单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 329 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-10-06 |
Phospho-seq: Integrated, multi-modal profiling of intracellular protein dynamics in single cells
2023-Mar-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.27.534442
PMID:37034703
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研究论文 | 开发了一种名为Phospho-seq的集成方法，用于在单细胞水平同时分析磷酸化蛋白质、染色质可及性和基因表达 | 首次实现了在单细胞水平整合磷酸化蛋白质、染色质可及性和转录组的多模态分析，通过简化的抗体偶联方法创建大型定制抗体panel | NA | 开发能够同时分析细胞信号状态与其他分子模态的集成单细胞分析技术 | 细胞系、诱导多能干细胞和3个月大脑类器官 | 单细胞多组学 | 神经发育疾病 | 单细胞多组学分析 | 桥接整合 | 单细胞多模态数据 | 细胞系、iPSCs和脑类器官样本 | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq, 蛋白质组分析 | NA | 整合scATAC-seq和scRNA-seq数据集的多模态分析平台 |
| 22 | 2025-10-06 |
Characterization of Intestinal Mesenchymal Stromal Cells From Patients With Inflammatory Bowel Disease for Autologous Cell Therapy
2023-03-03, Stem cells translational medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1093/stcltm/szad003
PMID:36869704
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研究论文 | 本研究评估了炎症性肠病患者自体肠道间充质基质细胞用于细胞治疗的适用性和功能性 | 首次系统性评估自体肠道MSCs作为细胞治疗平台的潜力，并发现IFN-γ预处理可消除基线转录差异 | 样本量相对较小（克罗恩病11例，溃疡性结肠炎12例，对照14例），需要更大规模研究验证 | 评估自体肠道MSCs作为炎症性肠病细胞治疗平台的可行性 | 炎症性肠病（克罗恩病和溃疡性结肠炎）患者和对照组的肠道黏膜活检来源的间充质基质细胞 | 细胞治疗 | 炎症性肠病 | 显微镜检查，流式细胞术，bulk RNA测序，单细胞RNA测序，Luminex多重检测 | NA | 图像，流式细胞数据，基因表达数据，蛋白质分泌数据 | 克罗恩病11例，溃疡性结肠炎12例，对照组14例 | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | NA | 30-plex Luminex panel |
| 23 | 2025-10-06 |
Integrated transcriptomics contrasts fatty acid metabolism with hypoxia response in β-cell subpopulations associated with glycemic control
2023-Mar-28, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-023-09232-5
PMID:36978008
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据，探索肥胖小鼠中β细胞异质性及其与血糖控制相关的亚群 | 整合单细胞和批量转录组数据识别β细胞新亚群，并发现脂肪酸代谢与缺氧反应在不同血糖表型肥胖中的关联 | 研究仅限于SM/J肥胖小鼠模型，未在其他物种或模型中验证 | 探索β细胞异质性对糖尿病发病机制的影响 | 肥胖SM/J小鼠的胰腺胰岛β细胞 | 单细胞转录组学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 24 | 2025-10-06 |
Extracellular vesicle distribution and localization in skeletal muscle at rest and following disuse atrophy
2023-03-10, Skeletal muscle
IF:5.3Q2
DOI:10.1186/s13395-023-00315-1
PMID:36895061
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研究论文 | 本研究探讨了细胞外囊泡在骨骼肌中的分布定位及其在废用性萎缩中的变化 | 首次系统揭示了骨骼肌中细胞外囊泡生物发生因子的细胞类型表达谱和空间定位特征，并比较了不同物种在废用性萎缩模型中细胞外囊泡浓度的差异 | 样本量有限，仅使用了啮齿动物和人类模型，且未深入探讨细胞外囊泡功能机制 | 研究骨骼肌中细胞外囊泡的生物发生、标记物表达和细胞定位，及其在废用性萎缩中的变化 | 大鼠骨骼肌和血清样本，以及人类卧床休息模型的血清样本 | 细胞生物学 | 肌肉萎缩疾病 | 密度梯度超速离心，荧光相关光谱，qPCR，单细胞RNA测序，免疫组织化学，纳米颗粒跟踪分析 | NA | 基因表达数据，蛋白质定位数据，纳米颗粒浓度数据 | 大鼠和人类废用性萎缩模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 25 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome analysis reveals a cancer-associated fibroblast marker gene signature in hepatocellular carcinoma that predicts prognosis
2023-Mar, ILIVER..
DOI:10.1016/j.iliver.2022.12.002
PMID:40636406
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析构建了肝细胞癌中癌症相关成纤维细胞的标志基因特征，用于预测患者预后 | 首次构建了基于单细胞RNA测序数据的CAF标志基因特征模型(CAFMGS)，为肝细胞癌预后预测提供了新的生物标志物 | 研究依赖于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 研究癌症相关成纤维细胞在肝细胞癌中的预后价值和治疗靶点潜力 | 肝细胞癌患者和癌症相关成纤维细胞 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 预后预测模型 | 基因表达数据 | TCGA训练队列和ICGC验证队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 26 | 2025-10-06 |
MerlinS13 phosphorylation controls meningioma Wnt signaling and magnetic resonance imaging features
2023-Mar-14, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2577844/v1
PMID:36993679
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和蛋白质质谱分析，揭示了Merlin蛋白S13磷酸化调控脑膜瘤Wnt信号通路及MRI特征的机制 | 首次发现Merlin通过S13去磷酸化激活Wnt信号通路，并建立了基于扩散加权成像ADC值的非侵入性影像学生物标志物 | 研究样本量有限，需要更大规模的临床验证 | 阐明Merlin完整型脑膜瘤的生长机制并开发预测临床结果的生物标志物 | 脑膜瘤细胞、异种移植模型和人类患者 | 数字病理 | 脑膜瘤 | 单细胞RNA测序, 邻近标记蛋白质质谱, 磁共振成像 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 医学影像 | 脑膜瘤细胞系、异种移植模型和人类患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质质谱, 空间转录组学 | NA | NA |
| 27 | 2025-10-06 |
Brassinosteroid gene regulatory networks at cellular resolution in the Arabidopsis root
2023-03-31, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adf4721
PMID:36996230
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术解析拟南芥根中油菜素甾醇激素响应基因的细胞类型特异性调控网络 | 首次在单细胞分辨率下揭示油菜素甾醇在特定细胞类型（皮层细胞）中介导从增殖向伸长转变的调控网络 | NA | 阐明油菜素甾醇在植物根发育过程中的时空特异性基因调控机制 | 拟南芥根的不同细胞类型和发育阶段 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 28 | 2025-10-06 |
Species-specific regulation of XIST by the JPX/FTX orthologs
2023-03-21, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad029
PMID:36727460
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研究论文 | 本研究探讨了XIST基因在人类和小鼠中受JPX/FTX同源基因调控的物种特异性差异 | 揭示了同源长链非编码RNA基因在不同物种中功能保守但作用机制多样化的现象 | 研究主要集中于人类和小鼠的比较，未涵盖更多哺乳动物物种 | 探究X染色体失活过程中XIST基因调控机制的物种特异性差异 | 人类和小鼠的多能干细胞及分化后XCI细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 功能测定 | NA | 单细胞RNA-seq数据 | 早期人类胚胎发生的单细胞RNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 29 | 2025-10-06 |
IBRAP: integrated benchmarking single-cell RNA-sequencing analytical pipeline
2023-03-19, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad061
PMID:36847692
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研究论文 | 开发了一个集成基准测试的单细胞RNA测序分析流程IBRAP，用于比较和优化不同分析工具的组合 | 提出了首个包含可互换分析组件和多种基准测试指标的单细胞RNA测序分析流程，支持用户根据数据特性确定最优分析方案 | 未明确说明该工具在处理超大规模数据集时的计算效率限制 | 开发一个标准化的单细胞RNA测序数据分析流程，解决分析工具选择困难的问题 | 单细胞RNA测序数据分析方法和工具 | 生物信息学 | 胰腺疾病，癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 原代胰腺组织、癌细胞系和模拟数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 30 | 2025-10-06 |
Apoptotic cell fragments locally activate tingible body macrophages in the germinal center
2023-03-16, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2023.02.004
PMID:36868219
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研究论文 | 本研究揭示了生发中心内凋亡细胞片段如何局部激活可染体巨噬细胞以清除细胞碎片 | 首次通过多种互补方法证明可染体巨噬细胞来源于淋巴结驻留的CD169谱系前体细胞，并发现其采用'懒惰'搜索策略捕获凋亡片段 | NA | 探究生发中心内凋亡细胞清除机制及可染体巨噬细胞的来源和功能 | 小鼠淋巴组织中的可染体巨噬细胞和凋亡B细胞 | 免疫学 | 自身免疫疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 31 | 2025-10-06 |
Skin γδ T cell inflammatory responses are hardwired in the thymus by oxysterol sensing via GPR183 and calibrated by dietary cholesterol
2023-03-14, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2023.01.025
PMID:36842431
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研究论文 | 本研究揭示了胆固醇代谢物氧固醇通过GPR183受体调控皮肤γδ T细胞的胸腺发育和炎症功能 | 首次发现氧固醇通过GPR183受体在胸腺中程序化地塑造皮肤γδ T细胞的炎症反应能力，并证明饮食胆固醇可通过此途径加剧银屑病炎症 | 研究主要基于小鼠模型，人类中的相关性需要进一步验证 | 探究胆固醇代谢物氧固醇如何通过GPR183受体影响γδ T细胞的组织驻留和功能 | 小鼠皮肤中产生IL-17的γδ T细胞 | 免疫学 | 银屑病 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 32 | 2025-10-06 |
Loss of MC1R signaling implicates TBX3 in pheomelanogenesis and melanoma predisposition
2023-Mar-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.10.532018
PMID:37090624
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示MC1R信号缺失导致红色毛发特征和黑色素瘤易感性的分子机制 | 首次发现TBX3作为红色素基因特征的关键调控因子，连接色素生成与衰老逃逸机制 | 研究基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证 | 阐明MC1R信号通路调控色素生成和黑色素瘤易感性的分子机制 | 携带红色毛发特征突变的小鼠模型黑色素细胞 | 单细胞组学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 红色毛发特征小鼠模型的黑色素细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 33 | 2025-10-06 |
Myocardial Milieu Favors Local Differentiation of Regulatory T Cells
2023-03-03, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.122.322183
PMID:36744467
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研究论文 | 本研究揭示了心肌微环境如何促进抗原特异性调节性T细胞的局部分化及其在心肌梗死后修复中的作用 | 首次证明心脏及其引流淋巴结通过促进具有抑制功能的抗原特异性调节性T细胞分化来主动塑造局部免疫反应 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限 | 研究心肌微环境如何影响抗原特异性T辅助细胞的分化 | 小鼠心肌梗死模型中的抗原特异性CD4+ T细胞 | 免疫学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序,流式细胞术,T细胞受体测序 | 转基因T细胞受体模型 | 基因表达数据,蛋白质表达数据 | 小鼠心肌组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 34 | 2025-10-06 |
Pioneer factor ASCL1 cooperates with the mSWI/SNF complex at distal regulatory elements to regulate human neural differentiation
2023-03-01, Genes & development
IF:7.5Q1
DOI:10.1101/gad.350269.122
PMID:36931659
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研究论文 | 本研究揭示了先驱转录因子ASCL1在人类神经分化过程中通过与mSWI/SNF复合物在远端调控元件合作调控染色质重塑的新机制 | 发现ASCL1不仅作为经典先驱因子发挥作用，还能作为非先驱重塑因子与BAF SWI/SNF染色质重塑复合物相互作用，揭示其染色质重塑功能依赖于伴侣ATPase活性的新机制 | 研究主要关注ASCL1在神经分化中的功能，可能不适用于其他发育过程或细胞类型 | 探索先驱转录因子ASCL1在人类神经分化过程中调控染色质重塑的分子机制 | 人类神经分化过程中的先驱转录因子ASCL1及其与mSWI/SNF复合物的相互作用 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 35 | 2025-10-06 |
Placental Inflammation Leads to Abnormal Embryonic Heart Development
2023-03-21, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 本研究通过建立胎盘炎症模型，揭示了中性粒细胞驱动的胎盘炎症如何通过改变胎盘屏障功能导致胚胎心脏发育异常 | 首次阐明了胎盘炎症通过母源炎症单核细胞迁移至胚胎心脏，改变心脏巨噬细胞组成和心脏结构的机制 | 研究仅使用小鼠模型，人类临床相关性尚需验证 | 探究胎盘发育异常导致先天性心脏病的机制 | 妊娠期小鼠及其胚胎 | 发育生物学 | 先天性心脏病 | 流式细胞术, 组织学分析, 批量RNA测序, 单细胞测序, 超声心动图 | NA | 基因表达数据, 细胞组成数据, 组织图像, 心脏功能数据 | 妊娠期小鼠模型，在胚胎期4.5、7.5和14.5天以及出生后5和28天进行分析 | NA | 单细胞测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 36 | 2025-10-06 |
MARVEL: an integrated alternative splicing analysis platform for single-cell RNA sequencing data
2023-03-21, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac1260
PMID:36631981
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研究论文 | 开发了一个用于单细胞RNA测序数据的综合可变剪接分析平台MARVEL | 首个适用于平板和液滴法的综合单细胞剪接分析R包，能系统整合剪接和基因表达分析 | NA | 解决单细胞分辨率下剪接动态分析计算工具缺乏的问题 | 多种细胞类型（包括疾病状态）的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 多个公开数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 适用于平板和液滴法的单细胞RNA测序数据 |
| 37 | 2025-10-06 |
Cancer-Associated Fibroblasts in Inflammation and Antitumor Immunity
2023-03-14, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-22-1031
PMID:36399325
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综述 | 本文系统阐述了癌症相关成纤维细胞在肿瘤相关炎症和抗肿瘤免疫中的双重作用 | 通过单细胞测序技术揭示了CAF的异质性和可塑性，并系统总结了其在肿瘤促进性炎症和免疫抑制中的新机制 | 作为综述文章，不涉及原始实验数据，主要基于已有研究进行总结和分析 | 探讨癌症相关成纤维细胞在肿瘤微环境炎症反应和免疫调节中的作用机制 | 癌症相关成纤维细胞及其在肿瘤微环境中的功能 | 肿瘤免疫学 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 文献资料 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 38 | 2025-10-06 |
Transcriptomic analyses reveal neuronal specificity of Leigh syndrome associated genes
2023-03, Journal of inherited metabolic disease
IF:4.2Q2
DOI:10.1002/jimd.12578
PMID:36502462
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研究论文 | 本研究通过转录组分析揭示了Leigh综合征相关基因在大脑中的神经元特异性表达模式 | 首次系统性地分析了所有Leigh综合征相关基因在大脑不同细胞类型中的表达特异性，并发现了与帕金森病和癫痫的遗传共通性 | 研究依赖于现有的公共数据库数据，缺乏实验验证 | 确定Leigh综合征相关基因在大脑中的细胞特异性，并探索与其他神经疾病的遗传共通性 | Leigh综合征相关基因和大脑不同细胞类型 | 生物信息学 | Leigh综合征 | 共表达网络分析, 表达加权细胞类型富集分析, 单细胞RNA测序 | CoExp网络分析, EWCE分析 | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | 基于英国大脑表达联盟数据的分析 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组分析 | NA | NA |
| 39 | 2025-10-06 |
Preparation of single-cell suspensions from the human placenta
2023-03, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-022-00772-w
PMID:36451054
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研究论文 | 开发了一种从人类胎盘组织制备高质量单细胞悬液的实验方案 | 首次描述了从胎盘组织制备单细胞悬液的标准化流程，填补了该领域的方法空白 | 需要具备胎盘结构基础知识的合格研究人员操作，未在多种实验条件下验证 | 建立适用于单细胞RNA测序的胎盘组织单细胞悬液制备方法 | 人类胎盘组织（基板、胎盘绒毛和绒毛膜羊膜） | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞悬液 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 基于液滴的单细胞RNA测序技术 |
| 40 | 2025-10-06 |
Identifying Fibrogenic Cells Following Salivary Gland Obstructive Injury
2023-Mar-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.09.531751
PMID:36945483
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探索唾液腺梗阻性损伤后参与纤维化反应的基质细胞类型及其信号通路 | 首次结合单细胞RNA测序和Gli1谱系追踪技术系统分析唾液腺纤维化过程中的细胞动态变化 | 研究仅使用小鼠模型，Gli1信号通路在纤维化中的作用相对有限 | 鉴定唾液腺梗阻性损伤后参与纤维化反应的基质细胞类型和信号通路 | 雌性小鼠颌下唾液腺 | 单细胞生物学 | 唾液腺纤维化 | 单细胞RNA测序, 谱系追踪, 导管结扎手术 | 小鼠疾病模型 | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 | 胚胎期16天和成年小鼠唾液腺组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |