单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5353 篇文献，本页显示第 1921 - 1940 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1921 | 2024-08-04 |
A Comprehensive narrative review of transcriptomics and epigenomics of gallbladder cancer
2023-Jan-01, Journal of cancer research and therapeutics
IF:1.4Q4
DOI:10.4103/jcrt.jcrt_1823_23
PMID:38384011
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review | 本综述分析了胆囊癌的转录组学和表观基因组学研究 | 该文章通过对2010年至2023年间已发布的高通量测序研究的分析，揭示了胆囊癌的基因与表观基因特征 | 当前研究基于已发布的文献，可能会有限制于数据的可用性和质量 | 研究胆囊癌的分子机制，开发诊断生物标志物和靶向治疗方法 | 胆囊癌相关的转录组和表观基因组特征 | 数字病理学 | 胆囊癌 | 下一代测序（NGS），RNA测序，单细胞测序，微阵列技术 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1922 | 2024-08-04 |
Single-Cell Sequencing of Lung Macrophages and Monocytes Reveals Novel Therapeutic Targets in COPD
2023-12-05, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12242771
PMID:38132091
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研究论文 | 本研究确定了COPD患者肺部巨噬细胞和单核细胞的特征，并识别了新型治疗靶点 | 首次明确了COPD患者肺部巨噬细胞和单核细胞的转录特征，为寻找新的治疗靶点提供了依据 | 样本量相对较小，可能限制了研究结果的广泛适用性 | 探索COPD患者肺部巨噬细胞和单核细胞在炎症过程中的作用 | COPD患者和对照组人类肺组织中的巨噬细胞和单核细胞 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 (COPD) | RNA测序 | NA | 转录组数据 | COPD患者18个样本和对照组28个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1923 | 2024-08-07 |
Pooled Genome-Scale CRISPR Screens in Single Cells
2023-11-27, Annual review of genetics
IF:8.7Q1
|
review | 本文综述了单细胞水平上基于CRISPR的基因筛选技术的原理和实际考虑 | 介绍了利用CRISPR-Cas技术在单细胞中进行基因功能调控和表达控制的创新方法 | NA | 探讨基因功能分配和表达控制的基础，以及其在细胞生物学和治疗开发中的应用 | 基因功能和表达控制 | 基因编辑 | NA | CRISPR-Cas | NA | RNA sequencing, 细胞图像 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1924 | 2024-08-07 |
IL-11 induces NLRP3 inflammasome activation in monocytes and inflammatory cell migration to the central nervous system
2023-06-27, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2221007120
PMID:37339207
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研究论文 | 本研究探讨了IL-11诱导的炎症细胞向中枢神经系统迁移的机制 | 首次报道IL-11在复发缓解型多发性硬化症患者中增加，并通过αIL-11 mAb治疗减少炎症和脱髓鞘 | NA | 研究IL-11诱导的炎症细胞向中枢神经系统迁移的机制 | IL-11在复发缓解型多发性硬化症患者中的作用及其治疗潜力 | NA | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括复发缓解型多发性硬化症患者和健康对照者的外周血单个核细胞及脑脊液细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1925 | 2024-08-04 |
Characterization of the Doublesex/MAB-3 transcription factor DMD-9 in Caenorhabditis elegans
2023-02-09, G3 (Bethesda, Md.)
DOI:10.1093/g3journal/jkac305
PMID:36454093
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研究论文 | 本文对秀丽隐杆线虫中的DMD-9转录因子的表达模式和功能进行了表征 | 识别了DMD-9在神经元中的细胞特异性调控及其可能的性别二态性角色 | 在dmd-9突变体中未能观察到DMD-9表达神经元介导的行为缺陷 | 研究DMD-9在秀丽隐杆线虫中的表达模式及其作用 | 主要研究对象为秀丽隐杆线虫的DMD-9转录因子和相关神经元 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | RNA表达数据 | 22种神经细胞命运报告基因 | NA | NA | NA | NA |
| 1926 | 2024-08-07 |
Gut microbiome dysbiosis in men who have sex with men increases HIV infection risk through immunity homeostasis alteration
2023, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2023.1260068
PMID:38035339
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研究论文 | 本研究旨在比较HIV感染者与男男性行为者（MSM）肠道微生物群变化的差异，并揭示MSM相关肠道微生物群失调对免疫系统的影响 | 本研究首次揭示了MSM相关肠道微生物群失调通过影响免疫稳态增加HIV感染风险 | 需要进一步研究阐明MSM肠道微生物群失调调节HIV易感性的机制 | 比较HIV感染者与MSM肠道微生物群变化的差异，并揭示MSM相关肠道微生物群失调对免疫系统的影响 | HIV感染者与男男性行为者（MSM）的肠道微生物群 | NA | HIV感染 | 生物信息学技术，单细胞RNA测序数据分析 | NA | 基因和代谢物数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 1927 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals common and unique gene expression profiles in primary CD4+ T cells latently infected with HIV under different conditions
2023, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2023.1286168
PMID:38156317
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了在不同条件下潜伏感染HIV的CD4+ T细胞的基因表达谱 | 研究揭示了在不同条件下潜伏感染HIV的CD4+ T细胞的共同和独特基因表达模式 | NA | 识别潜伏感染HIV的单个CD4+ T细胞的基因表达谱，并探索这些基因表达谱以优先考虑未来实验验证的基因 | 潜伏感染HIV的CD4+ T细胞 | 数字病理学 | HIV | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1928 | 2024-08-07 |
Pyroptosis-Related Subtypes Predict the Response of Clear Cell Renal Cell Carcinoma to Targeted Therapy
2023-12-08, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/j.fbl2812334
PMID:38179741
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研究论文 | 本研究基于焦亡相关基因的共识聚类对透明细胞肾细胞癌（ccRCC）进行分子分型，并探讨其对靶向治疗的反应预测 | 首次揭示了焦亡相关基因在ccRCC中的作用，并基于此开发了预测ccRCC对靶向治疗反应的分子亚型 | NA | 探讨焦亡在透明细胞肾细胞癌进展中的作用，并开发个性化治疗策略 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC） | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序，CIBERSORT分析，Lasso回归 | NA | 基因组，转录组，蛋白质 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1929 | 2024-08-07 |
Transcriptional diversity in specific synaptic gene sets discriminates cortical neuronal identity
2023-05-09, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-023-00372-y
PMID:37161421
|
研究论文 | 本文通过结合SynGO数据库和单细胞RNA测序数据，研究了小鼠新皮质中神经元细胞类型的转录多样性，并展示了通过突触基因可以有效区分细胞类型。 | 首次系统地识别了大脑中所有突触群体的转录多样性，并发现突触基因在区分细胞类型方面与所有基因具有相同的能力。 | NA | 量化并识别神经元细胞类型的特定突触特征。 | 小鼠新皮质中的神经元细胞类型。 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 小鼠新皮质中的所有突触群体 | NA | NA | NA | NA |
| 1930 | 2024-08-07 |
A Comparison of the Various Methods for Selecting Features for Single-Cell RNA Sequencing Data in Alzheimer's Disease
2023, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-031-31982-2_27
PMID:37486500
|
研究论文 | 本文比较了用于阿尔茨海默病中单细胞RNA测序数据特征选择的不同方法 | 本文采用了专门为单细胞RNA测序设计的特征选择算法，并将其应用于阿尔茨海默病的研究 | NA | 研究旨在评估和比较不同标记基因选择方法在阿尔茨海默病中的性能 | 阿尔茨海默病中的单细胞RNA测序数据 | 生物医学研究 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 支持向量机 (SVM), k-最近邻算法 (k-NN), 线性判别分析 (LDA) | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1931 | 2024-08-07 |
Construction and evaluation of endometriosis diagnostic prediction model and immune infiltration based on efferocytosis-related genes
2023, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2023.1298457
PMID:38370978
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研究论文 | 本研究构建并评估了基于吞噬作用相关基因的子宫内膜异位症诊断预测模型及免疫浸润 | 本研究首次识别并验证了与子宫内膜异位症相关的13个吞噬作用相关差异表达基因，并构建了诊断模型 | 研究主要基于公共数据库和机器学习技术，临床样本验证有限 | 旨在识别子宫内膜异位症的诊断标志物并构建诊断模型 | 子宫内膜异位症及其相关的吞噬作用相关基因 | 数字病理学 | 妇科疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | LASSO和SVM回归模型 | 基因表达数据 | 涉及多个公共数据库中的数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 1932 | 2024-08-07 |
Single-cell profiling reveals the trajectory of FOLR2-expressing tumor-associated macrophages to regulatory T cells in the progression of lung adenocarcinoma
2023-08-02, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-023-06021-6
PMID:37532692
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了肺腺癌（LUAD）中免疫抑制微环境的形成机制，揭示了FOLR2表达的肿瘤相关巨噬细胞向调节性T细胞的转变轨迹。 | 首次通过单细胞转录组图谱揭示了从癌前到侵袭性LUAD的免疫抑制微环境形成的潜在轨迹，包括ARM-RETN/TAM-FOLR2/DCs/CD4NR4A3/CD4FOXP3的转变。 | 研究样本量较小，仅包括12个LUAD样本和3个正常肺样本，可能影响结果的普遍性。 | 探究肺腺癌中免疫抑制微环境的细胞机制。 | 肺腺癌样本和正常肺样本中的细胞成分和转录组。 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 12个肺腺癌样本和3个正常肺样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1933 | 2024-08-07 |
Localizing Hormone Receptor Expression to Cellular Compartments in Idiopathic Subglottic Stenosis
2023-12, The Laryngoscope
DOI:10.1002/lary.30856
PMID:37382162
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，定位了特发性声门下狭窄（iSGS）患者中雌激素受体（ESR1和ESR2）和孕激素受体（PGR）在特定细胞亚群中的表达 | 首次通过单细胞RNA测序技术，详细分析了iSGS患者中激素受体在不同细胞亚群中的表达模式 | 研究样本量较小，且仅限于iSGS患者，可能影响结果的普遍性 | 探究雌激素和孕激素受体在iSGS病理发生中的作用机制 | 特发性声门下狭窄（iSGS）患者的气道瘢痕和健康黏膜组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | RNA | 25,974个单独测序的细胞，来自7例声门下瘢痕和3例匹配的无影响黏膜的iSGS患者 | NA | NA | NA | NA |
| 1934 | 2024-08-07 |
Predicting drug response from single-cell expression profiles of tumours
2023-12-01, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-023-03182-1
PMID:38041118
|
研究论文 | 本文介绍了DREEP方法，用于从肿瘤单细胞表达谱预测药物反应，并验证了其在多个独立单细胞数据集上的准确性和鲁棒性 | DREEP利用公开的药理基因组屏幕数据和功能富集分析，从转录组数据预测单细胞药物敏感性 | NA | 提高癌症治疗的疗效和精确性 | 肿瘤单细胞表达谱和药物反应 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 计算方法 | 转录组数据 | 超过200个癌症细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 1935 | 2024-08-07 |
Probing the communication patterns of different chondrocyte subtypes in osteoarthritis at the single cell level using pattern recognition and manifold learning
2023-09-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-41874-z
PMID:37660146
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组数据集探索不同软骨细胞亚型在骨关节炎中的协同和通信模式 | 首次基于单细胞层面的网络分析和模式识别，分析了不同软骨细胞亚型的活跃通信模式，并使用流形学习和定量对比分析了保守和特定的通信途径 | NA | 理解骨关节炎的微环境并优化细胞靶向疗法 | 不同软骨细胞亚型在人类软骨退化和再生中的通信模式 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞转录组 | 流形学习 | 转录组数据 | 1600个软骨细胞来自10名骨关节炎患者 | NA | NA | NA | NA |
| 1936 | 2024-08-04 |
Single-cell RNA sequencing integrated with bulk RNA sequencing analysis reveals diagnostic and prognostic signatures and immunoinfiltration in gastric cancer
2023-09, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2023.107239
PMID:37450965
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研究论文 | 本研究探讨了与胃癌（GC）患者T细胞相关的预后基因特征，提供了预测患者生存率和免疫浸润水平的见解 | 建立了胃癌的单细胞转录组图谱，并识别了与T细胞相关的预后基因特征 | 样本数量较少，仅基于10个肿瘤样本和相应的正常样本进行分析 | 探讨可以预测胃癌患者预后的相关基因特征 | 胃癌患者的免疫相关预后基因特征 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | 细胞 | 10个肿瘤样本和相应正常样本，包含18416个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1937 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing defines disease-specific differences between chronic nodular prurigo and atopic dermatitis
2023-08, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2023.04.019
PMID:37210042
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，比较了慢性结节性痒疹（CNPG）与特应性皮炎（AD）以及健康对照个体皮肤病变中的分子差异 | 发现了CNPG和AD中免疫偏斜的类型2，以及CNPG特有的细胞外基质组织、胶原蛋白合成和纤维化特征 | NA | 旨在深入理解CNPG的病理机制以及CNPG与AD之间的分子关系 | 慢性结节性痒疹（CNPG）和特应性皮炎（AD）患者的皮肤病变 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | CNPG、AD患者及健康对照个体的皮肤病变样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1938 | 2024-08-07 |
scJVAE: A novel method for integrative analysis of multimodal single-cell data
2023-05, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2023.106865
PMID:37030268
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为scJVAE的新方法，用于整合和学习多模态单细胞数据的联合表示，并去除批次效应 | scJVAE方法能够有效地去除批次效应并整合配对的scRNA-seq和scATAC-seq数据，优于现有的先进方法 | NA | 研究目的是开发一种新的方法来处理多模态单细胞数据的批次效应和联合表示 | 多模态单细胞数据，特别是scRNA-seq和scATAC-seq数据 | 单细胞组学 | NA | 单细胞技术 | 变分自编码器（VAE） | 多模态数据 | 使用多种配对基因表达和开放染色质数据集进行评估 | NA | NA | NA | NA |
| 1939 | 2024-08-04 |
Single-Cell Transcriptomics To Define Plasmodium falciparum Stage Transition in the Mosquito Midgut
2023-Feb-27, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.03671-22
PMID:36847501
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学分析了疟原虫在蚊子肠道中的发育过程 | 揭示了疟原虫在蚊子肠道中早期到晚期发展的转录组特征，并发现了一些新的生物标志物 | 对其他发育阶段或其他蚊子种类的适用性未进行探索 | 深入理解疟原虫在蚊子体内发育期间的生物学特性 | 疟原虫Plasmodium falciparum在蚊子肠道的发育过程 | 数字病理学 | 疟疾 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 覆盖疟原虫从配子到ookinete的多个阶段 | NA | NA | NA | NA |
| 1940 | 2024-08-07 |
Exploring the potential mechanisms of impairment on genitourinary system associated with coronavirus disease 2019 infection: Bioinformatics and molecular simulation analyses
2023-Feb-07, Asian journal of urology
IF:2.4Q2
DOI:10.1016/j.ajur.2022.12.004
PMID:36776826
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研究论文 | 本研究通过生物信息学和分子模拟分析，探讨了新冠病毒感染对泌尿生殖系统损害的潜在机制 | 本研究揭示了ACE2、TMPRSS2和CD147在正常泌尿生殖器官中的高表达，并分析了这些蛋白在多种肿瘤和慢性肾脏疾病中的表达情况，以及它们在泌尿生殖器官中的细胞特异性表达模式 | NA | 探索新冠病毒感染对泌尿生殖系统损害的潜在机制 | ACE2、TMPRSS2、CD147等蛋白在泌尿生殖器官中的表达模式及其与新冠病毒感染的关系 | 生物信息学 | 泌尿生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序、基因集富集分析 | NA | 基因表达数据 | 涉及膀胱、肾脏、前列腺和睾丸等多种泌尿生殖器官的细胞 | NA | NA | NA | NA |