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当前共找到 5353 篇文献，本页显示第 1661 - 1680 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1661 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing of human lung innate lymphoid cells in the vascular and tissue niche reveals molecular features of tissue adaptation
2023, Discovery immunology
DOI:10.1093/discim/kyad007
PMID:38650756
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研究论文 | 本研究利用人源化小鼠模型，通过单细胞RNA测序技术，揭示了人体肺部血管和组织微环境中先天淋巴细胞（ILCs）的基因特征及其组织适应性的分子机制 | 首次在人源化小鼠模型中定义了肺部血管和组织微环境中人体ILCs的基因特征，并揭示了微环境信号对ILCs分子程序的塑造作用 | NA | 研究人体肺部不同解剖微环境中先天淋巴细胞（ILCs）的分子特征及其组织适应性 | 人体肺部的先天淋巴细胞（ILCs）及其在血管和组织微环境中的适应性 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人源化MISTRG小鼠模型中的肺部ILCs和NK细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1662 | 2024-08-07 |
Stromal STAT5-Mediated Trophic Activity Regulates Hematopoietic Niche Factors
2023-10-08, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxad055
PMID:37465968
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研究论文 | 研究通过STAT5ab敲除小鼠模型，探讨STAT5在骨髓造血微环境中的作用及其对造血干细胞的影响 | 首次揭示了STAT5ab在骨髓微环境中对造血干细胞分化的调控作用，并通过单细胞转录组分析验证了其机制 | 研究主要集中在小鼠模型上，未来需要进一步在人类样本中验证这些发现 | 探讨STAT5在骨髓造血微环境中的作用及其对造血干细胞的影响 | STAT5ab敲除小鼠模型及其对骨髓造血微环境的影响 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | mRNA表达 | 多种Cre转基因小鼠品系 | NA | NA | NA | NA |
| 1663 | 2024-08-07 |
scMultiGAN: cell-specific imputation for single-cell transcriptomes with multiple deep generative adversarial networks
2023-09-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad384
PMID:37903416
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scMultiGAN的新型深度学习模型，用于单细胞转录组数据的插补，该模型利用多个协作生成对抗网络（GAN）实现细胞特异性插补 | scMultiGAN采用两阶段训练过程和多个GAN实现细胞特异性插补，与传统基于GAN的插补方法不同，后者基于随机噪声生成缺失值 | NA | 提高单细胞RNA测序数据分析中缺失值插补的准确性 | 单细胞转录组数据中的缺失值 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 生成对抗网络（GAN） | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1664 | 2024-08-04 |
Clinical, morphologic and molecular heterogeneity of HPV-associated oropharyngeal cancer
2023-09, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-023-02819-y
PMID:37666939
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综述 | 本综述探讨了HPV相关的口咽癌的临床、形态和分子异质性 | 提出了针对HPV+口咽鳞状细胞癌的不同亚型及其相关生物标志物的分类概念 | 缺乏对多中心临床试验结果的非劣性分析 | 识别与患者分层和个性化治疗相关的HPV+口咽鳞状细胞癌生物标志物 | HPV+口咽鳞状细胞癌的多样性及其相关临床和生物特征 | 数字病理学 | 咽癌 | 单细胞测序 | NA | 肿瘤样本数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1665 | 2024-08-07 |
ONECUT2 regulates RANKL-dependent enterocyte and microfold cell differentiation in the small intestine; a multi-omics study
2023-02-22, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac1236
PMID:36625255
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研究论文 | 本研究采用多组学方法探讨了小肠类器官中M细胞分化的分子机制 | 揭示了ONECUT2通过RANK/RANKL信号轴调控小肠中肠上皮细胞和M细胞分化的机制 | NA | 探究小肠中M细胞分化的分子机制及其调控因素 | 小肠类器官中的M细胞分化 | 分子生物学 | NA | 多组学分析, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 小鼠小肠类器官 | NA | NA | NA | NA |
| 1666 | 2024-08-04 |
The aryl hydrocarbon receptor cell intrinsically promotes resident memory CD8+ T cell differentiation and function
2023-01-31, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111963
PMID:36640340
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研究论文 | 该文章探讨了芳香烃受体(Ahr)在CD8 T细胞分化和功能中的内在作用 | 首次揭示了Ahr在CD8 T细胞蕴藏的记忆细胞分化和功能中的促进作用 | 研究主要基于小鼠模型，可能在转化为人类时受到限制 | 研究Ahr在CD8 T细胞功能及其记忆细胞分化中的作用 | 小鼠CD8 T细胞及人类肠道内的CD8 T细胞 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 涉及小鼠和人类的CD8 T细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1667 | 2024-08-07 |
Friend leukemia integration 1 overexpression decreases endometrial receptivity and induces embryo implantation failure by promoting PART1 transcription in the endometrial epithelial cells
2023, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.16105
PMID:37780395
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研究论文 | 本研究探讨了FLI1在子宫内膜容受性和反复植入失败（RIF）中的作用及其机制 | 发现FLI1通过结合PART1启动子区域促进PART1表达，从而抑制胚胎植入 | NA | 探索FLI1在子宫内膜容受性和反复植入失败中的作用及机制 | 子宫内膜细胞和胚胎植入 | 生殖医学 | 不孕症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单细胞转座酶可及染色质测序（scATAC-seq）、定量实时聚合酶链反应（qRT-PCR）、蛋白质印迹（western blotting）、细胞计数试剂盒（CCK）-8、划痕愈合试验、染色质免疫沉淀、双荧光素酶报告试验 | NA | RNA | 包括RIF患者和对照组的子宫内膜组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1668 | 2024-08-07 |
Lamin A upregulation reorganizes the genome during rod photoreceptor degeneration
2023-10-25, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-023-06224-x
PMID:37880237
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研究论文 | 研究了核纤层在杆状光感受器退化过程中对基因组组织的作用 | 首次展示了在视网膜色素变性模型中，核纤层蛋白A的异常上调与基因组可及性的增加相关，表明异染色质锚定蛋白对基因组可及性有全局影响 | 研究主要集中在杆状光感受器，未涉及其他类型的光感受器或细胞类型 | 探讨核纤层在神经退行性疾病中对基因组组织的影响 | 杆状光感受器及其在视网膜色素变性中的退化过程 | NA | 视网膜色素变性 | scRNA-seq, ATAC-seq | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 1669 | 2024-08-07 |
Comparative analysis of dimension reduction methods for cytometry by time-of-flight data
2023-04-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-37478-w
PMID:37005472
|
研究论文 | 本文比较了21种降维方法在110个真实和425个合成CyTOF样本上的性能 | 发现了一些不太知名但表现优异的降维方法，如SAUCIE、SQuaD-MDS和scvis | 选择降维方法应取决于数据结构和分析需求 | 评估和发展适用于CyTOF数据的计算方法 | CyTOF数据的降维方法 | 生物信息学 | NA | CyTOF | NA | 数据 | 110个真实样本和425个合成样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1670 | 2024-08-04 |
Compressed Perturb-seq: highly efficient screens for regulatory circuits using random composite perturbations
2023-Jan-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.23.525200
PMID:36747806
|
研究论文 | 本文提出了一种压缩的Perturb-seq技术，以提高功能基因组学中干扰电路的筛选效率 | 创新性在于通过算法对随机低维观察进行重新设计，显著降低了成本并提高了学习遗传互作的能力 | 该方法在规模上仍受到一定限制，具体的实验规模未在摘要中明确说明 | 研究旨在提高功能基因组学中基因调控电路筛选的效率 | 研究对象为与细菌脂多糖免疫反应相关的598个基因 | 功能基因组学 | 免疫疾病 | CRISPR筛选 | NA | 基因表达数据 | 涉及598个基因 | NA | NA | NA | NA |
| 1671 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing of Sox17-Expressing Lineages Reveals Distinct Gene Regulatory Networks and Dynamic Developmental Trajectories
2023-06-15, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxad030
PMID:37085274
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研究论文 | 本研究通过结合双色时间线追踪策略和单细胞RNA测序，分析了Sox17表达谱系中的6934个细胞，揭示了不同的基因调控网络和动态发育轨迹。 | 开发了一种双色时间线追踪策略，结合单细胞RNA测序技术，深入分析了Sox17在发育中的内胚层和内皮细胞中的功能。 | NA | 旨在更好地理解Sox17在发育中的内胚层和内皮细胞中的功能。 | Sox17表达谱系中的细胞，特别是内胚层和内皮细胞。 | 基因调控 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 6934个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1672 | 2024-08-07 |
TripletCell: a deep metric learning framework for accurate annotation of cell types at the single-cell level
2023-05-19, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad132
PMID:37080771
|
研究论文 | 本文提出了一种名为TripletCell的新型深度度量学习框架，用于跨物种、跨协议和跨样本的细胞类型注释 | TripletCell利用深度度量学习算法，通过特征提取模块TripletCell-FE，有效地处理了scRNA-seq数据中的批次效应和数据异质性问题 | NA | 开发一种高效准确的细胞类型注释方法，以克服传统手动注释的局限性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型注释 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | 深度度量学习 | 基因表达矩阵 | 21个数据集，涵盖九种scRNA-seq协议、两种物种和三种组织 | NA | NA | NA | NA |
| 1673 | 2024-08-07 |
Genomic characterization and therapeutic utilization of IL-13-responsive sequences in asthma
2023-Jan-11, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2022.100229
PMID:36777184
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研究论文 | 本文利用多种基因组技术在支气管上皮细胞中识别IL-13响应的调控元件，并开发基于CRISPR干扰（CRISPRi）的治疗方法，以细胞类型特异性和IL-13特异性的方式下调引起气道阻塞的基因。 | 本文首次利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）和H3K27ac染色质免疫沉淀测序（ChIP-seq）在人类支气管上皮细胞中识别IL-13响应基因和调控元件，并通过大规模并行报告分析（MPRAs）验证和优化这些序列的IL-13诱导活性。 | NA | 研究IL-13在哮喘中的基因组特征及其在治疗中的应用。 | 支气管上皮细胞中的IL-13响应调控元件。 | 基因组学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），H3K27ac染色质免疫沉淀测序（ChIP-seq），大规模并行报告分析（MPRAs） | CRISPR干扰（CRISPRi） | 基因组数据 | 人类支气管上皮细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1674 | 2024-08-04 |
Neighbor-specific gene expression revealed from physically interacting cells during mouse embryonic development
2023-01-10, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2205371120
PMID:36595695
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研究论文 | 本文探讨了小鼠胚胎发育过程中物理相互作用细胞的邻特异性基因表达 | 提出了物理相互作用细胞RNA测序（PIC-seq）技术，以克服单细胞RNA测序中缺失空间信息的局限性，揭示了接触特异的基因调控机制 | 主要集中于小鼠胚胎的特定发展阶段，未涵盖其他发育阶段或物种 | 研究胚胎发育过程中邻近细胞之间的相互作用如何影响基因表达 | 小鼠胚胎发育过程中的物理相互作用细胞 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠胚胎在胚胎日7.5到9.5期间产生的相互作用细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1675 | 2024-08-04 |
Prerequisite endocardial-mesenchymal transition for murine cardiac trabecular angiogenesis
2023-05-08, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.03.009
PMID:37023750
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研究论文 | 本文探讨了小鼠心脏内膜细胞如何通过“血管内皮细胞-间充质转化”机制生成小梁血管 | 首次揭示了小梁血管起源于心室内膜细胞的二步血管内皮细胞-间充质转化机制 | 研究主要集中于小鼠模型，可能对其他物种的应用有限 | 研究心脏小梁血管的起源和发育机制 | 心室内膜细胞及其在小梁血管形成中的作用 | 数字病理学 | 冠心病 | 单细胞转录组学、免疫荧光 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1676 | 2024-08-04 |
Integrative single-cell characterization of frugivory adaptations in the bat kidney and pancreas
2023-Feb-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.02.12.528204
PMID:36824791
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research paper | 本文使用综合单细胞测序研究了蝙蝠肾脏和胰腺中的果食适应性 | 研究揭示了与果食适应性相关的关键细胞群体、基因表达和调控元件差异 | 研究可能只针对特定的蝙蝠种类，结果的普遍性尚待验证 | 研究果食适应性的细胞和分子机制 | 研究对象为昆虫食性和果食性蝙蝠的肾脏和胰腺 | NA | 糖尿病 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1677 | 2024-08-04 |
Single cell and immunity: Better understanding immune cell heterogeneities with single cell sequencing
2023-01, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1159
PMID:36579366
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研究论文 | 单细胞测序在理解免疫细胞的异质性方面具有科学影响 | 探讨单细胞测序在免疫细胞功能多样性研究中的新进展和应用 | 需要更强的程序以及预临床和临床验证的确凿证据 | 旨在深入了解单细胞基础的免疫细胞异质性和功能 | 单细胞基础的免疫细胞在发展和疾病中的研究 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1678 | 2024-08-04 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveal POSTN+ cancer-associated fibroblasts correlated with immune suppression and tumour progression in non-small cell lung cancer
2023-12, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1515
PMID:38115703
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研究论文 | 本研究揭示了POSTN+癌症相关成纤维细胞与非小细胞肺癌中的免疫抑制和肿瘤进展的相关性 | 识别了POSTN+成纤维细胞亚群，与肿瘤进展和免疫抑制相关 | 研究局限于16例NSCLC患者的样本，且仅分析特定的CAF亚群 | 探讨癌症相关成纤维细胞在非小细胞肺癌进展中的作用 | 对16例非小细胞肺癌患者的肿瘤及其相邻样本进行单细胞转录组测序 | 数字病理学 | 非小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序，SpaTial增强分辨率组学测序，免疫组化 | NA | RNA数据 | 16名非小细胞肺癌患者的肿瘤和相邻样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1679 | 2024-08-07 |
Immunological link between periodontitis and type 2 diabetes deciphered by single-cell RNA analysis
2023-12, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1503
PMID:38082425
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，探讨了牙周炎与2型糖尿病之间的免疫学联系 | 首次揭示了2型糖尿病如何加剧T/NK细胞免疫的恶化以及牙周炎与糖尿病之间的免疫学基础 | 样本量较小，可能影响结果的普遍性 | 旨在比较单纯牙周炎患者与同时患有牙周炎和2型糖尿病患者的免疫反应，以扩展对牙周炎与糖尿病复杂联系的理解 | 外周血单个核细胞 | NA | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 11名健康对照者，10名单纯牙周炎患者，6名同时患有牙周炎和2型糖尿病的患者 | NA | NA | NA | NA |
| 1680 | 2024-08-04 |
Crosstalk between alternative splicing and inflammatory bowel disease: Basic mechanisms, biotechnological progresses and future perspectives
2023-11, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1479
PMID:37983927
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综述 | 这篇文章总结了替代剪接与炎症性肠病之间的关系，以及相关的生物技术进展和未来的前景 | 这是首个评估替代剪接事件在炎症性肠病中潜在调控机制的综述 | 文章未详细讨论所有潜在的异常剪接基因及其机制 | 探讨替代剪接在炎症性肠病发病机制中的作用 | 涉及炎症性肠病中的异常替代剪接事件及其相关分子 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 下一代测序（NGS）、微阵列、第三代测序（TGS）、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 数据 | NA | NA | NA | NA | NA |