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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2024-08-08 |
A comparative study of in vitro air-liquid interface culture models of the human airway epithelium evaluating cellular heterogeneity and gene expression at single cell resolution
2023-Feb-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.02.27.530299
PMID:36909601
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序、免疫组织化学和功能实验,比较了BCi-NS1.1细胞系和原代细胞衍生的HAE培养模型在细胞异质性和基因表达上的差异 | 首次全面比较了BCi-NS1.1细胞系和原代细胞衍生的HAE培养模型在基因表达和先天免疫功能上的差异 | 未观察到BCi-NS1.1 HAE培养模型与原代细胞在流感病毒感染敏感性上的显著差异 | 评估BCi-NS1.1细胞系衍生的HAE培养模型在呼吸道感染疾病研究中的应用价值 | BCi-NS1.1细胞系和原代细胞衍生的HAE培养模型 | NA | 呼吸道感染疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 122 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis of CX3CR1 + cells reveal a pathogenic role for BIRC5 + myeloid proliferating cells driven by Staphylococcus aureus leukotoxins
2023-Feb-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.02.27.529760
PMID:36909517
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和遗传命运图谱技术,揭示了在感染过程中,由金黄色葡萄球菌白细胞毒素驱动的BIRC5阳性骨髓增殖细胞在CX3CR1阳性细胞中的致病作用。 | 本研究首次通过单细胞RNA测序和遗传命运图谱技术,揭示了BIRC5阳性骨髓增殖细胞在感染中的致病作用,并发现这些细胞的扩增与组织损伤毒素的存在有关。 | 研究主要集中在小鼠模型上,可能需要进一步的人体研究来验证这些发现。 | 探讨在感染过程中,特定类型的骨髓细胞如何影响疾病进程。 | CX3CR1阳性细胞和BIRC5阳性骨髓增殖细胞。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 小鼠模型中的CX3CR1阳性细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 123 | 2024-08-05 |
Mitochondria-Associated Endoplasmic Reticulum Membrane (MAM) Is a Promising Signature to Predict Prognosis and Therapies for Hepatocellular Carcinoma (HCC)
2023-Feb-24, Journal of clinical medicine
IF:3.0Q1
DOI:10.3390/jcm12051830
PMID:36902617
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研究论文 | 这篇文章探讨了线粒体相关内质网膜(MAM)在肝细胞癌(HCC)预后和治疗中的潜在作用 | 研究首次详细探讨了MAM在HCC中的重要性并建立了MAM评分来预测患者预后 | 研究仅使用了特定数据集作为训练集,可能限制了发现的广泛适用性 | 旨在评估MAM评分在HCC患者预后和免疫治疗反应中的价值 | 研究对象为肝细胞癌患者及其肿瘤相关细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序,基因共表达网络 | NA | 基因表达数据 | 使用了TCGA-LIHC、ICGC及多个GEO数据集进行分析 | NA | NA | NA | NA |
| 124 | 2024-08-08 |
The CXCL10/CXCR3 Pathway Contributes to the Synergy of Thermal Ablation and PD-1 Blockade Therapy against Tumors
2023-Feb-23, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers15051427
PMID:36900218
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研究论文 | 研究探讨了热消融与PD-1阻断疗法联合治疗肿瘤的协同作用及其机制 | 首次揭示了CXCL10/CXCR3轴在热消融与抗PD-1疗法联合治疗中的作用,并提出该信号通路的激活可能增强这种联合治疗的协同效应 | NA | 研究热消融与PD-1阻断疗法联合治疗肿瘤的协同作用及其机制 | 肿瘤组织中的浸润性免疫细胞及热消融治疗后的变化 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 肿瘤携带小鼠的肿瘤组织与对照肿瘤组织 | NA | NA | NA | NA |
| 125 | 2024-08-05 |
Cell-Type-Specific Gene Regulatory Networks of Pro-Inflammatory and Pro-Resolving Lipid Mediator Biosynthesis in the Immune System
2023-Feb-22, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24054342
PMID:36901771
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研究论文 | 本研究探讨了免疫系统中促炎和促解决脂质介质合成的细胞类型特异性基因调控网络 | 首次系统地绘制了与PIM和SPM合成相关的细胞类型特异性基因调控网络 | 尽管识别了基因调控网络,但具体的调控机制仍需进一步研究 | 研究脂质介质在免疫反应中的基因调控及其细胞类型特异性 | 以免疫细胞为研究对象,关注PIM和SPM的合成路径 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 机器学习方法 | 基因表达数据 | 大规模单细胞数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 126 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Transcriptome Profiling of Liver Cells of Short-Term Alcoholic Liver Injury in Mice
2023-Feb-22, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24054344
PMID:36901774
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,分析了小鼠短期酒精性肝损伤中肝脏细胞的转录组变化 | 首次在单细胞水平上揭示了酒精性肝损伤中不同肝脏细胞类型的分子和细胞机制 | NA | 探讨酒精性肝损伤的细胞和分子机制 | 小鼠肝脏细胞 | 数字病理学 | 酒精性肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 51,619个肝脏单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 127 | 2024-08-05 |
Important Cells and Factors from Tumor Microenvironment Participated in Perineural Invasion
2023-Feb-21, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers15051360
PMID:36900158
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研究论文 | 本研究总结了肿瘤微环境中参与神经侵犯的细胞和因素 | 提供了关于神经侵犯的新见解,探讨了神经与肿瘤之间的相互作用 | 没有明确提到研究的限制 | 旨在总结神经侵犯的分子介质和发病机制 | 肿瘤微环境及其中的细胞和信号分子 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 128 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA-seq analysis reveals dual sensing of HIV-1 in blood Axl+ dendritic cells
2023-Feb-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.106019
PMID:36866043
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研究论文 | 本研究揭示了HIV-1在血液Axl+树突状细胞中的双重感知机制 | 首次识别了血液AxlDC亚群的特殊能力来识别和复制HIV-1并启动不同的转录程序 | 没有明显的局限性信息 | 研究Axl+树突状细胞对HIV-1的抗病毒响应 | 主要研究人类原代血液树突状细胞的不同亚群 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 主要针对多种血液树突状细胞亚群,具体样本数量未明 | NA | NA | NA | NA |
| 129 | 2024-08-05 |
Bulk and single-cell characterisation of the immune heterogeneity of atherosclerosis identifies novel targets for immunotherapy
2023-02-28, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-023-01540-2
PMID:36855107
|
研究论文 | 本文通过整合多样本的测序结果,探讨了动脉粥样硬化中的免疫细胞异质性 | 通过增强的单细胞测序工作流程,识别出28种不同的免疫细胞亚群,并提供了新的免疫治疗靶点 | 研究可能受限于样本数量和种类的多样性 | 研究旨在揭示动脉粥样硬化中免疫细胞的异质性 | 研究对象为参与动脉粥样硬化过程的不同亚群免疫细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 多个样本(确切样本数量未提供) | NA | NA | NA | NA |
| 130 | 2024-08-05 |
Supplementation with α-ketoglutarate improved the efficacy of anti-PD1 melanoma treatment through epigenetic modulation of PD-L1
2023-02-28, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-023-05692-5
PMID:36854755
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研究论文 | 本研究探讨了α-酮戊二酸对抗PD1黑色素瘤治疗的影响 | 研究首次阐明了α-酮戊二酸通过调节PD-L1的表观遗传机制改善抗PD1治疗效果 | 研究中涉及的样本量可能不足以全面验证结果的普遍性 | 提升抗PD1治疗黑色素瘤的疗效 | 健康对照者、抗PD1敏感的黑色素瘤小鼠和患者 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞测序 | NA | 临床数据和前临床样本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 131 | 2024-08-08 |
A cost-effective machine learning-based method for preeclampsia risk assessment and driver genes discovery
2023-Feb-28, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-023-00991-y
PMID:36849879
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研究论文 | 本文介绍了一种基于机器学习的计算生物学方法,用于评估子痫前期的风险并发现驱动基因 | 首次设计了一种使用单细胞转录组数据来识别病理细胞亚群并预测子痫前期风险的计算生物学方法,并开发了一个在线网络服务器以提高可访问性 | NA | 开发一种有效的机器学习方法来评估子痫前期的风险并发现相关的驱动基因 | 健康妊娠和早期发作子痫前期的单细胞转录组数据 | 机器学习 | 妊娠疾病 | 单细胞转录组测序(scRNA-seq) | 集成学习框架 | 转录组数据 | 健康妊娠38周和早期发作子痫前期28-32周的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 132 | 2024-08-08 |
Automating iPSC generation to enable autologous photoreceptor cell replacement therapy
2023-02-28, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-03966-2
PMID:36855199
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研究论文 | 本研究描述了使用Cell X精密机器人细胞培养平台实现临床级患者特异性iPSC的并行生产 | 开发了一种机器人iPSC生成平台和标准操作程序,用于生产高质量的光感受器前体细胞,符合当前的良好制造规范 | NA | 实现自体iPSC介导的光感受器细胞替换疗法 | 患者特异性iPSC的并行生产 | 细胞生物学 | 遗传性视网膜变性 | 细胞培养平台 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 133 | 2024-08-05 |
A variational algorithm to detect the clonal copy number substructure of tumors from scRNA-seq data
2023-02-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-36790-9
PMID:36841879
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研究论文 | 本文报告了一种快速的变分算法SCEVAN,用于从单细胞RNA测序数据中解卷肿瘤的克隆亚结构 | SCEVAN利用多通道分割算法,假设同一拷贝数克隆的所有细胞共享相同的断点,提供了一种新的分析肿瘤的方法 | NA | 研究单细胞RNA测序技术在肿瘤微环境中的应用 | 不同肿瘤类型和技术下的106个样本及93,322个细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | 变分算法 | 细胞数据 | 106个样本,93,322个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 134 | 2024-08-05 |
Mapping Spatiotemporal Heterogeneity in Tumor Profiles by Integrating High-Throughput Imaging and Omics Analysis
2023-Feb-21, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.2c06659
PMID:36844580
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综述 | 本文回顾了高通量成像和组学分析在肿瘤异质性映射中的应用 | 探讨了最新的技术趋势和生物学见解,结合了分子诊断和空间转录组学的发展 | 对异质性出现原因的理解仍然不完整,限制了从治疗角度管理异质性的能力 | 研究肿瘤内部异质性的动态演变 | 聚焦于肿瘤细胞类型和基质成分的异质性 | 数字病理学 | NA | 高通量分子成像、单细胞组学、空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 135 | 2024-08-05 |
Protoplast Preparation for Algal Single-Cell Omics Sequencing
2023-Feb-20, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms11020538
PMID:36838504
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review | 本文综述了制备藻类原生质体的方法,以便于单细胞测序的应用 | 创新点在于总结了藻类细胞壁的结构及化学成分,并介绍了多种制备藻类原生质体的先进方法 | 该综述主要集中在当前已知的制备方法,没有涉及新兴或未广泛应用的技术 | 探讨单细胞测序在真核藻类研究中的应用潜力 | 关注于绿藻门的藻类细胞壁和原生质体的制备 | NA | NA | NA | NA | NA | 涉及一些常用真核藻类的特定案例 | NA | NA | NA | NA |
| 136 | 2024-08-08 |
Proteomic and single-cell landscape reveals novel pathogenic mechanisms of HBV-infected intrahepatic cholangiocarcinoma
2023-Feb-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.106003
PMID:36852159
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研究论文 | 本研究通过全外显子测序、蛋白质组分析和单细胞RNA测序,揭示了HBV感染的肝内胆管癌(ICC)的新型致病机制 | 首次揭示了HBV感染的ICC患者中细胞间连接水平下降与上皮-间质转化(EMT)程序增加的关系,以及ICAM1肿瘤相关巨噬细胞与不良预后的关联 | 样本量相对较小,可能影响结果的普遍性 | 探讨HBV感染对肝内胆管癌的致癌效应及其相关致病机制 | HBV感染的肝内胆管癌患者与非HBV感染的ICC患者 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 全外显子测序、蛋白质组分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、蛋白质数据、单细胞RNA数据 | 32名HBV感染的ICC患者和89名非HBV感染的ICC患者 | NA | NA | NA | NA |
| 137 | 2024-08-08 |
The PD-L1 Expression and Tumor-Infiltrating Immune Cells Predict an Unfavorable Prognosis in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma and Adenosquamous Carcinoma
2023-Feb-09, Journal of clinical medicine
IF:3.0Q1
DOI:10.3390/jcm12041398
PMID:36835933
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研究论文 | 研究探讨了肿瘤微环境中的PD-L1表达和肿瘤浸润免疫细胞与胰腺导管腺癌及腺鳞癌患者预后之间的关系 | 首次详细分析了PD-L1表达和肿瘤浸润免疫细胞在胰腺导管腺癌及腺鳞癌中的临床意义 | 研究样本量相对较小,可能影响结果的普遍性 | 探究肿瘤微环境中的免疫细胞组成及其对胰腺癌预后的影响 | 胰腺导管腺癌和腺鳞癌患者的肿瘤微环境及免疫细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 免疫组织化学, scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 29例腺鳞癌患者和54例胰腺导管腺癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 138 | 2024-08-08 |
The Role of Ferroptosis and Cuproptosis in Curcumin against Hepatocellular Carcinoma
2023-Feb-08, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules28041623
PMID:36838613
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研究论文 | 研究了姜黄素在肝细胞癌治疗中通过铁死亡和铜死亡机制的作用 | 开发了铜死亡潜力指数(CPI)并与铁死亡潜力指数(FPI)结合,用于定量分析姜黄素处理的肝细胞癌细胞 | NA | 探讨姜黄素在肝细胞癌治疗中的作用机制,特别是铁死亡和铜死亡的影响 | 姜黄素处理下的PLC、KMCH和Huh7细胞 | NA | 肝细胞癌 | 加权基因共表达网络分析(WGCNA),单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 702、515和721个差异表达基因分别来自姜黄素处理的PLC、KMCH和Huh7细胞,以及16种肝细胞癌亚型的单细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA |
| 139 | 2024-08-05 |
Artificial Intelligence-Assisted Transcriptomic Analysis to Advance Cancer Immunotherapy
2023-Feb-06, Journal of clinical medicine
IF:3.0Q1
DOI:10.3390/jcm12041279
PMID:36835813
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综述 | 本文总结了人工智能辅助的转录组技术在癌症免疫治疗中的应用和新发现 | 探讨了AI辅助转录组分析在理解肿瘤异质性、肿瘤微环境及免疫相关不良事件机制方面的新见解 | 没有提及具体的实验数据或示例支持的具体结果 | 旨在提高癌症免疫治疗的有效性和理解其机制 | 主要研究肿瘤异质性、肿瘤微环境及其对免疫治疗的影响 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 140 | 2024-08-05 |
Complex hierarchical structures in single-cell genomics data unveiled by deep hyperbolic manifold learning
2023-02, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.277068.122
PMID:36849204
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研究论文 | 本研究提出了一种基于深度学习的模型,用于在低维超曲面空间中可视化单细胞RNA-seq数据的复杂层级结构 | 创新点在于提出了scDHMap模型,它优化了用于处理稀疏单细胞计数数据的层级结构可视化 | 现有基于超曲面的方法存在基本限制,尚未针对稀疏单细胞计数数据进行优化 | 研究旨在使用低维超曲面空间可视化单细胞基因组数据中的复杂层次结构 | 研究对象为单细胞RNA-seq和单细胞ATAC-seq数据 | 计算机视觉 | NA | 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序 | 深度学习模型 | 数据计数矩阵 | 广泛的模拟和真实实验 | NA | NA | NA | NA |