单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 307 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2024-08-07 |
A neuroepithelial wave of BMP signalling drives anteroposterior specification of the tuberal hypothalamus
2023-02-10, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.83133
PMID:36718990
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研究论文 | 本研究结合实验和生物信息学方法，探讨了胚胎期鸡的管状下丘脑前-后方向的生成机制 | 首次揭示了神经上皮来源的BMP信号波在胚胎发育中驱动管状下丘脑前-后方向特化的过程 | NA | 阐明管状下丘脑在胚胎发育中的细胞和信号通路特化机制 | 管状下丘脑的生成过程及其调控机制 | NA | NA | scRNA-Seq | NA | 基因表达数据 | 胚胎期鸡 |
| 102 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome profiles of Drosophila fruitless-expressing neurons from both sexes
2023-02-01, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.78511
PMID:36724009
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了果蝇 fruitless基因表达神经元的转录组，揭示了性别特异性的表达模式和神经元功能差异 | 首次使用单细胞RNA测序技术对果蝇性别特异性神经元进行全面分析，揭示了性别间神经元数量和表达模式的差异 | NA | 探究果蝇性别特异性神经元的转录组特征及其在生殖行为中的作用 | 果蝇 fruitless基因表达的神经元 | 生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | UMAP | 转录组数据 | 113个神经元集群 |
| 103 | 2024-08-05 |
Unique DUOX2+ACE2+ small cholangiocytes are pathogenic targets for primary biliary cholangitis
2023-02-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-34606-w
PMID:36759512
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研究论文 | 研究表明DUOX2+ACE2+小胆管细胞是原发性胆汁性胆管炎的致病靶点 | 首次识别出DUOX2ACE2小胆管细胞在原发性胆汁性胆管炎中的重要角色 | 尚未完全明确原发性胆汁性胆管炎的病因 | 探索胆管细胞在原发性胆汁性胆管炎中的作用 | 人类和小鼠肝脏中的DUOX2ACE2小胆管细胞 | 数字病理学 | 胆汁性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、荧光激活细胞分选、免疫荧光、多重RNA原位杂交分析 | NA | RNA测序数据，蛋白质组学数据 | PBC患者与健康对照样本（具体数量未提供） |
| 104 | 2024-08-05 |
Somatosensory neurons express specific sets of lincRNAs, and lincRNA CLAP promotes itch sensation in mice
2023-02-06, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.15252/embr.202154313
PMID:36524339
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研究论文 | 这篇文章探讨了体感神经元中特定类型的长非编码RNA（lincRNAs）的分布及其在痒感中的作用 | 首次揭示了特定类型的lincRNAs在体感神经元中的丰富性及其与痒感的关系 | 对lincRNAs在其他神经元类型中的作用尚未进行探索 | 研究体感神经元中特定lincRNAs的分布及其在感觉传递中的功能 | 小鼠的体感神经元及其特定类型的lincRNAs | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和Smart-seq2全长测序 | NA | RNA数据 | 分析了位于背根神经节（DRG）的单个神经元中的200个lincRNAs |
| 105 | 2024-08-07 |
Pancreatic stellate cells exploit Wnt/β-catenin/TCF7-mediated glutamine metabolism to promote pancreatic cancer cells growth
2023-Feb-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2022.216040
PMID:36565920
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研究论文 | 研究揭示了胰腺星状细胞通过Wnt/β-catenin/TCF7介导的谷氨酰胺代谢促进胰腺癌细胞生长的机制 | 首次详细阐明了胰腺星状细胞在谷氨酰胺代谢和肿瘤-基质代谢相互作用中的具体机制 | NA | 探讨胰腺星状细胞在胰腺导管腺癌中的代谢作用及其机制 | 胰腺星状细胞和胰腺癌细胞的谷氨酰胺代谢 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及人类组织和细胞样本 |
| 106 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing to identify cellular heterogeneity and targets in cardiovascular diseases: from bench to bedside
2023-02-07, Basic research in cardiology
IF:7.5Q1
DOI:10.1007/s00395-022-00972-1
PMID:36750503
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在心血管疾病（CVDs）中的应用，探讨了其在揭示细胞异质性和疾病机制方面的作用 | scRNA-seq技术提供了前所未有的单细胞转录组分析分辨率和通量，有助于发现心血管疾病的潜在治疗靶点 | NA | 探讨scRNA-seq技术在精准医学和临床应用中的潜力 | 心血管疾病的细胞异质性和疾病机制 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 107 | 2024-08-07 |
TNF receptor-related factor 3 inactivation promotes the development of intrahepatic cholangiocarcinoma through NF-κB-inducing kinase-mediated hepatocyte transdifferentiation
2023-02-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1002/hep.32317
PMID:34995376
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研究论文 | 本研究通过体内插入突变筛选，发现TNF受体相关因子3（TRAF3）失活通过NF-κB诱导激酶（NIK）介导的肝细胞转分化促进肝内胆管癌（ICC）的发展 | 首次揭示TRAF3失活通过NIK介导的肝细胞转分化促进ICC发展的机制，并提出TRAF3-NIK轴作为潜在的治疗靶点 | NA | 识别肝内胆管癌的分子驱动因素并寻找治疗靶点 | 肝内胆管癌（ICC） | NA | 肝内胆管癌 | Sleeping Beauty转座子、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及Pten敲除和KrasG12D突变小鼠模型，以及多个人类ICC细胞系 |
| 108 | 2024-08-05 |
[Research progress of single-cell sequencing technology in liver diseases]
2023-Feb-20, Zhonghua gan zang bing za zhi = Zhonghua ganzangbing zazhi = Chinese journal of hepatology
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综述 | 本文主要回顾了单细胞测序技术在肝脏疾病中的研究进展 | 探讨了单细胞测序技术在理解肝脏疾病发病机制中的创新性应用 | 由于肝脏疾病病因复杂，治疗选择相对有限 | 深入研究肝脏疾病的发病机制 | 单细胞测序技术在肝脏疾病中的应用 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | 单细胞测序 | NA | 基因组、转录组和表观基因组数据 | NA |
| 109 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis of platelets from patients with periodontitis and diabetes
2023-Feb, Research and practice in thrombosis and haemostasis
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.rpth.2023.100099
PMID:37063767
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研究论文 | 本研究分析了牙周炎患者和同时患有牙周炎与2型糖尿病患者的血小板表达谱，以探讨牙周炎诱导的血小板转录组特征及糖尿病的修饰效应 | 本研究首次使用单细胞RNA测序技术分析了牙周炎及牙周炎合并2型糖尿病患者的血小板转录组，揭示了血小板在疾病状态下的分子变化 | 研究样本量较小，可能影响结果的普遍性 | 探讨牙周炎及牙周炎合并2型糖尿病对血小板转录组的影响 | 牙周炎患者、牙周炎合并2型糖尿病患者的血小板 | NA | 牙周炎, 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 11名健康供体，10名牙周炎患者，6名牙周炎合并2型糖尿病患者 |
| 110 | 2024-08-08 |
Immune Factors Drive Expression of SARS-CoV-2 Receptor Genes Amid Sexual Disparity
2023-02-28, Viruses
DOI:10.3390/v15030657
PMID:36992366
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研究论文 | 研究探讨了性别差异在SARS-CoV-2感染中的分子机制，并识别了与性别相关的基因特征 | 首次识别了一个6基因特征，该特征在男性和女性中表达差异显著，并显示出区分COVID-19重症监护患者与非重症患者的潜在预后价值 | 研究主要基于小鼠和人类数据集，可能需要更多跨物种验证 | 探索与性别和COVID-19发病机制相关的分子特征，以开发更有效的干预措施 | SARS-CoV-2感染中的性别差异及其分子机制 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 小鼠和人类临床数据 |
| 111 | 2024-08-05 |
Cell Type Annotation Model Selection: General-Purpose vs. Pattern-Aware Feature Gene Selection in Single-Cell RNA-Seq Data
2023-02-26, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes14030596
PMID:36980868
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研究论文 | 本文比较和评估了两种先进的监督方法在单细胞RNA测序数据中的表现 | 首次展示了XGBoost在细胞类型自动注释中的优势，提供了一种更加简单和可扩展的框架 | 缺乏足够的标注数据可能限制了监督技术的应用范围 | 探讨不同的特征选择方法对细胞类型识别的影响 | 比较XGBoost和支持向量机(SVM)在单细胞RNA-Seq数据上的表现 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | XGBoost, SVM | 数据集 | 三个标准scRNA-seq数据集 |
| 112 | 2024-08-08 |
Cellular Transcriptomics of Carboplatin Resistance in a Metastatic Canine Osteosarcoma Cell Line
2023-02-23, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes14030558
PMID:36980828
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了犬骨肉瘤细胞系对卡铂化疗耐药性的转录组变化 | 首次揭示了化疗耐药性与上皮-间质转化（EMT）样过程的关联 | NA | 旨在理解基于铂的化疗耐药性的本质 | 犬骨肉瘤细胞系 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 三个HMPOS衍生的细胞系，包括两个耐药和一个未处理的细胞系 |
| 113 | 2024-08-08 |
A comparative study of in vitro air-liquid interface culture models of the human airway epithelium evaluating cellular heterogeneity and gene expression at single cell resolution
2023-Feb-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.02.27.530299
PMID:36909601
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序、免疫组织化学和功能实验，比较了BCi-NS1.1细胞系和原代细胞衍生的HAE培养模型在细胞异质性和基因表达上的差异 | 首次全面比较了BCi-NS1.1细胞系和原代细胞衍生的HAE培养模型在基因表达和先天免疫功能上的差异 | 未观察到BCi-NS1.1 HAE培养模型与原代细胞在流感病毒感染敏感性上的显著差异 | 评估BCi-NS1.1细胞系衍生的HAE培养模型在呼吸道感染疾病研究中的应用价值 | BCi-NS1.1细胞系和原代细胞衍生的HAE培养模型 | NA | 呼吸道感染疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未具体说明样本数量 |
| 114 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis of CX3CR1 + cells reveal a pathogenic role for BIRC5 + myeloid proliferating cells driven by Staphylococcus aureus leukotoxins
2023-Feb-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.02.27.529760
PMID:36909517
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和遗传命运图谱技术，揭示了在感染过程中，由金黄色葡萄球菌白细胞毒素驱动的BIRC5阳性骨髓增殖细胞在CX3CR1阳性细胞中的致病作用。 | 本研究首次通过单细胞RNA测序和遗传命运图谱技术，揭示了BIRC5阳性骨髓增殖细胞在感染中的致病作用，并发现这些细胞的扩增与组织损伤毒素的存在有关。 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能需要进一步的人体研究来验证这些发现。 | 探讨在感染过程中，特定类型的骨髓细胞如何影响疾病进程。 | CX3CR1阳性细胞和BIRC5阳性骨髓增殖细胞。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 小鼠模型中的CX3CR1阳性细胞 |
| 115 | 2024-08-05 |
Mitochondria-Associated Endoplasmic Reticulum Membrane (MAM) Is a Promising Signature to Predict Prognosis and Therapies for Hepatocellular Carcinoma (HCC)
2023-Feb-24, Journal of clinical medicine
IF:3.0Q1
DOI:10.3390/jcm12051830
PMID:36902617
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研究论文 | 这篇文章探讨了线粒体相关内质网膜(MAM)在肝细胞癌(HCC)预后和治疗中的潜在作用 | 研究首次详细探讨了MAM在HCC中的重要性并建立了MAM评分来预测患者预后 | 研究仅使用了特定数据集作为训练集，可能限制了发现的广泛适用性 | 旨在评估MAM评分在HCC患者预后和免疫治疗反应中的价值 | 研究对象为肝细胞癌患者及其肿瘤相关细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序，基因共表达网络 | NA | 基因表达数据 | 使用了TCGA-LIHC、ICGC及多个GEO数据集进行分析 |
| 116 | 2024-08-08 |
The CXCL10/CXCR3 Pathway Contributes to the Synergy of Thermal Ablation and PD-1 Blockade Therapy against Tumors
2023-Feb-23, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers15051427
PMID:36900218
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研究论文 | 研究探讨了热消融与PD-1阻断疗法联合治疗肿瘤的协同作用及其机制 | 首次揭示了CXCL10/CXCR3轴在热消融与抗PD-1疗法联合治疗中的作用，并提出该信号通路的激活可能增强这种联合治疗的协同效应 | NA | 研究热消融与PD-1阻断疗法联合治疗肿瘤的协同作用及其机制 | 肿瘤组织中的浸润性免疫细胞及热消融治疗后的变化 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 肿瘤携带小鼠的肿瘤组织与对照肿瘤组织 |
| 117 | 2024-08-05 |
Cell-Type-Specific Gene Regulatory Networks of Pro-Inflammatory and Pro-Resolving Lipid Mediator Biosynthesis in the Immune System
2023-Feb-22, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24054342
PMID:36901771
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研究论文 | 本研究探讨了免疫系统中促炎和促解决脂质介质合成的细胞类型特异性基因调控网络 | 首次系统地绘制了与PIM和SPM合成相关的细胞类型特异性基因调控网络 | 尽管识别了基因调控网络，但具体的调控机制仍需进一步研究 | 研究脂质介质在免疫反应中的基因调控及其细胞类型特异性 | 以免疫细胞为研究对象，关注PIM和SPM的合成路径 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 机器学习方法 | 基因表达数据 | 大规模单细胞数据集 |
| 118 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Transcriptome Profiling of Liver Cells of Short-Term Alcoholic Liver Injury in Mice
2023-Feb-22, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24054344
PMID:36901774
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了小鼠短期酒精性肝损伤中肝脏细胞的转录组变化 | 首次在单细胞水平上揭示了酒精性肝损伤中不同肝脏细胞类型的分子和细胞机制 | NA | 探讨酒精性肝损伤的细胞和分子机制 | 小鼠肝脏细胞 | 数字病理学 | 酒精性肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 51,619个肝脏单细胞 |
| 119 | 2024-08-05 |
Important Cells and Factors from Tumor Microenvironment Participated in Perineural Invasion
2023-Feb-21, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers15051360
PMID:36900158
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研究论文 | 本研究总结了肿瘤微环境中参与神经侵犯的细胞和因素 | 提供了关于神经侵犯的新见解，探讨了神经与肿瘤之间的相互作用 | 没有明确提到研究的限制 | 旨在总结神经侵犯的分子介质和发病机制 | 肿瘤微环境及其中的细胞和信号分子 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 120 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA-seq analysis reveals dual sensing of HIV-1 in blood Axl+ dendritic cells
2023-Feb-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.106019
PMID:36866043
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研究论文 | 本研究揭示了HIV-1在血液Axl+树突状细胞中的双重感知机制 | 首次识别了血液AxlDC亚群的特殊能力来识别和复制HIV-1并启动不同的转录程序 | 没有明显的局限性信息 | 研究Axl+树突状细胞对HIV-1的抗病毒响应 | 主要研究人类原代血液树突状细胞的不同亚群 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 主要针对多种血液树突状细胞亚群，具体样本数量未明 |