单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5351 篇文献，本页显示第 1881 - 1900 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1881 | 2024-08-07 |
Single-cell map of dynamic cellular microenvironment of radiation-induced intestinal injury
2023-12-09, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-023-05645-w
PMID:38071238
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，描绘了辐射诱导肠道损伤（RIII）及其再生过程中肠道微环境的动态变化图谱 | 揭示了肠道不同细胞类型的异质性辐射敏感性，以及肠道干细胞（ISCs）的动态变化模式和细胞间的复杂转换模式 | NA | 探究辐射诱导肠道损伤及其再生过程中肠道微环境的动态变化 | 肠道微环境中的细胞类型及其在辐射损伤后的动态变化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
| 1882 | 2024-08-05 |
Iron inhibits glioblastoma cell migration and polarization
2023-12, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202202157RR
PMID:37983646
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研究论文 | 这篇文章探讨了铁如何影响胶质母细胞瘤细胞的迁移能力和极性。 | 本研究首次系统性地调查了细胞内铁含量对胶质母细胞瘤细胞迁移能力的影响。 | 该研究未能全面探讨铁对胶质母细胞瘤细胞其他生物学特性的影响。 | 研究细胞内铁含量对胶质母细胞瘤细胞迁移及极性建立的影响。 | 人类胶质母细胞瘤细胞及其在肿瘤微环境中的行为。 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 使用了人类胶质母细胞瘤样本的单细胞RNA-seq数据集 |
| 1883 | 2024-08-05 |
Integrative Proteomics and N-Glycoproteomics Analyses of Rheumatoid Arthritis Synovium Reveal Immune-Associated Glycopeptides
2023-05, Molecular & cellular proteomics : MCP
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.mcpro.2023.100540
PMID:37019382
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研究论文 | 本研究首次呈现了类风湿关节炎滑膜的N-糖蛋白组，描述了与免疫相关的糖基化 | 通过完整N-糖肽的定量策略，识别了RA滑膜中的1260个完整N-糖肽，揭示了糖基化与免疫反应之间的关联 | 对滑膜组织的深入糖蛋白组学分析仍然不足 | 研究N-糖蛋白组在类风湿关节炎中的作用及其与免疫反应的关联 | 类风湿关节炎滑膜中的N-糖蛋白和免疫细胞类型 | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | 蛋白质组学，N-糖蛋白组学 | NA | 蛋白质数据 | 334个糖蛋白中的481个N-糖位点 |
| 1884 | 2024-08-07 |
A novel lncRNA-mediated epigenetic regulatory mechanism in periodontitis
2023, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.87977
PMID:37928259
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研究论文 | 本研究探讨了长非编码RNA lncR-APDC在牙周炎进展中的调控作用 | 发现了lncR-APDC沉默后牙周炎模型中独特的上皮细胞亚群和显著升高的表达水平，为牙周炎的表观遗传调控提供了新视角 | NA | 理解lncR-APDC在牙周炎进展中的调控作用 | lncR-APDC基因敲除小鼠和诱导的实验性牙周炎模型 | NA | 牙周炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | lncR-APDC基因敲除小鼠和牙周炎牙龈组织 |
| 1885 | 2024-08-07 |
Metastases and treatment-resistant lineages in patient-derived cancer cells of colorectal cancer
2023-11-24, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-023-05562-y
PMID:37996567
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研究论文 | 本研究旨在揭示结直肠癌中促进转移的关键细胞，并识别治疗抵抗的细胞谱系 | 首次使用EGFP表达的类器官在二维培养中研究POU5F1表达细胞的转移促进能力和治疗抵抗性 | 研究主要集中在体外实验和动物模型中，尚未在临床试验中验证 | 揭示结直肠癌中促进转移的关键细胞和治疗抵抗的细胞谱系 | 结直肠癌患者的循环肿瘤细胞和类器官 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 涉及多个临床患者的血液样本和类器官 |
| 1886 | 2024-08-07 |
Single-cell and spatial architecture of primary liver cancer
2023-11-20, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-023-05455-0
PMID:37985711
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序、空间转录组学和批量多组学技术，详细阐述了三种原发性肝癌（肝细胞癌、肝内胆管癌和混合型肝细胞-胆管癌）的分子结构 | 揭示了混合型肝细胞-胆管癌细胞内部不一致的表型，以及肝内胆管癌和肝细胞癌的特定肿瘤特征，并发现了肿瘤-肿瘤周围交界区存在的多种中间状态细胞 | NA | 探索原发性肝癌的同质性和异质性，并揭示其分子特征 | 原发性肝癌的三种类型：肝细胞癌、肝内胆管癌和混合型肝细胞-胆管癌 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、多组学 | NA | 转录组数据 | 三种原发性肝癌类型的样本 |
| 1887 | 2024-08-07 |
scMD: cell type deconvolution using single-cell DNA methylation references
2023-Aug-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.03.551733
PMID:37577715
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研究论文 | 本文介绍了scMD框架，用于从组织级别的DNA甲基化数据中可靠地估计细胞类型比例 | scMD框架通过统计方法聚合单细胞DNA甲基化数据，识别细胞类型标记的DNA甲基化位点，并创建精确的细胞类型签名矩阵，超越了现有的排序细胞或RNA衍生的参考 | 当前的单细胞DNA甲基化序列仅代表每个单细胞全基因组的一小部分，并且检测到的区域在细胞间不同，这使得单细胞DNA甲基化数据具有超高维度和超稀疏性 | 开发一种新的细胞类型反卷积框架，以从组织级别的DNA甲基化数据中估计细胞类型比例 | 单细胞DNA甲基化数据和组织级别的DNA甲基化数据 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞DNA甲基化 | NA | DNA甲基化数据 | 多个数据集 |
| 1888 | 2024-08-05 |
Single-cell analysis reveals the stromal dynamics and tumor-specific characteristics in the microenvironment of ovarian cancer
2023-Jun-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.07.544095
PMID:37333262
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研究论文 | 该文章揭示了高等级浆液性卵巢癌微环境中的基质动态和肿瘤特征 | 通过单细胞转录组学揭示了高基质与低基质肿瘤中免疫和非免疫细胞的独特转录组景观 | 仅基于公共和内部数据集的分析，可能缺乏多样性和广泛的适用性 | 研究高等级浆液性卵巢癌微环境中基质的作用和特征 | 高等级浆液性卵巢癌中的基质细胞及其与免疫细胞的相互作用 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 1889 | 2024-08-07 |
Mesenchymal stem cells ameliorate inflammation in an experimental model of Crohn's disease via the mesentery
2023-May-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.05.22.541829
PMID:37292753
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研究论文 | 研究了人骨髓间充质干细胞（hMSC）在慢性小肠炎症模型中治疗克罗恩病的效果及其机制 | 首次探讨了hMSC在慢性炎症模型中的长期疗效，并通过单细胞RNA测序证实了其通过巨噬细胞重编程发挥作用的机制 | NA | 探讨hMSC在克罗恩病治疗中的作用机制 | 人骨髓间充质干细胞（hMSC）及其在慢性小肠炎症模型中的治疗效果 | NA | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序（Sc-RNAseq） | NA | 单细胞RNA | NA |
| 1890 | 2024-08-05 |
Brain and blood single-cell transcriptomics in acute and subacute phases after experimental stroke
2023-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.31.535150
PMID:37066298
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研究论文 | 该文章研究了急性和亚急性中风后脑部和血液的单细胞转录组学 | 首次系统性分析了中风后免疫细胞亚群的时序动态和多样性，揭示了脑内浸润的白细胞和循环白细胞的转录组差异 | 对小鼠中风后的免疫细胞多样性尚不完全了解，且研究可能不适用于人类 | 了解中风后的免疫细胞反应及其在组织损伤和修复中的作用 | 小鼠的脑细胞和血液白细胞 | 数字病理学 | 脑卒中 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 小鼠，分别在中风后2天和14天收集样本 |
| 1891 | 2024-08-05 |
Astroglial toxicity promotes synaptic degeneration in the thalamocortical circuit in frontotemporal dementia with GRN mutations
2023-03-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI164919
PMID:36602862
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研究论文 | 这篇文章揭示了在有GRN突变的额叶前额叶痴呆中，星形胶质细胞的毒性促进了丘脑皮层回路的突触退化 | 本研究首次揭示了一种在FTLD-GRN中未被充分认识的星形胶质细胞病理过程，揭示了其在神经退行性病理中的关键机制 | 尽管该研究通过小鼠和人类患者的单细胞转录组学进行了比较，但仍需更多临床数据验证 | 探讨GRN突变引起的星形胶质细胞毒性如何影响丘脑皮层回路中的突触退化 | 该研究对象包括Grn-/-小鼠和FTLD-GRN患者的丘脑和额叶皮层 | 数字病理学 | 额叶前额叶痴呆 | 单细胞转录组学 | 小鼠模型 | 转录组数据 | 研究包括Grn-/-小鼠和FTLD-GRN患者的样本，具体数量未提及 |
| 1892 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomics add a new dimension to our understanding of the gut
2023-02-01, American journal of physiology. Gastrointestinal and liver physiology
DOI:10.1152/ajpgi.00191.2022
PMID:36472345
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review | 这篇文章探讨了空间转录组学在肠道研究中的应用 | 文章介绍了空间转录组技术如何提供肠道细胞转录组的新视角 | 文中未提及具体的局限性 | 研究肠道转录组的空间特征 | 探讨肠道中细胞的空间分布及其转录组特征 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 1893 | 2024-08-07 |
Human PD-1 agonist treatment alleviates neutrophilic asthma by reprogramming T cells
2023-02, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2022.07.022
PMID:35963455
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研究论文 | 本文研究了PD-1激动剂治疗在减轻中性粒细胞性哮喘中的作用，通过重编程T细胞来实现 | 首次探讨了PD-1激动剂在治疗中性粒细胞性哮喘中的应用，并展示了其在减轻气道高反应性和肺部炎症中的效果 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步的人体试验验证 | 探究PD-1在调节急性中性粒细胞性炎症中的作用 | 中性粒细胞性哮喘 | NA | 哮喘 | 单细胞RNA测序和流式细胞术 | NA | 细胞和分子数据 | 野生型和PD-1敲除小鼠，以及人源化PD-1小鼠模型 |
| 1894 | 2024-08-07 |
Clinical Implications of a New DDX58 Pathogenic Variant That Causes Lupus Nephritis due to RIG-I Hyperactivation
2023-02-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2022040477
PMID:36261300
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研究论文 | 本文通过全外显子测序在中国LN患者中鉴定出一种新的DDX58致病变体R109C，并研究了其对I型IFN信号传导的影响及靶向治疗的有效性 | 发现了一种新的DDX58 R109C致病变体，该变体通过减少自身抑制导致RIG-I超激活，增加RIG-I K63泛素化和MAVS聚集 | NA | 鉴定狼疮性肾炎的遗传原因，以促进更个性化的治疗策略 | 中国狼疮性肾炎患者 | NA | 狼疮性肾炎 | 全外显子测序，单细胞RNA测序 | NA | 基因序列，转录组 | 五个无关家庭的狼疮性肾炎患者 |
| 1895 | 2024-08-07 |
Bicuspid Aortic Valve-Associated Regulatory Regions Reveal GATA4 Regulation and Function During Human-Induced Pluripotent Stem Cell-Based Endothelial-Mesenchymal Transition-Brief Report
2023-02, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.122.318566
PMID:36519469
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简报 | 本研究通过CRISPR/Cas9编辑技术删除与二叶主动脉瓣（BAV）相关的大片段基因组，分析其在人诱导多能干细胞（hiPSC）介导的血管内皮-间充质转化（EndoMT）中的生物学效应 | 首次揭示了BAV相关远端区域在hiPSC介导的EndoMT中调控GATA4表达的作用，并发现了TWIST1作为GATA4表达的潜在调节因子 | NA | 确定大片非编码区域在hiPSC介导的EndoMT中的生物学效应 | 人诱导多能干细胞（hiPSC）及其在EndoMT过程中的基因表达调控 | NA | 心脏瓣膜病 | CRISPR/Cas9编辑技术，单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据，单细胞RNA序列数据 | 多个双等位基因克隆，BAV患者来源的hiPSCs |
| 1896 | 2024-08-07 |
Gene regulatory divergence amongst echinoderms underlies appearance of pigment cells in sea urchin development
2023-02, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2022.11.008
PMID:36519720
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研究论文 | 本研究探讨了海星中色素细胞缺失的原因，通过比较海胆和海星的基因表达，揭示了色素细胞发育的基因调控差异 | 首次揭示了海星中色素细胞缺失的基因调控机制，通过比较海胆和海星的基因表达，发现海星中PmGcm在色素基因表达中的作用缺失 | 研究仅限于海胆和海星两种生物，可能无法完全代表所有棘皮动物的色素细胞发育情况 | 探究海星中色素细胞缺失的原因及其基因调控机制 | 海胆和海星的色素细胞及其相关基因表达 | NA | NA | 原位RNA杂交和比较单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及海胆和海星的多个基因和细胞类型 |
| 1897 | 2024-08-07 |
Tbx2 and Tbx3 regulate cell fate progression of the otic vesicle for inner ear development
2023-Feb, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2022.12.003
PMID:36521641
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研究论文 | 本文研究了Tbx2和Tbx3基因在耳泡细胞命运进展中的作用，通过单细胞RNA测序分析了Tbx2/3cKO胚胎与对照组之间的差异。 | 首次揭示了Tbx2和Tbx3在耳泡发育中促进多能耳前体细胞向更分化细胞类型进展的作用。 | NA | 探讨Tbx2和Tbx3基因在耳泡形态发生中的作用及其对细胞命运的影响。 | 耳泡细胞及其在Tbx2/3cKO胚胎中的变化。 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 对照组与Tbx2/3cKO胚胎的耳泡细胞 |
| 1898 | 2024-08-05 |
Single-Cell Transcriptomics and In Vitro Lineage Tracing Reveals Differential Susceptibility of Human iPSC-Derived Midbrain Dopaminergic Neurons in a Cellular Model of Parkinson's Disease
2023-12-18, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12242860
PMID:38132179
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研究论文 | 本研究生成了一种能够纯化和追踪人类中脑多巴胺前体细胞及其分化后代的iPSC系。 | 使用CRISPR/Cas9技术将蓝色荧光蛋白(BFP)和Cre基因插入安全栖息地位点AAVS1，实现中脑多巴胺谱系标记。 | 未提及其他细胞类型的影响或长时间的体内模型验证，可能限制模型的真实性。 | 研究不同人类iPSC衍生的中脑多巴胺能神经元在帕金森病模型中的易感性。 | 人类诱导多能干细胞（iPSC）衍生的神经细胞。 | 干细胞技术 | 帕金森病 | CRISPR/Cas9 | NA | 单细胞RNA测序 | NA |
| 1899 | 2024-08-07 |
Exploring the Functional Heterogeneity of Directly Reprogrammed Neural Stem Cell-Derived Neurons via Single-Cell RNA Sequencing
2023-12-11, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12242818
PMID:38132138
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术探索了直接重编程神经干细胞衍生神经元的功能异质性 | 本文首次通过单细胞RNA测序分析了直接重编程神经干细胞及其衍生神经元的功能异质性，并揭示了细胞命运调控因子 | 本文未详细讨论直接重编程神经干细胞在临床应用中的具体挑战和解决方案 | 研究直接重编程神经干细胞衍生神经元的功能异质性，以提高其在神经退行性疾病治疗中的应用质量 | 直接重编程神经干细胞及其衍生神经元 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及人纤维母细胞、直接重编程神经干细胞及其衍生神经元的单细胞RNA测序数据 |
| 1900 | 2024-08-07 |
Effect of stretching on inflammation in a subcutaneous carrageenan mouse model analyzed at single-cell resolution
2023-12, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.31133
PMID:37909412
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研究论文 | 研究了拉伸对小鼠皮下卡拉胶炎症模型中单细胞分辨率下炎症反应的影响 | 首次在单细胞水平上分析了拉伸对小鼠皮下卡拉胶炎症模型的影响，揭示了拉伸对炎症反应和细胞间通讯的具体作用机制 | NA | 探索拉伸在细胞和分子水平上对小鼠皮下卡拉胶炎症模型的影响 | 小鼠皮下卡拉胶炎症模型中的炎症反应 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |