单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 307 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-07-24 |
Probing regenerative heterogeneity of corticospinal neurons with scRNA-Seq
2023-Feb-21, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2588274/v1
PMID:36865182
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术探究皮质脊髓神经元再生异质性 | 利用scRNA-Seq技术深入分析罕见再生神经元，发现抗氧化反应和线粒体生物合成在皮质脊髓神经元再生中的重要性，并开发了一种再生分类器（RC） | 研究仅涉及数百个表型鉴定的皮质脊髓神经元，样本量较小 | 探究皮质脊髓神经元再生异质性的分子机制 | 皮质脊髓神经元 | 神经科学 | 脊髓损伤 | scRNA-Seq | Garnett（监督分类方法） | 单细胞RNA测序数据 | 数百个表型鉴定的皮质脊髓神经元 |
| 2 | 2025-07-22 |
CPA-Perturb-seq: Multiplexed single-cell characterization of alternative polyadenylation regulators
2023-Feb-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.02.09.527751
PMID:36798324
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research paper | 介绍了一种名为CPA-Perturb-seq的多重扰动筛选数据集，用于研究42种已知的CPA调控因子如何影响多聚腺苷酸化位点的选择 | 开发了CPA-Perturb-seq数据集和APARENT-Perturb多任务深度神经网络，用于预测扰动响应性并揭示不同调控复合物之间的相互作用 | NA | 理解蛋白质如何调控多聚腺苷酸化位点的选择 | 42种已知的CPA调控因子 | 生物信息学 | NA | 3' scRNA-seq | multi-task deep neural network (APARENT-Perturb) | scRNA-seq数据 | NA |
| 3 | 2025-07-22 |
Losartan controls immune checkpoint blocker-induced edema and improves survival in glioblastoma mouse models
2023-02-07, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2219199120
PMID:36724255
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研究论文 | 研究发现免疫检查点抑制剂(ICBs)在胶质母细胞瘤患者和小鼠模型中引发脑水肿，并证明血管紧张素受体阻滞剂洛沙坦能预防这种水肿并改善治疗效果 | 首次揭示ICBs引发脑水肿的机制，并发现洛沙坦能预防水肿并重编程肿瘤微环境，提高生存率 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化效果需进一步验证 | 探索ICBs在胶质母细胞瘤治疗中的副作用机制及解决方案 | 胶质母细胞瘤小鼠模型及部分患者 | 肿瘤免疫治疗 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、活体成像、CD8 T细胞阻断研究 | 小鼠肿瘤模型 | 基因表达数据、影像数据 | 未明确说明具体样本量，涉及小鼠模型和部分患者数据 |
| 4 | 2025-07-22 |
Neonatal hyperoxia induces activated pulmonary cellular states and sex-dependent transcriptomic changes in a model of experimental bronchopulmonary dysplasia
2023-02-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00252.2022
PMID:36537711
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探究了高氧环境对新生小鼠肺部发育的影响及其性别依赖性分子和细胞编程 | 发现了高氧诱导的肺泡上皮细胞新型亚群及性别依赖的转录组变化，揭示了高氧对肺部细胞状态的调控机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据仅通过体外实验验证 | 探究高氧环境对新生儿支气管肺发育不良(BPD)的分子机制影响 | 新生小鼠肺部细胞和人类新生儿肺细胞 | 单细胞转录组学 | 支气管肺发育不良 | scRNA-seq(单细胞RNA测序) | NA | 基因表达数据 | 未明确说明样本数量(小鼠和人类细胞) |
| 5 | 2025-07-20 |
A cellular taxonomy of the adult human spinal cord
2023-02-01, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2023.01.007
PMID:36731429
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研究论文 | 该研究通过单核RNA测序和空间转录组学技术，构建了成人人类脊髓的细胞分类学 | 首次对人类脊髓细胞进行系统分类，并揭示了运动神经元在肌萎缩侧索硬化症（ALS）中的分子特征 | 研究样本量有限，可能无法完全代表人类脊髓细胞的多样性 | 揭示人类脊髓细胞的多样性和功能特征，特别是与疾病相关的分子机制 | 成人人类脊髓细胞 | 单细胞测序 | 肌萎缩侧索硬化症（ALS） | 单核RNA测序、空间转录组学 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 6 | 2025-07-20 |
Treatment of HCC with claudin-1-specific antibodies suppresses carcinogenic signaling and reprograms the tumor microenvironment
2023-02, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2022.10.011
PMID:36309131
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研究论文 | 本研究探讨了非连接性Claudin-1（CLDN1）作为肝细胞癌（HCC）治疗靶点的潜力，并开发了特异性单克隆抗体以抑制肿瘤生长和重塑肿瘤微环境 | 首次将非连接性CLDN1作为HCC的治疗靶点进行研究，并开发了特异性单克隆抗体，展示了其在抑制肿瘤生长和重塑肿瘤微环境方面的潜力 | 研究主要基于体外和动物模型，尚未进行临床试验验证 | 探索CLDN1作为HCC治疗靶点的潜力，并开发相关治疗方法 | 肝细胞癌（HCC）患者来源的细胞系、3D体外模型和异种移植小鼠模型 | 肿瘤学 | 肝细胞癌 | 单克隆抗体技术、单细胞RNA测序 | 患者来源的异种移植（PDX）模型 | 基因表达数据、肿瘤生长数据 | 大量患者来源的细胞系和动物模型 |
| 7 | 2025-05-11 |
The pluripotency factor Tex10 finetunes Wnt signaling for PGC and male germline development
2023-Feb-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.02.23.529824
PMID:36865339
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研究论文 | 本文探讨了Tex10在原始生殖细胞（PGC）规范和精子发生中的晚期发育作用，揭示了其通过调节Wnt信号通路在这些过程中的关键作用 | 首次发现Tex10通过结合Wnt负调控基因来精细调节Wnt信号通路，从而影响PGC规范和精子发生 | 研究主要基于细胞和动物模型，尚未在人类系统中验证 | 研究Tex10在PGC规范和精子发生中的作用机制 | 原始生殖细胞（PGC）和雄性生殖细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 条件性敲除小鼠模型 | 基因表达数据 | NA |
| 8 | 2025-05-09 |
Single-cell analysis identifies Ifi27l2a as a novel gene regulator of microglial inflammation in the context of aging and stroke
2023-Feb-15, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2557290/v1
PMID:36824976
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序技术，识别出Ifi27l2a作为调控小胶质细胞炎症反应的新基因，特别是在衰老和中风背景下 | 首次发现Ifi27l2a基因在小胶质细胞炎症反应中的调控作用，并证实其在中风后神经炎症中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型和体外培养的小胶质细胞，人类样本验证有限 | 探索调控小胶质细胞功能的基因，以寻找针对中风等炎症性疾病的治疗新靶点 | 衰老小鼠脑组织、中风模型、体外培养的小胶质细胞及人类尸检样本 | 神经科学 | 中风 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 9 | 2025-03-27 |
Type I interferon signaling facilitates resolution of acute liver injury by priming macrophage polarization
2023-02, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-022-00966-y
PMID:36596875
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研究论文 | 该研究揭示了I型干扰素信号在急性肝损伤恢复过程中通过调控巨噬细胞极化促进肝脏修复的机制 | 首次在单细胞水平解析了APAP诱导的急性肝损伤中肝脏髓系细胞的异质性，并发现IFN-I依赖的三方通讯通路在促进Trem2+修复性巨噬细胞成熟中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需要进一步验证 | 阐明对乙酰氨基酚过量诱导的急性肝损伤(APAP-ALI)中髓系细胞的异质性和细胞间通讯机制 | 野生型和STAT2 T403A突变小鼠的肝脏CD11b+细胞 | 肝脏病理学 | 急性肝损伤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、免疫荧光染色、bulk RNA-seq、体外和体内功能实验 | 小鼠疾病模型 | 单细胞转录组数据、免疫组化数据、功能实验数据 | 未明确说明样本数量，使用WT和STAT2 T403A两种基因型小鼠 |
| 10 | 2025-03-01 |
Network analysis of large-scale ImmGen and Tabula Muris datasets highlights metabolic diversity of tissue mononuclear phagocytes
2023-02-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112046
PMID:36708514
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研究论文 | 本文通过代谢网络分析，研究了单核吞噬细胞（MNP）在不同组织中的代谢多样性，并开发了一种基于网络的基因和代谢物（GAM）聚类方法 | 引入了三个大规模转录数据集，并开发了一种新的网络计算方法GAM聚类，用于无偏识别关键代谢子网络 | 研究主要基于小鼠模型，可能无法完全反映人类MNP的代谢多样性 | 理解单核吞噬细胞在不同组织中的代谢多样性 | 单核吞噬细胞（MNP） | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | GAM聚类 | 转录数据 | 337个样本（ImmGen MNP数据集），202个样本（ImmGen Phase I数据集），51,364个细胞（Tabula Muris Senis数据集） |
| 11 | 2025-02-13 |
Screening cell-cell communication in spatial transcriptomics via collective optimal transport
2023-02, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-022-01728-4
PMID:36690742
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研究论文 | 本文介绍了一种名为COMMOT的新方法，用于在空间转录组学中推断细胞间通讯（CCC），考虑了配体和受体之间的竞争以及细胞间的空间距离 | 开发了一种集体最优传输方法，以处理复杂的分子相互作用和空间约束，并引入了下游分析工具来推断空间信号方向性和受信号调控的基因 | NA | 研究空间转录组学中的细胞间通讯（CCC） | 空间转录组数据和单细胞RNA测序数据集 | 生物信息学 | NA | 空间转录组技术 | 机器学习模型 | 空间转录组数据 | 八个空间数据集，使用五种不同技术获取 |
| 12 | 2025-02-06 |
Targeting Epsins to Inhibit Fibroblast Growth Factor Signaling While Potentiating Transforming Growth Factor-β Signaling Constrains Endothelial-to-Mesenchymal Transition in Atherosclerosis
2023-02-21, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究探讨了epsin内吞适配蛋白在动脉粥样硬化中促进内皮-间质转化（EndoMT）的分子机制，并评估了一种治疗性肽在动脉粥样硬化临床前模型中的疗效 | 揭示了epsin通过增加转化生长因子-β信号传导促进动脉粥样硬化中的EndoMT，并提出了一种通过减少epsin-成纤维细胞生长因子受体-1相互作用来抑制EndoMT的新型治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证 | 探讨epsin在动脉粥样硬化中促进EndoMT的分子机制，并评估治疗性肽的疗效 | Apoe-/-小鼠模型和动脉粥样硬化小鼠模型 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、分子、细胞和生化分析 | NA | RNA测序数据、分子和细胞数据 | Apoe-/-小鼠模型和动脉粥样硬化小鼠模型 |
| 13 | 2025-01-30 |
Generation of blastoids from human parthenogenetic stem cells
2023-Feb, Life medicine
DOI:10.1093/lifemedi/lnad006
PMID:39872951
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研究论文 | 本文通过两步诱导协议从人类孤雌生殖干细胞生成孤雌生殖胚泡，以研究基因组印记在胚胎发育中的作用 | 首次从孤雌生殖干细胞生成孤雌生殖胚泡，为研究基因组印记提供了新模型 | 由于发育缺陷和伦理限制，对孤雌生殖胚胎发育的全面理解仍不足 | 研究基因组印记在胚胎发育中的作用及父母起源偏差对人类发育和病理机制的影响 | 孤雌生殖干细胞（hPg-ESCs）及其衍生的扩展多能干细胞（hPg-EPSCs） | 生物医学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 14 | 2024-12-15 |
Tumor Niche Network-Defined Subtypes Predict Immunotherapy Response of Esophageal Squamous Cell Cancer
2023-Feb-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.02.15.528539
PMID:36824935
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研究论文 | 本研究通过整合69名食管鳞状细胞癌患者的肿瘤微环境单细胞转录组数据，定义了不同的ESCC亚型，并预测了免疫治疗反应 | 提出了基于肿瘤微环境转录网络的ESCC亚型分类方法，并验证了其对免疫治疗反应的预测能力 | NA | 研究食管鳞状细胞癌的肿瘤微环境特征，并预测免疫检查点阻断疗法的反应 | 食管鳞状细胞癌患者的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞转录组 | NA | 转录组数据 | 69名食管鳞状细胞癌患者 |
| 15 | 2024-12-08 |
Chrna5 and lynx prototoxins identify acetylcholine super-responder subplate neurons
2023-Feb-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.105992
PMID:36798433
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研究论文 | 研究通过复杂转基因小鼠模型探索Chrna5+神经元及其对内源性乙酰胆碱的敏感性，发现Chrna5+神经元中存在乙酰胆碱超反应者亚群，并利用单细胞转录组学揭示了其分子标记 | 首次发现Chrna5+神经元中的乙酰胆碱超反应者亚群，并确定了其独特的GPI锚定lynx原毒素基因表达模式 | NA | 探索Chrna5+神经元及其对内源性乙酰胆碱的敏感性，揭示其在注意力障碍中的潜在作用 | Chrna5+神经元及其对乙酰胆碱的反应 | 神经科学 | 注意力障碍 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 复杂转基因小鼠模型 |
| 16 | 2024-10-16 |
Bacterial droplet-based single-cell RNA-seq reveals antibiotic-associated heterogeneous cellular states
2023-02-16, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2023.01.002
PMID:36708705
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研究论文 | 介绍了一种名为BacDrop的高可扩展性细菌单细胞RNA测序技术，用于研究抗生素压力下的细胞异质性 | BacDrop技术克服了细菌单细胞RNA测序的许多挑战，能够处理数千到数百万个细胞，并揭示了抗生素压力下的细胞异质性 | NA | 研究细菌在抗生素压力下的细胞异质性 | 肺炎克雷伯菌临床分离株及其对抗生素压力的异质性反应 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 数千到数百万个细菌细胞 |
| 17 | 2024-10-06 |
SARS-CoV-2 cellular tropism and direct multiorgan failure in COVID-19 patients: Bioinformatic predictions, experimental observations, and open questions
2023-Feb, Cell biology international
IF:3.3Q3
DOI:10.1002/cbin.11928
PMID:36229927
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综述 | 本文综述了SARS-CoV-2病毒的细胞趋向性及其在COVID-19患者中引发多器官衰竭的可能机制 | 首次广泛使用单细胞RNA测序（scRNA-seq）基因表达数据集来预测SARS-CoV-2的细胞趋向性 | 并非所有预测的易感细胞在COVID-19患者中都会被感染 | 探讨SARS-CoV-2病毒的传播途径及其在COVID-19患者中引发多器官衰竭的原因 | SARS-CoV-2病毒的细胞趋向性及其与早期感染和多器官衰竭的关联 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 18 | 2024-10-06 |
Human antibody BD-218 has broad neutralizing activity against concerning variants of SARS-CoV-2
2023-Feb-01, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2022.12.120
PMID:36528147
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研究论文 | 本文报道了一种名为BD-218的人类抗体，具有广泛的SARS-CoV-2变种中和活性 | BD-218抗体能够与SARS-CoV-2刺突蛋白的受体结合域上的新表位结合，显示出对多种变种（包括beta、delta和omicron变种）的广泛中和活性 | NA | 研究SARS-CoV-2变种的中和抗体，以提高现有抗COVID疗法的有效性 | BD-218抗体及其对SARS-CoV-2变种的中和活性 | NA | NA | 单细胞测序、生物化学方法、伪型病毒中和实验、冷冻电镜结构分析 | NA | 结构数据 | 从早期康复患者中筛选出的抗体 |
| 19 | 2024-10-02 |
Integrative single-cell RNA-seq and ATAC-seq analysis of myogenic differentiation in pig
2023-02-01, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-023-01519-z
PMID:36726129
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和ATAC测序分析了猪骨骼肌分化的分子和细胞动态 | 首次在猪胚胎发育过程中对骨骼肌分化进行了单细胞分辨率的基因表达和染色质可及性分析 | 研究仅限于猪胚胎发育阶段，未涵盖成年猪或人类 | 深入理解猪胚胎骨骼肌分化的分子和细胞动态 | 猪胚胎的骨骼肌分化过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和ATAC测序 | NA | 基因表达数据和染色质可及性数据 | 猪胚胎的骨骼肌细胞 |
| 20 | 2024-10-02 |
A Zinc- and Calcium-Rich Lysosomal Nanoreactor Rescues Monocyte/Macrophage Dysfunction under Sepsis
2023-02, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202205097
PMID:36596693
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研究论文 | 本文研究了一种富含锌和钙的溶酶体纳米反应器在脓毒症中恢复单核细胞/巨噬细胞功能的作用 | 开发了一种名为Alpha-MOFs的纳米颗粒，通过释放溶酶体敏感的离子来提升单核细胞/巨噬细胞的吞噬能力 | NA | 研究脓毒症中单核细胞/巨噬细胞功能失调的机制，并开发新的治疗方法 | 脓毒症中的单核细胞/巨噬细胞及其吞噬功能 | NA | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 外周血单核细胞 |