单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5352 篇文献，本页显示第 1901 - 1920 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1901 | 2024-08-07 |
Late fetal hematopoietic failure results from ZBTB11 deficiency despite abundant HSC specification
2023-11-14, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2022009580
PMID:37567157
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研究论文 | 本文研究了锌指和宽域、tramtrak、bric-a-brac结构域包含11（ZBTB11）转录因子在哺乳动物造血中的作用，发现Zbtb11基因缺失导致胚胎在胚胎日18.5时出现造血失败。 | 首次揭示了ZBTB11在维持造血干细胞和前体细胞成熟能力中的细胞内在需求，以及其在细胞周期调控和增殖中的作用。 | 研究主要集中在小鼠模型上，尚未探讨ZBTB11在人类造血系统中的具体作用。 | 探讨ZBTB11转录因子在哺乳动物造血系统中的作用及其对造血干细胞的影响。 | ZBTB11基因缺失的小鼠造血干细胞（HSCs）及其在胚胎发育中的表现。 | 血液学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | Zbtb11基因缺失的小鼠胚胎及对照组 |
| 1902 | 2024-08-07 |
A single-cell atlas of the aging murine ovary
2023-Sep-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.29.538828
PMID:37162983
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research paper | 本研究通过单细胞RNA测序分析了年轻和老年小鼠卵巢组织的转录组变化，揭示了卵巢衰老过程中的细胞和分子机制 | 首次提供了衰老小鼠卵巢的单细胞图谱，识别了卵巢衰退的早期驱动因素 | 研究仅限于小鼠模型，结果的临床相关性需进一步验证 | 填补关于衰老卵巢转录组变化的综合细胞图谱的空白 | 年轻和老年小鼠的卵巢组织 | digital pathology | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 年轻（3个月大）和老年（9个月大）小鼠的卵巢组织 |
| 1903 | 2024-08-07 |
A single-cell CRISPRi platform for characterizing candidate genes relevant to metabolic disorders in human adipocytes
2023-09-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00148.2023
PMID:37486064
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研究论文 | 本文利用CROP-Seq技术，结合CRISPR干扰和单细胞RNA测序，研究了人类脂肪细胞中的脂肪形成和脂肪细胞生物学 | 开发了一种强大的无假设工具，用于识别与代谢疾病相关的脂肪形成、前脂肪细胞和脂肪细胞功能的新调节因子 | 确定因果基因及其在代谢中的作用机制是一个耗时的过程 | 研究与代谢疾病相关的候选基因在人类脂肪细胞中的作用 | 人类前脂肪细胞SGBS细胞系和脂肪细胞 | 基因组学 | 代谢疾病 | CRISPR干扰、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 超过400个差异表达基因在至少一个时间点被识别 |
| 1904 | 2024-08-07 |
deCS: A Tool for Systematic Cell Type Annotations of Single-cell RNA Sequencing Data among Human Tissues
2023-04, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2022.04.001
PMID:35470070
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研究论文 | 本文介绍了一种名为deCS的自动细胞类型注释方法，该方法结合了人类细胞类型表达谱和标记基因，用于单细胞RNA测序数据的系统细胞类型注释 | deCS显著减少了计算时间并提高了注释准确性，能够集成到标准的单细胞RNA测序分析流程中，增强细胞类型注释 | NA | 构建一个全面的人类细胞类型参考图谱，并开发一种自动细胞类型注释方法 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型注释 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 51个人类复杂性状 |
| 1905 | 2024-08-07 |
Single-Cell Transcriptome Analysis of Acute Myeloid Leukemia Cells Using Methanol Fixation and Cryopreservation
2023-Dec-20, Diseases (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/diseases12010001
PMID:38275564
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研究论文 | 本研究通过甲醇固定和低温保存的方法，对急性髓系白血病细胞进行单细胞转录组分析 | 提出甲醇固定法作为常规临床使用的替代方法，用于获取难以活检的细胞进行单细胞RNA测序 | 观察到甲醇固定超过一年后会出现遗传性退化 | 探讨甲醇固定法在急性髓系白血病细胞单细胞转录组分析中的应用及其效果 | 急性髓系白血病细胞 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 两个急性髓系白血病样本 |
| 1906 | 2024-08-05 |
Bibliometric and visual analysis of single-cell sequencing from 2010 to 2022
2023, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2023.1285599
PMID:38274109
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研究论文 | 本文对2010年至2022年间单细胞测序相关研究进行了文献计量和视觉分析 | 首次通过文献计量软件绘制出单细胞测序研究的发展趋势图 | 缺乏对单细胞测序相关研究的全面和公正分析 | 旨在通过文献计量方法分析单细胞测序的研究状态和趋势 | 对2010年至2022年间的相关文献进行分析 | 数字病理学 | NA | 文献计量 | NA | 文献 | 9,929篇 |
| 1907 | 2024-08-05 |
Identification of a novel, MSC-induced macrophage subtype via single-cell sequencing: implications for intervertebral disc degeneration therapy
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1286011
PMID:38274272
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序识别了在缺氧条件下由间充质干细胞（MSC）诱导的独特巨噬细胞亚型，可能对椎间盘退变治疗具有重要意义 | 本文章创新性在于发现缺氧条件下MSC诱导的独特巨噬细胞亚群，揭示了MSC如何通过调节巨噬细胞表型影响椎间盘退变 | 研究局限性在于未能全面分离因缺氧影响而产生的所有调节因子 | 研究的目的在于探讨间充质干细胞对巨噬细胞的影响及其在椎间盘退变中的潜在治疗作用 | 研究对象为人类骨髓来源的巨噬细胞及间充质干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞培养和基因表达数据 | 实验使用了人类骨髓来源的STRO3 MSCs和巨噬细胞 |
| 1908 | 2024-08-07 |
PIM kinases regulate early human Th17 cell differentiation
2023-12-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113469
PMID:38039135
|
研究论文 | 本研究探讨了PIM激酶家族在人类Th17细胞分化早期的转录基因调控中的作用 | 首次全面研究了PIM1、PIM2和PIM3在人类Th17细胞分化早期的分子功能 | NA | 探讨PIM激酶在人类Th17细胞分化中的作用及其与自身免疫表型的关联 | PIM激酶家族及其在Th17细胞分化中的调控作用 | 免疫学 | 自身免疫病 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA |
| 1909 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing uncovers the cell type-dependent transcriptomic changes in the retrosplenial cortex after peripheral nerve injury
2023-12-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113551
PMID:38048224
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了外周神经损伤后后侧皮质（RSC）的细胞类型依赖性转录组变化 | 首次揭示了RSC在疼痛调节中的作用，并展示了通过化学遗传学方法减少特定神经元活动可以缓解神经损伤引起的疼痛 | NA | 探究外周神经损伤后RSC在疼痛调节中的作用及其分子机制 | 小鼠的RSC在神经损伤后的转录组变化 | 数字病理学 | 神经病理性疼痛 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
| 1910 | 2024-08-07 |
SPIDE: A single cell potency inference method based on the local cell-specific network entropy
2023-12, Methods (San Diego, Calif.)
DOI:10.1016/j.ymeth.2023.11.006
PMID:37952704
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研究论文 | 本文提出了一种基于细胞特异性网络熵的单细胞潜能推断方法SPIDE，通过引入局部加权细胞特异性网络来保持细胞异质性，并结合基因表达与网络结构计算熵值 | SPIDE方法通过引入局部加权细胞特异性网络，有效解决了现有方法中由于scRNA-seq数据不准确交互和噪声导致的推断不准确问题 | NA | 旨在准确推断单细胞RNA-seq数据中的细胞分化潜能 | 单细胞RNA-seq数据中的细胞分化潜能 | 生物信息学 | 结直肠癌 | scRNA-Seq | NA | 基因表达数据 | 八个scRNA-Seq数据集 |
| 1911 | 2024-08-05 |
Hypoxia-sensitive cells trigger NK cell activation via the KLF4-ASH1L-ICAM-1 axis, contributing to impairment in the rat epididymis
2023-11-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113442
PMID:37952156
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研究论文 | 该研究探讨了缺氧对大鼠附睾细胞的影响及其在不孕症中的作用 | 首次识别了缺氧敏感的附睾细胞，并阐明了通过KLF4-ASH1L-ICAM-1轴激活自然杀伤细胞的机制 | 研究主要在大鼠模型中进行，未必能完全适用于人类 | 探讨缺氧环境对附睾功能和不孕症的影响 | 大鼠附睾细胞在不同氧气条件下的变化 | 数字病理学 | 不孕症 | 单细胞转录组学 | NA | 细胞数据 | NA |
| 1912 | 2024-08-05 |
Single-cell analysis of multiple invertible promoters reveals differential inversion rates as a strong determinant of bacterial population heterogeneity
2023-08-04, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adg5476
PMID:37540747
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研究论文 | 本文研究了细菌种群异质性的一个重要机制，即可逆启动子的差异反转率。 | 揭示了通过组合性启动子反转生成的显著种群异质性，并表明反转率的差异在种群动态中起主要作用。 | 研究中可能未涵盖所有类型的微生物，局限于特定的细菌种群及其环境。 | 研究细菌种群异质性的机制及其对细菌适应性的影响。 | 以人类肠道共生细菌为研究对象，分析启动子反转对种群异质性的影响。 | 微生物学 | NA | 单细胞高通量测序 | 随机计算模型 | 基因组数据 | NA |
| 1913 | 2024-08-05 |
Exploring distinct properties of endometrial stem cells through advanced single-cell analysis platforms
2023-12-20, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-023-03616-w
PMID:38124100
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综述 | 本研究综述了先进的单细胞分析技术在子宫内膜干细胞研究中的应用 | 介绍了单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序和空间转录组学等新技术在识别和表征子宫内膜干细胞群体方面的创新 | 现有技术仍存在许多需要改进的技术局限性 | 探索子宫内膜干细胞在相关疾病中的重要性 | 子宫内膜干细胞及其在月经周期和分化过程中的动态变化 | 数字病理 | 子宫内膜疾病 | 单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序，空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 1914 | 2024-08-07 |
PD-L1 expression levels in mesenchymal stromal cells predict their therapeutic values for autoimmune hepatitis
2023-12-18, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-023-03594-z
PMID:38111045
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研究论文 | 本研究探讨了间充质基质细胞中PD-L1表达水平对其治疗自身免疫性肝炎疗效的预测作用 | 首次揭示了PD-L1表达水平与间充质基质细胞治疗自身免疫性肝炎疗效之间的正相关关系 | 研究仅限于从58个人类供体中分离的Wharton's jelly衍生的间充质基质细胞，且使用小鼠模型进行验证 | 探索间充质基质细胞中PD-L1表达水平作为选择治疗自身免疫性肝炎最佳细胞的指标 | 间充质基质细胞（MSCs）及其在自身免疫性肝炎治疗中的应用 | NA | 自身免疫性疾病 | 转录组和单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 58个不同供体来源的Wharton's jelly衍生的间充质基质细胞 |
| 1915 | 2024-08-05 |
Imputation for Single-cell RNA-seq Data with Non-negative Matrix Factorization and Transfer Learning
2023-Dec, Journal of bioinformatics and computational biology
IF:0.9Q4
DOI:10.1142/S0219720023500294
PMID:38248911
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研究论文 | 提出了一种集成非负矩阵分解和迁移学习的单细胞RNA-seq数据插补方法 | 该方法通过结合额外的数据集借用基因表达信息，并在分解矩阵中添加图正则化项，有效提升了表达值的估计准确性 | NA | 探索单细胞RNA-seq数据中的稀疏性问题并改进数据插补方法 | 单细胞RNA-seq数据 | 数字病理学 | NA | 非负矩阵分解和迁移学习 | NA | RNA-seq数据 | NA |
| 1916 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics of human traumatic brain injury reveals activation of endogenous retroviruses in oligodendroglia
2023-11-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113395
PMID:37967557
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研究论文 | 本研究揭示了创伤性脑损伤中寡突胶质细胞内源性逆转录病毒的激活。 | 本研究首次展示了在创伤性脑损伤后寡突胶质细胞在神经炎症中的重要作用和内源性逆转录病毒的转录上调。 | 该研究的限制包括其结果基于急性样本，可能无法完全代表长期的神经反应。 | 本研究旨在探讨创伤性脑损伤后神经炎症反应的启动事件。 | 研究对象为人类脑组织中不同细胞群体的转录组变化。 | 数字病理学 | NA | 单核RNA测序 (snRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 人类脑组织样本，具体数量未提及 |
| 1917 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics identifies a WNT7A-FZD5 signaling axis that maintains fallopian tube stem cells in patient-derived organoids
2023-11-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113354
PMID:37917586
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研究论文 | 该研究揭示了WNT7A-FZD5信号轴在患者衍生的类器官中维持输卵管干细胞的作用 | 研究首次通过优化的类器官培养条件深入表征了输卵管干细胞及其自我更新的分子要求 | 研究中对输卵管干细胞的知识仍有限，且模型可能无法完全模拟生理状态 | 揭示输卵管干细胞的功能及其在健康和疾病中的作用 | 输卵管干细胞及其在类器官中的表现 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 1918 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing-guided fate-mapping toolkit delineates the contribution of yolk sac erythro-myeloid progenitors
2023-11-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113364
PMID:37922312
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术分析了卵黄囊中的红系髓系前体细胞（EMPs）的异质性，并建立了多种命运图谱工具来追踪不同EMP亚群的贡献 | 首次详细描述了卵黄囊EMPs的异质性，并利用单细胞RNA测序技术建立了命运图谱工具来追踪其贡献 | NA | 阐明卵黄囊EMPs在胚胎发育至成年阶段的贡献 | 卵黄囊中的红系髓系前体细胞（EMPs）及其亚群 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个卵黄囊EMP亚群 |
| 1919 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics of the ocular anterior segment: a comprehensive review
2023-11, Eye (London, England)
DOI:10.1038/s41433-023-02539-3
PMID:37138096
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综述 | 本文全面回顾了眼前节的单细胞转录组学，探讨了相关技术和应用 | 提供了眼前节相关的单细胞RNA测序数据集的概述，并强调了其在靶向治疗中的重要性 | 技术限制及目前大部分研究集中在视网膜组织上 | 阐明眼组织的细胞和遗传组成，以揭示眼病的病理生理机制 | 主要研究眼前节相关的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 1920 | 2024-08-07 |
miR-126 identifies a quiescent and chemo-resistant human B-ALL cell subset that correlates with minimal residual disease
2023-10, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-023-02009-5
PMID:37640845
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研究论文 | 研究探讨了微小RNA-126（miR-126）在B细胞急性淋巴细胞白血病（B-ALL）中的作用，发现miR-126高表达的细胞亚群具有化疗抵抗和静止状态的特征，与最小残留病相关。 | 首次揭示了miR-126在B-ALL中的作用，及其与化疗抵抗和疾病持续的关系。 | 研究主要基于患者来源的异种移植模型，可能与临床实际情况存在差异。 | 探究miR-126在B-ALL中的作用及其与化疗抵抗和疾病持续的关系。 | B细胞急性淋巴细胞白血病细胞及其亚群。 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 8/9个患者来源的异种移植模型，多个成人和儿童B-ALL队列。 |