单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 330 篇文献，本页显示第 181 - 200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2024-08-05 |
Spatial Transcriptomics Arena (STAr): an Integrated Platform for Spatial Transcriptomics Methodology Research
2023-Mar-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.10.532127
PMID:36945650
|
研究论文 | 本文设计了Spatial Transcriptomics Arena (STAr)平台，以促进空间转录组学研究 | 开发了一个集成平台，包含多种数据集和分析方法，旨在提供无偏见的评估以帮助选择合适的空间基因检测方法 | 现有公共空间转录组数据集分散，处理方式不同，给开发计算方法的研究者带来障碍 | 研究空间转录组学方法的评估和比较 | 针对空间变异基因进行方法的开发和评估 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 数据集 | 193个数据集，来自七种技术和七种统计方法 |
| 182 | 2024-08-05 |
Integrative Single-Cell RNA-Seq and ATAC-Seq Analysis of Mouse Corneal Epithelial Cells
2023-03-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.64.3.30
PMID:36943152
|
研究论文 | 本文应用单细胞多组学分析描绘了小鼠角膜上皮细胞在正常稳态下的基因调控特征 | 本文首次综合了转录组和染色质可及性分析，揭示了角膜上皮细胞的基因调控程序及其细胞类型特异性 | 未提及具体的样本限制或实验局限 | 研究小鼠角膜上皮细胞的基因调控机制 | 小鼠角膜上皮细胞 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq 和 scATAC-seq | NA | RNA序列和染色质可及性数据 | 成年小鼠的角膜上皮细胞 |
| 183 | 2024-08-05 |
Exploring heterogeneity of tumor immune cells and adrenal cells in aldosterone-producing adenomas using single-cell RNA-seq and investigating differences by sex
2023-Mar, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2023.e14357
PMID:36942259
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序探讨了醛固酮产生腺瘤中的肿瘤免疫细胞和肾上腺细胞的异质性 | 揭示了女性CD8+ T细胞具有更强的细胞毒性和炎症相关功能，提供了性别对APA影响的新见解 | 本研究可能未能涵盖所有影响APA发生的因素 | 探讨性别在醛固酮产生腺瘤中的作用机制 | 醛固酮产生腺瘤中的肿瘤免疫细胞和肾上腺细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA |
| 184 | 2024-08-08 |
Potential biomarkers for the prognosis and treatment of HCC immunotherapy
2023-03, European review for medical and pharmacological sciences
DOI:10.26355/eurrev_202303_31569
PMID:36930502
|
研究论文 | 本文通过分析癌症基因组图谱(TCGA)中的肝细胞癌(HCC)样本，基于免疫细胞浸润将其分为两个亚型，并使用加权基因共表达网络分析(WGCNA)识别了重要的调控基因和模块，探讨了这些基因在免疫治疗中的潜在应用。 | 首次基于免疫细胞浸润对HCC样本进行分类，并识别出六个具有显著免疫能力的调控基因，这些基因可能作为HCC治疗的潜在靶点。 | NA | 旨在识别肝细胞癌(HCC)免疫治疗中的免疫相关亚型和潜在治疗靶点。 | 肝细胞癌(HCC)样本及其免疫细胞浸润情况。 | 数字病理学 | 肝癌 | 加权基因共表达网络分析(WGCNA)、单细胞RNA测序、ESTIMATE算法 | NA | 基因表达数据 | 来自癌症基因组图谱(TCGA)的HCC样本 |
| 185 | 2024-08-08 |
Corticosteroids reduce pathologic interferon responses by downregulating STAT1 in patients with high-risk COVID-19
2023-03, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-023-00964-8
PMID:36941461
|
研究论文 | 研究揭示皮质类固醇通过下调STAT1减少高风险COVID-19患者病理性干扰素反应的分子机制 | 首次详细描述了皮质类固醇在高风险COVID-19患者中通过下调STAT1减少病理性干扰素反应的具体机制 | 研究仅基于三个独立COVID-19队列的单细胞RNA测序数据，样本量相对有限 | 揭示COVID-19中高风险患者的分子机制及皮质类固醇的抗炎效果 | 高风险COVID-19患者的外周血单个核细胞（PBMCs） | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 共171个PBMC样本，来自56名患者和12名健康捐赠者 |
| 186 | 2024-08-05 |
Single-cell profiling of the copy-number heterogeneity in colorectal cancer
2023-Mar-20, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000002469
PMID:36914941
|
研究论文 | 本文通过单细胞测序和拷贝数特征识别微卫星稳定（MSS）结直肠癌中肿瘤细胞类型 | 该研究首次结合单细胞测序和拷贝数改变，揭示了MSS结直肠癌中的肿瘤异质性 | 该研究的样本来自特定的患者群体，可能影响结果的普遍性 | 探讨结直肠癌肿瘤细胞的拷贝数异质性 | 19名韩国患者和5名比利时患者的组织样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 26个组织样本来自19名韩国患者和15个组织样本来自5名比利时患者 |
| 187 | 2024-08-08 |
Generation of self-organized autonomic ganglion organoids from fibroblasts
2023-Mar-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.106241
PMID:36922996
|
研究论文 | 本文通过特定的三重转录因子组合APH，成功将小鼠成纤维细胞重编程为自组织和网络化的诱导自主神经节（iAG）类器官，并对其进行了多种方法的表征 | 首次实现了从成纤维细胞生成自组织的自主神经节类器官，这些类器官具有自主神经元的分子特性、亚型多样性和电生理特征 | NA | 研究神经发育和疾病的机制，以及药物筛选和基于细胞的治疗方法的开发 | 自主神经节类器官及其在神经系统和心脏功能中的应用 | 细胞生物学 | 自主神经系统疾病 | 免疫染色、qRT-PCR、膜片钳和单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 小鼠成纤维细胞 |
| 188 | 2024-08-08 |
Increased neutrophils in inflammatory bowel disease accelerate the accumulation of amyloid plaques in the mouse model of Alzheimer's disease
2023-Mar-15, Inflammation and regeneration
IF:5.0Q1
DOI:10.1186/s41232-023-00257-7
PMID:36922861
|
研究论文 | 本文研究了炎症性肠病中的中性粒细胞如何加速阿尔茨海默病小鼠模型中淀粉样蛋白斑块的积累 | 首次揭示了中性粒细胞在急性肠炎后侵入阿尔茨海默病大脑实质，并与疾病进展显著相关 | NA | 探究肠道炎症对阿尔茨海默病发病机制的影响 | 野生型和AppNL-G-F小鼠 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析，免疫组织化学 | NA | 单细胞RNA测序数据，免疫组织化学图像 | 野生型和AppNL-G-F小鼠各若干只 |
| 189 | 2024-08-05 |
Landscape of Exhausted T Cells in Tuberculosis Revealed by Single-Cell Sequencing
2023-Mar-14, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.02839-22
PMID:36916943
|
研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序分析揭示了结核病中耗竭T细胞的转录组特征 | 识别了CD4和CD8 T细胞中的多个亚群及其特征，并探索了耗竭标记基因 | 样本可能局限于特定患者群体，需在更广泛的群体中验证 | 通过了解T细胞的变化，探讨结核分枝杆菌对宿主免疫系统的影响 | 从健康个体和结核病患者的外周血单核细胞中分离的CD4 T和CD8 T细胞 | 数字病理学 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 健康个体和结核病患者的外周血单核细胞样本 |
| 190 | 2024-08-05 |
Screening of potential immune-related genes expressed during sepsis using gene sequencing technology
2023-03-14, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-23062-7
PMID:36918563
|
研究论文 | 通过基因测序技术筛选出在脓毒症期间表达的潜在免疫相关基因 | 首次通过RNA测序和单细胞测序确立了在脓毒症中与生存率相关的六个关键基因 | 样本量较小，可能影响结果的广泛适用性 | 筛选脓毒症的潜在关键靶标 | 脓毒症患者与健康志愿者的外周血样本 | 数字病理学 | 脓毒症 | RNA-seq、单细胞测序、RT-PCR | 小鼠脓毒症模型 | 基因表达数据 | 脓毒症患者23个，健康志愿者10个，单细胞样本5个 |
| 191 | 2024-08-05 |
Enzalutamide-induced signatures revealed by epigenetic plasticity using single-cell multi-omics sequencing in prostate cancer
2023-Mar-14, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2023.02.022
PMID:36910711
|
研究论文 | 本研究通过单细胞多组学测序揭示了恩杂鲁胺诱导的前列腺癌表观遗传可塑性特征 | 整合单细胞测序技术，以揭示前列腺癌对恩杂鲁胺处理的表观遗传响应，提出新的组合药物策略 | 主要用于体外细胞系模型，可能无法完全反映真实临床情况 | 旨在解码恩杂鲁胺处理下前列腺癌的表观遗传可塑性 | 前列腺癌细胞系的单细胞转座酶可接近染色质和全转录组数据 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞多组学测序 | NA | 基因组数据 | 七个特征基因集合的细胞群体 |
| 192 | 2024-08-08 |
B Lymphocyte Development in the Bursa of Fabricius of Young Broilers is Influenced by the Gut Microbiota
2023-Mar-14, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.04799-22
PMID:36917000
|
研究论文 | 本研究探讨了肠道微生物群对年轻肉鸡法氏囊B淋巴细胞发育的影响 | 发现了肠道微生物群与法氏囊B细胞发育的关联，并识别出Taf1作为B细胞谱系分化的一个新关键调节因子 | 肠道微生物群介导B细胞发育及其调控机制的研究尚不充分 | 研究肠道微生物群在早期生命中对B细胞发育和宿主体液免疫成熟的调控作用 | 年轻肉鸡的肠道微生物群和法氏囊B细胞发育 | 免疫学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 涉及抗生素处理的鸡只样本 |
| 193 | 2024-08-08 |
Atf4 regulates angiogenic differences between alveolar bone and long bone macrophages by regulating M1 polarization, based on single-cell RNA sequencing, RNA-seq and ATAC-seq analysis
2023-03-14, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04046-1
PMID:36918894
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、RNA-seq和ATAC-seq分析，探讨了Atf4在调节齿槽骨和长骨巨噬细胞血管生成差异中的作用，特别是通过调节M1极化。 | 首次揭示了Atf4在齿槽骨和长骨巨噬细胞血管生成差异中的作用，并通过实验证实了Atf4通过激活M1极化来调节Vegfa的表达。 | 研究主要集中在小鼠模型上，未来需要进一步在人体样本中验证这些发现。 | 探讨齿槽骨和长骨巨噬细胞在血管生成方面的差异，并揭示Atf4在这一过程中的作用。 | 齿槽骨和长骨的巨噬细胞，以及它们在血管生成中的差异。 | 数字病理学 | 口腔疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），RNA-seq，ATAC-seq | NA | RNA | 小鼠的齿槽骨和长骨样本 |
| 194 | 2024-08-08 |
Cell-specific clock-controlled gene expression program regulates rhythmic fiber cell growth in cotton
2023-03-14, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-023-02886-0
PMID:36918913
|
研究论文 | 本研究通过优化原生质体制备方法，结合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞ATAC测序（scATAC-seq），系统地表征了野生型和无毛/无棉絮（fl）棉花外珠被细胞，揭示了纤维细胞生长的分子机制。 | 首次揭示了纤维细胞特异性的昼夜节律钟控基因表达程序，为通过工程化纤维细胞的昼夜节律来改善纤维特性提供了新途径。 | NA | 探究棉花纤维细胞生长的分子机制。 | 野生型和无毛/无棉絮（fl）棉花的外珠被细胞。 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单细胞ATAC测序（scATAC-seq） | NA | 基因表达数据 | 野生型和无毛/无棉絮（fl）棉花的外珠被细胞 |
| 195 | 2024-08-08 |
Single-cell analyses reveal distinct expression patterns and roles of long non-coding RNAs during hESC differentiation into pancreatic progenitors
2023-03-13, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-023-03259-x
PMID:36907881
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了长非编码RNA在人胚胎干细胞向胰腺前体细胞分化过程中的表达模式和作用 | 首次全面描述了长非编码RNA在人胚胎干细胞分化过程中的表达特征，并揭示了特定长非编码RNA在胰腺前体细胞生成中的关键作用 | NA | 深入理解人胚胎干细胞的分化过程，特别是长非编码RNA在此过程中的作用 | 人胚胎干细胞及其向胰腺前体细胞的分化过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 77,382个细胞 |
| 196 | 2024-08-08 |
Single-cell and spatial dissection of precancerous lesions underlying the initiation process of oral squamous cell carcinoma
2023-Mar-13, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-023-00532-4
PMID:36914617
|
研究论文 | 本文构建了单细胞转录组图谱和空间转录组图谱，以解析口腔鳞状细胞癌（OSCC）前病变阶段的细胞组成和空间结构 | 首次揭示了前病变阶段的细胞景观及其在OSCC启动中的作用，特别是发现了一种独特的免疫抑制性单核细胞亚型和VEGF信号的空间切换调控 | NA | 阐明口腔鳞状细胞癌前病变阶段的细胞景观及其在癌症启动中的作用 | 口腔黏膜的早期OSCC、伴随中至重度异型增生的邻近前病变以及匹配的正常区域 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞转录组测序，空间转录组测序 | NA | 转录组数据 | 9名人类口腔黏膜活检样本 |
| 197 | 2024-08-05 |
Glycyrrhizic acid inhibits myeloid differentiation of hematopoietic stem cells by binding S100 calcium binding protein A8 to improve cognition in aged mice
2023-Mar-11, Immunity & ageing : I & A
IF:5.2Q1
DOI:10.1186/s12979-023-00337-9
PMID:36906583
|
研究论文 | 该研究探讨了甘草酸通过与S100钙结合蛋白A8结合，抑制造血干细胞的髓系分化，从而改善老年小鼠的认知能力。 | 本研究首次揭示了甘草酸通过调节免疫细胞群体以改善老年小鼠的认知能力的具体机制。 | 该研究主要集中于小鼠模型，可能无法完全推断人类的相应机制。 | 研究甘草酸对老年小鼠免疫系统的影响及其改善认知能力的机制。 | 研究对象为年轻小鼠、老年小鼠及甘草酸处理的老年小鼠的外周血单核细胞。 | 数字病理学 | 衰老疾病 | 单细胞测序 | NA | 细胞数据 | 涉及年轻小鼠、老年小鼠及甘草酸处理的老年小鼠的样本 |
| 198 | 2024-08-05 |
Multi-omics and experimental analysis unveil theragnostic value and immunological roles of inner membrane mitochondrial protein (IMMT) in breast cancer
2023-03-10, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04035-4
PMID:36899366
|
研究论文 | 这项研究揭示了内膜线粒体蛋白（IMMT）在乳腺癌中的治疗诊断价值及其免疫学角色 | 首次将多组学分析与实验验证结合，揭示IMMT在乳腺癌临床意义及其在免疫微环境中的作用 | IMMT的预后意义受到多种细胞成分和肿瘤突变负荷（TMB）水平的影响 | 评估内膜线粒体蛋白在乳腺癌中的诊断和预后价值 | 乳腺癌患者的内膜线粒体蛋白及其对肿瘤免疫微环境的影响 | 数字病理 | 乳腺癌 | 多组学分析，siRNA敲低 | NA | 临床样本，细胞样本 | 临床样本及单细胞分析 |
| 199 | 2024-08-08 |
CAF signature predicts the prognosis of colorectal cancer patients: A retrospective study based on bulk RNA sequencing and single-cell RNA sequencing data
2023-Mar-10, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000033149
PMID:36897717
|
研究论文 | 本研究基于批量RNA测序和单细胞RNA测序数据，构建了一个基于癌症相关成纤维细胞（CAFs）标志基因的结直肠癌（CRC）预后模型 | 首次基于CAFs标志基因构建了CRC患者的生存预测签名，并揭示了肿瘤抑制微环境和失调的免疫检查点基因在CRC组织中对患者不良预后的部分作用 | NA | 建立一个基于CAFs标志基因的CRC预后模型 | 结直肠癌患者的预后预测 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 数据来自癌症基因组图谱数据库和基因表达综合数据库，具体样本数量未详细说明 |
| 200 | 2024-08-08 |
Quantitative Evaluation of Stem-like Markers of Human Glioblastoma Using Single-Cell RNA Sequencing Datasets
2023-Mar-02, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers15051557
PMID:36900348
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据集对37名胶质母细胞瘤患者的干细胞标志物进行定量评估 | 首次通过单细胞RNA测序数据集对胶质母细胞瘤干细胞标志物进行大规模定量评估和选择 | 研究主要集中在实验室和临床治疗中的应用，未涉及其他可能的临床场景 | 评估和选择胶质母细胞瘤干细胞标志物的效率和可行性 | 胶质母细胞瘤干细胞标志物 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 37名胶质母细胞瘤患者，共2173个干细胞标志物候选 |