单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 307 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-03-20 |
Human ureteric bud organoids recapitulate branching morphogenesis and differentiate into functional collecting duct cell types
2023-02, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-022-01429-5
PMID:36038632
|
研究论文 | 本研究描述了从人类多能干细胞高效分化出输尿管芽类器官和功能性集合管细胞，模拟肾脏发育过程 | 首次实现人类多能干细胞在无血清条件下高效分化为输尿管芽类器官，并展示其分支形态发生和功能性集合管细胞分化 | NA | 肾脏再生医学，旨在通过干细胞分化模拟肾脏发育和功能 | 人类多能干细胞、输尿管芽类器官、集合管细胞 | 再生医学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | 类器官模型 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2 | 2026-03-15 |
Single-cell RNA-sequencing identifies disease-associated oligodendrocytes in male APP NL-G-F and 5XFAD mice
2023-02-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-36519-8
PMID:36781874
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，在阿尔茨海默病小鼠模型及人类死后大脑中鉴定出一种疾病相关的少突胶质细胞亚群，并探讨了其通过Erk1/2信号通路在疾病进展中的作用 | 首次在阿尔茨海默病背景下鉴定出疾病相关的少突胶质细胞亚群，并揭示了Erk1/2信号通路在该细胞亚群激活及疾病病理中的关键作用 | 研究主要基于雄性小鼠模型，可能无法完全反映雌性个体或人类群体的全部情况，且人类样本来源于死后大脑，可能存在保存偏差 | 探究少突胶质细胞在阿尔茨海默病发病机制中的作用 | 雄性APP NL-G-F和5XFAD阿尔茨海默病小鼠模型的大脑组织，以及人类死后阿尔茨海默病患者的大脑组织 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 雄性APP NL-G-F和5XFAD小鼠大脑及人类死后AD大脑样本（具体数量未在摘要中明确） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3 | 2026-03-14 |
A neuroepithelial wave of BMP signalling drives anteroposterior specification of the tuberal hypothalamus
2023-02-10, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.83133
PMID:36718990
|
研究论文 | 本研究结合实验与生物信息学方法，揭示了胚胎期结节下丘脑的渐进式生成机制，发现其由下丘脑底板样细胞产生，并受神经上皮来源的BMP信号波调控 | 首次揭示结节下丘脑由下丘脑底板样细胞渐进生成，并发现从前向后扫过的神经上皮BMP信号波驱动其前后轴特化 | 研究主要在鸡胚胎中进行，哺乳动物系统的保守性需进一步验证；信号通路的上下游调控网络尚未完全解析 | 探究中枢神经系统结节下丘脑区域在胚胎发育过程中的细胞来源与信号通路特化机制 | 鸡胚胎的结节下丘脑发育过程 | 发育生物学 | NA | 命运图谱研究、功能获得与缺失实验、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4 | 2026-03-13 |
[Research progress of single-cell sequencing technology in liver diseases]
2023-Feb-20, Zhonghua gan zang bing za zhi = Zhonghua ganzangbing zazhi = Chinese journal of hepatology
|
综述 | 本文综述了单细胞测序技术在肝脏疾病研究中的进展 | 总结了单细胞测序作为一种新兴测序方法在揭示肝脏疾病复杂机制方面的应用潜力 | NA | 综述单细胞测序技术在肝脏疾病研究中的应用进展 | 肝脏疾病 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | 单细胞测序 | NA | 基因组、转录组、表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 5 | 2026-03-10 |
Dissecting the immune suppressive human prostate tumor microenvironment via integrated single-cell and spatial transcriptomic analyses
2023-02-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-36325-2
PMID:36750562
|
研究论文 | 通过整合单细胞和空间转录组分析，深入解析了人类前列腺肿瘤微环境的免疫抑制特性 | 首次结合单细胞RNA测序和高分辨率空间转录组技术，全面描述局部前列腺癌的肿瘤微环境，并推断未解离组织切片中的细胞间相互作用 | 未明确提及研究样本量限制或技术验证的不足 | 理解前列腺癌免疫逃逸和肿瘤进展的驱动因素，以改善临床治疗策略 | 局部前列腺癌患者样本、邻近正常组织和健康对照 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组分析 | NA | RNA测序数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 6 | 2026-03-05 |
Central lung gene expression associates with myofibroblast features in idiopathic pulmonary fibrosis
2023-02, BMJ open respiratory research
IF:3.6Q1
DOI:10.1136/bmjresp-2022-001391
PMID:36725082
|
研究论文 | 本研究通过RNA测序分析特发性肺纤维化（IPF）中央与周边肺组织的基因表达差异，揭示了中央肺区肌成纤维细胞特征与疾病进展的关联 | 首次系统比较IPF中央与周边肺组织的转录组差异，并识别出85个中央IPF相关基因（CAG），这些基因在肌成纤维细胞中高度表达且与疾病信号通路相关 | 研究样本量有限，且依赖于计算细胞去卷积方法而非直接单细胞实验验证 | 探究中央肺组织在特发性肺纤维化发病机制中的作用 | 特发性肺纤维化患者的中央与周边肺组织活检样本，以及非IPF肺组织对照 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | RNA测序（RNA-seq），单细胞RNA测序分析 | 计算细胞去卷积分析，网络分析 | 基因表达数据，组织活检数据 | 未明确具体样本数量，但包括配对IPF中央与周边肺组织及非IPF对照 | NA | RNA-seq，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7 | 2026-03-04 |
Atlas-scale single-cell chromatin accessibility using nanowell-based combinatorial indexing
2023-02, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.276655.122
PMID:36792372
|
研究论文 | 本文介绍了基于纳米孔芯片的单细胞组合索引染色质可及性测定技术的进展，实现了大规模细胞通量（>10^5个细胞）的低成本测量 | 利用5184纳米孔芯片在PCR索引阶段实现规模提升52倍并降低单细胞制备成本，优化工作流程获得高比例峰值内读数（>80%）和低细胞双联率 | NA | 开发低成本、高通量的单细胞染色质可及性测定技术 | 小鼠脑组织样本 | 表观遗传学 | NA | 单细胞组合索引ATAC-seq | NA | 染色质可及性数据 | >10^5个细胞 | NA | 单细胞ATAC-seq | NA | 基于纳米孔芯片的sciATAC平台 |
| 8 | 2026-03-02 |
Tumor Niche Network-Defined Subtypes Predict Immunotherapy Response of Esophageal Squamous Cell Cancer
2023-Feb-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.02.15.528539
PMID:36824935
|
研究论文 | 本研究通过整合分析食管鳞状细胞癌（ESCC）患者肿瘤微环境的单细胞转录组数据，定义了基于T细胞耗竭、IFN a/b信号通路、TIGIT富集等特征的ESCC亚型，并预测了免疫检查点阻断（ICB）治疗的反应 | 利用单细胞转录组学数据，基于肿瘤微环境中T细胞、髓系细胞和成纤维细胞的细胞网络转录特征，首次定义了ESCC的亚型，并成功预测了ICB治疗反应，为精准免疫治疗提供了新策略 | 研究样本量相对较小（69例患者），且主要依赖转录组数据，缺乏蛋白质组或功能验证数据，可能限制了亚型定义的全面性和临床应用的普适性 | 旨在通过肿瘤微环境单细胞转录组分析，对ESCC进行亚型分类，并预测患者对免疫检查点阻断治疗的反应，以优化治疗选择 | 69例人类食管鳞状细胞癌（ESCC）患者的肿瘤微环境单细胞转录组数据集 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 69例ESCC患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2026-01-08 |
Single-cell profiling of alveolar rhabdomyosarcoma reveals RAS pathway inhibitors as cell-fate hijackers with therapeutic relevance
2023-02-10, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ade9238
PMID:36753540
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序等技术解析肺泡型横纹肌肉瘤的肿瘤内异质性，揭示了其细胞层级结构，并发现RAF和MEK抑制剂组合可诱导肿瘤细胞向分化状态转变，从而抑制肿瘤生长 | 首次在肺泡型横纹肌肉瘤中系统解析了包含肌肉干细胞样细胞、循环祖细胞和分化细胞的细胞层级结构，并创新性地通过药物筛选发现RAS通路抑制剂可作为“细胞命运劫持者”诱导肿瘤分化 | 研究主要基于患者来源的原代培养细胞，尚未在体内模型或大规模临床样本中全面验证 | 解析肺泡型横纹肌肉瘤的肿瘤内异质性、细胞发育状态与临床结局的关系，并寻找新的治疗策略 | 肺泡型横纹肌肉瘤患者来源的原代培养细胞 | 数字病理学 | 横纹肌肉瘤 | 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术, 高内涵成像 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据, 图像数据 | 患者来源的原代培养细胞（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10 | 2025-11-27 |
Meta-Analysis of Human Cancer Single-Cell RNA-Seq Datasets Using the IMMUcan Database
2023-02-03, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-0074
PMID:36459564
|
研究论文 | 本文介绍了IMMUcan scDB数据库的开发与应用，这是一个专门用于人类癌症单细胞RNA测序数据的集成数据库 | 开发了首个专门针对人类癌症的单细胞RNA测序数据库，包含144个数据集和56种癌症类型，提供详细的临床、技术和生物学注释 | 数据库主要基于已发表研究，可能受原始数据质量和研究异质性的限制 | 通过整合和分析多个人类癌症单细胞RNA测序数据集，促进肿瘤微环境的研究 | 人类癌症单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 细胞本体分类器 | 单细胞RNA测序数据 | 144个数据集，涵盖56种不同癌症类型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11 | 2025-10-05 |
Treatment of HCC with claudin-1-specific antibodies suppresses carcinogenic signaling and reprograms the tumor microenvironment
2023-02, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2022.10.011
PMID:36309131
|
研究论文 | 本研究通过靶向非连接性Claudin-1的单克隆抗体治疗肝细胞癌，揭示了其抑制肿瘤生长和重塑肿瘤微环境的作用机制 | 首次探索非连接性Claudin-1作为肝细胞癌治疗靶点的潜力，并开发特异性靶向该蛋白的人源化单克隆抗体 | 目前仍处于临床前研究阶段，尚未进行人体临床试验 | 研究Claudin-1作为肝细胞癌治疗靶点的可行性和作用机制 | 肝细胞癌患者来源的细胞模型和动物模型 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 大量患者来源的细胞系异种移植模型和患者来源的异种移植小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12 | 2025-10-06 |
Probing regenerative heterogeneity of corticospinal neurons with scRNA-Seq
2023-Feb-21, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2588274/v1
PMID:36865182
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探究皮质脊髓神经元在脊髓损伤后再生能力的异质性 | 首次使用基于贴片的scRNA-Seq对稀有再生神经元进行深度测序，发现抗氧化反应和线粒体生物合成在再生中的关键作用，并开发了再生分类器 | 仅对数百个表型鉴定的CST神经元进行测序，样本规模有限 | 探究皮质脊髓神经元再生能力的异质性机制 | 皮质脊髓神经元 | 单细胞基因组学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序，生物信息学分析，条件性基因敲除 | 监督分类方法(Garnett) | 单细胞转录组数据 | 数百个表型鉴定的CST神经元 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基于贴片的单细胞RNA测序 |
| 13 | 2025-10-06 |
CPA-Perturb-seq: Multiplexed single-cell characterization of alternative polyadenylation regulators
2023-Feb-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.02.09.527751
PMID:36798324
|
研究论文 | 开发了CPA-Perturb-seq方法，通过多重单细胞扰动筛选研究多聚腺苷酸化调控机制 | 首次将多重扰动筛选与3'单细胞RNA测序结合，开发了APARENT-Perturb深度学习模型解析调控代码 | 仅研究了42个已知CPA调控因子，可能遗漏其他重要调控因子 | 理解多聚腺苷酸化调控蛋白如何控制polyA位点选择 | 哺乳动物基因的多聚腺苷酸化调控机制 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序，深度学习 | 多任务深度神经网络 | 单细胞转录组数据 | 42个CPA调控因子的多重扰动筛选 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 3' scRNA-seq |
| 14 | 2025-10-06 |
Losartan controls immune checkpoint blocker-induced edema and improves survival in glioblastoma mouse models
2023-02-07, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2219199120
PMID:36724255
|
研究论文 | 本研究发现在胶质母细胞瘤中免疫检查点抑制剂会诱发脑水肿，而血管紧张素受体阻滞剂氯沙坦可预防此类水肿并改善生存率 | 首次揭示免疫检查点抑制剂引起脑水肿的机制，并发现氯沙坦可作为替代皮质类固醇的有效治疗药物 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化效果需进一步验证 | 探索免疫检查点抑制剂治疗胶质母细胞瘤失败的原因及解决方案 | 胶质母细胞瘤小鼠模型及部分患者 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,活体成像,CD8 T细胞阻断研究 | NA | 基因表达数据,影像数据 | 小鼠模型（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 15 | 2025-10-06 |
Neonatal hyperoxia induces activated pulmonary cellular states and sex-dependent transcriptomic changes in a model of experimental bronchopulmonary dysplasia
2023-02-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00252.2022
PMID:36537711
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探究高氧暴露对新生小鼠肺发育的影响及其性别依赖性分子机制 | 首次发现高氧诱导产生损伤相关短暂祖细胞(DATPs)和新型AT1细胞亚群，并揭示性别特异性肺再生反应差异 | 动物模型研究结果需在人类临床样本中进一步验证 | 探究高氧暴露在支气管肺发育不良中的性别依赖性分子和细胞编程机制 | 新生小鼠肺组织及人类新生儿肺细胞 | 单细胞组学 | 支气管肺发育不良 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 16 | 2025-10-06 |
A cellular taxonomy of the adult human spinal cord
2023-02-01, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2023.01.007
PMID:36731429
|
研究论文 | 通过单核RNA测序和空间转录组学技术构建了成人人类脊髓的细胞分类系统 | 首次系统性地建立了成人人类脊髓的细胞分类图谱，揭示了运动神经元的特异性分子特征 | 研究主要基于单核RNA测序数据，可能无法完全反映细胞在生理状态下的完整功能特性 | 构建人类脊髓细胞分类系统并探索其在人类疾病中的意义 | 成人人类脊髓组织 | 单细胞生物学 | 肌萎缩侧索硬化症 | 单核RNA测序, 空间转录组学, 抗体验证 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 17 | 2025-10-06 |
Zinc Supplementation Induced Transcriptional Changes in Primary Human Retinal Pigment Epithelium: A Single-Cell RNA Sequencing Study to Understand Age-Related Macular Degeneration
2023-02-28, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12050773
PMID:36899910
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析锌补充对人类原代视网膜色素上皮细胞转录组的影响，探索其对年龄相关性黄斑变性的保护机制 | 首次在单细胞水平揭示锌补充通过调控ID1/ID3转录调节影响RPE细胞分化动态的分子机制 | 研究基于体外细胞培养模型，可能与体内实际情况存在差异；细胞培养时间较长（19周）可能引入额外变量 | 阐明锌补充延缓年龄相关性黄斑变性进展的分子机制 | 人类原代视网膜色素上皮细胞 | 单细胞转录组学 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类分析，伪时间排序 | 单细胞转录组数据 | 在培养2、9、19周时分离的细胞，使用125 µM锌处理一周 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 18 | 2025-10-06 |
A program of successive gene expression in mouse one-cell embryos
2023-02-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112023
PMID:36729835
|
研究论文 | 本研究通过高分辨率单细胞RNA测序揭示了小鼠单细胞胚胎中胚胎基因组激活的早期基因表达程序 | 首次在脊椎动物中精确描述了受精后4小时内启动的即时胚胎基因组激活程序，并发现其受癌症相关转录因子调控 | 研究仅限于小鼠模型，在其他哺乳动物中的适用性需要进一步验证 | 阐明哺乳动物胚胎发育起始阶段的转录调控机制 | 小鼠单细胞胚胎 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 精确同步化的小鼠单细胞胚胎 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 高分辨率单细胞RNA测序 |
| 19 | 2025-10-06 |
Single cell transcriptomics identifies adipose tissue CD271+ progenitors for enhanced angiogenesis in limb ischemia
2023-Feb-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.02.09.527726
PMID:36865239
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析鉴定出脂肪组织CD271+祖细胞在肢体缺血中具有增强血管生成的能力 | 首次通过单细胞转录组技术从人类皮下脂肪组织中鉴定出CD271+祖细胞，并证明其具有优于传统脂肪基质细胞的血管生成能力 | 研究使用了异种移植模型，且发现胰岛素抵抗供体的CD271+祖细胞数量和功能显著降低 | 寻找治疗严重肢体缺血的更有效细胞疗法 | 人类皮下脂肪组织中的CD271+祖细胞 | 单细胞生物学 | 肢体缺血 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 20 | 2025-10-06 |
Genomic and microenvironmental heterogeneity shaping epithelial-to-mesenchymal trajectories in cancer
2023-02-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-36439-7
PMID:36774358
|
研究论文 | 提出一种基于转录组信号评估癌症上皮-间质转化轨迹的方法，并在7180个上皮来源肿瘤中识别出三种具有预后和治疗价值的宏观状态 | 开发了稳健评估单个肿瘤EMT转化的方法，首次系统识别出三种EMT宏观状态并揭示杂交状态的稳定性与非整倍性关联 | EMT中间状态的分子特征仍需进一步验证，空间异质性分析可能受限于样本数量 | 探索癌症上皮-间质转化轨迹的分子特征和微环境影响 | 7180个上皮来源肿瘤样本 | 癌症基因组学 | 癌症 | 转录组测序, 空间转录组学, 单细胞测序 | 轨迹分析模型 | 转录组数据, 空间转录组数据, 单细胞数据 | 7180个肿瘤样本 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |