单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 307 篇文献，本页显示第 181 - 200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2024-08-05 |
Distinct tissue niches direct lung immunopathology via CCL18 and CCL21 in severe COVID-19
2023-02-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-36333-2
PMID:36774347
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研究论文 | 本研究结合先进成像技术和空间转录组学揭示了严重COVID-19中局部免疫反应的机制 | 提出了促进自我维持和非解决性局部免疫反应的免疫间质相互作用机制 | 关于这一慢性炎症疾病的细胞和分子机制仍不明朗 | 研究严重COVID-19的肺部免疫病理机制 | 严重COVID-19患者的肺部组织微环境 | 数字病理学 | COVID-19 | 空间转录组学 | NA | 成像数据 | NA |
| 182 | 2024-08-08 |
Repositioning Lomitapide to block ZDHHC5-dependant palmitoylation on SSTR5 leads to anti-proliferation effect in preclinical pancreatic cancer models
2023-Feb-11, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-023-01359-4
PMID:36774350
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研究论文 | 本研究通过比较胰腺癌组织和正常胰腺组织的单细胞转录组数据，发现ZDHHC5是抑制胰腺癌细胞增殖的潜在靶点，并重新定位孤儿药物Lomitapide作为ZDHHC5的抑制剂，以阻断SSTR5的棕榈酰化，从而抑制胰腺癌细胞的生长和增殖。 | 本研究首次证明了使用ZDHHC5的药理抑制剂Lomitapide在胰腺癌中的应用，代表了针对棕榈酰化的新一类靶向治疗。 | NA | 探索抑制胰腺癌细胞增殖的新治疗策略。 | 胰腺癌细胞和正常胰腺细胞。 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞转录组 | NA | 转录组数据 | 胰腺癌组织和正常胰腺组织 |
| 183 | 2024-08-08 |
Murine neonatal cardiac B cells promote cardiomyocyte proliferation and heart regeneration
2023-Feb-11, NPJ Regenerative medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41536-023-00282-7
PMID:36774363
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研究论文 | 本文研究了新生小鼠心脏B细胞在心肌细胞增殖和心脏再生中的作用 | 首次阐明了B细胞在心肌细胞增殖和心脏再生中的作用，并揭示了新生和成年小鼠心脏B细胞功能的差异 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探讨B细胞在心肌细胞增殖和心脏再生中的作用 | 新生和成年小鼠的心脏B细胞 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 新生和成年小鼠 |
| 184 | 2024-08-08 |
Single Cell Analysis of Human Thyroid Reveals the Transcriptional Signatures of Aging
2023-02-11, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/endocr/bqad029
PMID:36791033
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了来自7名患者的54,726个甲状腺细胞，揭示了与年龄相关的甲状腺转录组变化 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了人类甲状腺中与年龄相关的特定转录组变化 | 研究样本仅来自7名患者，可能限制了结果的普遍性 | 探究甲状腺上皮细胞中与年龄相关的内分泌功能变化 | 人类甲状腺细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 54,726个细胞，来自7名患者 |
| 185 | 2024-08-05 |
A novel cryopreservation and biobanking strategy to study lymphoid tissue stromal cells in human disease
2023-Feb-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.02.06.525604
PMID:36798373
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研究论文 | 本文展示了一种新颖的冷冻保存和生物样本库策略，用于研究人类疾病中的淋巴组织基质细胞 | 采用冷冻保存技术对淋巴组织进行存储，以便于研究非造血性淋巴结基质细胞 | 研究主要依赖于人类扁桃体和淋巴结样本，可能不完全代表其他淋巴组织 | 研究非造血性淋巴结基质细胞在各种人类疾病中的作用 | 人类扁桃体中的淋巴组织片段 | 数字病理学 | 自身免疫疾病，移植物抗宿主病，淋巴增生性疾病 | 冷冻保存 | NA | 组织样本 | 人类扁桃体样本 |
| 186 | 2024-08-08 |
The Poisson distribution model fits UMI-based single-cell RNA-sequencing data
2023-Feb-06, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2517698/v1
PMID:36798423
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研究论文 | 本文提出了一种基于独立泊松分布（IPD）的单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据建模方法，通过引入一种新的数据表示方法——从简单的同质IPD（DIPD）偏离，来捕捉由细胞簇产生的每个基因每个细胞的内在异质性 | 本文的创新点在于提出了一种新的数据表示方法DIPD，用于scRNA-seq数据，能够揭示传统方法难以发现或需要仔细参数调整才能发现的新的细胞亚型 | NA | 改进单细胞RNA测序数据的建模方法，以促进下游数据分析 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 泊松分布模型 | 基因表达数据 | NA |
| 187 | 2024-08-05 |
Identification and characterization of a proliferative cell population in estrogen receptor-positive metastatic breast cancer through spatial and single-cell transcriptomics
2023-Feb-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.31.526403
PMID:36778271
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和单细胞RNA测序技术识别并描述了雌激素受体阳性转移性乳腺癌中的增殖细胞群体 | 首次阐明了在ER + 转移性乳腺癌中独特分布的‘增殖’细胞群体，并揭示其对癌症进展的不同贡献 | 研究主要基于患者来源的异种移植模型，可能限制了结果的广泛适用性 | 探讨雌激素依赖性肿瘤生长中的细胞群体及其功能多样性 | 针对两种‘ER高’转移性乳腺癌的患者衍生异种移植模型进行研究 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学、单细胞RNA测序 | NA | 基因数据 | 两种患者来源的异种移植模型 |
| 188 | 2024-08-05 |
Nociceptor neuroimmune interactomes reveal cell type- and injury-specific inflammatory pain pathways
2023-Feb-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.02.01.526526
PMID:36778477
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研究论文 | 本文构建了一个全面的受体-配体数据库，并结合单细胞转录组学，以生成特定损伤的神经免疫相互作用组 | 揭示了免疫配体在外周敏感性调节中的新角色，提供了疾病特定的神经免疫通路 | 尽管建立了丰富的数据库，但可能仍未涵盖所有神经免疫通路的多样性 | 系统映射与炎性疼痛相关的神经免疫通路 | 三种不同炎性疼痛条件下的免疫细胞和感觉神经元 | 数字病理学 | 炎性疼痛 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 三种不同炎症疼痛条件下的免疫细胞和感觉神经元 |
| 189 | 2024-08-08 |
Dissecting the role of cancer-associated fibroblast-derived biglycan as a potential therapeutic target in immunotherapy resistance: A tumor bulk and single-cell transcriptomic study
2023-02, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1189
PMID:36772945
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研究论文 | 本研究通过结合单细胞和整体转录组数据，系统评估了癌症患者中成纤维细胞的概况，并探讨了biglycan（BGN）在免疫治疗反应中的表达、生存预测价值及其与免疫治疗反应的关联。 | 揭示了癌症相关成纤维细胞（CAFs）在肿瘤微环境中的重要作用，并发现BGN可能是免疫治疗抵抗的治疗靶点。 | NA | 旨在系统评估癌症患者中成纤维细胞的概况，并探讨biglycan（BGN）在免疫治疗反应中的作用。 | 癌症相关成纤维细胞（CAFs）及其分泌因子biglycan（BGN）在免疫治疗反应中的作用。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 包括来自泛癌队列的整体肿瘤样本和27个单细胞RNA测序队列，以及免疫治疗队列中的三个整体和五个单细胞测序数据集。 |
| 190 | 2024-08-08 |
Epitenon-derived cells comprise a distinct progenitor population that contributes to both tendon fibrosis and regeneration following acute injury
2023-Feb-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.30.526242
PMID:36778469
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研究论文 | 本文通过遗传谱系追踪和单细胞RNA测序技术，识别了来源于表膜的双命运前体细胞群，这些细胞在急性肌腱损伤后参与了肌腱周围的纤维化和再生修复过程。 | 首次识别了来源于表膜的双命运前体细胞群，并揭示了其在肌腱损伤后的纤维化和再生修复中的作用。 | NA | 旨在理解参与肌腱损伤后纤维化和再生修复的细胞群，以开发新的治疗策略。 | 来源于表膜的前体细胞群及其在肌腱损伤后的纤维化和再生修复中的作用。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 191 | 2024-08-08 |
Senescent cancer cell vaccines induce cytotoxic T cell responses targeting primary tumors and disseminated tumor cells
2023-02, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2022-005862
PMID:36792123
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研究论文 | 本文研究了衰老癌细胞疫苗诱导细胞毒性T细胞反应，针对原发性肿瘤和扩散的肿瘤细胞的效果 | 提出了一种基于衰老肿瘤细胞和/或衰老细胞激活的树突状细胞的治疗性疫苗，以改善基因毒性和免疫疗法，并限制复发或转移 | 文章未明确提及具体限制 | 研究衰老癌细胞疫苗在预防和治疗癌症中的作用 | 衰老癌细胞（SnCs）和树突状细胞（DCs） | NA | NA | scRNA-seq, 流式细胞术, T细胞增殖试验 | NA | 细胞 | 使用小鼠CT26结肠癌细胞和4T1乳腺癌细胞进行实验 |
| 192 | 2024-08-08 |
Atlas-scale single-cell chromatin accessibility using nanowell-based combinatorial indexing
2023-02, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.276655.122
PMID:36792372
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研究论文 | 本文介绍了基于纳米孔的组合索引技术在单细胞染色质可及性测定（sciATAC）中的进展，利用纳米孔芯片实现了低成本下的大规模细胞通量（超过10万个细胞）。 | 该技术通过在PCR索引阶段的5184个纳米孔芯片，实现了52倍的规模提升和每细胞制备成本的降低，同时保持了高覆盖率和低细胞双峰率。 | NA | 旨在开发一种低成本、高效率的单细胞染色质可及性测定技术，以实现大规模细胞通量。 | 研究对象包括小鼠脑组织中的细胞类型和神经亚型，以及与现有scATAC和scRNA-seq数据集的整合。 | 基因组学 | NA | 单细胞组合索引测定（sciATAC） | NA | 染色质可及性数据 | 超过70,000个独特的可及位点，平均每个细胞 |
| 193 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing identifies differentiation-related markers for molecular classification and recurrence prediction of PitNET
2023-02-21, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2023.100934
PMID:36754052
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序揭示了PitNET的发源及分化相关标记 | 识别了代表PitNET不同亚型的独特基因，并提出了一种新的分化分类以预测肿瘤复发 | 未提及本文的具体局限性 | 旨在改进PitNET的复发预测，通过理解细胞起源和分化状态 | 来自3个前垂体腺和21个PitNET的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 21个PitNET和3个前垂体腺样本，以及800名患者的独立队列 |
| 194 | 2024-08-05 |
Self-renewing macrophages in dorsal root ganglia contribute to promote nerve regeneration
2023-02-14, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2215906120
PMID:36763532
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研究论文 | 这篇文章探讨了背根神经节中的自我更新巨噬细胞在神经再生中的作用 | 本研究揭示了背根神经节巨噬细胞的异质性及其自我更新能力，并介绍了它们在轴突再生中的重要性 | 文章中未提及实验的具体限制或不足之处 | 研究背根神经节巨噬细胞在外周神经损伤后的行为及其对神经再生的贡献 | 背根神经节中的巨噬细胞和神经元 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA | 涉及多个带有神经损伤的小鼠样本 |
| 195 | 2024-08-05 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveal aberrant lymphoid developmental programs driving granuloma formation
2023-02-14, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2023.01.014
PMID:36750099
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研究论文 | 本研究揭示了异常的淋巴发育程序驱动肉芽肿形成 | 首次通过单细胞转录组学和空间转录组学揭示肉芽肿中与淋巴器官发育相关的转录程序的重塑 | 本研究主要集中在肉芽肿而非其他免疫细胞相关疾病，可能无法全面反映各种疾病的机制 | 旨在更好地理解肉芽肿形成及其与淋巴器官发展的关系 | 以患有肉芽肿病（如类肉瘤病）的患者样本为研究对象 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序和空间转录组学 | NA | NA | 来自多个患者的肉芽肿样本 |
| 196 | 2024-08-08 |
Single-cell profiling of alveolar rhabdomyosarcoma reveals RAS pathway inhibitors as cell-fate hijackers with therapeutic relevance
2023-02-10, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ade9238
PMID:36753540
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、质谱流式细胞术和高内涵成像技术，分析了来自患者的原代RMS细胞培养物的肿瘤内异质性，揭示了aRMS亚型的细胞层次结构和驱动肿瘤生长的机制 | 首次揭示了aRMS亚型中具有肌肉干细胞样特征的细胞和增殖祖细胞的存在，并发现了一组RAF和MEK抑制剂组合，能有效诱导肌源性分化并抑制肿瘤生长 | NA | 探究RMS的细胞层次结构和导致发育停滞的机制，并寻找新的治疗策略 | 儿童癌症中的横纹肌肉瘤（RMS）及其亚型aRMS | 数字病理学 | 横纹肌肉瘤 | 单细胞RNA测序、质谱流式细胞术、高内涵成像 | NA | 细胞 | 来自患者的原代RMS细胞培养物 |
| 197 | 2024-08-08 |
Publisher Correction: High-throughput and high-sensitivity full-length single-cell RNA-seq analysis on third-generation sequencing platform
2023-Feb-07, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-023-00522-6
PMID:36746930
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 198 | 2024-08-08 |
Dissecting the immune suppressive human prostate tumor microenvironment via integrated single-cell and spatial transcriptomic analyses
2023-02-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-36325-2
PMID:36750562
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研究论文 | 本文通过综合单细胞和空间转录组学分析，详细描述了局部前列腺癌的肿瘤微环境及其与邻近正常样本和健康对照的比较 | 本文首次综合单细胞RNA测序和高分辨率空间转录组学分析，揭示了肿瘤微环境中基因表达的肿瘤上下文依赖性变化，并推断了细胞间的相互关系 | NA | 研究局部前列腺癌的肿瘤微环境，并探讨其与免疫逃逸和肿瘤进展的关系 | 局部前列腺癌的肿瘤微环境及其与邻近正常组织和健康对照的比较 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组学分析 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 199 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome profiling of human HSCs during development: new insights into HSC ontogeny
2023-02-06, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-022-01301-7
PMID:36746910
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 200 | 2024-08-08 |
The Evolution of Single-Cell RNA Sequencing Technology and Application: Progress and Perspectives
2023-Feb-02, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24032943
PMID:36769267
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术（scRNA-Seq）的最新技术进展及其在生命科学和医学研究领域的应用 | scRNA-Seq技术实现了对单个细胞的高通量和多维分析，克服了传统测序技术在检测细胞群体平均转录水平方面的不足 | NA | 探讨scRNA-Seq技术在胚胎学、组织学、肿瘤学和免疫学等前沿研究领域的最新研究成果及其在中医药研究中的创新应用前景 | 单细胞RNA测序技术及其在生命科学和医学研究中的应用 | 基因组学 | NA | scRNA-Seq | NA | RNA | NA |