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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1741 | 2024-08-07 |
Elaboration and validation of a prognostic signature associated with disulfidoptosis in lung adenocarcinoma, consolidated with integration of single-cell RNA sequencing and bulk RNA sequencing techniques
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1278496
PMID:37965333
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序技术,详细阐述并验证了与硫化物凋亡相关的肺腺癌预后标志物 | 首次将单细胞RNA测序与批量RNA测序技术结合,探索与硫化物凋亡相关的基因,并构建预后风险标志物 | NA | 旨在通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序技术,揭示与硫化物凋亡相关的基因,并预测肺腺癌患者的临床预后 | 肺腺癌(LUAD)及其与硫化物凋亡相关的基因 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和批量RNA测序(bulk RNA-seq) | LASSO-Cox回归模型 | RNA序列数据 | 使用GSE149655数据集的肺腺癌和正常样本,具体样本数量未详述 | NA | NA | NA | NA |
| 1742 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomic atlas throughout anti-BCMA CAR-T therapy in patients with multiple myeloma
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1278749
PMID:38035111
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,分析了多发性骨髓瘤患者在接受抗BCMA CAR-T治疗过程中骨髓和外周血样本的转录组图谱 | 揭示了复发患者肿瘤细胞中HSP90B1和HSPA5的高表达以及内质网应激和未折叠蛋白反应途径的显著富集 | NA | 探究多发性骨髓瘤患者在接受抗BCMA CAR-T治疗后的免疫细胞变化及其与复发的关系 | 多发性骨髓瘤患者在接受抗BCMA CAR-T治疗过程中的骨髓和外周血细胞 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 24个骨髓或外周血样本,共分析了59,725个骨髓细胞和72,479个外周血细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1743 | 2024-08-07 |
Single cell transcriptome analyses reveal the roles of B cells in fructose-induced hypertension
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1279439
PMID:38045685
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了B细胞在果糖诱导的高血压中的作用 | 首次揭示了B细胞在果糖诱导的高血压中的重要作用,并发现了B细胞与Tfh细胞及干扰素途径的激活之间的关联 | 研究仅限于Dahl盐敏感性雄性大鼠,结果的普遍性有待进一步验证 | 探讨B细胞在果糖诱导的高血压发展中的作用 | Dahl盐敏感性雄性大鼠的肠黏膜细胞和外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组 | 8周龄Dahl盐敏感性雄性大鼠,分为两组,每组给予不同处理,共进行4周的实验 | NA | NA | NA | NA |
| 1744 | 2024-08-07 |
Profiling cellular heterogeneity and fructose transporter expression in the rat nephron by integrating single-cell and microdissected tubule segment transcriptomes
2023-Dec-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.20.572656
PMID:38187558
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和微切割的肾小管片段转录组数据,分析了大鼠肾单位中的细胞异质性和果糖转运蛋白表达。 | 首次揭示了肾小管近端不同亚段细胞中果糖转运蛋白的复杂异质性表达模式,并发现S3段是果糖重吸收的主要部位。 | 研究主要基于公开数据库的数据,未进行实验验证。 | 探究大鼠肾单位中细胞异质性和果糖转运蛋白表达模式。 | 大鼠肾单位中的细胞和果糖转运蛋白。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用了公开数据库中的大鼠和人类肾脏转录组和蛋白质组数据。 | NA | NA | NA | NA |
| 1745 | 2024-08-05 |
Long-read single-cell sequencing reveals expressions of hypermutation clusters of isoforms in human liver cancer cells
2023-Aug-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.16.532991
PMID:36993628
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研究论文 | 本研究开发了一种基于 LOOPseq 技术的合成长读单细胞测序技术,分析了人类肝癌细胞中的超突变亚型表达 | 提出了 LOOPseq 单细胞测序技术,识别出特异性强的肝细胞癌突变 mRNA 亚型及新融合转录本 | 没有提到具体的限制 | 旨在揭示人类肝癌细胞中蛋白质表达的复杂性与多样性 | 分析了来自个体的 447 份肝细胞癌与良性肝组织的转录组 | 数字病理学 | 肝癌 | 长读单细胞测序 | NA | 转录组 | 447 份转录组样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1746 | 2024-08-05 |
Intercellular communication atlas reveals Oprm1 as a neuroprotective factor for retinal ganglion cells
2023-Aug-17, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3193738/v1
PMID:37645816
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研究论文 | 本文探讨了细胞间通信如何影响视网膜神经节细胞的存活 | 首次揭示了μ阿片受体(Oprm1)作为视网膜神经节细胞的神经保护因子的作用 | 未提及具体的临床应用或人类数据 | 研究细胞间信号在视网膜神经节细胞存活中的贡献 | 视网膜神经节细胞及其与其他视网膜细胞的相互作用 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1747 | 2024-08-05 |
Intercellular communication atlas reveals Oprm1 as a neuroprotective factor for retinal ganglion cells
2023-Jul-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.14.549118
PMID:37502873
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研究论文 | 本研究探讨了细胞间通信如何促进视网膜神经节细胞的生存 | 发现Oprm1作为一种神经保护因子并通过细胞间相互作用促进高生存率视网膜神经节细胞的存活 | 研究的局限性在于可能未能完全揭示所有相关的细胞间相互作用 | 研究细胞间通信在神经元存活中的作用 | 研究对象为视网膜神经节细胞和其他视网膜细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用了多种视网膜细胞亚群体的样本,通过细胞间交互分析来归纳 | NA | NA | NA | NA |
| 1748 | 2024-08-05 |
Immunologic barriers in liver transplantation: a single-cell analysis of the role of mesenchymal stem cells
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1274982
PMID:38143768
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研究论文 | 本研究分析了可能指示肝移植排斥或耐受的生物标志物及其机制 | 首次探讨了免疫抑制剂与间充质干细胞联合治疗对肝移植耐受性的影响 | 研究仅在特定的动物模型中进行,可能无法完全外推至临床 | 研究肝移植耐受的生物标志物和相关机制 | Lewis-Lewis和F344-Lewis大鼠模型 | 数字病理 | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞 | Lewis-Lewis和F344-Lewis大鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 1749 | 2024-08-07 |
Comprehensive analyses for the coagulation and macrophage-related genes to reveal their joint roles in the prognosis and immunotherapy of lung adenocarcinoma patients
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1273422
PMID:38022584
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研究论文 | 本研究通过综合分析凝血和巨噬细胞相关基因,揭示它们在肺腺癌患者预后和免疫治疗中的联合作用 | 构建了一个风险评分模型,用于预测肺腺癌患者的预后和免疫治疗临床结果 | NA | 探索与凝血过程和肿瘤相关巨噬细胞浸润相关的肺腺癌新型生物标志物 | 肺腺癌患者的凝血和巨噬细胞相关基因 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 加权基因共表达网络分析(WGCNA),单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 风险评分模型 | RNA-seq数据 | 涉及33个凝血和巨噬细胞相关基因,其中19个用于构建风险评分模型,最终包含10个与生存相关的基因 | NA | NA | NA | NA |
| 1750 | 2024-08-07 |
Distinct regulatory machineries underlying divergent chromatin landscapes distinguish innate lymphoid cells from T helper cells
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1271879
PMID:38106414
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研究论文 | 本研究通过综合分析294个批量RNA测序结果,利用scRNA-seq算法,探讨了先天淋巴细胞(ILCs)与T辅助细胞(Th细胞)在染色质景观和转录调控机制上的差异 | 发现了区分ILCs和Th细胞的两个基因集,以及区分不同免疫反应的三个基因集;通过染色质可及性分析,揭示了ILCs和Th细胞在转录调控上的差异 | NA | 探讨先天淋巴细胞与T辅助细胞在转录调控和染色质景观上的主要区别 | 先天淋巴细胞(ILCs)和T辅助细胞(Th细胞) | 免疫学 | NA | RNA测序(RNA-seq) | scRNA-seq算法 | RNA序列 | 294个批量RNA测序结果 | NA | NA | NA | NA |
| 1751 | 2024-08-07 |
The mosquito effect: regulatory and effector T cells acquire cytoplasmic material from tumor cells through intercellular transfer
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1272918
PMID:38179041
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研究论文 | 本文介绍了一种新的肿瘤小鼠模型,其中肿瘤细胞表达可溶性超亮荧光蛋白ZsGreen,用于检测和测量肿瘤细胞向浸润免疫细胞的细胞质转移 | 首次提出并命名了肿瘤浸润T细胞的“蚊子效应”,即T细胞通过细胞间转移从肿瘤细胞获取细胞质材料的现象 | 由于缺乏强有力的模型,免疫系统中这种转移的功能影响和分子机制仍大多未知 | 研究肿瘤细胞与免疫细胞间的细胞质转移现象及其对T细胞功能的影响 | 肿瘤细胞、T调节细胞、效应CD8 T细胞及髓系细胞 | 免疫学 | 肿瘤 | scRNA-seq | NA | 荧光蛋白ZsGreen | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 1752 | 2024-08-07 |
IL-7 receptor signaling drives human B-cell progenitor differentiation and expansion
2023-09-28, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2023019721
PMID:37369082
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研究论文 | 本研究通过流式细胞术和单细胞RNA测序分析健康对照组和IL-7Rα缺陷患者的骨髓样本,结合体外人B细胞分化模型,证明IL-7R信号在人B淋巴生成中起关键作用 | 揭示了IL-7信号在促进B淋巴细胞命运和扩展早期人B细胞前体中的先前未知作用,并指出了人与小鼠之间的差异 | NA | 探讨IL-7R信号在人B淋巴生成中的作用及其在血液干细胞移植和白血病发生中的意义 | IL-7R信号在人B淋巴生成中的作用 | 免疫学 | 免疫缺陷病 | 流式细胞术,单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 健康对照组和IL-7Rα缺陷患者的骨髓样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1753 | 2024-08-07 |
Prolonged response after TPO-RA discontinuation in primary ITP: results of a prospective multicenter study
2023-06-08, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2022018665
PMID:36893453
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研究论文 | 本研究探讨了在停止使用血小板生成素受体激动剂(TPO-RA)后,原发性免疫性血小板减少症(ITP)患者持续无治疗的反应情况 | 发现单细胞RNA测序揭示了在TPO-RA停药后无持续反应的患者中,CD8+ T细胞中肿瘤坏死因子α信号通过NF-κB途径的富集,以及CD69在基线时在这些患者中的过度表达 | 未发现显著的临床预测因子来预测第24周的无治疗持续反应 | 评估原发性ITP患者在TPO-RA停药后的持续无治疗反应 | 持续或慢性原发性ITP成年患者,且在TPO-RAs治疗下完全反应 | NA | 免疫性血小板减少症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 48名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 1754 | 2024-08-07 |
A single-cell atlas identifies pretreatment features of primary imatinib resistance in chronic myeloid leukemia
2023-06-01, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2022017295
PMID:36857629
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,识别了慢性髓性白血病中伊马替尼原发性耐药的前治疗特征 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了慢性髓性白血病中伊马替尼耐药的关键细胞特征和基因表达模式 | 研究主要集中在伊马替尼耐药的预后特征,未涉及其他治疗方案的耐药机制 | 探讨慢性髓性白血病中伊马替尼原发性耐药的分子机制 | 慢性髓性白血病患者的骨髓样本,特别是白血病干细胞和自然杀伤细胞 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 基因表达数据 | 多个慢性髓性白血病患者的骨髓样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1755 | 2024-08-07 |
Cardiomyocyte Pdk4 response is associated with metabolic maladaptation in aging
2023-04, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.13800
PMID:36797808
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术,探讨了老年和年轻小鼠心脏细胞在缺血/再灌注条件下转录差异,特别是心肌细胞中Pdk4基因的表达变化及其对葡萄糖代谢的影响 | 首次揭示了Pdk4在年轻和老年小鼠心肌细胞中的差异表达,及其对葡萄糖代谢的调控作用 | 研究仅限于小鼠模型,未来需在人类样本中验证这些发现 | 探索衰老如何增加心脏对缺血损伤的脆弱性 | 老年和年轻小鼠的心肌细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 老年和年轻小鼠的心脏样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1756 | 2024-08-04 |
In Silico Localization of Perilymph Proteins Enriched in Meńier̀e Disease Using Mammalian Cochlear Single-cell Transcriptomics
2023-Mar, Otology & neurotology open
DOI:10.1097/ONO.0000000000000027
PMID:38516320
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研究论文 | 本研究利用哺乳动物耳蜗的单细胞转录组学定位梅尼埃病患者富集的外淋巴蛋白 | 研究首次通过单细胞转录组数据分析梅尼埃病相关的外淋巴蛋白与特定耳蜗细胞类型的关联 | 目前对人类内耳疾病的理解有限,可能影响结果的广泛适用性 | 研究梅尼埃病患者外淋巴蛋白的表达与耳蜗特定细胞类型的关联 | 梅尼埃病患者的外淋巴蛋白及其在耳蜗细胞中的表达 | 数字病理学 | 梅尼埃病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个梅尼埃病患者及对照样本数据 | NA | NA | NA | NA |
| 1757 | 2024-08-07 |
Decoding aging-dependent regenerative decline across tissues at single-cell resolution
2023-12-07, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2023.09.014
PMID:37898124
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析,探讨了年轻和老年小鼠八个组织中再生能力的年龄依赖性下降机制 | 揭示了老年组织中再生过程减弱的细胞和分子机制,特别是干细胞移动能力受损和血管生成不足的影响 | NA | 解码年龄与再生能力之间的关系 | 年轻和老年小鼠的八个组织 | 生物学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 年轻和老年小鼠的八个组织 | NA | NA | NA | NA |
| 1758 | 2024-08-07 |
Generation of transgene-free hematopoietic stem cells from human induced pluripotent stem cells
2023-12-07, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2023.11.002
PMID:38065068
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研究论文 | 本文通过一种原创的一步培养系统,从人诱导多能干细胞(hiPSCs)中分化出无载体和基质的可移植造血干细胞(HSCs) | 首次成功从hiPSCs中生成无载体和基质的可移植HSCs,并展示了其在免疫缺陷小鼠中的多系造血能力 | NA | 研究从多能干细胞生成造血干细胞的可行性,并帮助识别人类个体发育过程中HSC产生的关键调控因子 | 人诱导多能干细胞(hiPSCs)和造血干细胞(HSCs) | 干细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1759 | 2024-08-05 |
Tissue morphology influences the temporal program of human brain organoid development
2023-10-05, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2023.09.003
PMID:37802039
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研究论文 | 本文研究了组织形态如何影响人脑类器官的发展时间程序 | 创新点在于揭示了组织形态对细胞命运决策的影响,并通过单核RNA测序和空间转录组学分析了这种相互作用 | 研究的局限性在于实验模型的复杂性可能影响结果的推广性 | 研究的目的是探讨组织形态如何影响细胞命运和组织架构的相互作用 | 研究对象为人类脑类器官及其发育过程中的细胞命运变化 | 数字病理 | NA | snRNA-seq 和空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1760 | 2024-08-07 |
CCL21-DC in situ vaccination in murine NSCLC overcomes resistance to immunotherapy and generates systemic tumor-specific immunity
2023-09, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-006896
PMID:37730274
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研究论文 | 本研究探讨了CCL21-DC在位疫苗与免疫检查点抑制剂联合治疗在小鼠非小细胞肺癌(NSCLC)中的应用,旨在克服免疫治疗抵抗并产生系统性肿瘤特异性免疫 | CCL21-DC在位疫苗能够增强免疫抵抗性小鼠NSCLC对免疫检查点抑制剂的敏感性,并建立肿瘤特异性免疫记忆 | NA | 研究CCL21-DC在位疫苗与免疫检查点抑制剂联合治疗对小鼠NSCLC的疗效 | 具有不同驱动突变的小鼠NSCLC模型 | 数字病理学 | 非小细胞肺癌 | 流式细胞术,单细胞RNA测序,全外显子测序 | NA | 细胞 | 具有不同驱动突变的小鼠NSCLC模型(KrasG12D/P53+/-/Lkb1-/- (KPL); KrasG12D/P53+/- (KP); 和 KrasG12D (K)) | NA | NA | NA | NA |