单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
321	2024-08-08	A Clustering Method Unifying Cell-Type Recognition and Subtype Identification for Tumor Heterogeneity Analysis 2023 Mar-Apr, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics DOI:10.1109/TCBB.2022.3203185 PMID:36044493	研究论文	本文提出了一种统一细胞类型识别和亚型鉴定的聚类方法（UCRSI），用于肿瘤异质性分析	UCRSI方法通过分别计算选择性表达基因的差异和表达水平的差异，并使用共识邻接矩阵进行组合，从而更准确地进行细胞类型和亚型的识别	NA	旨在改进肿瘤异质性分析中的细胞类型和亚型识别	肿瘤微环境中的不同免疫细胞和肿瘤克隆	单细胞技术	肿瘤	单细胞RNA测序	谱聚类算法	基因表达数据	NA
322	2024-08-08	Bioinformatics Analysis Identifies Key Genes in Recurrent Implantation Failure Based on Immune Infiltration 2023-03, Reproductive sciences (Thousand Oaks, Calif.) DOI:10.1007/s43032-022-01060-4 PMID:36045247	研究论文	本研究通过数据挖掘探索了与反复植入失败（RIF）相关的免疫相关基因	本研究通过综合分析方法（WGCNA、随机森林和LASSO回归）识别了四个关键基因（GJA1、PRKAG2、CPT1A和ICA1），并构建了一个有效的RIF预测模型	NA	探索反复植入失败（RIF）中的免疫相关基因	反复植入失败（RIF）患者与对照组的内膜表达谱	生物信息学	生殖障碍	单样本基因集富集分析（ssGSEA）	NA	RNA测序数据	24例反复植入失败患者和24例对照组
323	2024-08-08	Cross-platform analysis reveals cellular and molecular landscape of glioblastoma invasion 2023-03-14, Neuro-oncology IF:16.4Q1 DOI:10.1093/neuonc/noac186 PMID:35901838	研究论文	本研究通过综合分析组织学和单细胞RNA测序数据，揭示了胶质母细胞瘤侵袭的细胞和分子景观	发现了CRYAB和CD44在侵袭性胶质母细胞瘤中的高度共表达，并证实了它们对肿瘤侵袭性的贡献	NA	改善胶质母细胞瘤的治疗，特别是针对肿瘤侵袭性这一疾病特征	胶质母细胞瘤的侵袭性	数字病理学	脑肿瘤	单细胞RNA测序	NA	组织学样本和RNA测序数据	10名胶质母细胞瘤患者
324	2024-08-08	Prediction of cellular targets in diabetic kidney diseases with single-cell transcriptomic analysis of db/db mouse kidneys 2023-Mar, Journal of cell communication and signaling IF:3.6Q3 DOI:10.1007/s12079-022-00685-z PMID:35809207	研究论文	本研究通过单细胞转录组分析db/db小鼠肾脏，预测糖尿病肾病中的细胞靶点	首次在单细胞分辨率下分析db/db小鼠肾脏的转录组图谱，揭示肾细胞与免疫细胞间的通信	NA	揭示糖尿病肾病的分子机制，以开发更有效的治疗方法	db/db小鼠肾脏中的单细胞转录组	数字病理学	糖尿病肾病	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	db/db小鼠肾脏样本
325	2024-08-05	AP-1 activation mediates post-natal cardiomyocyte maturation 2023-03-31, Cardiovascular research IF:10.2Q1 DOI:10.1093/cvr/cvac088 PMID:35640820	研究论文	本研究表明AP-1转录因子在出生后心肌细胞成熟中的作用	首次提供证据表明AP-1转录因子在出生后心肌细胞成熟中发挥功能	研究主要基于大鼠模型，可能对人类心肌细胞的适用性有限	探讨调控心肌细胞成熟的关键分子机制	新生大鼠心脏中的心肌细胞	数字病理学	先天性心脏病	单细胞RNA测序	NA	RNA序列数据	大鼠心脏样本，出生后第1天和第7天
326	2024-08-05	Spatial transcriptomics unveils ZBTB11 as a regulator of cardiomyocyte degeneration in arrhythmogenic cardiomyopathy 2023-03-31, Cardiovascular research IF:10.2Q1 DOI:10.1093/cvr/cvac072 PMID:35576477	研究论文	本研究揭示了ZBTB11作为心肌病变调节因子的作用	首次将ZBTB11鉴定为在心肌组织中的新型驱动因子，影响心肌细胞的退化	未完全解析心肌细胞退化的所有分子机制	delineate gene expression changes related to remodelling in arrhythmogenic cardiomyopathy	心肌病患者的心脏组织样本	数字病理学	心律失常性心肌病	Tomo-Seq	NA	基因表达数据	多例心肌病患者的心脏组织
327	2024-08-08	Semi-Supervised Deep Learning for Cell Type Identification From Single-Cell Transcriptomic Data 2023 Mar-Apr, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics DOI:10.1109/TCBB.2022.3173587 PMID:35536811	研究论文	本文提出了一种半监督学习模型SemiRNet，用于从单细胞转录组数据中识别细胞类型	使用半监督学习方法，结合少量标记和大量未标记的单细胞转录组数据进行细胞类型识别	需要大量未标记的单细胞转录组数据和有限数量的标记数据	提高从单细胞转录组数据中识别细胞类型的效率和准确性	单细胞转录组数据中的细胞类型	机器学习	NA	单细胞RNA测序（scRNAseq）	循环卷积神经网络（RCNN）	转录组数据	两个大规模单细胞转录组数据集
328	2024-08-08	Deep Nonnegative Matrix Factorization Using a Variational Autoencoder With Application to Single-Cell RNA Sequencing Data 2023 Mar-Apr, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics DOI:10.1109/TCBB.2022.3172723 PMID:35511832	研究论文	本文提出了一种基于变分自编码器的深度非负矩阵分解方法，用于单细胞RNA测序数据的分析	该方法通过将参数分解为细胞间共享和细胞特异性参数，实现了有效的非线性降维，并引入了对数正则化以提高估计准确性	NA	旨在提高单细胞RNA测序数据分析的准确性和生物学解释性	单细胞RNA测序数据	生物信息学	NA	RNA测序	变分自编码器	基因表达数据	多个单细胞样本
329	2024-08-08	scTSSR2: Imputing Dropout Events for Single-Cell RNA Sequencing Using Fast Two-Side Self-Representation 2023 Mar-Apr, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics DOI:10.1109/TCBB.2022.3170587 PMID:35476574	研究论文	本文介绍了一种名为scTSSR2的新型单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据插补方法，该方法结合了矩阵分解和双侧稀疏自表示技术，用于插补scRNA-seq数据中的缺失事件	scTSSR2方法在计算速度和内存使用方面具有明显优势，并且在下游实验中表现优于现有的最先进插补方法	NA	开发一种高效的scRNA-seq数据插补方法，以提高数据质量和下游分析的准确性	scRNA-seq数据中的缺失事件	生物信息学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	双侧稀疏自表示	基因表达数据	NA