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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-09-21 |
ERS International Congress 2022: highlights from the Basic and Translational Science Assembly
2023-Mar, ERJ open research
IF:4.3Q1
DOI:10.1183/23120541.00561-2022
PMID:37077558
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综述 | 欧洲呼吸学会基础与转化科学组对2022年国际大会的亮点进行了总结,讨论了从出生到老年的呼吸事件后果,包括气候变化、早期生活事件、人类肺细胞图谱、细胞死亡方式以及哮喘和再生治疗的新靶点 | 介绍了人类肺细胞图谱(HLCA)作为健康人类肺的新参考点,结合单细胞RNA测序和空间数据发现新细胞类型/状态和生态位,并讨论了细胞死亡方式在慢性肺病中的调节作用及治疗潜力 | 未明确提及 | 概述2022年欧洲呼吸学会国际大会在基础与转化科学方面的亮点 | 呼吸系统疾病,包括支气管肺发育不良、先兆子痫、慢性肺病、哮喘等 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 文本 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | NA |
| 2 | 2026-09-20 |
Analysis of RNA processing directly from spatial transcriptomics data reveals previously unknown regulation
2023-Mar-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.13.532412
PMID:36993757
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研究论文 | 该文章首次将ReadZS和SpliZ方法应用于空间转录组数据,直接分析RNA加工的空间调控。 | 首次将ReadZS和SpliZ方法应用于空间转录组数据,分析RNA加工的空间定位。 | 计算挑战可能限制方法的广泛应用,样本仅限小鼠大脑和肾脏。 | 研究RNA加工在空间转录组数据中的空间调控。 | 小鼠大脑和肾脏的空间转录组数据。 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | Moran's I | 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | NA |
| 3 | 2026-09-20 |
Revealing the Heterogeneity of the Tumor Ecosystem of Cholangiocarcinoma through Single-Cell Transcriptomics
2023-03-10, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12060862
PMID:36980203
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综述 | 本文综述了利用单细胞转录组学揭示胆管癌肿瘤生态系统异质性的研究进展 | 系统总结了单细胞RNA测序在胆管癌肿瘤生态系统异质性研究中的应用,并提出了未来方向和潜在临床应用 | 讨论了当前研究的局限性 | 研究胆管癌肿瘤生态系统的异质性及各种细胞成分之间的相互作用 | 胆管癌肿瘤生态系统中的肿瘤细胞、基质细胞和浸润免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 胆管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4 | 2026-08-23 |
Endothelial and Leptin Receptor+ cells promote the maintenance of stem cells and hematopoiesis in early postnatal murine bone marrow
2023-03-13, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.02.003
PMID:36868235
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序,分析了出生后不同时间点小鼠骨髓基质细胞的变化,揭示了LepR细胞和内皮细胞在早期出生后骨髓中维持造血干细胞和造血功能的关键作用 | 首次系统描绘了早期出生后骨髓微环境中LepR细胞和内皮细胞的动态变化及其在造血调控中的具体功能,发现内皮细胞通过膜结合型SCF维持造血干细胞,而LepR/Prx1基质细胞通过SCF支持髓系和红系祖细胞 | 研究基于小鼠模型,未在人类样本中验证;具体分子机制和信号通路尚未完全阐明 | 阐明早期出生后骨髓微环境中LepR细胞和内皮细胞对造血干细胞和造血的维持作用 | 小鼠骨髓基质细胞,包括LepR细胞和内皮细胞 | 单细胞转录组学 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 单细胞转录组数据 | 出生后4天、14天和8周的小鼠骨髓基质细胞 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 5 | 2026-08-18 |
Placental Inflammation Leads to Abnormal Embryonic Heart Development
2023-03-21, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究通过小鼠模型发现,中性粒细胞驱动的胎盘炎症可导致胎盘发育不良,进而使母体炎性单核细胞迁移至胚胎心脏,引发心脏结构和功能异常,并持续至出生后 | 首次揭示了中性粒细胞驱动的胎盘炎症直接导致胚胎心脏发育异常的机制,证明胎盘炎症可通过免疫细胞迁移影响胎儿心脏,并通过调节胎盘炎症可预防心脏缺陷 | 研究基于小鼠模型,未在人类中验证;未深入探讨炎症单核细胞迁移的具体分子机制 | 探究胎盘炎症如何导致先天性心脏病的机制 | 小鼠胚胎心脏和胎盘组织 | 发育生物学 | 先天性心脏病 | 流式细胞术、组织学、批量RNA测序、单细胞测序 | 中性粒细胞耗竭小鼠模型 | 测序数据、图像数据 | 小鼠胚胎(不同发育阶段)和出生后幼鼠,具体数量未提供 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6 | 2026-08-13 |
Lysyl oxidase regulates epithelial differentiation and barrier integrity in eosinophilic esophagitis
2023-Mar-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.27.534387
PMID:37034590
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研究论文 | 本研究探讨了赖氨酰氧化酶(LOX)在嗜酸性食管炎(EoE)中对上皮分化和屏障完整性的调控作用,发现LOX通过激活骨形态发生蛋白(BMP)信号通路促进上皮稳态。 | 首次揭示了LOX在食管上皮中的非经典功能,即作为信号分子通过BMP通路调节上皮分化和屏障功能,提出了LOX/BMP轴作为EoE治疗的潜在靶点。 | 研究主要基于体外3D类器官和空气-液体界面培养模型,缺乏体内验证;且未深入探讨LOX/BMP轴的上下游调控机制。 | 阐明LOX在EoE食管上皮中的功能作用及其分子机制,评估其作为治疗靶点的潜力。 | 人食管上皮类器官和空气-液体界面培养细胞,经IL-13刺激模拟EoE炎症环境。 | 分子生物学 | 嗜酸性食管炎 | 单细胞RNA测序、定量逆转录聚合酶链反应、Western blot、组织学分析、屏障功能分析 | 3D类器官和空气-液体界面培养模型 | 基因表达数据和功能实验数据 | 患者来源的类器官(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7 | 2026-08-07 |
Multiplexed evaluation of mouse wound tissue using oligonucleotide barcoding with single-cell RNA sequencing
2023-03-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101946
PMID:36525348
|
研究论文 | 本文介绍了一种使用寡核苷酸条形码结合单细胞RNA测序对小鼠伤口组织进行多重评估的协议。 | 提出了一种针对伤口组织这一挑战性样本类型的寡核苷酸条形码标记和合并方案,降低了单细胞RNA测序在大规模研究中的成本。 | 文中未明确提及局限性,但可能受限于样本准备复杂性和跨物种应用的验证需求。 | 开发一种成本效益高的单细胞RNA测序方法,用于评估伤口愈合过程中的组织异质性,并可推广至其他物种。 | 小鼠皮肤伤口组织,以及可能的大鼠、猪和人类样本。 | 单细胞转录组学 | 伤口愈合 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据(单细胞转录组) | 未具体说明样本数量,但涉及小鼠模型。 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 未详细说明,可能使用10x Chromium单细胞3'试剂盒。 |
| 8 | 2026-05-30 |
JAK-STAT activation contributes to cytotoxic T cell-mediated basal cell death in human chronic lung allograft dysfunction
2023-03-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.167082
PMID:36946463
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析,揭示JAK-STAT信号激活导致细胞毒性T细胞介导的基底细胞死亡,进而参与人类慢性肺同种异体移植物功能障碍的发生机制 | 首次阐明JAK-STAT信号在气道上皮细胞中激活导致MHC-I上调,从而引起基底细胞被细胞毒性T细胞杀伤的细胞间相互作用机制,为CLAD治疗提供新靶点 | 研究基于离体组织样本,尚需在体模型验证;未明确JAK-STAT信号抑制剂的具体疗效 | 探究慢性肺同种异体移植物功能障碍(CLAD)中气道特异性同种免疫损伤的细胞分子机制 | 人类肺移植受者中CLAD患者的移植肺组织 | 数字病理学 | 慢性肺同种异体移植物功能障碍 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | 来自人类肺移植受者(具体样本量未提及) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 可能使用10x Chromium Single Cell 3'和10x Visium空间转录组试剂盒 |
| 9 | 2026-05-28 |
Astroglial toxicity promotes synaptic degeneration in the thalamocortical circuit in frontotemporal dementia with GRN mutations
2023-03-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI164919
PMID:36602862
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研究论文 | 通过比较单细胞转录组学揭示星形胶质细胞毒性在GRN突变导致的额颞叶痴呆丘脑皮质回路突触变性中的关键作用 | 首次发现并验证GRN突变引起的星形胶质细胞病理特征(GJA1、AQP4、APOE上调及SLC1A2下调)是跨物种突触变性的保守机制 | 未明确星形胶质细胞毒性与TDP-43蛋白病之间的上下游因果关系 | 阐明GRN突变导致额颞叶痴呆的丘脑皮质回路神经退行性机制 | Grn-/-小鼠及FTLD-GRN患者的丘脑和额叶皮层 | 数字病理学 | 额颞叶痴呆 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | Grn-/-小鼠及FTLD-GRN患者样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 10 | 2026-05-20 |
Single-Cell Kinetic Modeling of β-Lapachone Metabolism in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
2023-Mar-17, Antioxidants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antiox12030741
PMID:36978989
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据,对头颈部鳞状细胞癌中β-拉帕醌代谢进行动力学建模,模拟药物诱导的氧化应激反应 | 首次构建了基于单细胞转录组的抗氧化酶网络模型,揭示了健康与癌细胞之间氧化还原状态的系统性差异,为解释NQO1生物活化药物的临床异质性提供了机制基础 | 模型基于转录组数据推断酶活性,未直接测量蛋白质表达或代谢通量;样本量有限(10名患者),可能无法完全代表HNSCC的异质性 | 利用单细胞RNA测序数据模拟头颈部鳞状细胞癌对β-拉帕醌治疗的反应异质性 | 10名头颈部鳞状细胞癌患者的肿瘤组织及对应的健康组织细胞 | 单细胞组学、系统生物学建模 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、系统动力学建模 | 抗氧化酶网络模型(基于微分方程的系统生物学模型) | 单细胞转录组数据 | 10名头颈部鳞状细胞癌患者的肿瘤和健康组织样本,超过4000个单细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基于单细胞RNA测序数据的计算建模,未提及具体测序平台 |
| 11 | 2026-05-16 |
Single-cell RNA sequencing reveals cell landscape following antimony exposure during spermatogenesis in Drosophila testes
2023-Mar-09, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-023-01391-4
PMID:36894529
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示锑暴露对果蝇睾丸精子发生过程中细胞景观的影响 | 首次在单细胞分辨率下揭示锑暴露对果蝇睾丸精子发生的转录调控机制,并发现新的基因(如Dup98B)在精子发生过程中的状态偏向表达 | 未提及具体局限性 | 研究锑暴露对果蝇睾丸精子发生的影响及单细胞分辨率下的转录调控机制 | 果蝇睾丸细胞 | digital pathology | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 果蝇暴露于锑10天的睾丸样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12 | 2026-05-01 |
Inhibition of a signaling modality within the gp130 receptor enhances tissue regeneration and mitigates osteoarthritis
2023-03-22, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abq2395
PMID:36947594
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研究论文 | 研究发现gp130受体内的一个信号模块抑制后可以增强组织再生并缓解骨关节炎 | 首次发现gp130受体中的Y814酪氨酸作为细胞应激传感器,通过遗传和药理手段调控其活性可促进组织再生并抑制炎症 | 主要基于小鼠模型,在犬模型中初步验证但缺乏大动物和人体研究数据 | 探究gp130受体信号调控对组织再生和骨关节炎的影响机制 | 小鼠(野生型和F814突变体)、大鼠和犬的皮肤伤口及关节组织 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠(具体数量未明确)、大鼠和犬各若干只 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 13 | 2026-05-01 |
Reprogramming the tumor microenvironment leverages CD8+ T cell responses to a shared tumor/self antigen in ovarian cancer
2023-Mar-16, Molecular therapy oncolytics
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.omto.2023.02.002
PMID:36875325
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研究论文 | 利用CXCR4拮抗剂武装的溶瘤病毒疗法重编程肿瘤微环境,诱导针对肿瘤/自身抗原的CD8+ T细胞反应,提高卵巢癌治疗效果 | 首次通过CXCR4拮抗剂武装的溶瘤病毒靶向免疫抑制性肿瘤微环境,打破对弱免疫原性自身抗原的耐受,诱导肿瘤/自身特异性CD8 T细胞反应 | 研究基于小鼠模型,未涉及人类患者样本;依赖SV40 T抗原作为模型抗原,可能不完全代表人类卵巢癌中复杂的内源性肿瘤抗原 | 探究CXCR4拮抗剂武装的溶瘤病毒疗法对肿瘤进展和抗肿瘤免疫的影响 | 原位生长的SV40 T抗原卵巢癌小鼠模型(野生型和Tg转基因小鼠) | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, 免疫染色 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型(具体数量未说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 14 | 2026-04-30 |
Tumor PD-L1 engages myeloid PD-1 to suppress type I interferon to impair cytotoxic T lymphocyte recruitment
2023-03-13, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2023.02.005
PMID:36917954
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研究论文 | 该研究揭示肿瘤细胞PD-L1通过与髓系细胞PD-1结合,激活SHP2抑制I型干扰素信号通路,从而削弱细胞毒性T淋巴细胞向肺转移灶的募集,促进肿瘤免疫逃逸 | 首次发现肿瘤PD-L1并非直接抑制T细胞活性,而是通过髓系PD-1介导的SHP2-IFN-I-STAT1-CXCL9信号轴调控CTL募集,并证实该机制在肺转移中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类数据仅显示相关性,未完全验证机制;未阐明其他肿瘤模型或器官转移中的普适性 | 阐明肿瘤细胞PD-L1在肿瘤免疫逃逸中通过髓系细胞介导的分子机制 | 肿瘤细胞(PD-L1)、髓系细胞(PD-1)、细胞毒性T淋巴细胞、小鼠肺转移模型 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型(未明确具体数量);人癌症患者样本(数量未指定) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 15 | 2026-04-20 |
Protocol for multi-modal single-cell RNA sequencing on M. tuberculosis-infected mouse lungs
2023-03-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102102
PMID:36853694
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研究论文 | 本文开发了一种用于M. tuberculosis感染小鼠肺组织的多模态单细胞RNA测序协议 | 同时获取每个感染细胞的转录组、表面标志物表达和细菌表型信息 | NA | 阐明不同免疫细胞如何控制或促进M. tuberculosis感染 | M. tuberculosis感染的小鼠肺组织巨噬细胞 | 数字病理学 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 多模态单细胞分析 | NA | NA |
| 16 | 2026-04-09 |
Multiomic analyses implicate a neurodevelopmental program in the pathogenesis of cerebral arachnoid cysts
2023-03, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-023-02238-2
PMID:36879130
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研究论文 | 本研究通过多组学分析探讨了脑蛛网膜囊肿的发病机制,揭示了其与神经发育程序的关联 | 首次整合患者-父母外显子组、单细胞RNA测序转录组和医疗记录自然语言处理数据,系统性分析脑蛛网膜囊肿的遗传基础和临床亚型 | 研究样本量相对有限,且主要基于外显子组数据,可能遗漏非编码区域的变异 | 阐明脑蛛网膜囊肿的发病机制及其与神经发育障碍的关联 | 脑蛛网膜囊肿患者及其父母、人类和小鼠的脑及脑膜单细胞转录组数据 | 自然语言处理 | 脑蛛网膜囊肿 | 外显子组测序、单细胞RNA测序、自然语言处理 | NA | 基因组数据、转录组数据、文本数据 | 617个患者-父母三重外显子组、152,898个人类和小鼠脑及脑膜单细胞转录组 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 17 | 2026-04-07 |
Molecular and spatial profiling of the paraventricular nucleus of the thalamus
2023-03-03, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.81818
PMID:36867023
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研究论文 | 本研究通过单核RNA测序和多重荧光原位杂交技术,揭示了小鼠丘脑室旁核的分子多样性和空间组织特征 | 首次识别了五种分子上不同的PVT神经元亚型,并发现了以前未知的分子梯度组织模式,提供了对PVT与皮层连接的新见解 | 研究仅基于小鼠模型,未涉及人类或其他物种;单核RNA测序可能无法完全捕获所有细胞类型的转录组信息 | 阐明丘脑室旁核的分子身份和空间分布,以理解其功能多样性 | 小鼠丘脑室旁核的神经元 | 神经科学 | NA | 单核RNA测序,多重荧光原位杂交 | NA | RNA序列数据,图像数据 | 未明确指定样本数量,但基于小鼠脑组织 | NA | 单核RNA测序 | NA | NA |
| 18 | 2026-04-01 |
Lineage plasticity enables low-ER luminal tumors to evolve and gain basal-like traits
2023-03-01, Breast cancer research : BCR
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s13058-023-01621-8
PMID:36859337
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研究论文 | 本研究揭示了低雌激素受体(ER)表达的管腔型乳腺肿瘤可通过谱系可塑性演化并获得基底样特征 | 首次通过谱系追踪和单细胞RNA测序证明低ER管腔肿瘤可通过谱系可塑性演化出基底样特征,并发现SOX10是这一过程的关键驱动因子 | 研究主要基于MMTV-PyMT小鼠模型,人类肿瘤中的验证尚需进一步研究 | 探究低ER管腔型乳腺肿瘤如何演化并获得基底样特征的分子机制 | MMTV-PyMT小鼠乳腺肿瘤模型及乳腺肿瘤细胞 | 肿瘤生物学 | 乳腺癌 | 谱系追踪,单细胞RNA测序 | MMTV-PyMT小鼠肿瘤模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 19 | 2026-03-31 |
Proteomic Profiling of Fallopian Tube-Derived Extracellular Vesicles Using a Microfluidic Tissue-on-Chip System
2023-Mar-27, Bioengineering (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/bioengineering10040423
PMID:37106610
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研究论文 | 本研究建立了一个微流控组织芯片系统,用于培养人输卵管上皮细胞并收集其分泌的小细胞外囊泡,首次报道了295种常见的hFTE sEV蛋白,并揭示了这些蛋白与输卵管组织转录组之间的相关性 | 首次利用微流控平台培养人输卵管上皮细胞进行sEV收集,并通过质谱蛋白质组学分析,首次报道了295种常见的hFTE sEV蛋白质,并关联了sEV蛋白谱与组织空间转录组数据 | 研究受限于生物材料的可用性和适当的培养方法,且样本规模可能较小 | 研究人输卵管上皮细胞来源的小细胞外囊泡的蛋白质组成及其功能,探索其在卵巢癌发生和生殖功能中的作用 | 人输卵管上皮细胞及其分泌的小细胞外囊泡 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 质谱蛋白质组学分析,空间转录组学分析 | 微流控组织芯片系统 | 蛋白质组数据,转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | GeoMx Cancer Transcriptome Atlas | NA |
| 20 | 2026-03-19 |
Single-cell RNA sequencing identifies hippocampal microglial dysregulation in diet-induced obesity
2023-Mar-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.106164
PMID:36915697
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,探讨了高脂饮食诱导的肥胖对海马区小胶质细胞功能失调的影响及其与认知障碍的关联 | 利用单细胞转录组学分析,揭示了肥胖状态下海马小胶质细胞在细胞间通讯、免疫调节和蛋白质处理方面的动态变化机制 | 研究基于小鼠模型,其机制在人类中的适用性仍需进一步验证 | 探究肥胖诱导的认知障碍中海马小胶质细胞激活的精确分子机制 | 高脂饮食诱导的肥胖小鼠模型中的海马小胶质细胞 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |