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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
81 2024-08-07
ONECUT2 regulates RANKL-dependent enterocyte and microfold cell differentiation in the small intestine; a multi-omics study
2023-02-22, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 本研究采用多组学方法探讨了小肠类器官中M细胞分化的分子机制 揭示了ONECUT2通过RANK/RANKL信号轴调控小肠中肠上皮细胞和M细胞分化的机制 NA 探究小肠中M细胞分化的分子机制及其调控因素 小肠类器官中的M细胞分化 分子生物学 NA 多组学分析, 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据, 染色质可及性数据 小鼠小肠类器官 NA NA NA NA
82 2024-08-04
Integrative single-cell characterization of frugivory adaptations in the bat kidney and pancreas
2023-Feb-13, bioRxiv : the preprint server for biology
research paper 本文使用综合单细胞测序研究了蝙蝠肾脏和胰腺中的果食适应性 研究揭示了与果食适应性相关的关键细胞群体、基因表达和调控元件差异 研究可能只针对特定的蝙蝠种类,结果的普遍性尚待验证 研究果食适应性的细胞和分子机制 研究对象为昆虫食性和果食性蝙蝠的肾脏和胰腺 NA 糖尿病 单细胞测序 NA 基因表达数据 NA NA NA NA NA
83 2024-08-07
CXCR4 expression is associated with proneural-to-mesenchymal transition in glioblastoma
2023-02-15, International journal of cancer IF:5.7Q1
研究论文 研究探讨了CXCR4表达与胶质母细胞瘤中从proneural型向mesenchymal型转变的关系 首次揭示了CXCR4信号在胶质母细胞瘤中促进proneural型向mesenchymal型转变的作用,并提出了抑制CXCR4作为潜在治疗策略 研究主要基于RNA测序数据和遗传小鼠模型,需要进一步的临床试验验证 探究CXCR4表达与胶质母细胞瘤分子亚型转变及患者生存期的关系 胶质母细胞瘤的分子亚型转变及CXCR4表达的影响 数字病理学 脑肿瘤 RNA测序 NA RNA 包括TCGA数据库中的proneural型胶质母细胞瘤样本和内部高级别胶质瘤样本,以及单细胞RNA测序数据和小鼠模型 NA NA NA NA
84 2024-08-04
Global chromatin landscapes identify candidate noncoding modifiers of cardiac rhythm
2023-02-01, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 这篇文章建立了一个全球心脏传导系统的cis调控数据库,以研究心脏节律的非编码调节因子 首次建立了CCS-ATAC数据库,并识别了新型心脏增强子元素 未提及特定细胞类型的功能重要性和潜在影响 研究心脏传导系统的cis调控景观及其与心脏节律相关的人类基因组变异的关系 大鼠心脏传导系统的cis调控元件 数字病理学 心脏病 ATAC-Seq NA 基因组数据,单细胞RNA-Seq数据 大鼠心脏传导系统相关细胞 NA NA NA NA
85 2024-08-07
Dynamic states of cervical epithelia during pregnancy and epithelial barrier disruption
2023-Feb-17, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组和空间分析,识别了非孕期、孕期和分娩期小鼠宫颈上皮的亚型 发现了孕期中两种杯状细胞亚型在宫颈上皮最表层的分布,并揭示了它们表达的新保护因子和独特的黏膜网络 NA 探究宫颈上皮在孕期和分娩期间的动态变化及其对维持妊娠的重要性 宫颈上皮在不同妊娠阶段的亚型及其功能变化 NA NA 单细胞转录组分析 NA 转录组数据 涉及非孕期、孕期和分娩期的小鼠宫颈上皮样本 NA NA NA NA
86 2024-08-07
Combined PD-1, BRAF and MEK inhibition in BRAFV600E colorectal cancer: a phase 2 trial
2023-02, Nature medicine IF:58.7Q1
研究论文 本研究进行了一项单臂2期临床试验,评估联合使用PD-1、BRAF和MEK抑制剂在BRAFV600E结直肠癌患者中的效果 研究揭示了MAPK抑制与免疫反应之间潜在的协同作用机制,为优化结直肠癌的靶向和免疫联合治疗提供了新的临床评估方向 尽管研究达到了主要终点,但总体反应率仍然较低,且缺乏持久性 探索联合使用PD-1、BRAF和MEK抑制剂在BRAFV600E结直肠癌中的临床疗效 37名BRAFV600E结直肠癌患者 NA 结直肠癌 单细胞RNA测序 NA 生物样本 23对治疗前和治疗第15天的肿瘤活检样本 NA NA NA NA
87 2024-08-07
Alcohol reverses the effects of KCNJ6 (GIRK2) noncoding variants on excitability of human glutamatergic neurons
2023-02, Molecular psychiatry IF:9.6Q1
研究论文 研究探讨了KCNJ6基因非编码变异对人类谷氨酸能神经元兴奋性的影响及其与酒精使用障碍的关系,并通过iPSC来源的神经元模型进行了验证 首次揭示了酒精能够逆转KCNJ6非编码变异对神经元兴奋性的影响,并可通过过表达GIRK2模拟酒精的效果 研究样本量较小,仅包括四名受影响和四名未受影响的个体 探究KCNJ6基因非编码变异对神经元兴奋性的影响及其与酒精使用障碍的关联 KCNJ6基因非编码变异对人类谷氨酸能神经元的影响 神经科学 酒精使用障碍 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 四名酒精使用障碍诊断的受影响个体和四名未受影响的控制个体 NA NA NA NA
88 2024-08-07
Smoking induces shifts in cellular composition and transcriptome within the bronchial mucus barrier
2023-02, Respirology (Carlton, Vic.)
研究论文 本研究评估了吸烟对支气管黏液屏障细胞组成和基因表达的影响,并探讨了基于单细胞RNA测序的细胞解卷积方法在预测RNA测序数据中细胞类型组成的能力 研究首次使用细胞解卷积方法预测RNA测序数据中的细胞类型组成,并验证了该方法的有效性 研究样本量相对较小,且仅限于特定的疾病和吸烟状态群体 理解吸烟暴露对支气管黏液屏障黏膜损伤的机制 支气管黏液屏障的细胞组成和基因表达 数字病理学 慢性阻塞性肺疾病 RNA测序, 单细胞RNA测序 细胞解卷积 RNA测序数据 共149名参与者,包括56名慢性阻塞性肺疾病患者,77名无慢性阻塞性肺疾病参与者,以及16名停止吸烟一年的参与者 NA NA NA NA
89 2024-08-04
IL-21R signal reprogramming cooperates with CD40 and BCR signals to select and differentiate germinal center B cells
2023-02-24, Science immunology IF:17.6Q1
研究论文 本文研究了IL-21R信号如何与CD40和BCR信号共同作用,选择并分化生发中心B细胞 发现IL-21R与CD40信号的协同作用引导生发中心B细胞(GCBCs)走向特定命运,揭示了第二条正选择通路 研究主要基于体外和体内的细胞分选和转录组测序,可能未能完全模拟体内复杂的微环境 阐明IL-21R信号在生发中心B细胞命运决定中的作用 生发中心B细胞,特别是受IL-21R和CD40共同信号影响的细胞 免疫学 NA RNA测序,单细胞RNA测序,流式细胞术 NA 细胞,转录组数据 具体细胞数量未在摘要中提供 NA NA NA NA
90 2024-08-04
Characterization of the Doublesex/MAB-3 transcription factor DMD-9 in Caenorhabditis elegans
2023-02-09, G3 (Bethesda, Md.)
研究论文 本文对秀丽隐杆线虫中的DMD-9转录因子的表达模式和功能进行了表征 识别了DMD-9在神经元中的细胞特异性调控及其可能的性别二态性角色 在dmd-9突变体中未能观察到DMD-9表达神经元介导的行为缺陷 研究DMD-9在秀丽隐杆线虫中的表达模式及其作用 主要研究对象为秀丽隐杆线虫的DMD-9转录因子和相关神经元 NA NA 单细胞转录组学 NA RNA表达数据 22种神经细胞命运报告基因 NA NA NA NA
91 2024-08-04
Single-Cell Transcriptomics To Define Plasmodium falciparum Stage Transition in the Mosquito Midgut
2023-Feb-27, Microbiology spectrum IF:3.7Q2
研究论文 本研究利用单细胞转录组学分析了疟原虫在蚊子肠道中的发育过程 揭示了疟原虫在蚊子肠道中早期到晚期发展的转录组特征,并发现了一些新的生物标志物 对其他发育阶段或其他蚊子种类的适用性未进行探索 深入理解疟原虫在蚊子体内发育期间的生物学特性 疟原虫Plasmodium falciparum在蚊子肠道的发育过程 数字病理学 疟疾 单细胞转录组学 NA 转录组数据 覆盖疟原虫从配子到ookinete的多个阶段 NA NA NA NA
92 2024-08-07
Exploring the potential mechanisms of impairment on genitourinary system associated with coronavirus disease 2019 infection: Bioinformatics and molecular simulation analyses
2023-Feb-07, Asian journal of urology IF:2.4Q2
研究论文 本研究通过生物信息学和分子模拟分析,探讨了新冠病毒感染对泌尿生殖系统损害的潜在机制 本研究揭示了ACE2、TMPRSS2和CD147在正常泌尿生殖器官中的高表达,并分析了这些蛋白在多种肿瘤和慢性肾脏疾病中的表达情况,以及它们在泌尿生殖器官中的细胞特异性表达模式 NA 探索新冠病毒感染对泌尿生殖系统损害的潜在机制 ACE2、TMPRSS2、CD147等蛋白在泌尿生殖器官中的表达模式及其与新冠病毒感染的关系 生物信息学 泌尿生殖系统疾病 单细胞RNA测序、基因集富集分析 NA 基因表达数据 涉及膀胱、肾脏、前列腺和睾丸等多种泌尿生殖器官的细胞 NA NA NA NA
93 2024-08-04
Neural connectivity molecules best identify the heterogeneous clock and dopaminergic cell types in the Drosophila adult brain
2023-02-22, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 这篇文章研究了果蝇成年脑中时钟和多巴胺细胞类型的异质性 首次揭示了成体脑中多巴胺神经元与时钟神经元在基因表达上的相似异质性,并强调了神经连接分子在识别细胞类型中的重要性 研究主要集中于果蝇成年大脑的特定神经元类型,结果可能不适用于其他物种或更广泛的神经元类型 确定果蝇成体大脑中多巴胺神经元和时钟神经元的异质性及其基因表达特点 成年果蝇的大脑多巴胺神经元和时钟神经元 数字病理学 NA 单细胞测序 NA 基因表达数据 成年果蝇的大脑多个神经元群体 NA NA NA NA
94 2024-08-07
Assessing the effects of aging on the liver endothelial cell landscape using single-cell RNA sequencing
2023-02-01, Hepatology communications IF:5.6Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了肝脏内皮细胞在老化过程中的转录组变化 首次详细描述了老化对肝脏内皮细胞分子调控机制的影响,并发现了两种特异性表达于老年小鼠内皮细胞的亚型 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证这些发现 探究老化对肝脏内皮细胞分子机制的影响 肝脏内皮细胞及其在老化过程中的变化 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 年轻和老年小鼠的肝脏内皮细胞 NA NA NA NA
95 2024-08-07
Implanted Tissue-Engineered Vascular Graft Cell Isolation with Single-Cell RNA Sequencing Analysis
2023-02, Tissue engineering. Part C, Methods
研究论文 本文介绍了一种简单且商业可用的方法,用于从组织工程血管移植物(TEVG)中分离细胞,以便进行单细胞RNA测序(scRNA-Seq)分析,并揭示了参与TEVG早期新生组织重塑阶段的细胞亚群。 首次描述了植入的组织工程血管移植物在单细胞基因表达水平上的细胞组成,并展示了磁性细胞分离技术在生成高质量细胞悬液用于scRNA-Seq分析中的有效性。 该方法主要针对使用可生物降解合成材料作为支架成分的其他可植入材料,其广泛适用性尚需进一步验证。 利用单细胞RNA测序技术深入了解组织工程血管移植物的细胞组成和基因表达异质性,特别是在新生组织形成和重塑过程中的应用。 组织工程血管移植物(TEVG)中的细胞分离和单细胞RNA测序分析。 生物技术 NA 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) NA 基因表达数据 具体样本数量未在摘要中明确提及 NA NA NA NA
96 2024-08-05
Single-Cell Suspension Preparation from Nile Tilapia Intestine for Single-Cell Sequencing
2023-02-10, Journal of visualized experiments : JoVE
研究论文 本研究展示了一种优化的鲤鱼肠道单细胞悬浮液制备协议 提出并优化了针对尼罗河罗非鱼肠道的单细胞悬浮液制备方法 该方法主要针对特定鱼类的肠道,其他组织或鱼种可能需要进一步优化 开发高质量单细胞悬浮液制备方案以支持单细胞层级研究 尼罗河罗非鱼的肠道细胞 数字病理学 NA 胶原酶/解聚酶 NA 细胞悬浮液 NA NA NA NA NA
97 2024-08-05
Integration of Single-Cell RNA-Seq Datasets: A Review of Computational Methods
2023-Feb-28, Molecules and cells IF:3.7Q2
综述 本文总结了单细胞RNA测序数据集整合方法的概念和优缺点 提供了对不同整合方法的全面综述,强调了去除批次效应的方法学进展 未能深入探讨所有可能的整合方法和实际应用中的挑战 审视和总结单细胞RNA测序数据集整合的计算方法 针对公共库中单细胞RNA测序数据集的整合分析方法 数字病理 NA 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) NA NA NA NA NA NA NA
98 2024-08-05
Spatial transcriptomics add a new dimension to our understanding of the gut
2023-02-01, American journal of physiology. Gastrointestinal and liver physiology
review 这篇文章探讨了空间转录组学在肠道研究中的应用 文章介绍了空间转录组技术如何提供肠道细胞转录组的新视角 文中未提及具体的局限性 研究肠道转录组的空间特征 探讨肠道中细胞的空间分布及其转录组特征 数字病理学 NA 空间转录组学 NA 转录组数据 NA NA NA NA NA
99 2024-08-07
Human PD-1 agonist treatment alleviates neutrophilic asthma by reprogramming T cells
2023-02, The Journal of allergy and clinical immunology IF:11.4Q1
研究论文 本文研究了PD-1激动剂治疗在减轻中性粒细胞性哮喘中的作用,通过重编程T细胞来实现 首次探讨了PD-1激动剂在治疗中性粒细胞性哮喘中的应用,并展示了其在减轻气道高反应性和肺部炎症中的效果 研究主要基于小鼠模型,需要进一步的人体试验验证 探究PD-1在调节急性中性粒细胞性炎症中的作用 中性粒细胞性哮喘 NA 哮喘 单细胞RNA测序和流式细胞术 NA 细胞和分子数据 野生型和PD-1敲除小鼠,以及人源化PD-1小鼠模型 NA NA NA NA
100 2024-08-07
Clinical Implications of a New DDX58 Pathogenic Variant That Causes Lupus Nephritis due to RIG-I Hyperactivation
2023-02-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN IF:10.3Q1
研究论文 本文通过全外显子测序在中国LN患者中鉴定出一种新的DDX58致病变体R109C,并研究了其对I型IFN信号传导的影响及靶向治疗的有效性 发现了一种新的DDX58 R109C致病变体,该变体通过减少自身抑制导致RIG-I超激活,增加RIG-I K63泛素化和MAVS聚集 NA 鉴定狼疮性肾炎的遗传原因,以促进更个性化的治疗策略 中国狼疮性肾炎患者 NA 狼疮性肾炎 全外显子测序,单细胞RNA测序 NA 基因序列,转录组 五个无关家庭的狼疮性肾炎患者 NA NA NA NA
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