单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 5350 篇文献，本页显示第 1861 - 1880 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1861 | 2024-08-05 |
Spatial Transcriptomics Reveal Pitfalls and Opportunities for the Detection of Rare High-Plasticity Breast Cancer Subtypes
2023-12, Laboratory investigation; a journal of technical methods and pathology
DOI:10.1016/j.labinv.2023.100258
PMID:37813278
|
研究论文 | 该文章研究了高塑性乳腺癌亚型的检测方法及其面临的挑战。 | 提出使用高分辨率空间转录组学分析来识别特定的乳腺癌标记，并揭示了现有检测方法的局限性。 | 研究主要集中在三阴性乳腺肿瘤上，其他亚型的分析不足，可能限制了结果的普遍适用性。 | 探讨高塑性乳腺癌亚型的检测方法及其在临床治疗中的应用。 | 分析11个三阴性乳腺肿瘤，包括3个claudin-low亚型和4个MpBC亚型。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | NA | 表达数据 | 11个三阴性乳腺肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1862 | 2024-08-07 |
AP-1/c-Fos supports SIV and HIV-1 latency in CD4 T cells infected in vivo
2023-Oct-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.108015
PMID:37860759
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了未治疗的SIV感染猕猴的CD4 T细胞中的病毒RNA，发现Activator protein 1 (AP-1)转录因子在病毒潜伏建立和维持中的作用，并提出其作为治疗HIV-1潜伏库的潜在靶点。 | 首次揭示了AP-1在HIV-1和SIV潜伏中的作用，并提出其作为治疗靶点的可能性。 | 文章未详细讨论实验的具体限制，如样本量、实验重复性等。 | 阐明宿主细胞基因表达模式如何调控病毒基因表达，并探索治疗HIV-1潜伏库的新策略。 | SIV感染的猕猴CD4 T细胞和HIV-1治疗患者的感染细胞。 | NA | HIV-1感染 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 1863 | 2024-08-04 |
Endogenous adenine mediates kidney injury in diabetic models and predicts diabetic kidney disease in patients
2023-10-16, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI170341
PMID:37616058
|
研究论文 | 内源性腺苷在糖尿病模型中介导肾损伤，并预测患者的糖尿病肾病 | 首次提出内源性腺苷可能是糖尿病肾病的致病因素，并找到其作为机制生物标志物的潜力 | 研究集中于特定患者群体，可能无法广泛适用于所有糖尿病患者 | 探索内源性腺苷在糖尿病肾病中的作用及其机制 | 糖尿病患者尿液样本及动物模型 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 空间代谢组学和单细胞转录组学 | 小鼠模型 | 尿液和组织样本 | 来自多个研究的多名糖尿病患者和糖尿病小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 1864 | 2024-08-07 |
Cell type-specific attenuation of brassinosteroid signaling precedes stomatal asymmetric cell division
2023-09-05, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2303758120
PMID:37639582
|
研究论文 | 研究探讨了激素油菜素内酯（BR）信号传导与气孔发育之间的关系，特别是通过SHAGGY/GSK3样激酶BIN2的作用 | 揭示了BIN2在气孔不对称细胞分裂（ACD）中的双重角色，以及BR信号激活的两种模式如何产生时空上不同的转录反应 | NA | 阐明BR信号如何调控气孔发育 | 油菜素内酯信号传导和气孔发育 | 植物生物学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1865 | 2024-08-05 |
Approaches for single-cell RNA sequencing across tissues and cell types
2023 Jun-Oct, Transcription
DOI:10.1080/21541264.2023.2200721
PMID:37062951
|
综述 | 本文回顾了单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术及其方法。 | 提供了关于单细胞RNA测序技术的全面评述和实验室最佳实践的指导。 | 未详细描述特定技术的应用案例和实验数据。 | 旨在为单细胞RNA测序技术建立稳健的工作流程和最新的协议。 | 涵盖各类组织和细胞类型的单细胞RNA测序方法。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1866 | 2024-08-05 |
Understanding spatiotemporal coupling of gene expression using single molecule RNA imaging technologies
2023 Jun-Oct, Transcription
DOI:10.1080/21541264.2023.2199669
PMID:37050882
|
研究论文 | 本文概述了使用单分子RNA成像技术定量理解基因表达的最新进展 | 提出了先进成像技术如何揭示从转录到降解的mRNA生命过程之间的协调关系 | 对未来挑战的讨论尚不够深入 | 提高对基因表达中转录和后转录事件的时空耦合的理解 | 主要关注mRNA在单细胞中的表达监测 | 数字病理学 | NA | 单分子RNA成像技术 | NA | 图像 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1867 | 2024-08-05 |
Impact of disulfidptosis-associated clusters on breast cancer survival rates and guiding personalized treatment
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1256132
PMID:38116315
|
研究论文 | 本研究开发了一个与二硫化死亡相关的预后预测工具以指导乳腺癌患者的个性化治疗 | 首次将二硫化死亡及其相关基因与乳腺癌生存率关联，构建了预后模型 | 需要进一步研究以阐明不同风险组的免疫机制 | 研究乳腺癌与二硫化死亡的关系及其对生存率的影响 | 乳腺癌患者的样本数据及相关基因的表达情况 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序和转录组测序 | Cox和Lasso回归模型 | 基因表达数据 | 基于单细胞分析识别的21个细胞簇，包含多种细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 1868 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing analysis of lung cells in COVID-19 patients with diabetes, hypertension, and comorbid diabetes-hypertension
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1258646
PMID:38144556
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序分析了COVID-19患者中糖尿病、高血压及其合并症患者的肺细胞状态 | 首次揭示了SARS-CoV-2感染下糖尿病和高血压患者肺部纤维母细胞亚群的上调现象，并发现了KREMEN1可能是纤维母细胞激活的受体 | 研究仅限于特定的疾病组合和药物治疗效果的初步评估 | 探讨SARS-CoV-2感染下糖尿病、高血压及其合并症患者的肺细胞状态和潜在治疗靶点 | COVID-19患者中糖尿病、高血压及其合并症患者的肺细胞 | 数字病理学 | 糖尿病, 高血压, COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及糖尿病、高血压及其合并症的COVID-19患者肺样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1869 | 2024-08-04 |
Spatial transcriptomics stratifies psoriatic disease severity by emergent cellular ecosystems
2023-06-08, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abq7991
PMID:37267384
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析剖析了银屑病的严重程度与细胞生态系统的关系 | 首次通过空间转录组学揭示了健康皮肤和炎症皮肤之间免疫微环境的显著差异 | 尚未深入探讨银屑病对其他系统性疾病的影响 | 研究银屑病的细胞组学及其在不同严重程度下的差异 | 25个健康、活跃病变和临床未涉及的皮肤活检样本 | 数字病理学 | 银屑病 | 空间转录组学 | NA | 组织样本 | 25个皮肤活检样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1870 | 2024-08-07 |
Trajectory reconstruction identifies dysregulation of perinatal maturation programs in pluripotent stem cell-derived cardiomyocytes
2023-04-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112330
PMID:37014753
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）重建轨迹，识别了多能干细胞衍生的心肌细胞（PSC-CMs）中胎儿成熟程序的失调 | 首次通过单细胞RNA测序技术，比较了体内外心肌细胞成熟过程的差异，并识别了跨物种间在PSC-CMs中持续失调的转录因子网络 | 多能干细胞衍生的心肌细胞未能达到完全功能成熟 | 探究多能干细胞衍生的心肌细胞成熟过程中的机制差异，并寻找改善其临床应用的方法 | 多能干细胞衍生的心肌细胞及其成熟过程 | 干细胞研究 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 广泛采样了先前难以分离的胎儿期时间段的鼠体内心肌细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1871 | 2024-08-04 |
Wnt signal-dependent antero-posterior specification of early-stage CNS primordia modeled in EpiSC-derived neural stem cells
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1260528
PMID:38405136
|
研究论文 | 本文研究了早期中枢神经系统（CNS）前后轴的特征化过程，利用来源于EpiSC的神经干细胞模型。 | 该研究展示了Wnt信号在中枢神经系统前后轴特征化中所起的重要作用，特别是在不同Wnt信号强度影响转瞬细胞的区域特征化方面。 | 研究未展示后续中枢神经系统区域的特征，可能限制了对后部更后部区域的理解。 | 研究中胚胎早期CNS前后规格化过程中的分子机制。 | 使用小鼠源的EpiSC导出的神经干细胞进行实验和分析。 | 数字病理学 | NA | 微阵列和单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 六个神经干细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 1872 | 2024-08-07 |
Exploring the advances of single-cell RNA sequencing in thyroid cancer: a narrative review
2023-Dec-21, Medical oncology (Northwood, London, England)
DOI:10.1007/s12032-023-02260-x
PMID:38129369
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在甲状腺癌研究中的应用 | scRNA-seq技术革新了细胞亚群的鉴定和特征化，细胞间通信和受体相互作用的研究，揭示了前所未有的异质性，并为治疗发现提供了新的生物标志物 | scRNA-seq面临技术偏差、财务障碍和伦理问题等挑战 | 深入理解甲状腺癌的肿瘤微环境免疫学见解，为患者开发有效的个性化治疗 | 甲状腺癌的细胞亚群、细胞间通信和受体相互作用 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1873 | 2024-08-04 |
Increased m6A-RNA methylation and demethylase FTO suppression is associated with silica-induced pulmonary inflammation and fibrosis
2023-12, Toxicology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.tox.2023.153673
PMID:37979906
|
研究论文 | 该研究探讨了m6A RNA甲基化与硅尘引起的肺部炎症和纤维化的关系 | 首次揭示了m6A甲基化在硅尘引发的早期肺炎和纤维化中的作用及其效应细胞 | 研究主要集中在小鼠模型上，尚未在临床患者中广泛验证 | 研究硅尘引起的肺炎和纤维化中的m6A修饰及其机制 | 小鼠模型和硅尘患者的肺组织及外周血单核细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | m6A点杂交、m6A RNA甲基化定量和单细胞测序 | 小鼠模型 | RNA | 正常小鼠与硅沉积小鼠的对比及硅尘患者的外周血单核细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1874 | 2024-08-07 |
Identification of zona pellucida defects revealed a novel loss-of-function mutation in ZP2 in humans and rats
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1169378
PMID:37293489
|
研究论文 | 本研究通过全外显子测序和桑格测序，在一位具有薄透明带（ZP）表型的不孕女性中鉴定出一个新的ZP2基因无义突变，并探讨了ZP缺陷对卵母细胞基因转录的影响。 | 发现了与薄透明带和自然受精失败相关的新ZP2基因突变，并揭示了ZP完整性破坏对TGF-β信号通路的影响。 | NA | 旨在鉴定导致不孕的ZP2基因致病变异，并研究ZP缺陷对卵母细胞基因转录的影响。 | 不孕女性及其卵母细胞，以及Zp2mut/mut大鼠模型。 | 生殖生物学 | 不孕症 | 全外显子测序，桑格测序，免疫荧光（IF），单细胞RNA测序，定量实时PCR（qRT-PCR） | NA | 基因组数据，转录组数据 | 一位不孕女性，Zp2mut/mut大鼠模型中的卵母细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1875 | 2024-08-04 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals Crucial Cell Subsets and Functional Heterogeneity Associated With Carotid Atherosclerosis and Cerebrovascular Events
2023-12, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.123.318974
PMID:37881939
|
研究论文 | 这篇文章揭示了与颈动脉粥样硬化和脑血管事件相关的重要细胞亚群及功能异质性 | 文章提供了来自20名患者的颈动脉斑块及配对外周血单核细胞的前所未有的大数据集，揭示了动脉粥样硬化微环境的超高精度细胞景观 | 未具体提及高通量数据在临床应用中的限制 | 研究颈动脉粥样硬化和脑血管事件相关的免疫和内皮细胞亚群的功能特征 | 研究对象为来自20名颈动脉粥样硬化患者的颈动脉斑块及外周血单核细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 20名患者的颈动脉斑块和外周血单核细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1876 | 2024-08-04 |
Clonal Proliferation Within Smooth Muscle Cells in Unstable Human Atherosclerotic Lesions
2023-12, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.123.319479
PMID:37881937
|
研究论文 | 本研究探讨了人类不稳定动脉粥样硬化病变中平滑肌细胞的克隆增殖 | 提出了一种新的方法来检测动脉粥样硬化病变中的平滑肌细胞克隆性 | 本研究的空间分辨率和模型的可转化性受到限制 | 旨在研究人类动脉粥样硬化病变中平滑肌细胞的克隆性 | 研究对象为人类不稳定动脉粥样硬化斑块中的平滑肌细胞 | 数字病理学 | 动脉粥样硬化 | RNA原位杂交 | NA | RNA | 来自杂合女性的三种不同类型的冠状动脉斑块 | NA | NA | NA | NA |
| 1877 | 2024-08-07 |
Discovering a Rare Smooth Muscle Cell Population Specific to Men in Ascending Aortic Aneurysm Using Spatial Transcriptomics
2023-12, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.123.320235
PMID:37916413
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1878 | 2024-08-07 |
PD-1 signaling uncovers a pathogenic subset of T cells in inflammatory arthritis
2023-Nov-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.16.566893
PMID:38014321
|
研究论文 | 本研究通过流式细胞术和CRISPR/Cas9全基因组筛选分析了类风湿关节炎患者外周血和滑膜液中的T细胞，发现PD-1信号通路相关基因在炎症性关节炎中的作用 | 发现了与PD-1抑制T细胞功能相关的1,112个独特基因，并揭示了PD-1 + HLA-DR HIGH KLRG LOW T细胞作为炎症性T细胞的新亚群 | 需要进一步研究以完全阐明PD-1在滑膜T细胞亚群中的作用 | 探索PD-1信号通路在炎症性关节炎中的作用，并寻找新的治疗靶点 | 类风湿关节炎患者的T细胞 | 免疫学 | 类风湿关节炎 | 流式细胞术，CRISPR/Cas9全基因组筛选 | NA | RNA测序数据 | 来自类风湿关节炎患者的外周血和滑膜液中的T细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1879 | 2024-08-07 |
Morphological, molecular, and functional characterization of mouse glutamatergic myenteric neurons
2023-Sep-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.18.558146
PMID:37781576
|
研究论文 | 本文系统地表征了小鼠远端结肠和直肠中VGLUT2阳性肠神经元（VGLUT2-ENs）的形态、分子和功能特征 | 首次详细描述了VGLUT2-ENs的形态特征和功能激活机制，揭示了它们在肠神经系统中的独特作用 | 研究主要集中在小鼠的远端结肠和直肠，可能不完全适用于其他物种或其他肠段 | 探究VGLUT2阳性肠神经元的形态、分子和功能特征，以及它们在肠神经系统中的作用 | 小鼠远端结肠和直肠中的VGLUT2阳性肠神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞mRNA测序（scRNA-seq），GCaMP6f钙成像 | NA | mRNA序列，钙成像数据 | 52个VGLUT2阳性肠神经元，215个GCaMP6f记录 | NA | NA | NA | NA |
| 1880 | 2024-08-04 |
Technical optimization of spatially resolved single-cell transcriptomic datasets to study clinical liver disease
2023-Sep-05, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3307940/v1
PMID:37720049
|
研究论文 | 本研究针对临床肝病进行单细胞和空间转录组学的技术优化，揭示了RNA质量对转录组数据的影响 | 开发了多个去卷积方法，以在组织切片上的每个转录组'点'中预测单细胞类型 | 转录组平台成本高，限制了样本量，且空间转录组尚未达到单细胞分辨率 | 研究临床样本中基因表达和细胞间相互作用的空间解析单细胞数据集 | 来自肝病患者的配对组织标本，包括组织学正常和严重纤维化患者 | 数字病理学 | 肝病 | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | 去卷积方法 | 转录组数据 | 来自肝病患者的配对样本 | NA | NA | NA | NA |