单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202302-202302] [清除筛选条件]
当前共找到 307 篇文献,本页显示第 21 - 40 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
21 2025-10-06
The pluripotency factor Tex10 finetunes Wnt signaling for PGC and male germline development
2023-Feb-24, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究揭示了Tex10通过精细调控Wnt信号通路在原始生殖细胞特化和精子发生中的关键作用 首次发现Tex10通过结合H3K4me3标记的Wnt负调控基因来精细调控Wnt信号通路,影响PGC特化和精子发生 NA 探究Tex10在原始生殖细胞特化和精子发生中的发育功能 原始生殖细胞样细胞、条件性基因敲除小鼠模型 发育生物学 男性生殖系统疾病 单细胞RNA测序、条件性基因敲除 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
22 2025-10-07
Type I interferon signaling facilitates resolution of acute liver injury by priming macrophage polarization
2023-02, Cellular & molecular immunology IF:21.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了I型干扰素在急性肝损伤中通过调控髓系细胞分化促进肝脏修复的作用机制 首次发现I型干扰素依赖的三向通讯通路,涉及中间修复性巨噬细胞、衰老中性粒细胞和Trem2+修复性巨噬细胞的相互作用 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 阐明I型干扰素在乙酰氨基酚过量诱导的急性肝损伤中对髓系细胞功能的调控机制 肝脏CD11b+髓系细胞,包括巨噬细胞和中性粒细胞 单细胞生物学 急性肝损伤 单细胞RNA测序, 免疫荧光染色, 批量RNA测序 NA 单细胞转录组数据, 图像数据, 批量转录组数据 野生型和STAT2 T403A突变小鼠的肝脏CD11b+细胞 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
23 2025-10-07
Single-cell analysis identifies Ifi27l2a as a novel gene regulator of microglial inflammation in the context of aging and stroke
2023-Feb-15, Research square
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序识别Ifi27l2a为调控衰老和脑卒中背景下小胶质细胞炎症反应的新型基因 首次发现Ifi27l2a基因在神经退行性疾病中的作用机制,揭示其通过活性氧介导神经炎症的新功能 研究主要基于小鼠模型和细胞培养实验,人类样本验证有限 探索调控小胶质细胞功能的关键基因,为脑卒中治疗提供新靶点 衰老小鼠大脑、小胶质细胞培养模型、人类尸检样本 单细胞生物学 脑卒中 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
24 2025-10-07
Network analysis of large-scale ImmGen and Tabula Muris datasets highlights metabolic diversity of tissue mononuclear phagocytes
2023-02-28, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 通过代谢网络分析研究组织单核吞噬细胞的代谢多样性 开发了基于网络的GAM聚类计算方法,首次在38种不同组织中系统识别了单核吞噬细胞的9个关键代谢子网络 研究主要基于小鼠数据集,结果在人类中的适用性需要进一步验证 理解单核吞噬细胞在不同组织中的代谢变异性 小鼠单核吞噬细胞 生物信息学 NA 单细胞RNA测序,代谢网络分析 GAM聚类 转录组数据 337个样本(ImmGen MNP数据集)+202个样本(ImmGen Phase I)+51,364个细胞(Tabula Muris scRNA-seq) NA 单细胞RNA测序 NA NA
25 2025-10-07
Screening cell-cell communication in spatial transcriptomics via collective optimal transport
2023-02, Nature methods IF:36.1Q1
研究论文 开发了一种名为COMMOT的计算方法,通过集体最优传输技术分析空间转录组数据中的细胞间通讯 提出了考虑不同配体-受体物种竞争和细胞间空间距离的集体最优传输方法,能够处理复杂分子相互作用和空间约束 NA 推断空间转录组中的细胞间通讯 空间转录组数据和单细胞RNA测序数据集 空间转录组学 NA 空间转录组技术,单细胞RNA测序 最优传输模型,机器学习模型 空间转录组数据 模拟数据和8个空间数据集,涉及5种不同技术 NA 空间转录组学,单细胞RNA测序 NA NA
26 2025-10-07
Targeting Epsins to Inhibit Fibroblast Growth Factor Signaling While Potentiating Transforming Growth Factor-β Signaling Constrains Endothelial-to-Mesenchymal Transition in Atherosclerosis
2023-02-21, Circulation IF:35.5Q1
研究论文 本研究通过靶向Epsins蛋白调控成纤维细胞生长因子信号通路,抑制内皮-间质转化过程从而治疗动脉粥样硬化 首次揭示Epsins通过调控FGFR1内化和降解促进TGF-β信号通路的新机制,并开发了靶向治疗肽 研究主要基于小鼠模型,尚未进行人体临床试验验证 探究Epsins在动脉粥样硬化中促进内皮-间质转化的分子机制并评估治疗策略 Apoe-/-基因敲除小鼠和谱系示踪/PCSK9突变病毒诱导的动脉粥样硬化小鼠模型 分子生物学 心血管疾病 单细胞RNA测序,分子、细胞和生化分析,谱系示踪技术 基因敲除小鼠模型 基因表达数据,蛋白质相互作用数据 多种基因工程小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
27 2025-10-07
Generation of blastoids from human parthenogenetic stem cells
2023-Feb, Life medicine
研究论文 本研究利用人类孤雌生殖干细胞成功生成孤雌生殖囊胚结构 首次从人类孤雌生殖扩展多能干细胞生成孤雌生殖囊胚结构,为研究基因组印记提供新模型 存在发育缺陷和伦理限制,对孤雌生殖胚胎发育的全面理解仍不足 研究基因组印记在胚胎发育中的作用及亲本起源偏倚对人类发育的影响 人类孤雌生殖干细胞衍生的扩展多能干细胞 发育生物学 NA 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
28 2024-12-15
Tumor Niche Network-Defined Subtypes Predict Immunotherapy Response of Esophageal Squamous Cell Cancer
2023-Feb-15, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过整合69名食管鳞状细胞癌患者的肿瘤微环境单细胞转录组数据,定义了不同的ESCC亚型,并预测了免疫治疗反应 提出了基于肿瘤微环境转录网络的ESCC亚型分类方法,并验证了其对免疫治疗反应的预测能力 NA 研究食管鳞状细胞癌的肿瘤微环境特征,并预测免疫检查点阻断疗法的反应 食管鳞状细胞癌患者的肿瘤微环境 数字病理学 食管癌 单细胞转录组 NA 转录组数据 69名食管鳞状细胞癌患者 NA NA NA NA
29 2024-12-08
Chrna5 and lynx prototoxins identify acetylcholine super-responder subplate neurons
2023-Feb-17, iScience IF:4.6Q1
研究论文 研究通过复杂转基因小鼠模型探索Chrna5+神经元及其对内源性乙酰胆碱的敏感性,发现Chrna5+神经元中存在乙酰胆碱超反应者亚群,并利用单细胞转录组学揭示了其分子标记 首次发现Chrna5+神经元中的乙酰胆碱超反应者亚群,并确定了其独特的GPI锚定lynx原毒素基因表达模式 NA 探索Chrna5+神经元及其对内源性乙酰胆碱的敏感性,揭示其在注意力障碍中的潜在作用 Chrna5+神经元及其对乙酰胆碱的反应 神经科学 注意力障碍 单细胞转录组学 NA 转录组数据 复杂转基因小鼠模型 NA NA NA NA
30 2024-10-16
Bacterial droplet-based single-cell RNA-seq reveals antibiotic-associated heterogeneous cellular states
2023-02-16, Cell IF:45.5Q1
研究论文 介绍了一种名为BacDrop的高可扩展性细菌单细胞RNA测序技术,用于研究抗生素压力下的细胞异质性 BacDrop技术克服了细菌单细胞RNA测序的许多挑战,能够处理数千到数百万个细胞,并揭示了抗生素压力下的细胞异质性 NA 研究细菌在抗生素压力下的细胞异质性 肺炎克雷伯菌临床分离株及其对抗生素压力的异质性反应 基因组学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA 数千到数百万个细菌细胞 NA NA NA NA
31 2024-10-06
SARS-CoV-2 cellular tropism and direct multiorgan failure in COVID-19 patients: Bioinformatic predictions, experimental observations, and open questions
2023-Feb, Cell biology international IF:3.3Q3
综述 本文综述了SARS-CoV-2病毒的细胞趋向性及其在COVID-19患者中引发多器官衰竭的可能机制 首次广泛使用单细胞RNA测序(scRNA-seq)基因表达数据集来预测SARS-CoV-2的细胞趋向性 并非所有预测的易感细胞在COVID-19患者中都会被感染 探讨SARS-CoV-2病毒的传播途径及其在COVID-19患者中引发多器官衰竭的原因 SARS-CoV-2病毒的细胞趋向性及其与早期感染和多器官衰竭的关联 NA COVID-19 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 NA NA NA NA NA
32 2024-10-06
Human antibody BD-218 has broad neutralizing activity against concerning variants of SARS-CoV-2
2023-Feb-01, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1
研究论文 本文报道了一种名为BD-218的人类抗体,具有广泛的SARS-CoV-2变种中和活性 BD-218抗体能够与SARS-CoV-2刺突蛋白的受体结合域上的新表位结合,显示出对多种变种(包括beta、delta和omicron变种)的广泛中和活性 NA 研究SARS-CoV-2变种的中和抗体,以提高现有抗COVID疗法的有效性 BD-218抗体及其对SARS-CoV-2变种的中和活性 NA NA 单细胞测序、生物化学方法、伪型病毒中和实验、冷冻电镜结构分析 NA 结构数据 从早期康复患者中筛选出的抗体 NA NA NA NA
33 2024-10-02
Integrative single-cell RNA-seq and ATAC-seq analysis of myogenic differentiation in pig
2023-02-01, BMC biology IF:4.4Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序和ATAC测序分析了猪骨骼肌分化的分子和细胞动态 首次在猪胚胎发育过程中对骨骼肌分化进行了单细胞分辨率的基因表达和染色质可及性分析 研究仅限于猪胚胎发育阶段,未涵盖成年猪或人类 深入理解猪胚胎骨骼肌分化的分子和细胞动态 猪胚胎的骨骼肌分化过程 数字病理学 NA 单细胞RNA测序和ATAC测序 NA 基因表达数据和染色质可及性数据 猪胚胎的骨骼肌细胞 NA NA NA NA
34 2024-10-02
A Zinc- and Calcium-Rich Lysosomal Nanoreactor Rescues Monocyte/Macrophage Dysfunction under Sepsis
2023-02, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本文研究了一种富含锌和钙的溶酶体纳米反应器在脓毒症中恢复单核细胞/巨噬细胞功能的作用 开发了一种名为Alpha-MOFs的纳米颗粒,通过释放溶酶体敏感的离子来提升单核细胞/巨噬细胞的吞噬能力 NA 研究脓毒症中单核细胞/巨噬细胞功能失调的机制,并开发新的治疗方法 脓毒症中的单核细胞/巨噬细胞及其吞噬功能 NA 脓毒症 单细胞RNA测序 NA RNA 外周血单核细胞 NA NA NA NA
35 2024-09-30
Complex Analysis of Single-Cell RNA Sequencing Data
2023-Feb, Biochemistry. Biokhimiia
综述 本文综述了单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据分析的不同方法,讨论了生物信息学工具的优缺点,并提供了成功应用的示例和改进建议 强调了创建新的多组学协议以更全面地理解单个细胞的必要性 讨论了现有生物信息学工具的优缺点 探讨单细胞RNA测序数据分析的方法及其在临床和研究中的应用 单细胞RNA测序数据及其在疾病分子机制分析中的应用 基因组学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 NA NA NA NA NA
36 2024-09-30
Reconstruction of the tumor spatial microenvironment along the malignant-boundary-nonmalignant axis
2023-02-20, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 开发了一种名为Cottrazm的工具,结合空间转录组学、苏木精和伊红染色图像以及单细胞转录组学,用于描绘肿瘤边界并重建细胞类型特异性基因表达谱 首次将空间转录组学与病理学图像和单细胞转录组学结合,以描绘肿瘤边界并重建细胞类型特异性基因表达谱 NA 揭示肿瘤空间微环境的结构和功能特征 肿瘤边界及其与恶性细胞和非恶性细胞的相互作用 数字病理学 肿瘤 空间转录组学、苏木精和伊红染色、单细胞转录组学 NA 图像、基因表达数据 NA NA NA NA NA
37 2024-09-23
Transcriptomic changes in single yeast cells under various stress conditions
2023-Feb-24, BMC genomics IF:3.5Q2
研究论文 研究了在不同胁迫条件下单个酵母细胞的转录组变化 利用全长的单细胞RNA测序技术,提供了比传统群体细胞方法更精细的酵母胁迫响应图谱 单细胞间的技术噪声和批次效应可能会显著影响结果 探讨酵母在胁迫条件下的转录组变化 酵母细胞在不同胁迫条件下的转录组 基因组学 NA 全长单细胞RNA测序 NA 转录组数据 117个酵母细胞,分别在三种胁迫条件下(低渗条件、葡萄糖饥饿和氨基酸饥饿)进行测序 NA NA NA NA
38 2024-09-23
Progress in Discovering Transcriptional Noise in Aging
2023-Feb-12, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
综述 本文综述了衰老过程中转录噪音的发现进展 提出了基于网络分析的基因间协调水平分析等新方法来定义转录噪音 实验观察数量有限,单细胞RNA测序存在技术噪音,缺乏标准或最佳的数据分析测量方法 回顾近期技术进展、当前知识和挑战,以更好地理解衰老中的转录噪音 衰老过程中的转录噪音 NA NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA NA NA NA
39 2024-09-23
STAT3 protects HSCs from intrinsic interferon signaling and loss of long-term blood-forming activity
2023-Feb-11, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 研究探讨了STAT3在造血干细胞和祖细胞中的功能及其对长期造血活性的保护作用 首次通过混合骨髓嵌合小鼠模型,揭示了STAT3在造血干细胞和祖细胞中的关键作用,并提出了使用靶向合成致死方法与STAT3抑制剂结合来清除缺陷或疾病造血干细胞和祖细胞的潜力 研究主要集中在小鼠模型上,尚未在人类中验证STAT3功能的直接相关性 探讨STAT3在造血干细胞和祖细胞中的功能及其对长期造血活性的影响 造血干细胞和祖细胞 NA NA 单细胞RNA测序 NA RNA 20%的造血系统中使用CreER介导的删除方法建立了混合骨髓嵌合小鼠模型 NA NA NA NA
40 2024-09-23
Using single-cell RNA sequencing to generate cell-type-specific split-GAL4 reagents throughout development
2023-Feb-04, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文利用单细胞RNA测序数据生成基于基因特异性调控元件的细胞类型特异性split-GAL4工具,用于果蝇发育过程中的细胞类型研究 本文提出了一种基于单细胞RNA测序数据的高效流程,用于生成细胞类型特异性的split-GAL4工具,解决了现有增强子驱动的GAL4工具在表达模式预测上的不足 NA 开发新的细胞类型特异性工具,用于果蝇发育过程中特定细胞类型的靶向操作 果蝇的神经发育和视觉系统 基因组学 NA 单细胞RNA测序 (scRNAseq) NA 基因表达数据 大量编码内含子MiMIC/CRIMIC线 NA NA NA NA
回到顶部