单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 307 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2024-08-05 |
Bulk and single-cell characterisation of the immune heterogeneity of atherosclerosis identifies novel targets for immunotherapy
2023-02-28, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-023-01540-2
PMID:36855107
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研究论文 | 本文通过整合多样本的测序结果，探讨了动脉粥样硬化中的免疫细胞异质性 | 通过增强的单细胞测序工作流程，识别出28种不同的免疫细胞亚群，并提供了新的免疫治疗靶点 | 研究可能受限于样本数量和种类的多样性 | 研究旨在揭示动脉粥样硬化中免疫细胞的异质性 | 研究对象为参与动脉粥样硬化过程的不同亚群免疫细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 多个样本（确切样本数量未提供） |
| 122 | 2024-08-05 |
Supplementation with α-ketoglutarate improved the efficacy of anti-PD1 melanoma treatment through epigenetic modulation of PD-L1
2023-02-28, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-023-05692-5
PMID:36854755
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研究论文 | 本研究探讨了α-酮戊二酸对抗PD1黑色素瘤治疗的影响 | 研究首次阐明了α-酮戊二酸通过调节PD-L1的表观遗传机制改善抗PD1治疗效果 | 研究中涉及的样本量可能不足以全面验证结果的普遍性 | 提升抗PD1治疗黑色素瘤的疗效 | 健康对照者、抗PD1敏感的黑色素瘤小鼠和患者 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞测序 | NA | 临床数据和前临床样本 | NA |
| 123 | 2024-08-08 |
A cost-effective machine learning-based method for preeclampsia risk assessment and driver genes discovery
2023-Feb-28, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-023-00991-y
PMID:36849879
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研究论文 | 本文介绍了一种基于机器学习的计算生物学方法，用于评估子痫前期的风险并发现驱动基因 | 首次设计了一种使用单细胞转录组数据来识别病理细胞亚群并预测子痫前期风险的计算生物学方法，并开发了一个在线网络服务器以提高可访问性 | NA | 开发一种有效的机器学习方法来评估子痫前期的风险并发现相关的驱动基因 | 健康妊娠和早期发作子痫前期的单细胞转录组数据 | 机器学习 | 妊娠疾病 | 单细胞转录组测序（scRNA-seq） | 集成学习框架 | 转录组数据 | 健康妊娠38周和早期发作子痫前期28-32周的样本 |
| 124 | 2024-08-08 |
Automating iPSC generation to enable autologous photoreceptor cell replacement therapy
2023-02-28, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-03966-2
PMID:36855199
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研究论文 | 本研究描述了使用Cell X精密机器人细胞培养平台实现临床级患者特异性iPSC的并行生产 | 开发了一种机器人iPSC生成平台和标准操作程序，用于生产高质量的光感受器前体细胞，符合当前的良好制造规范 | NA | 实现自体iPSC介导的光感受器细胞替换疗法 | 患者特异性iPSC的并行生产 | 细胞生物学 | 遗传性视网膜变性 | 细胞培养平台 | NA | 细胞 | NA |
| 125 | 2024-08-05 |
A variational algorithm to detect the clonal copy number substructure of tumors from scRNA-seq data
2023-02-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-36790-9
PMID:36841879
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研究论文 | 本文报告了一种快速的变分算法SCEVAN，用于从单细胞RNA测序数据中解卷肿瘤的克隆亚结构 | SCEVAN利用多通道分割算法，假设同一拷贝数克隆的所有细胞共享相同的断点，提供了一种新的分析肿瘤的方法 | NA | 研究单细胞RNA测序技术在肿瘤微环境中的应用 | 不同肿瘤类型和技术下的106个样本及93,322个细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | 变分算法 | 细胞数据 | 106个样本，93,322个细胞 |
| 126 | 2024-08-05 |
Mapping Spatiotemporal Heterogeneity in Tumor Profiles by Integrating High-Throughput Imaging and Omics Analysis
2023-Feb-21, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.2c06659
PMID:36844580
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综述 | 本文回顾了高通量成像和组学分析在肿瘤异质性映射中的应用 | 探讨了最新的技术趋势和生物学见解，结合了分子诊断和空间转录组学的发展 | 对异质性出现原因的理解仍然不完整，限制了从治疗角度管理异质性的能力 | 研究肿瘤内部异质性的动态演变 | 聚焦于肿瘤细胞类型和基质成分的异质性 | 数字病理学 | NA | 高通量分子成像、单细胞组学、空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 127 | 2024-08-05 |
Protoplast Preparation for Algal Single-Cell Omics Sequencing
2023-Feb-20, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms11020538
PMID:36838504
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review | 本文综述了制备藻类原生质体的方法，以便于单细胞测序的应用 | 创新点在于总结了藻类细胞壁的结构及化学成分，并介绍了多种制备藻类原生质体的先进方法 | 该综述主要集中在当前已知的制备方法，没有涉及新兴或未广泛应用的技术 | 探讨单细胞测序在真核藻类研究中的应用潜力 | 关注于绿藻门的藻类细胞壁和原生质体的制备 | NA | NA | NA | NA | NA | 涉及一些常用真核藻类的特定案例 |
| 128 | 2024-08-08 |
Proteomic and single-cell landscape reveals novel pathogenic mechanisms of HBV-infected intrahepatic cholangiocarcinoma
2023-Feb-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.106003
PMID:36852159
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研究论文 | 本研究通过全外显子测序、蛋白质组分析和单细胞RNA测序，揭示了HBV感染的肝内胆管癌（ICC）的新型致病机制 | 首次揭示了HBV感染的ICC患者中细胞间连接水平下降与上皮-间质转化（EMT）程序增加的关系，以及ICAM1肿瘤相关巨噬细胞与不良预后的关联 | 样本量相对较小，可能影响结果的普遍性 | 探讨HBV感染对肝内胆管癌的致癌效应及其相关致病机制 | HBV感染的肝内胆管癌患者与非HBV感染的ICC患者 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 全外显子测序、蛋白质组分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、蛋白质数据、单细胞RNA数据 | 32名HBV感染的ICC患者和89名非HBV感染的ICC患者 |
| 129 | 2024-08-08 |
The PD-L1 Expression and Tumor-Infiltrating Immune Cells Predict an Unfavorable Prognosis in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma and Adenosquamous Carcinoma
2023-Feb-09, Journal of clinical medicine
IF:3.0Q1
DOI:10.3390/jcm12041398
PMID:36835933
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研究论文 | 研究探讨了肿瘤微环境中的PD-L1表达和肿瘤浸润免疫细胞与胰腺导管腺癌及腺鳞癌患者预后之间的关系 | 首次详细分析了PD-L1表达和肿瘤浸润免疫细胞在胰腺导管腺癌及腺鳞癌中的临床意义 | 研究样本量相对较小，可能影响结果的普遍性 | 探究肿瘤微环境中的免疫细胞组成及其对胰腺癌预后的影响 | 胰腺导管腺癌和腺鳞癌患者的肿瘤微环境及免疫细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 免疫组织化学, scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 29例腺鳞癌患者和54例胰腺导管腺癌患者 |
| 130 | 2024-08-08 |
The Role of Ferroptosis and Cuproptosis in Curcumin against Hepatocellular Carcinoma
2023-Feb-08, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules28041623
PMID:36838613
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研究论文 | 研究了姜黄素在肝细胞癌治疗中通过铁死亡和铜死亡机制的作用 | 开发了铜死亡潜力指数（CPI）并与铁死亡潜力指数（FPI）结合，用于定量分析姜黄素处理的肝细胞癌细胞 | NA | 探讨姜黄素在肝细胞癌治疗中的作用机制，特别是铁死亡和铜死亡的影响 | 姜黄素处理下的PLC、KMCH和Huh7细胞 | NA | 肝细胞癌 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA），单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 702、515和721个差异表达基因分别来自姜黄素处理的PLC、KMCH和Huh7细胞，以及16种肝细胞癌亚型的单细胞转录组数据 |
| 131 | 2024-08-05 |
Artificial Intelligence-Assisted Transcriptomic Analysis to Advance Cancer Immunotherapy
2023-Feb-06, Journal of clinical medicine
IF:3.0Q1
DOI:10.3390/jcm12041279
PMID:36835813
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综述 | 本文总结了人工智能辅助的转录组技术在癌症免疫治疗中的应用和新发现 | 探讨了AI辅助转录组分析在理解肿瘤异质性、肿瘤微环境及免疫相关不良事件机制方面的新见解 | 没有提及具体的实验数据或示例支持的具体结果 | 旨在提高癌症免疫治疗的有效性和理解其机制 | 主要研究肿瘤异质性、肿瘤微环境及其对免疫治疗的影响 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | NA | NA |
| 132 | 2024-08-05 |
Complex hierarchical structures in single-cell genomics data unveiled by deep hyperbolic manifold learning
2023-02, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.277068.122
PMID:36849204
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研究论文 | 本研究提出了一种基于深度学习的模型，用于在低维超曲面空间中可视化单细胞RNA-seq数据的复杂层级结构 | 创新点在于提出了scDHMap模型，它优化了用于处理稀疏单细胞计数数据的层级结构可视化 | 现有基于超曲面的方法存在基本限制，尚未针对稀疏单细胞计数数据进行优化 | 研究旨在使用低维超曲面空间可视化单细胞基因组数据中的复杂层次结构 | 研究对象为单细胞RNA-seq和单细胞ATAC-seq数据 | 计算机视觉 | NA | 单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序 | 深度学习模型 | 数据计数矩阵 | 广泛的模拟和真实实验 |
| 133 | 2024-08-08 |
[Preliminary Results of Single-cell Transcriptome Sequencing in Renal Arterial Lesions of Takayasu Arteritis]
2023-Feb, Zhongguo yi xue ke xue yuan xue bao. Acta Academiae Medicinae Sinicae
DOI:10.3881/j.issn.1000-503X.15006
PMID:36861160
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研究论文 | 本研究探讨了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在Takayasu动脉炎（TA）患者肾动脉病变中的初步应用 | 首次使用scRNA-seq技术探索TA患者肾动脉病变的细胞异质性，并比较了两种不同消化协议对细胞比例的影响 | 样本量较小，仅包括2名TA患者 | 探索scRNA-seq在TA患者肾动脉病变中的应用 | TA患者肾动脉病变的细胞组成 | 数字病理学 | Takayasu动脉炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 2名TA患者，共2920个细胞 |
| 134 | 2024-08-05 |
Transcriptome age of individual cell types in Caenorhabditis elegans
2023-02-28, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2216351120
PMID:36812209
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研究论文 | 本研究分析了线虫在发育过程中个体细胞类型的转录组年龄 | 首次探讨了小时glass模式与不同细胞类型转录组年龄变异的关系 | 未深入研究特定细胞在转录组年龄变化中的作用 | 研究线虫在发育不同阶段的转录组年龄 | 线虫的各种细胞类型 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | 转录组数据 | 128种神经元类型的转录组数据 |
| 135 | 2024-08-08 |
Defining and targeting tumor-associated macrophages in malignant mesothelioma
2023-02-28, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2210836120
PMID:36821580
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研究论文 | 本文研究了肿瘤相关巨噬细胞（TAM）在恶性间皮瘤中的起源和治疗靶点 | 首次鉴定了两种不同的巨噬细胞群体，并证实了通过条件性删除Dicer1基因选择性耗竭M2样TAM可以促进肿瘤排斥 | NA | 开发恶性间皮瘤的治疗靶点 | 肿瘤相关巨噬细胞（TAM）及其在恶性间皮瘤中的作用 | NA | 恶性间皮瘤 | 转录组和单细胞RNA测序分析 | NA | 转录组数据 | 小鼠腹腔和胸腔中的两种巨噬细胞群体 |
| 136 | 2024-08-08 |
Integrated multi-omics analyses and functional validation reveal TTK as a novel EMT activator for endometrial cancer
2023-02-25, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-03998-8
PMID:36829176
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研究论文 | 本研究通过综合多组学分析和功能验证，揭示了TTK作为子宫内膜癌中新的上皮-间质转化（EMT）激活因子的新角色。 | 首次全面研究了与子宫内膜癌发展相关的癌症-睾丸抗原（CTA）基因的表达和临床意义，并发现了TTK在子宫内膜癌中的新致癌功能。 | 研究主要基于TCGA和GEO数据库的数据，可能需要进一步的实验验证。 | 探讨TTK在子宫内膜癌中的临床相关性、生物学作用和分子机制。 | 子宫内膜癌样本和细胞。 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 生物信息学方法 | NA | 基因组、转录组和表观遗传数据 | 使用了来自TCGA数据库的子宫内膜癌样本和GEO数据库的单细胞数据。 |
| 137 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome profiling of the stepwise progression of head and neck cancer
2023-02-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-36691-x
PMID:36828832
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研究论文 | 该文章研究了头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）从正常组织到转移肿瘤的逐步演进过程中的肿瘤细胞异质性及其相互作用 | 通过单细胞RNA测序，提出了在白斑病变中可以识别出病理检查未检测到的原位癌细胞，并揭示了与不良预后相关的细胞类型亚群 | 在摘要中未提及任何具体的研究限制 | 阐明HNSCC进程中细胞间相互作用的病理生物学新见解 | 人头颈部鳞状细胞癌的肿瘤细胞及其微环境 | 数字病理学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA |
| 138 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing in orthopedic research
2023-Feb-24, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-023-00245-0
PMID:36828839
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研究论文 | 本文总结了单细胞RNA测序技术在骨科疾病研究中的应用，包括细胞亚群、基因及其在疾病发展中的潜在机制 | 介绍了单细胞RNA测序技术在骨科疾病研究中的新应用，提供了细胞异质性、新细胞亚型、功能性子簇、潜在分子机制、细胞命运转换和细胞间相互作用的信息 | NA | 深入阐明骨科疾病的具体机制，并提供新的治疗策略 | 骨科疾病，包括骨关节炎、腰椎间盘突出、类风湿性关节炎、骨折、肌腱损伤、脊髓损伤、异位骨化、骨肉瘤等 | 数字病理学 | 骨科疾病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因数据 | NA |
| 139 | 2024-08-08 |
Transcriptomic profiling of the developing brain revealed cell-type and brain-region specificity in a mouse model of prenatal stress
2023-Feb-24, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-023-09186-8
PMID:36829105
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研究论文 | 本研究使用RNA-seq技术探索了孕期慢性不可预测的轻度应激（CUMS）暴露后小鼠胎儿大脑基因表达的变化 | 首次提供了孕期慢性应激后整个胎儿大脑转录组改变的无偏数据源，并报告了发育中大脑在应对孕期环境压力时的细胞类型和脑区特异性的脆弱性 | NA | 探索孕期应激对小鼠胎儿大脑基因表达的影响及其细胞类型和脑区特异性 | 小鼠胎儿大脑在孕期慢性应激后的基因表达变化 | 数字病理学 | 精神障碍 | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 小鼠胎儿大脑样本 |
| 140 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomics reveals niche-specific enrichment and vulnerabilities of radial glial stem-like cells in malignant gliomas
2023-02-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-36707-6
PMID:36823172
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研究论文 | 本研究揭示了恶性胶质瘤中放射状胶质干细胞样细胞的特定栖息地富集和脆弱性。 | 通过结合短读和长读空间转录组学，首次对胶质瘤潜在的细胞状态和栖息地特征进行了空间剖析。 | 缺乏对空间组织在疾病进展中的时间动态分析。 | 研究恶性胶质瘤不同栖息地中的细胞状态和调控程序。 | 主要研究放射状胶质干细胞样细胞及其在胶质瘤栖息地的富集情况。 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 空间转录组学 | 人类神经干细胞衍生的正位胶质瘤模型 | 单细胞转录组数据 | NA |