单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 5353 篇文献，本页显示第 1701 - 1720 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1701 | 2024-08-04 |
FXYD3 functionally demarcates an ancestral breast cancer stem cell subpopulation with features of drug-tolerant persisters
2023-11-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI166666
PMID:37966117
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研究论文 | 该文章研究了FXYD3在三阴性乳腺癌干细胞亚群体中的功能及其耐药特征 | 发现了以FXYD3为标志的乳腺癌干细胞亚群，并揭示了其与药物耐受性持久存活者的关系 | 研究主要集中在三阴性乳腺癌，可能不适用于其他类型的癌症 | 探讨肿瘤中癌症干细胞的异质性及其在化疗中的敏感性 | 三阴性乳腺癌（TNBC）中的癌症干细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组分析 | NA | NA | NA |
| 1702 | 2024-08-07 |
Mechanisms underlying the therapeutic effects of cinobufagin in treating melanoma based on network pharmacology, single-cell RNA sequencing data, molecular docking, and molecular dynamics simulation
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1315965
PMID:38348352
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研究论文 | 本研究旨在预测蟾毒灵在黑色素瘤中的潜在作用靶点，通过网络药理学、单细胞RNA测序数据、分子对接和分子动力学模拟等方法进行分析 | 本研究结合多种先进技术，如单细胞RNA测序和分子动力学模拟，以揭示蟾毒灵治疗黑色素瘤的新机制 | 研究结论缺乏相关实验数据支持，需要进一步实验验证 | 预测蟾毒灵在黑色素瘤中的潜在作用靶点 | 蟾毒灵在黑色素瘤中的作用机制 | 分子生物学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, 分子对接, 分子动力学模拟 | NA | 基因表达数据 | 使用GSE46517和GSE215120数据集中的样本 |
| 1703 | 2024-08-05 |
Type I interferon signature and cycling lymphocytes in macrophage activation syndrome
2023-11-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI165616
PMID:37751296
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研究论文 | 本文研究了与Still病相关的巨噬细胞激活综合征（MAS）中的I型干扰素特征和循环淋巴细胞。 | 该研究揭示了MAS患者中I型干扰素过量产生与IL-15的协同作用，导致CD38+HLA-DR+循环淋巴细胞的生成，这为理解MAS的免疫机制提供了新见解。 | 该研究主要基于对外周血单核细胞的分析，尚需进一步验证其在不同患者群体中的普遍性。 | 旨在更深入地理解Still病和巨噬细胞激活综合征的免疫学特征。 | 研究对象为健康对照组与有或没有MAS的Still病患者。 | 数字病理学 | Still病 | bulk RNA-Seq, single-cell RNA-Seq, 质量细胞术, 流式细胞术 | NA | RNA数据 | 超过65,000个PBMC样本 |
| 1704 | 2024-08-05 |
SnapATAC2: a fast, scalable and versatile tool for analysis of single-cell omics data
2023-Sep-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.11.557221
PMID:37745443
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研究论文 | 本文介绍了一种新算法SnapATAC2，用于单细胞组学数据的分析。 | 提出了一种快速非线性降维算法，能够高效捕捉单细胞组学数据的异质性，同时运行时间和内存使用与细胞数量线性相关。 | 未提及具体的限制 | 旨在提高对复杂组织中动态基因调控的理解。 | 分析单细胞组学数据，包括单细胞ATAC-seq和单细胞RNA-seq等。 | 单细胞组学 | NA | NA | NA | 单细胞组学数据 | 使用了多种单细胞组学数据类型 |
| 1705 | 2024-08-07 |
Plakoglobin is a mechanoresponsive regulator of naive pluripotency
2023-07-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-39515-0
PMID:37419903
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研究论文 | 本文研究了机械力对小鼠胚胎干细胞原始多能性的调控作用，特别是通过微流控技术调控细胞微环境，发现Plakoglobin在维持原始多能性中的关键作用 | 首次揭示了Plakoglobin作为机械敏感调节因子在原始多能性中的作用，并提供了一种研究体积限制对细胞命运转变影响的新范式 | NA | 探讨机械刺激如何转化为转录程序，以深入了解哺乳动物植入前发育的机制 | 小鼠胚胎干细胞 | NA | NA | 微流控技术 | NA | 单细胞转录组 | NA |
| 1706 | 2024-08-05 |
New technologies to study helminth development and host-parasite interactions
2023-07, International journal for parasitology
IF:3.7Q1
DOI:10.1016/j.ijpara.2022.11.012
PMID:36931423
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综述 | 本文回顾了单细胞RNA测序在研究多细胞蠕虫和探讨宿主免疫细胞类型中的应用 | 引入了单细胞RNA测序技术，以更细致的方式分析寄生虫生物学和宿主免疫 | 在体内研究宿主与寄生虫的相互作用具挑战性 | 理解寄生虫的发展及其与宿主免疫反应的相互作用 | 多细胞蠕虫及其与宿主细胞之间的相互作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 1707 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics for the assessment of cardiac disease
2023-05, Nature reviews. Cardiology
DOI:10.1038/s41569-022-00805-7
PMID:36539452
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综述 | 本文综述了用于评估心脏疾病的单细胞转录组学的技术挑战和新发现 | 介绍了心脏不同细胞类型的新的转录组学发现，并讨论了单细胞数据与空间转录组学结合的高级应用 | 文章提到目前在细胞类型标注上存在共识与不一致，表明急需标准化 | 提高对心血管疾病机制的理解，以改善治疗策略和患者风险分层 | 心脏细胞类型的转录组学研究 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 1708 | 2024-08-05 |
Spatially Resolved Transcriptomics Deconvolutes Prognostic Histological Subgroups in Patients with Colorectal Cancer and Synchronous Liver Metastases
2023-04-14, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-2794
PMID:37057593
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研究论文 | 本研究确定了简单的组织学评估在预测结直肠癌和肝转移患者手术后结果中的实际应用 | 通过空间转录组学分析揭示了驱动不同预后表型的转录组程序 | 大规模转录组分析受到基质成分的干扰 | 研究结直肠癌和肝转移患者在同步切除后的预后预测 | 接受结直肠癌和肝转移同步切除手术的患者样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 空间转录组学 | NA | 组织样本 | 来自进行同步切除的患者的样本 |
| 1709 | 2024-08-05 |
Placental Inflammation Leads to Abnormal Embryonic Heart Development
2023-03-21, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 本研究探讨了胎盘炎症如何导致异常的胚胎心脏发育 | 发现中性粒细胞驱动的胎盘炎症会导致胎盘发育不良和心脏功能障碍 | 未涉及更大样本量或不同物种的验证 | 探讨胎盘发育不良与先天性心脏病间的机制关系 | 使用小鼠模型研究妊娠期间的胎盘和胚胎心脏发育 | 数字病理学 | 先天性心脏病 | 流式细胞术、组织学、RNA测序 | NA | 组织样本 | 小鼠胚胎14.5天和出生后5天及28天的样本 |
| 1710 | 2024-08-07 |
Losartan controls immune checkpoint blocker-induced edema and improves survival in glioblastoma mouse models
2023-02-07, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2219199120
PMID:36724255
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研究论文 | 本文研究了免疫检查点抑制剂（ICBs）在胶质母细胞瘤小鼠模型中引起的脑水肿问题，并发现洛沙坦能够控制这种水肿并提高生存率。 | 首次发现洛沙坦能够预防ICB诱导的脑水肿，并重新编程肿瘤微环境，提高小鼠生存率。 | 研究主要在动物模型中进行，需要在临床试验中进一步验证。 | 探讨洛沙坦与ICBs联合使用在胶质母细胞瘤治疗中的效果及机制。 | 胶质母细胞瘤小鼠模型及脑水肿的控制。 | NA | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序、活体成像、CD8 T细胞阻断研究 | NA | 图像、基因表达数据 | 小鼠模型，具体数量未详细说明 |
| 1711 | 2024-08-04 |
A cellular hierarchy of Notch and Kras signaling controls cell fate specification in the developing mouse salivary gland
2023-01-23, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2022.12.009
PMID:36693323
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研究论文 | 该文章探讨了小鼠唾液腺发育中Notch和Kras信号通路如何控制细胞命运规范。 | 研究首次揭示了在小鼠唾液腺发育过程中，Notch和Kras信号如何通过不同的表达影响细胞谱系的分离和管状模式的形成。 | 该研究主要专注于小鼠模型，尚需验证其在其他物种或人类中的适用性。 | 理解Notch和Kras信号在小鼠唾液腺发育中的作用及其对细胞命运的影响。 | 小鼠唾液腺发育中的细胞谱系及其信号通路。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 三维重构和细胞谱系追踪 | NA |
| 1712 | 2024-08-05 |
Spatial Transcriptomics in Kidney Tissue
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3179-9_17
PMID:37423994
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研究论文 | 本文介绍了在肾脏组织中应用空间转录组测序(ST-seq)的方法 | 结合组织学与RNA测序，提供组织内转录组表达的空间背景信息 | 未提及具体的局限性 | 探索空间转录组测序在肾脏组织中的应用 | 小鼠和人类肾脏组织 | 数字病理学 | NA | 空间转录组测序 | NA | 组织样本 | 小鼠和人类肾脏组织样本 |
| 1713 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics identifies adipose tissue CD271+ progenitors for enhanced angiogenesis in limb ischemia
2023-12-19, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2023.101337
PMID:38118404
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，识别出来自皮下脂肪组织的CD271前体细胞，在肢体缺血中具有增强的血管生成能力 | 指出CD271前体细胞独特的促血管生成基因特征，并展示其在肢体缺血模型中的优越效果 | 未提及具体的局限性 | 研究CD271前体细胞在肢体缺血中的血管生成作用 | 主要研究皮下脂肪组织中的CD271前体细胞 | 数字病理学 | 肢体缺血 | 单细胞转录组分析 | 异种移植物模型 | 基因表达数据 | NA |
| 1714 | 2024-08-04 |
Bexmarilimab-induced macrophage activation leads to treatment benefit in solid tumors: The phase I/II first-in-human MATINS trial
2023-12-19, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2023.101307
PMID:38056464
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研究论文 | 本研究探讨了bexmarilimab对治疗难治性实体肿瘤患者的安全性和耐受性。 | 首次在人类中研究Clever-1阻断的疗效，并显示了bexmarilimab诱导的巨噬细胞激活对成瘤免疫的积极影响。 | 本研究主要集中于早期的安全性和耐受性评估，缺乏长期疗效的完整数据。 | 评估bexmarilimab对治疗难治性实体肿瘤患者的初步抗肿瘤疗效及免疫相关性。 | 治疗难治性实体肿瘤患者，参与者总数为138。 | 数字病理学 | 皮肤黑色素瘤、胃癌、肝细胞癌、雌激素受体阳性乳腺癌和胆道癌 | NA | NA | 临床试验数据 | 138名患者 |
| 1715 | 2024-08-07 |
iPSC-derived hypoimmunogenic tissue resident memory T cells mediate robust anti-tumor activity against cervical cancer
2023-12-19, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2023.101327
PMID:38091985
|
研究论文 | 本文开发了一种HLA-A24&-E双整合的HPV-rejTs，通过消除HLA I类抗原来有效抑制受体免疫排斥，同时保持比原始细胞毒性T淋巴细胞更强的细胞毒性 | 通过单细胞RNA测序发现HPV-rejTs富含组织驻留记忆T细胞，增强了通过TGFβR信号通路对宫颈癌的细胞毒性，并上调了与免疫突触相关的基因，促进了T细胞受体（TCR）的更强激活和TCR介导的目标细胞死亡 | NA | 开发一种可行的“即用型”T细胞疗法，具有强大的抗宫颈癌效果 | 从诱导多能干细胞生成的功能性恢复的人乳头瘤病毒特异性细胞毒性T淋巴细胞（HPV-rejTs） | 免疫学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 1716 | 2024-08-07 |
Dapagliflozin protects against chronic heart failure in mice by inhibiting macrophage-mediated inflammation, independent of SGLT2
2023-12-19, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2023.101334
PMID:38118414
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研究论文 | 本研究使用SGLT2全局敲除小鼠评估SGLT2抑制剂对心力衰竭的作用机制，发现达格列净通过抑制巨噬细胞介导的炎症来保护心脏，且这一作用独立于SGLT2。 | 达格列净对心力衰竭的保护作用独立于SGLT2，主要通过抑制巨噬细胞炎症来实现。 | NA | 阐明SGLT2抑制剂在心力衰竭中的具体作用机制。 | SGLT2全局敲除小鼠及其在心肌梗死和主动脉缩窄诱导的心力衰竭模型中的表现。 | 心血管疾病 | 心力衰竭 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | SGLT2全局敲除小鼠 |
| 1717 | 2024-08-04 |
Metabolic predictors of response to immune checkpoint blockade therapy
2023-Nov-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.108188
PMID:37965137
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研究论文 | 本研究探讨了肿瘤微环境中免疫细胞代谢与免疫检查点抑制剂反应之间的关系 | 首次对接受免疫检查点抑制剂治疗的癌症患者肿瘤微环境中免疫细胞的代谢特征进行了分析，并建立了基于代谢基因特征的预测模型 | 目前只分析了部分代谢基因，可能未涵盖所有相关的代谢途径 | 旨在通过代谢特征预测癌症患者对免疫检查点抑制剂的反应 | 参与研究的对象为大约230例接受免疫检查点抑制剂治疗的癌症患者的免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 约230个样本，涉及超过100万个免疫细胞 |
| 1718 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptome analysis reveals the key genes associated with macrophage polarization in liver cancer
2023-11-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000304
PMID:37889536
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研究论文 | 本研究揭示了与肝癌巨噬细胞极化相关的关键基因 | 通过单细胞转录组分析识别了6个与巨噬细胞极化相关的关键基因，并建立了预后模型 | 尚未提及研究的具体限制 | 揭示与肝癌巨噬细胞极化相关的关键基因 | 肝癌组织中的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | Cox回归模型 | 基因表达数据 | 涉及2000个高变基因和15个细胞簇 |
| 1719 | 2024-08-04 |
Genetic vulnerability to Crohn's disease reveals a spatially resolved epithelial restitution program
2023-10-25, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adg5252
PMID:37878672
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研究论文 | 本文解剖了肠黏膜愈合反应，通过单细胞分辨率绘制细胞间通信图谱并与空间转录组学结合 | 揭示了与克罗恩病相关的遗传变异如何破坏损伤感知通路，在愈合机制上提供了空间分辨的生物学模型 | 主要使用小鼠模型进行研究，可能与人类的生物学过程存在差异 | 研究肠道组织修复过程中的细胞间通信与信号传导机制 | 研究对象为克罗恩病相关的HGFAC基因变异及其在小鼠模型中的表现 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 空间转录组学，单细胞转录组学 | 器官oid共培养模型 | 细胞数据 | 使用R509H小鼠模型进行实验 |
| 1720 | 2024-08-07 |
ETV6 represses inflammatory response genes and regulates HSPC function during stress hematopoiesis in mice
2023-09-26, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2022009313
PMID:37522715
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研究论文 | 本研究通过生成携带Etv6R355X失活突变的小鼠模型，探讨ETV6基因在HSPC功能和炎症反应基因调控中的作用 | 首次揭示了ETV6在HSPC中抑制炎症基因表达的机制，特别是在应激造血过程中的作用 | NA | 阐明ETV6基因变异如何影响HSPC功能并导致疾病 | ETV6基因在HSPC中的功能及其对炎症反应基因的调控作用 | NA | 血液系统恶性肿瘤 | 转座酶可及染色质测序、高吞吐量染色体构象捕获、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型，包括Etv6R355X/+和Etv6+/+小鼠的骨髓细胞 |