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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1821 | 2024-08-04 |
Cellular and transcriptome signatures unveiled by single-cell RNA-Seq following ex vivo infection of murine splenocytes with Borrelia burgdorferi
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1296580
PMID:38149246
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了小鼠脾细胞在Borrelia burgdorferi感染后的特征 | 首次利用GFP标记的Borrelia burgdorferi对小鼠脾细胞进行单细胞RNA测序分析,揭示了免疫响应的分子和细胞特征 | 研究结果主要基于小鼠模型,可能无法完全转化至人类 | 揭示Borrelia burgdorferi感染后宿主的免疫反应和相关生物标志物 | 感染Borrelia burgdorferi的小鼠脾细胞 | 数字病理学 | 莱姆病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 从小鼠中分离的GFP+和GFP-脾细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1822 | 2024-08-07 |
Multi-omics analyses unravel DNA damage repair-related clusters in breast cancer with experimental validation
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1297180
PMID:38022619
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了乳腺癌中与DNA损伤修复(DDR)相关的特征,并通过实验验证了其分类 | 本研究首次构建了DDR分类,并通过多层队列分析验证了DDR评分,揭示了恶性细胞在单细胞水平上对DDR评分的贡献 | NA | 研究乳腺癌中DNA损伤修复的异质性,并探索其个性化分子和临床病理机制 | 乳腺癌中的DNA损伤修复相关特征 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 多组学分析 | NA | 转录组学、基因组学、单细胞转录组数据 | 276个DDR相关基因,多个公共数据集包括SCAN-B数据集、METABRIC数据库和TCGA-BRCA数据库 | NA | NA | NA | NA |
| 1823 | 2024-08-04 |
Retinoic acid drives intestine-specific adaptation of effector ILC2s originating from distant sites
2023-12-04, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20221015
PMID:37773047
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研究论文 | 该研究展示了小肠微环境中效应性ILC2细胞的适应性变化及其功能 | 展示了效应性ILC2细胞能够在不同组织微环境中适应并改变表型的机制 | 研究主要集中在小肠和寄生虫感染的模型上,可能无法全面适用所有类型的组织适应 | 探讨效应性ILC2细胞在不同组织微环境中的适应性及其功能 | 小鼠效应性2型天生淋巴样细胞 (ILC2s) | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 细胞数据 | 小鼠多个器官的ILC2细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1824 | 2024-08-07 |
Hepatitis C virus infects and perturbs liver stem cells
2023-Nov-08, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.01318-23
PMID:37938000
|
研究论文 | 本文研究了丙型肝炎病毒(HCV)感染肝干细胞并干扰其正常功能,导致肝脏损伤和癌症风险增加的情况。 | 首次发现HCV可以感染肝干细胞,并通过转录重编程促进癌细胞发展和免疫反应改变。 | NA | 探讨HCV感染如何导致肝脏疾病进展和增加癌症风险。 | 肝干细胞和由其衍生的3D肝脏类器官。 | NA | 肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自活动性HCV感染个体的肝干细胞衍生的3D肝脏类器官 | NA | NA | NA | NA |
| 1825 | 2024-08-04 |
Robust enhancer-gene regulation identified by single-cell transcriptomes and epigenomes
2023-Jul-12, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2023.100342
PMID:37492103
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组和表观基因组数据识别增强子与基因之间的调控关系 | 提出了一种基于非参数置换的程序,以控制增强子-基因关联研究中的假阳性风险 | 未提及具体的样本大小和多样性限制 | 研究如何通过单细胞测序数据实现增强子与基因的稳健链接 | 包括小鼠和人脑的多种组织的大规模转录组和表观基因组数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组和表观基因组数据 | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 1826 | 2024-08-04 |
Integrative analysis of disulfidptosis and immune microenvironment in hepatocellular carcinoma: a putative model and immunotherapeutic strategies
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1294677
PMID:38235128
|
研究论文 | 本文研究了肝细胞癌中二硫键死亡及其免疫微环境的整合分析 | 建立了一个新模型以预测肝细胞癌患者的预后,并探讨了可能的治疗靶点 | NA | 探索肝细胞癌细胞的二硫键死亡及其与免疫微环境的关系 | 肝细胞癌细胞及其免疫微环境 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA测序, 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 结合了多个RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 1827 | 2024-08-04 |
MediMer: a versatile do-it-yourself peptide-receptive MHC class I multimer platform for tumor neoantigen-specific T cell detection
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1294565
PMID:38239352
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研究论文 | 本研究开发了一种名为MediMer的平台,用于肿瘤新抗原特异性T细胞的检测 | MediMer是一个多功能自制的pMHC-I多聚体平台,能够以较少的操作时间定制并生产用于个体化肿瘤患者的新抗原检测 | 未提及具体的局限性 | 提高针对个体肿瘤患者新抗原的T细胞受体的发现能力 | 主要研究人类抗原特异性T细胞,特别是针对黑色素瘤患者的新抗原特异性T细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 重组MHC分子 | NA | 细胞 | 黑色素瘤患者血液样本中发现稀有T细胞亚群 | NA | NA | NA | NA |
| 1828 | 2024-08-04 |
Amnion responses to intrauterine inflammation and effects of inhibition of TNF signaling in preterm Rhesus macaque
2023-Nov-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.108118
PMID:37953944
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研究论文 | 研究了羊膜在子宫内炎症中的反应及TNF信号抑制的影响 | 使用非人类灵长类动物模型与人类队列对比研究了羊膜转录组,揭示了关键的分娩介导基因的调控机制 | 本研究主要基于一个非人类灵长类动物模型,可能存在物种之间的差异 | 阐明子宫内感染/炎症在母胎界面如何调节 | 比较早产猕猴模型与人类病人群体的羊膜转录组 | 数字病理学 | 早产 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 早产猕猴模型与人类病例的比较,即多个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1829 | 2024-08-07 |
Characterisation of macrophage infiltration and polarisation based on integrated transcriptomic and histological analyses in Primary Sjögren's syndrome
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1292146
PMID:38022546
|
研究论文 | 本研究通过综合转录组学和组织学分析,探讨了原发性干燥综合征(pSS)中巨噬细胞浸润和极化的机制 | 首次详细描述了pSS患者中巨噬细胞的浸润和极化状态,并揭示了巨噬细胞与炎症微环境之间的双向关系 | 研究样本量较小,且仅使用了公开数据集中的样本,可能影响结果的普遍性 | 探究原发性干燥综合征中巨噬细胞浸润和极化的机制 | 原发性干燥综合征患者的外周血单个核细胞和唾液腺组织 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),批量RNA测序 | NA | 转录组数据 | pSS患者5例,健康个体5例,pSS唾液腺组织24例,非pSS唾液腺组织12例 | NA | NA | NA | NA |
| 1830 | 2024-08-04 |
Interferon-independent processes constrain measles virus cell-to-cell spread in primary human airway epithelial cells
2023-Sep-19, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.01361-23
PMID:37724882
|
研究论文 | 本研究探讨了麻疹病毒在主要人类气道上皮细胞中的细胞间传播机制 | 这项研究揭示了IFN信号在麻疹病毒细胞间传播中并不是限制因素,强调了IFN独立过程的重要性 | 研究未能完全理解阻止麻疹病毒传播的机制 | 了解麻疹病毒在气道上皮细胞中的传播特征和机制 | 主要人类气道上皮细胞(Hae)和麻疹病毒(MeV)突变体 | NA | NA | 深度测序、定量RT-PCR和单细胞RNA测序 | NA | 细胞模型 | 主要人类气道上皮细胞的培养 | NA | NA | NA | NA |
| 1831 | 2024-08-04 |
Preclinical models for prediction of immunotherapy outcomes and immune evasion mechanisms in genetically heterogeneous multiple myeloma
2023-03, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-022-02178-3
PMID:36928817
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研究论文 | 本文介绍了一种反映多发性骨髓瘤遗传异质性的前临床模型,以预测免疫治疗结果和免疫逃逸机制 | 建立了包含八种MM病变的新型小鼠模型,揭示了与免疫检查点阻断反应相关的CD8 T细胞与T细胞的比例 | 未提及具体的实验样本来源和规模的局限性 | 探讨多发性骨髓瘤的遗传和免疫特点与治疗反应之间的关系 | 多发性骨髓瘤模型小鼠及相关临床患者的免疫反应 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞转录组学与功能检测 | 小鼠模型 | 生物样本和临床数据 | 约500只小鼠和约1000名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 1832 | 2024-08-07 |
Combined PD-1, BRAF and MEK inhibition in BRAFV600E colorectal cancer: a phase 2 trial
2023-02, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-022-02181-8
PMID:36702949
|
研究论文 | 本研究进行了一项单臂2期临床试验,评估联合使用PD-1、BRAF和MEK抑制剂在BRAFV600E结直肠癌患者中的效果 | 研究揭示了MAPK抑制与免疫反应之间潜在的协同作用机制,为优化结直肠癌的靶向和免疫联合治疗提供了新的临床评估方向 | 尽管研究达到了主要终点,但总体反应率仍然较低,且缺乏持久性 | 探索联合使用PD-1、BRAF和MEK抑制剂在BRAFV600E结直肠癌中的临床疗效 | 37名BRAFV600E结直肠癌患者 | NA | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 生物样本 | 23对治疗前和治疗第15天的肿瘤活检样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1833 | 2024-08-04 |
Corrigendum: Application of single-cell sequencing to the research of tumor microenvironment
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1345222
PMID:38116015
|
更正 | 本文更正了关于单细胞测序在肿瘤微环境研究中的应用的文章 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1834 | 2024-08-04 |
Identification of TRDV-TRAJ V domains in human and mouse T-cell receptor repertoires
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1286688
PMID:38077312
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研究论文 | 本文描述了在人类和小鼠T细胞受体库中识别含有TRDV基因的两种T细胞受体 | 首次在小鼠和人类中识别到包括TRDV基因的TRA链,展示了这些TRDV基因对TRA多样性的贡献 | TRDV-TRA链在最终结果中被排除,可能导致对其丰富性的低估 | 研究TRDV基因在T细胞受体中的角色及其对TRA多样性的影响 | 人类和小鼠的T细胞受体 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 21个来自人类和23个来自小鼠的单细胞RNA-seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 1835 | 2024-08-04 |
Application of single-cell sequencing to the research of tumor microenvironment
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1285540
PMID:37965341
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综述 | 本文总结了单细胞测序及肿瘤微环境分析的最新进展 | 结合单细胞测序和肿瘤微环境分析为揭示肿瘤发展和进展的分子机制提供了独特机会 | NA | 探讨单细胞测序在肿瘤微环境研究中的应用 | 肿瘤微环境及其与单细胞测序的关系 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因组,转录组和表观基因组 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1836 | 2024-08-04 |
Examining the function of macrophage oxidative stress response and immune system in glioblastoma multiforme through analysis of single-cell transcriptomics
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1288137
PMID:38274828
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研究论文 | 该论文探讨了巨噬细胞在胶质母细胞瘤中的氧化应激反应和免疫系统的功能 | 首次通过单细胞转录组分析揭示了巨噬细胞在胶质母细胞瘤微环境中的中心角色及其潜在的极化机制 | 对现有巨噬细胞在胶质母细胞瘤作用机制的理解仍然有限 | 旨在重新定义胶质母细胞瘤肿瘤核心和周边区域内的细胞景观 | 研究对象为胶质母细胞瘤中的巨噬细胞及其相关亚群体 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞转录组分析 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1837 | 2024-08-04 |
Genetic and immunological insights into COVID-19 with acute myocardial infarction: integrated analysis of mendelian randomization, transcriptomics, and clinical samples
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1286087
PMID:38022594
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研究论文 | 本文探讨了COVID-19与急性心肌梗死之间的遗传和免疫学关联 | 采用两样本孟德尔随机化和机器学习发现TLR4和ABCA1作为相关性中心基因,具有高诊断价值 | 未能确认COVID-19与急性心肌梗死之间的直接因果关系 | 理解COVID-19与急性心肌梗死之间的分子机制 | 研究COVID-19患者中急性心肌梗死的遗传和免疫特征 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 机器学习 | 基因组数据, 临床血样本 | 在研究中包含了多样本的RNA-seq数据和临床血液样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1838 | 2024-08-07 |
Crosstalk of disulfidptosis-related subtypes, establishment of a prognostic signature and immune infiltration characteristics in bladder cancer based on a machine learning survival framework
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1180404
PMID:37152941
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研究论文 | 本研究探讨了胱硫醚病相关基因(DRGs)对膀胱癌(BLCA)预后的影响,并开发了一种基于机器学习生存框架的预测模型,用于评估患者的预后、免疫特征和治疗反应 | 本研究首次将胱硫醚病相关基因与膀胱癌的预后和免疫浸润特征联系起来,并开发了一种新的预测模型 | NA | 研究胱硫醚病相关基因在膀胱癌中的作用,并开发一种新的预测模型以指导临床管理和个性化治疗 | 膀胱癌患者及其胱硫醚病相关基因的表达和突变特征 | 机器学习 | 膀胱癌 | RNA测序 | 机器学习算法 | RNA-Seq数据 | 三个膀胱癌队列 | NA | NA | NA | NA |
| 1839 | 2024-08-07 |
Spatial modelling of the tumor microenvironment from multiplex immunofluorescence images: methods and applications
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1288802
PMID:38179056
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研究论文 | 本文探讨了通过多重免疫荧光(mIF)图像的空间建模方法来研究肿瘤微环境(TME)中的细胞相互作用及其在临床应用中的潜力 | 本文引入了多种数学模型,这些模型最初用于景观生态学和地理信息研究,现在应用于肿瘤微环境分析,以评估细胞群的空间聚集性 | NA | 提高基于免疫疗法的临床试验的成功率 | 肿瘤微环境中的细胞相互作用及其对治疗反应的影响 | 数字病理学 | NA | 多重免疫荧光(mIF) | 数学模型 | 图像 | 组织样本来自基线和治疗期间不同时间点的患者 | NA | NA | NA | NA |
| 1840 | 2024-08-07 |
An integrative analysis of single-cell and bulk transcriptome and bidirectional mendelian randomization analysis identified C1Q as a novel stimulated risk gene for Atherosclerosis
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1289223
PMID:38179058
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研究论文 | 本研究通过综合分析单细胞和批量转录组数据,并使用双向孟德尔随机化分析,确定了C1Q作为动脉粥样硬化的新风险基因 | 本研究首次通过单细胞RNA测序和批量RNA分析确定了C1Q相关的关键基因,并使用双向孟德尔随机化分析验证了C1Q与动脉粥样硬化的关联 | NA | 旨在通过单细胞RNA测序和批量RNA分析确定C1Q相关的关键基因,以更有效地诊断和预测动脉粥样硬化患者,并研究C1Q与动脉粥样硬化(缺血性中风)的关联 | C1Q相关基因在人类动脉粥样硬化斑块中的作用 | 基因组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 机器学习模型 | 转录组数据 | 使用了来自RAW264.7巨噬细胞和apoE-/-小鼠的样本 | NA | NA | NA | NA |