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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1721 | 2024-08-07 |
Single-cell landscape of immune cells during the progression from HBV infection to HBV cirrhosis and HBV-associated hepatocellular carcinoma
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1320414
PMID:38116005
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了不同疾病阶段的人类肝脏免疫微环境,揭示了HBV感染至HBV相关肝硬化和肝细胞癌过程中免疫细胞的变化 | 首次详细描述了从HBV感染到肝硬化和肝细胞癌进展过程中肝脏免疫微环境的单细胞景观,并识别了两个相关的免疫细胞亚群Macrophage-CD9/IL18和macrophage-CD9/IFI6 | 研究样本量相对较小,可能需要进一步扩大样本量以验证结果的普遍性 | 探究HBV相关肝脏疾病进展过程中肝脏免疫环境的变化 | HBV感染、HBV肝硬化和HBV相关肝细胞癌患者的肝脏免疫细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 118,455个免疫细胞,来自6名健康个体、4名HBV感染患者、5名HBV肝硬化患者和3名HBV相关肝细胞癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 1722 | 2024-08-07 |
Unraveling the enigma of B cells in diffuse large B-cell lymphoma: unveiling cancer stem cell-like B cell subpopulation at single-cell resolution
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1310292
PMID:38149239
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据和多种生物信息学工具,全面分析了弥漫大B细胞淋巴瘤中的B细胞亚群,特别是揭示了一种具有癌症干细胞特性的B细胞亚群 | 首次在单细胞分辨率下揭示了弥漫大B细胞淋巴瘤中存在具有癌症干细胞特性的B细胞亚群,并探讨了其与不良预后的关联 | 研究样本量较小,且仅限于DLBCL和正常淋巴组织,未来需扩大样本量和涵盖更多类型的淋巴瘤 | 揭示弥漫大B细胞淋巴瘤中癌症干细胞样B细胞亚群的特性和其在疾病进展中的作用 | 弥漫大B细胞淋巴瘤中的B细胞亚群及其与癌症干细胞的关系 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 230个DLBCL组织样本和3个DLBCL样本及1个正常淋巴组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1723 | 2024-08-07 |
Interferon response and profiling of interferon response genes in peripheral blood of vaccine-naive COVID-19 patients
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1315602
PMID:38268924
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研究论文 | 本研究旨在通过分析COVID-19患者外周血中的干扰素(IFN)反应基因表达,深入了解COVID-19感染期间的系统性干扰素反应 | 首次在未接种疫苗的COVID-19患者中研究了干扰素反应基因的表达,并利用单细胞RNA测序数据分析了特定细胞类型在干扰素反应中的作用 | 样本仅限于疾病发作后10天内的血液样本,且未考虑接种疫苗后的情况 | 研究COVID-19患者在自然感染期间的先天免疫反应,特别是干扰素反应 | COVID-19患者和健康对照组的外周血样本 | 数字病理学 | COVID-19 | RNA测序 | NA | RNA | 105名COVID-19患者和30名健康对照 | NA | NA | NA | NA |
| 1724 | 2024-08-07 |
Effect of sodium stibogluconate in recruiting and awakening immune cells in the pleural fluid of pancreatic cancer: preparation for immunotherapy
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1315468
PMID:38313432
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研究论文 | 研究钠锑葡萄糖酸盐(SSG)在胰腺癌患者的胸腔积液中招募和唤醒免疫细胞的效果,为免疫治疗做准备 | 首次使用单细胞RNA测序(scRNA-seq)研究SSG在胰腺癌胸腔积液中的免疫激活作用 | 研究仅限于胰腺癌患者的胸腔积液,未涉及其他类型的癌症或疾病 | 探讨SSG在胰腺癌胸腔积液中激活免疫细胞的机制,为免疫治疗提供新策略 | 胰腺癌患者的胸腔积液中的免疫细胞 | 免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中明确 | NA | NA | NA | NA |
| 1725 | 2024-08-04 |
Current annotation strategies for T cell phenotyping of single-cell RNA-seq data
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1306169
PMID:38187377
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综述 | 本文评估了当前单细胞RNA测序数据中T细胞表型注释的策略 | 提出了对T细胞及其亚群体的自动注释策略,并指出了现有工具中缺失的关键信息 | 缺乏金标准的细胞表型注释方法,导致对T细胞亚型的标记仍然存在问题 | 研究单细胞RNA测序中T细胞的表型注释方法 | 针对T细胞及其亚群体的注释工具和策略 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1726 | 2024-08-04 |
Single-cell sequencing analysis related to sphingolipid metabolism guides immunotherapy and prognosis of skin cutaneous melanoma
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1304466
PMID:38077400
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研究论文 | 本文探讨了与皮肤黑色素瘤相关的鞘脂代谢基因,以开发患者预后的指标 | 本文通过单细胞测序分析识别了与免疫微环境相关的关键预后基因,提出了一种基于SRG的风险标志 | 鞘脂代谢在黑色素瘤中的具体作用和机制尚不完全明确 | 开发一个与皮肤黑色素瘤患者预后相关的指标 | 研究对象为皮肤黑色素瘤患者的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 皮肤黑色素瘤 | scRNA-seq | LASSO和Cox回归 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的黑色素瘤患者的单细胞测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 1727 | 2024-08-07 |
Expansion of CD4+ cytotoxic T lymphocytes with specific gene expression patterns may contribute to suppression of tumor immunity in oral squamous cell carcinoma: single-cell analysis and in vitro experiments
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1305783
PMID:38077321
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、T细胞受体和B细胞受体序列分析以及多色免疫荧光染色,探讨了CD4+细胞毒性T淋巴细胞(CTLs)在口腔鳞状细胞癌(OSCC)中的免疫抑制作用及其与B细胞的相互作用。 | 本研究首次详细描述了CD4+ CTLs在OSCC中的独特基因表达模式及其与B细胞的潜在相互作用,为癌症免疫治疗提供了新的见解。 | 研究主要集中在体外实验和单细胞分析,尚未进行临床试验验证其在实际治疗中的效果。 | 深入理解CD4+ T细胞和B细胞在口腔鳞状细胞癌中的作用,以促进癌症免疫治疗的发展。 | CD4+ T细胞、CD8+ T细胞和B细胞在口腔鳞状细胞癌中的免疫反应和效应功能。 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序、T细胞受体和B细胞受体序列分析、多色免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据 | 多个口腔鳞状细胞癌病变中的免疫细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1728 | 2024-08-07 |
H2-O deficiency promotes regulatory T cell differentiation and CD4 T cell hyperactivity
2023-Sep-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.14.553240
PMID:37645777
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研究论文 | 本文首次提供了H2-O分子在胸腺调节性T细胞选择中的直接证据,并探讨了H2-O缺乏对调节性T细胞和CD4 T细胞活性的影响。 | 首次直接证明H2-O在胸腺调节性T细胞选择中的作用,并揭示了H2-O缺乏对免疫细胞功能的影响。 | NA | 探讨H2-O缺乏对调节性T细胞和CD4 T细胞活性的影响,以更好地理解自身免疫病的易感性并设计治疗方案。 | 胸腺调节性T细胞的发育和CD4 T细胞的活性。 | 免疫学 | 自身免疫病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1729 | 2024-08-04 |
Wnt signaling preserves progenitor cell multipotency during adipose tissue development
2023-06, Nature metabolism
IF:18.9Q1
DOI:10.1038/s42255-023-00813-y
PMID:37337125
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研究论文 | 该文章研究了Wnt信号在脂肪组织发育过程中如何维持祖细胞的多能性 | 本研究揭示了Wnt信号激活在祖细胞维持中的重要作用,并识别了一种新的细胞类型,即结构性Wnt调节的脂肪组织细胞 | 该研究主要基于人类祖细胞的单细胞转录组学数据,可能在其它类型细胞中的普遍性尚待验证 | 探讨在慢性分化压力下,间充质干细胞/祖细胞的维持机制 | 人类祖细胞及其在脂肪组织发育过程中的变化 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 人类祖细胞的单细胞数据 | NA | NA | NA | NA |
| 1730 | 2024-08-04 |
Friend or foe? The elusive role of hepatic stellate cells in liver cancer
2023-10, Nature reviews. Gastroenterology & hepatology
DOI:10.1038/s41575-023-00821-z
PMID:37550577
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综述 | 本文讨论了肝星形细胞在肝癌中的双重角色 | 揭示了肝星形细胞亚群在肝纤维化和肝癌发展中的不同作用 | NA | 探讨肝星形细胞在肝纤维化及肝癌进展中的作用 | 肝星形细胞及其在肝癌中的不同亚群 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞转录组学 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1731 | 2024-08-07 |
Longitudinal scRNA-seq analysis in mouse and human informs optimization of rapid mouse astrocyte differentiation protocols
2023-10, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-023-01424-2
PMID:37697111
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研究论文 | 本研究利用单细胞/单核RNA测序技术分析了超过298,000个细胞和细胞核,以优化小鼠和人类星形胶质细胞的分化协议 | 通过计算方法识别了参与胶质细胞命运指定的候选基因,并利用转录组数据优化了小鼠星形胶质细胞分化协议,缩短了协议长度和复杂性 | NA | 优化小鼠和人类星形胶质细胞的分化协议 | 小鼠胚胎和人类诱导多能干细胞中的星形胶质细胞和少突胶质细胞的分化 | 数字病理学 | NA | 单细胞/单核RNA测序(scRNA-seq/snRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 超过298,000个细胞和细胞核 | NA | NA | NA | NA |
| 1732 | 2024-08-04 |
CD168+ macrophages promote hepatocellular carcinoma tumor stemness and progression through TOP2A/β-catenin/YAP1 axis
2023-Jun-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.106862
PMID:37275516
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研究论文 | 本研究探讨了肝癌干样细胞的起源及TOP2A/β-catenin/YAP1轴在肝细胞癌干性和进展中的作用 | 首次揭示了M2样巨噬细胞对肝癌干样细胞的调控及TOP2A/β-catenin/YAP1轴在肝细胞癌干性中的关键作用 | 研究未全面评估其他免疫细胞在肝细胞癌干样细胞中的作用 | 探究肝癌干样细胞的起源及其在肝细胞癌进展中的机制 | 肝细胞癌干样细胞及其微环境中的M2样巨噬细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1733 | 2024-08-04 |
Allograft tissue under the microscope: only the beginning
2023-04-01, Current opinion in organ transplantation
IF:1.8Q3
DOI:10.1097/MOT.0000000000001052
PMID:36787238
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review | 回顾了肾移植活检的新方法,以补充当前的Banff分类方案 | 引入了人工智能、机器学习和数字病理学等新方法来改进移植组织的检查 | 活检的内在抽样误差和没有自动形态测量分析限制了其在移植健康预后中的表现 | 探索可以改进肾移植组织活检分析的新方法 | 肾移植活检样本和相关组织研究 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | AI和ML算法 | 组织样本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1734 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomic heterogeneity between conduit and resistance mesenteric arteries in rats
2023-04-01, Physiological genomics
IF:2.5Q2
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研究论文 | 该文章探讨了大鼠导管和阻力肠系膜动脉中内皮细胞的单细胞转录组异质性 | 通过单细胞RNA测序,揭示了不同动脉节段的内皮和血管平滑肌细胞在表型上的差异 | 仅基于9只成年雄性斯普拉格-道利大鼠进行研究,可能限制了结果的外推性 | 研究内皮细胞和血管平滑肌细胞在不同动脉之间的表型异质性 | 成年雄性斯普拉格-道利大鼠的不同径向动脉 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 9只成年雄性斯普拉格-道利大鼠,分为6个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1735 | 2024-08-04 |
MicroRNA-155 Plays Selective Cell-Intrinsic Roles in Brain-Infiltrating Immune Cell Populations during Neuroinflammation
2023-04-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2200478
PMID:36883849
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研究论文 | 本研究探讨了miR-155在神经炎症中浸润的免疫细胞群体中的细胞内作用 | 本研究首次确认了miR-155在不同免疫细胞中的特异性作用,展示了通过条件性KO方法对其功能的重要见解 | 研究未能确定miR-155在浸润的巨噬细胞中的作用 | 研究miR-155在多发性硬化症模型中不同免疫细胞群体的重要性 | 主要研究对象为小鼠模型中的T细胞、巨噬细胞和树突状细胞 | 数字病理学 | 神经炎症 | 单细胞RNA测序 | 条件性基因敲除(KO)模型 | RNA序列数据 | 多个小鼠样本,包括全球miR-155 KO小鼠和野生型对照小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 1736 | 2024-08-04 |
NOX1 is essential for TNFα-induced intestinal epithelial ROS secretion and inhibits M cell signatures
2023-04, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2021-326305
PMID:36191961
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研究论文 | 本文探讨了NOX1缺失如何影响肠道上皮ROS分泌及M细胞特征 | 揭示了NOX1缺失对M细胞诱导的影响及其在UC炎症中的作用 | 研究主要集中在小鼠模型,可能不能完全反映人类疾病的复杂性 | 探讨NOX1在炎症性肠病(IBD)中的角色和机制 | 以NOX1基因型和TNFα刺激分层的肠道类器官为研究对象 | 数字病理学 | 肠炎 | 单细胞转录组分析,免疫组化 | 小鼠 | 基因表达数据 | 使用了多个人来源的肠道类器官和小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 1737 | 2024-08-04 |
Osteoimmunology in Periodontitis and Orthodontic Tooth Movement
2023-04, Current osteoporosis reports
IF:4.2Q1
DOI:10.1007/s11914-023-00774-x
PMID:36862360
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review | 综述免疫细胞在牙周炎和正畸牙齿移动中的作用及其与其他细胞的相互作用 | 首次结合单细胞RNA测序揭示不同细胞类型在对抗细菌挑战中的作用 | 未能详细探讨系统性疾病对免疫反应的影响 | 研究免疫细胞与牙周组织中细胞的相互作用在牙周炎和正畸牙齿移动中的作用 | 牙周炎和正畸牙齿移动中细胞及其相互作用 | 数字病理学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1738 | 2024-08-07 |
Chronic jetlag accelerates pancreatic neoplasia in conditional Kras-mutant mice
2023-04, Chronobiology international
IF:2.2Q3
DOI:10.1080/07420528.2023.2186122
PMID:36912021
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研究论文 | 研究探讨了慢性时差对携带胰腺特异性激活突变的小鼠胰腺癌发生的影响 | 首次揭示了非细胞自主性时钟功能障碍在加速胰腺癌前病变发展中的作用,并通过单细胞RNA测序识别了与时钟依赖性变化最相关的细胞群 | 研究仅限于小鼠模型,需要进一步的人体研究来验证这些发现 | 探究时钟错位与胰腺癌之间的关联及其机制 | 携带胰腺特异性激活突变的小鼠 | NA | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 1739 | 2024-08-07 |
Preneoplastic stromal cells promote BRCA1-mediated breast tumorigenesis
2023-04, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-023-01298-x
PMID:36914836
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研究论文 | 本文研究了BRCA1突变携带者中,癌前基质细胞如何促进乳腺肿瘤的发生 | 首次揭示了癌前基质微环境在BRCA1驱动的肿瘤发生中的作用,特别是通过促进上皮细胞增殖和改变腔前体细胞的分化 | NA | 探讨BRCA1突变携带者中癌前基质细胞对乳腺肿瘤发生的影响 | BRCA1突变携带者的乳腺组织 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 人类癌前BRCA1和非携带者的乳腺组织 | NA | NA | NA | NA |
| 1740 | 2024-08-04 |
Identifying the programmed cell death index of hepatocellular carcinoma for prognosis and therapy response improvement by machine learning: a bioinformatics analysis and experimental validation
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1298290
PMID:38170006
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研究论文 | 本研究探讨了程序性细胞死亡与肝细胞癌之间的关联,并构建了用于预后和治疗反应预测的程序性死亡指数。 | 提出了一种基于机器学习的整合框架来构建程序性死亡指数(PCDI),超越了以往的预后模型。 | 研究可能存在数据来源的局限性,未提供样本具体数量的信息。 | 阐明程序性细胞死亡与肝细胞癌之间的关系,以改善临床管理及个体化治疗。 | 肝细胞癌患者,关注程序性死亡相关基因及其临床特征。 | 生物信息学 | 肝癌 | 单细胞测序,蛋白质组学 | 机器学习 | 基因数据,蛋白质组学数据 | NA | NA | NA | NA | NA |