单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5351 篇文献，本页显示第 1701 - 1720 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1701 | 2024-08-04 |
A Comprehensive narrative review of transcriptomics and epigenomics of gallbladder cancer
2023-Jan-01, Journal of cancer research and therapeutics
IF:1.4Q4
DOI:10.4103/jcrt.jcrt_1823_23
PMID:38384011
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review | 本综述分析了胆囊癌的转录组学和表观基因组学研究 | 该文章通过对2010年至2023年间已发布的高通量测序研究的分析，揭示了胆囊癌的基因与表观基因特征 | 当前研究基于已发布的文献，可能会有限制于数据的可用性和质量 | 研究胆囊癌的分子机制，开发诊断生物标志物和靶向治疗方法 | 胆囊癌相关的转录组和表观基因组特征 | 数字病理学 | 胆囊癌 | 下一代测序（NGS），RNA测序，单细胞测序，微阵列技术 | NA | 基因组数据 | NA |
| 1702 | 2024-08-04 |
Single-Cell Sequencing of Lung Macrophages and Monocytes Reveals Novel Therapeutic Targets in COPD
2023-12-05, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12242771
PMID:38132091
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研究论文 | 本研究确定了COPD患者肺部巨噬细胞和单核细胞的特征，并识别了新型治疗靶点 | 首次明确了COPD患者肺部巨噬细胞和单核细胞的转录特征，为寻找新的治疗靶点提供了依据 | 样本量相对较小，可能限制了研究结果的广泛适用性 | 探索COPD患者肺部巨噬细胞和单核细胞在炎症过程中的作用 | COPD患者和对照组人类肺组织中的巨噬细胞和单核细胞 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 (COPD) | RNA测序 | NA | 转录组数据 | COPD患者18个样本和对照组28个样本 |
| 1703 | 2024-08-07 |
Pooled Genome-Scale CRISPR Screens in Single Cells
2023-11-27, Annual review of genetics
IF:8.7Q1
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review | 本文综述了单细胞水平上基于CRISPR的基因筛选技术的原理和实际考虑 | 介绍了利用CRISPR-Cas技术在单细胞中进行基因功能调控和表达控制的创新方法 | NA | 探讨基因功能分配和表达控制的基础，以及其在细胞生物学和治疗开发中的应用 | 基因功能和表达控制 | 基因编辑 | NA | CRISPR-Cas | NA | RNA sequencing, 细胞图像 | NA |
| 1704 | 2024-08-07 |
IL-11 induces NLRP3 inflammasome activation in monocytes and inflammatory cell migration to the central nervous system
2023-06-27, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2221007120
PMID:37339207
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研究论文 | 本研究探讨了IL-11诱导的炎症细胞向中枢神经系统迁移的机制 | 首次报道IL-11在复发缓解型多发性硬化症患者中增加，并通过αIL-11 mAb治疗减少炎症和脱髓鞘 | NA | 研究IL-11诱导的炎症细胞向中枢神经系统迁移的机制 | IL-11在复发缓解型多发性硬化症患者中的作用及其治疗潜力 | NA | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括复发缓解型多发性硬化症患者和健康对照者的外周血单个核细胞及脑脊液细胞 |
| 1705 | 2024-08-04 |
Characterization of the Doublesex/MAB-3 transcription factor DMD-9 in Caenorhabditis elegans
2023-02-09, G3 (Bethesda, Md.)
DOI:10.1093/g3journal/jkac305
PMID:36454093
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研究论文 | 本文对秀丽隐杆线虫中的DMD-9转录因子的表达模式和功能进行了表征 | 识别了DMD-9在神经元中的细胞特异性调控及其可能的性别二态性角色 | 在dmd-9突变体中未能观察到DMD-9表达神经元介导的行为缺陷 | 研究DMD-9在秀丽隐杆线虫中的表达模式及其作用 | 主要研究对象为秀丽隐杆线虫的DMD-9转录因子和相关神经元 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | RNA表达数据 | 22种神经细胞命运报告基因 |
| 1706 | 2024-08-07 |
Gut microbiome dysbiosis in men who have sex with men increases HIV infection risk through immunity homeostasis alteration
2023, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2023.1260068
PMID:38035339
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研究论文 | 本研究旨在比较HIV感染者与男男性行为者（MSM）肠道微生物群变化的差异，并揭示MSM相关肠道微生物群失调对免疫系统的影响 | 本研究首次揭示了MSM相关肠道微生物群失调通过影响免疫稳态增加HIV感染风险 | 需要进一步研究阐明MSM肠道微生物群失调调节HIV易感性的机制 | 比较HIV感染者与MSM肠道微生物群变化的差异，并揭示MSM相关肠道微生物群失调对免疫系统的影响 | HIV感染者与男男性行为者（MSM）的肠道微生物群 | NA | HIV感染 | 生物信息学技术，单细胞RNA测序数据分析 | NA | 基因和代谢物数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 1707 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals common and unique gene expression profiles in primary CD4+ T cells latently infected with HIV under different conditions
2023, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2023.1286168
PMID:38156317
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了在不同条件下潜伏感染HIV的CD4+ T细胞的基因表达谱 | 研究揭示了在不同条件下潜伏感染HIV的CD4+ T细胞的共同和独特基因表达模式 | NA | 识别潜伏感染HIV的单个CD4+ T细胞的基因表达谱，并探索这些基因表达谱以优先考虑未来实验验证的基因 | 潜伏感染HIV的CD4+ T细胞 | 数字病理学 | HIV | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 1708 | 2024-08-07 |
Immune checkpoint inhibitor-induced colitis is mediated by polyfunctional lymphocytes and is dependent on an IL23/IFNγ axis
2023-10-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-41798-2
PMID:37872166
|
研究论文 | 研究免疫检查点抑制剂（CPIs）引起的结肠炎，通过分析小鼠模型中的免疫细胞和分子机制 | 首次揭示了CPIs引起的结肠炎依赖于IL23/IFNγ轴和多功能的淋巴细胞 | 研究仅限于小鼠模型，需要进一步在人类中验证 | 探究免疫检查点抑制剂引起的结肠炎的机制，并寻找可能的治疗策略 | 免疫检查点抑制剂引起的结肠炎及其相关免疫细胞和分子机制 | 免疫学 | 结肠炎 | RNA测序，单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 1709 | 2024-08-04 |
Meta-Analysis of Single-Cell RNA-Seq Data Reveals the Mechanism of Formation and Heterogeneity of Tertiary Lymphoid Organ in Vascular Disease
2023-10, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.123.318762
PMID:37589134
|
meta-analysis | 本文通过单细胞RNA测序数据分析了血管疾病中三级淋巴器官的形成机制及其异质性 | 首次系统性研究了血管疾病模型中三级淋巴器官的存在及其生长环境 | 未详细描述不同血管疾病模型各自的具体机制 | 探索不同血管疾病中三级淋巴器官的存在及其形成机制 | 分析28个单细胞RNA测序数据集，涉及5种血管疾病模型 | 数字病理学 | 血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq | 28个单细胞RNA测序数据集 |
| 1710 | 2024-08-07 |
The parenting hub of the hypothalamus is a focus of imprinted gene action
2023-10, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1010961
PMID:37856383
|
研究论文 | 本文通过系统生物学方法，利用单细胞RNA测序数据，研究了印记基因在调控亲代行为中的作用，特别是在下丘脑的亲代行为中枢中的表达情况。 | 首次发现并验证了印记基因Magel2在下丘脑亲代行为中枢中的表达，及其对亲代行为的调控作用。 | 研究仅限于Magel2基因，未涵盖所有印记基因在亲代行为中的作用。 | 探讨印记基因在调控亲代行为中的作用及其在下丘脑亲代行为中枢中的表达。 | 印记基因Magel2及其在下丘脑亲代行为中枢中的表达和功能。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | Magel2-null(+/p)小鼠的母鼠、父鼠和未交配雌鼠 |
| 1711 | 2024-08-04 |
Core conserved transcriptional regulatory networks define the invasive trophoblast cell lineage
2023-08-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.201826
PMID:37417811
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研究论文 | 该研究探讨了老鼠和人类侵袭性滋养层细胞谱系的转录调控网络 | 首次整合了单核ATAC-seq和单细胞RNA-seq数据，揭示了跨物种的基因调控相似性 | 该研究主要集中于老鼠模型，可能无法完全代表人类系统 | 研究侵袭性滋养层细胞的调控机制及其在妊娠中的作用 | 老鼠的侵袭性滋养层细胞及其相关细胞类型 | 数字病理学 | NA | ATAC-seq和RNA-seq | NA | 基因组数据 | 未具体说明样本数量，涉及孕期15.5天和19.5天的老鼠子宫-胎盘界面组织 |
| 1712 | 2024-08-04 |
Species-specific regulation of XIST by the JPX/FTX orthologs
2023-03-21, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad029
PMID:36727460
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研究论文 | 本研究探讨了JPX和FTX同源基因对XIST的物种特异性调控 | 揭示了人类和小鼠之间JPX对XIST表达的调控差异，尽管其主要序列没有保守性 | 本研究主要集中于人类和小鼠的比较，可能无法推广到其他物种 | 研究X染色体失活过程中XIST的调控机制及其在不同物种中的功能保守性 | 主要研究FTX和JPX这两个lncRNA基因在不同物种中的功能 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 分析了早期人类胚胎发育中单细胞的RNA-seq数据以及小鼠的多能干细胞或分化后细胞 |
| 1713 | 2024-08-07 |
Comparing engineered nuclear-localized reporter cassettes
2023, microPublication biology
DOI:10.17912/micropub.biology.001014
PMID:38021170
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研究论文 | 本文通过CRISPR/Cas9基因编辑技术，为6种不同的神经肽编码基因生成了报告基因等位基因，并比较了不同报告基因盒的表达水平 | 首次比较了不同核定位报告基因盒在神经肽基因表达分析中的应用效果 | NA | 分析神经肽基因表达的动态变化及其调控机制 | 6种不同的神经肽编码基因 | 基因工程 | NA | CRISPR/Cas9 | NA | 基因表达数据 | 6种不同的神经肽编码基因 |
| 1714 | 2024-08-07 |
Pyroptosis-Related Subtypes Predict the Response of Clear Cell Renal Cell Carcinoma to Targeted Therapy
2023-12-08, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/j.fbl2812334
PMID:38179741
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研究论文 | 本研究基于焦亡相关基因的共识聚类对透明细胞肾细胞癌（ccRCC）进行分子分型，并探讨其对靶向治疗的反应预测 | 首次揭示了焦亡相关基因在ccRCC中的作用，并基于此开发了预测ccRCC对靶向治疗反应的分子亚型 | NA | 探讨焦亡在透明细胞肾细胞癌进展中的作用，并开发个性化治疗策略 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC） | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序，CIBERSORT分析，Lasso回归 | NA | 基因组，转录组，蛋白质 | NA |
| 1715 | 2024-08-07 |
Transcriptional diversity in specific synaptic gene sets discriminates cortical neuronal identity
2023-05-09, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-023-00372-y
PMID:37161421
|
研究论文 | 本文通过结合SynGO数据库和单细胞RNA测序数据，研究了小鼠新皮质中神经元细胞类型的转录多样性，并展示了通过突触基因可以有效区分细胞类型。 | 首次系统地识别了大脑中所有突触群体的转录多样性，并发现突触基因在区分细胞类型方面与所有基因具有相同的能力。 | NA | 量化并识别神经元细胞类型的特定突触特征。 | 小鼠新皮质中的神经元细胞类型。 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 小鼠新皮质中的所有突触群体 |
| 1716 | 2024-08-07 |
A Comparison of the Various Methods for Selecting Features for Single-Cell RNA Sequencing Data in Alzheimer's Disease
2023, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-031-31982-2_27
PMID:37486500
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研究论文 | 本文比较了用于阿尔茨海默病中单细胞RNA测序数据特征选择的不同方法 | 本文采用了专门为单细胞RNA测序设计的特征选择算法，并将其应用于阿尔茨海默病的研究 | NA | 研究旨在评估和比较不同标记基因选择方法在阿尔茨海默病中的性能 | 阿尔茨海默病中的单细胞RNA测序数据 | 生物医学研究 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 支持向量机 (SVM), k-最近邻算法 (k-NN), 线性判别分析 (LDA) | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 1717 | 2024-08-07 |
Construction and evaluation of endometriosis diagnostic prediction model and immune infiltration based on efferocytosis-related genes
2023, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2023.1298457
PMID:38370978
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研究论文 | 本研究构建并评估了基于吞噬作用相关基因的子宫内膜异位症诊断预测模型及免疫浸润 | 本研究首次识别并验证了与子宫内膜异位症相关的13个吞噬作用相关差异表达基因，并构建了诊断模型 | 研究主要基于公共数据库和机器学习技术，临床样本验证有限 | 旨在识别子宫内膜异位症的诊断标志物并构建诊断模型 | 子宫内膜异位症及其相关的吞噬作用相关基因 | 数字病理学 | 妇科疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | LASSO和SVM回归模型 | 基因表达数据 | 涉及多个公共数据库中的数据集 |
| 1718 | 2024-08-07 |
Single-cell profiling reveals the trajectory of FOLR2-expressing tumor-associated macrophages to regulatory T cells in the progression of lung adenocarcinoma
2023-08-02, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-023-06021-6
PMID:37532692
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了肺腺癌（LUAD）中免疫抑制微环境的形成机制，揭示了FOLR2表达的肿瘤相关巨噬细胞向调节性T细胞的转变轨迹。 | 首次通过单细胞转录组图谱揭示了从癌前到侵袭性LUAD的免疫抑制微环境形成的潜在轨迹，包括ARM-RETN/TAM-FOLR2/DCs/CD4NR4A3/CD4FOXP3的转变。 | 研究样本量较小，仅包括12个LUAD样本和3个正常肺样本，可能影响结果的普遍性。 | 探究肺腺癌中免疫抑制微环境的细胞机制。 | 肺腺癌样本和正常肺样本中的细胞成分和转录组。 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 12个肺腺癌样本和3个正常肺样本 |
| 1719 | 2024-08-07 |
Localizing Hormone Receptor Expression to Cellular Compartments in Idiopathic Subglottic Stenosis
2023-12, The Laryngoscope
DOI:10.1002/lary.30856
PMID:37382162
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，定位了特发性声门下狭窄（iSGS）患者中雌激素受体（ESR1和ESR2）和孕激素受体（PGR）在特定细胞亚群中的表达 | 首次通过单细胞RNA测序技术，详细分析了iSGS患者中激素受体在不同细胞亚群中的表达模式 | 研究样本量较小，且仅限于iSGS患者，可能影响结果的普遍性 | 探究雌激素和孕激素受体在iSGS病理发生中的作用机制 | 特发性声门下狭窄（iSGS）患者的气道瘢痕和健康黏膜组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | RNA | 25,974个单独测序的细胞，来自7例声门下瘢痕和3例匹配的无影响黏膜的iSGS患者 |
| 1720 | 2024-08-07 |
A gain-of-function variation in PLCG1 causes a new immune dysregulation disease
2023-11, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2023.06.020
PMID:37422272
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研究论文 | 本文研究了一种新的免疫调节疾病，由PLCG1酶的获得性功能变异引起 | 首次报道了人类疾病中的生殖系PLCG1突变，并揭示了PLCG1激活变异在免疫失调中的关键作用 | NA | 探究PLCG1激活变异在免疫失调中的分子发病机制 | PLCG1激活变异对蛋白质功能和免疫信号的影响 | NA | 免疫调节疾病 | 全外显子测序, 批量RNA测序, 单细胞RNA测序, 定量PCR, 飞行时间流式细胞术, 免疫印迹, 流式细胞术, 荧光素酶测定, IP-One ELISA, 钙通量测定 | NA | RNA, 蛋白质 | 一名早期发病的免疫失调疾病患者, COS-7和Jurkat细胞系 |