了新的生物标志物 | 研究依赖于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 研究癌症相关成纤维细胞在肝细胞癌中的预后价值和治疗靶点潜力 | 肝细胞癌患者和癌症相关成纤维细胞 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 预后预测模型 | 基因表达数据 | TCGA训练队列和ICGC验证队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 34 | 2025-10-06 |
MerlinS13 phosphorylation controls meningioma Wnt signaling and magnetic resonance imaging features
2023-Mar-14, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2577844/v1
PMID:36993679
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和蛋白质质谱分析，揭示了Merlin蛋白S13磷酸化调控脑膜瘤Wnt信号通路及MRI特征的机制 | 首次发现Merlin通过S13去磷酸化激活Wnt信号通路，并建立了基于扩散加权成像ADC值的非侵入性影像学生物标志物 | 研究样本量有限，需要更大规模的临床验证 | 阐明Merlin完整型脑膜瘤的生长机制并开发预测临床结果的生物标志物 | 脑膜瘤细胞、异种移植模型和人类患者 | 数字病理 | 脑膜瘤 | 单细胞RNA测序, 邻近标记蛋白质质谱, 磁共振成像 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 医学影像 | 脑膜瘤细胞系、异种移植模型和人类患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质质谱, 空间转录组学 | NA | NA |
| 35 | 2025-10-06 |
Brassinosteroid gene regulatory networks at cellular resolution in the Arabidopsis root
2023-03-31, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adf4721
PMID:36996230
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术解析拟南芥根中油菜素甾醇激素响应基因的细胞类型特异性调控网络 | 首次在单细胞分辨率下揭示油菜素甾醇在特定细胞类型（皮层细胞）中介导从增殖向伸长转变的调控网络 | NA | 阐明油菜素甾醇在植物根发育过程中的时空特异性基因调控机制 | 拟南芥根的不同细胞类型和发育阶段 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 36 | 2025-10-06 |
Species-specific regulation of XIST by the JPX/FTX orthologs
2023-03-21, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad029
PMID:36727460
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研究论文 | 本研究探讨了XIST基因在人类和小鼠中受JPX/FTX同源基因调控的物种特异性差异 | 揭示了同源长链非编码RNA基因在不同物种中功能保守但作用机制多样化的现象 | 研究主要集中于人类和小鼠的比较，未涵盖更多哺乳动物物种 | 探究X染色体失活过程中XIST基因调控机制的物种特异性差异 | 人类和小鼠的多能干细胞及分化后XCI细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 功能测定 | NA | 单细胞RNA-seq数据 | 早期人类胚胎发生的单细胞RNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 37 | 2025-10-06 |
IBRAP: integrated benchmarking single-cell RNA-sequencing analytical pipeline
2023-03-19, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad061
PMID:36847692
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研究论文 | 开发了一个集成基准测试的单细胞RNA测序分析流程IBRAP，用于比较和优化不同分析工具的组合 | 提出了首个包含可互换分析组件和多种基准测试指标的单细胞RNA测序分析流程，支持用户根据数据特性确定最优分析方案 | 未明确说明该工具在处理超大规模数据集时的计算效率限制 | 开发一个标准化的单细胞RNA测序数据分析流程，解决分析工具选择困难的问题 | 单细胞RNA测序数据分析方法和工具 | 生物信息学 | 胰腺疾病，癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 原代胰腺组织、癌细胞系和模拟数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 38 | 2025-10-06 |
Apoptotic cell fragments locally activate tingible body macrophages in the germinal center
2023-03-16, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2023.02.004
PMID:36868219
|
研究论文 | 本研究揭示了生发中心内凋亡细胞片段如何局部激活可染体巨噬细胞以清除细胞碎片 | 首次通过多种互补方法证明可染体巨噬细胞来源于淋巴结驻留的CD169谱系前体细胞，并发现其采用'懒惰'搜索策略捕获凋亡片段 | NA | 探究生发中心内凋亡细胞清除机制及可染体巨噬细胞的来源和功能 | 小鼠淋巴组织中的可染体巨噬细胞和凋亡B细胞 | 免疫学 | 自身免疫疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 39 | 2025-10-06 |
Skin γδ T cell inflammatory responses are hardwired in the thymus by oxysterol sensing via GPR183 and calibrated by dietary cholesterol
2023-03-14, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2023.01.025
PMID:36842431
|
研究论文 | 本研究揭示了胆固醇代谢物氧固醇通过GPR183受体调控皮肤γδ T细胞的胸腺发育和炎症功能 | 首次发现氧固醇通过GPR183受体在胸腺中程序化地塑造皮肤γδ T细胞的炎症反应能力，并证明饮食胆固醇可通过此途径加剧银屑病炎症 | 研究主要基于小鼠模型，人类中的相关性需要进一步验证 | 探究胆固醇代谢物氧固醇如何通过GPR183受体影响γδ T细胞的组织驻留和功能 | 小鼠皮肤中产生IL-17的γδ T细胞 | 免疫学 | 银屑病 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 40 | 2025-10-06 |
Loss of MC1R signaling implicates TBX3 in pheomelanogenesis and melanoma predisposition
2023-Mar-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.10.532018
PMID:37090624
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示MC1R信号缺失导致红色毛发特征和黑色素瘤易感性的分子机制 | 首次发现TBX3作为红色素基因特征的关键调控因子，连接色素生成与衰老逃逸机制 | 研究基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证 | 阐明MC1R信号通路调控色素生成和黑色素瘤易感性的分子机制 | 携带红色毛发特征突变的小鼠模型黑色素细胞 | 单细胞组学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 红色毛发特征小鼠模型的黑色素细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |