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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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261 | 2024-08-08 |
Identification of Cell Types and Transcriptome Landscapes of Porcine Epidemic Diarrhea Virus-Infected Porcine Small Intestine Using Single-Cell RNA Sequencing
2023-02-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2101216
PMID:36548460
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研究论文 | 本研究首次使用单细胞RNA测序技术系统分析了感染猪流行性腹泻病毒(PEDV)的猪空肠细胞类型和转录组景观 | 首次使用单细胞RNA测序技术系统分析PEDV感染的猪空肠,并鉴定了一种新的绒毛细胞标记物DNAH11 | NA | 研究PEDV感染后猪空肠不同细胞类型的反应,加深对病毒发病机制的理解 | 猪流行性腹泻病毒(PEDV)感染的猪空肠细胞类型和转录组景观 | 数字病理学 | 猪病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
262 | 2024-08-08 |
NF-κB drives epithelial-mesenchymal mechanisms of lung fibrosis in a translational lung cell model
2023-02-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.154719
PMID:36520540
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研究论文 | 研究探讨了在特发性肺纤维化进展阶段,肺上皮细胞和肺间质细胞在共培养模型中的相互作用及其对纤维化的影响 | 首次揭示了NF-κB信号通路在肺上皮细胞和肺纤维细胞共培养模型中的活性,及其在纤维化过程中的潜在介导作用 | NA | 研究肺上皮细胞和肺间质细胞在特发性肺纤维化中的相互作用及NF-κB信号通路的角色 | 人原代气道上皮细胞和肺纤维细胞的共培养模型 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及人原代气道上皮细胞和肺纤维细胞的共培养样本 |
263 | 2024-08-05 |
Single-Cell and Spatial Transcriptomics Decodes Wharton's Jelly-Derived Mesenchymal Stem Cells Heterogeneity and a Subpopulation with Wound Repair Signatures
2023-02, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202204786
PMID:36504438
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研究论文 | 本研究系统分析了脐带胶(WJ-MSCs)来源的间充质干细胞的高度异质性 | 通过单细胞转录组学分析,识别出四种WJ-MSC亚群及其独特的愈合特性 | 尚未提及具体的局限性 | 探索WJ-MSC的异质性,建立精准的MSC亚型分类 | 脐带胶来源的间充质干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞和空间转录组测序 | NA | 基因组数据 | NA |
264 | 2024-08-08 |
Manf Enhances the Pyroptosis Inhibition of Bone Marrow-derived Mesenchymal Stem Cells to Relieve Cerebral Infarction Injury
2023-02-01, Neuroscience
IF:2.9Q2
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研究论文 | 本研究通过构建大脑中动脉闭塞(MCAO)动物模型,利用单细胞RNA测序(scRNA-seq)比较假手术组和MCAO组的差异表达基因(DEGs),探讨脑梗死中潜在的细胞死亡相关通路,并通过慢病毒将Manf转染到骨髓间充质干细胞(BMSCs)中,评估其对MANF含量、凋亡、细胞焦亡、脑梗死体积和神经功能的影响。 | 本研究首次通过基因修饰的细胞疗法,特别是通过转染Manf到BMSCs中,显著增加了MANF的表达和分泌,从而有效抑制了凋亡和细胞焦亡相关分子的表达,减少了脑梗死体积,改善了神经功能。 | 研究主要集中在动物模型上,尚未在临床试验中验证其疗效和安全性。 | 探讨基因修饰的细胞疗法在脑梗死治疗中的潜在机制和疗效。 | 骨髓间充质干细胞(BMSCs)及其转染Manf后的效果。 | 细胞生物学 | 脑梗死 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 涉及多个细胞集群和动物模型 |
265 | 2024-08-05 |
TNFα/TNFR1 signal induces excessive senescence of decidua stromal cells in recurrent pregnancy loss
2023-02, Journal of reproductive immunology
IF:2.9Q2
DOI:10.1016/j.jri.2022.103776
PMID:36495656
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研究论文 | 本文研究了肿瘤坏死因子α(TNFα)在复发性妊娠损失(RPL)中的作用,尤其是它如何诱导决策基质细胞的过度衰老。 | 本文揭示了TNFα/TNFR1信号通路在RPL患者子宫内膜决策细胞中的作用及其机制,这是以前未被探讨的。 | 目前的研究可能未涵盖所有影响决策细胞衰老的因素,且样本量相对较小。 | 研究TNFα如何通过TNFR1信号通路诱导RPL患者决策细胞的过度衰老。 | 研究对象为复发性妊娠损失患者的决策细胞及正常对照组细胞。 | 数字病理学 | 复发性妊娠损失 | 单细胞测序 | 体外决策化模型 | 细胞 | 6个复发性妊娠损失样本和5个正常对照样本 |
266 | 2024-08-05 |
Genetics in non-alcoholic fatty liver disease: The role of risk alleles through the lens of immune response
2023-02, Clinical and molecular hepatology
IF:14.0Q1
DOI:10.3350/cmh.2022.0318
PMID:36472053
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综述 | 这篇文章从免疫系统的视角总结了非酒精性脂肪肝病(NAFLD)和非酒精性脂肪性肝炎(NASH)的遗传学最新进展 | 强调了基因组技术的新应用,包括单细胞测序和基因表达遗传学,以阐明NAFLD/NASH风险等位基因在调节免疫系统细胞中的潜在作用 | NA | 研究NAFLD和NASH相关风险变异在调节免疫驱动的肝病严重性中的潜在作用 | NAFLD和NASH的遗传学及其与免疫反应的关系 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
267 | 2024-08-05 |
Meta-Analysis of Human Cancer Single-Cell RNA-Seq Datasets Using the IMMUcan Database
2023-02-03, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-0074
PMID:36459564
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meta-analysis | 开发了一个专门用于人类癌症的单细胞RNA测序数据库IMMUcan scDB并进行了元分析 | 提供了一个集成化、可公开访问的数据库,涵盖56种不同癌症类型的144个数据集,并具有详细的临床和生物信息注释 | 数据异质性和研究之间的变异性可能对结果造成影响 | 探讨与肿瘤微环境相关的单细胞RNA测序数据并进行元分析 | 涉及56种不同癌症类型的单细胞RNA测序数据集 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 数据集 | 144个数据集 |
268 | 2024-08-08 |
Development of a personalized dendritic cell vaccine and single-cell RNA sequencing-guided assessment of its cell type composition
2023-02, Cytotherapy
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.jcyt.2022.10.013
PMID:36443171
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研究论文 | 本文研究了一种个性化树突状细胞疫苗的细胞类型组成,并通过单细胞RNA测序技术进行评估 | 首次通过单细胞转录组分析方法,详细研究了DC疫苗CUD-002的细胞类型组成,并确认了其安全性 | NA | 旨在评估和解决基于树突状细胞的免疫治疗产品在制造过程中细胞类型异质性的监管考虑 | 个性化树突状细胞疫苗CUD-002的细胞类型组成及其安全性 | 免疫治疗 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
269 | 2024-08-08 |
Heterogeneity of Circulating Epithelial Cells in Breast Cancer at Single-Cell Resolution: Identifying Tumor and Hybrid Cells
2023-02, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202200206
PMID:36449636
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析非转移性乳腺癌患者中CD45阴性和CD45阳性循环上皮细胞(CECs)的异质性 | 首次在单细胞分辨率下识别出乳腺癌中的肿瘤细胞和杂交细胞,并发现CD45 CECs中存在大量拷贝数异常,与肿瘤分级正相关 | 需要进一步研究以确定哪些循环肿瘤和杂交细胞亚群对乳腺癌转移有贡献 | 研究循环肿瘤细胞和杂交细胞在乳腺癌中的异质性及其在转移中的作用 | 非转移性乳腺癌患者的循环上皮细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 非转移性乳腺癌患者的循环上皮细胞 |
270 | 2024-08-08 |
Single-cell genomics illustrates heterogeneous phenotypes of myocardial fibroblasts under ischemic insults
2023-02-01, Biochemistry and cell biology = Biochimie et biologie cellulaire
DOI:10.1139/bcb-2022-0229
PMID:36458696
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研究论文 | 本文通过单细胞基因组学研究,揭示了心肌纤维母细胞在缺血损伤下的表型异质性 | 首次在单细胞分辨率下揭示了心肌纤维母细胞在缺血和再灌注条件下的表型异质性 | NA | 探索心肌纤维母细胞在心肌梗死区域的再生/修复反应 | 心肌纤维母细胞的表型异质性 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 从心肌梗死区域的Yucatan小型猪中分离的心肌纤维母细胞 |
271 | 2024-08-08 |
Molecular Dissection of Somatic Skeletal Disease in Neurofibromatosis Type 1
2023-02, Journal of bone and mineral research : the official journal of the American Society for Bone and Mineral Research
IF:5.1Q1
DOI:10.1002/jbmr.4755
PMID:36459048
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研究论文 | 本研究通过时间序列单细胞RNA测序(scRNA-seq)分析了神经纤维瘤病1型(NF1)患者来源的假关节样本中的骨基质细胞(BSCs),揭示了NF1相关骨骼疾病的发病机制。 | 首次应用时间序列单细胞RNA测序技术研究NF1患者的骨基质细胞,揭示了Clec11a-Itga11-Wnt信号通路在NF1相关骨骼疾病中的作用。 | 研究主要集中在细胞和分子层面,缺乏对NF1患者骨骼疾病的临床治疗效果的直接评估。 | 探讨NF1患者骨骼疾病的发病机制。 | NF1患者的骨基质细胞和假关节样本。 | 数字病理学 | 神经纤维瘤病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 细胞 | 患者匹配的控制组和假关节来源的初级骨基质细胞 |
272 | 2024-08-05 |
Identification of chondrocyte subpopulations in osteoarthritis using single-cell sequencing analysis
2023-Feb-05, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2022.147063
PMID:36427677
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序分析鉴定了骨关节炎中的软骨细胞亚群 | 研究揭示了骨关节炎中软骨细胞亚群的异质性,并识别出不同亚群的潜在功能 | 未提及具体的样本数量和临床信息 | 研究软骨细胞在骨关节炎中异质性的存在及其功能 | 骨关节炎患者的软骨细胞 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞测序 | K-均值聚类 | 细胞数据 | NA |
273 | 2024-08-05 |
Transcriptional glucocorticoid effects in the brain: Finding the relevant target genes
2023-02, Journal of neuroendocrinology
IF:3.3Q2
DOI:10.1111/jne.13213
PMID:36426812
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研究论文 | 本文讨论了糖皮质激素在大脑中的转录效应及其相关靶基因 | 探讨了MR和GR受体特异性及确定转录结果的上下文因素 | 未提供有关样本大小和具体实验条件的详细信息 | 阐明糖皮质激素在大脑中的跨细胞类型转录效应 | 涉及矿物皮质激素和糖皮质激素受体的靶基因 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
274 | 2024-08-05 |
Oligodendrocyte lineage cells: Advances in development, disease, and heterogeneity
2023-02, Journal of neurochemistry
IF:4.2Q2
DOI:10.1111/jnc.15728
PMID:36415921
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综述 | 本综述探讨了寡突胶质细胞前体细胞的不同亚群体、其发育轨迹及在相关疾病中的应用 | 使用单细胞测序技术研究寡突胶质细胞谱系的异质性 | 未提及具体的实验数据和样本规模 | 研究寡突胶质细胞谱系细胞的发育和异质性及其在疾病中的应用 | 寡突胶质细胞谱系的不同亚群体及其发育轨迹 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和单细胞核测序 (snRNA-seq) | NA | NA | NA |
275 | 2024-08-08 |
The dynamic cellular landscape of grafts with acute rejection after heart transplantation
2023-02, The Journal of heart and lung transplantation : the official publication of the International Society for Heart Transplantation
DOI:10.1016/j.healun.2022.10.017
PMID:36411190
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探讨了心脏移植后急性细胞排斥反应中的细胞动态景观 | 揭示了一个新的心脏成纤维细胞亚群,该亚群可能在急性心脏排斥反应中起中介作用 | NA | 探讨心脏移植后急性细胞排斥反应中的细胞动态景观 | 心脏移植后急性细胞排斥反应中的细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 小鼠心脏移植样本 |
276 | 2024-08-08 |
B lymphocytes ameliorate Alzheimer's disease-like neuropathology via interleukin-35
2023-Feb, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2022.11.012
PMID:36427805
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研究论文 | 本研究探讨了B淋巴细胞通过产生白细胞介素-35(IL-35)减轻阿尔茨海默病(AD)样神经病理学的作用 | 首次揭示了B淋巴细胞衍生的IL-35通过抑制前额叶皮质中的Aβ产生,对AD具有潜在治疗作用 | NA | 研究B淋巴细胞在AD病理过程中的作用及其机制 | B淋巴细胞、IL-35、Aβ病理、记忆障碍 | NA | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 5×FAD小鼠模型及AD患者血液样本 |
277 | 2024-08-05 |
Dynamic cellular and molecular characteristics of spermatogenesis in the viviparous marine teleost Sebastes schlegelii†
2023-02-13, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioac203
PMID:36401879
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研究论文 | 本研究探讨了海洋活胎鱼Sebastes schlegelii的精子发生的动态细胞和分子特征 | 该研究结合了细胞组织学和单细胞RNA测序技术,填补了关于活胎鱼精子发生动态变化的研究空白 | 本研究未提及样本的具体数量或外部验证的结果 | 揭示活胎鱼的精子发生过程中的细胞和分子动态变化 | 重点研究海洋鱼类Sebastes schlegelii的精子发生过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq、转录组技术 | NA | 基因表达数据 | NA |
278 | 2024-08-08 |
Construction of a novel immune-related prognostic-predicting model of gastric cancer
2023-Feb-05, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2022.147032
PMID:36403868
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据识别出274个差异表达的免疫相关基因,并构建了一个用于预测胃癌预后的风险评分模型 | 首次通过单细胞RNA测序数据识别出胃癌中的差异表达免疫相关基因,并构建了一个新的免疫相关预后预测模型 | NA | 研究胃癌的预后预测模型 | 胃癌患者的预后 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO回归分析 | RNA测序数据 | 274个差异表达的免疫相关基因,TCGA-GC训练队列和GSE66229外部数据集 |
279 | 2024-08-08 |
The heterogeneity of fibrosis and angiogenesis in endometriosis revealed by single-cell RNA-sequencing
2023-02, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2022.166602
PMID:36400338
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探索了异位子宫内膜、同位子宫内膜和正常子宫内膜在分泌期的细胞异质性 | 首次在没有激素药物干扰的情况下,通过单细胞RNA测序技术研究了异位和非异位子宫内膜的细胞异质性 | NA | 探索子宫内膜异位症中纤维化、血管生成和慢性炎症的细胞异质性 | 异位子宫内膜、同位子宫内膜和正常子宫内膜的细胞特性 | 数字病理学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
280 | 2024-08-05 |
Biglycan promotes hepatic fibrosis through activating heat shock protein 47
2023-Feb, Liver international : official journal of the International Association for the Study of the Liver
IF:6.0Q1
DOI:10.1111/liv.15477
PMID:36371672
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研究论文 | 本研究探讨了大肌糖蛋白(BGN)在肝纤维化中的作用及其机制。 | 确认了BGN通过调节HSP47依赖机制影响肝纤维化和细胞外基质沉积。 | 该研究主要基于小鼠模型和细胞实验,临床相关性需要进一步验证。 | 研究BGN在肝纤维化中的作用及其调控机制。 | 使用人类肝样本、BGN缺失小鼠模型及人类LX-2肝星状细胞模型进行研究。 | 数字病理学 | 肝纤维化 | qRT-PCR, 西方印迹, 免疫共沉淀, 免疫荧光染色 | NA | 生物信息数据, 单细胞RNA-seq数据 | 人类肝样本和BGN缺失小鼠模型, LX-2细胞模型 |