单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 307 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2024-08-05 |
BOMA, a machine-learning framework for comparative gene expression analysis across brains and organoids
2023-02-27, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2023.100409
PMID:36936070
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研究论文 | 本研究提出了一种机器学习框架BOMA，用于比较大脑和类器官之间的基因表达分析 | 开发了一种全球对齐和局部细化的机器学习框架，能够揭示大脑和类器官间保护的和特定的发育轨迹 | 没有提到具体的局限性 | 旨在比较和分析大脑与类器官之间的基因表达差异 | 研究对象为人类大脑和人类类器官，以及非人灵长类动物的大脑 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 使用多个人类大脑和类器官的样本，具体数量未说明 |
| 62 | 2024-08-05 |
The pluripotency factor Tex10 finetunes Wnt signaling for PGC and male germline development
2023-Feb-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.02.23.529824
PMID:36865339
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研究论文 | 本文探讨了转录因子Tex10在原始生殖细胞（PGC）特化和雄性生殖发育中的作用 | 本文首次揭示了Tex10通过调节Wnt信号通路在PGC特化和雄性生殖发育中的关键角色 | 研究局限于使用小鼠模型，可能无法完全代表其他物种的生殖发育机制 | 本研究旨在探讨Tex10在原始生殖细胞特化和精子发生中的功能 | 研究对象为小鼠模型中的Tex10转录因子及其在生殖系统的发展角色 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞和动物模型的数据 | 多个Tex10条件性敲除小鼠模型的样本 |
| 63 | 2024-08-05 |
Cholesterol homeostasis regulated by ABCA1 is critical for retinal ganglion cell survival
2023-02, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-021-2126-2
PMID:35829808
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研究论文 | 本文探讨了ABCA1在视网膜神经节细胞存活中的重要性以及其与原发性开角型青光眼的关联 | 研究表明ABCA1表达降低和HDL水平下降是POAG的风险因素，并提出使用他汀类药物作为预防治疗 | 研究主要集中在小鼠模型，临床转化需要进一步验证 | 探明ABCA1与视网膜神经节细胞存活之间的关系及其在原发性开角型青光眼中的作用 | 主要研究对象为小鼠模型以及POAG患者的白细胞样本 | 数字病理 | 原发性开角型青光眼 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞样本和基因表达数据 | 小鼠模型和POAG患者的血液样本 |
| 64 | 2024-08-04 |
Insulin-like growth factor 1 reduces coronary atherosclerosis in pigs with familial hypercholesterolemia
2023-02-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.165713
PMID:36602878
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研究论文 | 这项研究探讨了类胰岛素生长因子1在家族性高胆固醇血症猪中的动脉粥样硬化作用 | 首次在家族性高胆固醇血症猪模型中证实IGF-1能减少冠状动脉粥样硬化并促进稳定斑块特征 | 本研究的结果可能仅限于猪模型，需在临床试验中进一步验证 | 研究IGF-1对冠状动脉粥样硬化的影响及其机制 | 家族性高胆固醇血症（FH）猪 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 空间转录组学 | NA | 组织样本 | 使用家族性高胆固醇血症猪进行6个月的实验 |
| 65 | 2024-08-04 |
Hypercapnia alters stroma-derived Wnt production to limit β-catenin signaling and proliferation in AT2 cells
2023-02-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.159331
PMID:36626234
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研究论文 | 这篇文章探讨了高二氧化碳血症如何通过限制β-连环蛋白信号传导和增殖能力，影响肺泡Ⅱ型细胞的功能 | 研究揭示了高二氧化碳血症对肺泡Ⅱ型细胞增殖能力的抑制及其机制，尤其是Wnt信号通路的改变 | 该研究主要基于小鼠模型，可能在人类中的适用性有限 | 了解高二氧化碳血症对肺损伤后肺修复过程的影响 | 小鼠模型中的肺泡Ⅱ型细胞及其周围的基质细胞 | 数字病理学 | 肺病 | 空间转录组学、细胞谱系追踪、3D培养 | NA | NA | 小鼠模型，样本数量未明确描述 |
| 66 | 2024-08-07 |
ONECUT2 regulates RANKL-dependent enterocyte and microfold cell differentiation in the small intestine; a multi-omics study
2023-02-22, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac1236
PMID:36625255
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研究论文 | 本研究采用多组学方法探讨了小肠类器官中M细胞分化的分子机制 | 揭示了ONECUT2通过RANK/RANKL信号轴调控小肠中肠上皮细胞和M细胞分化的机制 | NA | 探究小肠中M细胞分化的分子机制及其调控因素 | 小肠类器官中的M细胞分化 | 分子生物学 | NA | 多组学分析, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 小鼠小肠类器官 |
| 67 | 2024-08-04 |
Integrative single-cell characterization of frugivory adaptations in the bat kidney and pancreas
2023-Feb-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.02.12.528204
PMID:36824791
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research paper | 本文使用综合单细胞测序研究了蝙蝠肾脏和胰腺中的果食适应性 | 研究揭示了与果食适应性相关的关键细胞群体、基因表达和调控元件差异 | 研究可能只针对特定的蝙蝠种类，结果的普遍性尚待验证 | 研究果食适应性的细胞和分子机制 | 研究对象为昆虫食性和果食性蝙蝠的肾脏和胰腺 | NA | 糖尿病 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 68 | 2024-08-07 |
Network analysis of large-scale ImmGen and Tabula Muris datasets highlights metabolic diversity of tissue mononuclear phagocytes
2023-02-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112046
PMID:36708514
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研究论文 | 本文通过代谢网络分析，研究了组织单核吞噬细胞（MNP）的代谢多样性，基于三个大规模转录组数据集进行了分析。 | 开发了一种基于网络的计算方法——基因和代谢物（GAM）聚类，用于无偏倚地识别基于转录组数据的关键代谢子网络。 | NA | 理解单核吞噬细胞（MNP）在不同组织中的代谢变异性。 | 单核吞噬细胞（MNP）在不同组织中的代谢多样性。 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 网络分析模型 | 转录组数据 | 337个样本（ImmGen MNP数据集），202个MNP样本（ImmGen Phase I数据集），51,364个细胞（Tabula Muris Senis数据集） |
| 69 | 2024-08-07 |
CXCR4 expression is associated with proneural-to-mesenchymal transition in glioblastoma
2023-02-15, International journal of cancer
IF:5.7Q1
DOI:10.1002/ijc.34329
PMID:36250346
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研究论文 | 研究探讨了CXCR4表达与胶质母细胞瘤中从proneural型向mesenchymal型转变的关系 | 首次揭示了CXCR4信号在胶质母细胞瘤中促进proneural型向mesenchymal型转变的作用，并提出了抑制CXCR4作为潜在治疗策略 | 研究主要基于RNA测序数据和遗传小鼠模型，需要进一步的临床试验验证 | 探究CXCR4表达与胶质母细胞瘤分子亚型转变及患者生存期的关系 | 胶质母细胞瘤的分子亚型转变及CXCR4表达的影响 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | RNA测序 | NA | RNA | 包括TCGA数据库中的proneural型胶质母细胞瘤样本和内部高级别胶质瘤样本，以及单细胞RNA测序数据和小鼠模型 |
| 70 | 2024-08-04 |
Global chromatin landscapes identify candidate noncoding modifiers of cardiac rhythm
2023-02-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI153635
PMID:36454649
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研究论文 | 这篇文章建立了一个全球心脏传导系统的cis调控数据库，以研究心脏节律的非编码调节因子 | 首次建立了CCS-ATAC数据库，并识别了新型心脏增强子元素 | 未提及特定细胞类型的功能重要性和潜在影响 | 研究心脏传导系统的cis调控景观及其与心脏节律相关的人类基因组变异的关系 | 大鼠心脏传导系统的cis调控元件 | 数字病理学 | 心脏病 | ATAC-Seq | NA | 基因组数据，单细胞RNA-Seq数据 | 大鼠心脏传导系统相关细胞 |
| 71 | 2024-08-07 |
Dynamic states of cervical epithelia during pregnancy and epithelial barrier disruption
2023-Feb-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.105953
PMID:36718364
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组和空间分析，识别了非孕期、孕期和分娩期小鼠宫颈上皮的亚型 | 发现了孕期中两种杯状细胞亚型在宫颈上皮最表层的分布，并揭示了它们表达的新保护因子和独特的黏膜网络 | NA | 探究宫颈上皮在孕期和分娩期间的动态变化及其对维持妊娠的重要性 | 宫颈上皮在不同妊娠阶段的亚型及其功能变化 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 涉及非孕期、孕期和分娩期的小鼠宫颈上皮样本 |
| 72 | 2024-08-07 |
Combined PD-1, BRAF and MEK inhibition in BRAFV600E colorectal cancer: a phase 2 trial
2023-02, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-022-02181-8
PMID:36702949
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研究论文 | 本研究进行了一项单臂2期临床试验，评估联合使用PD-1、BRAF和MEK抑制剂在BRAFV600E结直肠癌患者中的效果 | 研究揭示了MAPK抑制与免疫反应之间潜在的协同作用机制，为优化结直肠癌的靶向和免疫联合治疗提供了新的临床评估方向 | 尽管研究达到了主要终点，但总体反应率仍然较低，且缺乏持久性 | 探索联合使用PD-1、BRAF和MEK抑制剂在BRAFV600E结直肠癌中的临床疗效 | 37名BRAFV600E结直肠癌患者 | NA | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 生物样本 | 23对治疗前和治疗第15天的肿瘤活检样本 |
| 73 | 2024-08-07 |
Alcohol reverses the effects of KCNJ6 (GIRK2) noncoding variants on excitability of human glutamatergic neurons
2023-02, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-022-01818-x
PMID:36207584
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研究论文 | 研究探讨了KCNJ6基因非编码变异对人类谷氨酸能神经元兴奋性的影响及其与酒精使用障碍的关系，并通过iPSC来源的神经元模型进行了验证 | 首次揭示了酒精能够逆转KCNJ6非编码变异对神经元兴奋性的影响，并可通过过表达GIRK2模拟酒精的效果 | 研究样本量较小，仅包括四名受影响和四名未受影响的个体 | 探究KCNJ6基因非编码变异对神经元兴奋性的影响及其与酒精使用障碍的关联 | KCNJ6基因非编码变异对人类谷氨酸能神经元的影响 | 神经科学 | 酒精使用障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 四名酒精使用障碍诊断的受影响个体和四名未受影响的控制个体 |
| 74 | 2024-08-07 |
Zinc Supplementation Induced Transcriptional Changes in Primary Human Retinal Pigment Epithelium: A Single-Cell RNA Sequencing Study to Understand Age-Related Macular Degeneration
2023-02-28, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12050773
PMID:36899910
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了锌补充剂对人类视网膜色素上皮细胞转录组变化的影响，以理解年龄相关性黄斑变性的分子机制 | 首次使用单细胞RNA测序技术研究锌补充剂对视网膜色素上皮细胞转录组的影响，并揭示了锌处理后与年龄相关性黄斑变性相关的多个生物途径的基因表达变化 | 研究仅限于体外细胞培养，未涉及临床试验，且锌补充剂对视网膜色素上皮细胞的长期影响仍需进一步研究 | 探讨锌补充剂对年龄相关性黄斑变性进展的分子机制 | 人类视网膜色素上皮细胞 | 数字病理学 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及2周、9周和19周的细胞培养样本，以及1周和18周的锌补充处理样本 |
| 75 | 2024-08-07 |
PD-1 and TIM-3 differentially regulate subsets of mouse IL-17A-producing γδ T cells
2023-02-06, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20211431
PMID:36480166
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研究论文 | 研究探讨了在小鼠中，PD-1和TIM-3如何不同地调节产生IL-17A的γδ T细胞亚群 | 首次展示了肺部Vγ4+和Vγ6+细胞在肿瘤和非肿瘤状态下表达不同的细胞表面分子和共抑制分子，并发现这些分子抑制其扩张 | NA | 研究γδ T细胞亚群在稳态和癌症中的调控机制 | 小鼠中产生IL-17A的γδ T细胞亚群 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序和流式细胞术 | NA | 细胞表面分子表达数据 | 肿瘤和非肿瘤小鼠的肺部Vγ4+和Vγ6+细胞 |
| 76 | 2024-08-04 |
LRRC15 mediates an accessory interaction with the SARS-CoV-2 spike protein
2023-02, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3001959
PMID:36735681
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研究论文 | 本研究发现LRRC15是一种伴随因子，与SARS-CoV-2的刺突蛋白相互作用 | 本研究首次揭示了LRRC15作为SARS-CoV-2刺突蛋白的附加结合因子，与已知的结合机制不同 | LRRC15单独并不足以引发病毒进入，需要进一步研究其在感染中的作用 | 探讨SARS-CoV-2刺突蛋白与人类细胞之间的相互作用 | SARS-CoV-2刺突蛋白及其与人类细胞因子LRRC15的相互作用 | NA | COVID-19 | 蛋白组学与单细胞转录组学 | 细胞基因表达模型 | NA | 人类肺血管细胞和成纤维细胞的分析 |
| 77 | 2024-08-07 |
Smoking induces shifts in cellular composition and transcriptome within the bronchial mucus barrier
2023-02, Respirology (Carlton, Vic.)
DOI:10.1111/resp.14401
PMID:36414410
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研究论文 | 本研究评估了吸烟对支气管黏液屏障细胞组成和基因表达的影响，并探讨了基于单细胞RNA测序的细胞解卷积方法在预测RNA测序数据中细胞类型组成的能力 | 研究首次使用细胞解卷积方法预测RNA测序数据中的细胞类型组成，并验证了该方法的有效性 | 研究样本量相对较小，且仅限于特定的疾病和吸烟状态群体 | 理解吸烟暴露对支气管黏液屏障黏膜损伤的机制 | 支气管黏液屏障的细胞组成和基因表达 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | 细胞解卷积 | RNA测序数据 | 共149名参与者，包括56名慢性阻塞性肺疾病患者，77名无慢性阻塞性肺疾病参与者，以及16名停止吸烟一年的参与者 |
| 78 | 2024-08-04 |
An in vitro approach to understand contribution of kidney cells to human urinary extracellular vesicles
2023-02, Journal of extracellular vesicles
IF:15.5Q1
DOI:10.1002/jev2.12304
PMID:36785873
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研究论文 | 本文探索了不同人类肾细胞对尿液外泌体成分的贡献 | 提出了一种体外模型，揭示了酗酒细胞类型特异的外泌体货物，可以作为肾脏疾病的生物标记物 | 未对尿液中所有细胞类型的外泌体成分进行详尽分析 | 旨在理解不同肾细胞分泌的外泌体成分及其在正常尿液中的表现 | 不同类型的人类肾细胞（足细胞、肾小管细胞、肾小球内皮细胞和系膜细胞） | 数字病理学 | 肾脏疾病 | RNA测序、质谱分析、纳米颗粒跟踪分析等 | NA | 生物体液（尿液）、细胞培养的外泌体 | 从不同类型的条件性永生化人类肾细胞中提取的外泌体 |
| 79 | 2024-08-07 |
Nuclear factor I-C overexpression promotes monocytic development and cell survival in acute myeloid leukemia
2023-02, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-022-01801-z
PMID:36572750
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研究论文 | 本文研究了核因子I-C（NFIC）在急性髓系白血病中的过表达及其对单核细胞发育和细胞存活的影响 | 首次展示了NFIC蛋白在急性髓系白血病患者中的显著过表达，并证明了其在单核细胞分化和细胞存活中的促进作用 | NA | 探讨NFIC在急性髓系白血病中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 急性髓系白血病患者的NFIC蛋白表达及其功能影响 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 69%的急性髓系白血病患者样本，以及AML细胞系和AML患者 blasts |
| 80 | 2024-08-04 |
IL-21R signal reprogramming cooperates with CD40 and BCR signals to select and differentiate germinal center B cells
2023-02-24, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.add1823
PMID:36800413
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研究论文 | 本文研究了IL-21R信号如何与CD40和BCR信号共同作用，选择并分化生发中心B细胞 | 发现IL-21R与CD40信号的协同作用引导生发中心B细胞（GCBCs）走向特定命运，揭示了第二条正选择通路 | 研究主要基于体外和体内的细胞分选和转录组测序，可能未能完全模拟体内复杂的微环境 | 阐明IL-21R信号在生发中心B细胞命运决定中的作用 | 生发中心B细胞，特别是受IL-21R和CD40共同信号影响的细胞 | 免疫学 | NA | RNA测序，单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | 细胞，转录组数据 | 具体细胞数量未在摘要中提供 |