单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 5350 篇文献，本页显示第 1761 - 1780 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1761 | 2024-08-07 |
Construction of a cross-species cell landscape at single-cell level
2023-01-25, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac633
PMID:35929025
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术构建了跨物种的细胞图谱，涵盖了小鼠、斑马鱼和果蝇等多个生命阶段。 | 首次实现了跨物种的细胞景观动态比较，并识别了生命周期中变化的特征和共同通路。 | NA | 研究不同物种的细胞异质性及其在生命周期中的变化。 | 小鼠、斑马鱼和果蝇的细胞景观。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞数据 | 超过260万个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1762 | 2024-08-07 |
Matrisome gene-based subclassification of patients with liver fibrosis identifies clinical and molecular heterogeneities
2023-10-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000423
PMID:37098756
|
研究论文 | 本文通过分析肝纤维化患者的转录组数据，识别并验证了与肝纤维化相关的基质基因（LFMGs），并探讨了这些基因在临床和生物学上的相关性 | 本文首次识别了与病因无关的肝纤维化特异性基质基因（LFMGs），并揭示了这些基因在肝纤维化进展和逆转中的表达模式和细胞景观 | NA | 旨在揭示与病因无关的基质基因，这些基因在临床上与肝纤维化相关 | 肝纤维化患者的转录组数据和临床特征 | 数字病理学 | 肝纤维化 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 35个肝纤维化特异性基质基因（LFMGs） | NA | NA | NA | NA |
| 1763 | 2024-08-07 |
An immune cell atlas reveals the dynamics of human macrophage specification during prenatal development
2023-09-28, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2023.08.019
PMID:37703875
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，绘制了人类胚胎发育期间（4-26周）巨噬细胞分化动态的图谱 | 首次在多个组织中识别出15种巨噬细胞亚型，包括类似小胶质细胞和促血管生成巨噬细胞，并揭示了它们在胚胎发育中的分布和功能 | NA | 揭示人类胚胎发育期间巨噬细胞的多样性和发育动态 | 人类胚胎发育期间的巨噬细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 涉及19个组织的巨噬细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1764 | 2024-08-07 |
Mapping the two distinct proliferative bursts early in T-cell development
2023-09, Immunology and cell biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1111/imcb.12670
PMID:37465975
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序结合轨迹推断方法，精确确定了T细胞发育过程中胸腺细胞进入细胞周期的时机 | 首次精确界定了T细胞发育早期两个增殖爆发的时间点，即在双阴性(DN) 2a阶段和DN3b阶段 | NA | 研究T细胞发育过程中早期的两个增殖爆发 | T细胞发育过程中的胸腺细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1765 | 2024-08-07 |
RNA sequencing of single allergen-specific memory B cells after grass pollen immunotherapy: Two unique cell fates and CD29 as a biomarker for treatment effect
2023-03, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.15529
PMID:36153670
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了草花粉免疫治疗后特异性记忆B细胞的变化，并探讨了CD29作为治疗效果生物标志物的可能性 | 首次揭示了草花粉免疫治疗后特异性记忆B细胞存在两种独特的转录特征，并发现CD29可作为治疗效果的早期生物标志物 | 研究样本量较小，仅涉及四名患者，可能影响结果的普遍性 | 探讨草花粉免疫治疗对特异性记忆B细胞的影响及其作为治疗效果生物标志物的潜力 | 特异性记忆B细胞及其表面蛋白表达变化 | NA | 过敏性鼻炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 27名对黑麦草花粉敏感且患有季节性鼻炎的患者 | NA | NA | NA | NA |
| 1766 | 2024-08-04 |
Single-cell RNA-seq analyses inform necroptosis-associated myeloid lineages influence the immune landscape of pancreas cancer
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1263633
PMID:38149248
|
研究论文 | 研究揭示了胰腺癌中与坏死性凋亡相关的髓系细胞谱系对免疫环境的影响 | 首次识别出与坏死性凋亡相关的10个基因以及三种髓系细胞亚群体 | 未提及研究的局限性 | 探讨胰腺导管腺癌中肿瘤浸润髓系细胞的特性和影响 | 16名胰腺导管腺癌患者的肿瘤和正常组织细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | scRNA-seq | NA | 细胞 | 12个原发肿瘤组织和4个转移肿瘤组织，3个正常胰腺组织，以及PBMC样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1767 | 2024-08-07 |
Myeloid PFKFB3-mediated glycolysis promotes kidney fibrosis
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1259434
PMID:38035106
|
研究论文 | 本研究探讨了髓系细胞中糖酵解途径在肾脏纤维化发展中的作用 | 首次揭示了髓系细胞中糖酵解途径在肾脏纤维化中的作用，并提出靶向髓系糖酵解是一种新的抑制肾脏纤维化的方法 | 研究主要基于小鼠模型，未来需在人类样本中验证其有效性和安全性 | 研究髓系细胞中糖酵解途径在肾脏纤维化中的作用 | 髓系细胞中的糖酵解途径及其在肾脏纤维化中的作用 | NA | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型中的髓系细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1768 | 2024-08-07 |
Chemical immune conization of precancerous cervical lesions awakens immune cells and restores normal HPV negative and abnormal proliferation
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1259723
PMID:38235142
|
研究论文 | 研究使用半抗原增强的肿瘤内化疗（HEIC）治疗宫颈癌前病变和HPV感染的效果 | 提出了一种新的治疗策略，即通过半抗原增强的肿瘤内化疗来激活免疫细胞，防止宫颈癌前细胞的异常增殖 | 研究仅基于单一患者的细胞样本，可能需要进一步的临床试验来验证其普遍性和有效性 | 探讨半抗原增强的肿瘤内化疗对宫颈癌前病变和HPV感染的治疗效果 | 宫颈癌前病变组织和HPV感染 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 转录组 | 40,239个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1769 | 2024-08-07 |
Novel tumor-associated macrophage populations and subpopulations by single cell RNA sequencing
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1264774
PMID:38347955
|
综述 | 本文通过单细胞RNA测序技术探讨了四种新型肿瘤相关巨噬细胞亚群在不同实体瘤中的核心基因特征及其功能 | 利用单细胞RNA测序技术识别与特定功能相关的肿瘤相关巨噬细胞亚群 | 单细胞RNA测序识别的细胞类型和亚群与其实际功能之间可能存在潜在的脱节 | 探讨肿瘤相关巨噬细胞在不同实体瘤中的亚群及其功能 | 肿瘤相关巨噬细胞及其亚群 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 不同实体瘤组织中的多个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1770 | 2024-08-04 |
Deep learning in spatial transcriptomics: Learning from the next next-generation sequencing
2023-Mar, Biophysics reviews
IF:2.9Q2
DOI:10.1063/5.0091135
PMID:38505815
|
综述 | 本文综述了用于空间转录组学分析的深度学习方法 | 提出了利用深度学习模型解决空间转录组学特定挑战的新方法 | 目前深度学习模型尚处于初期阶段，需要进一步探索 | 研究深度学习在空间转录组学中的应用及其潜力 | 空间转录组学的数据分析方法 | 机器学习 | NA | 转录组学 | 深度学习模型 | 多模态数据，包括组织学图像和计数矩阵 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1771 | 2024-08-07 |
Identifying biomarkers of heterogeneity and transplantation efficacy in retinal pigment epithelial cells
2023-12-04, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20230913
PMID:37728563
|
研究论文 | 本文通过批量和单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析了成人RPE干细胞衍生的RPE细胞产品，评估了其在体外和体内的功能细胞整合及视觉恢复效果 | 本文首次鉴定了lncRNA（TREX）作为体内疗效的预测标记物，并通过敲低和过表达实验验证了其在细胞整合和视觉恢复中的作用 | NA | 提高视网膜色素上皮细胞移植疗法的疗效和安全性 | 视网膜色素上皮细胞的异质性和移植效果的生物标志物 | 数字病理学 | 年龄相关性黄斑变性 | RNA测序 | NA | RNA | 涉及Royal College of Surgeons大鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 1772 | 2024-08-05 |
Tumor macrophage functional heterogeneity can inform the development of novel cancer therapies
2023-12, Trends in immunology
IF:13.1Q1
DOI:10.1016/j.it.2023.10.007
PMID:37995659
|
研究论文 | 本文讨论了肿瘤相关巨噬细胞的功能异质性及其对癌症新疗法开发的影响 | 识别出巨噬细胞的分子亚型和功能，从而发现新的治疗靶点 | 传统治疗方法未能提供改变临床实践的突破性进展 | 提高对肿瘤微环境中巨噬细胞作用的理解，并推动新型靶向治疗的发展 | 聚焦于肿瘤微环境中的巨噬细胞功能及其潜在治疗靶点 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和空间转录组技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1773 | 2024-08-07 |
A single-cell atlas of immunocytes in the spleen of a mouse model of Wiskott-Aldrich syndrome
2023 Nov-Dec, Cellular immunology
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.cellimm.2023.104783
PMID:37944382
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，对Wiskott-Aldrich综合征小鼠模型的脾脏免疫细胞进行了全面的转录组分析 | 首次在单细胞分辨率下揭示了WAS-KO小鼠脾脏免疫细胞的转录特征，并鉴定了与疾病病理相关的新基因 | NA | 探究Wiskott-Aldrich综合征小鼠模型脾脏免疫细胞的免疫缺陷机制 | WAS-KO小鼠脾脏的免疫细胞 | 数字病理学 | 免疫缺陷疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 11,269个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1774 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics reveals subtype-specific molecular profiles in Nrf2-deficient macrophages from murine atherosclerotic aortas
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1249379
PMID:37965327
|
研究论文 | 本研究分析了小鼠动脉粥样硬化主动脉中缺乏Nrf2的巨噬细胞亚群的转录组 | 揭示了Nrf2缺乏导致的巨噬细胞亚型特异性转录组变化与炎症、铁稳态和细胞损伤或死亡途径之间的联系 | 仅使用了特定的小鼠模型，可能限制了结果的普遍适用性 | 研究Nrf2在小鼠动脉粥样硬化中的具体作用 | 来自小鼠动脉粥样硬化主动脉的不同Nrf2缺乏的巨噬细胞亚群 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA表达数据 | 实验中使用了Cdh5表达细胞中的Nrf2失活小鼠和适当的对照小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 1775 | 2024-08-04 |
mitoSplitter: A mitochondrial variants-based method for efficient demultiplexing of pooled single-cell RNA-seq
2023-09-26, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2307722120
PMID:37725654
|
研究论文 | 本文开发了一种基于线粒体变体的方法‘mitoSplitter’，用于高效地解混合池化的单细胞RNA-seq数据 | 提出利用线粒体RNA变体进行解混合的新算法，从而克服传统方法的局限 | 在多样本和大规模细胞数据的情况下，仍可能存在一定的挑战与限制 | 旨在提高单细胞RNA-seq数据分析的效率，减少批次效应 | 研究五种非小细胞肺癌细胞系对BET化学降解的反应 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA-seq | NA | RNA数据 | 10个样本，60000个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1776 | 2024-08-07 |
A Refined Single Cell Landscape of Haematopoiesis in the Mouse Foetal Liver
2023-Mar-23, Journal of developmental biology
IF:2.2Q3
DOI:10.3390/jdb11020015
PMID:37092477
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，对小鼠胎肝中的造血细胞进行了精细的细胞图谱构建 | 发现了小鼠胎肝中一种类似于人类已知的胎盘中等血红蛋白特征，以及一种先前未被识别的原始红细胞群 | NA | 获得胎肝中造血细胞的精细单细胞图谱 | 小鼠胎肝中的造血细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 包括了比先前数据集更多的细胞的E12.5小鼠胎肝样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1777 | 2024-08-07 |
Smoking induces shifts in cellular composition and transcriptome within the bronchial mucus barrier
2023-02, Respirology (Carlton, Vic.)
DOI:10.1111/resp.14401
PMID:36414410
|
研究论文 | 本研究评估了吸烟对支气管黏液屏障细胞组成和基因表达的影响，并探讨了基于单细胞RNA测序的细胞解卷积方法在预测RNA测序数据中细胞类型组成的能力 | 研究首次使用细胞解卷积方法预测RNA测序数据中的细胞类型组成，并验证了该方法的有效性 | 研究样本量相对较小，且仅限于特定的疾病和吸烟状态群体 | 理解吸烟暴露对支气管黏液屏障黏膜损伤的机制 | 支气管黏液屏障的细胞组成和基因表达 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | 细胞解卷积 | RNA测序数据 | 共149名参与者，包括56名慢性阻塞性肺疾病患者，77名无慢性阻塞性肺疾病参与者，以及16名停止吸烟一年的参与者 | NA | NA | NA | NA |
| 1778 | 2024-08-04 |
Single-cell and bulk RNA sequencing analysis of B cell marker genes in TNBC TME landscape and immunotherapy
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1245514
PMID:38111587
|
研究论文 | 本研究旨在通过分析三阴性乳腺癌（TNBC）患者的B细胞标记基因来调查其预后特征 | 建立了基于B细胞标记基因的肿瘤微环境预测模型，以预测TNBC患者的预后和免疫治疗反应 | 鉴于样本量仅限于四个TNBC患者，可能限制了结果的普遍适用性 | 探索三阴性乳腺癌患者的预后特征 | 四名TNBC患者的肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | RNA测序 | NA | 细胞和基因表达数据 | 参与研究的样本量为四名TNBC患者的22,106个细胞和20,556个基因 | NA | NA | NA | NA |
| 1779 | 2024-08-07 |
Loss of CFTR function in macrophages alters the cell transcriptional program and delays lung resolution of inflammation
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1242381
PMID:38035088
|
研究论文 | 本文研究了囊性纤维化（CF）中CFTR基因功能丧失对巨噬细胞的影响及其对肺部炎症消退的延迟作用 | 首次报道了CFTR功能丧失在巨噬细胞中引起的细胞转录程序改变，以及这种改变对肺部炎症消退的影响 | NA | 探讨CFTR功能丧失与中性粒细胞性炎症之间的关系 | CFTR基因功能丧失对巨噬细胞和肺部炎症的影响 | NA | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 1780 | 2024-08-04 |
Unravelling spatial gene associations with SEAGAL: a Python package for spatial transcriptomics data analysis and visualization
2023-07-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btad431
PMID:37436699
|
研究论文 | 本文介绍了一个名为SEAGAL的Python包，用于分析和可视化空间转录组数据。 | SEAGAL包能够在单基因和基因集水平上检测和可视化空间基因相关性，突破了传统共表达分析的局限。 | 尚未提及具体局限性。 | 旨在通过空间转录组分析揭示基因的空间相关性。 | 对空间转录组数据集中的基因表达和空间坐标进行分析。 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |