单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5352 篇文献，本页显示第 1961 - 1980 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1961 | 2024-08-05 |
Decoding mTOR signalling heterogeneity in the tumour microenvironment using multiplexed imaging and graph convolutional networks
2023-Dec-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.30.573693
PMID:38234756
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研究论文 | 这篇文章探讨了肿瘤微环境中mTOR信号的异质性及其对患者预后的影响 | 使用高度多重化的数据集和图卷积网络揭示了mTOR信号在肿瘤和免疫区室中的异质激活模式 | 本文未提及任何限制 | 研究肿瘤微环境中mTOR信号对结直肠肿瘤患者预后的影响 | 746个结直肠肿瘤样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 多重成像 | 图神经网络 | 标记数据 | 746个肿瘤样本 |
| 1962 | 2024-08-05 |
Personalized Immunotherapy of Patients: Defining by Single-cell RNA-seq with Artificial Intelligence
2023-Aug, Medical research archives
DOI:10.18103/mra.v11i8.4293
PMID:37736242
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研究论文 | 这篇文章探讨了使用单细胞RNA测序和人工智能来个性化患者的免疫疗法 | 结合机器学习模型的单细胞RNA测序数据，用于评估个体患者的最佳免疫疗法和药物组合 | 研究中可能缺乏与其他疗法直接比较的长期临床数据 | 旨在提高临床免疫疗法的有效性，降低不良反应和临床应用成本 | 研究了肿瘤浸润淋巴细胞的基因组学，包括详述的单细胞RNA-seq数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 基因组数据 | 包括多种免疫细胞治疗相关的数据和临床试验数据 |
| 1963 | 2024-08-05 |
Spatial Omics Driven Crossmodal Pretraining Applied to Graph-based Deep Learning for Cancer Pathology Analysis
2023-Jul-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.30.551187
PMID:37577686
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研究论文 | 本文探讨了空间组学数据与图基深度学习在癌症病理分析中的结合 | 提出了一种对比性交叉模态预训练机制，利用空间转录组学数据来生成深度学习模型 | 未提及具体的样本数量和数据来源限制 | 旨在改善图基深度学习模型在病理切片分析中的表现 | 利用空间转录组学数据与组织学成像数据进行癌症分期和预后预测 | 数字病理学 | 癌症 | 空间转录组学 | 图基深度学习 | 图像 | NA |
| 1964 | 2024-08-05 |
A spatially resolved single cell genomic atlas of the adult human breast
2023-Apr-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.22.537946
PMID:37163043
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研究论文 | 本文构建了一个成人人的乳腺单细胞基因组图谱 | 首次以单细胞和空间分辨率构建了全面的人类乳腺细胞图谱 | 对非上皮细胞类型的研究仍然相对不足 | 研究成人正常乳腺组织，以了解乳腺生物学和相关疾病状态 | 535,941个细胞和120,024个细胞核的数据来自62名和20名女性 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 细胞数据 | 535,941个细胞和120,024个细胞核 |
| 1965 | 2024-08-07 |
Gastric Stem Cell Biology and Helicobacter pylori Infection
2023, Current topics in microbiology and immunology
DOI:10.1007/978-3-031-47331-9_1
PMID:38231213
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研究论文 | 研究幽门螺杆菌感染对胃干细胞生物学的影响及其在胃癌发展中的作用 | 利用细胞系追踪、类器官和单细胞RNA测序技术，深入了解正常稳态和感染状态下上皮和间质细胞亚型的分子“身份”，并揭示了幽门螺杆菌感染下干细胞（微环境）行为的原理 | NA | 探讨幽门螺杆菌感染如何影响胃干细胞行为及其在胃癌发展中的作用 | 胃干细胞、幽门螺杆菌感染、胃癌发展 | 数字病理学 | 胃癌 | 细胞系追踪、类器官、单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
| 1966 | 2024-08-05 |
Targeting neuropilin-1 abolishes anti-PD-1-upregulated regulatory T cells and synergizes with 4-1BB agonist for liver cancer treatment
2023-11-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000320
PMID:36811396
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研究论文 | 本研究探讨了神经元细胞膜蛋白-1对抗PD-1上调的调节性T细胞的影响，并与4-1BB激动剂协同用于肝癌治疗 | 揭示了抗PD-1治疗通过神经元细胞膜蛋白-1调节肝细胞癌中的调节性T细胞积累的潜在机制 | 研究可能未对所有肝癌模型进行广泛验证，可能限制了结果的普遍性 | 探讨调节性T细胞在肝细胞癌治疗中的作用及其与抗PD-1和4-1BB激动剂的协同效果 | 主要研究肝细胞癌（HCC）中的调节性T细胞及其与抗PD-1治疗的相互作用 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞转录组学 | 人源化肝细胞癌模型 | 基因组数据 | NA |
| 1967 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing of liver fine-needle aspirates captures immune diversity in the blood and liver in chronic hepatitis B patients
2023-11-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000438
PMID:37158243
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，通过肝细针穿刺获取慢性乙型肝炎患者的血液和肝脏样本，比较了两种单细胞RNA测序技术（Seq-Well S3和10× Chromium）在捕捉肝脏细胞多样性方面的效果，并分析了不同细胞类型在血液和肝脏中的转录组差异。 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术，系统比较了慢性乙型肝炎患者血液和肝脏的免疫细胞多样性，并发现Seq-Well S3技术能有效捕捉到10× Chromium技术未能捕捉到的中性粒细胞。 | 研究主要依赖于两种特定的单细胞RNA测序技术，可能存在技术偏倚；此外，样本量未在摘要中明确提及，可能影响研究结果的普遍性。 | 克服肝脏采样的实际障碍，通过细针穿刺和单细胞RNA测序技术，全面比较慢性乙型肝炎患者血液和肝脏的免疫细胞多样性。 | 慢性乙型肝炎患者的血液和肝脏样本。 | 数字病理学 | 肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本量未在摘要中提及 |
| 1968 | 2024-08-07 |
Identification and characterization of a hepatic IL-13-producing ILC3-like population potentially involved in liver fibrosis
2023-09-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000350
PMID:37029085
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研究论文 | 本文详细研究了人体肝脏中的固有淋巴细胞（ILCs）在健康和纤维化肝脏中的组成及其在慢性肝病中的潜在作用 | 发现了一种先前未被描述的IL-13产生型ILC3样细胞亚群，该细胞在人体肝脏中富集，可能参与调节慢性肝病 | NA | 研究肝脏中固有淋巴细胞的组成及其在慢性肝病中的作用 | 肝脏中的固有淋巴细胞（ILCs） | NA | 肝纤维化 | 流式细胞术和单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 总共分析了50个肝脏样本（非纤维化=22，纤维化=29），以及结肠和扁桃体组织（各14个）和外周血（32个） |
| 1969 | 2024-08-07 |
A neuroepithelial wave of BMP signalling drives anteroposterior specification of the tuberal hypothalamus
2023-02-10, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.83133
PMID:36718990
|
研究论文 | 本研究结合实验和生物信息学方法，探讨了胚胎期鸡的管状下丘脑前-后方向的生成机制 | 首次揭示了神经上皮来源的BMP信号波在胚胎发育中驱动管状下丘脑前-后方向特化的过程 | NA | 阐明管状下丘脑在胚胎发育中的细胞和信号通路特化机制 | 管状下丘脑的生成过程及其调控机制 | NA | NA | scRNA-Seq | NA | 基因表达数据 | 胚胎期鸡 |
| 1970 | 2024-08-05 |
Pancancer analysis reveals the role of disulfidptosis in predicting prognosis, immune infiltration and immunotherapy response in tumors
2023-Dec-29, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000036830
PMID:38206694
|
研究论文 | 本研究构建了多组学数据分析，揭示了二硫化死亡在肿瘤中的作用。 | 提出了二硫化死亡作为癌症治疗的新策略，并系统分析了其在多种肿瘤中的作用。 | 样本规模和数据库选择可能影响结果的普遍性。 | 探讨二硫化死亡在预测肿瘤预后、免疫浸润和免疫治疗反应中的作用。 | 33种肿瘤的数据以及与二硫化死亡相关的基因。 | 数字病理学 | NA | 多组学数据分析 | NA | 基因表达数据 | 33种肿瘤 |
| 1971 | 2024-08-05 |
Neural tube-associated boundary caps are a major source of mural cells in the skin
2023-Dec-14, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.69413
PMID:38095361
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研究论文 | 本文研究了神经管相关的边界帽细胞在皮肤血管中作为重要的壁细胞来源的作用 | 揭示了边界帽细胞衍生物的多样性及其在小鼠皮肤中的壁细胞来源的潜力 | 研究主要基于小鼠模型，结果的普遍适用性仍需进一步验证 | 探讨边界帽细胞在皮肤血管发育中的作用 | 小鼠中的边界帽细胞衍生物 | NA | NA | Cre基础报告细胞追踪和单细胞转录组学 | NA | NA | 小鼠模型中涉及的数量未具体说明 |
| 1972 | 2024-08-07 |
Multimodal single-cell datasets characterize antigen-specific CD8+ T cells across SARS-CoV-2 vaccination and infection
2023-Oct, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-023-01608-9
PMID:37735591
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研究论文 | 本研究利用多模态测序技术对mRNA疫苗BNT162b2接种前后循环人白细胞进行纵向分析，以表征和量化T细胞反应 | 本研究定义了CD8 T细胞的转录组、可及染色质景观和免疫表型，并识别了每种模态中的独特生物标志物 | NA | 研究SARS-CoV-2感染或疫苗接种后抗原特异性CD8+ T细胞的特征 | SARS-CoV-2疫苗接种和感染后的抗原特异性CD8+ T细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 多模态测序技术 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 接种mRNA疫苗BNT162b2前后收集的循环人白细胞样本 |
| 1973 | 2024-08-05 |
Potential to Enhance Large Scale Molecular Assessments of Skin Photoaging through Virtual Inference of Spatial Transcriptomics from Routine Staining
2023-Jul-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.30.551188
PMID:37577612
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研究论文 | 本文探讨了如何通过常规染色法推断空间转录组学信息，以增强皮肤光老化的大规模分子评估 | 提出了一种利用常规H&E染色切片推断空间转录组学信息的新方法，以提高评估光老化的可靠性 | 使用最先进的空间转录组学技术成本高，且不同患者间存在变异性，限制了大规模分子流行病学研究的范围 | 研究空间转录组学在皮肤光老化评估中的应用潜力 | 分析261个皮肤标本中4位患者的基底细胞和鳞状细胞肿瘤切片 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 空间转录组学 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 261个皮肤标本，分析4位患者的切片 |
| 1974 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics uncovers cellular architecture and developmental trajectories in hepatoblastoma
2023-06-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1002/hep.32775
PMID:36059151
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研究论文 | 本研究揭示了肝母细胞瘤的细胞结构和发育轨迹 | 利用单细胞转录组分析，建立了肝母细胞瘤的细胞层级和亚型分类方法 | 基于仅五名患者的样本，样本量较小 | 探讨肝母细胞瘤的肿瘤发生机制及其异质性 | 肝母细胞瘤患者的肿瘤及配对远端肝组织样本 | 数字病理学 | 肝母细胞瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 五名肝母细胞瘤患者的样本 |
| 1975 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing dissects the transcriptional identity of activated fibroblasts and identifies novel persistent distal tubular injury patterns in kidney fibrosis
2023-May-17, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2880248/v1
PMID:37293022
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研究论文 | 该研究通过单细胞转录组分析揭示了肾纤维化中活化成纤维细胞的转录特征，并识别了新的持久远端小管损伤模式 | 首次确定了三种具有特定转录特征的成纤维细胞簇，并识别了肾小管损伤的新空间模式 | 研究未提及样本数量及其具体来源 | 深入理解肾纤维化的分子机制和促进靶向策略的开发 | 分析了两种与临床相关的肾纤维化模型中的单细胞转录组特征 | 数字病理学 | 慢性肾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 1976 | 2024-08-07 |
RhoA GEF Mcf2lb regulates rosette integrity during collective cell migration
2023-Apr-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.19.537573
PMID:37131612
|
研究论文 | 本文研究了RhoA GEF Mcf2lb在多细胞迁移过程中对花环结构完整性的调控作用 | 首次揭示了Mcf2lb通过激活RhoA调控细胞顶端收缩，从而影响花环结构的形成和维持 | NA | 探究花环结构形成和维持的分子机制 | RhoA GEF Mcf2lb在多细胞花环结构中的作用 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序，原位杂交 | NA | 图像 | 约150个细胞组成的斑马鱼后侧线原基(pLLP) |
| 1977 | 2024-08-07 |
Phospholipase A2 Group IIA Is Associated with Inflammatory Hepatocellular Adenoma
2023-Dec-28, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16010159
PMID:38201587
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研究论文 | 本研究旨在全面调查肝细胞腺瘤（HCA）的亚型分类，并比较分析HCA和肝细胞癌（HCC）组织之间的基因表达谱 | 发现磷脂酶A2组IIA（PLA2G2A）mRNA在炎症性HCA中特异性表达，这可能有助于炎症性HCA的新定义 | 研究结果需要通过其他新鲜HCA样本进行验证 | 研究HCA的亚型分类及其与HCC的基因表达差异 | 炎症性HCA、非B非C HCC、乙型肝炎病毒相关HCC及正常肝组织 | NA | 肝细胞腺瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 1个炎症性HCA，3个非B非C HCC，2个乙型肝炎病毒相关HCC，1个正常肝组织样本 |
| 1978 | 2024-08-07 |
A new insight of immunosuppressive microenvironment in osteosarcoma lung metastasis
2023-06, Experimental biology and medicine (Maywood, N.J.)
DOI:10.1177/15353702231171900
PMID:37439349
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析单细胞RNA测序数据，揭示了骨肉瘤肺转移的免疫抑制微环境的复杂性 | 首次详细分类了骨肉瘤肺转移中的17个细胞集群，并发现CD63在决定T细胞和恶性细胞浸润中的关键作用 | 研究基于已发表的单细胞RNA测序数据，可能存在样本选择偏倚 | 探讨骨肉瘤肺转移的免疫抑制微环境，为精准治疗提供依据 | 骨肉瘤肺转移的细胞集群及其免疫特性 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列 | 75,317个细胞，来自两个骨肉瘤肺转移和五个正常肺组织 |
| 1979 | 2024-08-05 |
Biomarkers in Cancer Detection, Diagnosis, and Prognosis
2023-Dec-20, Sensors (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/s24010037
PMID:38202898
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综述 | 该论文描述了在癌症检测和诊断中适用的各种生物标志物 | 该文综述了影像学、血液、细胞成像、组织成像和基因方面的生物标志物在癌症中的应用 | 该文未提及研究的具体限制 | 探讨生物标志物在癌症检测、诊断和预后中的重要性 | 文中涉及的研究对象包括用于癌症检测和诊断的各种生物标志物 | 数字病理学 | 癌症 | 影像学诊断、血基生物标志物、细胞成像、组织成像、基因组测序 | NA | NA | NA |
| 1980 | 2024-08-07 |
Machine Learning and Single-Cell Analysis Identify Molecular Features of IPF-Associated Fibroblast Subtypes and Their Implications on IPF Prognosis
2023-Dec-20, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25010094
PMID:38203265
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研究论文 | 本研究旨在系统分类纤维母细胞群体，揭示纤维化肺组织中纤维母细胞亚型的分子和生物学特征，并建立与IPF相关的纤维母细胞相关预测模型 | 本研究首次使用scRNA-seq数据和hdWGCNA技术，识别出与IPF相关的纤维母细胞亚型及其共表达基因模块，并构建了基于机器学习的IPF纤维母细胞相关预测模型 | NA | 系统分类纤维母细胞群体，揭示其分子和生物学特征，并建立IPF相关的预测模型 | 纤维化肺组织中的纤维母细胞亚型及其分子特征 | 数字病理学 | 肺纤维化 | scRNA-seq, hdWGCNA | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 来自正常和IPF患者的肺组织样本 |