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当前共找到 5353 篇文献，本页显示第 1681 - 1700 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1681 | 2024-08-05 |
Cancer cell-derived extracellular vesicles drive pre-metastatic niche formation of lymph node via IFNGR1/JAK1/STAT1-activated-PD-L1 expression on FRCs in head and neck cancer
2023-10, Oral oncology
IF:4.0Q2
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研究论文 | 本研究评估了癌细胞来源的细胞外囊泡（CEVs）调节的成纤维网状细胞（FRCs）在淋巴结（LN）前转移生态位形成中的作用 | 发现癌细胞来源的细胞外囊泡通过IFNGR1/JAK1/STAT1通路促进FRCs上PD-L1的表达，进而导致CD8+ T细胞耗竭 | 本研究仅基于有限的样本数量，需进一步验证 | 评估癌细胞来源的细胞外囊泡在前转移生态位形成中的角色 | 来自20例癌症患者的60个新鲜颈部淋巴结中的FRCs | 数字病理学 | 头颈部癌症 | 单细胞RNA测序、质谱分析、蛋白质印迹法 | NA | 细胞、蛋白质 | 60个颈部淋巴结样本来自20位患者 | NA | NA | NA | NA |
| 1682 | 2024-08-05 |
Lymphoid tissues contribute to viral clonotypes present in plasma at early post-ATI in SIV-infected rhesus macaques
2023-May-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.05.30.542512
PMID:37398418
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研究论文 | 本研究揭示了淋巴组织在抗逆转录病毒治疗干预后早期对血浆中病毒克隆型的贡献 | 通过使用条形码SIVmac239M感染狒狒，监测病毒条形码克隆型的动态，这为减小复发病毒储存库提供了新见解 | 样本量有限，仅涉及七只狒狒，并且在某些情况下血浆病毒RNA仍然低于检测阈值 | 探究抗逆转录病毒治疗干预后，病毒群体的细胞和组织来源以及动态变化 | 感染了SIV的狒狒，具体分析了其血液和多种淋巴及非淋巴组织样本 | 数字病理学 | NA | 条形码测序、完整前病毒DNA检测、单细胞RNA测序、结合CODEX/RNAscope/杂交 | NA | 血液和组织样本 | 七只狒狒 | NA | NA | NA | NA |
| 1683 | 2024-08-05 |
Distinct secretomes in p16- and p21- positive senescent cells across tissues
2023-Dec-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.05.569858
PMID:38106149
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研究论文 | 本文综合研究了不同组织中p16和p21阳性衰老细胞的独特分泌组 | 揭示了p21和p16转录本在不同细胞类型和组织中的重大异质性，强调了细胞衰老及其分泌表型的多样性 | 部分SASP因子持续贡献于共享的“核心”SASP，仍需在更广泛的生物学背景下进行更细致的研究 | 探讨p21和p16在衰老细胞及其分泌表型中的作用 | 多个小鼠和人类组织的单细胞RNA测序数据集 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 多个小鼠和人类组织的数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 1684 | 2024-08-07 |
Correction to: Implanted Tissue-Engineered Vascular Graft Cell Isolation with Single-Cell RNA Sequencing Analysis, by Mirhaidari et al. Tissue Engineering Part C: Methods 2023;29(2):72-84; doi: 10.1089/ten.tec.2022.0189
2023-Oct, Tissue engineering. Part C, Methods
DOI:10.1089/ten.tec.2022.0189.correx
PMID:37672627
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1685 | 2024-08-05 |
Systemic Alterations in Type-2 Conventional Dendritic Cells Lead to Impaired Tumor Immunity in Pancreatic Cancer
2023-08-03, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-21-0946
PMID:37229629
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研究论文 | 本研究分析了胰腺癌患者的外周血和骨髓中常规树突状细胞（cDC2）的变化 | 揭示了胰腺癌对系统性cDC2发育和功能的影响 | 未充分研究PDAC对系统性cDC1的影响 | 探讨胰腺癌对树突状细胞功能的影响及其对肿瘤免疫的影响 | 胰腺癌患者的外周血和骨髓样本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 血液和骨髓样本 | 106个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1686 | 2024-08-04 |
Dissection and Integration of Bursty Transcriptional Dynamics for Complex Systems
2023-Jun-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.13.544828
PMID:37398022
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研究论文 | 本文提出了一种新方法，通过概率主题模型解构并整合单细胞RNA-seq数据中的转录动力学 | 采用概率主题模型来推断与个别过程相关的细胞和基因，以准确估计过程特定的速度 | 缺乏先进的代谢标记技术，可能影响RNA速度估计的准确性 | 研究单细胞RNA-seq数据中转录变化的方向性 | 聚焦于与过程相关的细胞和基因 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | 概率主题模型 | 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1687 | 2024-08-05 |
Prognostic subtypes of thyroid cancer was constructed based on single cell and bulk-RNA sequencing data and verified its authenticity
2023-Mar-18, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-023-01027-x
PMID:36933059
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研究论文 | 通过单细胞和大规模RNA测序数据构建了甲状腺癌的预后亚型并验证其真实性 | 创新性地结合了单细胞RNA测序和全局RNA测序数据，构建了有效的预后模型并揭示了甲状腺癌的细胞微环境及肿瘤异质性 | 研究主要基于样本数据，对于临床广泛应用的验证仍需进一步研究 | 研究甲状腺癌的预后因素及其细胞微环境 | 23个甲状腺癌肿瘤样本的细胞类型及其微环境 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序(Sc-RNAseq) | NA | RNA数据 | 23个甲状腺癌肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1688 | 2024-08-04 |
Presence of immunogenic alternatively spliced insulin gene product in human pancreatic delta cells
2023-05, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-023-05882-y
PMID:36884057
|
研究论文 | 本文研究人类胰腺δ细胞中免疫原性替代剪接胰岛素基因产物的表达 | 首次指出胰腺δ细胞中存在一种由替代剪接产生的胰岛素变体，并揭示其可能在胰岛素自身免疫和病理中发挥作用 | 未全面阐明这种替代剪接INS产物在其他细胞类型中的潜在作用 | 探讨人类胰腺内胰岛素基因的替代剪接及其在β细胞和其他内分泌细胞中的表达 | 人类胰腺中各种内分泌细胞（特别是δ细胞） | 数字病理学 | 糖尿病 | PCR分析、单细胞RNA-seq分析、免疫组化 | NA | RNA、蛋白序列 | 人类胰腺样本，具体样本数量未提及 | NA | NA | NA | NA |
| 1689 | 2024-08-05 |
Sortilin enhances fibrosis and calcification in aortic valve disease by inducing interstitial cell heterogeneity
2023-03-07, European heart journal
IF:37.6Q1
DOI:10.1093/eurheartj/ehac818
PMID:36660854
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研究论文 | 本研究探讨了sortilin在钙化性主动脉瓣病（CAVD）病理生理中的作用及其对瓣膜间质细胞（VICs）转变的影响 | 首次识别sortilin作为钙化性主动脉瓣病中关键因素，并发现了一种新型的炎症肌成纤维细胞-成骨细胞混合表型（IMO-VIC） | 研究主要集中于小鼠模型，可能无法完全反映人类的疾病机制 | 阐明sortilin在主动脉瓣钙化中的作用及其潜在的治疗靶点 | 研究对象为主动脉瓣间质细胞（VICs）及其在钙化性主动脉瓣病中的转变 | 数字病理学 | 主动脉瓣疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 小鼠模型 | 生物样本（VICs） | 使用sortilin缺陷的小鼠模型和人类初级VIC样本，样本数量未具体说明 | NA | NA | NA | NA |
| 1690 | 2024-08-05 |
Hepatocyte Smoothened Activity Controls Susceptibility to Insulin Resistance and Nonalcoholic Fatty Liver Disease
2023, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2022.12.008
PMID:36535507
|
研究论文 | 本研究旨在探讨Smoothened (Smo) 在肝细胞代谢稳态及其对非酒精性脂肪肝病 (NASH) 易感性中的作用 | 发现肝细胞Smo的缺失通过激活mTORC1-SREBP1c信号通路，促进了脂肪生成并抑制了肝脏胰岛素信号 | 研究主要基于小鼠模型和已有的人类RNA-seq数据，可能无法完全反映所有人群的情况 | 明确Smoothened在肝细胞代谢调节和NASH易感性中的作用 | 健康饮食的小鼠肝细胞及两大人类队列的肝脏RNA-seq数据 | 数字病理学 | 非酒精性脂肪肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 在小鼠模型中进行了条件性Smo缺失，以及分析了两大人类队列的RNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA |
| 1691 | 2024-08-05 |
Single-cell genomics reveals new rozellid lineages and supports their sister relationship to Microsporidia
2023-12, Biology letters
IF:2.8Q2
DOI:10.1098/rsbl.2023.0398
PMID:38087939
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研究论文 | 本研究揭示了新发现的rozellid谱系，并支持其与微孢子虫的姐妹关系 | 首次通过单细胞测序提供三种新的rozellid谱系的基因组数据 | 目前尚未完全理解rozellids与微孢子虫之间的系统发育关系 | 探讨rozellid谱系的系统发育及其与微孢子虫的关系 | 新发现的三种rozellid谱系 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 来自环境样本的三个新rozellid谱系 | NA | NA | NA | NA |
| 1692 | 2024-08-05 |
Speed and navigation control of thymocyte development by the fetal T-cell gene regulatory network
2023-05, Immunological reviews
IF:7.5Q1
DOI:10.1111/imr.13190
PMID:36722494
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review | 本文回顾了胎儿和成人小鼠胸腺中 T 细胞分化相关的转录因子网络 | 探讨了胎儿 T 细胞发育与成人的不同之处，并强调了转录因子网络的独特性 | 主要基于小鼠模型，可能无法完全转化到人类的机制理解 | 研究胎儿 T 细胞发育过程中的转录因子网络 | 胎儿和成人小鼠的 T 细胞和胸腺发育 | NA | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1693 | 2024-08-04 |
Deep Crypt Secretory Cell Differentiation in the Colonic Epithelium Is Regulated by Sprouty2 and Interleukin 13
2023, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2022.11.004
PMID:36414210
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研究论文 | 深隐窝分泌（DCS）细胞的分化受到Sprouty2和白细胞介素13的调控 | 本研究揭示了Sprouty2如何通过抑制IL13信号通路来限制结肠DCS细胞分化的机制 | 尚未探讨DCS细胞数量和功能调控的所有可能机制 | 研究Sprouty2与IL13在结肠DCS细胞分化中的作用 | 小鼠肠上皮特异性Sprouty2缺失模型与对照组 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、免疫染色、bulk RNA测序、定量聚合酶链反应 | NA | RNA | 小鼠结肠组织 | NA | NA | NA | NA |
| 1694 | 2024-08-04 |
Integrated analysis of single-cell RNA-seq and chipset data unravels PANoptosis-related genes in sepsis
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1247131
PMID:38239341
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和芯片数据，揭示了败血症中PANoptosis相关基因 | 开发了一种基于Boruta算法的机器学习模型，用于识别PANoptosis相关亚组并预测败血症的生存和临床特征 | 尚未全面阐明PANoptosis在败血症中的角色 | 研究PANoptosis相关基因在败血症中的作用及其预后潜力 | 败血症样本和单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 败血症 | 单细胞RNA-seq | Boruta算法 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的败血症样本和单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA |
| 1695 | 2024-08-05 |
Integrative single-cell RNA sequencing and metabolomics decipher the imbalanced lipid-metabolism in maladaptive immune responses during sepsis
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1181697
PMID:37180171
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研究论文 | 本文旨在识别与脓毒症免疫功能障碍相关的差异表达脂质代谢基因。 | 通过机器学习算法筛选出关键的脂质代谢相关中心基因，揭示了脓毒症中的免疫抑制微环境。 | 未提及具体的样本来源和大小，可能限制结果的普遍适用性。 | 探讨脓毒症中脂质代谢失衡与免疫反应的关系。 | 脓毒症患者与健康对照者的脂质代谢相关基因及相关免疫功能。 | 机器学习 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | 支持向量机-递归特征消除(SVM-RFE) | 基因数据 | 508个差异表达脂质代谢相关基因 | NA | NA | NA | NA |
| 1696 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics uncovers a non-autonomous Tbx1-dependent genetic program controlling cardiac neural crest cell development
2023-03-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-37015-9
PMID:36941249
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研究论文 | 这篇文章揭示了一个非自主的Tbx1依赖的基因程序，该程序控制心脏神经嵴细胞的发展 | 首次使用单细胞RNA测序揭示了心脏神经嵴细胞的动态转变及其在Tbx1缺失下的非自主变化 | 未提及研究的限制 | 探讨心脏神经嵴细胞在发育过程中的命运动态 | 对照小鼠胚胎和Tbx1失活小鼠的神经嵴细胞进行单细胞RNA测序 | 数字病理学 | 先天性心脏病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 来自对照小鼠和Tbx1失活小鼠的神经嵴细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1697 | 2024-08-05 |
BOMA, a machine-learning framework for comparative gene expression analysis across brains and organoids
2023-02-27, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2023.100409
PMID:36936070
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研究论文 | 本研究提出了一种机器学习框架BOMA，用于比较大脑和类器官之间的基因表达分析 | 开发了一种全球对齐和局部细化的机器学习框架，能够揭示大脑和类器官间保护的和特定的发育轨迹 | 没有提到具体的局限性 | 旨在比较和分析大脑与类器官之间的基因表达差异 | 研究对象为人类大脑和人类类器官，以及非人灵长类动物的大脑 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 使用多个人类大脑和类器官的样本，具体数量未说明 | NA | NA | NA | NA |
| 1698 | 2024-08-04 |
ProtoCell4P: an explainable prototype-based neural network for patient classification using single-cell RNA-seq
2023-08-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btad493
PMID:37540223
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研究论文 | 本文提出了一种名为ProtoCell4P的原型基础神经网络，用于基于单细胞RNA测序进行患者分类并提供可解释性 | 该模型通过利用细胞知识和细胞的代表（称为原型）来缓解样本稀缺和细胞数量多样性的问题，具备良好的可解释性 | 样本数量通常较小，单细胞表达轮廓较嘈杂，并且高维性可能限制了一些分析 | 旨在设计深度学习模型对患者表型进行精准分类 | 研究对象为通过单细胞RNA测序数据获得的患者样本 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 原型基础神经网络 | 单细胞表达数据 | 样本数量通常较小，具体数字未给出 | NA | NA | NA | NA |
| 1699 | 2024-08-05 |
Generation of ventralized human thalamic organoids with thalamic reticular nucleus
2023-05-04, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2023.03.007
PMID:37019105
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研究论文 | 本研究报告了一种将人类胚胎干细胞转化为具有不同核身份的腹侧丘脑类器官的方法 | 实现了以前未能达到的丘脑模式，展现了丘脑网状核的特征 | 未影响整体丘脑谱系发育的神经功能变化可能限定了结果的适用性 | 探索人类丘脑中核特异性发育与病理的机制 | 使用腹侧丘脑类器官研究TRN特异性与病相关基因的功能 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 类器官模型 | 组织样本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1700 | 2024-08-05 |
PD-1 Mediated Regulation of Unique Activated CD8 + T Cells by NK Cells in the Submandibular Gland
2023-Sep-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.15.557930
PMID:37745414
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研究论文 | 本文研究了NK细胞如何通过PD-1/PD-L1轴在下颌下腺调控CD8 T细胞的稳态 | 发现PD-1缺乏小鼠的下颌下腺中存在独特的CD8 T细胞群，以及NK细胞在该部位的免疫调节作用 | 研究主要集中在小鼠模型上，缺乏在人体中的验证 | 探讨NK细胞在下颌下腺对CD8 T细胞稳态的调控作用 | PD-1缺乏小鼠及NK细胞缺乏的小鼠模型 | 数字病理学 | 干燥综合症 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 涉及PD-1缺乏和NK细胞缺乏的小鼠样本 | NA | NA | NA | NA |