单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5354 篇文献，本页显示第 1921 - 1940 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1921 | 2024-08-07 |
Mesenchymal-epithelial transition in lymph node metastases of oral squamous cell carcinoma is accompanied by ZEB1 expression
2023-04-19, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04102-w
PMID:37076857
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和批量转录组测序，探讨了口腔鳞状细胞癌（OSCC）淋巴结转移中上皮-间质可塑性（EMP）的异质性及其对基质细胞的影响 | 首次揭示了在口腔鳞状细胞癌淋巴结转移中，间质-上皮转化（MET）过程中ZEB1的活性增加，表明ZEB1在MET中的复杂作用 | 研究样本量有限，且仅限于口腔鳞状细胞癌，可能限制了结果的普遍性 | 探讨口腔鳞状细胞癌淋巴结转移中上皮-间质可塑性的异质性及其对肿瘤微环境的影响 | 口腔鳞状细胞癌的肿瘤细胞和基质细胞 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 23个口腔鳞状细胞癌病变样本，共7263个癌细胞的单细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA |
| 1922 | 2024-08-05 |
Integrated single-cell and bulk characterization of cuproptosis key regulator PDHB and association with tumor microenvironment infiltration in clear cell renal cell carcinoma
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1132661
PMID:37350959
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研究论文 | 本研究探讨了cuproptosis关键调节因子PDHB在透明细胞肾癌中的生物功能及其与肿瘤微环境浸润的关系 | 揭示了PDHB作为cuproptosis相关中心基因在ccRCC中的重要性，并探讨其在临床治疗中的潜在应用 | 研究可能未深入探讨cuproptosis与其他肿瘤类型的关系 | 旨在发现cuproptosis调节因子的生物学功能，以指导临床治疗 | 主要研究对象为透明细胞肾癌（ccRCC）患者中的PDHB基因 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序和大规模转录组数据 | NA | 基因表达数据 | 包括ccRCC组织和正常配对组织 | NA | NA | NA | NA |
| 1923 | 2024-08-04 |
Roles of immune microenvironment in the female reproductive maintenance and regulation: novel insights into the crosstalk of immune cells
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1109122
PMID:38223507
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研究论文 | 本文探讨了免疫微环境在女性生殖维持与调节中的作用 | 通过单细胞测序技术揭示了免疫细胞的分布图，为免疫细胞在女性生殖中的作用提供了新见解 | 本文未提及具体的实验数据与样本量 | 构建女性生殖过程中免疫微环境的全面描述 | 关注女性生殖过程中免疫细胞的动态作用 | 数字病理学 | 女性生殖健康 | 单细胞测序（scRNA-seq） | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1924 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing analysis identifies one subpopulation of endothelial cells that proliferates and another that undergoes the endothelial-mesenchymal transition in regenerating pig hearts
2023, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2023.1257669
PMID:38288246
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研究论文 | 本研究利用自编码器算法分析新生猪心脏中内皮细胞的单核RNA测序数据，识别出五种内皮细胞集群，其中VEC1集群表达增殖相关标记，而VEC3集群富集了调节细胞间连接和促进内皮间质转化的基因 | 首次在再生猪心脏中发现内皮细胞的两种不同响应机制：增殖和内皮间质转化，并揭示了这些过程在心肌再生中的潜在作用 | 研究仅限于新生猪模型，且样本量较小，需要进一步在更多种类的动物模型和更大样本量中验证 | 探讨内皮细胞在心肌再生中的作用及其分子机制 | 新生猪心脏中的内皮细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单核RNA测序 | 自编码器 | RNA测序数据 | 新生猪心脏样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1925 | 2024-08-07 |
CAR T-cell Design-dependent Remodeling of the Brain Tumor Immune Microenvironment Modulates Tumor-associated Macrophages and Anti-glioma Activity
2023-12-01, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-23-0424
PMID:37971169
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研究论文 | 本研究探讨了脑肿瘤免疫微环境（TIME）和嵌合抗原受体（CAR）设计对B7-H3特异性CAR T细胞抗胶质瘤活性的影响 | 研究通过转基因表达41BBL在基于CD28的CAR T细胞中，增强了治疗效果和持久性，并揭示了CAR设计对TIME的调节作用 | 尽管在体外实验中CAR设计提高了抗胶质瘤疗效，但在体内实验中并未观察到类似改善 | 旨在理解转移性免疫细胞与脑肿瘤免疫微环境之间的复杂动态关系，以开发有效的基于T细胞的免疫疗法 | B7-H3特异性CAR T细胞及其在脑肿瘤免疫微环境中的作用 | 免疫学 | 脑肿瘤 | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | CAR T细胞 | 细胞 | 使用了七种完全鼠源的B7-H3 CARs进行评估 | NA | NA | NA | NA |
| 1926 | 2024-08-04 |
Cancer-prone Phenotypes and Gene Expression Heterogeneity at Single-cell Resolution in Cigarette-smoking Lungs
2023-11-10, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-23-0195
PMID:37910161
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研究论文 | 该文章通过单细胞RNA测序技术揭示了吸烟肺部的癌症易感性表型和基因表达异质性 | 提出了两种新的单细胞元分析方法VARIED和AGED，并建立了吸烟肺部图谱，揭示了与吸烟相关的基因表达多样性和衰老差异 | 未提及研究的样本来源和潜在的外部影响因素 | 建立吸烟肺部图谱，以探究吸烟对人类肺部细胞多样性的影响 | 104个肺部单细胞RNA测序样本和相关的临床病理信息 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 104个肺部单细胞RNA测序样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1927 | 2024-08-07 |
Plasticity in airway smooth muscle differentiation during mouse lung development
2023-03-13, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.02.002
PMID:36868232
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研究论文 | 研究探讨了在小鼠肺部发育过程中，平滑肌分化对气道上皮分支形态的影响 | 发现胚胎期气道平滑肌表现出可塑性，并证实合成型平滑肌层促进气道分支形态发生 | NA | 探究平滑肌分化在肺部发育中的作用及其机制 | 小鼠胚胎肺部平滑肌分化 | NA | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | Srf基因缺失的小鼠胚胎肺部样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1928 | 2024-08-07 |
Endothelial and Leptin Receptor+ cells promote the maintenance of stem cells and hematopoiesis in early postnatal murine bone marrow
2023-03-13, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.02.003
PMID:36868235
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了出生后4天、14天和8周的小鼠骨髓基质细胞，探讨了早期新生小鼠骨髓中内皮细胞和瘦素受体阳性细胞在造血干细胞和造血维持中的作用。 | 首次详细描述了早期新生小鼠骨髓中瘦素受体阳性细胞和内皮细胞在造血干细胞和造血维持中的作用，并揭示了这些细胞表达的干细胞因子在不同造血阶段的作用。 | NA | 探究早期新生小鼠骨髓中内皮细胞和瘦素受体阳性细胞在造血干细胞和造血维持中的作用。 | 小鼠骨髓中的内皮细胞和瘦素受体阳性细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 出生后4天、14天和8周的小鼠骨髓基质细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1929 | 2024-08-04 |
Single-cell RNA-seq revealing the immune features of donor liver during liver transplantation
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1096733
PMID:36845096
|
研究论文 | 本研究揭示了肝移植过程中供体肝脏的免疫特征 | 使用单细胞RNA测序和TCR/BCR谱序列分析供体肝脏免疫细胞的表达和分布 | 样本数量较少，仅分析了三对供体肝脏的免疫特征 | 探讨肝移植过程中免疫细胞的变化及其与移植排斥反应的关联 | 三对供体肝脏的免疫细胞及其TCR/BCR谱 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和TCR/BCR谱序列 | NA | 转录组数据 | 三对供体肝脏样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1930 | 2024-08-07 |
Shared immune metabolic reprogramming between COVID-19 patients in the intensive care unit and ischemic stroke: a pilot study
2023, Archives of medical science : AMS
IF:3.0Q1
DOI:10.5114/aoms/172161
PMID:38058697
|
研究论文 | 本研究探讨了COVID-19和缺血性中风之间的共享基因特征 | 通过结合现有的批量RNA测序和单细胞RNA测序数据，更全面地理解了代谢失调的作用，并使用机器学习方法识别了潜在的诊断模型 | NA | 研究COVID-19和缺血性中风之间的共享基因特征 | COVID-19患者和缺血性中风患者 | NA | COVID-19, 缺血性中风 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | 机器学习 | RNA测序数据 | 19个上调差异表达基因和24个下调基因 | NA | NA | NA | NA |
| 1931 | 2024-08-07 |
Charting the tumor microenvironment with spatial profiling technologies
2023-12, Trends in cancer
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.trecan.2023.08.004
PMID:37673713
|
综述 | 本文综述了空间分析技术在肿瘤微环境（TME）表征中的应用及其在临床上改善癌症患者诊断和预后的潜力 | 空间分析技术能够捕捉细胞在肿瘤微环境中的复杂空间背景及其密集的相互作用网络 | 传统的单细胞RNA测序（scRNA-seq）由于需要样本解离步骤，无法捕捉细胞的空间信息 | 探讨空间分析技术在肿瘤微环境表征中的应用及其在临床上的潜在价值 | 肿瘤微环境中的细胞组织和相互作用 | NA | NA | 空间分析技术 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1932 | 2024-08-07 |
Integrative single-cell transcriptome analysis reveals immune suppressive landscape in the anaplastic thyroid cancer
2023-12, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-023-00663-6
PMID:37679527
|
研究论文 | 本研究通过综合单细胞转录组分析，揭示了间变性甲状腺癌中的免疫抑制微环境 | 首次在单细胞水平上揭示了间变性甲状腺癌与甲状腺乳头状癌的肿瘤免疫微环境及其动态变化 | NA | 深入理解间变性甲状腺癌的肿瘤免疫微环境，以改善癌症治疗和预后 | 间变性甲状腺癌和甲状腺乳头状癌的肿瘤免疫微环境 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 间变性甲状腺癌和甲状腺乳头状癌的原发性肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1933 | 2024-08-07 |
Characterization of the long noncoding RNA transcriptome in human preimplantation embryo development
2023-Dec, Journal of assisted reproduction and genetics
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10815-023-02951-4
PMID:37770818
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研究论文 | 本研究通过scRNA-seq和SUPeR-seq数据分析了人类植入前胚胎发育过程中的长非编码RNA（lncRNA）表达谱 | 研究揭示了不同发育阶段特异性和共享的高表达lncRNA，并发现这些lncRNA及其相关的超级增强子和RNA结合蛋白在胚胎发育调控中的重要作用 | NA | 旨在深入了解发育事件的转录基础 | 人类植入前胚胎发育过程中的lncRNA | NA | 不孕症 | scRNA-seq, SUPeR-seq | NA | RNA | 涉及多个发育阶段的人类植入前胚胎样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1934 | 2024-08-07 |
Exploration of a screening model for intrahepatic cholangiocarcinoma patients prone to cuproptosis and mechanisms of the susceptibility of CD274-knockdown intrahepatic cholangiocarcinoma cells to cuproptosis
2023-12, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-023-00673-4
PMID:37828105
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研究论文 | 本研究旨在探索易发生铜死亡的肝内胆管癌患者的筛查模型及CD274敲低肝内胆管癌细胞对铜死亡的易感性机制 | 首次系统全面地探索了肝内胆管癌中的铜死亡现象，构建了针对易发生铜死亡的肝内胆管癌患者的精确诊断和治疗策略 | 需要在大规模前瞻性队列中进一步验证这些结论 | 识别易发生铜死亡的肝内胆管癌患者的新诊断和治疗策略，并探索相关的细胞内和细胞外机制 | 肝内胆管癌患者及细胞 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 单样本基因集富集分析、机器学习算法 | nomogram模型 | 转录组数据 | 训练数据集255例，验证数据集包括65例、104例、78例和14例 | NA | NA | NA | NA |
| 1935 | 2024-08-07 |
Blockage of EGFR/AKT and mevalonate pathways synergize the antitumor effect of temozolomide by reprogramming energy metabolism in glioblastoma
2023-12, Cancer communications (London, England)
DOI:10.1002/cac2.12502
PMID:37920878
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研究论文 | 本研究探讨了表皮生长因子受体（EGFR）途径在脂肪酸代谢重编程和能量生成中的功能角色，并通过临床GBM样本的单细胞RNA测序和非靶向代谢组学分析，验证了代谢相关RTK-脂肪酸-基因特征。 | 本研究揭示了EGFR激活的GBM中代谢重编程的机制，并提供了一种组合治疗策略用于临床GBM管理。 | NA | 研究EGFR途径在GBM中的代谢重编程和能量生成的作用。 | 临床GBM样本，包括单细胞RNA测序和代谢组学分析。 | 数字病理学 | 脑瘤 | 单细胞RNA测序，非靶向代谢组学分析 | NA | RNA序列，代谢数据 | 临床GBM样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1936 | 2024-08-07 |
Early clonal extinction in glioblastoma progression revealed by genetic barcoding
2023-08-14, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2023.07.001
PMID:37541243
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研究论文 | 本文通过在鼠脑中转移PDGFB和遗传条形码来启动胶质瘤发生，并直接追踪胶质母细胞瘤从最早可能阶段的演化，揭示了胶质母细胞瘤早期克隆消亡的现象。 | 本文首次观察到胶质母细胞瘤早期阶段的高频率克隆消亡事件和克隆大小的渐进性分歧，并通过计算模型和转录组分析揭示了这些动态变化的原因。 | NA | 研究胶质母细胞瘤在其早期阶段的进展和演化机制。 | 胶质母细胞瘤的早期克隆消亡和演化。 | NA | 脑肿瘤 | 遗传条形码 | 计算模型 | 转录组 | 鼠脑中的胶质瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1937 | 2024-08-07 |
Stricturing Crohn's disease single-cell RNA sequencing reveals fibroblast heterogeneity and intercellular interactions
2023-Apr-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.03.534781
PMID:37066202
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，首次揭示了克罗恩病狭窄部位的纤维母细胞异质性及其细胞间相互作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术构建了克罗恩病狭窄肠道的全面图谱，并验证了CDH11作为潜在治疗靶点 | NA | 旨在通过系统层面的研究揭示克罗恩病狭窄形成的病理机制，并发现新的治疗靶点 | 克罗恩病患者的全层肠组织，包括未受累、非狭窄炎症和狭窄段以及正常非克罗恩病肠段 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | RNA | 99个组织样本和409,001个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1938 | 2024-08-07 |
The immune-metabolic crosstalk between CD3+C1q+TAM and CD8+T cells associated with relapse-free survival in HCC
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1033497
PMID:36845133
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探讨了肝细胞癌（HCC）中免疫细胞间的免疫代谢交叉对话，特别是CD3+C1q+肿瘤相关巨噬细胞（TAM）与CD8+ CCL4+T细胞之间的相互作用。 | 本研究首次鉴定了CD3+C1q+TAM这一新群体，并揭示了其通过C1q信号通路诱导的代谢和表观遗传重编程影响T细胞免疫，进而可能影响肿瘤预后。 | NA | 揭示肝细胞癌中免疫细胞间的免疫代谢交叉对话，并提供调控免疫抑制性肿瘤微环境的策略。 | 肝细胞癌（HCC）中的免疫细胞及其相互作用。 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 组织 | 配对的肿瘤和肿瘤周围组织 | NA | NA | NA | NA |
| 1939 | 2024-08-05 |
Antigen-presenting autoreactive B cells activate regulatory T cells and suppress autoimmune arthritis in mice
2023-11-06, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20230101
PMID:37695523
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研究论文 | 本研究探讨了自反应性B细胞如何激活调节性T细胞并抑制小鼠中的自身免疫性关节炎 | 揭示了自反应性B细胞通过诱导调节性T细胞扩展的新机制，并区分了它们与IL10分泌B细胞的不同 | 可能未探讨其他类型B细胞在自身免疫中角色的全面影响 | 研究自反应性B细胞在自身免疫性疾病中的作用 | 研究自反应性B细胞及其对T细胞的影响 | 免疫学 | 自身免疫性关节炎 | 单细胞测序 | NA | 生物样本 | 使用了小鼠作为样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1940 | 2024-08-07 |
Characterization of the Limbal Epithelial Stem Cell Niche
2023-10-03, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.64.13.48
PMID:37906057
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研究论文 | 本文研究了角膜缘上皮干细胞微环境的主要成分，特别是透明质酸（HA）及其复合物在维持干细胞状态中的作用 | 首次详细描述了透明质酸/重链复合物在角膜缘上皮干细胞微环境中的存在及其表达情况 | 研究主要基于小鼠模型，可能需要进一步的人体研究来验证结果 | 鉴定角膜缘上皮干细胞微环境的关键成分，特别是透明质酸特异性微环境的组成部分 | 角膜和角膜缘边缘的mRNA提取物 | NA | NA | 单细胞RNA测序、实时PCR、Western blotting、免疫组织化学 | NA | mRNA | 小鼠和人类的角膜样本 | NA | NA | NA | NA |