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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1761 | 2024-08-05 |
Spinal astrocytic MeCP2 regulates Kir4.1 for the maintenance of chronic hyperalgesia in neuropathic pain
2023-05, Progress in neurobiology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.pneurobio.2023.102436
PMID:36931588
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研究论文 | 本文探讨了脊髓星形胶质细胞中的MeCP2如何调节Kir4.1以维持神经病理性疼痛中的慢性痛觉过敏 | 揭示了Kir4.1通道在慢性神经病理性疼痛中通过MeCP2的调节作用 | 研究主要基于小鼠模型,需要在其他模型中进一步验证 | 探讨脊髓星形胶质细胞在慢性神经病理性疼痛中的作用及其机制 | 脊髓星形胶质细胞和Kir4.1通道 | 数字病理学 | 神经病理性疼痛 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 小鼠模型中观察到的脊髓星形胶质细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1762 | 2024-08-05 |
Cytotoxic T Cells Targeting Spike Glycoprotein Are Associated with Hybrid Immunity to SARS-CoV-2
2023-05-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2200815
PMID:36961450
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研究论文 | 这篇文章探讨了针对SARS-CoV-2尖峰糖蛋白的细胞毒性T细胞与混合免疫之间的关联 | 这项研究揭示了混合免疫中细胞毒性T细胞的重要性,并比较了带有和没有既往感染的个体的T细胞反应 | 样本数量相对较小,且未足够探讨其他可能影响免疫反应的因素 | 研究混合免疫的免疫机制及其对SARS-CoV-2突破性感染的保护作用 | 参与者分为SARS-CoV-2未感染和康复个体,均接受了两剂mRNA疫苗接种 | 免疫学 | SARS-CoV-2 | 流式细胞术和单细胞RNA测序 | NA | 生物数据 | 30名个体 (13名未感染者,17名康复者) | NA | NA | NA | NA |
| 1763 | 2024-08-05 |
An update in club cell biology and its potential relevance to chronic obstructive pulmonary disease
2023-05-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00192.2022
PMID:36942863
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评论 | 本综述整合了俱乐部细胞的最新研究发现及其与慢性阻塞性肺病的潜在关联 | 通过整合单细胞RNA测序数据,提供了俱乐部细胞异质性和功能的新见解 | 缺乏对俱乐部细胞在COPD患者中的具体机制的深入探讨 | 探讨俱乐部细胞的生物学及其在慢性阻塞性肺病中的潜在重要性 | 俱乐部细胞及其在小气道中的功能 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1764 | 2024-08-05 |
Immune Checkpoint Molecule TIGIT Regulates Kidney T Cell Functions and Contributes to AKI
2023-05-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000000000063
PMID:36747315
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研究论文 | 本研究揭示了免疫检查点分子TIGIT在肾脏T细胞功能中的调节作用,并探讨其在急性肾损伤(AKI)中的贡献 | 发现TIGIT在小鼠及人类肾脏T细胞中的上调,并揭示其通过影响T细胞的效应特征和细胞因子产生来调节AKI病理生理 | 该研究主要在小鼠模型中进行,尚需进一步验证人类中的具体机制和临床相关性 | 探讨TIGIT在肾脏T细胞中的作用及其对AKI结果的影响 | 针对小鼠及人类肾脏T细胞进行的研究 | NA | 急性肾损伤 | RNA测序(RNA-Seq),流式细胞术 | NA | RNA序列数据 | 小鼠和人类样本,包括缺失TIGIT的小鼠和来自肾脏切除术样本的人类T细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1765 | 2024-08-05 |
A Salivary Gland Resident Macrophage Subset Regulating Radiation Responses
2023-05, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345221150005
PMID:36883649
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研究论文 | 本研究发现唾液腺驻留巨噬细胞亚群在放射反应中起调节作用 | 首次报告了具有不同功能或转录谱的唾液腺驻留巨噬细胞亚群 | 研究主要在小鼠模型中进行,临床转化需进一步验证 | 揭示唾液腺驻留巨噬细胞亚群的功能及其对放射影响的调节作用 | 小鼠下颌唾液腺中的巨噬细胞亚群 | 数字病理学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 小鼠下颌唾液腺样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1766 | 2024-08-05 |
High-Resolution Transcriptomic Landscape of the Human Submandibular Gland
2023-05, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345221147908
PMID:36726292
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研究论文 | 该文章深入分析了人类下颌下腺的转录组特征,特别是在单细胞层面。 | 首次在单细胞分辨率下揭示了下颌下腺细胞群体的复杂转录组异质性,并识别了人特有的异常细胞类型。 | 由于正常人类组织获取的困难,全面的分子特征描述仍然不完整。 | 旨在深入理解人类下颌下腺的生物学和病理生理学。 | 人类下颌下腺的成年男性和女性样本。 | 数字病理学 | NA | RNA-seq, scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 成年男性和女性人类下颌下腺样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1767 | 2024-08-05 |
Single-cell RNAseq provides insight into altered immune cell populations in human fracture nonunions
2023-05, Journal of orthopaedic research : official publication of the Orthopaedic Research Society
IF:2.1Q2
DOI:10.1002/jor.25452
PMID:36200412
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研究论文 | 该研究通过单细胞 RNA 测序分析人类骨折不愈合中的免疫细胞群体变化 | 使用单细胞 RNA 测序揭示了骨折不愈合中免疫细胞基因表达的变化 | 样本量较小,仅涉及9名患者 | 探讨骨免疫学在骨折愈合中的作用 | 来自五名股骨不愈合患者的髓腔组织样本 | 数字病理学 | NA | 单细胞 RNA 测序 | NA | 基因表达数据 | 9个样本(5个股骨不愈合样本和4个原生骨对照) | NA | NA | NA | NA |
| 1768 | 2024-08-04 |
Identification and Localization of Cell Types in the Mouse Olfactory Bulb Using Slide-SeqV2
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3425-7_13
PMID:37688732
|
研究论文 | 本文记录了使用Slide-SeqV2技术在小鼠嗅球中可视化基因表达。 | 提出了一种无偏见的方法,通过空间识别的珠子定位和量化个体转录本,从而识别和定位个别细胞类型。 | NA | 研究小鼠嗅球中细胞类型的识别和定位。 | 小鼠嗅球中的细胞类型和亚型。 | 数字病理学 | NA | Slide-SeqV2 | NA | RNA分子 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1769 | 2024-08-05 |
Tissue-specific Cre driver mice to study vascular diseases
2023-12, Vascular pharmacology
IF:3.5Q2
DOI:10.1016/j.vph.2023.107241
PMID:37923099
|
研究论文 | 本文探讨了组织特异性Cre驱动小鼠在血管疾病研究中的应用 | 介绍了革命性的单细胞RNA测序和双重重组酶系统对于组织特异性Cre驱动小鼠的未来发展 | 未提及具体实验局限性 | 扩展对血管疾病的理解 | 主要研究血管壁的主要细胞类型及相关的Cre驱动小鼠 | 数字病理学 | NA | Cre-loxP系统 | 条件性基因敲除小鼠 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1770 | 2024-08-04 |
CCR7+ CD4 T Cell Immunosurveillance Disrupted in Chronic SIV-Induced Neuroinflammation in Rhesus Brain
2023-Aug-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.28.555037
PMID:37693567
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研究论文 | 这篇文章探讨了CCR7+ CD4 T细胞在恒河猴脑中慢性SIV诱导的神经炎症中的免疫监视功能的破坏 | 首次揭示了CCR7+ CD4 T细胞在中枢神经系统中的特定亚群及其功能特点 | 样本主要来自恒河猴,可能限制了结果对人类的直接适用性 | 研究CCR7+ CD4 T细胞在慢性SIV诱导的神经炎症中的角色 | 恒河猴的CCR7+ CD4 T细胞及其在神经炎症中的功能 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析、ATAC-seq、空间转录组学、流式细胞术 | NA | NA | 慢性SIV感染的恒河猴 | NA | NA | NA | NA |
| 1771 | 2024-08-05 |
Lactate-dependent transcriptional regulation controls mammalian eye morphogenesis
2023-07-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-39672-2
PMID:37452018
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研究论文 | 这篇文章研究了乳酸在哺乳动物眼形态发生中的转录调控作用 | 揭示了乳酸作为信号分子在哺乳动物眼形态发生中扮演的重要角色 | 未详细探讨其他代谢途径对 retinal morphogenesis 的潜在影响 | 探讨乳酸在视网膜发育早期阶段的重要性和机制 | 研究了小鼠胚胎中的视网膜祖细胞及其代谢活动 | 数字病理学 | NA | 单细胞 RNA 测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1772 | 2024-08-04 |
Insulin-like growth factor 1 reduces coronary atherosclerosis in pigs with familial hypercholesterolemia
2023-02-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.165713
PMID:36602878
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研究论文 | 这项研究探讨了类胰岛素生长因子1在家族性高胆固醇血症猪中的动脉粥样硬化作用 | 首次在家族性高胆固醇血症猪模型中证实IGF-1能减少冠状动脉粥样硬化并促进稳定斑块特征 | 本研究的结果可能仅限于猪模型,需在临床试验中进一步验证 | 研究IGF-1对冠状动脉粥样硬化的影响及其机制 | 家族性高胆固醇血症(FH)猪 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 空间转录组学 | NA | 组织样本 | 使用家族性高胆固醇血症猪进行6个月的实验 | NA | NA | NA | NA |
| 1773 | 2024-08-04 |
Single cell and spatial transcriptomics analysis of kidney double negative T lymphocytes in normal and ischemic mouse kidneys
2023-11-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-48213-2
PMID:38017015
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研究论文 | 本文探讨了小鼠正常和缺血性肾脏中双阴性T淋巴细胞的单细胞与空间转录组学分析 | 研究首次揭示了相比传统CD4和CD8T细胞,DN T细胞在急性肾损伤中的分子特征和空间动态 | 对于DN T细胞的研究信息仍然非常有限,与CD4和CD8细胞的比较尚需进一步研究 | 阐明急性肾损伤期间DN T细胞的分子特征和空间动态 | 小鼠的DN、CD4和CD8 T细胞 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和空间转录组学 | NA | RNA数据 | 排序的小鼠DN、CD4和CD8细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1774 | 2024-08-05 |
Uncovering the Heterogeneity of Cardiac Lin-KIT+ Cells: A scRNA-seq Study on the Identification of Subpopulations
2023-10-08, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxad057
PMID:37539750
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序(scRNA-seq)分析心脏Lin-KIT+细胞的异质性及其亚群体。 | 该研究揭示并分类了心脏KIT细胞的三种主要亚群体及其独特的代谢适应性。 | 研究主要基于小鼠模型,可能无法完全反映人类心脏细胞的特性。 | 揭示心脏Lin-KIT+细胞的异质性并识别其亚群体及标记物。 | 成年小鼠心脏来源的细胞群体。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | scRNA-seq | NA | 基因组数据 | 成年小鼠心脏细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1775 | 2024-08-04 |
SUMA: a lightweight machine learning model-powered shared nearest neighbour-based clustering application interface for scRNA-Seq data
2023, Turkish journal of biology = Turk biyoloji dergisi
DOI:10.55730/1300-0152.2675
PMID:38681777
|
研究论文 | 本文介绍了SUMA,一个轻量级的机器学习模型驱动的共享最近邻聚类应用界面,用于scRNA-Seq数据 | SUMA使用随机森林模型预测邻居的最优数量,从而获得最佳聚类结果,并集成了多种常用方法 | 主要依赖用户定义的参数,可能会影响聚类结果的有效性 | 开发一种有效的工具用于单细胞转录组数据的聚类和细胞类型标注 | 公开的scRNA-Seq数据集及三种不同的基于图形的聚类算法 | 机器学习 | NA | 随机森林 | NA | 基因表达数据 | 多个公开可用的scRNA-Seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 1776 | 2024-08-05 |
StemnesScoRe: an R package to estimate the stemness of glioma cancer cells at single-cell resolution
2023, Turkish journal of biology = Turk biyoloji dergisi
DOI:10.55730/1300-0152.2672
PMID:38681778
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研究论文 | 本研究开发了一个用于估计胶质瘤癌细胞干性指数的R软件包StemnesScoRe,达到单细胞分辨率。 | 首次使用scATAC-seq数据构建了特定于胶质瘤的干性评分模型。 | 尚未提及本研究的具体局限性 | 旨在更好地理解胶质瘤细胞的干性特征。 | 研究对象为胶质瘤癌症干细胞。 | 机器学习 | 胶质瘤 | scATAC-seq | 随机森林、梯度提升、极端梯度提升 | 转录组和表观基因组数据 | 涉及多个患者的胶质瘤单细胞RNA-seq数据和scATAC-seq数据 | NA | NA | NA | NA |
| 1777 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptional landscapes of bovine peri-implantation development
2023-Jun-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.13.544813
PMID:37398069
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研究论文 | 该文章展示了牛的胚胎植入前发育过程中单细胞转录组的全景视图 | 发现了一种之前未被认识的原始滋养层细胞谱系,负责牛的妊娠维持 | 没有提供具体的样本量信息 | 全面理解牛的植入前发育中的细胞层次及其分子机制 | 牛的植入前胚胎在不同发育阶段的细胞组成和基因表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 不同发育阶段(第12、14、16和18天)的单细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1778 | 2024-08-05 |
Inference of cell type-specific gene regulatory networks on cell lineages from single cell omic datasets
2023-05-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-38637-9
PMID:37244909
|
研究论文 | 本文提出了一种新颖的方法,通过单细胞组学数据推断特定细胞类型的基因调控网络 | 开发了单细胞多任务网络推断(scMTNI)框架,可以整合scRNA-seq和scATAC-seq数据,推断细胞谱系上的基因调控网络 | 当前方法在整合scRNA-seq和scATAC-seq测量及建模网络动态方面存在局限性 | 旨在提高细胞类型特异性基因调控网络的推断精度 | 特定细胞类型的基因调控网络 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 单细胞可转座酶可及染色质测序(scATAC-seq) | 多任务学习框架 | 模拟数据和真实数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1779 | 2024-08-05 |
Improved Protocol for Reproducible Human Cortical Organoids Reveals Early Alterations in Metabolism with MAPT Mutations
2023-Jul-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.11.548571
PMID:37503195
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研究论文 | 本研究报告了一种96孔方法,用于高效、可扩展和可重复的人类皮层类器官的生产 | 采用可控释放的FGF2和适当浓度的SB431542显著提高了类器官的皮层模式化和重复性 | 不同hPSC供体线和实验重复之间的高变异性仍然存在 | 研究人类皮层类器官的建立及分析与前额叶痴呆相关的突变对代谢的早期影响 | 来源于人类多能干细胞(hPSCs)的皮层类器官 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1780 | 2024-08-04 |
YAP1 and WWTR1 expression inversely correlates with neuroendocrine markers in Merkel cell carcinoma
2023-03-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI157171
PMID:36719743
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研究论文 | 本文探讨了Merkel细胞癌(MCC)中YAP1和WWTR1的表达与神经内分泌标志物之间的反向关系 | 研究揭示了MCC中NE基因表达的异质性,并发现YAP1/WWTR1沉默对MCPyV阳性MCC的发展至关重要 | 目前的临床诊断标志物无法区分MCPyV阳性和阴性亚型,且MCC肿瘤的表达谱尚未探索 | 研究MCC的转录环境及其与YAP1和WWTR1的关系 | 针对来自患者的肿瘤活检和细胞系进行的RNA-Seq分析 | 数字病理学 | 皮肤癌 | RNA-Seq | NA | 转录组数据 | 多个肿瘤活检样本和细胞系 | NA | NA | NA | NA |