单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5353 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2024-12-13 |
Single-cell, whole-embryo phenotyping of mammalian developmental disorders
2023-Nov, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06548-w
PMID:37968388
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研究论文 | 本文开发了一种基于单细胞RNA测序的全胚胎表型分析平台，用于系统性地表征小鼠遗传模型的发育异常 | 首次将单细胞RNA测序应用于全胚胎表型分析，提供了前所未有的广度和分辨率 | 研究仅限于胚胎发育的特定阶段（胚胎第13.5天），且样本量相对较小 | 建立一种可扩展的平台，用于系统性地表征小鼠遗传模型的发育异常 | 22种突变型和4种野生型小鼠胚胎的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 发育障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 101个胚胎，包括22种突变型和4种野生型 |
| 162 | 2024-12-13 |
The cellular response to extracellular vesicles is dependent on their cell source and dose
2023-09, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adh1168
PMID:37656796
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研究论文 | 研究探讨了不同细胞来源和剂量的外泌体对细胞反应的影响 | 首次系统分析了不同细胞来源和剂量的外泌体对细胞转录效应的影响，并使用单细胞RNA测序技术在体内外进行了验证 | 研究主要集中在体外和体内实验，未涉及临床应用 | 探讨外泌体在细胞间通讯中的作用及其作为治疗剂的潜力 | 不同细胞来源和剂量的外泌体对成纤维细胞的转录效应 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 12种不同细胞来源的外泌体，剂量范围为每细胞20到200,000 |
| 163 | 2024-12-13 |
Single-cell transcriptomics identifies prothymosin α restriction of HIV-1 in vivo
2023-08-02, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adg0873
PMID:37531416
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组分析，鉴定了在体内限制HIV-1感染的宿主因子prothymosin α | 首次通过单细胞转录组分析鉴定了prothymosin α作为体内限制HIV-1感染的宿主因子，并在体外实验中验证了其抑制HIV-1转录和病毒产生的作用 | 研究样本量相对较小，且仅限于特定HIV-1亚型和地区的参与者 | 鉴定在体内限制HIV-1感染的宿主因子，并探讨其对病毒传播和治愈策略的影响 | HIV-1感染的宿主因子prothymosin α及其在体内外的抗病毒作用 | 基因组学 | HIV感染 | 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 30名参与者（包括1名高病毒载量的参与者和28名来自泰国和美洲的HIV-1 CRF01_AE和亚型B感染者） |
| 164 | 2024-12-13 |
Six3 and Six6 jointly regulate the identities and developmental trajectories of multipotent retinal progenitor cells in the mouse retina
2023-May-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.05.03.539288
PMID:37205402
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研究论文 | 研究了Six3和Six6在调控小鼠视网膜多能祖细胞的身份和发育轨迹中的作用 | 通过单细胞RNA测序和条件性基因敲除技术，揭示了Six3和Six6在视网膜祖细胞分化中的协同调控作用，并发现了新的候选基因 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类视网膜中验证这些发现 | 探讨Six3和Six6在视网膜发育中的分子机制，为视网膜再生治疗提供理论基础 | 小鼠视网膜中的多能祖细胞及其分化轨迹 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 胚胎小鼠眼杯样本 |
| 165 | 2024-12-12 |
scMIC: A Deep Multi-Level Information Fusion Framework for Clustering Single-Cell Multi-Omics Data
2023-12, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2023.3317272
PMID:37725723
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研究论文 | 提出了一种名为scMIC的深度多层次信息融合框架，用于聚类单细胞多组学数据 | 该框架能够整合细胞的属性信息和潜在的结构关系，减少不同组学之间的冗余信息，并通过多重协同监督聚类策略提高聚类精度 | NA | 提高单细胞多组学数据聚类的准确性 | 单细胞多组学数据 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 深度学习框架 | 多组学数据 | 七个单细胞多组学数据集 |
| 166 | 2024-12-12 |
scGCC: Graph Contrastive Clustering With Neighborhood Augmentations for scRNA-Seq Data Analysis
2023-12, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2023.3319551
PMID:37751336
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研究论文 | 本文提出了一种名为scGCC的图对比聚类模型，用于单细胞RNA测序数据分析，旨在解决高维度、稀疏性和批次效应等问题 | 引入图注意力网络（GAT）进行细胞表示学习，并提出了五种数据增强方法以提高聚类性能和鲁棒性 | 未提及具体局限性 | 开发一种新的图自监督对比学习模型，用于单细胞RNA测序数据的聚类分析 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型和亚型识别 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 图对比学习模型 | 数据 | 14个真实世界数据集 |
| 167 | 2024-12-12 |
Single-cell transcriptomics suggest distinct upstream drivers of IL-17A/F in hidradenitis versus psoriasis
2023-09, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2023.05.012
PMID:37271319
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研究论文 | 研究比较了化脓性汗腺炎（HS）和银屑病中T17细胞的转录组及其与邻近免疫细胞亚群的配体-受体相互作用 | 首次揭示了HS和银屑病中T17细胞的不同上游驱动因素，特别是IL-1β在HS中的主导作用 | 研究仅限于皮肤样本，未涵盖全身免疫反应 | 探讨化脓性汗腺炎和银屑病中T17细胞的转录组特征及其驱动机制 | 化脓性汗腺炎和银屑病中的T17细胞及其与邻近免疫细胞的相互作用 | 数字病理学 | 皮肤病 | 单细胞转录组 | NA | 转录组数据 | 12,300个来自8个化脓性汗腺炎皮肤样本的免疫细胞，19,525个来自11个银屑病皮肤样本的细胞，以及11,920个来自10个对照皮肤样本的细胞 |
| 168 | 2024-12-12 |
Cell Type- and Tissue-specific Enhancers in Craniofacial Development
2023-Jun-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.26.546603
PMID:37425964
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研究论文 | 本文结合组蛋白修饰和染色质可及性分析以及单细胞分析，创建了人类面部发育的调控景观图谱 | 首次系统性地绘制了人类面部发育过程中细胞类型和组织特异性增强子的全面目录，并验证了其在小鼠中的功能保守性 | 研究主要集中在胚胎发育的特定阶段，未来需要进一步扩展到其他发育阶段和更多物种 | 揭示颅面发育的遗传基础，特别是增强子在不同细胞类型和组织中的作用 | 人类面部发育过程中的增强子及其在不同细胞类型和组织中的活性 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序、单核ATAC-seq、转基因小鼠报告基因分析 | NA | 基因组数据、单细胞数据 | 约14,000个增强子，跨越人类胚胎面部发育的七个阶段，以及小鼠颅面组织的单细胞数据 |
| 169 | 2024-12-12 |
Antigen-driven colonic inflammation is associated with development of dysplasia in primary sclerosing cholangitis
2023-Jun, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-023-02372-x
PMID:37322120
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研究论文 | 研究探讨了原发性硬化性胆管炎（PSC）患者中抗原驱动的结肠炎症与发育不良发展的关联 | 通过结合流式细胞术、bulk和单细胞转录组学以及T和B细胞受体 repertoire 分析，识别出与PSC患者更高风险和更短时间至发育不良相关的独特适应性炎症转录特征 | 研究样本量有限，且仅限于特定患者群体，可能无法完全代表所有PSC患者的炎症特征 | 探讨PSC患者中抗原驱动的结肠炎症与发育不良发展的机制，并提供分子见解以指导结直肠癌的预防 | 65名PSC患者、108名IBD患者和48名健康个体的右结肠组织 | NA | 原发性硬化性胆管炎 | 流式细胞术、bulk和单细胞转录组学、T和B细胞受体 repertoire 分析 | NA | 转录组数据 | 65名PSC患者、108名IBD患者和48名健康个体 |
| 170 | 2024-12-12 |
Novel Candidate Regulators and Developmental Trajectory of Pituitary Thyrotropes
2023-04-17, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/endocr/bqad076
PMID:37183548
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研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序技术分析幼鼠垂体细胞，识别了调控甲状腺激素分泌细胞发育的新因子 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了垂体甲状腺激素分泌细胞的发育轨迹，并发现了新的调控因子 | 研究仅限于幼鼠垂体细胞，未涉及其他物种或成年动物 | 揭示垂体甲状腺激素分泌细胞的发育机制及其调控因子 | 幼鼠垂体细胞中的甲状腺激素分泌细胞及其亚型 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 幼鼠P7垂体细胞 |
| 171 | 2024-12-12 |
Tick innate immune responses to hematophagy and Ehrlichia infection at single-cell resolution
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1305976
PMID:38274813
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了孤星蜱在未进食、部分进食和感染埃立克体时的血细胞反应 | 首次在单细胞分辨率下揭示了蜱对埃立克体感染和吸血的先天免疫反应 | NA | 深入了解血细胞在蜱与蜱传微生物相互作用中的作用，揭示其在媒介传播能力中的功能 | 孤星蜱的血细胞及其在不同状态下的基因表达 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未进食、部分进食和感染埃立克体的孤星蜱血细胞样本 |
| 172 | 2024-12-11 |
Increased spatial coupling of integrin and collagen IV in the immunoresistant clear cell renal cell carcinoma tumor microenvironment
2023-Nov-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.16.567457
PMID:38014063
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研究论文 | 研究探讨了免疫治疗抵抗的透明细胞肾细胞癌肿瘤微环境中整合素和IV型胶原蛋白的空间耦合增加 | 首次使用细胞分辨率的空间转录组学技术，结合空间基因集富集分析和自相关分析，揭示了免疫治疗暴露的肿瘤微环境中整合素和IV型胶原蛋白的高表达耦合 | 研究样本量较小，仅包括21个患者样本，可能影响结果的普适性 | 探讨免疫治疗抵抗的透明细胞肾细胞癌肿瘤微环境中分子机制 | 透明细胞肾细胞癌肿瘤及其微环境中的整合素和IV型胶原蛋白 | 数字病理学 | 肾癌 | 空间转录组学、空间分子成像、多重免疫荧光 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据 | 21个患者样本 |
| 173 | 2024-12-11 |
Single-cell analysis of human nasal mucosal IgE antibody secreting cells reveals a newly minted phenotype
2023-06, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.mucimm.2023.02.008
PMID:36931600
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了过敏性真菌性鼻窦炎患者鼻息肉中的IgE抗体分泌细胞，揭示了一种新的表型 | 本文首次通过单细胞RNA测序揭示了鼻黏膜IgE抗体分泌细胞的新表型，并发现其与IgD和记忆B细胞的发育关系 | 研究样本量较小，仅包括3名患者，可能影响结果的普遍性 | 研究过敏性真菌性鼻窦炎患者鼻黏膜中IgE抗体分泌细胞的表型和功能 | 过敏性真菌性鼻窦炎患者鼻息肉中的IgE抗体分泌细胞 | 免疫学 | 过敏性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 3名过敏性真菌性鼻窦炎患者的鼻息肉样本 |
| 174 | 2024-12-11 |
Pharmacologic targeting of Nedd8-activating enzyme reinvigorates T-cell responses in lymphoid neoplasia
2023-06, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-023-01889-x
PMID:37031300
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研究论文 | 本文研究了Nedd8激活酶（NAE）抑制剂pevonedistat在淋巴瘤中的治疗作用，特别是其对CD8 T细胞反应的重新激活 | 首次展示了NAE抑制剂pevonedistat能够直接作用于CD8 T细胞，增强其细胞毒性和细胞因子表达，并在淋巴瘤模型中延缓肿瘤进展 | 研究主要集中在体外实验和小鼠模型，尚未在临床试验中验证其效果 | 探讨NAE抑制剂在淋巴瘤治疗中的潜在作用及其对T细胞反应的影响 | CD8 T细胞、淋巴瘤模型、淋巴瘤患者 | NA | 淋巴瘤 | NA | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 175 | 2024-12-11 |
Targeting lymphoid-derived IL-17 signaling to delay skin aging
2023-Jun, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-023-00431-z
PMID:37291218
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研究论文 | 本文研究了皮肤老化过程中IL-17信号通路的作用，并探讨了通过靶向IL-17信号来延缓皮肤老化的可能性 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了老年皮肤中T辅助细胞、γδ T细胞和先天淋巴细胞向IL-17表达表型的偏移，并证明了IL-17信号通路的阻断可以减少皮肤炎症并延缓老化特征的出现 | 研究仅在老鼠模型上进行，尚未在人类中验证其效果 | 探讨皮肤老化过程中炎症信号的作用，并寻找延缓皮肤老化的方法 | 皮肤老化过程中的IL-17信号通路及其对皮肤炎症和功能的影响 | NA | 皮肤老化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 老鼠皮肤样本 |
| 176 | 2024-12-10 |
Cytotoxic CD4+ tissue-resident memory T cells are associated with asthma severity
2023-Dec-08, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2023.09.003
PMID:37865091
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研究论文 | 研究探讨了细胞毒性CD4+组织驻留记忆T细胞与哮喘严重程度之间的关系 | 发现了在严重哮喘患者中，CD4+组织驻留记忆T细胞（TRM）显著增加，并且这些细胞表达与细胞毒性和炎症相关的基因 | 研究样本仅包括30名患者，可能不足以代表所有哮喘患者的情况 | 探讨不同CD4+ T细胞亚群在哮喘发病机制中的作用 | 从30名轻度和重度哮喘患者中提取的50,000多个气道CD4+ T细胞 | NA | 哮喘 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 30名轻度和重度哮喘患者 |
| 177 | 2024-12-09 |
Identification of human exTreg cells as CD16+CD56+ cytotoxic CD4+ T cells
2023-Oct, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-023-01589-9
PMID:37563308
|
研究论文 | 本文通过RNA测序和单细胞RNA测序技术，鉴定了人类exTreg细胞为CD16+CD56+细胞毒性CD4+T细胞 | 首次鉴定了人类exTreg细胞为CD16+CD56+细胞毒性CD4+T细胞，并验证了其细胞毒性功能 | 研究主要基于小鼠模型和人类样本，可能存在种属差异 | 鉴定人类exTreg细胞的表型和功能 | 人类和小鼠的T细胞和exT细胞 | 免疫学 | 动脉粥样硬化 | RNA测序、单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | RNA | 小鼠和人类样本 |
| 178 | 2024-12-09 |
T cell-Mediated Development of Stromal Fibroblasts with an Immune-Enhancing Chemokine Profile
2023-Jun-07, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-22-0593
PMID:37285176
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研究论文 | 研究探讨了癌症相关成纤维细胞（CAF）在不同免疫微环境中的适应性变化及其对T细胞浸润的影响 | 首次揭示了CAF在T细胞介导下可以转变为促进免疫的表型，通过调节CXCL12和CXCL9的表达来影响T细胞的浸润 | 研究主要在体外和小鼠模型中进行，需要进一步的临床验证 | 探讨CAF在不同免疫微环境中的适应性及其对免疫反应的影响 | 癌症相关成纤维细胞（CAF）和T细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠胰腺腺癌中的CAF样本 |
| 179 | 2024-12-08 |
Single-cell RNA-Seq reveals intracellular microbial diversity within immune cells during SARS-CoV-2 infection and recovery
2023-Nov-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.108357
PMID:38026191
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研究论文 | 研究利用单细胞RNA测序技术揭示了SARS-CoV-2感染和恢复期间免疫细胞内的微生物多样性 | 首次利用单细胞RNA测序技术探索了免疫细胞内微生物的分布及其对宿主细胞的影响 | 需要进一步研究以理解这些微生物在不同生理状态下的细胞特异性丰度的功能意义 | 揭示SARS-CoV-2感染和恢复期间免疫细胞内的微生物多样性及其对宿主细胞的影响 | 健康个体、SARS-CoV-2阳性患者和康复者的外周血单核细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及健康个体、SARS-CoV-2阳性患者和康复者的外周血单核细胞样本 |
| 180 | 2024-12-08 |
Comprehensive single cell aging atlas of mammary tissues reveals shared epigenomic and transcriptomic signatures of aging and cancer
2023-Oct-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.20.563147
PMID:37961129
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研究论文 | 研究了衰老如何重塑小鼠乳腺组织的转录组和表观基因组程序，揭示了衰老和癌症之间的共同表观遗传和转录特征 | 首次在单细胞分辨率下全面分析了小鼠乳腺组织的衰老和癌症相关特征，并发现了衰老细胞在代谢、炎症和癌症相关基因中的表观遗传和转录变化 | 研究主要集中在小鼠模型上，尚未完全验证这些发现是否适用于人类 | 探讨衰老相关的细胞和分子事件如何影响癌症的发生 | 小鼠乳腺组织的单细胞转录组和表观基因组 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠乳腺组织样本 |