单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5353 篇文献，本页显示第 1941 - 1960 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1941 | 2024-08-07 |
Cross-species analysis of transcriptome emphasizes a critical role of TNF-α in mediating MAP2K7/AKT2 signaling in zearalenone-induced apoptosis
2023-10-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2023.132226
PMID:37549580
|
研究论文 | 本研究通过跨物种转录组分析，探讨了玉米赤霉烯酮（ZEN）诱导的细胞凋亡中TNF-α介导的MAP2K7/AKT2信号通路的关键作用 | 首次综合运用比较转录组分析、单细胞转录组分析和加权基因共表达网络分析（WGCNA），结合体内基因敲除和体外RNA干扰技术，揭示了ZEN诱导的细胞凋亡中TNF-α-MAP2K7/AKT2轴的主要信号通路 | NA | 探究ZEN诱导的细胞凋亡机制，并为因ZEN导致的畜牧业和人类生殖健康损失提供新的潜在治疗靶点 | 猪和鼠的颗粒细胞（pGCs和mGCs） | 数字病理学 | 生殖健康风险 | 比较转录组分析、单细胞转录组分析、加权基因共表达网络分析（WGCNA）、基因敲除、RNA干扰 | NA | 转录组数据 | 涉及猪和鼠的颗粒细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1942 | 2024-08-04 |
Neural connectivity molecules best identify the heterogeneous clock and dopaminergic cell types in the Drosophila adult brain
2023-02-22, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ade8500
PMID:36812309
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研究论文 | 这篇文章研究了果蝇成年脑中时钟和多巴胺细胞类型的异质性 | 首次揭示了成体脑中多巴胺神经元与时钟神经元在基因表达上的相似异质性，并强调了神经连接分子在识别细胞类型中的重要性 | 研究主要集中于果蝇成年大脑的特定神经元类型，结果可能不适用于其他物种或更广泛的神经元类型 | 确定果蝇成体大脑中多巴胺神经元和时钟神经元的异质性及其基因表达特点 | 成年果蝇的大脑多巴胺神经元和时钟神经元 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 成年果蝇的大脑多个神经元群体 | NA | NA | NA | NA |
| 1943 | 2024-08-04 |
Reactive astrogliosis in the era of single-cell transcriptomics
2023, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2023.1173200
PMID:37153637
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综述 | 本文概述了通过单细胞转录组学定义的反应性星形胶质细胞群体在多种神经病理中的作用 | 揭示了反应性星形胶质细胞在神经病理中的多样性及其时间和空间上的不同表达模式 | 未详细探讨特定疾病模型中的机制，可能影响对复杂病理的理解 | 探讨反应性星形胶质细胞在不同神经病理中的作用及其转录组特征 | 反应性星形胶质细胞及其在神经病理中的表现 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 多种神经病理的数据集，具体样本量未明确 | NA | NA | NA | NA |
| 1944 | 2024-08-04 |
FXYD3 functionally demarcates an ancestral breast cancer stem cell subpopulation with features of drug-tolerant persisters
2023-11-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI166666
PMID:37966117
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研究论文 | 该文章研究了FXYD3在三阴性乳腺癌干细胞亚群体中的功能及其耐药特征 | 发现了以FXYD3为标志的乳腺癌干细胞亚群，并揭示了其与药物耐受性持久存活者的关系 | 研究主要集中在三阴性乳腺癌，可能不适用于其他类型的癌症 | 探讨肿瘤中癌症干细胞的异质性及其在化疗中的敏感性 | 三阴性乳腺癌（TNBC）中的癌症干细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组分析 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1945 | 2024-08-07 |
Mechanisms underlying the therapeutic effects of cinobufagin in treating melanoma based on network pharmacology, single-cell RNA sequencing data, molecular docking, and molecular dynamics simulation
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1315965
PMID:38348352
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研究论文 | 本研究旨在预测蟾毒灵在黑色素瘤中的潜在作用靶点，通过网络药理学、单细胞RNA测序数据、分子对接和分子动力学模拟等方法进行分析 | 本研究结合多种先进技术，如单细胞RNA测序和分子动力学模拟，以揭示蟾毒灵治疗黑色素瘤的新机制 | 研究结论缺乏相关实验数据支持，需要进一步实验验证 | 预测蟾毒灵在黑色素瘤中的潜在作用靶点 | 蟾毒灵在黑色素瘤中的作用机制 | 分子生物学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, 分子对接, 分子动力学模拟 | NA | 基因表达数据 | 使用GSE46517和GSE215120数据集中的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1946 | 2024-08-05 |
Type I interferon signature and cycling lymphocytes in macrophage activation syndrome
2023-11-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI165616
PMID:37751296
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研究论文 | 本文研究了与Still病相关的巨噬细胞激活综合征（MAS）中的I型干扰素特征和循环淋巴细胞。 | 该研究揭示了MAS患者中I型干扰素过量产生与IL-15的协同作用，导致CD38+HLA-DR+循环淋巴细胞的生成，这为理解MAS的免疫机制提供了新见解。 | 该研究主要基于对外周血单核细胞的分析，尚需进一步验证其在不同患者群体中的普遍性。 | 旨在更深入地理解Still病和巨噬细胞激活综合征的免疫学特征。 | 研究对象为健康对照组与有或没有MAS的Still病患者。 | 数字病理学 | Still病 | bulk RNA-Seq, single-cell RNA-Seq, 质量细胞术, 流式细胞术 | NA | RNA数据 | 超过65,000个PBMC样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1947 | 2024-08-05 |
SnapATAC2: a fast, scalable and versatile tool for analysis of single-cell omics data
2023-Sep-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.11.557221
PMID:37745443
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研究论文 | 本文介绍了一种新算法SnapATAC2，用于单细胞组学数据的分析。 | 提出了一种快速非线性降维算法，能够高效捕捉单细胞组学数据的异质性，同时运行时间和内存使用与细胞数量线性相关。 | 未提及具体的限制 | 旨在提高对复杂组织中动态基因调控的理解。 | 分析单细胞组学数据，包括单细胞ATAC-seq和单细胞RNA-seq等。 | 单细胞组学 | NA | NA | NA | 单细胞组学数据 | 使用了多种单细胞组学数据类型 | NA | NA | NA | NA |
| 1948 | 2024-08-05 |
New technologies to study helminth development and host-parasite interactions
2023-07, International journal for parasitology
IF:3.7Q1
DOI:10.1016/j.ijpara.2022.11.012
PMID:36931423
|
综述 | 本文回顾了单细胞RNA测序在研究多细胞蠕虫和探讨宿主免疫细胞类型中的应用 | 引入了单细胞RNA测序技术，以更细致的方式分析寄生虫生物学和宿主免疫 | 在体内研究宿主与寄生虫的相互作用具挑战性 | 理解寄生虫的发展及其与宿主免疫反应的相互作用 | 多细胞蠕虫及其与宿主细胞之间的相互作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1949 | 2024-08-04 |
Bexmarilimab-induced macrophage activation leads to treatment benefit in solid tumors: The phase I/II first-in-human MATINS trial
2023-12-19, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2023.101307
PMID:38056464
|
研究论文 | 本研究探讨了bexmarilimab对治疗难治性实体肿瘤患者的安全性和耐受性。 | 首次在人类中研究Clever-1阻断的疗效，并显示了bexmarilimab诱导的巨噬细胞激活对成瘤免疫的积极影响。 | 本研究主要集中于早期的安全性和耐受性评估，缺乏长期疗效的完整数据。 | 评估bexmarilimab对治疗难治性实体肿瘤患者的初步抗肿瘤疗效及免疫相关性。 | 治疗难治性实体肿瘤患者，参与者总数为138。 | 数字病理学 | 皮肤黑色素瘤、胃癌、肝细胞癌、雌激素受体阳性乳腺癌和胆道癌 | NA | NA | 临床试验数据 | 138名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 1950 | 2024-08-07 |
iPSC-derived hypoimmunogenic tissue resident memory T cells mediate robust anti-tumor activity against cervical cancer
2023-12-19, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2023.101327
PMID:38091985
|
研究论文 | 本文开发了一种HLA-A24&-E双整合的HPV-rejTs，通过消除HLA I类抗原来有效抑制受体免疫排斥，同时保持比原始细胞毒性T淋巴细胞更强的细胞毒性 | 通过单细胞RNA测序发现HPV-rejTs富含组织驻留记忆T细胞，增强了通过TGFβR信号通路对宫颈癌的细胞毒性，并上调了与免疫突触相关的基因，促进了T细胞受体（TCR）的更强激活和TCR介导的目标细胞死亡 | NA | 开发一种可行的“即用型”T细胞疗法，具有强大的抗宫颈癌效果 | 从诱导多能干细胞生成的功能性恢复的人乳头瘤病毒特异性细胞毒性T淋巴细胞（HPV-rejTs） | 免疫学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1951 | 2024-08-07 |
Dapagliflozin protects against chronic heart failure in mice by inhibiting macrophage-mediated inflammation, independent of SGLT2
2023-12-19, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2023.101334
PMID:38118414
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研究论文 | 本研究使用SGLT2全局敲除小鼠评估SGLT2抑制剂对心力衰竭的作用机制，发现达格列净通过抑制巨噬细胞介导的炎症来保护心脏，且这一作用独立于SGLT2。 | 达格列净对心力衰竭的保护作用独立于SGLT2，主要通过抑制巨噬细胞炎症来实现。 | NA | 阐明SGLT2抑制剂在心力衰竭中的具体作用机制。 | SGLT2全局敲除小鼠及其在心肌梗死和主动脉缩窄诱导的心力衰竭模型中的表现。 | 心血管疾病 | 心力衰竭 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | SGLT2全局敲除小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 1952 | 2024-08-04 |
Metabolic predictors of response to immune checkpoint blockade therapy
2023-Nov-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.108188
PMID:37965137
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研究论文 | 本研究探讨了肿瘤微环境中免疫细胞代谢与免疫检查点抑制剂反应之间的关系 | 首次对接受免疫检查点抑制剂治疗的癌症患者肿瘤微环境中免疫细胞的代谢特征进行了分析，并建立了基于代谢基因特征的预测模型 | 目前只分析了部分代谢基因，可能未涵盖所有相关的代谢途径 | 旨在通过代谢特征预测癌症患者对免疫检查点抑制剂的反应 | 参与研究的对象为大约230例接受免疫检查点抑制剂治疗的癌症患者的免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 约230个样本，涉及超过100万个免疫细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1953 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptome analysis reveals the key genes associated with macrophage polarization in liver cancer
2023-11-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000304
PMID:37889536
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研究论文 | 本研究揭示了与肝癌巨噬细胞极化相关的关键基因 | 通过单细胞转录组分析识别了6个与巨噬细胞极化相关的关键基因，并建立了预后模型 | 尚未提及研究的具体限制 | 揭示与肝癌巨噬细胞极化相关的关键基因 | 肝癌组织中的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | Cox回归模型 | 基因表达数据 | 涉及2000个高变基因和15个细胞簇 | NA | NA | NA | NA |
| 1954 | 2024-08-04 |
Genetic vulnerability to Crohn's disease reveals a spatially resolved epithelial restitution program
2023-10-25, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adg5252
PMID:37878672
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研究论文 | 本文解剖了肠黏膜愈合反应，通过单细胞分辨率绘制细胞间通信图谱并与空间转录组学结合 | 揭示了与克罗恩病相关的遗传变异如何破坏损伤感知通路，在愈合机制上提供了空间分辨的生物学模型 | 主要使用小鼠模型进行研究，可能与人类的生物学过程存在差异 | 研究肠道组织修复过程中的细胞间通信与信号传导机制 | 研究对象为克罗恩病相关的HGFAC基因变异及其在小鼠模型中的表现 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 空间转录组学，单细胞转录组学 | 器官oid共培养模型 | 细胞数据 | 使用R509H小鼠模型进行实验 | NA | NA | NA | NA |
| 1955 | 2024-08-07 |
ETV6 represses inflammatory response genes and regulates HSPC function during stress hematopoiesis in mice
2023-09-26, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2022009313
PMID:37522715
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研究论文 | 本研究通过生成携带Etv6R355X失活突变的小鼠模型，探讨ETV6基因在HSPC功能和炎症反应基因调控中的作用 | 首次揭示了ETV6在HSPC中抑制炎症基因表达的机制，特别是在应激造血过程中的作用 | NA | 阐明ETV6基因变异如何影响HSPC功能并导致疾病 | ETV6基因在HSPC中的功能及其对炎症反应基因的调控作用 | NA | 血液系统恶性肿瘤 | 转座酶可及染色质测序、高吞吐量染色体构象捕获、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型，包括Etv6R355X/+和Etv6+/+小鼠的骨髓细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1956 | 2024-08-07 |
A Frizzled4-LRP5 agonist promotes blood-retina barrier function by inducing a Norrin-like transcriptional response
2023-Aug-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.107415
PMID:37559903
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研究论文 | 本研究通过使用四价抗体模式F4L5.13，在因NDP信号受损而表现出复杂视网膜病理的幼鼠中，发现FZD4-LRP5激动剂的活动，并探讨其在发育期和成熟期对血视网膜屏障（BRB）功能的恢复作用。 | 本研究首次使用F4L5.13抗体模式，识别并验证了FZD4-LRP5激动剂在恢复血视网膜屏障功能中的作用，揭示了其在视网膜和神经疾病治疗中的潜在价值。 | 研究主要集中在幼鼠和成熟鼠模型上，未涉及其他年龄段的动物模型，可能影响结果的普遍性。 | 探讨FZD4-LRP5激动剂在维持和恢复血视网膜屏障功能中的作用及其潜在治疗价值。 | 幼鼠和成熟鼠的视网膜病理模型。 | 生物医学 | 视网膜疾病 | scRNA-seq | NA | RNA | 幼鼠和成熟鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 1957 | 2024-08-07 |
EZH2 inhibition promotes tumor immunogenicity in lung squamous cell carcinomas
2023-Jun-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.06.543919
PMID:37333199
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研究论文 | 本研究探讨了EZH2甲基转移酶抑制剂在肺鳞状细胞癌（LSCC）中增强免疫检查点抑制剂（ICI）反应的可能性 | 首次证明EZH2抑制剂能增加主要组织相容性复合体I和II（MHCI/II）的表达，并改变肿瘤微环境，使其更具免疫原性 | NA | 研究EZH2抑制剂在肺鳞状细胞癌中增强免疫检查点抑制剂反应的效果 | 肺鳞状细胞癌（LSCC）及其免疫微环境 | 数字病理学 | 肺鳞状细胞癌 | ChIP-seq, 单细胞RNA测序 | NA | mRNA, 蛋白质 | 使用2D人类癌细胞系以及3D鼠源和患者来源的类器官进行实验 | NA | NA | NA | NA |
| 1958 | 2024-08-07 |
A TREM2-activating antibody with a blood-brain barrier transport vehicle enhances microglial metabolism in Alzheimer's disease models
2023-03, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-022-01240-0
PMID:36635496
|
研究论文 | 本文描述了一种高亲和力的人源TREM2激活抗体，该抗体通过单价的转铁蛋白受体（TfR）结合位点工程化，称为抗体运输载体（ATV），以促进血脑屏障的转运，从而增强阿尔茨海默病模型中的小胶质细胞代谢。 | 开发了一种新型的高亲和力TREM2激活抗体，结合了抗体运输载体（ATV）技术，以改善血脑屏障的穿透性和小胶质细胞的代谢活性。 | NA | 探索通过激活TREM2受体来改善阿尔茨海默病患者脑内小胶质细胞功能和代谢的治疗策略。 | TREM2激活抗体及其在阿尔茨海默病模型中的应用。 | 生物技术 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用人诱导多能干细胞（iPSC）衍生的小胶质细胞和阿尔茨海默病小鼠模型进行研究。 | NA | NA | NA | NA |
| 1959 | 2024-08-04 |
A Novel Molecular Classification Method for Glioblastoma Based on Tumor Cell Differentiation Trajectories
2023, Stem cells international
IF:3.8Q2
DOI:10.1155/2023/2826815
PMID:37964983
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研究论文 | 本文提出了一种基于肿瘤细胞分化轨迹的新的胶质母细胞瘤分子分类方法 | 探索了基于单细胞转录组测序(scRNA-seq)数据的分化轨迹推断在胶质母细胞瘤分子分类中的应用 | 该研究仅使用了10个胶质母细胞瘤样本的单细胞数据，并在公共队列中验证其结果 | 研究新的胶质母细胞瘤分子分类，以便于治疗选择和提高癌症患者的反应率 | 10个胶质母细胞瘤样本的单细胞转录组测序数据 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞转录组测序(串行单细胞RNA测序) | NA | 基因表达数据 | 10个胶质母细胞瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1960 | 2024-08-04 |
Tsp-1+ microglia attenuate retinal neovascularization by maintaining the expression of Smad3 in endothelial cells through exosomes with decreased miR-27a-5p
2023, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.84236
PMID:37441592
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研究论文 | 本文探讨了微胶质细胞通过调节Smad3的表达而影响视网膜新血管生成的机制 | 揭示了Tsp-1/miR-27a-5p/Smad3轴在微胶质细胞相关和外泌体介导的抗血管生成调控中的新机制 | 文章中未提到实验样本的多样性和长期效果的观察 | 研究视网膜微胶质细胞在病理性新血管生成中的作用及其机制 | 小鼠视网膜中微胶质细胞和内皮细胞 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序，外泌体分离，miRNA测序，荧光素酶报告试验 | NA | RNA数据 | 小鼠视网膜样本 | NA | NA | NA | NA |