单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5350 篇文献，本页显示第 1881 - 1900 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1881 | 2024-08-07 |
Lysyl oxidase regulates epithelial differentiation and barrier integrity in eosinophilic esophagitis
2023-Mar-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.27.534387
PMID:37034590
|
研究论文 | 本文研究了赖氨酰氧化酶（LOX）在嗜酸性食管炎（EoE）中调控上皮细胞分化和屏障完整性的功能 | 首次揭示了LOX在食管上皮细胞中的非经典信号分子作用，通过激活骨形态发生蛋白（BMP）途径维持上皮稳态 | NA | 探究LOX在嗜酸性食管炎中对上皮细胞分化和屏障完整性的调控作用 | 人食管上皮细胞 | NA | 嗜酸性食管炎 | 单细胞RNA测序，定量逆转录-聚合酶链反应，蛋白质印迹，组织学 | NA | RNA | 患者来源的类器官 | NA | NA | NA | NA |
| 1882 | 2024-08-04 |
IL-21R signal reprogramming cooperates with CD40 and BCR signals to select and differentiate germinal center B cells
2023-02-24, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.add1823
PMID:36800413
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研究论文 | 本文研究了IL-21R信号如何与CD40和BCR信号共同作用，选择并分化生发中心B细胞 | 发现IL-21R与CD40信号的协同作用引导生发中心B细胞（GCBCs）走向特定命运，揭示了第二条正选择通路 | 研究主要基于体外和体内的细胞分选和转录组测序，可能未能完全模拟体内复杂的微环境 | 阐明IL-21R信号在生发中心B细胞命运决定中的作用 | 生发中心B细胞，特别是受IL-21R和CD40共同信号影响的细胞 | 免疫学 | NA | RNA测序，单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | 细胞，转录组数据 | 具体细胞数量未在摘要中提供 | NA | NA | NA | NA |
| 1883 | 2024-08-07 |
Tumor-derived Endothelial Cell: Important Etiological Factors in Endometriosis
2023-11, Archives of medical research
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.arcmed.2023.102891
PMID:37738888
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术构建了子宫内膜异位症细胞的转录组特征，并分析了肿瘤来源的内皮细胞在疾病中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了子宫内膜异位症中细胞异质性，并发现了肿瘤来源内皮细胞在疾病中的重要作用 | 研究样本量较小，且仅包括了三名患者，可能影响结果的普遍性 | 探究子宫内膜异位症中肿瘤来源内皮细胞的作用及其病理特征 | 子宫内膜异位症患者的异位和正常子宫内膜组织 | 数字病理学 | 妇科疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 三名子宫内膜异位症患者，包括114例回顾性病例 | NA | NA | NA | NA |
| 1884 | 2024-08-07 |
DOT1L regulates lung developmental epithelial cell fate and adult alveolar stem cell differentiation after acute injury
2023-09-12, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2023.07.006
PMID:37595582
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研究论文 | 研究探讨了DOT1L在肺发育和急性损伤后成年肺泡干细胞分化中的调控作用 | 首次发现DOT1L是AT2细胞生长和分化的调控因子，并揭示了Dot1l失活后AT2细胞的新状态 | NA | 识别控制肺AT2-AT1再生反应的表观遗传途径 | 肺AT2细胞和AT1细胞的分化 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1885 | 2024-08-04 |
Temporal and spatial staging of lung alveolar regeneration is determined by the grainyhead transcription factor Tfcp2l1
2023-05-30, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112451
PMID:37119134
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研究论文 | 本研究探讨了转录因子Tfcp2l1在肺泡再生过程中对细胞命运的调控作用 | 本研究揭示了Tfcp2l1在肺泡AT2细胞自我更新与分化中的时间和空间调控功能 | 本研究主要基于小鼠模型，可能限制了其在其他物种中的适用性 | 探讨Tfcp2l1在肺泡再生过程中的作用及其机制 | 焦点是肺泡上皮2型（AT2）细胞及其在再生过程中的行为 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞数据 | 通过小鼠进行的多次实验和细胞追踪 | NA | NA | NA | NA |
| 1886 | 2024-08-04 |
Patient-Induced Pluripotent Stem Cell-Derived Hepatostellate Organoids Establish a Basis for Liver Pathologies in Telomeropathies
2023, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2023.06.003
PMID:37302654
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研究论文 | 研究利用患者诱导多能干细胞衍生的肝星状细胞类器官探讨端粒病中的肝脏病理机制 | 首次利用同源诱导多能干细胞衍生的类器官模型建立端粒病相关肝病的研究基础 | 尚未明确端粒功能障碍引发肝病的具体机制 | 探索端粒病中肝脏病理的机制 | 利用人类诱导多能干细胞研究有端粒病突变的肝脏细胞 | 数字病理学 | 端粒病 | CRISPR/Cas9 | 类器官 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1887 | 2024-08-07 |
Integrative analysis implicates the significance of m6A in the liver fibrosis of biliary atresia by regulating THY1
2023-01-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000004
PMID:36633486
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研究论文 | 本研究全面评估了m6A在胆道闭锁（BA）中的表达情况，并探讨了m6A通过调控THY1在BA引起的肝纤维化中的作用 | 首次揭示了m6A在BA中的重要作用，并提出了通过靶向m6A/THY1轴来缓解BA引起的肝纤维化的新疗法 | NA | 探讨m6A在胆道闭锁肝纤维化中的作用及其调控机制 | m6A在胆道闭锁中的表达及其对THY1的调控作用 | 数字病理学 | 胆道疾病 | 甲基化RNA免疫沉淀测序（MeRIP-seq） | NA | RNA序列 | 涉及大量阵列（GSE46960, GSE15235）和单细胞RNA测序（GSE136103）数据，以及体外培养的LX-2细胞和原代HSCs | NA | NA | NA | NA |
| 1888 | 2024-08-07 |
Generation of Atp6v1g3-Cre mice for investigation of intercalated cells and the collecting duct
2023-12-01, American journal of physiology. Renal physiology
DOI:10.1152/ajprenal.00137.2023
PMID:37823193
|
研究论文 | 本研究通过CRISPR/CAS技术生成了Atp6v1g3-Cre小鼠，用于研究肾间质细胞和集合管 | 开发了一种新的Atp6v1g3-Cre报告小鼠模型，该模型在肾脏细胞中具有高度特异性，且在其他器官中表达极少或无表达 | NA | 研究肾间质细胞在肾脏先天免疫功能中的作用 | 肾间质细胞和集合管 | NA | 肾脏感染、酸碱失衡和急性肾损伤 | CRISPR/CAS技术 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1889 | 2024-08-04 |
Spatial Transcriptomics of Intraductal Papillary Mucinous Neoplasms of the Pancreas Identifies NKX6-2 as a Driver of Gastric Differentiation and Indolent Biological Potential
2023-08-04, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-22-1200
PMID:37285225
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组技术揭示了胰腺导管内乳头状粘液性肿瘤的转录因子NKX6-2对胃部分化和温和生物学潜力的影响 | 首次发现NKX6-2是推动IPMN温和胃部分化的转录因子 | 研究中未详细探讨NKX6-2在其他癌症类型中的作用 | 旨在探讨IPMN中的胃部分化的分子基础 | 以一组胰腺导管内乳头状粘液性肿瘤为研究对象 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间转录组技术 | 小鼠IPMN模型 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1890 | 2024-08-04 |
Single-cell RNA-seq reveals alterations in peripheral CX3CR1 and nonclassical monocytes in familial tauopathy
2023-07-18, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-023-01205-3
PMID:37464408
|
研究论文 | 这篇文章揭示了携带MAPT致病变异的家族性tau病患者在外周单核细胞中CX3CR1和非经典单核细胞的变化 | 首次系统地分析了人类外周免疫细胞在tau病理变化下的表达和丰度，特别关注CX3CR1和非经典单核细胞 | 样本量较小，仅包括8名变异携带者和8名健康对照，可能影响结果的普遍性 | 研究tau病理对人类外周免疫系统的影响 | 来自MAPT致病变异携带者和健康对照的外周血单核细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 音乐 | 16个样本（8个病变携带者和8个健康对照） | NA | NA | NA | NA |
| 1891 | 2024-08-04 |
A Comprehensive narrative review of transcriptomics and epigenomics of gallbladder cancer
2023-Jan-01, Journal of cancer research and therapeutics
IF:1.4Q4
DOI:10.4103/jcrt.jcrt_1823_23
PMID:38384011
|
review | 本综述分析了胆囊癌的转录组学和表观基因组学研究 | 该文章通过对2010年至2023年间已发布的高通量测序研究的分析，揭示了胆囊癌的基因与表观基因特征 | 当前研究基于已发布的文献，可能会有限制于数据的可用性和质量 | 研究胆囊癌的分子机制，开发诊断生物标志物和靶向治疗方法 | 胆囊癌相关的转录组和表观基因组特征 | 数字病理学 | 胆囊癌 | 下一代测序（NGS），RNA测序，单细胞测序，微阵列技术 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1892 | 2024-08-04 |
Single-Cell Sequencing of Lung Macrophages and Monocytes Reveals Novel Therapeutic Targets in COPD
2023-12-05, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12242771
PMID:38132091
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研究论文 | 本研究确定了COPD患者肺部巨噬细胞和单核细胞的特征，并识别了新型治疗靶点 | 首次明确了COPD患者肺部巨噬细胞和单核细胞的转录特征，为寻找新的治疗靶点提供了依据 | 样本量相对较小，可能限制了研究结果的广泛适用性 | 探索COPD患者肺部巨噬细胞和单核细胞在炎症过程中的作用 | COPD患者和对照组人类肺组织中的巨噬细胞和单核细胞 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 (COPD) | RNA测序 | NA | 转录组数据 | COPD患者18个样本和对照组28个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1893 | 2024-08-07 |
Pooled Genome-Scale CRISPR Screens in Single Cells
2023-11-27, Annual review of genetics
IF:8.7Q1
|
review | 本文综述了单细胞水平上基于CRISPR的基因筛选技术的原理和实际考虑 | 介绍了利用CRISPR-Cas技术在单细胞中进行基因功能调控和表达控制的创新方法 | NA | 探讨基因功能分配和表达控制的基础，以及其在细胞生物学和治疗开发中的应用 | 基因功能和表达控制 | 基因编辑 | NA | CRISPR-Cas | NA | RNA sequencing, 细胞图像 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1894 | 2024-08-07 |
IL-11 induces NLRP3 inflammasome activation in monocytes and inflammatory cell migration to the central nervous system
2023-06-27, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2221007120
PMID:37339207
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研究论文 | 本研究探讨了IL-11诱导的炎症细胞向中枢神经系统迁移的机制 | 首次报道IL-11在复发缓解型多发性硬化症患者中增加，并通过αIL-11 mAb治疗减少炎症和脱髓鞘 | NA | 研究IL-11诱导的炎症细胞向中枢神经系统迁移的机制 | IL-11在复发缓解型多发性硬化症患者中的作用及其治疗潜力 | NA | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括复发缓解型多发性硬化症患者和健康对照者的外周血单个核细胞及脑脊液细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1895 | 2024-08-04 |
Characterization of the Doublesex/MAB-3 transcription factor DMD-9 in Caenorhabditis elegans
2023-02-09, G3 (Bethesda, Md.)
DOI:10.1093/g3journal/jkac305
PMID:36454093
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研究论文 | 本文对秀丽隐杆线虫中的DMD-9转录因子的表达模式和功能进行了表征 | 识别了DMD-9在神经元中的细胞特异性调控及其可能的性别二态性角色 | 在dmd-9突变体中未能观察到DMD-9表达神经元介导的行为缺陷 | 研究DMD-9在秀丽隐杆线虫中的表达模式及其作用 | 主要研究对象为秀丽隐杆线虫的DMD-9转录因子和相关神经元 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | RNA表达数据 | 22种神经细胞命运报告基因 | NA | NA | NA | NA |
| 1896 | 2024-08-07 |
Gut microbiome dysbiosis in men who have sex with men increases HIV infection risk through immunity homeostasis alteration
2023, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2023.1260068
PMID:38035339
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研究论文 | 本研究旨在比较HIV感染者与男男性行为者（MSM）肠道微生物群变化的差异，并揭示MSM相关肠道微生物群失调对免疫系统的影响 | 本研究首次揭示了MSM相关肠道微生物群失调通过影响免疫稳态增加HIV感染风险 | 需要进一步研究阐明MSM肠道微生物群失调调节HIV易感性的机制 | 比较HIV感染者与MSM肠道微生物群变化的差异，并揭示MSM相关肠道微生物群失调对免疫系统的影响 | HIV感染者与男男性行为者（MSM）的肠道微生物群 | NA | HIV感染 | 生物信息学技术，单细胞RNA测序数据分析 | NA | 基因和代谢物数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 1897 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals common and unique gene expression profiles in primary CD4+ T cells latently infected with HIV under different conditions
2023, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2023.1286168
PMID:38156317
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了在不同条件下潜伏感染HIV的CD4+ T细胞的基因表达谱 | 研究揭示了在不同条件下潜伏感染HIV的CD4+ T细胞的共同和独特基因表达模式 | NA | 识别潜伏感染HIV的单个CD4+ T细胞的基因表达谱，并探索这些基因表达谱以优先考虑未来实验验证的基因 | 潜伏感染HIV的CD4+ T细胞 | 数字病理学 | HIV | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1898 | 2024-08-07 |
Pyroptosis-Related Subtypes Predict the Response of Clear Cell Renal Cell Carcinoma to Targeted Therapy
2023-12-08, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/j.fbl2812334
PMID:38179741
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研究论文 | 本研究基于焦亡相关基因的共识聚类对透明细胞肾细胞癌（ccRCC）进行分子分型，并探讨其对靶向治疗的反应预测 | 首次揭示了焦亡相关基因在ccRCC中的作用，并基于此开发了预测ccRCC对靶向治疗反应的分子亚型 | NA | 探讨焦亡在透明细胞肾细胞癌进展中的作用，并开发个性化治疗策略 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC） | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序，CIBERSORT分析，Lasso回归 | NA | 基因组，转录组，蛋白质 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1899 | 2024-08-07 |
Transcriptional diversity in specific synaptic gene sets discriminates cortical neuronal identity
2023-05-09, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-023-00372-y
PMID:37161421
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研究论文 | 本文通过结合SynGO数据库和单细胞RNA测序数据，研究了小鼠新皮质中神经元细胞类型的转录多样性，并展示了通过突触基因可以有效区分细胞类型。 | 首次系统地识别了大脑中所有突触群体的转录多样性，并发现突触基因在区分细胞类型方面与所有基因具有相同的能力。 | NA | 量化并识别神经元细胞类型的特定突触特征。 | 小鼠新皮质中的神经元细胞类型。 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 小鼠新皮质中的所有突触群体 | NA | NA | NA | NA |
| 1900 | 2024-08-07 |
A Comparison of the Various Methods for Selecting Features for Single-Cell RNA Sequencing Data in Alzheimer's Disease
2023, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-031-31982-2_27
PMID:37486500
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研究论文 | 本文比较了用于阿尔茨海默病中单细胞RNA测序数据特征选择的不同方法 | 本文采用了专门为单细胞RNA测序设计的特征选择算法，并将其应用于阿尔茨海默病的研究 | NA | 研究旨在评估和比较不同标记基因选择方法在阿尔茨海默病中的性能 | 阿尔茨海默病中的单细胞RNA测序数据 | 生物医学研究 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 支持向量机 (SVM), k-最近邻算法 (k-NN), 线性判别分析 (LDA) | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |