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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-10-06 |
An in vitro approach to understand contribution of kidney cells to human urinary extracellular vesicles
2023-02, Journal of extracellular vesicles
IF:15.5Q1
DOI:10.1002/jev2.12304
PMID:36785873
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研究论文 | 本研究通过体外培养人肾脏细胞系并分析其分泌的细胞外囊泡成分,探索不同肾脏细胞对尿液中细胞外囊泡的贡献 | 首次系统比较体外培养的多种人肾脏细胞系分泌的EV成分与尿液EV成分,建立体外模型解析生物体液中细胞类型特异性EV货物 | 研究基于条件永生化的细胞系,可能与原代细胞存在差异;体外环境无法完全模拟体内复杂微环境 | 理解不同肾脏细胞类型对尿液细胞外囊泡组成的贡献,探索肾脏疾病细胞类型特异性EV生物标志物 | 条件永生化的四种人肾脏细胞系(足细胞、肾小球内皮细胞、系膜细胞和近端小管细胞)及其分泌的细胞外囊泡 | 细胞生物学 | 肾脏疾病 | miRNA测序, RNA测序, 串联质量标签蛋白质组学, 电子显微镜, 纳米颗粒跟踪分析, 蛋白质印迹 | 体外细胞模型 | RNA测序数据, 蛋白质组数据, 显微镜图像 | 四种人肾脏细胞系及其分泌的EV,与人类尿液EV进行比较 | NA | RNA测序, 蛋白质组学, 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 22 | 2025-10-06 |
LRRC15 mediates an accessory interaction with the SARS-CoV-2 spike protein
2023-02, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3001959
PMID:36735681
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研究论文 | 本研究发现了SARS-CoV-2刺突蛋白与人类宿主因子LRRC15之间的新型辅助相互作用 | 首次发现LRRC15可作为SARS-CoV-2刺突蛋白的辅助结合受体,这种相互作用不同于已知的硫酸肝素或凝集素受体结合机制 | LRRC15单独不足以允许病毒进入,其具体作用机制需要进一步研究 | 探索SARS-CoV-2刺突蛋白与人类细胞的额外相互作用机制 | SARS-CoV-2病毒刺突蛋白和人类宿主因子 | 病毒学 | COVID-19 | 细胞筛选、蛋白质组学、单细胞转录组学 | NA | 蛋白质相互作用数据、基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 23 | 2025-10-06 |
A chromosome-scale epigenetic map of the Hydra genome reveals conserved regulators of cell state
2023-02, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.277040.122
PMID:36639202
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研究论文 | 本研究构建了水螅基因组染色体尺度的表观遗传图谱,揭示了细胞状态保守调控因子 | 发现了水螅基因组中存在包含转录共调控基因的大型染色质相互作用域,识别了两种先前未分子表征的细胞类型,并鉴定出可能自4亿年前水螅与水母分化以来保守的细胞类型特异性转录候选调控因子 | NA | 解析水螅干细胞维持和分化的转录调控机制 | 淡水息肉水螅的上皮和间质干细胞系统 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序、染色质相互作用图谱、染色质可及性分析、序列保守性分析、组蛋白修饰分析 | NA | 基因组序列、单细胞转录组、表观基因组 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 24 | 2025-10-06 |
Regulators of male and female sexual development are critical for the transmission of a malaria parasite
2023-02-08, Cell host & microbe
IF:20.6Q1
DOI:10.1016/j.chom.2022.12.011
PMID:36634679
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研究论文 | 本研究通过条形码突变体筛选和单细胞转录组分析,鉴定了疟原虫性别决定的关键基因及其调控机制 | 首次系统鉴定了疟原虫雄性和雌性性别决定的关键基因,揭示了LOTUS/OST-HTH结构域蛋白在雄性决定和锌指蛋白在雌性决定中的新功能 | 研究主要基于啮齿类疟原虫模型,在人类疟原虫中的保守性需要进一步验证 | 阐明疟原虫有性生殖发育的分子调控机制 | 伯氏疟原虫(Plasmodium berghei) | 分子生物学 | 疟疾 | 条形码突变体筛选,单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据,突变表型数据 | 10种突变体寄生虫 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 高分辨率单细胞转录组分析 |
| 25 | 2025-10-06 |
PD-1 and TIM-3 differentially regulate subsets of mouse IL-17A-producing γδ T cells
2023-02-06, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20211431
PMID:36480166
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术揭示了小鼠肺中产生IL-17A的γδ T细胞亚群在稳态和癌症状态下受PD-1和TIM-3差异性调控的机制 | 首次发现Vγ6+和Vγ4+ γδ T细胞亚群分别通过PD-1和TIM-3受到差异性调控,并证明这些细胞导致免疫检查点抑制剂治疗耐药 | 研究局限于小鼠模型,尚未在人类中验证 | 探究小鼠产生IL-17A的γδ T细胞亚群在稳态和癌症状态下的调控机制 | 小鼠肺组织中的Vγ6+组织驻留型和Vγ4+循环型γδ T细胞 | 免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | 肿瘤游离和荷瘤小鼠的肺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 26 | 2025-10-06 |
Spatial Gene Expression Changes in the Mouse Heart After Base-Targeted Irradiation
2023-02-01, International journal of radiation oncology, biology, physics
DOI:10.1016/j.ijrobp.2022.08.031
PMID:35985456
|
研究论文 | 本研究使用空间转录组学技术分析小鼠心脏基底区域靶向照射后的基因表达变化 | 首次在辐照组织中报告空间分辨的基因表达变化 | 仅使用两只小鼠(一只照射组,一只假照射对照组),样本量较小 | 表征心脏基底区域放射敏感性模型中基因表达的晚期变化 | 老年雌性C57BL/6小鼠 | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 空间转录组学分析 | NA | 基因表达数据 | 2只小鼠(1只照射组,1只假照射对照组) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 27 | 2025-10-06 |
The astroglial and stem cell functions of adult rat folliculostellate cells
2023-02, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.24267
PMID:36093576
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和免疫组织荧光分析揭示成年大鼠垂体滤泡星状细胞的星形胶质细胞和干细胞功能 | 首次在单细胞水平识别出垂体滤泡星状细胞的两个功能亚群,并发现其中一个亚群具有干细胞样特征 | 研究仅针对成年雌性大鼠,样本来源单一 | 解析垂体非激素产生细胞的转录组特征和功能 | 成年雌性大鼠垂体细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序, 免疫组织荧光 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | 成年雌性大鼠全垂体及分离的前后叶细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 28 | 2025-10-06 |
Nuclear factor I-C overexpression promotes monocytic development and cell survival in acute myeloid leukemia
2023-02, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-022-01801-z
PMID:36572750
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研究论文 | 本研究揭示核因子I-C在急性髓系白血病中的过表达现象及其对单核细胞分化和细胞存活的影响 | 首次发现NFIC在69%AML患者中过表达,并证实其通过调控MLL-1等信号通路促进单核细胞分化和白血病细胞存活 | 研究主要基于细胞系和体外模型,缺乏体内动物模型的验证 | 探讨NFIC在急性髓系白血病发生发展中的生物学功能 | 急性髓系白血病患者样本、HSPCs、AML细胞系(THP-1)和小鼠MLL::AF9前白血病干细胞模型 | 血液肿瘤学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, shRNA基因敲低 | NA | 基因表达数据 | AML患者样本(69%过表达NFIC) | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 29 | 2025-10-06 |
The pluripotency factor Tex10 finetunes Wnt signaling for PGC and male germline development
2023-Feb-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.02.23.529824
PMID:36865339
|
研究论文 | 本研究揭示了Tex10通过精细调控Wnt信号通路在原始生殖细胞特化和精子发生中的关键作用 | 首次发现Tex10通过结合H3K4me3标记的Wnt负调控基因来精细调控Wnt信号通路,影响PGC特化和精子发生 | NA | 探究Tex10在原始生殖细胞特化和精子发生中的发育功能 | 原始生殖细胞样细胞、条件性基因敲除小鼠模型 | 发育生物学 | 男性生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序、条件性基因敲除 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 30 | 2025-10-07 |
Type I interferon signaling facilitates resolution of acute liver injury by priming macrophage polarization
2023-02, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-022-00966-y
PMID:36596875
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了I型干扰素在急性肝损伤中通过调控髓系细胞分化促进肝脏修复的作用机制 | 首次发现I型干扰素依赖的三向通讯通路,涉及中间修复性巨噬细胞、衰老中性粒细胞和Trem2+修复性巨噬细胞的相互作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 | 阐明I型干扰素在乙酰氨基酚过量诱导的急性肝损伤中对髓系细胞功能的调控机制 | 肝脏CD11b+髓系细胞,包括巨噬细胞和中性粒细胞 | 单细胞生物学 | 急性肝损伤 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光染色, 批量RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据, 批量转录组数据 | 野生型和STAT2 T403A突变小鼠的肝脏CD11b+细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 31 | 2025-10-07 |
Single-cell analysis identifies Ifi27l2a as a novel gene regulator of microglial inflammation in the context of aging and stroke
2023-Feb-15, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2557290/v1
PMID:36824976
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序识别Ifi27l2a为调控衰老和脑卒中背景下小胶质细胞炎症反应的新型基因 | 首次发现Ifi27l2a基因在神经退行性疾病中的作用机制,揭示其通过活性氧介导神经炎症的新功能 | 研究主要基于小鼠模型和细胞培养实验,人类样本验证有限 | 探索调控小胶质细胞功能的关键基因,为脑卒中治疗提供新靶点 | 衰老小鼠大脑、小胶质细胞培养模型、人类尸检样本 | 单细胞生物学 | 脑卒中 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 32 | 2025-10-07 |
Network analysis of large-scale ImmGen and Tabula Muris datasets highlights metabolic diversity of tissue mononuclear phagocytes
2023-02-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112046
PMID:36708514
|
研究论文 | 通过代谢网络分析研究组织单核吞噬细胞的代谢多样性 | 开发了基于网络的GAM聚类计算方法,首次在38种不同组织中系统识别了单核吞噬细胞的9个关键代谢子网络 | 研究主要基于小鼠数据集,结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 理解单核吞噬细胞在不同组织中的代谢变异性 | 小鼠单核吞噬细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序,代谢网络分析 | GAM聚类 | 转录组数据 | 337个样本(ImmGen MNP数据集)+202个样本(ImmGen Phase I)+51,364个细胞(Tabula Muris scRNA-seq) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 33 | 2025-10-07 |
Screening cell-cell communication in spatial transcriptomics via collective optimal transport
2023-02, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-022-01728-4
PMID:36690742
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研究论文 | 开发了一种名为COMMOT的计算方法,通过集体最优传输技术分析空间转录组数据中的细胞间通讯 | 提出了考虑不同配体-受体物种竞争和细胞间空间距离的集体最优传输方法,能够处理复杂分子相互作用和空间约束 | NA | 推断空间转录组中的细胞间通讯 | 空间转录组数据和单细胞RNA测序数据集 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组技术,单细胞RNA测序 | 最优传输模型,机器学习模型 | 空间转录组数据 | 模拟数据和8个空间数据集,涉及5种不同技术 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 34 | 2025-10-07 |
Targeting Epsins to Inhibit Fibroblast Growth Factor Signaling While Potentiating Transforming Growth Factor-β Signaling Constrains Endothelial-to-Mesenchymal Transition in Atherosclerosis
2023-02-21, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究通过靶向Epsins蛋白调控成纤维细胞生长因子信号通路,抑制内皮-间质转化过程从而治疗动脉粥样硬化 | 首次揭示Epsins通过调控FGFR1内化和降解促进TGF-β信号通路的新机制,并开发了靶向治疗肽 | 研究主要基于小鼠模型,尚未进行人体临床试验验证 | 探究Epsins在动脉粥样硬化中促进内皮-间质转化的分子机制并评估治疗策略 | Apoe-/-基因敲除小鼠和谱系示踪/PCSK9突变病毒诱导的动脉粥样硬化小鼠模型 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,分子、细胞和生化分析,谱系示踪技术 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,蛋白质相互作用数据 | 多种基因工程小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 35 | 2025-10-07 |
Generation of blastoids from human parthenogenetic stem cells
2023-Feb, Life medicine
DOI:10.1093/lifemedi/lnad006
PMID:39872951
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研究论文 | 本研究利用人类孤雌生殖干细胞成功生成孤雌生殖囊胚结构 | 首次从人类孤雌生殖扩展多能干细胞生成孤雌生殖囊胚结构,为研究基因组印记提供新模型 | 存在发育缺陷和伦理限制,对孤雌生殖胚胎发育的全面理解仍不足 | 研究基因组印记在胚胎发育中的作用及亲本起源偏倚对人类发育的影响 | 人类孤雌生殖干细胞衍生的扩展多能干细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 36 | 2024-12-08 |
Chrna5 and lynx prototoxins identify acetylcholine super-responder subplate neurons
2023-Feb-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.105992
PMID:36798433
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研究论文 | 研究通过复杂转基因小鼠模型探索Chrna5+神经元及其对内源性乙酰胆碱的敏感性,发现Chrna5+神经元中存在乙酰胆碱超反应者亚群,并利用单细胞转录组学揭示了其分子标记 | 首次发现Chrna5+神经元中的乙酰胆碱超反应者亚群,并确定了其独特的GPI锚定lynx原毒素基因表达模式 | NA | 探索Chrna5+神经元及其对内源性乙酰胆碱的敏感性,揭示其在注意力障碍中的潜在作用 | Chrna5+神经元及其对乙酰胆碱的反应 | 神经科学 | 注意力障碍 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 复杂转基因小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 37 | 2024-10-16 |
Bacterial droplet-based single-cell RNA-seq reveals antibiotic-associated heterogeneous cellular states
2023-02-16, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2023.01.002
PMID:36708705
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研究论文 | 介绍了一种名为BacDrop的高可扩展性细菌单细胞RNA测序技术,用于研究抗生素压力下的细胞异质性 | BacDrop技术克服了细菌单细胞RNA测序的许多挑战,能够处理数千到数百万个细胞,并揭示了抗生素压力下的细胞异质性 | NA | 研究细菌在抗生素压力下的细胞异质性 | 肺炎克雷伯菌临床分离株及其对抗生素压力的异质性反应 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 数千到数百万个细菌细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 38 | 2024-10-06 |
SARS-CoV-2 cellular tropism and direct multiorgan failure in COVID-19 patients: Bioinformatic predictions, experimental observations, and open questions
2023-Feb, Cell biology international
IF:3.3Q3
DOI:10.1002/cbin.11928
PMID:36229927
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综述 | 本文综述了SARS-CoV-2病毒的细胞趋向性及其在COVID-19患者中引发多器官衰竭的可能机制 | 首次广泛使用单细胞RNA测序(scRNA-seq)基因表达数据集来预测SARS-CoV-2的细胞趋向性 | 并非所有预测的易感细胞在COVID-19患者中都会被感染 | 探讨SARS-CoV-2病毒的传播途径及其在COVID-19患者中引发多器官衰竭的原因 | SARS-CoV-2病毒的细胞趋向性及其与早期感染和多器官衰竭的关联 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 39 | 2024-10-06 |
Human antibody BD-218 has broad neutralizing activity against concerning variants of SARS-CoV-2
2023-Feb-01, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2022.12.120
PMID:36528147
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研究论文 | 本文报道了一种名为BD-218的人类抗体,具有广泛的SARS-CoV-2变种中和活性 | BD-218抗体能够与SARS-CoV-2刺突蛋白的受体结合域上的新表位结合,显示出对多种变种(包括beta、delta和omicron变种)的广泛中和活性 | NA | 研究SARS-CoV-2变种的中和抗体,以提高现有抗COVID疗法的有效性 | BD-218抗体及其对SARS-CoV-2变种的中和活性 | NA | NA | 单细胞测序、生物化学方法、伪型病毒中和实验、冷冻电镜结构分析 | NA | 结构数据 | 从早期康复患者中筛选出的抗体 | NA | NA | NA | NA |
| 40 | 2024-10-02 |
Integrative single-cell RNA-seq and ATAC-seq analysis of myogenic differentiation in pig
2023-02-01, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-023-01519-z
PMID:36726129
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和ATAC测序分析了猪骨骼肌分化的分子和细胞动态 | 首次在猪胚胎发育过程中对骨骼肌分化进行了单细胞分辨率的基因表达和染色质可及性分析 | 研究仅限于猪胚胎发育阶段,未涵盖成年猪或人类 | 深入理解猪胚胎骨骼肌分化的分子和细胞动态 | 猪胚胎的骨骼肌分化过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和ATAC测序 | NA | 基因表达数据和染色质可及性数据 | 猪胚胎的骨骼肌细胞 | NA | NA | NA | NA |