单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 307 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2024-08-07 |
Implanted Tissue-Engineered Vascular Graft Cell Isolation with Single-Cell RNA Sequencing Analysis
2023-02, Tissue engineering. Part C, Methods
DOI:10.1089/ten.TEC.2022.0189
PMID:36719780
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研究论文 | 本文介绍了一种简单且商业可用的方法，用于从组织工程血管移植物（TEVG）中分离细胞，以便进行单细胞RNA测序（scRNA-Seq）分析，并揭示了参与TEVG早期新生组织重塑阶段的细胞亚群。 | 首次描述了植入的组织工程血管移植物在单细胞基因表达水平上的细胞组成，并展示了磁性细胞分离技术在生成高质量细胞悬液用于scRNA-Seq分析中的有效性。 | 该方法主要针对使用可生物降解合成材料作为支架成分的其他可植入材料，其广泛适用性尚需进一步验证。 | 利用单细胞RNA测序技术深入了解组织工程血管移植物的细胞组成和基因表达异质性，特别是在新生组织形成和重塑过程中的应用。 | 组织工程血管移植物（TEVG）中的细胞分离和单细胞RNA测序分析。 | 生物技术 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中明确提及 | NA | NA | NA | NA |
| 102 | 2024-08-05 |
Single-Cell Suspension Preparation from Nile Tilapia Intestine for Single-Cell Sequencing
2023-02-10, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/64688
PMID:36847395
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研究论文 | 本研究展示了一种优化的鲤鱼肠道单细胞悬浮液制备协议 | 提出并优化了针对尼罗河罗非鱼肠道的单细胞悬浮液制备方法 | 该方法主要针对特定鱼类的肠道，其他组织或鱼种可能需要进一步优化 | 开发高质量单细胞悬浮液制备方案以支持单细胞层级研究 | 尼罗河罗非鱼的肠道细胞 | 数字病理学 | NA | 胶原酶/解聚酶 | NA | 细胞悬浮液 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 103 | 2024-08-05 |
Integration of Single-Cell RNA-Seq Datasets: A Review of Computational Methods
2023-Feb-28, Molecules and cells
IF:3.7Q2
DOI:10.14348/molcells.2023.0009
PMID:36859475
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综述 | 本文总结了单细胞RNA测序数据集整合方法的概念和优缺点 | 提供了对不同整合方法的全面综述，强调了去除批次效应的方法学进展 | 未能深入探讨所有可能的整合方法和实际应用中的挑战 | 审视和总结单细胞RNA测序数据集整合的计算方法 | 针对公共库中单细胞RNA测序数据集的整合分析方法 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 104 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomics add a new dimension to our understanding of the gut
2023-02-01, American journal of physiology. Gastrointestinal and liver physiology
DOI:10.1152/ajpgi.00191.2022
PMID:36472345
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review | 这篇文章探讨了空间转录组学在肠道研究中的应用 | 文章介绍了空间转录组技术如何提供肠道细胞转录组的新视角 | 文中未提及具体的局限性 | 研究肠道转录组的空间特征 | 探讨肠道中细胞的空间分布及其转录组特征 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 105 | 2024-08-07 |
Human PD-1 agonist treatment alleviates neutrophilic asthma by reprogramming T cells
2023-02, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2022.07.022
PMID:35963455
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研究论文 | 本文研究了PD-1激动剂治疗在减轻中性粒细胞性哮喘中的作用，通过重编程T细胞来实现 | 首次探讨了PD-1激动剂在治疗中性粒细胞性哮喘中的应用，并展示了其在减轻气道高反应性和肺部炎症中的效果 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步的人体试验验证 | 探究PD-1在调节急性中性粒细胞性炎症中的作用 | 中性粒细胞性哮喘 | NA | 哮喘 | 单细胞RNA测序和流式细胞术 | NA | 细胞和分子数据 | 野生型和PD-1敲除小鼠，以及人源化PD-1小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 106 | 2024-08-07 |
Clinical Implications of a New DDX58 Pathogenic Variant That Causes Lupus Nephritis due to RIG-I Hyperactivation
2023-02-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2022040477
PMID:36261300
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研究论文 | 本文通过全外显子测序在中国LN患者中鉴定出一种新的DDX58致病变体R109C，并研究了其对I型IFN信号传导的影响及靶向治疗的有效性 | 发现了一种新的DDX58 R109C致病变体，该变体通过减少自身抑制导致RIG-I超激活，增加RIG-I K63泛素化和MAVS聚集 | NA | 鉴定狼疮性肾炎的遗传原因，以促进更个性化的治疗策略 | 中国狼疮性肾炎患者 | NA | 狼疮性肾炎 | 全外显子测序，单细胞RNA测序 | NA | 基因序列，转录组 | 五个无关家庭的狼疮性肾炎患者 | NA | NA | NA | NA |
| 107 | 2024-08-07 |
Bicuspid Aortic Valve-Associated Regulatory Regions Reveal GATA4 Regulation and Function During Human-Induced Pluripotent Stem Cell-Based Endothelial-Mesenchymal Transition-Brief Report
2023-02, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.122.318566
PMID:36519469
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简报 | 本研究通过CRISPR/Cas9编辑技术删除与二叶主动脉瓣（BAV）相关的大片段基因组，分析其在人诱导多能干细胞（hiPSC）介导的血管内皮-间充质转化（EndoMT）中的生物学效应 | 首次揭示了BAV相关远端区域在hiPSC介导的EndoMT中调控GATA4表达的作用，并发现了TWIST1作为GATA4表达的潜在调节因子 | NA | 确定大片非编码区域在hiPSC介导的EndoMT中的生物学效应 | 人诱导多能干细胞（hiPSC）及其在EndoMT过程中的基因表达调控 | NA | 心脏瓣膜病 | CRISPR/Cas9编辑技术，单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据，单细胞RNA序列数据 | 多个双等位基因克隆，BAV患者来源的hiPSCs | NA | NA | NA | NA |
| 108 | 2024-08-07 |
Gene regulatory divergence amongst echinoderms underlies appearance of pigment cells in sea urchin development
2023-02, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2022.11.008
PMID:36519720
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研究论文 | 本研究探讨了海星中色素细胞缺失的原因，通过比较海胆和海星的基因表达，揭示了色素细胞发育的基因调控差异 | 首次揭示了海星中色素细胞缺失的基因调控机制，通过比较海胆和海星的基因表达，发现海星中PmGcm在色素基因表达中的作用缺失 | 研究仅限于海胆和海星两种生物，可能无法完全代表所有棘皮动物的色素细胞发育情况 | 探究海星中色素细胞缺失的原因及其基因调控机制 | 海胆和海星的色素细胞及其相关基因表达 | NA | NA | 原位RNA杂交和比较单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及海胆和海星的多个基因和细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 109 | 2024-08-07 |
Tbx2 and Tbx3 regulate cell fate progression of the otic vesicle for inner ear development
2023-Feb, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2022.12.003
PMID:36521641
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研究论文 | 本文研究了Tbx2和Tbx3基因在耳泡细胞命运进展中的作用，通过单细胞RNA测序分析了Tbx2/3cKO胚胎与对照组之间的差异。 | 首次揭示了Tbx2和Tbx3在耳泡发育中促进多能耳前体细胞向更分化细胞类型进展的作用。 | NA | 探讨Tbx2和Tbx3基因在耳泡形态发生中的作用及其对细胞命运的影响。 | 耳泡细胞及其在Tbx2/3cKO胚胎中的变化。 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 对照组与Tbx2/3cKO胚胎的耳泡细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 110 | 2024-08-07 |
Establishment of an Inactivation Method for Ebola Virus and SARS-CoV-2 Suitable for Downstream Sequencing of Low Cell Numbers
2023-Feb-17, Pathogens (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/pathogens12020342
PMID:36839614
|
research paper | 本文介绍了一种适用于低细胞数量下游测序的埃博拉病毒和SARS-CoV-2灭活方法 | 开发了一种使用TCL缓冲液和热处理的方法，能够有效灭活埃博拉病毒和SARS-CoV-2，同时保持RNA质量和下游测序结果 | NA | 研究适用于高生物安全级别实验室的病毒灭活方法，以便进行下游测序分析 | 埃博拉病毒和SARS-CoV-2 | NA | NA | scRNA-seq | NA | RNA | 低细胞数量 | NA | NA | NA | NA |
| 111 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome profiles of Drosophila fruitless-expressing neurons from both sexes
2023-02-01, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.78511
PMID:36724009
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了果蝇 fruitless基因表达神经元的转录组，揭示了性别特异性的表达模式和神经元功能差异 | 首次使用单细胞RNA测序技术对果蝇性别特异性神经元进行全面分析，揭示了性别间神经元数量和表达模式的差异 | NA | 探究果蝇性别特异性神经元的转录组特征及其在生殖行为中的作用 | 果蝇 fruitless基因表达的神经元 | 生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | UMAP | 转录组数据 | 113个神经元集群 | NA | NA | NA | NA |
| 112 | 2024-08-05 |
Unique DUOX2+ACE2+ small cholangiocytes are pathogenic targets for primary biliary cholangitis
2023-02-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-34606-w
PMID:36759512
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研究论文 | 研究表明DUOX2+ACE2+小胆管细胞是原发性胆汁性胆管炎的致病靶点 | 首次识别出DUOX2ACE2小胆管细胞在原发性胆汁性胆管炎中的重要角色 | 尚未完全明确原发性胆汁性胆管炎的病因 | 探索胆管细胞在原发性胆汁性胆管炎中的作用 | 人类和小鼠肝脏中的DUOX2ACE2小胆管细胞 | 数字病理学 | 胆汁性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、荧光激活细胞分选、免疫荧光、多重RNA原位杂交分析 | NA | RNA测序数据，蛋白质组学数据 | PBC患者与健康对照样本（具体数量未提供） | NA | NA | NA | NA |
| 113 | 2024-08-05 |
Somatosensory neurons express specific sets of lincRNAs, and lincRNA CLAP promotes itch sensation in mice
2023-02-06, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.15252/embr.202154313
PMID:36524339
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研究论文 | 这篇文章探讨了体感神经元中特定类型的长非编码RNA（lincRNAs）的分布及其在痒感中的作用 | 首次揭示了特定类型的lincRNAs在体感神经元中的丰富性及其与痒感的关系 | 对lincRNAs在其他神经元类型中的作用尚未进行探索 | 研究体感神经元中特定lincRNAs的分布及其在感觉传递中的功能 | 小鼠的体感神经元及其特定类型的lincRNAs | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和Smart-seq2全长测序 | NA | RNA数据 | 分析了位于背根神经节（DRG）的单个神经元中的200个lincRNAs | NA | NA | NA | NA |
| 114 | 2024-08-07 |
Pancreatic stellate cells exploit Wnt/β-catenin/TCF7-mediated glutamine metabolism to promote pancreatic cancer cells growth
2023-Feb-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2022.216040
PMID:36565920
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研究论文 | 研究揭示了胰腺星状细胞通过Wnt/β-catenin/TCF7介导的谷氨酰胺代谢促进胰腺癌细胞生长的机制 | 首次详细阐明了胰腺星状细胞在谷氨酰胺代谢和肿瘤-基质代谢相互作用中的具体机制 | NA | 探讨胰腺星状细胞在胰腺导管腺癌中的代谢作用及其机制 | 胰腺星状细胞和胰腺癌细胞的谷氨酰胺代谢 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及人类组织和细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 115 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing to identify cellular heterogeneity and targets in cardiovascular diseases: from bench to bedside
2023-02-07, Basic research in cardiology
IF:7.5Q1
DOI:10.1007/s00395-022-00972-1
PMID:36750503
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在心血管疾病（CVDs）中的应用，探讨了其在揭示细胞异质性和疾病机制方面的作用 | scRNA-seq技术提供了前所未有的单细胞转录组分析分辨率和通量，有助于发现心血管疾病的潜在治疗靶点 | NA | 探讨scRNA-seq技术在精准医学和临床应用中的潜力 | 心血管疾病的细胞异质性和疾病机制 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 116 | 2024-08-07 |
TNF receptor-related factor 3 inactivation promotes the development of intrahepatic cholangiocarcinoma through NF-κB-inducing kinase-mediated hepatocyte transdifferentiation
2023-02-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1002/hep.32317
PMID:34995376
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研究论文 | 本研究通过体内插入突变筛选，发现TNF受体相关因子3（TRAF3）失活通过NF-κB诱导激酶（NIK）介导的肝细胞转分化促进肝内胆管癌（ICC）的发展 | 首次揭示TRAF3失活通过NIK介导的肝细胞转分化促进ICC发展的机制，并提出TRAF3-NIK轴作为潜在的治疗靶点 | NA | 识别肝内胆管癌的分子驱动因素并寻找治疗靶点 | 肝内胆管癌（ICC） | NA | 肝内胆管癌 | Sleeping Beauty转座子、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及Pten敲除和KrasG12D突变小鼠模型，以及多个人类ICC细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 117 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis of platelets from patients with periodontitis and diabetes
2023-Feb, Research and practice in thrombosis and haemostasis
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.rpth.2023.100099
PMID:37063767
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研究论文 | 本研究分析了牙周炎患者和同时患有牙周炎与2型糖尿病患者的血小板表达谱，以探讨牙周炎诱导的血小板转录组特征及糖尿病的修饰效应 | 本研究首次使用单细胞RNA测序技术分析了牙周炎及牙周炎合并2型糖尿病患者的血小板转录组，揭示了血小板在疾病状态下的分子变化 | 研究样本量较小，可能影响结果的普遍性 | 探讨牙周炎及牙周炎合并2型糖尿病对血小板转录组的影响 | 牙周炎患者、牙周炎合并2型糖尿病患者的血小板 | NA | 牙周炎, 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 11名健康供体，10名牙周炎患者，6名牙周炎合并2型糖尿病患者 | NA | NA | NA | NA |
| 118 | 2024-08-08 |
Immune Factors Drive Expression of SARS-CoV-2 Receptor Genes Amid Sexual Disparity
2023-02-28, Viruses
DOI:10.3390/v15030657
PMID:36992366
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研究论文 | 研究探讨了性别差异在SARS-CoV-2感染中的分子机制，并识别了与性别相关的基因特征 | 首次识别了一个6基因特征，该特征在男性和女性中表达差异显著，并显示出区分COVID-19重症监护患者与非重症患者的潜在预后价值 | 研究主要基于小鼠和人类数据集，可能需要更多跨物种验证 | 探索与性别和COVID-19发病机制相关的分子特征，以开发更有效的干预措施 | SARS-CoV-2感染中的性别差异及其分子机制 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 小鼠和人类临床数据 | NA | NA | NA | NA |
| 119 | 2024-08-05 |
Cell Type Annotation Model Selection: General-Purpose vs. Pattern-Aware Feature Gene Selection in Single-Cell RNA-Seq Data
2023-02-26, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes14030596
PMID:36980868
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研究论文 | 本文比较和评估了两种先进的监督方法在单细胞RNA测序数据中的表现 | 首次展示了XGBoost在细胞类型自动注释中的优势，提供了一种更加简单和可扩展的框架 | 缺乏足够的标注数据可能限制了监督技术的应用范围 | 探讨不同的特征选择方法对细胞类型识别的影响 | 比较XGBoost和支持向量机(SVM)在单细胞RNA-Seq数据上的表现 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | XGBoost, SVM | 数据集 | 三个标准scRNA-seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 120 | 2024-08-08 |
Cellular Transcriptomics of Carboplatin Resistance in a Metastatic Canine Osteosarcoma Cell Line
2023-02-23, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes14030558
PMID:36980828
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了犬骨肉瘤细胞系对卡铂化疗耐药性的转录组变化 | 首次揭示了化疗耐药性与上皮-间质转化（EMT）样过程的关联 | NA | 旨在理解基于铂的化疗耐药性的本质 | 犬骨肉瘤细胞系 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 三个HMPOS衍生的细胞系，包括两个耐药和一个未处理的细胞系 | NA | NA | NA | NA |